合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 382 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-06-05 |
Microbial-driven nature-based solutions for environmental antimicrobial resistance and emerging contaminants: mechanisms, platform trade-offs, and decision framework
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1804764
PMID:42238881
|
综述 | 本文综述了微生物驱动的自然解决方案在应对环境抗菌素耐药性和新兴污染物中的机制、平台权衡及决策框架 | 提出了一个连接环境来源、微生物机制、平台设计和监测指标的微生物自然解决方案决策框架，并整合了微生物生态学、合成生物学和组学方法的设计思路 | 面临可扩展性、长期性能、生态风险和监管接受度方面的挑战 | 探讨微生物驱动的自然解决方案在环境抗菌素耐药性和新兴污染物缓解中的应用与决策框架 | 抗菌素耐药性和新兴污染物（包括药物、个人护理产品、微塑料和内分泌干扰物） | 机器学习 | NA | 微生物生态学、合成生物学、组学方法 | NA | NA | 2000年至2024年间发表的文献 | NA | NA | NA | 环境 |
| 202 | 2026-06-05 |
Diterpenoids in medicinal plants: structure, distribution, biological activities, biosynthesis, and bioengineering prospects
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1833614
PMID:42239869
|
综述 | 系统总结药用植物中二萜类化合物的结构、分布、生物活性、生物合成途径及生物工程前景 | 全面整合了二萜类化合物的结构分类、功能机制与合成生物学应用，并提出了机器学习在药理学和酶工程中的未来方向 | 未深入讨论具体化合物的临床前或临床试验数据，可能缺乏实际应用案例的定量分析 | 系统梳理二萜类化合物的研究现状，为发现新活性化合物、阐明完整生物合成途径及可持续生产提供基础 | 药用植物中的二萜类化合物 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 203 | 2026-06-04 |
Yeast Biosensors for the Safety of Fermented Beverages
2026-Jan-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16010064
PMID:41590316
|
综述 | 综述酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的应用与发展 | 系统总结了酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的优势，包括实时检测、低成本、可集成于发酵系统，以及利用酵母的GRAS特性确保安全 | 酵母生物传感器仍主要停留在实验室规模，与工业广泛应用之间存在明显差距，需进一步研究其鲁棒性、可扩展性和监管整合 | 探讨酵母生物传感器在发酵饮料生产中保障安全性和品质的潜力，推动更安全、更高质量产品的制造 | 酵母生物传感器及其在啤酒、葡萄酒、康普茶等发酵饮料中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 报告系统（如荧光、颜色变化或电信号） | 食品 |
| 204 | 2026-06-04 |
The synergy of foundation technologies and computer sciences advances microbial expression systems in biomedical genetic engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.007
PMID:42191273
|
综述 | 基础技术与计算机科学的协同作用推动了生物医学基因工程中微生物表达系统的发展 | 系统阐述了合成生物学、CRISPR-Cas9等基因组编辑工具、下一代测序与组学技术、人工智能以及系统生物学与代谢建模等多学科技术的协同潜力，并提出克服当前障碍的策略 | 仍存在脱靶效应、代谢负担和放大生产限制等挑战 | 探讨基础生物技术与计算科学如何协同推进生物医学基因工程中微生物表达系统的进步 | 微生物表达系统 | 机器学习 | NA | 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 医学 |
| 205 | 2026-06-04 |
Protein Design Enters the Artificial Intelligence Era: Foundations, Tools, and Emerging Paradigms
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0105
PMID:42231905
|
综述 | 本文综述了人工智能在蛋白质设计领域的应用，涵盖深度学习、蛋白质语言模型和知识图谱等技术，以及它们在序列-结构-功能关系解析中的进展 | 系统总结了AI在蛋白质设计中的新范式，包括AlphaFold2的结构预测精度和Transformer模型从头序列设计，突出了计算与实验整合的趋势 | 模型可解释性不足、训练数据存在偏差以及实验验证率较低仍是主要挑战 | 分析人工智能驱动蛋白质设计的计算方法、基准指标及机器学习与实验管线的整合 | 蛋白质序列、结构和功能关系，以及相关计算工具和模型 | 机器学习 | NA | 深度学习, 蛋白质语言模型, 知识图谱, AlphaFold2, Transformer | 深度学习模型, 蛋白质语言模型, Transformer | 蛋白质序列数据, 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 206 | 2026-06-03 |
Engineering Trichoderma-mediated plant defense against bacterial phytopathogens: Micro-and nanobiotechnological strategies
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026002
PMID:41938783
|
综述 | 该文章综述了利用木霉介导的植物防御对抗细菌性植物病原体的微生物与纳米生物技术策略 | 将纳米技术与CRISPR基因编辑和合成生物学相结合，构建木霉作为下一代精准作物保护平台 | 田间转化、生物安全性和监管方面仍存在挑战 | 综述木霉在防控细菌性植物病害中的微生物与纳米生物技术策略 | 木霉属真菌及细菌性植物病原体（如XXX、XXX等） | NA | 细菌性植物病害 | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米技术、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 木霉 | 工程化生物防治菌株 | 农业 |
| 207 | 2026-06-03 |
Engineering the holobiont: Synthetic biology strategies for reversing bioenergetic collapse in radiation enteritis
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026003
PMID:41938784
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学策略工程化肠道微生物组，以逆转放射场肠炎中生物能量崩溃的方法 | 提出从经验性益生菌补充转向理性微生物组工程，包括热力学工程、遗传驯化和布尔逻辑门生物计算机设计，以解决当前治疗的局限性 | 目前仍处于概念性路线图阶段，缺乏大规模人体临床验证和安全性评估的具体数据 | 通过合成生物学方法重建肠道稳态，实现放射场肠炎的治疗并改善癌症长期生存率 | 肠道微生物组，特别是工程化共生菌和宿主-微生物互作网络 | 合成生物学 | 放射场肠炎 | 合成生物学，基因编辑，微生物工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程化共生菌（如大肠杆菌），肠道微生物组 | 布尔逻辑门，热力学工程，遗传驯化（如磺酸酶删除），生物计算机，STALEMATE生物防护系统 | 医学，肿瘤放疗 |
| 208 | 2026-06-02 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-01-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
|
综述 | 综述了液-液相分离驱动生物分子凝聚体形成的分子机制、设计策略及其在合成生物学中的转化前景 | 将液-液相分离原理从细胞组织引申至合成平台，系统归纳了利用内在无序蛋白、模块化互作基序和RNA支架设计功能性凝聚体的策略 | 未涉及合成凝聚体在体内复杂环境中的长期稳定性及潜在脱靶效应 | 总结液-液相分离介导的凝聚体分子机制与工程设计方法，促进细胞生物物理学与生物工程的交叉研究 | 液-液相分离形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 合成凝聚体（用于增强催化、代谢控制、靶向药物递送和生物传感） | 医学, 工业生物技术 |
| 209 | 2026-06-02 |
Chemically synthesized high-fidelity oligos ≤ 600 nt as building blocks to accelerate complex gene construction in synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag005
PMID:42222009
|
研究论文 | 报道一种名为UCOS的新型平台，用于高效合成长度≤600个核苷酸、具有复杂重复序列和碱基分布不均特征的高保真寡核苷酸 | 采用非多孔硅微球替代传统可控孔玻璃作为固相载体，结合5'侧翼序列杂交的全长富集和错误去除酶，显著提升复杂超长寡核苷酸的合成保真度 | NA | 开发能够高效合成复杂、超长DNA片段的方法，以支持合成生物学和基因工程应用 | 超长复杂寡核苷酸（≤600 nt），包括串联重复序列和碱基分布不均的序列 | 合成生物学 | NA | UCOS（超长复杂寡核苷酸合成） | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、合成基因组学 |
| 210 | 2026-06-01 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
|
研究论文 | 介绍了DNA-Diffusion，一种基于生成式人工智能的框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用机器学习基于多种细胞系的DNA可及性数据生成200碱基对的合成调控元件，重构内源转录因子结合语法，并增强细胞类型特异性 | 未提及在体内长期稳定性或脱靶效应的评估 | 开发生成式AI方法以设计用于精确基因表达控制的调控元件 | 合成调控元件及其在不同细胞系中的功能验证 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式人工智能框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件的STARR-seq文库，在三种细胞系中验证 | NA | 人类细胞系 | 合成调控元件 | 医学, 基因治疗 |
| 211 | 2026-05-29 |
High-Throughput Stationary 13C-Based Metabolic Flux Analysis of Pichia pastoris Strains
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4779-0_9
PMID:41028460
|
研究论文 | 描述了一种利用高通量培养平台对毕赤酵母菌株进行静态碳代谢流分析的方法 | 提出高通量平台用于大规模工程菌株的代谢流特征分析，加速菌株工程循环 | NA | 实现高通量的13C代谢流分析，以表征工程菌株的细胞内代谢反应速率 | 毕赤酵母（Komagataella phaffii）菌株 | 代谢工程 | NA | 13C代谢流分析 | NA | 代谢通量数据 | 一组工程菌株 | NA | 毕赤酵母（Komagataella phaffii） | NA | 工业生物技术 |
| 212 | 2026-05-27 |
New frontiers and applications of cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.002
PMID:41581983
|
综述 | 该文章概述了无细胞系统及其在合成生物学中的应用 | 强调了无细胞系统在消除细胞膜屏障、实现高通量蛋白质合成、非规范氨基酸掺入、生物传感、药物发现和代谢工程中的创新应用 | 未明确提及局限性 | 突出无细胞系统的基础及其在生物技术和工业中的快速、适应性解决方案 | 无细胞系统及其应用案例 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 原核生物、真核生物 | NA | 生物技术, 生物医学, 环境可持续性 |
| 213 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
|
综述 | 全面概述基于无细胞系统的低成本诊断技术的原理、设计方法和突破 | 系统性地总结了无细胞诊断平台在资源贫乏环境中的应用，包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物和PURE系统，并融合合成生物学基因回路、CRISPR-Cas工具和RNA适体以提高诊断灵敏度和特异性 | 试剂稳定性、可扩展性和监管问题仍是主要挑战 | 阐明无细胞系统在低成本诊断中的潜力，推动即时诊断和全球健康改善 | 基于无细胞表达的诊断平台 | 数字病理学 | 未提及 | 无细胞表达，CRISPR-Cas，RNA适体 | 未提及 | 未提及 | 未提及 | CRISPR-Cas | 大肠杆菌，小麦，纯化系统 | 基因回路，生物传感器 | 医学 |
| 214 | 2026-05-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
|
研究论文 | 提供无细胞蛋白合成系统的制备方案，包括细胞提取物制备、反应优化及蛋白质表征方法 | 详细阐述了从宿主菌选择、机械裂解到能量离子平衡优化的完整流程，并整合了常见瓶颈的解决方案，为无细胞系统在合成生物学和诊断领域的应用提供了可复现的标准化方法 | 未涉及大规模生产中的成本控制问题，且对复杂蛋白质（如膜蛋白）的合成效率优化讨论有限 | 建立高效制备无细胞蛋白合成系统的标准化协议，并展望其与机器学习结合的未来应用 | 无细胞蛋白合成系统（细胞提取物、反应体系优化及蛋白质功能分析） | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 实验数据（蛋白质表达与功能分析） | NA | NA | 大肠杆菌 | 无细胞表达反应体系（代谢通路） | 合成生物学，诊断，生物制造，食品，医疗 |
| 215 | 2026-05-27 |
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.010
PMID:41581989
|
综述 | 综述无细胞系统在合成生物学中的应用和进展 | 强调了无细胞系统在快速原型构建、与人工智能和微流控技术集成以及实现去中心化、可编程生物技术方面的范式转变 | 仍面临试剂成本高、批次差异大和可扩展性有限等挑战 | 系统阐述无细胞系统在合成生物学中的变革性作用及其未来发展方向 | 无细胞系统技术及其应用场景 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | 无细胞系统, PURE系统 | NA | 基因回路, 代谢途径, 生物传感器 | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 216 | 2026-05-26 |
Next-Generation Probiotics: From Traditional Strains to Personalized Therapeutics
2026-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70339
PMID:41327880
|
review | 本文综述了从传统益生菌到下一代益生菌的演变，重点比较了机制差异和功能进步，并探讨了合成生物学、人工智能和微生物组分析在个性化益生菌治疗中的潜力 | 系统对比传统益生菌与下一代益生菌在机制上的区别，引入合成生物学可编程基因电路和人工智能驱动的个性化治疗策略 | 广泛临床应用仍处于早期阶段，面临安全性、监管和转化方面的挑战 | 比较传统与下一代益生菌，探讨个性化治疗的前沿进展 | 传统益生菌（如乳杆菌属、双歧杆菌属）与下一代益生菌（如阿克曼氏菌、普拉梭菌） | NA | 代谢性疾病、炎症性疾病、神经系统疾病 | 合成生物学、微生物组分析 | NA | NA | NA | 可编程基因电路 | 人体肠道微生物 | 可编程基因电路 | 医学、营养学 |
| 217 | 2026-05-26 |
Gut-engineered Bacillus subtilis-mediated BAMBI delivery for the treatment of thioacetamide-induced liver fibrosis through mechanotransduction inhibition
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1817519
PMID:42183058
|
研究论文 | 利用肠道工程化枯草芽孢杆菌递送BAMBI蛋白治疗硫代乙酰胺诱导的肝纤维化 | 首次采用遗传工程枯草芽孢杆菌通过肠-肝轴持续递送BAMBI蛋白，同时抑制生化信号和机械传导，创新性地将合成生物学与机械生物学相结合治疗肝纤维化 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证；需评估长期口服活菌的安全性和潜在副作用 | 开发一种基于工程微生物的肝纤维化治疗方法，通过抑制机械传导来逆转肝纤维化 | 经硫代乙酰胺诱导肝纤维化的小鼠模型 | 合成生物学 | 肝纤维化 | 遗传工程、口服给药、组织分析、血清标志物检测 | NA | 实验数据（组织学评分、血清生化指标、蛋白表达数据） | 小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 构建持续分泌BAMBI蛋白的基因电路 | 医学 |
| 218 | 2026-05-25 |
Predicting lasso peptide structure with LassoPred
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.037
PMID:42177065
|
研究论文 | 提出LassoPred，一个基于机器学习的模块化计算流程，用于从序列预测套索肽的三维结构 | LassoPred通过整合ESM2嵌入训练的支持向量机分类器注释关键拓扑特征（异肽环和塞子残基），并采用拓扑感知的结构构建器组装和优化原子模型，实现了近实验精度，同时将预测时间缩短至分钟级，并将已知套索肽结构覆盖率从不足50个扩展至超过4000个基因组挖掘模型 | 输入标题与摘要中未明确提及局限性 | 从序列准确预测套索肽的三维结构，桥接序列发现与结构洞察的差距 | 套索肽（LaPs） | 机器学习 | NA | 机器学习、同源建模、能量最小化 | 支持向量机 | 序列数据 | 超过4000个基因组挖掘模型 | NA | NA | NA | 酶学、结构生物学、合成生物学、治疗学设计 |
| 219 | 2026-05-23 |
Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications
2026-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70260
PMID:40936353
|
研究论文 | 本研究设计并合成了编码肠球菌素A的完整遗传盒，在大肠杆菌中异源表达并纯化出具有抗菌活性的重组多肽 | 开发了从包含体中高效回收并重折叠生物活性细菌素的稳健低成本方法，为抗菌肽应用提供新途径 | 未提及该方法的长期稳定性或体内应用效果 | 开发基于合成生物学的异源表达和纯化方法，以生产抗菌肽肠球菌素A | 肠球菌素A的合成基因盒及其在大肠杆菌中的表达产物 | 合成生物学 | 抗菌耐药相关疾病 | PCR、测序、Ni-NTA亲和层析 | NA | 序列数据 | 5种多重耐药病原菌用于抗菌活性测试 | NA | 大肠杆菌 | 合成遗传盒包含entA基因、His标签及调控元件，用于表达肠球菌素A | 医学、食品 |
| 220 | 2026-05-19 |
Editorial: Biomolecule production in plant synthetic biology
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1857952
PMID:42147288
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |