合成生物学相关文章
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当前共找到 268 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-01-20 |
Synthetic Biology Strategies for Harnessing Bacterial Glucose Oxidation Pathways
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00901
PMID:41494861
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综述 | 本文系统综述了细菌葡萄糖氧化途径的组成、分布、生理功能、关键酶及其代谢产物的工业应用，并重点讨论了通过代谢工程策略优化该途径以生产高价值化合物的潜力 | 系统整合了细菌葡萄糖氧化途径的生物学知识与代谢工程策略，并全面评估了该途径在可持续生产多种高价值化合物（如酒石酸、2,5-呋喃二甲酸、维生素C前体和磷肥）中的应用潜力 | NA | 探讨如何利用合成生物学与代谢工程策略优化细菌的葡萄糖氧化途径，以实现特定高价值化合物的高效、可持续生产 | 细菌的葡萄糖氧化途径及其关键酶（如PQQ依赖型和FAD依赖型葡萄糖酸脱氢酶），以及该途径的代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 葡萄糖氧化途径（涉及葡萄糖酸、5-酮基-D-葡萄糖酸、2-酮基-D-葡萄糖酸和2,5-二酮基-D-葡萄糖酸等中间产物的代谢通路） | 工业生物技术, 农业, 医药 |
| 202 | 2026-01-20 |
A Framework for a Standard-Enabled FAIR Data Management Workflow for Synthetic Biology
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00813
PMID:41498158
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综述 | 本文提出了一个基于标准的FAIR数据管理框架，用于合成生物学实验室中数据与元数据的整合与标准化工作流 | 通过半结构化访谈分析当前实践，构建了将常见数据类型映射到社区标准的框架，并提供逐步采用指南和软件解决方案目录 | NA | 解决合成生物学数据分散、格式不一致的问题，提升数据的可查找性、可访问性、互操作性和可重用性 | 合成生物学项目生命周期中产生的序列、模型、协议、图像和时间序列测量等数据与元数据 | 合成生物学 | NA | 半结构化访谈 | NA | 序列、模型、协议、图像、时间序列测量 | 美国多个实验室的合成生物学研究人员 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 203 | 2026-01-20 |
Chimeric antigen receptor-based cellular therapy for T-cell malignancies
2026-Jan, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105044
PMID:41285209
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综述 | 本文综述了基于嵌合抗原受体（CAR）的细胞疗法在T细胞恶性肿瘤中的应用，探讨了包括T细胞亚群、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞和γδ T细胞在内的多种免疫效应细胞，并讨论了多抗原靶向、新兴技术和最新临床试验 | 聚焦于CAR疗法在T细胞恶性肿瘤中的挑战，如抗原共享导致的细胞自相残杀和T细胞再生障碍，并探索了多种免疫效应细胞和新兴技术以改善疗效 | NA | 改善复发或难治性T细胞恶性肿瘤的CAR疗法疗效 | T细胞恶性肿瘤患者 | NA | T细胞恶性肿瘤 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞、γδ T细胞 | 嵌合抗原受体（CAR）设计，使用单链可变片段（scFv）识别肿瘤相关抗原 | 医学 |
| 204 | 2026-01-20 |
Toward full automation in synthetic biology: A progressive conceptual framework integrating robotics and intelligent agents
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100378
PMID:41360266
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综述 | 本文探讨了合成生物学中物理（机器人）和认知（智能代理）自动化的进展与前景，并提出了一个双重概念框架 | 提出了一个双重概念框架：一个用于设计-构建-测试-学习（DBTL）周期的完全自动化，另一个适用于不同实验室环境的渐进式自动化 | NA | 支持合成生物学实验室中自动化系统的开发和负责任实施 | 合成生物学中的自动化技术和智能代理 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 205 | 2026-01-19 |
Arabinose-Inducible Univariant Control System (AUCS) for Microbial Production of Proteins, Enzymes, and Metabolites
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00602
PMID:41423945
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研究论文 | 本文介绍了一种阿拉伯糖诱导的单变量控制系统（AUCS），用于微生物生产蛋白质、酶和代谢物，旨在克服现有诱导系统的局限性 | AUCS通过组成型表达阿拉伯糖转运蛋白AraE消除了碳分解代谢物阻遏，并最小化诱导异质性，仅需3 μM l-阿拉伯糖即可实现最大蛋白质输出，显著降低诱导剂成本和环境足迹 | NA | 开发一种稳健、紧密调控且低成本的表达平台，以优化微生物生产中的基因表达控制 | 微生物生产系统，包括蛋白质（如卵清蛋白）、酶（如萜烯合酶、类胡萝卜素裂解双加氧酶）和次级代谢物（如芳樟醇、橙花叔醇和香紫苏醇） | 合成生物学 | NA | 基因表达调控、启动子库定制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 单变量控制系统，包括阿拉伯糖诱导的启动子和阿拉伯糖转运蛋白AraE的组成型表达，用于精确调控多酶操纵子和复杂生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 206 | 2026-01-19 |
SynVectorDB: embedding-based retrieval system for synthetic biology parts
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf088
PMID:41537189
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研究论文 | 本文介绍了SynVectorDB，一个基于嵌入的合成生物学元件检索系统，旨在解决现有数据库数据组织不一致和语义搜索能力有限的问题 | 开发了基于BGE-M3多语言嵌入的可扩展向量数据库架构，实现了语义相似性匹配；提出了新颖的三级层次分类系统；建立了标准化的数据整理工作流程 | NA | 改进合成生物学元件的发现和组织方式，提高检索效率和准确性 | 合成生物学元件（生物部件） | 生物信息学 | NA | 嵌入技术，语义相似性匹配 | BGE-M3嵌入模型 | 文本数据，元数据 | 19,850个生物部件（来自Addgene、iGEM注册库和实验室收集），其中7,656个通过文献验证获得验证状态 | iGEM | NA | NA | 工业生物技术 |
| 207 | 2026-01-19 |
MGTbind: a comprehensive database of molecular glue ternary interactome
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1075
PMID:41160881
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研究论文 | 本文介绍了一个名为MGTbind的综合性数据库，该数据库专门收集分子胶参与的三元相互作用组数据 | 开发了首个全面整合分子胶三元相互作用组结构数据和实验数据的数据库，并集成了AlphaFold 3预测的结构信息 | 数据库依赖现有实验数据和预测模型，可能无法覆盖所有未知的分子胶相互作用 | 为分子胶的理性设计提供数据资源支持 | 分子胶及其参与的三元蛋白质相互作用 | 生物信息学 | NA | 数据库构建、AlphaFold 3结构预测 | NA | 化学结构数据、蛋白质相互作用数据、生物活性测量数据 | 3093个经人工整理的分子胶，3924个三元相互作用 | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 208 | 2026-01-19 |
GotEnzymes2: expanding coverage of enzyme kinetics and thermal properties
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1053
PMID:41171142
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研究论文 | 本文介绍了GotEnzymes2数据库，这是一个大幅扩展的酶动力学和热性质资源库 | 相比第一版，GotEnzymes2首次整合了催化参数和热参数，实现了kcat、Km、kcat/Km、最适温度和熔解温度的联合预测，创建了迄今最全面的酶动力学和稳定性参数数据库 | NA | 解决酶动力学实验测量参数稀缺的问题，为数据驱动的酶发现、设计和工程提供资源 | 酶动力学参数和热性质参数 | 系统生物学 | NA | 酶动力学参数预测模型 | NA | 酶催化参数和热参数数据库 | 覆盖10,765个物种、730万种酶、5,960万条独特条目 | NA | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 |
| 209 | 2026-01-19 |
Open Enzyme Database: a community-wide repository for sharing enzyme data
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1082
PMID:41188073
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研究论文 | 本研究开发了一个名为开放酶数据库（OED）的社区共享平台，用于整合和共享酶相关数据 | 构建了一个集成了酶动力学参数、结构数据、反应信息和功能注释的综合性数据库，并整合了AI预测工具和化学信息学算法 | NA | 解决现有酶数据库更新不及时、缺乏标准化和机器学习支持不足的问题 | 酶及其相关数据 | 生物信息学 | NA | 数据库构建、人工智能、化学信息学 | AI预测模型 | 酶动力学参数、结构数据、反应数据、实验条件、功能注释 | NA | NA | NA | NA | 生物催化、系统生物学、合成生物学、酶工程、人工智能 |
| 210 | 2026-01-19 |
TEDD: a comprehensive database for translation efficiency dynamics
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1125
PMID:41217970
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研究论文 | 介绍了一个名为TEDD的综合性数据库，用于探索人类翻译效率（TE）、起始效率（TR）和延伸速度（EVI）的动态变化，重点关注5'/3' UTR的调控特征 | 首次系统性地整合了基因和转录本水平的翻译效率、起始效率和延伸速度数据，并关联了详细的UTR注释，为翻译调控研究提供了多维度的在线比较平台 | 数据库目前仅涵盖人类数据，且样本来源（24种组织/细胞类型、74种细胞系、52种条件）虽广泛但仍有扩展空间 | 构建一个全面的翻译效率动态数据库，以支持翻译调控机制研究和相关生物技术应用 | 人类的翻译效率、起始效率、延伸速度及UTR调控特征 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq, RNC-seq | NA | 高通量测序数据 | 1518个RNA-seq、Ribo-seq和RNC-seq样本，来自143个人类项目（279个数据集） | NA | NA | NA | mRNA疫苗设计、合成生物学、基因治疗、酶工程 |
| 211 | 2026-01-18 |
Resource Competition and Growth Dilution Modulate Synthetic Gene Cascade Dynamics
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00606
PMID:41457566
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研究论文 | 本文通过构建和表征抑制性基因级联库，揭示了资源竞争和生长稀释对合成基因电路动力学的关键影响 | 发现下游模块表达增强会通过竞争共享细胞资源意外降低上游调控模块的表达，揭示了资源限制可将单向抑制级联转化为意外反馈回路 | NA | 研究合成基因电路的稳健性和可预测性设计 | 抑制性基因级联库（含不同启动子强度、RBS强度和质粒骨架） | 合成生物学 | NA | 基因电路构建与表征 | NA | 基因表达数据 | NA | 质粒构建 | NA | 抑制性基因级联 | 工业生物技术 |
| 212 | 2026-01-18 |
Synergistic regulatory mechanisms in glycolysis revealed by pathway transplantation
2026-Jan-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00219-25
PMID:41532746
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研究论文 | 本研究通过移植糖酵解途径，揭示了多个变构蛋白之间的协同调控机制及其在动态环境中对细胞存活的影响 | 首次通过完整途径互补和单基因互补实验，识别了糖酵解中的关键调控步骤（葡萄糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶），并展示了变构调控在防止糖酵解失衡中的协同作用 | 实验主要基于模式真核生物酿酒酵母，结果可能不直接适用于其他生物体 | 探究糖酵解途径中多个变构调控步骤如何相互作用以调节代谢 | 糖酵解途径（Embden-Meyerhof-Parnas途径）及其变构蛋白 | 系统生物学 | NA | 途径移植、动力学建模、微流控实验 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母 | 糖酵解代谢途径 | 工业生物技术 |
| 213 | 2026-01-17 |
Screening and machine learning-based prediction of translation-enhancing peptides that reduce ribosomal stalling in Escherichia coli
2026-Jan-14, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00199d
PMID:41142649
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研究论文 | 本研究通过筛选随机人工四肽库，鉴定出能减少大肠杆菌中SecM停滞肽诱导的翻译停滞的翻译增强肽，并开发了基于随机森林算法的机器学习模型来预测其活性 | 首次系统性筛选翻译增强肽，并利用机器学习模型预测其活性，为合成生物学提供了紧凑的肽工具包和数据驱动方法 | 研究主要针对SecM停滞肽，对其他停滞肽的适用性未充分验证，且实验基于大肠杆菌系统，在其他生物中的效果未知 | 开发翻译增强肽以减轻停滞肽诱导的核糖体停滞，并建立预测模型 | 随机人工四肽库和SecM停滞肽在大肠杆菌中的翻译停滞现象 | 合成生物学 | NA | 随机肽库筛选、翻译分析、机器学习 | 随机森林 | 肽序列数据和翻译活性测量数据 | 随机人工四肽库中的多个肽样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 214 | 2026-01-17 |
Oral live microbial therapeutics: A synthetic biology roadmap toward durable oral microbiome-based therapies
2026-Jan-09, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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综述 | 本文是一篇关于口服活微生物疗法（LMTs）的叙述性综述，旨在通过整合临床证据和工程学原理，为开发持久有效的口腔微生物疗法提供合成生物学路线图 | 将合成生物学工程工具（如粘附载体、多层生物防护和逻辑门控/CRISPR杀灭开关）系统性地应用于口腔LMTs的开发，并提出了一个包含定植曲线下面积、表观半衰期等指标的位点解析测量框架，以量化微生物在口腔内的持久性 | 这是一篇叙述性综述，而非原始研究，其结论基于现有文献的综合分析，可能受到已发表研究偏倚和异质性的限制；此外，文中提出的工程策略大多处于概念或早期开发阶段，尚未经过大规模临床验证 | 为开发持久、安全的口服活微生物疗法提供合成生物学指导框架，并推动临床转化 | 口服活微生物疗法（LMTs）及其在口腔疾病（如口臭、龋齿、牙周病）中的应用 | 合成生物学 | 口腔疾病（包括口臭、龋齿、牙周病） | NA | NA | NA | NA | CRISPR, 逻辑门控杀灭开关, 合成营养缺陷型设计 | NA | 逻辑门控杀灭开关, 合成营养缺陷型设计, 多层生物防护系统 | 医学 |
| 215 | 2026-01-16 |
Establishing synthetic ribbon-type active zones in a heterologous expression system
2026-Jan-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98254
PMID:41528127
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研究论文 | 本研究采用合成生物学方法，在HEK293细胞中重建了类似带状活性区的结构，以探究其最小分子需求并研究突触前钙通道的聚集 | 首次在异源表达系统中成功重建了模拟带状活性区的合成结构，结合超分辨率STED显微镜和冷冻相关电子断层扫描技术验证其与天然带状结构的相似性 | 研究基于异源细胞系统，可能不完全反映神经元原生环境中的复杂相互作用 | 探究带状突触活性区的最小分子组成和钙通道聚集机制 | 带状突触活性区的重建结构及其分子组件 | 合成生物学 | NA | STED超分辨率显微镜、冷冻相关电子断层扫描、钙成像、膜片钳技术 | NA | 图像数据、功能分析数据 | 使用HEK293细胞作为异源表达系统 | 合成生物学方法 | 人类胚胎肾293细胞（HEK293） | 带状活性区模拟结构，涉及Bassoon蛋白膜锚定版本和RIBEYEB蛋白共表达 | 医学 |
| 216 | 2026-01-15 |
Dynamic Interaction: Synthetic Biology and Cell-Free Biosensors Drive Each Other Forward
2026-Jan-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12137
PMID:41406611
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综述 | 本文探讨了合成生物学与生物传感器技术的融合如何推动生物技术革命，并系统总结了无细胞生物传感器领域的最新研究进展与技术突破 | 强调了合成生物学与无细胞生物传感器之间的动态互动关系，突出了无细胞生物传感器在快速原型设计、高可控性、优异生物安全性及对潜在毒性物质耐受性方面的核心优势 | NA | 探索合成生物学与生物传感器整合所释放的创新潜力，并系统总结无细胞生物传感器领域的最新研究进展与技术突破 | 无细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物回路精确设计、代谢途径智能优化 | 生物技术、高效诊断 |
| 217 | 2026-01-15 |
Emerging Chemical and Biological Materials Technologies in the Extraplanetary Environment
2026-Jan-12, Nano-micro letters
IF:31.6Q1
DOI:10.1007/s40820-025-01979-8
PMID:41521243
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综述 | 本文综述了化学和生物纳米/微米/介观尺度制造技术在太空探索中的应用，旨在通过原位生产生命支持材料、推进剂等资源来克服太空探索挑战 | 整合了合成生物学和人工智能等新兴技术，以应对微重力、资源有限和极端环境等太空制造限制 | NA | 探讨太空制造技术的起源、演变、最新进展及未来方向，以支持太空科学和跨学科创新 | 轨道空间站、月球表面、火星和小行星等不同太空环境中的制造技术 | NA | NA | 化学和生物纳米/微米/介观尺度制造 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 太空探索, 制造 |
| 218 | 2026-01-15 |
Nature-Inspired Biomineralization for Food Innovation: Biomimetic Material Design and Targeted Nutrient Delivery
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70400
PMID:41532716
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综述 | 本文系统回顾了过去25年间生物矿化策略从分子机制到食品应用的进展，重点介绍了其在智能包装、功能成分控释和功能性食品开发方面的贡献 | 首次系统地将自然启发的生物矿化策略深入应用于食品科学领域，为解决食品包装、加工、安全检测和营养强化等关键挑战提供了创新方案 | 规模化生产和安全性评估方面仍存在持续挑战 | 探索生物矿化策略在食品创新中的应用潜力，推动食品产业向更高效、自动化和可持续方向转型 | 生物矿化过程及其在食品包装、功能成分递送和功能性食品开发中的应用 | 材料科学与食品科学交叉领域 | NA | 生物矿化、有机模板调控矿化、物理化学策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品、材料科学 |
| 219 | 2026-01-14 |
Molecular networks and signaling pathways governing abiotic stress tolerance in cotton: advances and perspectives
2026-Jan-13, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01795-8
PMID:41528403
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综述 | 本文综述了棉花响应非生物胁迫（如干旱、盐分、热、冷和重金属毒性）的分子网络与信号通路研究进展，并展望了未来研究方向 | 整合了最新的表观遗传调控机制（如m6A RNA甲基化和非编码RNA）以及合成生物学方法在棉花胁迫响应网络研究中的应用 | NA | 阐明棉花非生物胁迫耐受性的分子调控网络与信号通路，为培育抗逆棉花品种提供理论基础 | 棉花（Gossypium spp.） | NA | NA | 分子生物学、生物技术、遗传工程、基因组编辑、组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 220 | 2026-01-14 |
Industrial Byproducts as Sustainable Feedstocks for Biopharmaceutical Manufacturing: Waste-to-Medicine Pathways for a Circular Economy
2026-Jan-12, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.70124
PMID:41527212
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综述 | 本文系统性地探讨了工业副产品作为生物制药可持续原料的来源、分类及应用，评估了将其转化为高价值治疗产品的生物技术策略，并分析了相关的环境、经济、监管及技术挑战 | 首次系统性地将工业副产品定位为生物制药的可持续原料，并整合了从废物到药物的转化路径、生命周期分析及人工智能等未来优化策略，强调了其在推动循环经济和零废物生产中的变革潜力 | 存在技术限制、严格的质量与标准化要求、复杂的政策与伦理挑战等重大障碍，且工业副产品的来源和成分可能不稳定，影响生产的可重复性和规模化 | 探索工业副产品作为可持续原料在生物制药制造中的应用潜力，以降低生产成本并促进循环经济 | 工业副产品（如制药及相关行业的废弃物、农业工业废物、海洋来源残留物、发酵副产品）及其转化为生物制药产品的过程 | 工业生物技术 | NA | 微生物发酵、酶促生物转化、合成生物学驱动的代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术 |