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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-01-06 |
Long noncoding RNA regulation of immunity
2026-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02355-9
PMID:41482550
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA(lncRNA)在哺乳动物免疫系统中的调控作用,包括其在免疫细胞分化、功能及疾病关联中的机制 | 文章强调了lncRNA在代谢途径、细胞表面糖基化非编码RNA及抗原性细胞外核糖核蛋白复合物中的新型调控机制,并特别关注了女性特异性lncRNA XIST在自身免疫性疾病中的性别偏向作用 | NA | 探讨lncRNA在免疫系统调控中的角色及其在免疫相关疾病中的影响 | 长链非编码RNA(lncRNA)及其在免疫细胞和免疫反应中的功能 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 高通量功能基因组学、人类遗传学、分子互作图谱、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 202 | 2026-01-06 |
Structure-Guided Engineering of 2-Oxoglutarate-Dependent Oxygenases: Principles, Case Studies, and Emerging Opportunities
2026, Chemical & pharmaceutical bulletin
IF:1.5Q3
DOI:10.1248/cpb.c25-00652
PMID:41485885
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综述 | 本文综述了2-酮戊二酸依赖性非血红素铁加氧酶(2OGX)的结构引导工程原理、案例研究及新兴机遇 | 系统总结了基于2OGX保守结构基序(如CLip、CLid、SL、DL及β-折叠框架)进行理性重编程以改变反应性的策略,展示了将羟化酶转化为卤化酶、重定向真菌酶构建非天然萜类支架等创新案例 | NA | 探讨如何通过结构引导的蛋白质工程策略,理性改造2OGX酶的功能,拓展其在生物催化中的应用 | 2-酮戊二酸依赖性非血红素铁加氧酶(2OGX)及其结构-功能关系 | 合成生物学 | NA | 结构生物学、计算设计、蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、天然产物发现、药物开发 |
| 203 | 2026-01-03 |
Advances in the engineering of living probiotics for cancer immunotherapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.125301
PMID:41355950
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综述 | 本文综述了工程化活益生菌在癌症免疫治疗中的应用进展,包括细菌与肿瘤的复杂关系、细菌修饰的工程方法及其在增强癌症疗法中的应用 | 探讨了利用合成生物学等工程方法改造细菌以创建先进的基于细菌的药物递送系统,并展望了组合疗法、个性化医疗和微生物组在提高治疗效果中的潜力 | NA | 概述工程化活益生菌在癌症免疫治疗中的发展,以增强治疗疗效和安全性 | 细菌(特别是活益生菌)及其与肿瘤微环境和免疫系统的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 测序技术、物理化学方法、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌(如益生菌) | 基于细菌的药物递送系统 | 医学 |
| 204 | 2026-01-03 |
Biosensors for Cancer and Inflammation: Whole-Cell Biosensors for Soluble Molecules
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4901-5_25
PMID:41478986
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综述 | 本章节介绍了利用合成转录因子构建全细胞生物传感器,用于检测炎症和癌症生物标志物(如唾液中的神经氨酸)的流程 | 提出了一种基于定制转录因子的原核生物传感器菌株构建方法,以神经氨酸作为口腔癌生物标志物检测为例 | NA | 开发用于检测可溶性小分子(如癌症和炎症生物标志物)的全细胞生物传感器 | 全细胞生物传感器(WCBs),特别是基于合成转录因子的原核生物传感器菌株 | 合成生物学 | 口腔癌 | 合成生物学方法,包括遗传电路设计和转录因子工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌(Escherichia coli MG1655) | 集成定制转录因子的遗传电路,用于检测神经氨酸 | 医学 |
| 205 | 2025-12-24 |
Structure prediction and engineering of de novo proteins
2026-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Proteins and proteomics
DOI:10.1016/j.bbapap.2025.141100
PMID:40962101
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综述 | 本文综述了从头蛋白质的定义、历史、功能意义及研究方法,涵盖自然进化与合成设计两类 | 强调自然进化过程与理性蛋白质工程之间的日益融合,突显其在生物学发现和人类创新中的重要性 | NA | 概述从头蛋白质的研究领域,包括其结构预测与工程应用 | 从头蛋白质,包括自然进化与合成设计两类 | 合成生物学 | NA | 计算与实验方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2025-12-23 |
Construction of an mKate-based fluorescent protein reporting system in Limosilactobacillus reuteri
2026-Jan, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107347
PMID:41314353
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研究论文 | 本文在罗伊氏乳杆菌中建立了一个高效的遗传转化系统,并构建了基于mKate的红色荧光蛋白报告系统 | 通过优化转化协议,首次在罗伊氏乳杆菌中实现了高效的遗传转化,并成功构建了mKate荧光报告系统,为实时监测细菌定位和基因表达提供了新工具 | NA | 开发适用于罗伊氏乳杆菌的合成生物学工具,以支持实时监测细菌行为和基因表达 | 罗伊氏乳杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传转化优化、荧光蛋白报告系统构建 | NA | NA | NA | NA | 罗伊氏乳杆菌 | mKate红色荧光蛋白报告系统 | 工业生物技术 |
| 207 | 2025-12-23 |
The Road to Sustainable Soy Sauce Production and Consumption
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70352
PMID:41355608
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综述 | 本文通过系统综述分析了酱油生产与消费的趋势,重点关注工艺优化、微生物发酵、安全性、废物管理和新兴分析技术五个关键领域,并提出了一个连接可持续性核心支柱的整合框架 | 提出了一个将五个关键主题领域(工艺优化、微生物发酵、安全、废物管理、分析技术)与可持续性核心支柱(环境、经济、社会、技术、营养)相连接的整合框架,为未来研究、政策制定和工业实践提供指导 | 整合传统方法与新兴技术(如精准发酵)仍面临微生物菌株不兼容、可扩展性问题以及保持文化真实性和感官属性的挑战 | 审查酱油生产与消费的趋势,并探讨如何通过技术进步实现可持续的酱油生产与消费 | 酱油的生产工艺、微生物发酵过程、相关分析技术及可持续性实践 | NA | NA | 宏基因组学、合成生物学、酶工程、多组学方法(代谢组学、基因组学、转录组学)、光谱学、基于传感器的系统 | NA | NA | 基于181篇同行评审文章 | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 208 | 2025-12-21 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2026-Jan-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
|
综述 | 本文综述了抗体-药物偶联物(ADCs)的当前成就与未解决问题,并强调了基于全基因编码蛋白质构建体的创新方向,特别是双功能嵌合蛋白,为下一代蛋白质治疗药物奠定基础 | 强调双功能嵌合蛋白作为ADCs的替代方案,整合基于支架的靶向域与肽衍生细胞毒性模块,具有高选择性、紧凑结构、低免疫原性和细菌表达兼容性,并利用合成生物学、展示系统和机器学习等技术加速其发现与优化 | NA | 探索超越ADCs的可编程治疗蛋白质,以克服ADCs的高成本、分子异质性、系统毒性和窄治疗窗等限制,推动标准化和可及性治疗的发展 | 抗体-药物偶联物(ADCs)及其替代方案,特别是双功能嵌合蛋白质构建体 | 个性化医疗 | 肿瘤学 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 细菌表达系统 | NA | 医学 |
| 209 | 2025-12-20 |
Graduate Student Literature Review: Advancing synthetic biology in the dairy industry-Innovations, applications, and policy implications
2026-Jan, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27456
PMID:41176263
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综述 | 本文综述了合成生物学在乳制品行业中的应用现状、创新策略及政策影响 | 系统性地探讨了合成生物学在乳制品行业中的多种分子策略(如重组技术和噬菌体应用)及其政策含义,强调了其在推动行业创新和可持续发展方面的潜力 | NA | 为乳制品行业中合成生物学的当前应用提供全面概述,并展望其未来创新策略和政策影响 | 乳制品行业中的合成生物学技术、应用及政策框架 | NA | NA | 重组技术、噬菌体应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 210 | 2025-12-18 |
Extraction, preparation, pharmacological activities, and potential applications of ginsenosides Rk1 and Rg5
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120678
PMID:41052692
|
综述 | 本文系统综述了稀有人参皂苷Rk1和Rg5的最新研究进展,涵盖其天然来源、提取加工技术、结构特征、药理机制以及在功能性食品和营养保健品中的潜在应用 | 整合了网络药理学和分子对接技术来预测Rk1和Rg5的潜在抗癌和生殖保护作用,并探讨了人工智能辅助生物转化和合成生物学等新兴技术为其大规模、高效制备提供的新途径 | 其工业化应用受到天然丰度低、结构复杂和可持续生产挑战的阻碍,未来研究需优先优化提取方案、阐明药代动力学特征并进行严格的临床试验以验证其功效 | 旨在弥合临床前研究与临床转化之间的差距,促进Rk1和Rg5在医疗保健和营养领域更广泛的应用 | 稀有人参皂苷Rk1和Rg5 | NA | 肿瘤、代谢性疾病、心血管疾病 | 网络药理学、分子对接、人工智能辅助生物转化、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、功能性食品、营养保健品 |
| 211 | 2025-12-17 |
Metabolic Engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for L-Leucine Production
2026-Jan, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70075
PMID:40745981
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Acinetobacter baylyi ADP1,以提高L-亮氨酸的产量 | 在ADP1中,过表达野生型leuA和ilvBN基因即可有效驱动L-亮氨酸合成,无需反馈抑制抗性突变,这不同于大肠杆菌和谷氨酸棒杆菌等经典底盘生物 | ADP1独特的葡萄糖分解代谢网络限制了其丙酮酸可用性,需要补充丙酮酸并减少碳损失以优化生产 | 评估ADP1作为合成生物学底盘在天然产物生物合成中的潜力,并优化其L-亮氨酸生产能力 | Acinetobacter baylyi ADP1菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因过表达、基因敲除、sRNA调控系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acinetobacter baylyi ADP1 | L-亮氨酸生物合成途径改造、Entner-Doudoroff途径增强、TCA循环动态抑制系统 | 工业生物技术 |
| 212 | 2025-12-12 |
Living materials for gas therapy
2026-Jan, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115738
PMID:41248756
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综述 | 本文系统总结了基于活体材料的气体疗法最新进展,重点按生物来源和工程设计原则分类,并讨论了其在癌症、炎症性疾病和组织再生中的治疗机制与疗效 | 提出活体材料作为气体疗法的新范式,利用工程化生物实体(如细菌、细胞、藻类)实现智能气体生成和可控释放,克服传统纳米载体的生物相容性、靶向性和响应性不足 | 生物安全性和可扩展性仍是主要挑战 | 推动精准气体医学领域发展,通过整合合成生物学和多模式治疗策略优化气体疗法 | 一氧化氮、一氧化碳、硫化氢、氢气和二氧化硫等医用气体 | NA | 癌症、炎症性疾病 | 合成生物学、基因编程、仿生工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌、细胞、藻类 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器 | 医学 |
| 213 | 2025-12-12 |
Rooted intelligence: Integrating AI, Omics, and Synthetic biology to engineer the plant microbiome
2026-Jan, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04614-w
PMID:41376894
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综述 | 本文综述了整合组学、合成生物学和人工智能以深化对植物-微生物互作的理解并支持可持续农业的最新进展 | 提出了“根植智能”的概念,将AI、组学和合成生物学整合用于工程化设计植物微生物组,旨在理性设计下一代植物根际促生菌和合成微生物群落 | 将实验室发现转化到田间条件存在挑战,需确保工程微生物的生物安全性,并解决伦理和监管问题 | 通过跨学科技术整合,支持可持续农业并设计适应不同农业生态系统的优化微生物群落 | 植物微生物组、植物-微生物相互作用、根际微生物群落 | 合成生物学、人工智能、农业生物技术 | NA | 组学技术(包括多组学数据整合)、合成生物学、AI驱动的预测建模和实时表型分析 | 预测建模、AI驱动工具 | 多组学数据、表型数据 | NA | 合成生物学工具(用于设计微生物菌株和合成群落) | 植物根际微生物 | 设计具有增强性状(如营养溶解、胁迫耐受、病原抑制)的微生物菌株和合成群落 | 农业、环境 |
| 214 | 2025-12-10 |
Biogenic amines in fermented foods: A comprehensive review from formation pathways, risk analysis, detection technologies to control measures
2026-Jan-15, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.117832
PMID:41360534
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综述 | 本文系统综述了发酵食品中生物胺的形成途径、风险分析、检测技术及控制措施,特别聚焦于微生物策略及其机制与未来展望 | 特别强调微生物控制策略作为内在兼容的解决方案,并展望了将微生物策略与AI驱动的生物传感器等智能技术结合,以及利用合成生物学提高酶产量的未来研究方向 | 在优化菌株效能、稳定性及大规模生产应用方面仍存在挑战 | 为发酵食品中生物胺的相关研究和实际应用提供结构化参考 | 发酵食品中的生物胺 | NA | NA | AI驱动的生物传感器、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 215 | 2025-12-05 |
Marine-derived natural products as anti-osteoporosis agents
2026-Jan-15, European journal of medicinal chemistry
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ejmech.2025.118284
PMID:41138334
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综述 | 本文系统总结了152种具有抗骨质疏松活性的海洋天然产物,并探讨了其生物合成途径、全合成策略及临床转化挑战 | 首次系统梳理海洋来源(主要为海洋真菌)的抗骨质疏松天然产物,并整合基因组挖掘与合成生物学等新兴技术推动临床转化 | 未涉及具体临床实验数据,转化路径中的药效学与毒理学评估仍需深入 | 加速海洋天然产物在骨质疏松治疗领域的药物开发 | 海洋来源的天然产物(以聚酮类和萜类为主) | NA | 骨质疏松症 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | 文献数据、化合物结构信息 | 152种海洋天然产物 | NA | 海洋真菌 | NA | 医药 |
| 216 | 2025-12-04 |
Darkfield illumination enhancing artificial-intelligence-assisted digital microfluidics for on-site pathogen detection
2026-Jan-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2025.344831
PMID:41330666
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研究论文 | 本研究提出了一种集成暗场照明的数字微流控平台,通过人工智能辅助增强液滴检测性能,用于现场病原体检测 | 开发了具有可切换双模式光学系统的ITO-DMF平台,利用暗场成像显著提升液滴对比度,优化AI驱动的液滴识别和特征提取 | NA | 提高数字微流控系统中基于人工智能的液滴识别精度,实现自动化病原体检测 | 数字微流控平台中的液滴,以及临床样本中的肺炎支原体 | 计算机视觉 | 肺炎 | 暗场成像,荧光成像,qPCR | 深度学习模型 | 图像 | 临床样本 | NA | NA | NA | 医学 |
| 217 | 2025-12-03 |
Microplastics and microbial interactions in marine environments: A critical review on biogeochemical cycling and ecological impacts
2026-Jan, Marine pollution bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.marpolbul.2025.118891
PMID:41166776
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综述 | 本文通过文献计量分析和机制综述,系统探讨了海洋环境中微塑料与微生物之间的双向相互作用及其对生物地球化学循环和生态的影响 | 整合了文献计量分析(2015-2025)与机制综述,系统性地阐述了微塑料与微生物的双向相互作用及其对海洋生物地球化学循环的级联效应 | 在将分子水平机制与生态系统尺度结果(尤其是在深海和沉积物生境中)联系起来方面仍存在关键空白 | 研究海洋微塑料污染及其与微生物的相互作用对生物地球化学循环和生态系统的影响 | 海洋环境中的微塑料和微生物 | NA | NA | 文献计量分析,多组学技术,沉积物微生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 218 | 2025-11-21 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
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综述 | 本文综述了基因表达与蛋白质丰度之间关系的研究进展,重点关注不同实验环境和细胞背景下两者的关联性 | 系统分类和比较了基于不同相关性度量方法的研究,并整合了单细胞分析等最新技术进展 | 主要依赖相关性分析,对因果关系的解释有限 | 探讨基因表达与蛋白质丰度之间的关联程度及其在生物技术中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的关系研究 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、代谢工程、合成生物学 |
| 219 | 2025-11-21 |
Synthetic biology for scalable production of medical polyhydroxyalkanoates: Advances and applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108722
PMID:41046988
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综述 | 本文综述了合成生物学在医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产中的进展与应用 | 系统整合了CRISPR/Cas基因组编辑、启动子工程、核糖体结合位点优化等合成生物学技术,并引入嗜盐菌下一代工业生物技术提升生产经济性 | 未提供具体实验数据验证技术改进效果,主要基于现有研究进展的总结分析 | 探讨合成生物学技术促进医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产的进展与前景 | 聚羟基脂肪酸酯及其生产工艺 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, 启动子工程, 核糖体结合位点优化, 代谢通路优化, 形态工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 220 | 2025-11-18 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
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研究论文 | 本研究在热纤维梭菌中开发了一种热稳定的L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在热纤维梭菌中构建了具有175倍诱导动态范围和可忽略背景表达的热稳定L-阿拉伯糖诱导系统 | 未在其他梭菌属微生物中进行广泛验证 | 开发适用于热纤维梭菌的热稳定诱导表达系统 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | 合成生物学 | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | L-阿拉伯糖诱导系统,包含来自嗜热脂肪地芽孢杆菌T-6的诱导型启动子P和阻遏蛋白AraR | 工业生物技术, 能源 |