合成生物学相关文章
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当前共找到 312 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-01-28 |
An Optimization Scheme Based on the Simulated Annealing Algorithm for In situ DNA Microarray Synthesis
2026-Jan-21, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究将DNA微阵列原位合成建模为旅行商问题，并开发基于模拟退火算法的优化策略以提高合成效率 | 首次将DNA微阵列合成顺序优化问题转化为旅行商问题，并应用模拟退火算法显著减少合成周期 | 研究主要基于计算模拟，未涉及实际实验验证优化策略的物理合成效果 | 优化DNA微阵列原位合成的核苷酸添加顺序以提高效率和降低成本 | DNA微阵列合成过程 | 合成生物学 | NA | DNA微阵列合成 | 模拟退火算法、贪婪算法 | 序列数据 | 从10×10 nt到10000×120 nt的不同规模阵列 | NA | NA | NA | 基因编辑、药物开发、DNA数据存储 |
| 222 | 2026-01-28 |
Photoacid-Fueled Nanopropeller for the Controllable Motion of One-Hole Colloidal Motors with On-Board ATP Supply
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506850
PMID:41014546
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研究论文 | 报道了一种能够定向运动并现场合成ATP的旋转FF-ATP酶驱动胶体马达 | 利用光酸燃料驱动的纳米推进器，通过跨膜质子动力驱动ATP酶旋转，实现可控运动与现场ATP合成，并展示出向ADP/OH梯度的趋化性 | NA | 开发集自主运动与局部能量生产于一体的仿生推进平台 | 单孔胶体马达 | 合成生物学 | NA | 分层组装、光异构化 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生推进平台，整合运动与能量生产功能 | 生物医学, 合成生物学 |
| 223 | 2026-01-28 |
Synthetic biology empowers development of traditional Chinese medicine
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.010
PMID:41584699
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2026-01-27 |
Biomanufacturing polyhydroxyalkanoates from CO2: A critical review of advances, challenges, and solutions for autotrophic and hybrid systems
2026-Jan-23, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108810
PMID:41581798
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综述 | 本文系统评述了利用二氧化碳生物转化生产聚羟基脂肪酸酯的技术进展、挑战与解决方案，重点关注自养和混合系统 | 首次系统比较了直接自养与两步混合系统在CO2至PHA转化中的性能差距，并提出了基于合成生物学、反应器工程和系统集成的战略路线图 | 当前所有平台仍存在气液传质效率低、催化剂稳定性差（寿命<100小时）及下游分离能耗高等关键瓶颈，导致生产成本（3-8美元/公斤）远高于经济阈值 | 评估CO2生物转化为可生物降解聚合物PHA的技术现状，以推动气候缓解与可持续制造的融合 | 二氧化碳生物转化技术，特别是自养系统（如Cupriavidus necator）和混合系统 | 工业生物技术 | NA | 生物转化、合成生物学、反应器工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | Cupriavidus necator | NA | 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 225 | 2026-01-26 |
Engineering bacteriophages for gut health: precision antimicrobials and beyond
2026-Jan-22, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04038-5
PMID:41566387
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道健康中的应用，涵盖合成生物学和纳米技术进展，并探讨其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的治疗潜力 | 利用合成生物学和纳米技术重新设计噬菌体，增强其特异性、功能性和稳定性，作为微生物群中心疗法的多功能工具 | 面临长期稳定性、耐药性发展和规模化生产等挑战 | 探讨工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道疾病治疗中的应用，以应对微生物失调、抗生素耐药性和宿主-微生物相互作用破坏 | 工程化噬菌体及其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病、结直肠癌、感染性肠炎 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 226 | 2026-01-26 |
Contrasting genome composition and codon usage in Listeria monocytogenes temperate versus virulent phages
2026, Virus evolution
IF:5.5Q1
DOI:10.1093/ve/veaf100
PMID:41573078
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研究论文 | 本研究比较了单核细胞增生李斯特菌温和噬菌体与烈性噬菌体的基因组组成和密码子使用模式 | 首次系统比较了单核细胞增生李斯特菌中温和与烈性噬菌体的基因组大小、基因长度及密码子使用偏好的差异，揭示了噬菌体生活方式对密码子使用的塑造作用 | 研究仅针对单核细胞增生李斯特菌噬菌体，结论在其他细菌噬菌体中的普适性有待验证 | 探究噬菌体生活方式（温和型 vs 烈性）对基因组结构和密码子使用模式的影响 | 单核细胞增生李斯特菌的温和噬菌体（686个）和烈性噬菌体（1516个）的编码序列 | 微生物基因组学 | NA | 基因组比较分析、密码子适应指数计算 | NA | 基因组序列数据 | 2202个噬菌体编码序列（686个温和型 + 1516个烈性型） | NA | 单核细胞增生李斯特菌 | NA | 生物技术、合成生物学、治疗应用、生物防治 |
| 227 | 2026-01-25 |
ACCU-RATES: A web tool for accurate enzyme kinetics and initial reaction rate measurements
2026-Jan-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169654
PMID:41577122
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研究论文 | 开发了一个名为ACCU-RATES的网络工具，用于精确分析酶动力学数据和测定初始反应速率 | 采用微分形式的米氏方程对反应进程曲线进行数值拟合，无需依赖线性反应阶段，在数据噪声和低采样率条件下仍能提供可靠参数估计 | 需要至少两个时间点的产物积累或底物消耗曲线数据 | 开发精确测定酶初始反应速率和动力学参数的工具 | 酶反应进程曲线 | 生物信息学 | NA | 数值拟合方法 | 微分形式的米氏方程 | 酶反应动力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,医学（抑制剂发现和生物标志物检测） |
| 228 | 2026-01-25 |
The Importance of Being Imperfect: Structure and Function of Bacterial Amyloid
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517090
PMID:41347620
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综述 | 本文综述了细菌功能性淀粉样蛋白（FuBAs）的结构、组装和功能，强调其作为进化中间体和生物材料工程平台的潜力 | 通过冷冻电镜和计算研究揭示了FuBAs（如CsgA和FapC）的β-螺旋折叠结构，由不完美重复序列稳定，具有高稳定性和低多态性，并展示了其内在催化活性和分层机械性能 | NA | 探讨细菌功能性淀粉样蛋白的结构与功能关系及其在生物材料和合成生物学中的应用 | 细菌功能性淀粉样蛋白，特别是大肠杆菌的curli（CsgA）和假单胞菌的FapC | NA | NA | 冷冻电镜（cryo-EM）、整合计算研究 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌（Escherichia coli）、假单胞菌（Pseudomonas） | NA | 生物材料工程、合成生物学、催化、生物膜控制 |
| 229 | 2026-01-25 |
Engineered food-borne probiotics delivering checkpoint-inhibitor modulators
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004399
PMID:41497008
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研究论文 | 本文探讨了工程化食源性益生菌作为递送检查点抑制剂调节剂的新型策略，结合合成生物学、营养学和癌症免疫疗法 | 开发了工程化食源性益生菌，通过分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2等分子，在临床前模型中显示出显著的抗肿瘤效果，并首次在非小细胞肺癌的I期试验中验证了其安全性和有效性 | 存在定植和生物安全性方面的挑战 | 研究工程化食源性益生菌作为低毒性免疫治疗平台的潜力 | 工程化食源性益生菌、检查点抑制剂调节剂、癌症免疫疗法 | 合成生物学 | 肺癌 | 工程化益生菌、可控基因电路 | NA | 临床前模型数据、临床荟萃分析、I期试验数据 | 临床前小鼠模型、非小细胞肺癌I期试验患者 | 可控基因电路 | 食源性益生菌 | 分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2的生物传感器或递送系统 | 医学 |
| 230 | 2026-01-25 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
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研究论文 | 本文提出了一种利用工程化乳酸杆菌表达肿瘤杀伤细胞因子（如IL-12、IL-15和TRAIL）的新型生物治疗方法，旨在克服系统性细胞因子疗法的毒性问题 | 将免疫疗法与微生物组工程相结合，开发出局部作用、低毒性的工程化益生菌作为抗肿瘤生物治疗剂 | 研究目前主要基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发一种新型的低毒性抗肿瘤生物治疗方法 | 工程化乳酸杆菌及其表达的肿瘤杀伤细胞因子 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具（诱导型启动子、生物安全杀死开关） | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | 细胞因子表达系统（IL-12、IL-15、TRAIL表达通路） | 医学 |
| 231 | 2026-01-25 |
Structure of Chlamydomonas reinhardtii LciA guided the engineering of FNT family proteins to gain bicarbonate transport activity
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02200-9
PMID:41507353
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研究论文 | 本研究解析了莱茵衣藻LciA蛋白的结构，并基于结构指导成功改造了FNT家族蛋白，使其获得碳酸氢盐转运活性 | 首次报道了莱茵衣藻LciA的冷冻电镜结构，揭示了碳酸氢盐选择性的分子机制，并成功通过定点突变将细菌FNT家族亚硝酸盐通道改造为碳酸氢盐通道 | NA | 增强光合作用效率，为将CO2浓缩机制引入C3作物提供分子工具 | 莱茵衣藻LciA蛋白、细菌FNT家族蛋白NirC、莱茵衣藻亚硝酸盐通道NAR1.1/NAR1.5 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、定点突变、生长测定 | NA | 结构数据、功能数据 | NA | 定点突变 | 莱茵衣藻、细菌 | 碳酸氢盐转运通道 | 农业 |
| 232 | 2026-01-24 |
Microbial and molecular approaches for PFAS transformation in soils: prospects and limitations
2026-Jan-16, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d5ra07508d
PMID:41561006
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综述 | 本文综述了微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的潜力与限制 | 评估了微生物介导的PFAS转化、多组学研究提出的酶候选机制，以及分子工程和合成生物学的前景 | 尚无实验验证的酶能高效催化全氟C-F键断裂，转化多涉及前体化合物而非终端PFAS，环境因素、慢动力学和机制不确定性限制实际应用 | 探讨微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的科学发展和应用前景 | 全氟和多氟烷基物质（PFAS）及其在土壤中的转化 | 环境生物技术 | NA | 多组学、计算建模、分子工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 233 | 2026-01-23 |
Advancing cellulose degradation through synthetic biology: engineered pathways and microbial systems for sustainable biomass conversion
2026-Jan-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01328-0
PMID:41555463
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综述 | 本文综述了合成生物学在改善纤维素降解方面的最新进展，并强调了这些工具如何优化可持续农业和工业应用中的纤维利用 | 结合人工智能，合成生物学实现了微生物菌株的预测筛选和精准工程，以高效降解纤维素 | NA | 克服纤维素降解中的关键技术障碍，以支持循环生物经济原则 | 纤维素，作为植物纤维的主要成分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，包括工程基因、合成调节因子和优化酶的引入 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物系统 | 多酶复合物的理性重新设计，以改善纤维素酶的分泌和催化效率 | 农业, 工业生物技术 |
| 234 | 2026-01-23 |
Recoded Bacteriophage Genome for Bio-Orthogonal-Enabled Concentration and Detection of E. coli in Drinking Water
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00665
PMID:41436063
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研究论文 | 本研究通过高复杂度Golden Gate组装技术重新编码噬菌体基因组，开发了一种基于噬菌体的生物传感器，用于饮用水中大肠杆菌的浓缩和检测 | 利用HC-GGA技术直接合成噬菌体基因组，实现快速、准确、灵活的基因组修饰，并通过生物正交反应结合磁性纳米颗粒，显著提高检测效率和灵敏度 | NA | 开发一种基于合成生物学的噬菌体工程方法，以应对饮用水中有害病原体和指示性非致病菌的检测挑战 | 大肠杆菌作为饮用水中的指示生物 | 合成生物学 | NA | 高复杂度Golden Gate组装技术 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 生物传感器设计，通过基因组重编码实现炔烃修饰非经典氨基酸的掺入，并与叠氮化物共轭磁性纳米颗粒进行生物正交环加成反应 | 环境监测, 公共卫生 |
| 235 | 2026-01-23 |
Artificial Multidomain Ribosomally Synthesized and Post-translationally Modified Peptide Enzymes for Farnesylated Peptide Library Generation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00613
PMID:41451912
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研究论文 | 本文开发了一种人工多结构域核糖体合成和翻译后修饰肽酶系统，用于生成法尼基化肽库 | 设计了一种简单而稳健的方法，通过融合多个生物合成基因到一个高表达、可溶的构建体中，实现了大环肽的生产和酪氨酸侧链上C、C或C类异戊二烯的选择性修饰 | NA | 开发合成生物学方法以创建具有药物特性的肽基化学库 | 蓝细菌素生物合成途径及其酶 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）途径 | NA | NA | 估计最大规模为260万肽衍生物的库 | Gibson Assembly, BioBrick | 活体生物（未具体指定） | 多结构域酶融合构建体，用于大环化和异戊二烯化 | 药物发现 |
| 236 | 2026-01-22 |
High-throughput mechanical characterization of giant unilamellar vesicles by real-time deformability cytometry
2026-Jan-21, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01140j
PMID:41416886
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研究论文 | 本研究将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的高通量力学表征，并开发了基于模拟的模型和拟合策略来提取囊泡的面积膨胀模量 | 首次将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的力学表征，开发了两种互补的拟合策略和一种组合拟合方法，实现了无接触、高通量的囊泡群体力学分析 | NA | 开发一种高通量、无接触的方法来表征巨单层囊泡的力学性质 | 巨单层囊泡 | 软物质研究 | NA | 实时变形流式细胞术、相场模拟 | 基于模拟的力学模型 | 变形数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质研究 |
| 237 | 2026-01-22 |
From edits to insights: precision microbial engineering for systems biology
2026-Jan-19, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102705
PMID:41558158
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综述 | 本文综述了精准微生物工程在系统生物学中的应用，重点探讨了从基因编辑到系统洞察的技术进展 | 强调了精准扰动策略（如序列变异分析）在揭示基因水平扰动无法触及的生物学原理方面的创新，包括蛋白质序列-功能图谱和途径变异影响 | NA | 通过精准工程方法提升对生物功能的理解，并加速生物技术和合成生物学的进展 | 微生物系统，包括其基因组和细胞机制 | 系统生物学 | NA | 基因敲除文库、CRISPRi/a文库、精准扰动策略 | NA | 基因组序列数据、变异数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物（如细菌、酵母） | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 238 | 2026-01-22 |
InSillyClo, a User-Friendly Web Application to Assist Large-Scale Golden Gate Cloning and MoClo Workflows
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00553
PMID:41404662
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研究论文 | 本文介绍了InSillyClo，一个开源网络应用程序，用于辅助大规模Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | InSillyClo是首个专门处理大规模克隆工作流程中耗时且易错任务的软件工具，提供用户友好的界面和自动化数据生成 | NA | 开发一个工具来简化和自动化大规模克隆工作流程中的计算任务 | Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 支持用户定义的遗传设计和工作流程生成 | 工业生物技术 |
| 239 | 2026-01-22 |
Force Transmission by Minimal Focal Adhesion Complexes Induces Synthetic Cell Deformation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00645
PMID:41407554
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研究论文 | 本研究通过重构最小黏着斑样复合物于巨型单层囊泡中，揭示了仅由特定蛋白质-膜相互作用即可实现肌动蛋白募集、力传递及结构稳定性，为探究机械传感和工程化力响应仿生系统提供了可控合成生物学平台 | 首次在合成系统中重构了包含kindlin-2、talin-1等核心蛋白的最小黏着斑复合物，并展示了其能独立介导肌动蛋白网络形成、力传递及囊泡变形，无需完整细胞环境 | 研究基于简化合成系统，可能未完全模拟天然细胞中黏着斑的复杂调控机制和动态相互作用 | 探究黏着斑复合物进行力传递和机械传感的最小物理要求 | 由kindlin-2、talin-1、FAK、paxillin、zyxin和VASP等蛋白质与含PIP和整合素β1尾的膜组成的合成黏着斑样复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重构与膜锚定技术 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | 巨型单层囊泡（GUVs） | 黏着斑样复合物作为力传感与传递模块，结合肌动蛋白网络和非肌肉肌球蛋白IIa形成收缩系统 | 医学、工业生物技术 |
| 240 | 2026-01-22 |
Synthetic Biology Strategies for Activating Cryptic BGCs in Streptomyces: Engineering Native and Synthetic Promoters for Antibiotic Discovery
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c08473
PMID:41552574
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综述 | 本文综述了在链霉菌中利用天然和合成启动子工程激活隐性生物合成基因簇以发现新型抗生素的策略 | 系统整合了CRISPR激活系统和机器学习引导的启动子设计等前沿技术，用于激活隐性基因簇 | NA | 为天然产物发现提供启动子工具的系统级理解和转化应用指南 | 链霉菌中的隐性生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、CRISPR激活系统、机器学习引导设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 启动子重构（组成型和诱导型）用于激活隐性生物合成基因簇 | 医药 |