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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-07 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 探讨生物工厂如何通过集成自动化、人工智能和标准化工作流程来推动酵母工程的高通量发展 | 强调了从设计-构建-测试-学习循环向设计-构建-部署循环的转变,并展望了自主优化型“自驱动实验室”的未来 | 协议可变性和人工智能工具的集成仍是关键障碍 | 实现可扩展的合成生物学和自主酵母工程 | 酵母工程中的菌株开发流程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 22 | 2026-06-07 |
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.003
PMID:41581985
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综述 | 本文综述了基于无细胞系统的生物传感器的设计、功能和临床应用 | 强调了无细胞系统在生物传感器开发中的模块化、可定制化和快速响应优势,并探讨了与智能技术(如物联网)的结合 | 当前无细胞生物传感器面临保质期、灵敏度和可扩展性等限制 | 全面介绍无细胞生物传感器的设计原理和应用潜力 | 无细胞生物传感器及其在病原体检测、环境监测等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 体外转录和翻译 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 基因电路、信号输出策略 | 医疗保健, 环境科学, 农业, 食品安全 |
| 23 | 2026-06-07 |
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.008
PMID:41581984
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综述 | 本文探讨了无细胞系统与自动化和机器人技术结合在生物技术和生物工程领域的变革作用 | 系统性地分析了无细胞系统与自动化平台集成的设计、功能和局限性,并强调了人工智能和机器学习在实验设计和过程优化中的潜力 | 面临标准化、更稳健经济的无细胞提取物制备以及AI/ML集成等挑战 | 推动无细胞系统与自动化和机器人技术的融合,以加速发现、开发创新生物材料并拓宽生物技术应用 | 无细胞蛋白合成(CFPS)系统、自动化机器人平台(微流控装置、液体处理机器人、集成分析平台) | 生物工程 | NA | 无细胞蛋白合成(CFPS) | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学电路 | 生物技术,生物工程 |
| 24 | 2026-06-06 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化细菌用于癌症治疗中的最新进展,重点讨论了基因回路设计如何增强肿瘤特异性、调控治疗递送和调动宿主免疫系统 | 强调了通过理性工程实现时空控制和菌群行为编程的策略,为下一代微生物疗法提供指导 | 当前临床转化存在障碍,但本文未具体展开,仅作简要讨论 | 促进工程化细菌作为癌症治疗方法的开发和应用 | 工程化细菌及其基因回路设计 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学基因回路工具箱 | 细菌 | 基因回路,包括减毒控制、有效载荷释放和免疫调节回路 | 医学 |
| 25 | 2026-06-06 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
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综述 | 综述微生物黑色素的生物合成、功能见解及新兴研究挑战 | 系统总结了组学技术和基因工程在阐明微生物黑色素合成机制和提高产量中的关键作用,并提出了整合合成生物学、先进分析技术和安全性评估的未来研究方向 | 强调该领域仍存在挑战和争议,从基础研究到工业化之间存在差距 | 为微生物黑色素领域的研究者提供全面且关键的参考,推动基础研究与工业化的衔接 | 微生物黑色素及其产生菌(细菌和真菌) | NA | NA | 组学技术,基因工程,分析技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌,真菌 | NA | 工业生物技术 |
| 26 | 2026-06-06 |
A modular single- and dual-gene expression toolkit for Kluyveromyces marxianus
2026-Jan-23, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04794-4
PMID:41571921
|
研究论文 | 为马克斯克鲁维酵母开发了一套模块化的单基因和双基因表达工具包 | 首次基于筛选的pENO启动子和pHTX双向启动子,构建了适用于马克斯克鲁维酵母的单基因和双基因表达系统,并实现了与HEM1共表达增强血红素合成,提升外源蛋白产量 | 表达水平受遗传元件组合、碳源和培养时间影响,尚未测试在工业大规模发酵条件下的稳定性 | 扩展马克斯克鲁维酵母的合成生物学工具库,提高其作为工业蛋白生产底盘菌株的适用性 | 马克斯克鲁维酵母(Kluyveromyces marxianus) | 合成生物学 | NA | 基因表达系统构建 | NA | NA | 多个马克斯克鲁维酵母菌株 | NA | 马克斯克鲁维酵母(K. marxianus) | 单基因表达系统、双基因表达系统、双顺反子表达系统 | 工业生物技术,医药 |
| 27 | 2026-06-06 |
Breaking the cell wall for efficient DNA delivery to diatoms
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68562-6
PMID:41571648
|
研究论文 | 报道了两种优化方法用于高效递送DNA和Cas9核糖核蛋白复合物到模式硅藻三角褐指藻,并实现了体内组装和大片段质粒传递 | 首次发现通过电穿孔可在硅藻细胞内通过非同源或同源修复机制直接组装附加体(命名为DIVA技术),并将PEG方法成功应用于另一种硅藻Thalassiosira pseudonana | 未提及 | 开发高效遗传工具以促进硅藻合成生物学研究及可持续发展技术应用 | 硅藻(三角褐指藻和Thalassiosira pseudonana) | 合成生物学 | NA | 电穿孔、PEG转化、Cas9核糖核蛋白复合物递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻, Thalassiosira pseudonana | 附加体(线性或环形)的体内组装 | 工业生物技术, 环境 |
| 28 | 2026-06-06 |
Phyllosphere microbiome: Exploring the unexplored frontiers for precision agricultural and environmental sustainability
2026-Jan-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04788-2
PMID:41549150
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综述 | 综述叶际微生物组在可持续农业和环境保护中的潜能与挑战 | 强调利用组学技术、微生物联合工程和纳米递送系统克服叶际微生物实际应用的障碍 | 叶际微生物应用受限于环境不稳定性、田间持久性差及功能特征不完全 | 推动精准农业和环境可持续性发展 | 叶际微生物组(细菌、真菌、酵母) | 机器学习 | NA | 组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学、生态建模 | 植物 | NA | 农业, 环境 |
| 29 | 2026-06-06 |
Development of a high-performance synthetic promoter for plant-based bioproduction
2026-Jan-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04925-z
PMID:41553553
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研究论文 | 通过副逆转录病毒启动子的结构域改组开发了一种高性能合成启动子,其活性比CaMV35S高4倍,并在植物中实现了重组蛋白的高效生产 | 通过策略性的分子间结构域改组,将FMV和MMV全长度转录启动子的关键调控区域融合,生成了活性比CaMV35S高4倍的新型合成启动子FM,并验证了其与CRISPR-dCas9/VP64正交调控系统的兼容性 | 未明确说明,但可能包括植物表达系统的瞬时稳定性限制以及研究主要集中在模式植物中 | 开发用于植物合成生物学和分子农业的高性能组成型启动子,以最大化重组蛋白产量 | FM合成启动子以及其在三种模式植物和转基因植株中的功能 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、结构域改组、GUS检测、qRT-PCR、组织化学染色、CRISPR-dCas9/VP64转录激活、抗病毒测定 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性测定数据 | 三种模式植物(烟草、本氏烟草、矮牵牛)用于瞬时表达;稳定转基因烟草和拟南芥品系 | CRISPR-dCas9/VP64 | 烟草(Nicotiana tabacum)、本氏烟草(Nicotiana benthamiana)、矮牵牛(Petunia × atkinsiana)、拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 合成启动子FM驱动的抗病毒肽scytovirin表达系统 | 医学、分子农业 |
| 30 | 2026-06-06 |
Research and Application of the Polyene Macrolide Antibiotic Nystatin
2026-Jan-19, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31020330
PMID:41599380
|
综述 | 系统阐述了多烯大环内酯类抗生素制霉菌素的多组分化学性质、靶向麦角固醇的作用机制、质量控制分析技术、临床应用及组合疗法,以及在生物合成和基因编辑技术方面的最新进展 | 重点介绍了基因编辑技术特别是CRISPR/Cas9在靶向敲除毒性成分相关基因、优化生产菌株以提高制霉菌素产量和纯度方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或临床研究结果的量化分析 | 为制霉菌素的进一步研究和临床应用提供参考,展望通过结构优化、创新递送系统和合成生物学策略提高其安全性和疗效的未来发展方向 | 制霉菌素的多组分化学性质、作用机制、毒性成分RT6、质量控制方法、临床应用、生物合成途径及基因编辑技术 | NA | 浅表真菌感染、口腔疾病、阴道炎、外耳炎 | CRISPR/Cas9, I型聚酮合酶途径 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 制霉菌素A的I型聚酮合酶组装机制及其后续修饰过程 | 医学 |
| 31 | 2026-06-06 |
Stem cells in organogenesis and regeneration
2026-Jan-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04889-z
PMID:41549301
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综述 | 综述了干细胞在器官发生与再生中的主要类型、来源、调控信号通路及临床转化进展 | 整合胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞及类器官模型,结合CRISPR、3D生物打印和合成生物学等前沿技术,全面探讨干细胞生物学与临床转化潜力 | 未详细讨论具体实验局限性或定量比较不同干细胞疗法的效果 | 概述干细胞在器官发生与再生中的关键作用、调控机制及临床转化进展 | 干细胞(胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞)及类器官 | 机器学习 | NA | CRISPR, 3D生物打印, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR, 3D生物打印, 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 32 | 2026-06-06 |
YhfH functions as a tri-function RNA in Bacillus thuringiensis BMB171
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1528
PMID:41562254
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研究论文 | 揭示了苏云金芽孢杆菌BMB171中YhfH RNA作为一种三功能RNA的作用机制 | 首次发现YhfH RNA同时具有小RNA、反义RNA和信使RNA三种功能,即三功能RNA | NA | 阐明YhfH RNA的多功能调控机制及其在合成生物学中的应用潜力 | 苏云金芽孢杆菌BMB171菌株中的YhfH RNA | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | 苏云金芽孢杆菌BMB171 | 三功能RNA调控回路 | 合成生物学 |
| 33 | 2026-06-06 |
Marine-derived antimicrobial peptides (AMPs): Blue biotechnological assets for sustainable healthcare and circular bioeconomy
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.08.002
PMID:41581932
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综述 | 综述海洋源抗菌肽作为可持续医疗和循环生物经济资源的蓝生物技术资产 | 强调了海洋源抗菌肽在应对抗菌素耐药性危机中的独特优势,包括低耐药倾向、多功能生物活性,以及通过基因组学、宏基因组学、机器学习和合成生物学等先进技术推动发现与优化的创新方法 | 讨论了生产可扩展性和监管框架等关键挑战,这些是商业化面临的主要障碍 | 综述海洋源抗菌肽在可持续医疗和循环生物经济中的应用潜力,并为其商业化路径提供清晰方向 | 海洋源抗菌肽,源自无脊椎动物、极端微生物和蓝细菌等海洋生物 | 计算生物学、合成生物学 | NA | 基因组学、宏基因组学、机器学习、合成生物学、异源表达、海洋生物质转化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗、水产养殖、食品安全、环境修复 |
| 34 | 2026-06-06 |
High-throughput screening of biomolecules using cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.11.001
PMID:41581987
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综述 | 探索基于无细胞系统的高通量筛选原理、平台及应用 | 该系统绕开细胞生理限制,实现从DNA或RNA模板直接快速可调地表达生物分子,并与微孔板、液滴微流控及纸基设备等高通量平台集成 | 高试剂成本及有限的翻译后修饰 | 推动下一代生物分子筛选和治疗开发 | 生物分子(化合物、核酸、蛋白质) | 合成生物学、药物发现、诊断学、蛋白质工程 | NA | 无细胞系统、高通量筛选、液滴微流控、数字PCR、质谱 | NA | 荧光、发光、质谱、数字PCR信号 | NA | NA | 大肠杆菌、小麦胚芽、兔网织红细胞 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 35 | 2026-06-06 |
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.009
PMID:41581993
|
综述 | 探讨人工智能与无细胞系统的整合,关注最新进展、工业应用及未来方向 | 通过深度学习发现抗菌肽和主动学习实现蛋白产量34倍提升,展示了AI在无细胞系统优化中的显著成效 | 存在数据需求、模型可迁移性和可扩展性等挑战 | 研究AI在无细胞系统中的应用,推动合成生物学发展 | 无细胞系统,包括蛋白质合成和代谢过程 | 机器学习 | NA | 无细胞蛋白质合成 | 深度学习, 主动学习, 贝叶斯优化, 神经网络 | 实验数据 | NA | NA | NA | 代谢通路 | 生物制造, 制药, 诊断 |
| 36 | 2026-06-06 |
Harnessing Cannabis sativa as a dual-use platform for biohydrogen production and pharmaceutical synthesis: a hypothesis and theory
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1833491
PMID:42245109
|
假设与理论 | 提出一种利用工程化大麻进行生物氢生产和药物合成的双用途生物炼制范式 | 提出利用工程化大麻的光合作用驱动绿色氢生产,同时保持其药用价值,并利用现有受控环境农业基础设施 | NA | 探索大麻作为双用途平台在生物氢生产和药物合成中的应用 | 工程化大麻 | 合成生物学 | NA | 光合电子流重定向、氢化酶活性工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、氢化酶工程 | 大麻 (Cannabis sativa) | 光合电子流重定向至氧保护氢化酶通路,用于分子氢生成 | 能源、医药、工业生物技术 |
| 37 | 2026-06-05 |
Microbial-driven nature-based solutions for environmental antimicrobial resistance and emerging contaminants: mechanisms, platform trade-offs, and decision framework
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1804764
PMID:42238881
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综述 | 本文综述了微生物驱动的自然解决方案在应对环境抗菌素耐药性和新兴污染物中的机制、平台权衡及决策框架 | 提出了一个连接环境来源、微生物机制、平台设计和监测指标的微生物自然解决方案决策框架,并整合了微生物生态学、合成生物学和组学方法的设计思路 | 面临可扩展性、长期性能、生态风险和监管接受度方面的挑战 | 探讨微生物驱动的自然解决方案在环境抗菌素耐药性和新兴污染物缓解中的应用与决策框架 | 抗菌素耐药性和新兴污染物(包括药物、个人护理产品、微塑料和内分泌干扰物) | 机器学习 | NA | 微生物生态学、合成生物学、组学方法 | NA | NA | 2000年至2024年间发表的文献 | NA | NA | NA | 环境 |
| 38 | 2026-06-05 |
Diterpenoids in medicinal plants: structure, distribution, biological activities, biosynthesis, and bioengineering prospects
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1833614
PMID:42239869
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综述 | 系统总结药用植物中二萜类化合物的结构、分布、生物活性、生物合成途径及生物工程前景 | 全面整合了二萜类化合物的结构分类、功能机制与合成生物学应用,并提出了机器学习在药理学和酶工程中的未来方向 | 未深入讨论具体化合物的临床前或临床试验数据,可能缺乏实际应用案例的定量分析 | 系统梳理二萜类化合物的研究现状,为发现新活性化合物、阐明完整生物合成途径及可持续生产提供基础 | 药用植物中的二萜类化合物 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 39 | 2026-06-04 |
Gut microecology empowers cancer immunotherapy: commensal microbiota-mediated mechanisms and translational prospects of PD-1/PD-L1 therapy
2026-Jan-29, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 系统探讨共生微生物群在PD-1/PD-L1免疫治疗中的调控作用及其转化前景 | 通过多机制解析肠道微生物增强PD-1/PD-L1阻断疗效,包括代谢产物重塑肿瘤微环境和激活免疫通路,并整合多组学、合成生物学及精准干预策略 | 临床研究有限,基于微生物组的个性化免疫治疗策略仍需进一步验证 | 阐明肠道微生物群通过代谢产物和免疫途径调控PD-1/PD-L1免疫治疗效果的机制,并评估粪便微生物移植和益生菌干预的转化潜力 | 肠道共生微生物与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 机器学习 | 癌症 | 粪菌移植、益生菌干预、多组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 40 | 2026-06-04 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的应用,以推动农业、环境及未来技术的发展 | 利用新基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能实现“智能植物”与微生物群落协同工程,突破传统单基因改造限制 | 未具体说明现有技术在实际应用中的生物安全风险或规模化部署的挑战 | 推动合成生物学驱动下一次农业革命,并拓展植物工程在制造、基础设施、传感和修复领域的应用 | 植物(核、叶绿体、线粒体基因组)及其相关微生物(真菌、细菌、古菌) | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物, 真菌, 细菌, 古菌 | 环境响应电路、形态改变电路、威胁响应电路 | 农业, 环境, 制造, 基础设施, 传感, 修复 |