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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-03-06 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DNA-Diffusion的生成式人工智能框架,用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用机器学习训练DNA可及性数据,生成能重现内源转录因子结合语法并增强细胞类型特异性的合成调控元件 | NA | 系统设计调控元件以实现精确的基因表达控制 | 合成调控元件及其在基因调控中的应用 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式人工智能框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件库在三种细胞系中验证 | NA | 多种细胞系 | 紧凑调控元件设计 | 医学 |
| 22 | 2026-03-03 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将小鼠H3K9甲基转移酶和HP1引入酿酒酵母,探究H3K9甲基化及其阅读器分子HP1对转录和染色质压缩的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基转移酶和HP1,以简化系统研究其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行,可能不适用于其他生物或染色质区域;H3K9甲基化和HP1单独不足以改变高阶染色质结构 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的重要性及其对转录和染色质结构的影响 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 引入小鼠H3K9甲基转移酶和HP1以模拟异染色质表观基因组系统 | 基础生物学研究 |
| 23 | 2026-03-03 |
Imagining an ethics for synthetic biology
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1746379
PMID:41767306
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2026-03-01 |
Exploring structural, functional, evolutionary, and genetic characteristics of sugar transporters in maize and their roles in abiotic stress tolerance
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342990
PMID:41746965
|
研究论文 | 本文通过生物信息学分析鉴定了玉米中的60个糖转运蛋白,并研究了它们在非生物胁迫耐受性中的潜在作用 | 首次在玉米中系统鉴定和表征糖转运蛋白家族,并通过干湿实验结合的方法揭示了它们在非生物胁迫响应中的调控机制 | 研究主要基于生物信息学预测和初步实验验证,需要进一步的体内功能验证来确认转运蛋白的具体作用机制 | 探索玉米糖转运蛋白的结构、功能和进化特征,及其在非生物胁迫耐受性中的作用 | 玉米糖转运蛋白家族 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq, qRT-PCR, 系统发育分析, 共表达分析, 分子对接 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质序列数据 | 60个玉米糖转运蛋白 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 25 | 2026-02-27 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的最新进展,旨在推动农业革命并拓展植物工程在制造、传感和修复等新领域的应用 | 提出将植物及其共生微生物视为整体系统进行工程化设计,并整合基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能等新技术 | NA | 探讨合成生物学如何通过先进基因工程技术驱动农业革命并拓展植物工程的新应用领域 | 植物及其共生微生物(真菌、细菌、古菌) | NA | NA | 基因组构建工具、计算机辅助设计、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物、真菌、细菌、古菌 | 响应环境变化、改变形态或应对威胁的智能植物电路 | 农业, 环境, 制造业, 基础设施, 传感, 修复 |
| 26 | 2026-02-26 |
The rise and future of peptide-based antimicrobials
2026-Jan-30, Journal of microbiology (Seoul, Korea)
DOI:10.71150/jm.2510002
PMID:41736369
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综述 | 本文综述了肽类抗生素的兴起与未来,涵盖其发现、优化和应用的最新进展,包括结构分类、作用机制以及人工智能和合成生物学等新兴策略 | 整合了人工智能、合成生物学和现代递送技术等新兴策略,以应对抗菌素耐药性挑战,并系统分类肽类抗生素以指导其治疗潜力 | NA | 探讨肽类抗生素作为传统小分子药物替代品的潜力,以应对日益严重的抗菌素耐药性威胁 | 肽类抗生素,包括天然、半合成和全合成类型,以及其结构分类如α-螺旋、β-折叠、环状和延伸形式 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 27 | 2026-02-26 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
|
综述 | 本文综述了生物铸造厂如何通过整合自动化、人工智能和标准化工作流程,推动高通量酵母工程向自主化和规模化方向发展 | 探讨了从DBTL(设计-构建-测试-学习)循环向自主优化的“自动驾驶实验室”和Design-Build-Deploy(设计-构建-部署)循环的转变趋势 | 仍存在协议可变性、AI工具整合不足以及国际标准、数据治理和伦理保障需要协调等关键障碍 | 推动酵母工程的高通量、自主化和规模化发展,以实现经济、可持续的大规模生物制造 | 酵母工程、生物铸造厂及其在菌株开发中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | 预测模型(AI驱动) | NA | NA | CRISPR-Cas9(提及基因组编辑,但未明确指定工具) | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 28 | 2026-02-25 |
Genetic make-up and regulation of the L-lysine biosynthesis pathway in Vibrio natriegens
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.02.867
PMID:41732680
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研究论文 | 本研究分析了Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径的组成与调控,为将其开发为氨基酸过量生产菌株提供基础 | 发现了一种新的单功能天冬氨酸激酶同工酶Vn.LysC2,该酶对所有L-天冬氨酸家族氨基酸的变构抑制不敏感,并鉴定了L-天冬氨酸半醛脱氢酶和二氢二吡啶酸合酶的功能重复基因 | NA | 分析Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关氨基酸生物合成途径的遗传组成与调控机制,以支持未来的代谢工程应用 | Vibrio natriegens DSM759菌株及其L-赖氨酸和L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | RNA测序、基因删除突变体生长表型分析、酶活性测定 | NA | 基因组测序数据、转录组数据 | NA | NA | Vibrio natriegens | L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 29 | 2026-02-24 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
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研究论文 | 本研究在嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae中建立了高通量核基因组工程框架,并验证了基因组位置对转基因表达效率无显著影响 | 首次通过实验验证了C. merolae中40个基因间位点作为中性整合位点,并建立了机器人辅助的高通量转化方法 | 研究仅针对C. merolae这一特定藻类物种,结论在其他生物中的普适性尚未验证 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响,建立合成生物学底盘生物的基因组工程平台 | 嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人技术、异源蛋白和代谢产物检测 | NA | 基因组数据、蛋白质表达数据、代谢产物数据 | 40个基因间位点(覆盖16条染色体),验证了38个位点 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae(嗜热嗜酸红藻) | 异源异戊二烯合酶表达系统 | 工业生物技术 |
| 30 | 2026-02-24 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
|
综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程化细菌在癌症治疗中的最新进展,重点探讨了遗传电路设计如何提升肿瘤特异性、调控治疗递送和激活宿主免疫系统 | 通过组合遗传电路策略实现细菌疗法的可编程时空控制和群体行为调控,推动细菌从简单定植剂向多功能治疗平台的转变 | 未提及具体实验数据或临床转化中的具体技术障碍细节 | 探讨如何通过理性工程化设计下一代微生物癌症疗法 | 工程化细菌及其遗传电路在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤特异性靶向电路、治疗载荷释放调控电路、免疫调节电路、时空控制电路和群体行为电路 | 医学 |
| 31 | 2026-02-23 |
Bio-Oil from Phototrophic Microorganisms: Innovative Technologies and Strategies
2026-Jan-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010011
PMID:41718349
|
综述 | 本文综述了利用光养微生物生产生物油的技术与策略,重点讨论了热化学转化技术和生物优化方法的进展 | 强调将先进热化学转化技术与定向生物优化策略有效结合,是实现光养微生物规模化生产生物油的最有前景途径 | NA | 探讨利用光养微生物生产液体生物燃料的可行技术与策略,以支持低碳能源系统转型 | 光养微生物(特别是微藻)及其生物油生产 | NA | NA | 水热液化、快速热解、催化提质(加氢脱氧等)、菌株优化、胁迫诱导、共培养、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 光养微生物(微藻) | NA | 能源 |
| 32 | 2026-02-23 |
Breaking the cell wall for efficient DNA delivery to diatoms
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68562-6
PMID:41571648
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研究论文 | 本文提出了针对硅藻(特别是三角褐指藻和假微型海链藻)的高效DNA递送方法,包括优化的电穿孔和PEG转化技术 | 开发了高效的DNA递送方法,首次实现Cas9核糖核蛋白复合体在硅藻中的高效递送,并发现硅藻体内组装(DIVA)新机制 | NA | 开发适用于硅藻的遗传工程工具,以提升其作为细胞工厂的利用潜力 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)和假微型海链藻(Thalassiosira pseudonana) | 合成生物学 | NA | 电穿孔、PEG转化、Cas9核糖核蛋白复合体递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻, 假微型海链藻 | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 33 | 2026-02-21 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
|
综述 | 本章概述了活体生物治疗产品(LBPs)的定义、作用机制、临床应用、监管框架以及未来发展趋势 | 强调了LBPs与传统益生菌、益生元和合生元的区别,并展望了其在代谢、神经和免疫介导疾病等胃肠道以外领域的应用潜力,以及合成生物学、CRISPR基因组编辑和多组学技术如何推动其向更精准和个性化的疗法发展 | LBPs的临床开发面临菌株选择、复杂制造工艺、在脆弱共病人群中的活性和安全性问题,以及应对不断演变的监管框架等关键挑战 | 概述活体生物治疗产品(LBPs)的现状、作用机制、临床应用、监管环境及未来方向 | 活体生物治疗产品(LBPs) | NA | NA | 合成生物学、CRISPR基因组编辑、多组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 34 | 2026-02-21 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
|
综述 | 本章综述了重组活体生物治疗药物(rLBPs)开发的最新进展,包括利用合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法设计用于恢复微生物平衡、调节免疫和治疗特定疾病的工程化微生物 | 整合了合成生物学、多组学和AI/ML等前沿技术来设计和优化重组活体生物治疗药物,强调通过局部作用或肠-体轴相互作用实现精准治疗 | 在可扩展性、安全性和临床应用方面仍面临重大挑战,需要持续的创新、严格的临床评估和转化策略 | 开发用于人类健康治疗的下一代重组活体生物治疗药物 | 基因和代谢工程化的微生物物种 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、多组学、人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | 基因工程 | 微生物物种 | 用于恢复微生物平衡、调节免疫和治疗特定疾病的工程化微生物 | 医学 |
| 35 | 2026-02-21 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
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综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为新型活体生物治疗剂来源的潜力 | 将人类生殖道微生物组定位为新型活体生物治疗剂的创新来源,并介绍了阴道微生物移植等新兴策略 | NA | 探索生殖道微生物组在开发下一代活体生物治疗剂中的应用潜力 | 人类生殖道微生物组,特别是阴道微生物群落 | NA | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、妊娠并发症 | 合成生物学、基因工程、微生物组科学 | NA | NA | NA | NA | 人类 | NA | 医学 |
| 36 | 2026-02-21 |
Recent advances of microbial medicine to prevent and treat cardiovascular disease
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.028
PMID:41714082
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综述 | 本章探讨了微生物医学在预防和治疗心血管疾病方面的最新进展,重点关注肠道微生物组及其代谢产物在心血管健康中的作用,以及基于微生物组的干预策略 | 系统阐述了肠道微生物组作为心血管健康关键调节器的新角色,并介绍了工程化微生物、粪便微生物移植等合成生物学方法作为心血管疾病治疗的新兴策略 | 存在菌株特异性、递送系统和监管框架方面的挑战,且许多干预措施仍处于临床前或早期临床研究阶段 | 探索微生物医学在心血管疾病预防和治疗中的应用潜力 | 人类肠道微生物组及其代谢产物(如短链脂肪酸、氧化三甲胺、吲哚衍生物) | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程化微生物 | NA | 医学 |
| 37 | 2026-02-21 |
Recombinant live biotherapeutics and synthetic biology: Recent advancement and perspective
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.004
PMID:41714087
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综述 | 本文综述了重组活体生物治疗产品(LBPs)在合成生物学中的最新进展与前景,重点探讨其原理、宿主免疫反应、递送机制及临床应用 | 强调了合成生物学在LBPs开发中的关键作用,包括精准微生物修饰、生物安全策略和个性化微生物联合体的未来潜力 | NA | 探讨活体生物治疗产品(LBPs)作为疾病治疗新策略的发展与应用 | 人类肠道微生物群及工程化活微生物(LBPs) | 合成生物学 | 代谢紊乱、病原体感染、炎症性肠病(IBD)、癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌(E. coli)、酿酒酵母(S. cerevisiae)、枯草芽孢杆菌(B. subtilis)、哺乳动物细胞 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 医学 |
| 38 | 2026-02-21 |
Live biotherapeutics in cancer therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.002
PMID:41714084
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综述 | 本文综述了活体生物治疗剂在癌症治疗中的应用,包括其机制、优势及未来发展方向 | 探讨了活体生物治疗剂作为下一代癌症治疗策略的潜力,并强调了合成生物学和组学技术在精准方法中的应用 | 面临安全性、制造、监管和个性化方面的挑战 | 研究活体生物治疗剂在癌症治疗中的作用和潜力 | 活体生物治疗产品,包括原生和工程化的细菌和病毒 | NA | 结肠癌、胃癌、胰腺癌、肝癌 | 合成生物学、组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 39 | 2026-02-21 |
Editorial: Advancing plant defense: genome editing, RNAi, and synthetic biology for sustainable pest control
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1785705
PMID:41717108
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2026-02-20 |
Gut microecology empowers cancer immunotherapy: commensal microbiota-mediated mechanisms and translational prospects of PD-1/PD-L1 therapy
2026-Jan-29, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文系统探讨了肠道菌群在调节PD-1/PD-L1免疫疗法反应中的关键作用及其转化前景 | 综述了肠道菌群通过代谢物产生和免疫通路激活等多机制增强PD-1/PD-L1疗法疗效,并探讨了基于菌群的个性化免疫治疗策略的临床前前景 | NA | 探讨肠道菌群在PD-1/PD-L1免疫疗法中的调控作用及转化应用 | 肠道共生微生物及其与PD-1/PD-L1免疫疗法的相互作用 | NA | 癌症 | 多组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |