本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-10 |
Advancements and expanding applications of CAR-T cell therapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802718
PMID:41953032
|
综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在肿瘤学及免疫介导疾病中的进展与应用,包括其机制基础、工程策略、安全控制系统及面临的挑战 | 探讨了CAR-T疗法从血液恶性肿瘤扩展到自身免疫疾病和慢性病毒感染的新应用领域,并分析了通用型、同种异体工程策略及新型基因递送平台等前沿技术 | 存在可扩展性、制造标准化和长期免疫持久性等转化障碍,以及生物学和物流方面的重大挑战 | 评估CAR-T细胞疗法在肿瘤学和免疫介导疾病中的进展、应用潜力及未来发展方向 | CAR-T细胞疗法,包括其工程策略、安全控制系统和基因递送平台 | NA | 血液恶性肿瘤,自身免疫疾病(如多发性硬化症、系统性红斑狼疮),慢性病毒感染(如HIV、乙型肝炎) | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 逻辑门控和可诱导系统 | 医学 |
| 22 | 2026-04-10 |
Deep learning on protein language model embeddings unlocks accurate prediction of protein solubility
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1716930
PMID:41953440
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DeepSolNet的深度学习模型,利用蛋白质语言模型嵌入来准确预测蛋白质溶解度 | 首次将先进的蛋白质语言模型ESM Cambrian与双向LSTM、CNN和注意力机制相结合,构建多模块架构用于溶解度预测,在独立测试集上达到最先进性能 | 模型在独立测试集上的准确率为0.53,仍有提升空间;未明确说明训练数据的具体来源和规模限制 | 开发准确预测蛋白质溶解度的工具,以解决原核表达系统中蛋白质错误折叠的问题 | 异源蛋白质,特别是大肠杆菌表达系统中的蛋白质 | 机器学习 | NA | 深度学习,蛋白质语言模型 | 双向LSTM,CNN,注意力机制 | 蛋白质序列 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学,蛋白质工程 |
| 23 | 2026-04-07 |
Engineering Trichoderma-mediated plant defense against bacterial phytopathogens: Micro-and nanobiotechnological strategies
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026002
PMID:41938783
|
综述 | 本文综述了利用木霉属真菌通过微纳米生物技术策略工程化增强植物对细菌性植物病原体的防御能力 | 整合多组学、CRISPR基因组编辑、合成生物学与纳米技术,将木霉开发为可持续精准作物保护的下一代平台 | 仍面临田间转化、生物安全与监管方面的挑战 | 开发可持续且精准的作物保护策略以对抗细菌性植物病原体 | 木霉属真菌及其与植物和细菌病原体的相互作用 | 合成生物学与农业生物技术 | 植物细菌性病害 | 多组学分析、CRISPR基因组编辑、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学方法 | 木霉属真菌 | 通过基因编辑和合成生物学方法定制具有增强生物防治效率的菌株 | 农业 |
| 24 | 2026-04-07 |
Engineering the holobiont: Synthetic biology strategies for reversing bioenergetic collapse in radiation enteritis
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026003
PMID:41938784
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学策略逆转辐射性肠炎中生物能量崩溃的方法 | 提出从经验性益生菌补充转向微生物合成生物学,通过工程化共生菌作为活体氧汇、基因驯化及生物计算机设计来理性重编程肠道生态系统 | NA | 逆转辐射性肠炎中的生物能量崩溃,改善长期癌症生存率 | 肠道全息生物体(肠道微生物生态系统) | 合成生物学 | 辐射性肠炎 | 微生物合成生物学、基因工程、Gut-on-a-Chip验证 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, STALEMATE | 工程化共生菌 | 布尔逻辑门生物计算机、cGAS-STING轴调节、衣康酸分流代谢重编程 | 医学 |
| 25 | 2026-04-06 |
Recent advances on fermentation of mustard plant (Brassica juncea L.): microbial community, fermentation processing and sensorial quality: a review
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1784857
PMID:41883800
|
综述 | 本文系统综述了芥菜发酵过程中微生物群落、加工工艺与感官品质的最新研究进展 | 整合了多组学与合成生物学技术作为未来研究方向,以阐明风味形成机制并开发标准化工艺 | NA | 总结芥菜发酵领域的研究进展,以支持发酵芥菜产品风味一致、质量提升与安全生产的可持续发展 | 芥菜(Brassica juncea L.)及其发酵产品 | NA | NA | 多组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 26 | 2026-04-06 |
Subcellular localization of enzymes involved in the biosynthesis of digoxin in Digitalis lanata
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1703671
PMID:41884437
|
研究论文 | 本研究确定了毛地黄中地高辛生物合成途径中三种已知酶的亚细胞定位 | 首次揭示了地高辛生物合成途径中三种关键酶(P450、3HSD和P5R2)的亚细胞定位,并发现毛地黄P450定位于内质网,与哺乳动物线粒体定位的CYP11A1形成对比 | 仅研究了三种已知酶的定位,整个心脏糖苷生物合成途径仍不完全清楚 | 阐明地高辛生物合成途径的亚细胞空间组织 | 毛地黄(Digitalis lanata)中地高辛生物合成相关的三种酶:细胞色素P450甾醇侧链裂解酶(P450)、3-羟基类固醇脱氢酶(3HSD)和孕酮-5-还原酶2(P5R2) | NA | 心力衰竭、心房颤动 | 荧光标记蛋白表达、亚细胞定位分析 | NA | NA | NA | NA | 烟草叶片 | NA | 医药 |
| 27 | 2026-04-06 |
Smart control of CAR-T cells: emerging strategies for safer and more effective cancer immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1746673
PMID:41884842
|
综述 | 本文综述了用于实现CAR-T细胞智能控制的最新策略,旨在提高癌症免疫疗法的安全性和有效性 | 聚焦于通过可调控、可逆和情境依赖的机制来增强CAR-T疗法安全性和精确性的新兴智能控制系统,包括可诱导CAR表达、逻辑门控受体以及利用药物、光或生物材料的外部控制系统 | NA | 总结旨在以高精度调控CAR-T细胞活化、持久性和细胞毒性的关键分子、遗传和合成方法 | CAR-T细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 传感器电路、反馈回路、逻辑门控受体 | 医学 |
| 28 | 2026-04-06 |
Recent Progress in Sequence Optimization of mRNA Vaccine: Biological Mechanism, Quantitative Metrics, and Computational Model
2026, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322261431255
PMID:41883679
|
综述 | 本文深入分析了mRNA疫苗序列优化的最新进展,综述了该领域的最新计算和生物学方法,并提出了当前模型的局限性 | 综合探讨mRNA疫苗序列优化的生物机制、定量指标和计算模型,为有效mRNA疫苗设计提供新见解 | 当前模型难以应对生物系统的复杂性,需要进一步研究以优化不同生物背景和治疗应用中的mRNA序列 | 优化mRNA疫苗序列以提升其效力、稳定性和免疫原性 | mRNA疫苗序列 | 合成生物学与计算生物学 | 传染病 | 合成生物学方法和计算模型 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 29 | 2026-04-05 |
Synthetic soils for ecological and synthetic biology applications
2026-Jan-02, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag012
PMID:41860425
|
综述 | 本文综述了合成土壤在生态学和合成生物学中的应用,探讨了其优势、局限性和未来发展方向 | 提出了“合成土壤”作为标准化可控实验平台的概念,用于在简化定义的环境中系统研究土壤理化性质与生物组分的相互作用 | 合成土壤无法完全复制自然土壤的复杂性和异质性,其简化设计可能忽略某些关键生态过程 | 为生态学和合成生物学研究提供标准化可控的实验平台,以理解土壤中生物与非生物组分的相互作用 | 合成土壤系统及其在生态过程和合成生物学应用中的表现 | 生态学与合成生物学交叉领域 | NA | 合成土壤构建与表征技术 | NA | 文献综述与系统分析 | NA | NA | 微生物、植物、土壤动物等 | NA | 环境, 农业 |
| 30 | 2026-04-03 |
Achieving bottom-up ethical, legal, and societal implications and responsible research and innovation in the synthetic biology research community from the Japanese context
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1716198
PMID:41923881
|
研究论文 | 本文探讨了在合成生物学研究中,从日本背景出发如何实现自下而上的伦理、法律和社会影响以及负责任的研究与创新 | 聚焦于ELSI中的规则制定,强调学术界在自下而上倡议方面的不足,并提出三个关键行动领域 | NA | 促进合成生物学研究社区在伦理、法律和社会影响方面的负责任创新 | 合成生物学研究社区及其规则制定过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2026-04-03 |
Expanding the genetic code: phage-driven evolution of pyrrolysyl-synthetase for site-specific incorporation of synthetic phenylalanine and tyrosine derivatives
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1737987
PMID:41924351
|
研究论文 | 本研究利用噬菌体辅助非连续进化技术,优化了来自Methanosarcina mazei的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶,以增强其对酪氨酸和苯丙氨酸衍生物的识别与掺入能力 | 采用PANCE技术高效进化PylRS,显著提高了对目标非经典氨基酸的掺入效率,并识别出结合口袋中的关键突变簇 | NA | 扩展遗传密码,通过工程化PylRS实现合成苯丙氨酸和酪氨酸衍生物的位点特异性掺入 | 吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其变体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体辅助非连续进化,荧光掺入测定,质谱分析 | NA | 序列数据,荧光数据,质谱数据 | NA | PANCE | NA | NA | 合成生物学 |
| 32 | 2026-03-29 |
De novo chemoenzymatic construction of lipid membranes
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.013
PMID:41895902
|
研究论文 | 本文提出了一种化学酶促策略,在水溶液中从头构建磷脂和膜 | 开发了一种模块化方法,通过天然化学连接将脂肪酸合成与磷脂组装结合,实现无预存双层的膜构建 | NA | 为自下而上的合成生物学和生命起源研究提供从头构建膜的平台 | 磷脂和膜 | 合成生物学 | NA | 化学酶促合成,天然化学连接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,生命起源研究 |
| 33 | 2026-03-28 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
|
研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C对两性霉素B活性的影响 | 首次开发了一种分析系统,通过浓度依赖的释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂的活性,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 研究纳米孔在脂质体膜上的形成特性,并开发一种用于分析膜活性化合物(如两性霉素B及其增强剂)的新系统 | 脂质体膜、两性霉素B、麦角固醇、shodoamide C | 合成生物学 | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像 | NA | NA | NA | NA | 医药、药物发现、合成生物学 |
| 34 | 2026-03-25 |
Automated workflow for genotyping individual transposon library variants
2026-Jan-12, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-025-00054-3
PMID:41869086
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于转座子插入库个体变异基因分型的自动化工作流程,利用开源OT-2液体处理器和自定义Python包实现 | 开发了模块化、标准化的自动化工作流程,结合开源液体处理器和自定义软件,提高了基因分型的可靠性和可重复性 | 工作流程的吞吐量受液体处理器平台容量限制,需通过多次运行或多台设备并行处理来扩展 | 为基因组工程和合成生物学中的高通量筛选提供自动化、可扩展的个体变异基因分型解决方案 | 转座子插入库中的个体克隆变异 | 合成生物学 | NA | 转座子插入、PCR分析、测序 | NA | 测序数据 | 46个变异体(其中40个成功鉴定) | OT-2液体处理器 | 恶臭假单胞菌KT2440 | NA | 工业生物技术 |
| 35 | 2026-03-25 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2026-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
|
研究论文 | 本文报道了构建完全基于蛋白质的微三维打印机器人结构的过程,这些结构由最小化肌动球蛋白皮层涂层并驱动 | 首次实现了完全由蛋白质材料构建和驱动的三维机器人结构,结合了三维打印技术和肌动球蛋白主动涂层 | 需要生物材料专业知识,完成过程耗时15天,可能限制广泛采用 | 将生物分子活动组装和放大以在人造设备中执行工作,推动合成生物学应用 | 蛋白质基三维打印机器人结构、肌动球蛋白皮层 | 合成生物学 | NA | 三维打印、肌动球蛋白涂层组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 36 | 2026-03-24 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2026-01-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
|
综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合了结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程及活性位点外修饰等多种策略,并展望了机器学习与代谢工程等未来方向 | 萜烯合酶催化复杂性及序列-功能相关性弱带来了显著的工程挑战 | 工程化I类萜烯合酶以实现萜烯骨架的多样性,这是合成生物学的关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程、半理性与随机方法(如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化)、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 37 | 2026-03-24 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2026-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
|
综述 | 本文综述了抗体-药物偶联物(ADCs)的当前成就与未解决问题,并强调了基于全基因编码蛋白质构建体的创新方向,特别是双功能嵌合蛋白,为下一代蛋白质治疗药物奠定基础 | 强调双功能嵌合蛋白作为ADCs的替代方案,结合支架靶向域和肽衍生细胞毒性模块,具有高选择性、紧凑结构、低免疫原性和细菌表达兼容性,并利用合成生物学、展示系统和机器学习加速优化 | NA | 探索超越ADCs的可编程治疗蛋白质,以解决其成本高、生产系统依赖、分子异质性、系统毒性和治疗窗口窄等局限性 | 抗体-药物偶联物(ADCs)及其替代方案,特别是双功能嵌合蛋白质构建体 | 个性化医疗 | 肿瘤学 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 38 | 2026-03-22 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
|
研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了配体响应的液-液相分离凝聚物,用于基因调控和转录放大 | 创新点包括利用内源性信号分子(如激素和药物)构建化学诱导二聚化系统,以及设计配体控制的液-液相分离凝聚物以实现可调谐的转录控制,实现高达数百倍的激活效果 | NA | 研究目的是开发与内源性生理信号整合的合成生物学工具,用于基因调控和转录控制 | 研究对象包括核受体(如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)的配体结合域、TIF2共激活因子肽,以及相关的激素和药物配体 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化、液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 双输入转录开关、配体响应的液-液相分离凝聚物 | 医学、基因电路、生物传感、治疗学 |
| 39 | 2026-03-22 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
|
研究论文 | 本研究报道了口腔链球菌中的一种三重酶复合物,该复合物通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变,从原始的HMG-CoA合成功能进化获得Friedel-Crafts C-酰化新功能的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特殊功能,阐明酶功能多样化的进化机制 | 口腔链球菌来源的三重酶复合物(SmaATase),包含HMGS、ACAT和DUF35蛋白 | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌(Streptococcus macacae) | NA | 合成生物学(为C-C键形成催化剂工程提供模板) |
| 40 | 2026-03-22 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
|
综述 | 本文总结了利用酵母工程化生产色氨酸衍生芳香化合物的最新进展 | 聚焦于色氨酸作为关键前体,综述了酵母代谢工程和合成生物学工具在可持续生产芳香化合物中的应用 | NA | 实现色氨酸衍生芳香化合物在酵母中的高效、可扩展且经济可行的生物合成 | 酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药 |