合成生物学相关文章
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当前共找到 382 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-09-27 |
Regulatory mechanisms and multidimensional applications of blueberry anthocyanins: a review of current gaps and future directions
2026, Engineering in life sciences
IF:3.9Q2
DOI:10.48130/els-0026-0005
PMID:42781482
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综述 | 本文综述了蓝莓花青素的调控机制及其在食品、医药、化妆品等多领域的应用，并探讨了未来研究方向 | 系统整合了蓝莓花青素在酶促途径和遗传层面的调控机制，强调了光温等环境因子的作用，并提出了代谢工程、合成生物学和生物过程工程策略来提升花青素生物合成、稳定性和产量 | 蓝莓花青素产生的精确调控机制仍未完全阐明，现有研究存在不足 | 全面分析蓝莓花青素的调控机制、健康益处和多维应用，为未来研究提供框架 | 蓝莓花青素 | 机器学习 | 心血管疾病, 神经退行性疾病, 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药, 化妆品, 纺织品, 智能包装 |
| 42 | 2026-09-26 |
Functional, structural, and taxonomical diversity of glycoside transporters in bacteria
2026-01-02, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag040
PMID:42685310
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综述 | 本综述系统总结了细菌中糖苷转运蛋白的鉴定与表征方法，并整合了不同家族糖苷转运蛋白的功能、机制、结构和分类多样性 | 首次系统整合了TonB依赖性转运蛋白、ABC转运蛋白、磷酸转移酶系统及主要 facilitator 超家族等多家族细菌糖苷转运蛋白的功能、机制、结构和分类多样性，并强调了实验表征与序列数据之间的巨大差距 | 缺乏对未培养细菌中糖苷转运蛋白的有效研究手段，膜蛋白重组表达困难，功能表征的转运蛋白数量远少于可用序列数据 | 总结鉴定和表征细菌糖苷转运蛋白的现有方法与技术，整合已验证糖苷转运蛋白的知识，并指出未来研究方向 | 细菌糖苷转运蛋白，包括TonB依赖性转运蛋白、ATP结合盒转运蛋白、磷酸转移酶系统和主要 facilitator 超家族 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 43 | 2026-09-25 |
CAX1 beyond calcium transport: evidence for a transport-independent regulatory module in plants
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1937940
PMID:42769593
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综述 | 本文综述了植物CAX1的结构、调控和生理功能，并评估了其氨基端具有不依赖转运的调节模块的证据。 | 提出CAX1的氨基端结构可能作为一个控制模块，整合环境和细胞信号以影响胁迫响应，拓展了CAX1的功能范围 beyond 离子交换。 | 基于现有遗传学和合成生物学证据的综述，缺乏直接证明CAX1氨基端不依赖转运功能的分子机制实验。 | 总结CAX1结构、调控和生理功能，评估支持氨基端不依赖转运活性的证据。 | 植物CAX1蛋白及其氨基端调控区域。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 44 | 2026-09-25 |
Engineering probiotic consortia to improve chemotherapy tolerance and reduce toxicity in breast cancer patients: a new frontier in supportive precision oncology
2026, Oncology reviews
IF:3.1Q2
DOI:10.3389/or.2026.1909404
PMID:42774746
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综述 | 本文综述了工程化益生菌联合体在改善乳腺癌患者化疗耐受性和减轻毒性方面的机制、临床前与临床证据及转化前景 | 提出工程化益生菌联合体作为支持性精准肿瘤学的新策略，通过合成生物学和微生物组工程精确设计多菌株群落以恢复微生物平衡、增强化疗耐受性 | 主要基于临床前和初步临床研究，缺乏大规模随机对照试验验证，工程菌联合体的长期安全性和生态稳定性仍需进一步评估 | 探讨工程化益生菌联合体在改善乳腺癌化疗耐受性和减轻毒性中的作用及转化应用 | 乳腺癌患者、肠道微生物组、工程化益生菌联合体 | 微生物组工程、合成生物学、肿瘤学 | 乳腺癌 | 微生物组工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 多菌株益生菌联合体 | 医学、工业生物技术 |
| 45 | 2026-09-25 |
Optimization Strategies and Synergistic Applications of Engineered Salmonella Typhimurium in Cancer Therapy: From Synthetic Biology to Nanobiotechnology
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S632739
PMID:42775009
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综述 | 系统综述了工程化鼠伤寒沙门氏菌在肿瘤治疗中的应用进展，包括其内在抗肿瘤机制、靶向修饰策略、基于纳米生物技术的表面工程策略以及联合治疗方案 | 总结了四种基于纳米生物技术的表面工程策略（化学偶联、生物矿化、物理吸附、仿生或聚合物涂层），并提出了细菌-纳米材料混合系统与基因编辑工程的协同互补，以及多机制联合治疗模式突破单药治疗瓶颈 | 存在种间模型差异、给药途径限制和工业化生产障碍等临床转化瓶颈 | 系统综述工程化鼠伤寒沙门氏菌在肿瘤治疗中的应用进展，分析其抗肿瘤机制、修饰策略和联合治疗方案，并探讨临床转化面临的核心问题 | 鼠伤寒沙门氏菌及其工程化改造菌株、细菌-纳米材料混合系统 | 肿瘤学、合成生物学、纳米生物技术 | 癌症、实体瘤 | 合成生物学、纳米生物技术、基因编辑工程、化学偶联、生物矿化、物理吸附、仿生或聚合物涂层 | NA | 文本 | NA | 基因编辑工程 | 鼠伤寒沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 46 | 2026-09-24 |
Life beyond 6000 genes: from sequence to synthesis in a post-genomics era
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag034
PMID:42556387
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综述 | 本文回顾了酵母基因组测序三十年来的发展，从序列解码到合成基因组学，并展望了人工智能和生物电子学对未来酵母基因组学和工程生物学的影响 | 系统总结了从酵母基因组测序到Sc2.0合成基因组计划的演进历程，并前瞻性地探讨了人工智能和生物电子学在酵母工程生物学中的潜在应用 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，对酵母基因组暗物质的讨论仍停留在问题提出层面，未给出具体解决方案 | 回顾酵母基因组学三十年发展历程，阐述从基因组测序到合成基因组学的转变，并展望未来三十年酵母基因组学和工程生物学的发展方向 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）基因组及以其为平台的合成生物学和工程生物学研究 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、功能基因组学、系统生物学、合成基因组学、人工智能、生物电子学 | NA | 文本 | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 医学, 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 47 | 2026-09-23 |
Approaches to deorphanize secretome: Classical, computational, and next generation strategies to reveal ligand-receptor networks
2026, EXO : beyond the cell
DOI:10.70401/EXO.2026.0008
PMID:42181609
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综述 | 本文综述了分泌蛋白去孤儿化的方法，包括生化方法、遗传筛选策略和计算框架，并展望了未来加速配体-受体鉴定的方向 | 系统整合了经典、计算和下一代策略，并提出了包括多重筛选平台、提高低亲和力相互作用灵敏度的方法、将瞬时结合事件转化为稳定读数的合成生物学工具以及与单细胞和空间转录组技术整合的未来方向 | 未提及具体实验验证，主要基于现有文献的总结和展望 | 总结和评估当前分泌蛋白去孤儿化的策略，并展望未来加速配体-受体鉴定的方向 | 分泌蛋白及其同源受体 | 机器学习 | NA | 亲和纯化-质谱、交联受体捕获、RNA干扰、CRISPR筛选、AI驱动的蛋白质结构建模 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 48 | 2026-09-23 |
A CURE for synthetic regulation of gene expression: rapid screening of guide RNA efficacy as a framework for enabling undergraduate research in plant synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag007
PMID:42293129
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研究论文 | 本文开发并验证了一个基于课程的本科生研究体验（CURE），利用病毒递送gRNA快速筛选植物合成生物学中gRNA的有效性 | 利用基于病毒的gRNA递送系统实现高通量快速筛选gRNA效率，克服植物转化周期长的限制，使本科生能够在学期内完成植物合成生物学研究 | 研究仅在拟南芥中进行，CURE的长期效果和学生受益程度未量化评估，gRNA筛选依赖VipariNama系统可能受病毒递送效率限制 | 开发和验证一个适用于植物合成生物学的CURE，让学生参与设计并测试靶向Cas9转录抑制因子的gRNA效率，以促进植物功能基因组学和工程化研究 | 拟南芥中三个基因（FT、TSF和CO）的启动子区域及靶向这些区域的gRNA | 植物合成生物学 | NA | 病毒递送gRNA、CRISPR-Cas9转录抑制、基因表达分析、稳定转基因植物生成 | NA | 基因表达数据、表型数据 | 12个新gRNA，多个学生团队，稳定转基因株系 | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | 合成转录因子（SynTF）构建体，包含Cas9-based转录抑制因子 | 农业、植物合成生物学 |
| 49 | 2026-09-23 |
Chemical organizations as a conceptual tool: from synthetic biology to interdisciplinary systems and back
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1801128
PMID:42453133
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研究论文 | 本文提出化学组织理论（COT）作为合成生物学的形式化框架，并开发了计算平台pyCOT，用于分析和模拟从基因线路到合成菌群的合成生物学系统 | 将化学组织理论（COT）引入合成生物学，提供领域通用的形式化框架，使自组织、涌现、反馈和鲁棒性等抽象概念可操作和可计算，并开发了专用计算平台pyCOT | 论文未明确说明COT框架在具体生物学预测中的实验验证程度，以及pyCOT平台的可扩展性和性能边界 | 建立合成生物学的形式化理论框架，推动跨学科的系统思维教育，并促进复杂自适应系统素养在生物学之外的传播 | 合成生物学中的反应网络、基因线路、代谢工程系统和合成菌群 | 合成生物学 | NA | 反应网络形式化建模、计算模拟 | 化学组织理论（COT）形式化模型 | NA | 4年教学实践，涉及设计、社会科学、数学和生态学等不同背景的学生群体 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 50 | 2026-09-22 |
From biological surfaces to engineered systems: how synthetic and systems biology enable biomimetic design
2026, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2026.1860815
PMID:42761473
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综述 | 该综述探讨了生物表面的结构与功能特性如何启发高级仿生系统的设计，通过整合系统生物学与合成生物学的框架，提炼关键设计原则并展示其在工程系统中的应用 | 采用整合系统生物学与合成生物学的框架，从生物表面的通讯、交换、防御和运动功能中提炼设计原则，而非仅关注制造方法，强调生物机制与工程设计的结合 | 作为综述文章，未涉及具体实验验证，且可能未全面覆盖所有生物表面类型或工程应用 | 探讨生物表面的结构与功能特性如何为先进仿生系统的设计提供信息，并建立跨学科的设计原则 | 生物表面（包括其通讯、分子交换、防御和运动相关的结构与功能）以及仿生工程系统 | 合成生物学 | NA | 系统生物学建模，合成生物学工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学，材料，工业生物技术 |
| 51 | 2026-09-22 |
Cell-type-specific alkaloid and terpenoid biosynthesis in glandular trichomes: single-cell and spatial transcriptomic perspectives
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1911787
PMID:42761523
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综述 | 本文系统总结了单细胞和空间组学技术在腺毛研究中的最新应用，重点关注生物碱和萜类生物合成途径，并展望了与合成生物学的深度融合 | 整合单细胞组学和空间组学技术，以更高分辨率解析腺毛中不同细胞类型的代谢生物合成和细胞间运输机制，并构建更精细的预测性代谢网络模型 | 传统宏观组学方法忽视组织内细胞异质性，难以解析腺毛中不同细胞类型的具体动态 | 阐明腺毛中不同细胞类型的次级代谢途径及其调控机制，并探索单细胞组学、空间组学与合成生物学的深度融合前景 | 腺毛，特别是（L.）G. Don、L.、L.、和等关键模式植物中的生物碱和萜类生物合成途径 | 单细胞组学, 空间组学 | NA | 单细胞组学, 空间组学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 医学 |
| 52 | 2026-09-21 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
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研究论文 | 该研究通过生物信息学分析、液体处理机器人和异源蛋白及代谢物生产实验，建立了在Cyanidioschyzon merolae中进行核基因组工程的框架，并发现基因组位置不影响转基因表达效率 | 首次在Cyanidioschyzon merolae中实验验证了中性整合位点，并建立了高通量转化方案；发现基因组位置对转基因表达影响极小，具有转录中性 | 未明确提及 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响，并建立可重复的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae（一种嗜热嗜酸红藻） | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人、异源蛋白和代谢物生产测定、顶空分析 | NA | 基因组序列、实验数据 | 40个基因间 loci（分布于20条染色体中的16条），验证了38个 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae | NA | 工业生物技术 |
| 53 | 2026-09-21 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了植物和微生物合成生物学在农业、环境及未来应用中的进展，包括基因组构建工具、CAD和AI，以及智能植物和微生物组工程 | 将植物与相关微生物视为一个整体系统进行工程化，利用合成生物学工具扩展可工程化物种、增加工程化功能复杂性、控制环境释放并组装稳定菌群 | 传统育种和转基因方法速度慢、性状不可预测且持续表达，合成生物学在植物多基因组和微生物组工程中仍面临复杂性和稳定性挑战 | 推动下一次农业革命，并将植物工程拓展至制造、基础设施、传感和修复等新领域 | 植物（作物）和相关的微生物（真菌、细菌、古菌） | 合成生物学 | NA | 基因组构建工具、计算机辅助设计（CAD）、人工智能（AI） | NA | 文本 | NA | NA | 植物，微生物（真菌、细菌、古菌） | 响应环境变化的基因回路，可改变形态或应对威胁 | 农业，环境，制造，基础设施，传感，修复 |
| 54 | 2026-09-21 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了KSHV的致癌机制，重点介绍了其操纵宿主细胞信号、逃避免疫检测和促进肿瘤发生的能力，并探讨了下一代诊断工具和治疗方法 | 整合了新兴诊断生物标志物（如病毒microRNA）与下一代治疗策略（包括基因编辑和基于合成生物学的方法），为精准医学改善疾病检测、治疗特异性和患者预后提供了机会 | 当前KS诊断仍主要依赖组织病理学和LANA免疫染色，在早期或不典型病变以及区分潜伏感染和裂解感染方面存在重要局限性；KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗，临床结果仍不理想 | 探索KSHV的致癌机制，并探讨下一代诊断工具和治疗方法 | KSHV病毒及其相关疾病（卡波西肉瘤、原发性渗出性淋巴瘤、多中心Castleman病） | 医学 | 卡波西肉瘤, 原发性渗出性淋巴瘤, 多中心Castleman病 | CRISPR-Cas9, 治疗性适配体, 先进成像, 分子生物标志物 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 55 | 2026-09-21 |
Engineered probiotics that sequester arsenite in a mouse gastrointestinal system
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.699961
PMID:41648437
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研究论文 | 该研究通过合成生物学方法改造益生菌，使其在胃肠道内检测并螯合亚砷酸盐，从而阻止其被吸收进入血液 | 设计了一个砷响应遗传拨动开关，在暴露时激活螯合剂表达并在生物静息条件下维持生产，而在活跃细胞分裂时自动关闭以减少代谢负担和增强生物安全性；同时改造了ArsR衍生的砷结合蛋白，消除DNA结合活性但保留高亲和力金属结合能力，产生无毒螯合剂；结合质量传递模型预测细菌剂量，并在小鼠模型中验证了工程益生菌减少亚砷酸盐进入血液的效果 | 摘要未明确提及研究的局限性 | 开发一种基于工程益生菌的合成生物学方法，在胃肠道内拦截膳食亚砷酸盐，防止其被人体吸收 | 工程益生菌（EcN）、亚砷酸盐、小鼠胃肠道模型 | 合成生物学 | 癌症、器官功能障碍、神经系统疾病 | 合成生物学、基因工程 | 遗传拨动开关、质量传递模型 | 实验数据、模型预测数据 | NA | NA | 益生菌（EcN） | 砷响应遗传拨动开关，激活螯合剂表达，在生物静息条件下维持生产，细胞分裂时关闭 | 医学、环境 |
| 56 | 2026-09-21 |
The oleaginous yeast Cutaneotrichosporon oleaginosum modifies corn stover alkali lignin
2026-Jan-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-36483-5
PMID:41549121
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研究论文 | 利用多种分析工具评估玉米秸秆提取的碱木质素与产油酵母Cutaneotrichosporon oleaginosum之间的相互作用 | 首次系统研究非模式产油酵母C. oleaginosum对玉米秸秆碱木质素的修饰作用，发现其可通过胞外醌氧化还原循环产生活性氧来修饰木质素，并首次在该酵母中观察到铁还原酶和草酸交换体在木质素条件下的特异性表达 | 研究主要基于体外分析和组学数据，尚未进行基因工程验证实验，木质素 uptake 的具体机制和聚合物木质素能否被完整摄取仍需进一步证实 | 探究产油酵母Cutaneotrichosporon oleaginosum对玉米秸秆碱木质素的修饰能力及其分子机制 | 产油酵母Cutaneotrichosporon oleaginosum和玉米秸秆提取的碱木质素 | 合成生物学 | NA | 2D-NMR、超分辨荧光显微镜、分泌组学、蛋白质组学 | NA | 光谱数据、图像、蛋白质组学数据 | NA | NA | Cutaneotrichosporon oleaginosum | NA | 能源、工业生物技术 |
| 57 | 2026-09-21 |
Resource Competition and Growth Dilution Modulate Synthetic Gene Cascade Dynamics
2026-01-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00606
PMID:41457566
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研究论文 | 本文构建并表征了具有不同启动子强度、RBS强度和质粒骨架的抑制性基因级联文库，研究了资源竞争和生长稀释对合成基因级联动态的影响。 | 发现增加下游模块表达会通过竞争共享细胞资源意外降低上游调控模块表达，将单向抑制级联转变为非预期反馈回路；并揭示生长介导的稀释重塑基因表达模式。 | 未明确说明具体资源类型和定量模型，可能未在单细胞水平验证或缺乏动态调控的精确预测。 | 设计具有准确可预测行为的鲁棒稳定基因回路，理解资源竞争对模块化基因回路动态的影响。 | 合成基因级联（抑制性基因级联） | 合成生物学 | NA | 基因回路构建与表征 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | 抑制性基因级联 | 医学, 工业生物技术 |
| 58 | 2026-09-21 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 本研究探讨了普利茅斯沙雷氏菌的浮游细胞和生物膜系统中，紧密结合的胞外聚合物对铜生物吸附的作用 | 揭示了紧密结合的胞外聚合物中蛋白质组分在铜生物吸附中的关键作用，并展示了在真实电镀废水中高效吸附铜的能力 | 未来需要采用合成生物学方法提高铜螯合能力，并在真实工业废水条件下研究这些系统的可扩展性以提高技术成熟度 | 探索细菌胞外聚合物作为铜活性结合表面的作用，开发高效的生物系统去除工业废水中的重金属 | 普利茅斯沙雷氏菌菌株As3-5a(5)的浮游细胞和生物膜系统 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附 | NA | 实验数据 | NA | NA | 普利茅斯沙雷氏菌 | NA | 环境，工业生物技术 |
| 59 | 2026-09-21 |
SynVectorDB: embedding-based retrieval system for synthetic biology parts
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf088
PMID:41537189
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研究论文 | 开发了SynVectorDB，一个基于嵌入的检索系统，用于合成生物学元件的语义搜索和发现 | 整合了多来源的19850个生物元件，建立了三级层次分类系统，采用BGE-M3多语言嵌入在可扩展向量数据库中实现语义相似度匹配，显著优于关键词检索方法 | 摘要中未明确提及 | 解决合成生物学元件发现中数据组织不一致和语义搜索能力有限的问题 | 合成生物学元件（DNA元件、RNA元件、编码序列、应用构建体） | 自然语言处理 | NA | BGE-M3多语言嵌入 | BGE-M3 | 文本 | 19850个生物元件，其中7656个经文献验证达到验证状态 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 60 | 2026-09-21 |
Emerging Chemical and Biological Materials Technologies in the Extraplanetary Environment
2026-Jan-12, Nano-micro letters
IF:31.6Q1
DOI:10.1007/s40820-025-01979-8
PMID:41521243
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综述 | 本文综述了空间制造的历史演变与最新进展，涵盖轨道空间站、月球表面、火星及小行星等环境，并探讨了化学与生物纳米/微米/介观尺度制造技术以及合成生物学和人工智能在克服微重力、资源有限和极端条件中的应用前景 | 整合了化学与生物制造技术在多种地外环境中的最新进展，并首次系统讨论了合成生物学和人工智能在克服空间制造限制中的潜在应用 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，对具体技术的可行性缺乏实验验证 | 梳理空间制造的研究现状，概述关键制造策略与技术，评估技术与环境挑战，并讨论新兴趋势与未来方向 | 空间制造技术，包括化学和生物纳米/微米/介观尺度制造，以及轨道空间站、月球表面、火星和小行星等环境 | space manufacturing | NA | NA | NA | text | NA | NA | NA | NA | space exploration, industrial biotechnology |