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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-02-20 |
Integrated omics analysis of the cellulose co-degradation network of Chaetomium thermophilum
2026-Jan-24, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02741-x
PMID:41580774
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研究论文 | 本研究通过整合组学分析揭示了嗜热毛壳菌纤维素共降解网络的协同机制,包括核心转录因子调控、酶分泌级联模式及糖酸代谢网络的作用 | 首次在嗜热真菌中发现CtClr-2作为核心转录因子驱动LPMOs、CDH和CBH等关键基因共表达,并揭示氧化酶与水解酶的三阶段级联分泌模式使还原糖产量提升60.6% | 研究聚焦于单一嗜热真菌物种,其机制在其他工业相关真菌中的普适性仍需验证;合成生物学工程改造仅停留在理论建议阶段 | 解析嗜热真菌高效降解纤维素的系统机制,为生物燃料工业化生产提供菌株改造靶点 | 嗜热毛壳菌(Chaetomium thermophilum)的纤维素降解网络 | 合成生物学 | NA | 整合组学分析(包括转录组、蛋白质组) | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学 | 嗜热毛壳菌 | 纤维素降解网络(包含转录调控模块、酶分泌级联模块、糖酸代谢模块) | 能源 |
| 42 | 2026-02-19 |
T cell immunotherapy for solid tumors: limitations, progress, and future prospects
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755751
PMID:41694348
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综述 | 本文全面综述了针对实体瘤的T细胞免疫疗法的现状、挑战与未来前景 | 系统梳理了CAR-T、TCR-T和TIL疗法在实体瘤中的最新进展,并重点讨论了克服抗原异质性、肿瘤微环境抑制等障碍的新兴策略 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据或临床结果,主要基于现有文献进行分析 | 总结T细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的进展、挑战及未来发展方向 | 针对实体瘤的T细胞免疫疗法,包括CAR-T细胞、TCR-T细胞和肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 实体瘤 | 合成生物学工具、基因编辑技术、多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 嵌合抗原受体、T细胞受体工程 | 医学 |
| 43 | 2026-02-19 |
Elucidation of the pramanicin biosynthetic pathway reveals a DUF2306 family membrane protein involved in terminal epoxidation
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1765828
PMID:41695960
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研究论文 | 本研究阐明了真菌代谢产物pramanicin的生物合成途径,并首次揭示了DUF2306家族膜蛋白在终端环氧化反应中的功能 | 首次鉴定了pramanicin的生物合成基因簇,并发现DUF2306家族膜蛋白PraC在天然产物生物合成中的环氧化功能 | NA | 解析pramanicin的生物合成途径 | 真菌代谢产物pramanicin及其生物合成基因 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组合表达、饲喂实验 | NA | NA | NA | 异源表达 | 真菌、Aspergillus nidulans | pramanicin生物合成途径(包含PKS-NRPS杂合酶、单加氧酶、短链脱氢酶/还原酶及膜蛋白环氧化酶) | 医药 |
| 44 | 2026-02-19 |
KmPred: prediction of Michaelis constants (Km) using an integrative machine learning framework
2026, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2026.1711471
PMID:41696044
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研究论文 | 本文提出了一个名为KmPred的集成机器学习框架,用于预测酶动力学参数米氏常数(Km) | 整合了最先进语言模型的蛋白质序列嵌入与底物SMILES描述的分子描述符,构建了多模态特征融合的预测框架 | NA | 开发一个计算预测方法,以替代传统耗时费力的体外实验测定酶动力学参数 | 酶-底物相互作用的米氏常数(Km) | 机器学习 | NA | 机器学习 | LSTM, Transformer, XGBoost | 蛋白质序列, 化学描述符 | MPEK数据集和Kroll等人组装的独立数据集 | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药物发现 |
| 45 | 2026-02-19 |
Tripterygium glycosides: recent advances in mechanisms, therapeutic applications, and safety optimization
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1728162
PMID:41704700
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综述 | 本文综述了雷公藤多苷在药理机制、临床应用及安全性优化方面的最新进展 | 强调了通过单体分离、结构优化、前药策略和创新递送系统来克服雷公藤多苷治疗窗口窄的问题,并介绍了新兴衍生物如LLDT-8和雷公藤内酯的减毒增效特性 | NA | 总结雷公藤多苷的药理机制、治疗应用及安全性优化策略 | 雷公藤多苷及其衍生物 | NA | 系统性红斑狼疮、糖尿病肾病、类风湿关节炎、银屑病 | 系统药理学、合成生物学、AI辅助药物设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 46 | 2026-02-17 |
Mining the Hidden Pharmacopeia: Fungal Endophytes, Natural Products, and the Rise of AI-Driven Drug Discovery
2026-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031365
PMID:41683797
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综述 | 本文综述了真菌内生菌天然产物的化学与生物合成多样性,并探讨了人工智能如何将天然产物发现从经验筛选转变为具有直接工业应用价值的预测性学科 | 将真菌内生菌这一进化优化的天然产物宝库与人工智能、机器学习及多组学整合技术相结合,实现了对隐蔽生物合成基因簇的预测、激活及从头设计,推动了药物发现向预测性、工程化方向转型 | NA | 探讨人工智能如何加速真菌内生菌天然产物的发现、设计与工业化应用,以应对生物医学和可持续性挑战 | 真菌内生菌产生的天然产物(如聚酮、生物碱、萜类、肽类)及其生物合成基因簇 | 机器学习 | NA | 多组学整合、基因组挖掘、代谢组学注释 | 深度学习、生成式AI、扩散模型 | 基因组数据、代谢组数据、生物合成基因簇数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 47 | 2026-02-17 |
Phage Therapy in Plant Disease Management: 110 Years of History, Current Challenges, and Future Trends
2026-Jan-24, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15030368
PMID:41681534
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综述 | 本文回顾了噬菌体疗法在植物病害管理中110年的发展历史,分析了当前面临的挑战,并探讨了未来的发展趋势 | 全面梳理了噬菌体疗法在植物病害管理领域的完整历史脉络,并前瞻性地讨论了合成生物学、先进递送系统与人工智能等前沿技术的整合潜力 | NA | 回顾噬菌体疗法在植物病害管理领域的发展历程,并展望其未来趋势 | 噬菌体及其在植物病害管理中的应用 | NA | 植物病害 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 48 | 2026-02-16 |
Membrane and proteome allocation constraints in Escherichia coli models during overflow metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
|
研究论文 | 本研究开发了膜相关约束通量平衡分析模型,以探究大肠杆菌在溢流代谢中膜资源分配的关键作用 | 引入了可调节的膜蛋白质量约束,首次在基因组尺度模型中整合膜分配限制,提高了溢流代谢预测的准确性 | 模型可能未涵盖所有膜相关生物物理因素,且主要基于大肠杆菌,在其他微生物中的普适性有待验证 | 探究膜资源分配如何与整体蛋白质组限制共同调控细菌生理和溢流代谢 | 大肠杆菌的代谢策略和膜蛋白表达 | 代谢工程 | NA | 通量平衡分析 | MAFBA | 基因组尺度代谢模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 49 | 2026-02-15 |
Stem cells in organogenesis and regeneration
2026-Jan-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04889-z
PMID:41549301
|
综述 | 本文综述了干细胞在器官发生和再生中的作用,包括干细胞类型、信号通路、器官形成、再生修复以及先进技术和伦理问题 | 整合了干细胞生物学的最新进展,如CRISPR、3D生物打印和合成生物学在干细胞治疗中的应用,并探讨了未来方向和伦理挑战 | NA | 概述干细胞在器官发生和再生中的基础与临床潜力 | 干细胞类型(如胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞)、器官发生过程、再生修复机制 | NA | NA | CRISPR, 3D生物打印, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 50 | 2026-02-15 |
Innovations in cell-free synthetic biology via microfluidic approaches
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.004
PMID:41688139
|
综述 | 本章节综述了基于微流控技术的无细胞合成生物学方法,探讨了其基本原理、整合案例及潜在应用 | 提出微流控技术与无细胞系统的协同整合,作为开发创新合成生物学平台的先驱性方法 | NA | 探讨微流控技术如何解决无细胞合成生物学面临的挑战,并推动其在多领域的应用 | 无细胞合成生物学系统与微流控技术的整合平台 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学、治疗、诊断、环境 |
| 51 | 2026-02-15 |
Cell-free systems for expression of transmembrane protein
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.001
PMID:41688133
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综述 | 本章讨论了无细胞蛋白合成(CFPS)系统在跨膜蛋白表达中的基本原理、进展和应用 | 强调了CFPS作为开放、可重复、高产平台,可规避体内表达的诸多限制,并探讨了结合膜模拟物、折叠伴侣、非标准氨基酸等生化方法以及混合系统、微流控反应器、高通量自动化等技术创新 | NA | 探讨无细胞蛋白合成系统在跨膜蛋白表达中的应用潜力 | 跨膜蛋白 | NA | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | 原核生物,真核生物 | NA | 药物发现,结构生物学,生物传感器开发,下一代生物制剂生产 |
| 52 | 2026-02-15 |
Challenges and opportunities in cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.006
PMID:41688140
|
综述 | 本章全面评估了无细胞系统(CFS)面临的技术挑战、科学局限以及相关的伦理、环境和社会问题,并探讨了其在合成生物学等领域的未来机遇 | 系统性地整合了CFS的技术挑战、伦理考量与发展机遇,为下一代合成生物学的研究、教学和政策制定提供了基础参考 | 作为综述章节,未提出具体实验数据或技术解决方案,主要基于现有文献进行评述 | 评估无细胞系统技术的现状、挑战与未来机遇 | 无细胞系统技术及其在生物医学等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 53 | 2026-02-15 |
Cell-free systems for vaccine production
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.001
PMID:41688142
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综述 | 本章全面概述了无细胞系统在生物医学科学领域的应用,重点关注疫苗开发与生产 | 提出了多项创新方案以解决当前无细胞平台的局限性,如糖工程引入功能性糖基化、冻干技术改善储存与分发、外泌体递送设计下一代疫苗,以及机器学习集成优化生产流程 | 当前无细胞平台存在翻译后修饰不足、内毒素存在和生产成本高等限制 | 探讨无细胞系统在生物医学研究中的应用,特别是疫苗开发与生产 | 无细胞系统及其在疫苗生产中的应用,包括来自恶性疟原虫、鼠衣原体和SARS-CoV-2等挑战性病原体的抗原表达 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、糖工程、冻干技术、外泌体递送、机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 54 | 2026-02-15 |
Cell free systems for production of chemicals
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.003
PMID:41688134
|
综述 | 本章节概述了无细胞系统在工业化学品、生物燃料、药物前体和特殊化合物生产中的设计、优化和应用 | 强调无细胞系统在模块化途径构建、辅因子平衡和能量再生方面的功能,并整合合成生物学工具和系统工程策略以提高生产力 | NA | 探索无细胞系统在可持续生物制造和合成生物化学中的应用潜力 | 无细胞系统,包括酶基系统、裂解物基系统和混合系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | 模块化途径构建 | 工业生物技术, 能源, 医药 |
| 55 | 2026-02-15 |
Cell-free systems for biotransformation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.005
PMID:41688135
|
综述 | 本章综述了基于无细胞系统的生物转化技术,重点介绍了其从传统系统到现代无细胞蛋白质合成(CFPS)的发展,以及在合成治疗剂、生物燃料和化学品中的应用 | 系统阐述了无细胞系统生物转化从传统方法到现代CFPS的演变,并整合了机器学习和高通量筛选技术以优化途径设计 | NA | 探讨无细胞系统在生物转化领域的应用、优化方法及未来发展方向 | 无细胞生物转化系统、酶催化、氧化还原转化和水解过程 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、机器学习、高通量筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | 模块化途径设计 | 医药, 能源, 工业生物技术 |
| 56 | 2026-02-15 |
Cell-free systems for production of therapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.004
PMID:41688141
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综述 | 本章探讨了无细胞系统(CFS)的概念、技术、工程和治疗方法应用,并分析了其可扩展性、成本效益和翻译后修饰等问题 | 无细胞系统通过利用多种生物的基本转录和翻译机制,提供了比基于细胞的系统更好的模块化、控制性和生产速度,适用于高通量筛选和按需生物制造 | 存在可扩展性、成本效益和翻译后修饰方面的挑战 | 探索无细胞系统在生物分子治疗制造中的应用和前景 | 无细胞系统平台及其在治疗生产中的应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、冻干配方和系统优化 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌、小麦胚芽、哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 57 | 2026-02-15 |
Cell-free systems for expression of proteins and enzymes
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.002
PMID:41688138
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综述 | 本章回顾了无细胞表达系统在蛋白质和酶生物合成中的发展历程、类型、应用及未来挑战 | 无细胞表达系统提供了一个开放且可控的环境,突破了细胞调控的限制,实现了对表达动态的精确操控,特别适用于有毒蛋白质和复杂酶的合成 | NA | 探讨无细胞表达系统在蛋白质和酶生物合成中的应用及其在生物技术领域的潜力 | 无细胞表达系统及其在蛋白质和酶生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统,包括基于提取物的系统和PURE系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 诊断学、治疗学、生物制造、合成生物学 |
| 58 | 2026-02-14 |
Engineered probiotics that sequester arsenite in a mouse gastrointestinal system
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.699961
PMID:41648437
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研究论文 | 本研究开发了一种基于合成生物学的工程化益生菌,用于在小鼠胃肠道中检测和隔离砷离子,以减少其系统性吸收 | 创新点包括设计了一个砷离子响应的遗传切换开关,能激活螯合剂表达并在生物静态条件下维持生产,同时自动在细胞分裂时关闭以降低代谢负担和提高生物安全性,并改造了砷离子结合蛋白以消除DNA结合活性,保留高亲和力金属结合,适合细胞内隔离 | NA | 研究目的是开发一种策略,防止饮食中的砷离子在消化过程中进入人体,以减少长期健康风险 | 研究对象是工程化的益生菌菌株,用于在小鼠胃肠道系统中隔离砷离子 | 合成生物学 | 癌症、器官功能障碍、神经系统疾病 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 砷离子响应的遗传切换开关,用于激活螯合剂表达,并设计了一个非毒性螯合剂用于细胞内隔离 | 医学 |
| 59 | 2026-02-13 |
Digital Twins are a Key Enabling Technology for Personalized Medicine
2026-Jan-14, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-025-01589-w
PMID:41530522
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观点文章 | 本文探讨了数字孪生作为个性化医疗的关键使能技术,强调其在健康管理中的潜力 | 从学术和商业视角分析数字孪生技术,并扩展到生态、生物技术等跨领域应用 | NA | 强调数字孪生技术对数学建模社区的机遇及其在个性化医疗中的作用 | 数字孪生技术及其在人类生物学和健康管理中的应用 | NA | NA | NA | 计算模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗, 生态, 生物技术, 农业, 合成生物学 |
| 60 | 2026-02-12 |
Light force-powered cellular medical micromachines
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1746261
PMID:41658983
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综述 | 本文系统综述了光力驱动的细胞微机器(包括趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构)的设计策略及其在靶向药物递送、微创手术和免疫治疗中的应用 | 提出将天然生物细胞与可编程光镊技术相结合,克服传统人工合成材料微机器在生物安全性和深部组织疗效方面的限制 | 存在组织穿透深度有限、光毒性管理以及操作智能化不足等关键挑战 | 探讨光力驱动的细胞微机器在精准医疗中的应用潜力与发展方向 | 趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构 | 生物医学工程 | NA | 光镊技术、光子技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、人类红细胞、免疫细胞 | NA | 医学 |