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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-28 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
|
综述 | 本文综述了微生物黑色素在生物合成途径、生产优化策略、挑战及潜在应用方面的最新进展 | 重点强调了组学技术和基因工程在阐明生物合成机制和提高产量方面的关键作用,并提出了整合合成生物学、先进分析技术和全面安全评估的未来研究方向 | NA | 为微生物黑色素这一快速发展的领域提供全面且具有批判性的参考 | 微生物黑色素(由多种细菌和真菌产生的天然色素) | NA | NA | 组学技术、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌、真菌 | NA | 生物技术 |
| 42 | 2026-01-28 |
Amodiaquine Enhances Anti-Melanoma Efficacy of Attenuated Salmonella via Targeting Glutathione Reductase in Neutrophils
2026-Jan-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515009
PMID:41588921
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研究论文 | 本研究探讨了阿莫地喹通过靶向中性粒细胞中的谷胱甘肽还原酶,增强减毒沙门氏菌抗黑色素瘤疗效的机制 | 首次揭示了减毒沙门氏菌VNP20009在肿瘤微环境中招募的主要是N2型中性粒细胞,并发现阿莫地喹能通过靶向谷胱甘肽还原酶选择性消除这些细胞,从而增强抗肿瘤效果 | NA | 增强减毒沙门氏菌在癌症治疗中的抗肿瘤疗效,并探索中性粒细胞在其中的作用 | 黑色素瘤、减毒沙门氏菌VNP20009、中性粒细胞 | NA | 黑色素瘤 | 化学生物学方法、shRNA负载工程 | NA | NA | NA | shRNA负载工程 | 减毒沙门氏菌VNP20009 | 负载GR-shRNA的工程菌株,用于靶向谷胱甘肽还原酶 | 医学 |
| 43 | 2026-01-28 |
An Optimization Scheme Based on the Simulated Annealing Algorithm for In situ DNA Microarray Synthesis
2026-Jan-21, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究将DNA微阵列原位合成建模为旅行商问题,并开发基于模拟退火算法的优化策略以提高合成效率 | 首次将DNA微阵列合成顺序优化问题转化为旅行商问题,并应用模拟退火算法显著减少合成周期 | 研究主要基于计算模拟,未涉及实际实验验证优化策略的物理合成效果 | 优化DNA微阵列原位合成的核苷酸添加顺序以提高效率和降低成本 | DNA微阵列合成过程 | 合成生物学 | NA | DNA微阵列合成 | 模拟退火算法、贪婪算法 | 序列数据 | 从10×10 nt到10000×120 nt的不同规模阵列 | NA | NA | NA | 基因编辑、药物开发、DNA数据存储 |
| 44 | 2026-01-28 |
Energy-driven innovations in computational de novo protein engineering
2026-Jan-20, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.01.005
PMID:41570866
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综述 | 本文综述了能量模型在计算从头蛋白质工程中的关键作用,分析了相关计算方法、工具及与机器学习融合的最新进展 | 提出了基于精度-成本-通量权衡的方法选择决策框架,并整合经典力场、量子力学方法与AI预测,为治疗性和工业蛋白质设计提供协同策略路线图 | NA | 通过能量驱动策略推进计算从头蛋白质工程,设计具有定制功能的新型蛋白质 | 蛋白质的折叠、稳定性与功能 | 计算生物学 | NA | 分子动力学(MD)、热力学积分、蒙特卡洛采样、机器学习(ML)、深度学习(DL) | 能量模型、AI驱动预测模型 | 蛋白质结构数据、能量景观模拟数据 | NA | CHARMM, Amber, Rosetta | NA | NA | 生物技术, 医学, 合成生物学, 工业生物技术 |
| 45 | 2026-01-28 |
Yeast Biosensors for the Safety of Fermented Beverages
2026-Jan-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16010064
PMID:41590316
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综述 | 本文综述了基于酵母的生物传感器在啤酒、葡萄酒和康普茶等发酵饮料安全与质量保障方面的开发与应用 | 利用合成生物学工具开发基因工程酵母菌株,通过荧光、颜色变化或电信号等报告系统实时检测重金属、霉菌毒素等污染物,为发酵饮料安全监控提供快速、低成本的新方法 | 目前主要局限于实验室规模研究,在鲁棒性、可扩展性和监管整合方面仍需进一步研究以实现广泛的工业应用 | 开发用于发酵饮料安全监控的生物传感器技术,以生产更安全、更高质量的产品 | 基因工程酵母菌株及其在发酵饮料(啤酒、葡萄酒、康普茶)安全检测中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具、基因工程 | NA | 生物传感器信号(荧光、颜色、电信号) | NA | NA | 酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 生物传感器电路(包含感应元件和报告系统,如荧光蛋白、显色酶等) | 食品、工业生物技术 |
| 46 | 2026-01-28 |
Photoacid-Fueled Nanopropeller for the Controllable Motion of One-Hole Colloidal Motors with On-Board ATP Supply
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506850
PMID:41014546
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研究论文 | 报道了一种能够定向运动并现场合成ATP的旋转FF-ATP酶驱动胶体马达 | 利用光酸燃料驱动的纳米推进器,通过跨膜质子动力驱动ATP酶旋转,实现可控运动与现场ATP合成,并展示出向ADP/OH梯度的趋化性 | NA | 开发集自主运动与局部能量生产于一体的仿生推进平台 | 单孔胶体马达 | 合成生物学 | NA | 分层组装、光异构化 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生推进平台,整合运动与能量生产功能 | 生物医学, 合成生物学 |
| 47 | 2026-01-28 |
PIONEER: A periplasmic display platform for synthetic biology-based screening of genetically encoded protein regulators
2026-Jan, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
|
研究论文 | 本文介绍了PIONEER平台,一种用于在酿酒酵母周质空间展示基因编码蛋白调节剂的合成生物学筛选平台 | 开发了模块化的周质展示平台,通过优化分泌信号和展示支架实现稳定配体保留和自分泌信号传导,首次实现基于信号传导而非单纯结合的功能优先筛选 | 目前主要针对G蛋白偶联受体进行验证,尚未在其他类型膜蛋白或可溶性蛋白上全面应用 | 开发用于筛选和研究基因编码生物分子的合成生物学平台 | 肽、蛋白质和纳米抗体等基因编码的蛋白调节剂 | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、分泌信号优化、自分泌信号检测 | NA | 蛋白质序列、信号传导数据 | NA | 合成生物学平台 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 周质展示系统、膜蛋白功能检测电路、自分泌信号通路 | 药物发现、蛋白质工程、生物技术 |
| 48 | 2026-01-28 |
Synthetic biology empowers development of traditional Chinese medicine
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.010
PMID:41584699
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2026-01-27 |
The Coli Toolkit (CTK): An Extension of the Modular Yeast Toolkit for Use in E. coli
2026-Jan-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00489
PMID:41581077
|
研究论文 | 本文介绍了Coli Toolkit (CTK),一个基于Golden Gate的模块化克隆系统,专为大肠杆菌设计,旨在加速遗传电路的组装 | CTK通过将启动子部分细分为启动子、绝缘核酶和核糖体结合位点(RBS),提供了更灵活的转录和翻译控制,并整合了Cello库中的20个NOT门作为预组装基本部件 | NA | 开发一个用于大肠杆菌的模块化遗传电路组装工具,以优化合成生物学中的设计-构建-测试-学习(DBTL)循环 | 遗传电路的设计与组装,特别是在大肠杆菌中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | E. coli | 遗传电路,包括启动子、绝缘核酶、RBS和NOT门等基本部件 | 健康、可持续性、生物技术 |
| 50 | 2026-01-27 |
Polyphenols as Modulators of Macrophage Polarization: Mechanisms and Therapeutic Potential in Chronic Inflammatory Diseases
2026-Jan-25, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.70181
PMID:41582068
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综述 | 本文综述了天然多酚通过调控关键信号通路(如NF-κB、JAK/STAT等)来影响巨噬细胞极化(M1/M2表型),及其在慢性炎症性疾病和癌症治疗中的潜在应用 | 系统阐述了多酚调控巨噬细胞极化的双重治疗潜力(促M2极化缓解慢性炎症,促M1极化用于癌症免疫治疗),并提出了利用纳米技术、合成生物学和人工智能等创新方法克服多酚生物利用度低等局限性的新策略 | 多酚存在生物利用度低和毒性低的局限性,文中提出的创新方法(如纳米技术、合成生物学等)仍处于提议阶段,需进一步实验验证 | 探讨天然多酚作为免疫调节剂,通过调控巨噬细胞极化来治疗慢性炎症性疾病和癌症的潜力 | 天然多酚化合物及其对巨噬细胞极化的调控作用 | NA | 慢性炎症性疾病(包括动脉粥样硬化、代谢性疾病、神经退行性疾病等) | 文献综述(基于Web of Science和PubMed数据库检索) | NA | 文本(已发表文献) | NA | NA | NA | NA | 医学(慢性炎症性疾病治疗、癌症免疫治疗) |
| 51 | 2026-01-27 |
Biomanufacturing polyhydroxyalkanoates from CO2: A critical review of advances, challenges, and solutions for autotrophic and hybrid systems
2026-Jan-23, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108810
PMID:41581798
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综述 | 本文系统评述了利用二氧化碳生物转化生产聚羟基脂肪酸酯的技术进展、挑战与解决方案,重点关注自养和混合系统 | 首次系统比较了直接自养与两步混合系统在CO2至PHA转化中的性能差距,并提出了基于合成生物学、反应器工程和系统集成的战略路线图 | 当前所有平台仍存在气液传质效率低、催化剂稳定性差(寿命<100小时)及下游分离能耗高等关键瓶颈,导致生产成本(3-8美元/公斤)远高于经济阈值 | 评估CO2生物转化为可生物降解聚合物PHA的技术现状,以推动气候缓解与可持续制造的融合 | 二氧化碳生物转化技术,特别是自养系统(如Cupriavidus necator)和混合系统 | 工业生物技术 | NA | 生物转化、合成生物学、反应器工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | Cupriavidus necator | NA | 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 52 | 2026-01-27 |
Marine-derived antimicrobial peptides (AMPs): Blue biotechnological assets for sustainable healthcare and circular bioeconomy
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.08.002
PMID:41581932
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综述 | 本文综述了海洋来源抗菌肽作为可持续替代品在应对全球抗菌素耐药性危机中的潜力,涵盖其发现、优化、生产及应用 | 强调海洋来源抗菌肽在结构功能上的独特优势,并整合基因组学、机器学习与合成生物学技术进行创新发现与优化,推动蓝色生物经济发展 | 面临生产可扩展性和监管框架等关键挑战 | 探讨海洋来源抗菌肽作为可持续医疗和循环生物经济资产的应用前景 | 海洋来源抗菌肽,来源于无脊椎动物、极端微生物和蓝细菌等海洋生物 | NA | NA | 基因组学、宏基因组学工具、机器学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健、水产养殖、食品安全、环境修复 |
| 53 | 2026-01-27 |
New frontiers and applications of cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.002
PMID:41581983
|
综述 | 本章节概述了无细胞系统(CFS)作为合成生物学关键平台的基本原理及其在蛋白质合成、生物传感、药物发现和代谢工程等领域的广泛应用 | 强调了无细胞系统在消除细胞膜分子运输障碍方面的独特设计,以及其在生物技术、生物医学和环境可持续性领域提供快速、适应性强且经济高效解决方案的最新进展 | NA | 探讨无细胞系统在合成生物学中的应用及其对生物技术和工业领域的转型作用 | 无细胞系统,包括来自原核和真核生物的细胞提取物 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统技术 | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | NA | 生物技术, 生物医学, 环境可持续性 |
| 54 | 2026-01-27 |
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.003
PMID:41581985
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综述 | 本章深入探讨了无细胞系统在生物传感器开发中的设计、功能与应用 | 强调了无细胞生物传感器在即时检测和资源匮乏环境中的独特价值,并展望了其与物联网、分布式制造等智能技术的融合前景 | 讨论了当前无细胞生物传感器在储存寿命、灵敏度和可扩展性方面的限制 | 综述无细胞系统在生物传感器开发中的应用潜力与技术进展 | 无细胞系统及其构建的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 体外转录与翻译 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传电路(包括信号输出策略) | 医疗保健, 环境科学, 农业, 食品质量保障 |
| 55 | 2026-01-27 |
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.008
PMID:41581984
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综述 | 本章探讨了无细胞系统与自动化和机器人技术的融合,及其在生物技术和生物工程领域的应用 | 将无细胞系统的可编程性与自动化和机器人技术的精确性和可扩展性相结合,以加速发现和创新生物材料的开发 | 标准化、创建更稳健且经济的无细胞提取物,以及整合人工智能和机器学习以优化实验设计和过程 | 研究无细胞系统在自动化和机器人技术中的应用,以推动生物技术和生物工程的发展 | 无细胞蛋白质合成(CFPS)和其他可编程的无细胞生物机制 | 生物工程 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、微流体设备、液体处理机器人、集成分析平台 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学电路的快速原型设计 | 生物技术、生物工程、高通量筛选、按需生物制造、即时诊断 |
| 56 | 2026-01-27 |
High-throughput screening of biomolecules using cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.11.001
PMID:41581987
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综述 | 本文探讨了基于无细胞系统的高通量筛选在生物分子鉴定与评估中的原理、平台及应用 | 系统阐述了无细胞系统作为传统活细胞筛选的替代方案,克服了细胞毒性、代谢干扰等限制,并整合了微流控、自动化与机器学习等前沿技术 | 存在试剂成本较高、翻译后修饰功能有限等挑战 | 推动合成生物学、药物发现、诊断和蛋白质工程领域的下一代生物分子筛选与治疗开发 | 生物分子(化合物、核酸、蛋白质) | 合成生物学 | NA | 高通量筛选、无细胞转录翻译系统、微流控、数字PCR、质谱分析 | NA | 荧光、发光、质谱等生化输出数据 | NA | NA | 大肠杆菌、小麦胚芽、兔网织红细胞 | NA | 医药、诊断、工业生物技术 |
| 57 | 2026-01-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
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综述 | 本章节全面概述了无细胞系统作为低成本诊断平台的基本原理、设计方法、技术突破及其在即时诊断中的应用 | 系统性地整合了无细胞诊断平台的生化基础、合成生物学工具(如基因电路、CRISPR-Cas、RNA适配体)以及新兴技术(纸基检测、微流控/可穿戴生物传感器),并探讨了AI辅助系统设计等前沿趋势 | 作为综述章节,未提供原始实验数据,且重点讨论技术原理与应用前景,对具体实施细节和商业化路径的覆盖可能有限 | 总结无细胞系统在低成本诊断领域的发展现状、技术原理与应用潜力,旨在推动该技术在医疗资源匮乏地区的普及 | 无细胞诊断系统(包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物、PURE系统等平台)及其在即时诊断中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统、CRISPR-Cas工具、RNA适配体技术、纸基检测、微流控生物传感、可穿戴生物传感 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 基因电路 | 大肠杆菌, 小麦胚芽 | 用于提高诊断灵敏度与特异性的基因电路 | 医学 |
| 58 | 2026-01-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
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研究论文 | 本文提供了无细胞蛋白质合成(CFPS)系统的完整制备协议,包括高活性细胞提取物的制备、蛋白质表达反应系统的优化以及蛋白质表达与功能的评估方法 | 详细介绍了宿主菌株选择、机械裂解、提取物澄清以及能量与离子平衡优化的逐步协议,并探讨了将机器学习与冻干格式CFPS结合的未来集成流程 | 协议可能面临mRNA降解、蛋白质错误折叠和污染等常见瓶颈,导致产量损失 | 开发高效的无细胞蛋白质合成系统,用于快速、模块化的蛋白质生产 | 无细胞蛋白质合成系统的制备与优化 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、SDS-PAGE、Western印迹分析、荧光检测 | NA | 实验协议 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、诊断领域、按需生物制造、食品、医疗保健、工业 |
| 59 | 2026-01-27 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
|
综述 | 本文综述了无细胞转录翻译系统的发展历程、优势、应用及面临的挑战与未来方向 | 系统总结了无细胞转录翻译系统从E. coli提取物到多物种提取物的演变,并强调了其在合成蛋白质方面的快速、高效和化学耐受性优势 | 高成本、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定性 | 探讨无细胞转录翻译系统在分子生物学、合成生物学和生物技术中的应用潜力与改进方向 | 无细胞转录翻译系统及其在蛋白质合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | NA | E. coli, 细菌, 酵母, 真核生物 | NA | 生物技术, 生物制药 |
| 60 | 2026-01-27 |
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.009
PMID:41581993
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综述 | 本章探讨了人工智能与无细胞系统的整合,重点关注其在合成生物学中的最新进展、工业应用及未来方向 | 利用人工智能(包括机器学习、深度学习和生成模型)优化无细胞系统,实现了抗菌肽的发现和蛋白质产量的显著提升 | 面临数据需求、模型可转移性和可扩展性等挑战 | 优化无细胞系统以加速生物过程测试和反应条件控制 | 无细胞系统中的蛋白质合成、代谢和反应条件 | 合成生物学 | NA | 细胞游离蛋白质合成 | 机器学习、深度学习、生成模型、贝叶斯优化、神经网络 | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 生物制造、制药、诊断 |