合成生物学相关文章
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当前共找到 268 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-06-04 |
Yeast Biosensors for the Safety of Fermented Beverages
2026-Jan-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16010064
PMID:41590316
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综述 | 综述酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的应用与发展 | 系统总结了酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的优势，包括实时检测、低成本、可集成于发酵系统，以及利用酵母的GRAS特性确保安全 | 酵母生物传感器仍主要停留在实验室规模，与工业广泛应用之间存在明显差距，需进一步研究其鲁棒性、可扩展性和监管整合 | 探讨酵母生物传感器在发酵饮料生产中保障安全性和品质的潜力，推动更安全、更高质量产品的制造 | 酵母生物传感器及其在啤酒、葡萄酒、康普茶等发酵饮料中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 报告系统（如荧光、颜色变化或电信号） | 食品 |
| 42 | 2026-06-04 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
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综述 | 综述了无细胞转录翻译系统的开发历程、现状及未来发展方向 | 详细阐述了无细胞系统从最初的大肠杆菌提取物发展到涵盖多种生物来源的综合平台，并指出其在快速高效合成蛋白质、增强化学抗性和简化标记等方面的独特优势 | 存在成本高、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定等挑战 | 介绍无细胞转录翻译系统的开发进展及其在合成生物学和生物制药中的应用潜力 | 无细胞转录翻译系统（TXTL） | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母, 真核细胞 | NA | 合成生物学, 生物制药 |
| 43 | 2026-06-04 |
Advances in protein engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.002
PMID:42191275
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综述 | 综述蛋白质工程在医学、食品和环境等领域的最新进展，重点关注人类疾病治疗和生物医学科学 | 系统总结了蛋白质工程在CRISPR/Cas系统、高通量数据和合成生物学中的关键成就，涵盖进化、理性设计、半理性设计和混合方法等创新技术 | 讨论了蛋白质工程应用的当前挑战和伦理考量 | 回顾蛋白质工程的最新发展，强调其在人类疾病特别是癌症治疗中的变革潜力 | 蛋白质工程相关技术及其在治疗性蛋白质、抗体工程、酶合成中的应用 | 蛋白质工程 | 癌症 | 蛋白质工程、CRISPR/Cas、高通量数据 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学、食品、环境、工业生物技术 |
| 44 | 2026-06-04 |
The synergy of foundation technologies and computer sciences advances microbial expression systems in biomedical genetic engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.007
PMID:42191273
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综述 | 基础技术与计算机科学的协同作用推动了生物医学基因工程中微生物表达系统的发展 | 系统阐述了合成生物学、CRISPR-Cas9等基因组编辑工具、下一代测序与组学技术、人工智能以及系统生物学与代谢建模等多学科技术的协同潜力，并提出克服当前障碍的策略 | 仍存在脱靶效应、代谢负担和放大生产限制等挑战 | 探讨基础生物技术与计算科学如何协同推进生物医学基因工程中微生物表达系统的进步 | 微生物表达系统 | 机器学习 | NA | 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 医学 |
| 45 | 2026-06-04 |
Protein Design Enters the Artificial Intelligence Era: Foundations, Tools, and Emerging Paradigms
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0105
PMID:42231905
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综述 | 本文综述了人工智能在蛋白质设计领域的应用，涵盖深度学习、蛋白质语言模型和知识图谱等技术，以及它们在序列-结构-功能关系解析中的进展 | 系统总结了AI在蛋白质设计中的新范式，包括AlphaFold2的结构预测精度和Transformer模型从头序列设计，突出了计算与实验整合的趋势 | 模型可解释性不足、训练数据存在偏差以及实验验证率较低仍是主要挑战 | 分析人工智能驱动蛋白质设计的计算方法、基准指标及机器学习与实验管线的整合 | 蛋白质序列、结构和功能关系，以及相关计算工具和模型 | 机器学习 | NA | 深度学习, 蛋白质语言模型, 知识图谱, AlphaFold2, Transformer | 深度学习模型, 蛋白质语言模型, Transformer | 蛋白质序列数据, 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 46 | 2026-06-03 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 探究普城沙雷氏菌胞外聚合物在浮游和生物膜系统中对铜离子吸附的关键作用 | 首次揭示普城沙雷氏菌As3-5a(5)菌株中紧密结合型胞外聚合物的蛋白组分对铜离子高效吸附的贡献，并定量比较浮游细胞与生物膜系统的吸附效率 | 未通过合成生物学方法优化铜离子固定能力，且系统在真实工业废水条件下的技术成熟度尚需提升 | 阐明细菌胞外聚合物在铜离子生物吸附中的核心机制并开发工业废水处理应用 | 普城沙雷氏菌As3-5a(5)菌株的浮游细胞和生物膜系统 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附 | NA | 浓度数据 | 铜离子初始浓度3.14 mM（实验室体系）和40 mM（电镀废水） | NA | 普城沙雷氏菌 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 47 | 2026-06-03 |
Engineering Trichoderma-mediated plant defense against bacterial phytopathogens: Micro-and nanobiotechnological strategies
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026002
PMID:41938783
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综述 | 该文章综述了利用木霉介导的植物防御对抗细菌性植物病原体的微生物与纳米生物技术策略 | 将纳米技术与CRISPR基因编辑和合成生物学相结合，构建木霉作为下一代精准作物保护平台 | 田间转化、生物安全性和监管方面仍存在挑战 | 综述木霉在防控细菌性植物病害中的微生物与纳米生物技术策略 | 木霉属真菌及细菌性植物病原体（如XXX、XXX等） | NA | 细菌性植物病害 | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米技术、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 木霉 | 工程化生物防治菌株 | 农业 |
| 48 | 2026-06-03 |
Engineering the holobiont: Synthetic biology strategies for reversing bioenergetic collapse in radiation enteritis
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026003
PMID:41938784
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略工程化肠道微生物组，以逆转放射场肠炎中生物能量崩溃的方法 | 提出从经验性益生菌补充转向理性微生物组工程，包括热力学工程、遗传驯化和布尔逻辑门生物计算机设计，以解决当前治疗的局限性 | 目前仍处于概念性路线图阶段，缺乏大规模人体临床验证和安全性评估的具体数据 | 通过合成生物学方法重建肠道稳态，实现放射场肠炎的治疗并改善癌症长期生存率 | 肠道微生物组，特别是工程化共生菌和宿主-微生物互作网络 | 合成生物学 | 放射场肠炎 | 合成生物学，基因编辑，微生物工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程化共生菌（如大肠杆菌），肠道微生物组 | 布尔逻辑门，热力学工程，遗传驯化（如磺酸酶删除），生物计算机，STALEMATE生物防护系统 | 医学，肿瘤放疗 |
| 49 | 2026-06-02 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-01-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
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综述 | 综述了液-液相分离驱动生物分子凝聚体形成的分子机制、设计策略及其在合成生物学中的转化前景 | 将液-液相分离原理从细胞组织引申至合成平台，系统归纳了利用内在无序蛋白、模块化互作基序和RNA支架设计功能性凝聚体的策略 | 未涉及合成凝聚体在体内复杂环境中的长期稳定性及潜在脱靶效应 | 总结液-液相分离介导的凝聚体分子机制与工程设计方法，促进细胞生物物理学与生物工程的交叉研究 | 液-液相分离形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 合成凝聚体（用于增强催化、代谢控制、靶向药物递送和生物传感） | 医学, 工业生物技术 |
| 50 | 2026-06-02 |
Chemically synthesized high-fidelity oligos ≤ 600 nt as building blocks to accelerate complex gene construction in synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag005
PMID:42222009
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研究论文 | 报道一种名为UCOS的新型平台，用于高效合成长度≤600个核苷酸、具有复杂重复序列和碱基分布不均特征的高保真寡核苷酸 | 采用非多孔硅微球替代传统可控孔玻璃作为固相载体，结合5'侧翼序列杂交的全长富集和错误去除酶，显著提升复杂超长寡核苷酸的合成保真度 | NA | 开发能够高效合成复杂、超长DNA片段的方法，以支持合成生物学和基因工程应用 | 超长复杂寡核苷酸（≤600 nt），包括串联重复序列和碱基分布不均的序列 | 合成生物学 | NA | UCOS（超长复杂寡核苷酸合成） | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、合成基因组学 |
| 51 | 2026-06-01 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 介绍了DNA-Diffusion，一种基于生成式人工智能的框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用机器学习基于多种细胞系的DNA可及性数据生成200碱基对的合成调控元件，重构内源转录因子结合语法，并增强细胞类型特异性 | 未提及在体内长期稳定性或脱靶效应的评估 | 开发生成式AI方法以设计用于精确基因表达控制的调控元件 | 合成调控元件及其在不同细胞系中的功能验证 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式人工智能框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件的STARR-seq文库，在三种细胞系中验证 | NA | 人类细胞系 | 合成调控元件 | 医学, 基因治疗 |
| 52 | 2026-05-29 |
High-Throughput Stationary 13C-Based Metabolic Flux Analysis of Pichia pastoris Strains
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4779-0_9
PMID:41028460
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研究论文 | 描述了一种利用高通量培养平台对毕赤酵母菌株进行静态碳代谢流分析的方法 | 提出高通量平台用于大规模工程菌株的代谢流特征分析，加速菌株工程循环 | NA | 实现高通量的13C代谢流分析，以表征工程菌株的细胞内代谢反应速率 | 毕赤酵母（Komagataella phaffii）菌株 | 代谢工程 | NA | 13C代谢流分析 | NA | 代谢通量数据 | 一组工程菌株 | NA | 毕赤酵母（Komagataella phaffii） | NA | 工业生物技术 |
| 53 | 2026-05-29 |
From feeding cell to fruiting body: Multidrug transport in the life cycle of Dictyostelium discoideum
2026, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2026.02.002
PMID:42203389
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综述 | 本文综述了盘基网柄菌生命周期中多药转运蛋白的功能与进化保守性 | 首次系统整合盘基网柄菌中多药耐药蛋白的遗传组成，结合RNAseq与转录组共表达数据，揭示其在趋化、合作和细胞分化中的未探索角色 | 多药转运蛋白在该生物中的实验表征研究稀疏，功能验证数据有限 | 探讨多药转运蛋白在盘基网柄菌生命周期中的进化保守角色及在合成生物学、药物研究和微生物生理学中的应用潜力 | 盘基网柄菌的多药转运蛋白家族（ABC、MFS、MATE、SMR/DMT、RND、AbgT、PACE） | 微生物学 | NA | RNA-seq、转录组学共表达分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 盘基网柄菌 | NA | 医学、合成生物学、药学 |
| 54 | 2026-05-27 |
New frontiers and applications of cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.002
PMID:41581983
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综述 | 该文章概述了无细胞系统及其在合成生物学中的应用 | 强调了无细胞系统在消除细胞膜屏障、实现高通量蛋白质合成、非规范氨基酸掺入、生物传感、药物发现和代谢工程中的创新应用 | 未明确提及局限性 | 突出无细胞系统的基础及其在生物技术和工业中的快速、适应性解决方案 | 无细胞系统及其应用案例 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 原核生物、真核生物 | NA | 生物技术, 生物医学, 环境可持续性 |
| 55 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
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综述 | 全面概述基于无细胞系统的低成本诊断技术的原理、设计方法和突破 | 系统性地总结了无细胞诊断平台在资源贫乏环境中的应用，包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物和PURE系统，并融合合成生物学基因回路、CRISPR-Cas工具和RNA适体以提高诊断灵敏度和特异性 | 试剂稳定性、可扩展性和监管问题仍是主要挑战 | 阐明无细胞系统在低成本诊断中的潜力，推动即时诊断和全球健康改善 | 基于无细胞表达的诊断平台 | 数字病理学 | 未提及 | 无细胞表达，CRISPR-Cas，RNA适体 | 未提及 | 未提及 | 未提及 | CRISPR-Cas | 大肠杆菌，小麦，纯化系统 | 基因回路，生物传感器 | 医学 |
| 56 | 2026-05-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
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研究论文 | 提供无细胞蛋白合成系统的制备方案，包括细胞提取物制备、反应优化及蛋白质表征方法 | 详细阐述了从宿主菌选择、机械裂解到能量离子平衡优化的完整流程，并整合了常见瓶颈的解决方案，为无细胞系统在合成生物学和诊断领域的应用提供了可复现的标准化方法 | 未涉及大规模生产中的成本控制问题，且对复杂蛋白质（如膜蛋白）的合成效率优化讨论有限 | 建立高效制备无细胞蛋白合成系统的标准化协议，并展望其与机器学习结合的未来应用 | 无细胞蛋白合成系统（细胞提取物、反应体系优化及蛋白质功能分析） | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 实验数据（蛋白质表达与功能分析） | NA | NA | 大肠杆菌 | 无细胞表达反应体系（代谢通路） | 合成生物学，诊断，生物制造，食品，医疗 |
| 57 | 2026-05-27 |
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.010
PMID:41581989
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综述 | 综述无细胞系统在合成生物学中的应用和进展 | 强调了无细胞系统在快速原型构建、与人工智能和微流控技术集成以及实现去中心化、可编程生物技术方面的范式转变 | 仍面临试剂成本高、批次差异大和可扩展性有限等挑战 | 系统阐述无细胞系统在合成生物学中的变革性作用及其未来发展方向 | 无细胞系统技术及其应用场景 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | 无细胞系统, PURE系统 | NA | 基因回路, 代谢途径, 生物传感器 | 医学, 环境, 工业生物技术 |
| 58 | 2026-05-27 |
Innovations in cell-free synthetic biology via microfluidic approaches
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.004
PMID:41688139
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综述 | 本文综述了利用微流控技术解决无细胞合成生物学面临挑战的创新方法 | 首次系统总结了微流控与无细胞系统整合作为合成生物学创新平台的前沿方法，并探讨其在生物医学、治疗、诊断和环境等领域的潜力 | 作为一章书籍内容，可能未包含最新研究进展且深度有限 | 综述微流控方法在无细胞合成生物学中的应用及创新平台开发 | 无细胞系统与微流控技术的集成应用 | 合成生物学 | NA | 微流控 | NA | NA | NA | 无细胞系统 | NA | 基因和蛋白质合成回路 | 生物医学, 治疗, 诊断, 环境 |
| 59 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for vaccine production
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.001
PMID:41688142
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综述 | 这篇综述全面概述了无细胞系统在生物医学领域的应用，重点关注疫苗开发与生产 | 提出解决无细胞平台当前局限性的创新方法，如糖工程改造、冻干保存、外泌体递送及机器学习集成 | 无细胞系统存在翻译后修饰不足、内毒素残留和生产成本高等限制 | 综述无细胞系统在疫苗开发和生产中的应用及未来创新方向 | 无细胞系统及其在疫苗生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 60 | 2026-05-27 |
Cell free systems for production of chemicals
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.003
PMID:41688134
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综述 | 本章概述了无细胞系统在化学品生产中的设计、优化和应用 | 强调了无细胞系统在模块化途径构建、辅因子平衡和能量再生方面的功能，并介绍了合成生物学工具、系统工程策略和放大技术 | 未明确提及，但无细胞系统可能面临成本、稳定性和规模化方面的挑战 | 探讨无细胞系统在工业化学品、生物燃料、药物前体和特种化合物生产中的应用 | 无细胞系统，包括基于酶的系统、基于裂解液的系统和混合系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 模块化途径构建、辅因子平衡、能量再生 | 工业生物技术, 医药, 能源, 材料 |