合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 215 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-01-27 |
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.010
PMID:41581989
|
综述 | 本文综述了无细胞系统在合成生物学中的发展、优势、应用及挑战 | 阐述了无细胞系统如何通过消除细胞膜限制，实现对生化条件的空前控制，并加速设计-构建-测试周期，代表了向去中心化、可编程生物技术的范式转变 | 面临试剂成本高、批次间差异和规模化等挑战 | 探讨无细胞系统作为合成生物学变革性工具的原理、进展与应用前景 | 无细胞系统及其相关技术与平台 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统，PURE系统，冻干技术，可编程生物合成平台 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | NA | 遗传电路，代谢途径，生物传感器 | 医学，环境，工业生物技术 |
| 62 | 2026-01-26 |
Integrated omics analysis of the cellulose co-degradation network of Chaetomium thermophilum
2026-Jan-24, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02741-x
PMID:41580774
|
研究论文 | 本研究通过整合组学分析揭示了嗜热毛壳菌纤维素共降解网络的协同机制 | 首次在嗜热真菌中系统揭示了从转录调控到酶分泌适应的多级协同降解机制，并发现CtClr-2作为核心转录因子驱动关键基因共表达 | 研究聚焦于单一嗜热真菌物种，其机制在其他工业相关真菌中的普适性仍需验证 | 解析嗜热真菌高效降解纤维素的系统机制，为生物燃料工业化提供理论依据 | 嗜热毛壳菌（Chaetomium thermophilum）的纤维素降解网络 | 合成生物学 | NA | 整合组学分析（omics analysis） | NA | 转录组与蛋白质组数据 | NA | 合成生物学（synthetic biology） | 嗜热毛壳菌 | 纤维素降解网络（包含LPMOs、CDH、CBH等酶的协同作用） | 能源 |
| 63 | 2026-01-26 |
Plant non-canonical peptides: from identification to mechanisms
2026-Jan-23, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
|
综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控植物生长、发育、免疫和环境适应中的功能机制 | 系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新策略，并提出了整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学以揭示植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探讨植物肽在作物改良和跨学科创新中的应用潜力 | 植物肽，包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学、质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 64 | 2026-01-26 |
Membrane and Proteome Allocation Constraints in Escherichia coli Models during Overflow Metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
|
研究论文 | 本研究开发了一个考虑膜蛋白分配约束的基因组尺度代谢模型MAFBA，以揭示大肠杆菌在快速生长时发生溢出代谢的机制 | 提出了首个可扩展的、引入膜蛋白总质量可调约束的基因组尺度代谢模型MAFBA，揭示了膜资源分配与整体蛋白质组限制共同作用驱动溢出代谢的机制 | 模型基于大肠杆菌构建，其普适性在其他微生物中仍需验证；约束参数可能依赖于特定生长条件 | 探究膜蛋白分配约束如何影响大肠杆菌的代谢策略，特别是溢出代谢的发生机制 | 大肠杆菌的代谢网络与膜蛋白分配 | 合成生物学 | NA | 通量平衡分析 | 基因组尺度代谢模型 | 代谢网络数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 65 | 2026-01-26 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-Jan-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
|
研究论文 | 本文报道了一种中性双组分系统，首次在生理pH下实现了cAMP和AMP跨脂质体膜的促进运输 | 首次展示了使用中性双组分系统促进cAMP和AMP跨膜运输，通过合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物配对提高运输效率 | NA | 研究核苷酸跨膜运输机制，探索小分子系统在药物递送和合成生物学中的应用潜力 | cAMP和AMP核苷酸 | 合成生物学 | NA | 脂质体荧光实验、P NMR实验 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 合成生物学 |
| 66 | 2026-01-26 |
Engineering bacteriophages for gut health: precision antimicrobials and beyond
2026-Jan-22, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04038-5
PMID:41566387
|
综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道健康中的应用，涵盖合成生物学和纳米技术进展，并探讨其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的治疗潜力 | 利用合成生物学和纳米技术重新设计噬菌体，增强其特异性、功能性和稳定性，作为微生物群中心疗法的多功能工具 | 面临长期稳定性、耐药性发展和规模化生产等挑战 | 探讨工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道疾病治疗中的应用，以应对微生物失调、抗生素耐药性和宿主-微生物相互作用破坏 | 工程化噬菌体及其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病、结直肠癌、感染性肠炎 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 67 | 2026-01-26 |
HMRPred: A Machine Learning-Based Web Resource for Identification of Heavy Metal Resistance Proteins
2026-Jan-22, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169659
PMID:41580067
|
研究论文 | 开发了一个基于机器学习的网络资源HMRPred，用于识别重金属抗性蛋白 | 首个针对多种重金属（砷、镉、铬等10种）和生物域的系统性重金属抗性蛋白分类资源，填补了现有机器学习方法主要关注抗生素抗性基因的空白 | 未明确说明模型在跨物种泛化能力方面的具体限制 | 开发一个可靠的预测框架，用于识别重金属抗性蛋白，支持环境修复和合成生物学应用 | 重金属抗性蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 多种机器学习算法 | 蛋白质序列 | 经过实验验证的抗性和非抗性蛋白质数据集 | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 68 | 2026-01-26 |
YhfH functions as a tri-function RNA in Bacillus thuringiensis BMB171
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1528
PMID:41562254
|
研究论文 | 本研究揭示了枯草芽孢杆菌BMB171菌株中的YhfH RNA具有三重功能：作为小RNA调控嘧啶生物合成、作为反义RNA调控LipR表达、以及作为mRNA编码抑制自身转录的肽YhfH-P | 首次发现单个RNA分子（YhfH）同时具备小RNA、反义RNA和mRNA三重调控功能，并阐明其通过编码肽YhfH-P实现自我反馈抑制的新机制 | 研究局限于枯草芽孢杆菌BMB171菌株，尚未在其他细菌中验证YhfH功能的保守性；YhfH-P抑制ilv-leu操纵子的具体结构机制有待进一步解析 | 探究枯草芽孢杆菌中YhfH RNA的多重调控功能及其分子机制 | 枯草芽孢杆菌BMB171菌株的YhfH RNA及其编码肽YhfH-P | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 三重功能RNA调控网络（包含自我抑制反馈环路、代谢途径交叉调控） | 合成生物学 |
| 69 | 2026-01-26 |
A new frontier in synthetic biology: leveraging phase separation for robust gene circuits
2026-Jan-12, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.020
PMID:41580366
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2026-01-26 |
Contrasting genome composition and codon usage in Listeria monocytogenes temperate versus virulent phages
2026, Virus evolution
IF:5.5Q1
DOI:10.1093/ve/veaf100
PMID:41573078
|
研究论文 | 本研究比较了单核细胞增生李斯特菌温和噬菌体与烈性噬菌体的基因组组成和密码子使用模式 | 首次系统比较了单核细胞增生李斯特菌中温和与烈性噬菌体的基因组大小、基因长度及密码子使用偏好的差异，揭示了噬菌体生活方式对密码子使用的塑造作用 | 研究仅针对单核细胞增生李斯特菌噬菌体，结论在其他细菌噬菌体中的普适性有待验证 | 探究噬菌体生活方式（温和型 vs 烈性）对基因组结构和密码子使用模式的影响 | 单核细胞增生李斯特菌的温和噬菌体（686个）和烈性噬菌体（1516个）的编码序列 | 微生物基因组学 | NA | 基因组比较分析、密码子适应指数计算 | NA | 基因组序列数据 | 2202个噬菌体编码序列（686个温和型 + 1516个烈性型） | NA | 单核细胞增生李斯特菌 | NA | 生物技术、合成生物学、治疗应用、生物防治 |
| 71 | 2026-01-25 |
Biosynthesis of Indigoidine in Microorganisms: Strategies and Applications
2026-Jan-23, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00800
PMID:41576205
|
综述 | 本文系统回顾了微生物中靛蓝素的生物合成策略与应用，重点关注宿主系统、代谢工程和合成生物学技术 | 整合了微生物宿主系统、代谢与酶工程以及合成生物学技术，为靛蓝素生产提供了全面的路线图 | 存在途径优化、产量提升和应用多样性方面的挑战 | 探讨微生物中靛蓝素的生物合成策略及其在工业应用中的潜力 | 靛蓝素及其在微生物中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶（NRPSs）介导的生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 微生物底盘菌株 | 靛蓝素生物合成途径 | 纺织工业 |
| 72 | 2026-01-25 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
|
综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）的致癌机制，并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合了新兴诊断生物标志物（如病毒microRNA）与下一代治疗策略（包括基因编辑和合成生物学方法），强调精准医学在改善疾病检测和治疗特异性方面的机会 | 当前KS诊断仍主要依赖组织病理学和LANA免疫染色，这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要局限性 | 理解KSHV驱动的致癌机制，并概述未来诊断和治疗创新的关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）及其相关的癌症，如卡波西肉瘤（KS）、原发性渗出性淋巴瘤（PEL）和多中心性Castleman病（MCD） | NA | 卡波西肉瘤、淋巴增生性疾病 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 73 | 2026-01-25 |
ACCU-RATES: A web tool for accurate enzyme kinetics and initial reaction rate measurements
2026-Jan-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169654
PMID:41577122
|
研究论文 | 开发了一个名为ACCU-RATES的网络工具，用于精确分析酶动力学数据和测定初始反应速率 | 采用微分形式的米氏方程对反应进程曲线进行数值拟合，无需依赖线性反应阶段，在数据噪声和低采样率条件下仍能提供可靠参数估计 | 需要至少两个时间点的产物积累或底物消耗曲线数据 | 开发精确测定酶初始反应速率和动力学参数的工具 | 酶反应进程曲线 | 生物信息学 | NA | 数值拟合方法 | 微分形式的米氏方程 | 酶反应动力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,医学（抑制剂发现和生物标志物检测） |
| 74 | 2026-01-25 |
The Importance of Being Imperfect: Structure and Function of Bacterial Amyloid
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517090
PMID:41347620
|
综述 | 本文综述了细菌功能性淀粉样蛋白（FuBAs）的结构、组装和功能，强调其作为进化中间体和生物材料工程平台的潜力 | 通过冷冻电镜和计算研究揭示了FuBAs（如CsgA和FapC）的β-螺旋折叠结构，由不完美重复序列稳定，具有高稳定性和低多态性，并展示了其内在催化活性和分层机械性能 | NA | 探讨细菌功能性淀粉样蛋白的结构与功能关系及其在生物材料和合成生物学中的应用 | 细菌功能性淀粉样蛋白，特别是大肠杆菌的curli（CsgA）和假单胞菌的FapC | NA | NA | 冷冻电镜（cryo-EM）、整合计算研究 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌（Escherichia coli）、假单胞菌（Pseudomonas） | NA | 生物材料工程、合成生物学、催化、生物膜控制 |
| 75 | 2026-01-25 |
Engineered food-borne probiotics delivering checkpoint-inhibitor modulators
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004399
PMID:41497008
|
研究论文 | 本文探讨了工程化食源性益生菌作为递送检查点抑制剂调节剂的新型策略，结合合成生物学、营养学和癌症免疫疗法 | 开发了工程化食源性益生菌，通过分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2等分子，在临床前模型中显示出显著的抗肿瘤效果，并首次在非小细胞肺癌的I期试验中验证了其安全性和有效性 | 存在定植和生物安全性方面的挑战 | 研究工程化食源性益生菌作为低毒性免疫治疗平台的潜力 | 工程化食源性益生菌、检查点抑制剂调节剂、癌症免疫疗法 | 合成生物学 | 肺癌 | 工程化益生菌、可控基因电路 | NA | 临床前模型数据、临床荟萃分析、I期试验数据 | 临床前小鼠模型、非小细胞肺癌I期试验患者 | 可控基因电路 | 食源性益生菌 | 分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2的生物传感器或递送系统 | 医学 |
| 76 | 2026-01-25 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
|
研究论文 | 本文提出了一种利用工程化乳酸杆菌表达肿瘤杀伤细胞因子（如IL-12、IL-15和TRAIL）的新型生物治疗方法，旨在克服系统性细胞因子疗法的毒性问题 | 将免疫疗法与微生物组工程相结合，开发出局部作用、低毒性的工程化益生菌作为抗肿瘤生物治疗剂 | 研究目前主要基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发一种新型的低毒性抗肿瘤生物治疗方法 | 工程化乳酸杆菌及其表达的肿瘤杀伤细胞因子 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具（诱导型启动子、生物安全杀死开关） | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | 细胞因子表达系统（IL-12、IL-15、TRAIL表达通路） | 医学 |
| 77 | 2026-01-25 |
Structure of Chlamydomonas reinhardtii LciA guided the engineering of FNT family proteins to gain bicarbonate transport activity
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02200-9
PMID:41507353
|
研究论文 | 本研究解析了莱茵衣藻LciA蛋白的结构，并基于结构指导成功改造了FNT家族蛋白，使其获得碳酸氢盐转运活性 | 首次报道了莱茵衣藻LciA的冷冻电镜结构，揭示了碳酸氢盐选择性的分子机制，并成功通过定点突变将细菌FNT家族亚硝酸盐通道改造为碳酸氢盐通道 | NA | 增强光合作用效率，为将CO2浓缩机制引入C3作物提供分子工具 | 莱茵衣藻LciA蛋白、细菌FNT家族蛋白NirC、莱茵衣藻亚硝酸盐通道NAR1.1/NAR1.5 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、定点突变、生长测定 | NA | 结构数据、功能数据 | NA | 定点突变 | 莱茵衣藻、细菌 | 碳酸氢盐转运通道 | 农业 |
| 78 | 2026-01-24 |
A modular single- and dual-gene expression toolkit for Kluyveromyces marxianus
2026-Jan-23, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04794-4
PMID:41571921
|
研究论文 | 本文开发了基于筛选元件（如启动子pENO和双向启动子pHTX）的单基因和双基因表达工具包，用于Kluyveromyces marxianus，以提升其合成生物学应用 | 开发了适用于K. marxianus的模块化单基因和双基因表达系统，包括利用短基因间序列（IGG）进行双顺反子表达，以及通过SV40核定位信号实现亚细胞靶向 | NA | 开发高效且响应环境的基因表达工具包，以促进K. marxianus作为工业蛋白质生产和合成生物学应用的多功能微生物底盘 | Kluyveromyces marxianus酵母及其基因表达系统 | 合成生物学 | NA | 基因表达系统构建、荧光蛋白定位 | NA | NA | 多个K. marxianus菌株 | Gibson Assembly, BioBrick | Kluyveromyces marxianus | 单基因表达系统、双基因表达系统、双向启动子pHTX、核定位信号（NLS）靶向 | 工业生物技术, 食品 |
| 79 | 2026-01-24 |
Breaking the cell wall for efficient DNA delivery to diatoms
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68562-6
PMID:41571648
|
研究论文 | 本文介绍了针对硅藻Phaeodactylum tricornutum优化的电穿孔和聚乙二醇转化方法，以提高DNA和Cas9核糖核蛋白复合物的递送效率 | 开发了高效的DNA递送方法，包括电穿孔和PEG转化，并发现硅藻体内组装能力，适用于多种硅藻物种 | NA | 加速硅藻合成生物学项目及可持续技术的发展 | 硅藻物种，特别是Phaeodactylum tricornutum和Thalassiosira pseudonana | 合成生物学 | NA | 电穿孔，聚乙二醇转化，Cas9核糖核蛋白复合物递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Phaeodactylum tricornutum, Thalassiosira pseudonana | NA | 环境，能源，工业生物技术 |
| 80 | 2026-01-24 |
Bioremediation of ether PFAS alternatives: A structure-reactivity-partitioning framework for hybrid treatment design
2026-Jan-21, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2026.181367
PMID:41570765
|
综述 | 本文综述了醚基PFAS替代物的生物修复研究，提出了一个结构-反应性-分配框架，用于设计混合处理策略 | 识别了醚基PFAS的结构-反应性规则，并整合了混合处理（物理化学预活化与生物抛光结合）和基因增强系统作为创新修复途径 | NA | 探讨醚基PFAS替代物的生物修复策略，以解决其环境持久性和生物顽固性问题 | 醚基PFAS替代物，如HFPO-DA (GenX)、ADONA和氯化PFESAs (F-53B) | 环境科学 | NA | 生物修复技术，包括微生物、真菌、酶和植物系统，以及物理化学方法如UV/亚硫酸盐、电芬顿、等离子体和维生素B12/硫化物还原 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程微生物、转基因植物 | 表达加氧酶、脱卤酶或氟化物输出模块的工程微生物，以及携带氧化酶的转基因植物 | 环境 |