合成生物学相关文章
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当前共找到 225 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-02-10 |
A programmable ribozyme for RNA signal transduction
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68175-5
PMID:41519779
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研究论文 | 本文报道了一种可编程的RNA触发激活双位点自切割核酶平台UNBAR，用于RNA信号转导 | 首次开发了一种通用方法，允许RNA触发器直接激活多种非编码RNA效应子，实现了RNA检测与功能转导的一体化 | NA | 开发一种可编程的RNA信号转导平台，用于合成生物学、诊断和基因调控 | RNA触发器、非编码RNA效应子（如sgRNA、shRNA、适配体） | 合成生物学 | NA | RNA工程、细胞自由传感、蛋白质自由扩增 | NA | RNA序列数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 斑马鱼胚胎、人类细胞 | 可编程双位点自切割核酶，具有模块化传感域和切割产物 | 医学、合成生物学、诊断 |
| 62 | 2026-02-09 |
AP2/ERF transcription factors regulate the biosynthesis of terpenoids, phenolics, and alkaloids in plants
2026-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf280
PMID:41647723
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综述 | 本文综述了AP2/ERF转录因子在调控植物萜类、酚类和生物碱等次生代谢物生物合成中的分子机制与作用 | 系统性地分类和剖析了AP2/ERF转录因子调控次生代谢的多种模式，并探讨了其在代谢工程和合成生物学中的新兴应用 | NA | 阐明AP2/ERF转录因子调控植物次生代谢物生物合成的分子机制 | AP2/ERF转录因子及其调控的萜类、酚类和生物碱等植物次生代谢物 | NA | NA | 多组学技术、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 63 | 2026-02-08 |
HMRPred: A Machine Learning-Based Web Resource for Identification of Heavy Metal Resistance Proteins
2026-Jan-22, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169659
PMID:41580067
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研究论文 | 开发了一个基于机器学习的网络资源HMRPred，用于识别重金属抗性蛋白 | 首个针对多种重金属（砷、镉、铬等十种金属）和生物域的系统性重金属抗性蛋白分类资源，解决了传统同源性方法的局限性 | NA | 开发可靠的机器学习框架以识别重金属抗性蛋白，支持环境修复和合成生物学应用 | 重金属抗性蛋白和非抗性蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习算法 | 多种机器学习分类器 | 蛋白质序列 | 经过实验验证的抗性和非抗性蛋白数据集 | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 64 | 2026-02-08 |
Microbial engineering for sustainable microplastic biodegradation: from enzyme redesign to synthetic consortia
2026-Jan, International microbiology : the official journal of the Spanish Society for Microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s10123-025-00760-6
PMID:41423577
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综述 | 本文综述了微生物工程在可持续微塑料生物降解中的应用，涵盖从酶重设计到合成菌群的最新进展 | 结合CRISPR技术、计算酶设计和合成菌群，推动塑料生物降解效率，并连接实验室研究与实际应用 | 聚乙烯和聚苯乙烯降解的可扩展性不足、转基因生物的生物安全标准不明确、降解副产物可能带来环境风险 | 开发可持续的微塑料生物降解方法，以应对塑料污染问题 | 微塑料、微生物、酶（如PET水解酶、角质酶）、合成菌群 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术、基因组编辑、酶重设计、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌 | NA | 环境、工业生物技术 |
| 65 | 2026-02-08 |
From Atoms to Cells: AI-Based Structure Prediction Fueling Molecular Dynamics Simulations in Computational Structural Biology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-07511-6_2
PMID:41652159
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综述 | 本章探讨了人工智能与分子动力学模拟如何结合，从静态结构预测推进到动态细胞过程模拟，为全细胞模拟铺平道路 | 利用AI（如AlphaFold）快速准确预测蛋白质结构，结合分子动力学模拟，将模拟范围从单个生物分子扩展到复杂组装和整个细胞环境 | 仅结构预测不足以捕捉生物功能，需依赖分子动力学模拟揭示动态变化；模拟整个细胞过程仍面临计算资源和模型精度的挑战 | 通过AI与分子动力学模拟的融合，实现从原子到细胞的生物系统模拟，以推动计算结构生物学发展 | 蛋白质结构、生物分子组装、细胞过程及动态行为 | 计算结构生物学 | NA | 分子动力学模拟、AI结构预测（如AlphaFold） | AI模型（如AlphaFold） | 结构数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 生物研究、药物发现、合成生物学 |
| 66 | 2026-02-07 |
Engineered probiotics platform for oral delivery of antibody as a high-compliance alternative for immune-mediated inflammatory diseases
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102523
PMID:41421354
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研究论文 | 本研究开发了一种名为AIDEN的工程化益生菌平台，用于口服递送治疗性抗体，以改善免疫介导炎症性疾病的治疗依从性 | 首次构建了能够口服递送单链可变片段抗体的工程化益生菌平台，实现了肠道稳定定植和原位抗体持续生产 | 研究仅在鼠类模型中进行，尚未进行人体临床试验；系统IL-17A水平仅中度降低 | 开发一种高依从性的口服抗体递送平台，用于治疗免疫介导炎症性疾病 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917（EcN）益生菌平台及其分泌抗IL-17A单链可变片段的变体AIDEN-IL17 | 合成生物学 | 银屑病，炎症性肠病 | 合成生物学技术 | NA | NA | 鼠类模型 | 合成生物学 | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 抗体分泌系统，可模块化适配多种抗体治疗 | 医学 |
| 67 | 2026-02-06 |
Corrigendum to "Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications" [Biotechnology Advances 86 (2026) 108748]
2026-Jan-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108816
PMID:41611037
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2026-02-06 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
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研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶，能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸为三磷酸盐，并展示了其在体外转录中的应用潜力 | 开发了一种具有广泛底物谱的通用多磷酸激酶，突破了现有PPKs底物限制，实现了对嘌呤和嘧啶单磷酸及二磷酸的高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于通用多磷酸激酶的一锅法体外转录系统 | 工业生物技术 |
| 69 | 2026-02-06 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
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综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属（类金属）生物修复中的应用，探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了一个整合CRISPR编辑、多组学、合成生物学和新兴CRISPR生物传感器的统一路线图，用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前面临的生态风险、技术难题、法规问题以及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性，以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 70 | 2026-02-06 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
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综述 | 本文综述了细菌在转录水平精确控制蛋白质亚基化学计量的机制，并探讨了这些机制在合成生物学中的应用 | 超越经典的转录调控，重点阐述了转录后精细调控机制（如内部转录终止子和选择性RNA加工与稳定系统）在控制化学计量中的作用，并展示了如何利用这些机制设计可编程的合成基因电路 | NA | 探索细菌精确控制转录化学计量的机制及其在合成生物学中的应用 | 细菌的RNA水平调控机制及合成基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 启动子库、工程化终止子、基于RNase的加工模块、合成基因电路 | 生物技术、生物医学 |
| 71 | 2026-02-05 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用，包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 全面探讨了AI在单细胞分辨率分析、细胞行为建模以及蛋白质结构预测中的创新应用，并强调了工具民主化的未来方向 | NA | 探索人工智能在细胞生物学研究中的转化潜力与应用前景 | 细胞生物学数据、显微镜图像、单细胞转录组学、蛋白质结构 | 机器学习 | NA | 深度学习、高通量技术 | 深度学习 | 图像、生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、基础研究 |
| 72 | 2026-02-05 |
Biological conversion of methane to organic molecules: towards a low-carbon bioeconomy
2026-Jan, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaf547
PMID:41623557
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综述 | 本文综述了将甲烷生物转化为有机分子的研究进展，旨在推动低碳生物经济的发展 | 提出了一个整合合成生物学、代谢工程和系统生物学的系统性框架，用于设计基于甲烷的生物制造，以开发高效的甲烷同化细胞工厂 | NA | 开发下一代甲烷氧化细胞工厂，克服天然甲烷氧化菌的生理限制，实现甲烷向高价值生物产品的可持续转化 | 甲烷氧化菌及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 甲烷氧化菌 | 甲烷同化途径、中心碳代谢整合 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 73 | 2026-02-02 |
Synthetic biology for heparin biomanufacturing
2026-Jan-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00999-x
PMID:41588187
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综述 | 本文全面讨论了肝素生物制造技术的最新进展、挑战和未来前景 | 通过酶工程、代谢工程和合成生物学方法系统优化肝素生物合成途径，探索体内/体外组合策略和从头生物合成作为替代生产方法 | NA | 探索肝素生物制造技术以替代动物源提取方法 | 肝素生物合成途径 | 合成生物学 | 炎症、癌症 | 酶工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 肝素生物合成途径 | 医药 |
| 74 | 2026-02-02 |
PanForest: predicting genes in genomes using random forests
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag005
PMID:41512299
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研究论文 | 本文介绍了PanForest，一种使用随机森林分类器根据基因组中其他基因的存在情况来预测基因存在或缺失的软件工具 | 开发了首个基于随机森林的基因共现与互斥模式预测工具，能够大规模分析泛基因组并量化每个基因对预测其他基因的重要性 | 未明确说明模型在非细菌基因组或其他复杂真核生物中的泛化能力，且分析依赖于现有基因注释的准确性 | 研究基因共现与互斥模式，以揭示基因组组织的基本原理，并应用于进化重建和合成基因组设计 | 大肠杆菌（Escherichia coli）基因组中的12,741个附属基因 | 生物信息学 | NA | 随机森林分类器 | 随机森林 | 基因存在/缺失数据 | 1000个大肠杆菌基因组 | NA | NA | NA | 生物医学科学、合成生物学、分子生态学 |
| 75 | 2026-02-02 |
Protein engineering strategies to optimise recombinant product synthesis and accumulation in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70232
PMID:40577356
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综述 | 本文综述了在植物分子农业中，通过蛋白质工程和亚细胞工程策略优化本氏烟草中重组产品合成与积累的方法 | 讨论了蛋白质工程与亚细胞工程策略的创新结合，以定制本氏烟草用于重组蛋白质、肽和小分子的生产，包括信号序列融合、多功能结构域应用和异源酶共表达 | NA | 优化本氏烟草中重组产品的合成与积累，提高植物分子农业的生产效率 | 本氏烟草中的重组蛋白质、肽和小分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、亚细胞工程、异源酶共表达 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草 | 合成细胞器、正交翻译后修饰途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 76 | 2026-02-02 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达在Nicotiana benthamiana中工程化Solanum家族甾体生物碱和皂苷的生物合成途径，成功生产了多种高价值代谢物 | 发现并利用SlGAME2-NEW木糖基转移酶，首次在异源植物宿主中完整重构了番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷生物合成途径 | NA | 应用合成生物学在异源植物宿主中生产高价值的甾体代谢物 | 番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷，包括α-番茄碱、脱氢番茄碱及其立体异构体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、基因工程 | NA | NA | NA | 基因组合表达 | Nicotiana benthamiana | 甾体生物碱和皂苷的生物合成途径，涉及9至15个基因的组合表达 | 医药 |
| 77 | 2026-02-02 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
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综述 | 本文综述了在烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略，以提升其作为生物工厂的潜力 | 整合了化学/电磁信号传感器、可编程转录因子合成启动子、病毒复制子扩增系统及重组酶处理器等前沿技术，提出植物细胞包和自持生物发光系统等快速原型平台 | 未提供具体实验数据验证所述技术的实际效率与稳定性 | 开发可控制转基因表达的系统以克服烟草生物工厂的规模化限制 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、重组酶技术、病毒复制子技术 | NA | NA | NA | CRISPR, 重组酶系统 | 本氏烟草 | 条件性基因表达电路、信号传感器、合成启动子、转录信号放大系统、细胞记忆模块 | 农业, 工业生物技术 |
| 78 | 2026-02-02 |
A Comprehensive Multiomics Approach Illuminates the Biosynthetic Mechanism of Scoparone in Artemisia capillaris
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70398
PMID:41078345
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研究论文 | 本研究通过多组学方法阐明了茵陈蒿中主要活性成分滨蒿内酯的生物合成机制 | 首次生成了茵陈蒿的全长转录组和整合代谢组数据集，鉴定并表征了催化滨蒿内酯生物合成最后一步的新型O-甲基转移酶AcOMT1 | NA | 阐明茵陈蒿中滨蒿内酯的生物合成途径 | 茵陈蒿（Artemisia capillaris）及其活性成分滨蒿内酯 | 代谢组学 | 肝病 | 全长转录组学、整合代谢组学、加权基因共表达网络分析、系统发育分析、亚细胞定位分析、酶活性测定、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学、代谢工程 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | 滨蒿内酯生物合成途径 | 医药 |
| 79 | 2026-01-30 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2026-Jan-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
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综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合结构生物学、计算模拟、多样化工程技术和先进筛选方法，以应对萜烯合酶催化复杂性和序列-功能相关性弱的挑战 | 萜烯合酶催化复杂性及序列-功能相关性弱导致工程化面临显著挑战 | 工程化I类萜烯合酶以生成多样化的萜烯骨架，这是合成生物学的一个关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程、半理性与随机方法（如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化）、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 80 | 2026-01-30 |
Green biomineralization of magnetic metal ions: comparative mechanisms and emerging applications
2026-Jan-28, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb02352a
PMID:41427805
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综述 | 本文系统比较了微生物介导的磁性金属离子生物矿化的三种主要机制，并综述了其在生物医学、环境修复和工业生产等领域的应用与挑战 | 首次系统性地比较和整合了生物控制矿化（BCM）、生物诱导矿化（BIM）和微生物影响矿化（MIM）三种机制，弥补了文献中长期以来对BCM过度关注而对BIM和MIM覆盖不足的失衡问题 | BIM机制的结构精确性较低，MIM机制仍处于早期发展阶段，且整个领域面临规模化、批次一致性和转化障碍等跨领域挑战 | 为微生物介导的磁性生物矿化的工业转化和跨学科发展提供一个全面的指导框架 | 磁性金属离子的微生物介导生物矿化机制 | NA | NA | 生物矿化 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 微生物 | NA | 生物医学, 环境, 工业生物技术 |