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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for biotransformation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.005
PMID:41688135
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综述 | 本篇综述介绍了基于无细胞系统的生物转化技术,涵盖其从传统无细胞系统向现代无细胞蛋白合成的转变,以及酶催化、氧化还原转化和水解三大反应类型,并探讨了其在生物燃料、治疗性蛋白和环保制造中的应用 | 系统性地阐述了无细胞系统在生物转化中的模块化设计优化,并结合机器学习和高通量筛选整合合成生物学平台,强调了人工细胞和合成生物学在提升生产效率和可持续性方面的创新 | 未具体讨论无细胞系统在大规模工业化应用中的成本、稳定性和可扩展性等实际限制 | 概述无细胞系统在生物转化中的发展、反应类型及应用,以推动高效、环保的化学生产 | 无细胞系统、生物转化反应(酶催化、氧化还原转化、水解)、治疗性蛋白、生物燃料和化学品的合成 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成、高通量筛选、机器学习 | NA | 案例研究数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 能源, 环境 |
| 62 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for production of therapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.004
PMID:41688141
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综述 | 探讨无细胞系统在生物治疗药物生产中的概念、技术、工程及应用 | 强调无细胞系统在模块化、控制性和快速生产方面的优势,以及通过合成生物学和代谢工程改进其性能 | 涉及可扩展性、成本效益和翻译后修饰等关键问题 | 分析无细胞系统在治疗药物生产中的现状和未来前景 | 无细胞系统(包括大肠杆菌、小麦胚芽和哺乳动物细胞提取物) | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | 大肠杆菌、小麦胚芽、哺乳动物细胞 | 无细胞表达系统 | 医学、个性化医疗、疫情防范 |
| 63 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for expression of proteins and enzymes
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.002
PMID:41688138
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综述 | 本文综述了无细胞系统在蛋白质和酶表达中的发展历程、不同类型格式、应用、挑战及未来前景 | 系统梳理了从基础提取物系统到高度先进系统(如PURE)的演变,强调无细胞系统在诊断、治疗、生物制造和合成生物学中的广泛应用潜力 | 无细胞系统面临规模化成本、反应稳定性和翻译后修饰等挑战 | 概述无细胞表达系统在蛋白质和酶生物合成中的技术进展及应用 | 无细胞表达系统(CFES)及其中表达的蛋白质和酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统(CFES) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 诊断、治疗、生物制造、合成生物学 |
| 64 | 2026-05-27 |
Approaches to deorphanize secretome: Classical, computational, and next generation strategies to reveal ligand-receptor networks
2026, EXO : beyond the cell
DOI:10.70401/EXO.2026.0008
PMID:42181609
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综述 | 综述当前用于解析分泌蛋白配体-受体网络的经典、计算和下一代策略 | 系统总结并比较了生化、遗传筛选和AI驱动计算三种去孤儿化策略的优势与局限,并提出了未来发展方向 | 未详细讨论每种技术的具体实施细节和实验验证案例 | 推动分泌蛋白去孤儿化从经典方法向可扩展、上下文感知框架的转变,以解码器官间通信 | 分泌蛋白及其未知受体 | 机器学习 | NA | 亲和纯化-质谱、交联受体捕获、RNA干扰、CRISPR、AI蛋白结构建模 | AI蛋白结构模型 | 蛋白质组学数据、空间转录组数据 | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 65 | 2026-05-26 |
Next-Generation Probiotics: From Traditional Strains to Personalized Therapeutics
2026-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70339
PMID:41327880
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review | 本文综述了从传统益生菌到下一代益生菌的演变,重点比较了机制差异和功能进步,并探讨了合成生物学、人工智能和微生物组分析在个性化益生菌治疗中的潜力 | 系统对比传统益生菌与下一代益生菌在机制上的区别,引入合成生物学可编程基因电路和人工智能驱动的个性化治疗策略 | 广泛临床应用仍处于早期阶段,面临安全性、监管和转化方面的挑战 | 比较传统与下一代益生菌,探讨个性化治疗的前沿进展 | 传统益生菌(如乳杆菌属、双歧杆菌属)与下一代益生菌(如阿克曼氏菌、普拉梭菌) | NA | 代谢性疾病、炎症性疾病、神经系统疾病 | 合成生物学、微生物组分析 | NA | NA | NA | 可编程基因电路 | 人体肠道微生物 | 可编程基因电路 | 医学、营养学 |
| 66 | 2026-05-26 |
Gut-engineered Bacillus subtilis-mediated BAMBI delivery for the treatment of thioacetamide-induced liver fibrosis through mechanotransduction inhibition
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1817519
PMID:42183058
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研究论文 | 利用肠道工程化枯草芽孢杆菌递送BAMBI蛋白治疗硫代乙酰胺诱导的肝纤维化 | 首次采用遗传工程枯草芽孢杆菌通过肠-肝轴持续递送BAMBI蛋白,同时抑制生化信号和机械传导,创新性地将合成生物学与机械生物学相结合治疗肝纤维化 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证;需评估长期口服活菌的安全性和潜在副作用 | 开发一种基于工程微生物的肝纤维化治疗方法,通过抑制机械传导来逆转肝纤维化 | 经硫代乙酰胺诱导肝纤维化的小鼠模型 | 合成生物学 | 肝纤维化 | 遗传工程、口服给药、组织分析、血清标志物检测 | NA | 实验数据(组织学评分、血清生化指标、蛋白表达数据) | 小鼠模型,具体数量未在摘要中说明 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 构建持续分泌BAMBI蛋白的基因电路 | 医学 |
| 67 | 2026-05-25 |
Predicting lasso peptide structure with LassoPred
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.037
PMID:42177065
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研究论文 | 提出LassoPred,一个基于机器学习的模块化计算流程,用于从序列预测套索肽的三维结构 | LassoPred通过整合ESM2嵌入训练的支持向量机分类器注释关键拓扑特征(异肽环和塞子残基),并采用拓扑感知的结构构建器组装和优化原子模型,实现了近实验精度,同时将预测时间缩短至分钟级,并将已知套索肽结构覆盖率从不足50个扩展至超过4000个基因组挖掘模型 | 输入标题与摘要中未明确提及局限性 | 从序列准确预测套索肽的三维结构,桥接序列发现与结构洞察的差距 | 套索肽(LaPs) | 机器学习 | NA | 机器学习、同源建模、能量最小化 | 支持向量机 | 序列数据 | 超过4000个基因组挖掘模型 | NA | NA | NA | 酶学、结构生物学、合成生物学、治疗学设计 |
| 68 | 2026-05-23 |
Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications
2026-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70260
PMID:40936353
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研究论文 | 本研究设计并合成了编码肠球菌素A的完整遗传盒,在大肠杆菌中异源表达并纯化出具有抗菌活性的重组多肽 | 开发了从包含体中高效回收并重折叠生物活性细菌素的稳健低成本方法,为抗菌肽应用提供新途径 | 未提及该方法的长期稳定性或体内应用效果 | 开发基于合成生物学的异源表达和纯化方法,以生产抗菌肽肠球菌素A | 肠球菌素A的合成基因盒及其在大肠杆菌中的表达产物 | 合成生物学 | 抗菌耐药相关疾病 | PCR、测序、Ni-NTA亲和层析 | NA | 序列数据 | 5种多重耐药病原菌用于抗菌活性测试 | NA | 大肠杆菌 | 合成遗传盒包含entA基因、His标签及调控元件,用于表达肠球菌素A | 医学、食品 |
| 69 | 2026-05-19 |
Synthetic soils for ecological and synthetic biology applications
2026-Jan-02, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag012
PMID:41860425
|
综述 | 探讨人工合成土壤在生态学和合成生物学中的应用、优势、局限性及未来发展方向 | 首次系统性地综述人工合成土壤作为标准化实验平台在生态学和合成生物学中的应用,强调其可控制理化性质以研究生物响应 | 人工合成土壤可能无法完全复制天然土壤的复杂性和动态性,且其应用主要局限于实验室条件 | 评估人工合成土壤在生态学和合成生物学中的潜力,推动标准化实验平台的发展 | 人工合成土壤设计及其在微生物、植物、土壤动物等生物成分研究中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物、土壤动物 | 人工合成土壤系统(模拟天然土壤的理化特性) | 农业, 环境, 生态学 |
| 70 | 2026-05-19 |
Editorial: Biomolecule production in plant synthetic biology
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1857952
PMID:42147288
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2026-05-16 |
Achieving bottom-up ethical, legal, and societal implications and responsible research and innovation in the synthetic biology research community from the Japanese context
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1716198
PMID:41923881
|
研究论文 | 本文探讨日本合成生物学研究社区中实现自下而上的伦理、法律及社会影响与负责任研究与创新的途径 | 强调学术界缺乏自下而上的ELSI措施,提出三项关键行动领域以推动生物制造和合成生物学领域的负责任创新 | NA | 从日本背景出发,探讨如何在合成生物学研究社区中加强自下而上的伦理、法律及社会影响与负责任研究与创新 | 日本合成生物学研究社区的伦理、法律及社会影响与负责任研究创新实践 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 政策 |
| 72 | 2026-05-16 |
Synthetic immunomodulators: Revolutionizing immunotherapy
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2026.02.002
PMID:42134885
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综述 | 本文综述了合成免疫调节剂在免疫治疗中的应用,重点介绍其通过化学、合成生物学和纳米技术实现更精准免疫调控的策略 | 系统分类了合成免疫调节剂(小分子、合成肽、细胞因子模拟物、核酸类调节剂和合成检查点调节剂),并强调其在时空和细胞类型精度上的优势 | 临床转化面临递送和生物分布、过度激活导致的毒性上限以及生物标志物指导的患者选择和测序需求等瓶颈 | 探讨合成免疫调节剂如何通过精密调控免疫活动来改善肿瘤、自身免疫和慢性炎症疾病的治疗效果 | 合成免疫调节剂的各种类型(小分子、合成肽、细胞因子模拟物等)及其在免疫治疗中的应用 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 73 | 2026-05-16 |
A new era of natural killer cell immunotherapy in tumor treatment: latest advances and cutting-edge perspectives from basic research to clinical practice
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1795143
PMID:42136666
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综述 | 系统综述自然杀伤细胞免疫疗法在肿瘤治疗中的最新进展,从基础研究到临床实践的多维度分析 | 综合分析了CAR-NK细胞疗法、双特异性/三特异性抗体招募策略、ADCC增强技术及CIML-NK细胞等多种增强策略,并聚焦实体瘤治疗中的核心挑战与协同策略 | NK细胞疗法在实体瘤中存在肿瘤浸润不足、肿瘤微环境强抑制及持久性有限的瓶颈,且临床转化仍需克服诸多障碍 | 为NK细胞疗法从实验室到广泛临床应用提供全面且具有前瞻性的参考 | 自然杀伤细胞及其在肿瘤治疗中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 74 | 2026-05-16 |
Engineering glowing plants: recent progress and future directions for application-oriented design
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1819614
PMID:42137625
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综述论文 | 综述了发光植物工程的最新进展,强调从底物依赖型报告系统向自发光系统的转变,并探讨了应用导向的设计方向 | 首次系统总结了真菌生物发光途径在高等植物中的重建,提出了与非转基因纳米材料发光策略的比较,并强调了向观赏园艺、艺术装置和环境传感等实际应用的扩展 | 包括代谢负担、发育和环境条件下的稳定性差异,以及生态和监管约束 | 总结发光植物工程的最新进展,突出早期与当前系统在应用准备方面的差异,并概述未来应用导向研究的关键挑战和方向 | 发光植物(高等植物) | 合成生物学 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 高等植物 | 真菌生物发光途径重建 | 观赏园艺,教育,艺术,环境传感 |
| 75 | 2026-05-15 |
Expanding the genetic code: phage-driven evolution of pyrrolysyl-synthetase for site-specific incorporation of synthetic phenylalanine and tyrosine derivatives
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1737987
PMID:41924351
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研究论文 | 本研究利用噬菌体辅助非连续进化技术对吡咯赖氨酰-tRNA合成酶进行定向进化,以增强其对苯丙氨酸和酪氨酸衍生物等非经典氨基酸的识别与掺入能力 | 首次将噬菌体辅助非连续进化应用于PylRS工程化,高效获得了底物特异性显著增强的突变体,并揭示了底物结合口袋的关键突变区域 | 未对进化后变体的体内蛋白质表达效率进行全面评估,也未探讨其在复杂细胞环境中的长期稳定性 | 拓展PylRS底物谱,实现酪氨酸和苯丙氨酸衍生物在蛋白质中的位点特异性掺入 | 来源于Methanosarcina mazei的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其突变体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体辅助非连续进化, 荧光掺入检测, 质谱分析 | NA | 测序数据, 荧光定量数据 | 未明确样品数量,涉及PylRS突变文库及多个进化变体 | PANCE | 噬菌体 | NA | 合成生物学 |
| 76 | 2026-05-12 |
CRISPR-Based Approaches to Engineer Nonmodel Bacteria for Bioproduction and Biotherapeutics
2026-01-20, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.5c00613
PMID:41488985
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综述 | 总结了CRISPR-Cas工具箱及其在非模式微生物工程中的应用,重点讨论生物制造和生物治疗领域的创新 | 强调了CRISPR系统对传统难以改造的非模式微生物(如C1-气体固定醋杆菌、抗生素链霉菌和肠道共生菌)的适应性,并提出了基因组编辑、合成生物学和系统方法整合的新方向 | 讨论了当前限制,如非模式微生物中CRISPR工具效率不足、宿主依赖性问题及未来改进机会 | 综述CRISPR在非模式微生物工程中的应用,推动可持续生物制造、天然产物发现和下一代活体生物治疗的发展 | 非模式微生物,包括C1-气体固定醋杆菌、抗生素链霉菌和肠道共生菌 | 微生物工程 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,CRISPR-Cas12,CRISPR-Cas13,CRISPRi,CRISPRa | C1-气体固定醋杆菌,抗生素链霉菌,肠道共生菌 | 代谢途径工程,天然产物合成回路,活体生物治疗回路 | 生物制造,天然产物发现,生物治疗 |
| 77 | 2026-05-12 |
Living materials for gas therapy
2026-01, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115738
PMID:41248756
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综述 | 综述了基于活体材料的气体疗法在肿瘤、炎症和组织再生中的最新进展 | 提出了利用活体材料的生物活性(如疾病趋向性、免疫调节和动态响应性)实现智能气体生成和控释的创新范式 | 活体材料的生物安全性和规模化生产是主要挑战 | 系统总结基于活体材料的气体疗法进展,强调工程化设计原理与治疗效果 | 基于生物实体(如细菌、细胞、藻类)及其仿生衍生物构建的活体材料 | 生物医学工程 | 癌症、炎症性疾病、组织再生 | 基因编程、混合架构设计 | NA | NA | NA | NA | 细菌、细胞、藻类 | 基因回路用于自主气体生产,刺激响应释放架构 | 医学 |
| 78 | 2026-05-12 |
Omics Technologies-Driven Research and Applications of Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5264-0_16
PMID:42108303
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综述 | 系统阐述多组学、空间组学和培养组学等组学技术如何驱动合成生物学的研究与应用,涵盖从功能预测到社区构建的全链条解决方案 | 提出多组学整合为合成生物学提供从功能预测、动态调控、功能验证到群落构建的全链条解决方案,强调空间组学解析空间互作机制和培养组学突破培养瓶颈的新思路 | NA | 探讨组学技术如何深入整合合成生物学,解决合成系统功能稳定性差、代谢途径适应性不足和自然微生态互作模拟困难等挑战 | 合成生物系统、合成菌群、底盘菌株 | 合成生物学 | NA | 微生物组学、多组学、空间组学、培养组学 | NA | 多组学数据、空间分布数据、培养数据 | NA | NA | NA | NA | 生物制造、环境修复、医疗健康 |
| 79 | 2026-05-10 |
Subcellular localization of enzymes involved in the biosynthesis of digoxin in Digitalis lanata
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1703671
PMID:41884437
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研究论文 | 本文鉴定了毛地黄中地高辛生物合成三种已知酶的亚细胞定位 | 首次揭示了地高辛生物合成途径中P450酶定位在内质网,而3HSD和P5R2定位在细胞质,并发现毛地黄P450与哺乳动物同源酶(CYP11A1)的线粒体定位不同 | 研究仅限于烟草叶片中的瞬时表达,未在毛地黄原生细胞中验证;仅覆盖三种已知酶,途径的其他未知酶尚未涉及 | 阐明地高辛生物合成途径的空间组织,为合成生物学和代谢工程提供指导 | 毛地黄中地高辛生物合成的三种酶(P450、3HSD、P5R2) | 合成生物学 | 心血管疾病 | 荧光标记与共聚焦显微镜 | NA | 图像 | 烟草叶片中的瞬时表达实验 | NA | 烟草 | 地高辛生物合成途径 | 医药 |
| 80 | 2026-05-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-01-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文探讨了人工智能在细胞生物学发现中的应用,涵盖显微镜、成像、药物发现和合成生物学等领域 | 系统总结了AI在单细胞分辨率分析、复杂模式识别和细胞行为预测方面的进展 | 数据质量要求高、模型可解释性不足以及AI工具普及性有限 | 综述AI在细胞生物学中的应用与未来方向 | 细胞生物学数据、显微图像、转录组数据等 | 机器学习和数字病理学交叉领域 | 不适用 | 深度学习、单细胞转录组分析 | CNN | 图像、文本、基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 医学, 基础研究 |