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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-09-03 |
From Negative Feedback to Integrated Control: Recombinase-Based Strategies for Mitigating Resource Competition
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_14
PMID:42420734
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综述 | 本文讨论了基于重组酶的负反馈与前馈控制策略,用于缓解合成生物学中资源竞争导致的模块间干扰,提高基因系统的稳健性和可预测性。 | 提出了Re-NF和Re-NF-FF控制器,利用重组酶介导的启动子翻转实现负反馈和整合前馈控制,以平衡资源分配并减少串扰。 | 未提及具体局限性。 | 开发并验证重组酶-based 控制策略,以减轻宿主细胞资源竞争对独立基因模块的干扰,提高合成基因线路的模块化、稳健性和可预测性。 | 合成基因线路中的模块控制器(Re-NF和Re-NF-FF)及其在宿主细胞中的性能。 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的启动子翻转 | NA | 文本(概念性综述) | NA | 重组酶 | NA | 负反馈控制器(Re-NF),整合负反馈与前馈的控制器(Re-NF-FF) | 工业生物技术,医学 |
| 82 | 2026-09-03 |
Icariin: Unraveling Ferroptosis Mechanisms, Metabolic Networks, and Innovative Therapy Strategies
2026, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X26500655
PMID:42634093
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综述 | 本文系统综述了淫羊藿苷(ICA)在铁死亡中的双向调控机制、代谢网络及其创新治疗策略,涵盖从机制到治疗再到代谢的完整谱系 | 首次系统阐明ICA作为铁死亡双向调节剂的“机制-治疗-代谢”连续谱作用,揭示其通过Nrf2/GPX4轴作为氧化还原稳态的“分子开关”,并提出纳米递送和合成生物学策略优化其代谢轮廓 | ICA低系统生物利用度限制临床转化,且缺乏原始数据的非英语研究和会议摘要被排除,可能引入选择偏倚 | 系统阐明ICA在铁死亡中的作用机制、代谢网络及其作为铁死亡靶向治疗策略的潜力,以推动复杂疾病治疗开发 | 淫羊藿苷(ICA)及其在神经退行性疾病和耐药癌症模型中的铁死亡调控作用 | 药理学、系统生物学 | 神经退行性疾病、癌症 | 文献综述(基于PubMed、ScienceDirect、Web of Science和Google Scholar数据库检索) | NA | 文献数据 | NA(综述2015-2025年间相关文献) | NA | NA | NA | 医学 |
| 83 | 2026-09-03 |
New-to-Nature Photoenzymatic Catalysis
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5257-2_2
PMID:42681173
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研究论文 | 本文描述了一种制备和纯化来自Escherichia coli BL21(DE3)酶的基础实验方案,包括克隆表达、纯化、浓度测定及光酶催化示例反应,为合成生物学研究者提供实用指导。 | 提出了新到自然界的光酶催化实验方法,用于控制光化学和生物催化中的化学选择性和对映选择性,展示了合成化学的新前沿。 | 摘要中未提及具体局限性。 | 为光酶催化提供基础实验方案和实践指导,促进合成生物学研究。 | Escherichia coli BL21(DE3)菌株及其表达的酶。 | 生物技术 | NA | 克隆与表达、蛋白质纯化、浓度测定、光酶催化 | NA | 实验数据 | 未提及具体样本数量,涉及E. coli BL21(DE3)菌株 | NA | 大肠杆菌 (E. coli) | NA | 生物技术、合成化学 |
| 84 | 2026-09-03 |
Fluorescence-Based Assays to Evaluate the Functionality of Phage-Derived Regulatory Elements for Applications in Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5257-2_18
PMID:42681189
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研究论文 | 提出了一种基于荧光的流程,用于体内表征噬菌体来源的启动子和终止子,以扩展合成生物学工具包 | 利用噬菌体来源的调控元件,结合SEVAtile DNA组装方法,实现对宿主特异和噬菌体特异启动子及终止子的规模化表征,适用于非模式细菌宿主 | 仅以荧光报告基因和板读数器测量为基础,可能无法完全反映体内复杂环境中的调控效果 | 开发可扩展的工作流程,以表征和验证噬菌体来源的调控元件,扩展合成生物学工具包至多样细菌底盘 | 假单胞菌绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis)中的噬菌体来源启动子和终止子 | 合成生物学 | NA | 荧光测定 | NA | 荧光测量数据 | 多种启动子和终止子构建体,具体数量未说明 | SEVAtile DNA组装, 电穿孔 | 假单胞菌绿针假单胞菌(Pseudomonas chlororaphis) | 宿主特异和噬菌体特异启动子及终止子构建体,含msfGFP和mCherry报告基因 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 85 | 2026-08-30 |
Thailand's Synthetic Biology Strategy
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70006
PMID:42662237
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评论 | 本文概述了泰国合成生物学的发展机遇、面临的挑战以及为期十年的工程与合成生物学战略,旨在通过构建支持性生态系统、加强知识基础和提升工业技术能力来促进可持续国家增长 | 提出了一个针对泰国国情的十年期综合战略,涵盖生态系统建设、知识强化和工业能力提升三个主要部分,以推动合成生物学在多个领域的应用 | 摘要中未提及具体实施细节或潜在风险,缺乏对战略可行性和效果的深入分析 | 制定并描述泰国工程与合成生物学战略,以促进创新和高价值产品与服务的发展,支持可持续增长 | 泰国的合成生物学研究体系、政策框架和工业应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品, 化学品, 生物材料, 能源, 制药, 医疗保健 |
| 86 | 2026-08-29 |
Coupled Perturbations of Gene Circuit Dynamics by Resource Competition and Growth Dilution
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_19
PMID:42420739
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研究论文 | 本文介绍了一种在E. coli中构建和表征抑制性基因级联的实验流程,以研究资源竞争和生长稀释对基因电路动力学的耦合影响 | 首次系统解析资源竞争和生长介导稀释对基因电路行为的耦合效应,而非单独考虑每个因素 | 未提供具体的实验结果或数据,仅描述实验方案,且可能局限于E. coli系统 | 研究共享细胞资源和生长过程如何塑造基因电路行为,指导合成生物学中多个上下文依赖效应的研究 | 大肠杆菌中的抑制性基因级联 | 合成生物学 | NA | 荧光测定法 | NA | 荧光数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 抑制性基因级联 | 工业生物技术 |
| 87 | 2026-08-29 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0346164
PMID:42566484
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研究论文 | 本文提出了SEGUID v2,扩展了原始SEGUID校验和以支持环形、线性、单链和双链生物序列 | SEGUID v2通过引入方向不变性和旋转不变性,解决了原始SEGUID无法处理环形DNA和双链DNA的问题,并采用Base64url编码以提高在文件名和URL中的兼容性 | 摘要中未提及明确的局限性 | 开发一种适用于各种类型DNA和RNA序列的校验和算法,以增强序列数据的完整性和注释检索效率 | DNA和RNA序列,包括线性、环形、单链和双链形式 | 生物信息学 | NA | 校验和算法(SHA-1哈希) | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 88 | 2026-08-29 |
Recombinant humanized type VII collagen for skin repair and regeneration: prospects for reconstructing the dermal-epidermal junction
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1912442
PMID:42656479
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综述 | 本文综述了重组人源化VII型胶原蛋白在皮肤修复与再生中的应用前景,重点探讨其在重建真皮-表皮连接中的作用 | 首次系统总结rhCol VII相较于传统I型和III型胶原材料的潜在优势,包括安全性、可规模化生产和针对DEJ的结构功能靶向性 | 尚需解决材料开发和临床转化中的挑战,如生产工艺优化和长期安全性评估 | 为基于rhCol VII的皮肤修复材料进一步研究提供参考,推动其在慢性伤口、美容术后屏障损伤和组织工程皮肤中的应用 | VII型胶原蛋白及其重组人源化形式(rhCol VII) | 合成生物学 | 皮肤损伤 | 重组蛋白表达技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 89 | 2026-08-29 |
A review of glycosylation diversity and biosynthetic advances of steroidal saponins in Paris polyphylla var. yunnanensis
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1905483
PMID:42657317
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综述 | 系统总结了云南重楼中甾体皂苷的糖基化多样性和生物合成途径的研究进展,并探讨了利用异源生物合成提高其产量的策略。 | 整合多组学技术和合成生物学的最新进展,重点分析了甾体皂苷的糖基化模式及其对结构多样性的贡献。 | 未提及具体实验验证,仅基于已有文献进行总结。 | 阐明云南重楼中甾体皂苷的结构多样性和糖基化模式,并系统总结其生物合成途径,为可持续利用提供理论基础。 | 云南重楼中的甾体皂苷及其生物合成途径。 | 合成生物学 | NA | 多组学技术 | NA | 文献数据 | 不适用 | NA | NA | 甾体皂苷生物合成途径 | 医药 |
| 90 | 2026-08-28 |
Harnessing yeast biodiversity for advanced industrial applications
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag031
PMID:42631727
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综述 | 本文综述了酵母菌生物多样性在工业应用中的最新进展,包括自然多样性和人工多样性,并强调了多组学分析、人工智能辅助工程和过程优化策略的重要性。 | 整合了自然多样性(生态适应和遗传变异)与人工多样性(适应性实验室进化、代谢或表观遗传工程、合成生物学)的视角,并突出了极端嗜极酵母作为胁迫适应模型及菌株水平培养库的建立。 | 未具体说明。 | 总结酵母菌多样性在工业应用中的研究进展,并讨论充分开发和利用该多样性以实现高效生物生产的关键策略。 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和各种非传统酵母菌种。 | 机器学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、非传统酵母菌种 | NA | 医药、生物燃料、生物化学品、生物材料、工业生物技术 |
| 91 | 2026-08-27 |
Exploring Fecal Microbiota Transplantation: Potential Benefits, Associated Risks, and Challenges in Cancer Treatment
2026-01, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70455
PMID:41496455
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综述 | 本文综述了粪便微生物群移植在癌症治疗中的潜在益处、相关风险和挑战,重点探讨其增强免疫治疗疗效、恢复微生物组稳态及减轻癌症相关并发症的作用。 | 强调FMT在重新编程肿瘤微环境和增强免疫检查点抑制剂反应中的潜力,并探讨精准微生物群落和合成生物学等新兴创新策略。 | 标准化、监管框架和机制理解的不足以及病原体传播和免疫失调等风险限制了临床转化。 | 评估粪便微生物群移植在肿瘤学中的应用前景,并识别其临床整合所需的条件。 | 粪便微生物群移植在癌症治疗中的应用。 | 微生物组学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 人类 | NA | 医学 |
| 92 | 2026-08-23 |
Natural polysaccharides as immune adjuvants to overcome immune checkpoint inhibitor resistance: mechanistic insights, clinical evidence, and translational challenges
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1914914
PMID:42626083
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综述 | 本文系统综述了天然多糖作为免疫佐剂克服免疫检查点抑制剂耐药性的机制、临床证据与转化挑战 | 提出多糖通过重编程肿瘤相关巨噬细胞、缓解CD8 T细胞耗竭、调节肠道微生物-免疫双向串扰和抑制肿瘤内在免疫逃逸级联等四种核心机制克服免疫治疗耐药,并引入AI辅助糖组学、图神经网络及合成生物学平台解决结构与生产限制,结合工业6.0和循环生物经济模型,提出精准医学工作流程 | 缺乏大规模随机III期试验的强有力证据,多糖尚不能验证为标准佐剂用于解决ICI耐药;存在结构异质性、非标准质控、低口服生物利用度和临床试验方案不一致等转化瓶颈 | 系统剖析多糖免疫调节的结构基础,总结克服免疫治疗耐药的核心机制和临床证据,提出加速临床转化的机制导向路线图 | 天然多糖作为免疫佐剂,用于克服免疫检查点抑制剂耐药 | 免疫学 | 多种恶性肿瘤 | NA | 图神经网络 | 文本 | NA | 合成生物学平台 | NA | NA | 医学 |
| 93 | 2026-08-22 |
Application of bacteriophages in the prevention and control of bacterial infectious diseases in animals
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1851321
PMID:42621610
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综述 | 本文综述了噬菌体在动物细菌性传染病防控中的应用,涵盖溶菌性噬菌体疗法、噬菌体展示衍生干预以及CRISPR-Cas等工程化平台,并分析了从临床前研究到兽医应用的转化瓶颈 | 不同于以往描述性综述,本文系统分析转化瓶颈,包括宿主范围限制、药代动力学局限和监管碎片化,并评估了微生物群保护和生物膜穿透等声称优势的研究证据,同时承认实验结果不一致性和固有应用限制 | 大多数证据仍处于临床前阶段,转化差距显著,且有益效应的实验结果不一致 | 评估噬菌体在动物细菌性传染病防控中的应用潜力,并提出实现兽医治疗学应用所需的协调进展 | 牲畜、家禽和水产养殖动物中的细菌性传染病 | 生物信息学、合成生物学 | 细菌性传染病 | 噬菌体疗法、噬菌体展示、CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 动物宿主(牲畜、家禽、水产养殖) | 多功能生物平台,整合直接杀伤、免疫调节和抗原递送 | 医学、农业 |
| 94 | 2026-08-21 |
Systematic discovery of novel ribozymes with gene silencing properties from global deep-sea RNA viromes
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1866359
PMID:42614413
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研究论文 | 系统分析全球深海RNA病毒组,发现具有基因沉默功能的新型核酶 | 首次从深海RNA病毒组中系统发现大量锤头状核酶,并验证其对HIV-1和HSV-1的抑制能力,展示其作为治疗性催化RNA支架的潜力 | 文中未提及具体局限性 | 探索深海RNA病毒作为核酶资源库的潜力,并评估其基因沉默和抗病毒功能 | 全球深海沉积物中的RNA病毒组,包括291个样本中的1305种锤头状核酶 | 合成生物学 | HIV-1感染、HSV-1感染 | RNA病毒组测序 | NA | 序列数据 | 291个深海沉积物样本 | NA | NA | 锤头状核酶 | 医学, 合成生物学 |
| 95 | 2026-08-21 |
Microbial valorization of E-waste: Bacterial recycling and synthesis of technology-critical metal nanoparticles
2026, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2026.06.001
PMID:42618146
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综述 | 本文探讨了电子废弃物作为城市矿山在循环经济中的作用,并重点介绍了利用细菌系统进行可持续金属回收的生物策略,以及将回收金属升级转化为具有应用价值的纳米颗粒。 | 将电子废弃物管理与微生物生物技术和纳米技术相结合,提出了一种可持续获取技术关键金属的新途径,强调利用组学方法指导合成生物学策略以增强金属回收和纳米颗粒合成。 | 未提及具体局限性。 | 探讨利用细菌回收电子废弃物中技术关键金属并合成金属纳米颗粒的可持续策略,促进绿色循环经济转型。 | 电子废弃物中的技术关键金属以及用于金属回收和纳米颗粒合成的细菌系统。 | 微生物生物技术、纳米技术、合成生物学 | NA | 转录组学、代谢组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 环境、材料、医学、能源 |
| 96 | 2026-08-20 |
Probiotic-Based Materials as Living Therapeutics
2026-01, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508500
PMID:40999775
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综述 | 本文综述了基于益生菌的工程活体材料(PLMs)作为活体治疗药物的研究进展,涵盖其设计、应用及面临的挑战。 | 提出了益生菌活体材料(PLMs)作为工程活体材料(ELMs)的一个亚类,与活体生物治疗产品(LBPs)区分,并系统探讨其在多种医学应用中的潜力及临床转化障碍。 | PLMs在临床应用中面临缺乏稳健的益生菌工程遗传工具、生物安全担忧(如水平基因转移或非预期生物活性)、临床前结果转化困难及缺乏明确监管指南等挑战。 | 探讨基于益生菌的活体材料在生物医学应用中的设计、进展、生物安全问题及监管框架的现状。 | 基因工程益生菌与基质结合的活体材料(PLMs),涵盖生物传感、感染治疗、骨修复、伤口愈合、阴道失衡、肠道相关疾病和癌症治疗等应用。 | 生物医学工程 | 感染、骨损伤、伤口、阴道失衡、肠道疾病、癌症 | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 益生菌 | 基因工程电路用于生物传感和疾病治疗 | 医学 |
| 97 | 2026-08-18 |
Omics Technologies-Driven Research and Applications of Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5264-0_16
PMID:42108303
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综述 | 本文系统阐述了整合多组学、空间组学和培养组学如何为合成生物学提供全链条解决方案,涵盖功能预测、动态调控、功能验证和群落构建,并推动其在生物制造、环境修复和医疗健康等领域的应用 | 提出整合多组学、空间组学和培养组学的全链条策略,以解决合成生物学中功能稳定性差、代谢通路适应性不足和自然微生态模拟困难等关键挑战 | 未明确讨论具体实验验证或技术局限性,内容偏向概念性综述 | 探讨组学技术如何驱动合成生物学的研究与应用,实现组学与合成生物学的深度融合 | 合成生物系统,包括合成菌群、底盘菌株和自然微生态系统 | 合成生物学 | NA | 组学技术(多组学、空间组学、培养组学) | NA | 文本、组学数据 | NA | NA | NA | 代谢通路优化 | 生物制造、环境修复、医疗健康 |
| 98 | 2026-08-16 |
Natural flavonoids in multiple sclerosis: molecular insights and emerging therapeutic strategies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1888423
PMID:42597552
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综述 | 本文综述了天然黄酮类化合物在多发性硬化中的分子机制和新兴治疗策略,涵盖实验模型和人类研究证据 | 系统整合了黄酮类化合物在调节NF-κB、Nrf2、炎症小体信号及小胶质细胞/巨噬细胞极化中的作用,并探讨了结构-活性关系、代谢和糖基化对暴露的影响,以及合成生物学在规模化生产和衍生物优化中的应用 | 临床证据尚早期且结果不一,存在低且可变生物利用度、血脑屏障穿透有限、标准化不足及与获批疗法潜在相互作用等转化障碍 | 总结黄酮类化合物对多发性硬化的治疗潜力及其分子机制,并评估新兴递送和优化策略 | 天然黄酮类化合物及其在多发性硬化中的分子靶点和细胞过程 | 神经免疫学 | 多发性硬化 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 99 | 2026-08-14 |
Recent strategies in synthetic food production for sustainable food security: applications and challenges
2026, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2026.1829214
PMID:42358301
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综述 | 本文综述了合成食品生产的最新策略,包括细胞、组织和干细胞培养技术、转基因生物、微生物发酵、植物蛋白工程及人工智能等,并探讨其在可持续食品安全中的应用与挑战 | 系统性地整合了多种前沿技术(如合成生物学、人工智能)在合成食品生产中的应用,并全面分析了其经济、监管和公众接受度方面的挑战 | 合成食品生产面临高生产成本、缺乏技术优化、监管复杂性及安全性等问题,且商业化需要先进技术降低成本和立法支持 | 探讨合成食品生产的创新技术及其在满足全球食品安全需求方面的潜力和挑战 | 合成食品,包括培养肉、人工甜味剂、微生物蛋白、新型脂肪、强化及合成乳制品和功能食品成分 | 生物技术 | NA | 细胞培养、组织培养、干细胞培养、转基因技术、微生物发酵、合成生物学、人工智能 | NA | 文本 | NA | 转基因、合成生物学 | 微生物、植物细胞 | 代谢途径工程 | 食品工业、医药、农业、营养保健品 |
| 100 | 2026-08-13 |
Transcriptional regulation: efficient genetic engineering tools for non-conventional yeasts
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag032
PMID:42545751
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综述 | 本文综述了非传统酵母的转录调控工具,包括经典启动子、转录因子以及CRISPR/Cas等创新技术,旨在优化代谢工程以提高生物燃料等产物的产量 | 重点介绍了新型可编程技术如CRISPR/Cas介导的转录激活与抑制,以及动态调控系统,为精细调节代谢途径和平衡细胞资源提供新策略 | 未详细讨论具体实验数据或案例,可能缺乏实际应用效果的深入分析 | 探讨非传统酵母中用于代谢工程的转录调控工具,以促进可持续生物产品开发 | 非传统酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非传统酵母 | 动态调控系统 | 工业生物技术 |