合成生物学相关文章
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当前共找到 312 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-06-22 |
Deep learning on protein language model embeddings unlocks accurate prediction of protein solubility
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1716930
PMID:41953440
|
研究论文 | 提出了一种基于蛋白质语言模型嵌入的深度学习模型DeepSolNet，用于准确预测蛋白质溶解度 | 利用先进的蛋白质语言模型ESM Cambrian结合双向长短期记忆网络、卷积神经网络和注意力机制的多模块架构，显著提升了溶解度预测性能 | 在独立测试集上的准确率仅为0.53，性能仍有提升空间 | 提高蛋白质溶解度的预测准确性，以促进合成生物学和蛋白质工程中的应用 | 蛋白质溶解度预测相关的序列数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, 注意力机制 | 序列 | 验证集和独立测试集包含γ-抗体、转谷氨酰胺酶和醛脱氢酶序列 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 82 | 2026-06-20 |
T-cell engagers in cancer immunotherapy: mechanisms, challenges, and future perspectives
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755512
PMID:42317371
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综述 | 本文综述了T细胞衔接器在癌症免疫治疗中的机制、挑战和未来前景 | 系统比较了T细胞衔接器与CAR-T细胞疗法的疗效、安全性、毒性和成本，并探讨了提高特异性和降低毒性的新策略，如肿瘤选择性激活和CD3亲和力调节 | 实体瘤中仍面临抗原异质性和免疫抑制肿瘤微环境的挑战 | 总结T细胞衔接器平台的发展现状，分析其临床成功案例与挑战，并展望未来方向 | T细胞衔接器平台，包括双特异性（BiTE）和三特异性（TriTE）T细胞衔接器、双重亲和力重定向（DART）及其他新兴格式 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤，实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 人类 | T细胞衔接器（包括双特异性和三特异性结构） | 医学 |
| 83 | 2026-06-20 |
Metabolic engineering strategies for optimized lignan production in plants
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1827862
PMID:42318117
|
综述 | 本文综述了植物中优化木脂素生产的代谢工程策略，提出了“推-拉-释放”框架，并探讨了合成生物学原理在植物系统中的应用 | 提出了“推-拉-释放”整合框架，系统组织转录调控、代谢流优化和CRISPR基因组编辑等多层策略，并讨论了空间时间调控和系统表型评估的需求 | 木脂素产量最大化需平衡植物结构完整性和抗病性之间的权衡，缺乏对实际应用效果的全面验证 | 总结现有木脂素代谢工程方法，提出未来整合策略以实现可持续生产的同时保持植物适应性 | 植物中木脂素（如芝麻素、鬼臼毒素、SDG）的生产优化 | 代谢工程 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物（如亚麻） | 推-拉-释放框架：推策略（增加前体供应）、拉策略（重定向代谢流）、释放策略（缓解途径抑制），以及模块化途径重建、多组分基因组编辑和时空调控 | 医药 |
| 84 | 2026-06-19 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 基于2325个宏基因组样本，构建了反刍动物胃肠道微生物组参考基因组目录（CRMC），揭示了维生素合成微生物的路径选择和基因共选择模式 | 首次构建大规模反刍动物胃肠道维生素合成微生物参考基因组目录，发现不同反刍动物宿主间维生素合成微生物存在高度趋同的路径选择和基因共选择模式，且与人类肠道微生物组具有一致性 | 未提及因果关系验证和功能实验验证 | 系统解析反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征和生态分布模式 | 8种反刍动物宿主的2325个宏基因组样本 | 微生物组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组测序数据 | 2325个宏基因组样本，来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物（8种宿主） | NA | 农业, 医学 |
| 85 | 2026-06-18 |
Editorial: Biofabrication and synthetic biology for enhanced medicinal plant bioproduction
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1876560
PMID:42306426
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2026-06-17 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-01-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
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研究论文 | 报道首个在生理pH下利用中性双组分系统辅助环磷酸腺苷和磷酸腺苷穿过脂质体膜转运的研究 | 首次实现中性小分子系统对环磷酸腺苷和磷酸腺苷的跨膜转运，采用磷酸基团靶向合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物协同作用提高转运效率 | 仅基于脂质体模型验证，未在活细胞体系中测试，且转运机制细节尚需进一步阐明 | 开发小分子系统实现核苷酸跨膜转运，探索在药物递送和合成生物学中的应用 | 环磷酸腺苷和磷酸腺苷的跨膜转运过程 | 合成生物学 | NA | 荧光检测、磷核磁共振 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量，涉及脂质体模型和多种小分子化合物 | NA | 脂质体（模拟膜系统） | 双组分小分子转运系统：合成阴离子载体（氟化方酰胺）与胸腺嘧啶衍生物协同作用 | 药物递送, 合成生物学 |
| 87 | 2026-06-16 |
A CURE for synthetic regulation of gene expression: rapid screening of guide RNA efficacy as a framework for enabling undergraduate research in plant synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag007
PMID:42293129
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研究论文 | 开发并验证了一种基于课程的本科研经历（CURE），通过病毒载体快速筛选导向RNA（gRNA）效率，用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 创新性地将CURE模式应用于植物合成生物学，利用病毒递送gRNA实现高通量快速筛选，解决植物转化周期长的难题 | 未明确说明局限性 | 开发适用于植物合成生物学的CURE框架，快速筛选靶向Cas9转录抑制因子的gRNA | 本科学员及三个基因的启动子区域 | 数字病理学 | NA | 病毒载体递送gRNA, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 12个新gRNA，稳定转基因系 | CRISPR-Cas9 | 植物 | Cas9转录抑制因子回路 | 农业, 工业生物技术 |
| 88 | 2026-06-15 |
Advances in Machine Learning Models for Predicting Enzyme Kinetic Parameters
2026-01-12, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02428
PMID:41406463
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综述 | 综述机器学习模型在预测酶动力学参数方面的最新进展 | 系统总结了基于机器学习的全局和局部模型在酶动力学参数预测中的应用，并提出了利用高通量数据生成和半监督学习来克服数据稀缺问题的新机遇 | 数据稀缺仍然是这些模型的主要限制 | 为利用机器学习提升酶动力学参数预测的性能、鲁棒性和范围提供路线图 | 酶动力学参数（kcat、Km、kcat/Km等） | 机器学习 | NA | NA | 机器学习模型（全局模型和局部模型） | 酶序列和动力学参数数据 | NA | NA | NA | NA | 酶工程、代谢建模、合成生物学 |
| 89 | 2026-06-13 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343925
PMID:41941447
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研究论文 | 利用合成生物学方法工程化BCG菌株以增强HMBPP的产生，进而促进Vγ9Vδ2 T细胞扩增 | 通过宿主自身-非自身识别机制利用HMBPP感知来增强免疫应答，而非传统的配体或抗原策略 | 尚未进行体内验证，且未评估工程菌株的安全性和长期免疫保护效果 | 开发更有效的抗结核疫苗，增强BCG诱导的免疫应答 | BCG菌株、Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、体外刺激实验、同线性分析 | NA | 基因组序列、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种和356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG（牛分枝杆菌卡介苗） | MEP途径合成基因座，包括HMBPP合酶GcpE过表达 | 医学 |
| 90 | 2026-06-11 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 该文章综述了通过工程化酵母可持续生产色氨酸衍生芳香族化合物的最新进展 | 系统总结了利用酵母细胞工厂生产色氨酸衍生物的最新策略与合成生物学工具 | 讨论了实现高效、可扩展和经济可行的酵母生物合成所面临的挑战 | 推动酵母在可持续生物生产中替代传统化学合成以应对气候变化和资源枯竭 | 酵母细胞工厂和色氨酸衍生芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 酵母 | 色氨酸代谢通路 | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药工业 |
| 91 | 2026-06-11 |
Characterization of phage AbpL with a terminally redundant genome and its therapeutic potential against drug-resistant Acinetobacter baumannii infections
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1760018
PMID:41798749
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研究论文 | 表征具有末端冗余基因组的噬菌体AbpL及其对耐药鲍曼不动杆菌感染的治疗潜力 | 首次分离并全面表征了具有400 bp末端冗余的噬菌体AbpL，评估其对多重耐药鲍曼不动杆菌的体内外疗效，并作为合成生物学工程候选平台 | 主要依赖小鼠模型，未涉及人体临床试验或长期安全性评估 | 评估噬菌体AbpL作为替代抗生素治疗多重耐药鲍曼不动杆菌感染的潜力 | 多重耐药鲍曼不动杆菌（MDR-AB）和噬菌体AbpL | NA | 鲍曼不动杆菌感染 | NA | NA | 实验数据（形态、生长特性、基因组、治疗结果） | 52%的临床MDR-AB分离株和40只小鼠（脓毒症模型） | NA | NA | NA | 医学 |
| 92 | 2026-06-08 |
From Atoms to Cells: AI-Based Structure Prediction Fueling Molecular Dynamics Simulations in Computational Structural Biology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-07511-6_2
PMID:41652159
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综述 | 探讨人工智能结构预测与分子动力学模拟的融合如何推动计算结构生物学从单分子到全细胞模拟的变革 | 首次系统阐述人工智能驱动的结构预测（如AlphaFold）与分子动力学模拟相结合，突破静态结构局限，实现动态细胞过程模拟，为全细胞建模奠定基础 | 未讨论当前全细胞模拟在计算资源需求、多尺度整合及实验验证方面的具体挑战 | 综述人工智能与分子动力学模拟在计算结构生物学中的协同作用及其对全细胞模拟的推动作用 | 生物系统从单蛋白质到细胞环境的模拟 | 计算结构生物学 | NA | 分子动力学模拟，人工智能结构预测（如AlphaFold） | AlphaFold等人工智能预测模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物学研究、药物发现、合成生物学 |
| 93 | 2026-06-07 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 探讨生物工厂如何通过集成自动化、人工智能和标准化工作流程来推动酵母工程的高通量发展 | 强调了从设计-构建-测试-学习循环向设计-构建-部署循环的转变，并展望了自主优化型“自驱动实验室”的未来 | 协议可变性和人工智能工具的集成仍是关键障碍 | 实现可扩展的合成生物学和自主酵母工程 | 酵母工程中的菌株开发流程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 94 | 2026-06-06 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
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综述 | 综述微生物黑色素的生物合成、功能见解及新兴研究挑战 | 系统总结了组学技术和基因工程在阐明微生物黑色素合成机制和提高产量中的关键作用，并提出了整合合成生物学、先进分析技术和安全性评估的未来研究方向 | 强调该领域仍存在挑战和争议，从基础研究到工业化之间存在差距 | 为微生物黑色素领域的研究者提供全面且关键的参考，推动基础研究与工业化的衔接 | 微生物黑色素及其产生菌（细菌和真菌） | NA | NA | 组学技术，基因工程，分析技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌，真菌 | NA | 工业生物技术 |
| 95 | 2026-06-06 |
A modular single- and dual-gene expression toolkit for Kluyveromyces marxianus
2026-Jan-23, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04794-4
PMID:41571921
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研究论文 | 为马克斯克鲁维酵母开发了一套模块化的单基因和双基因表达工具包 | 首次基于筛选的pENO启动子和pHTX双向启动子，构建了适用于马克斯克鲁维酵母的单基因和双基因表达系统，并实现了与HEM1共表达增强血红素合成，提升外源蛋白产量 | 表达水平受遗传元件组合、碳源和培养时间影响，尚未测试在工业大规模发酵条件下的稳定性 | 扩展马克斯克鲁维酵母的合成生物学工具库，提高其作为工业蛋白生产底盘菌株的适用性 | 马克斯克鲁维酵母（Kluyveromyces marxianus） | 合成生物学 | NA | 基因表达系统构建 | NA | NA | 多个马克斯克鲁维酵母菌株 | NA | 马克斯克鲁维酵母（K. marxianus） | 单基因表达系统、双基因表达系统、双顺反子表达系统 | 工业生物技术，医药 |
| 96 | 2026-06-06 |
Breaking the cell wall for efficient DNA delivery to diatoms
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68562-6
PMID:41571648
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研究论文 | 报道了两种优化方法用于高效递送DNA和Cas9核糖核蛋白复合物到模式硅藻三角褐指藻，并实现了体内组装和大片段质粒传递 | 首次发现通过电穿孔可在硅藻细胞内通过非同源或同源修复机制直接组装附加体（命名为DIVA技术），并将PEG方法成功应用于另一种硅藻Thalassiosira pseudonana | 未提及 | 开发高效遗传工具以促进硅藻合成生物学研究及可持续发展技术应用 | 硅藻（三角褐指藻和Thalassiosira pseudonana） | 合成生物学 | NA | 电穿孔、PEG转化、Cas9核糖核蛋白复合物递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻, Thalassiosira pseudonana | 附加体（线性或环形）的体内组装 | 工业生物技术, 环境 |
| 97 | 2026-06-06 |
Phyllosphere microbiome: Exploring the unexplored frontiers for precision agricultural and environmental sustainability
2026-Jan-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04788-2
PMID:41549150
|
综述 | 综述叶际微生物组在可持续农业和环境保护中的潜能与挑战 | 强调利用组学技术、微生物联合工程和纳米递送系统克服叶际微生物实际应用的障碍 | 叶际微生物应用受限于环境不稳定性、田间持久性差及功能特征不完全 | 推动精准农业和环境可持续性发展 | 叶际微生物组（细菌、真菌、酵母） | 机器学习 | NA | 组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学、生态建模 | 植物 | NA | 农业, 环境 |
| 98 | 2026-06-06 |
Development of a high-performance synthetic promoter for plant-based bioproduction
2026-Jan-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04925-z
PMID:41553553
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研究论文 | 通过副逆转录病毒启动子的结构域改组开发了一种高性能合成启动子，其活性比CaMV35S高4倍，并在植物中实现了重组蛋白的高效生产 | 通过策略性的分子间结构域改组，将FMV和MMV全长度转录启动子的关键调控区域融合，生成了活性比CaMV35S高4倍的新型合成启动子FM，并验证了其与CRISPR-dCas9/VP64正交调控系统的兼容性 | 未明确说明，但可能包括植物表达系统的瞬时稳定性限制以及研究主要集中在模式植物中 | 开发用于植物合成生物学和分子农业的高性能组成型启动子，以最大化重组蛋白产量 | FM合成启动子以及其在三种模式植物和转基因植株中的功能 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、结构域改组、GUS检测、qRT-PCR、组织化学染色、CRISPR-dCas9/VP64转录激活、抗病毒测定 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性测定数据 | 三种模式植物（烟草、本氏烟草、矮牵牛）用于瞬时表达；稳定转基因烟草和拟南芥品系 | CRISPR-dCas9/VP64 | 烟草（Nicotiana tabacum）、本氏烟草（Nicotiana benthamiana）、矮牵牛（Petunia × atkinsiana）、拟南芥（Arabidopsis thaliana） | 合成启动子FM驱动的抗病毒肽scytovirin表达系统 | 医学、分子农业 |
| 99 | 2026-06-06 |
Research and Application of the Polyene Macrolide Antibiotic Nystatin
2026-Jan-19, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31020330
PMID:41599380
|
综述 | 系统阐述了多烯大环内酯类抗生素制霉菌素的多组分化学性质、靶向麦角固醇的作用机制、质量控制分析技术、临床应用及组合疗法，以及在生物合成和基因编辑技术方面的最新进展 | 重点介绍了基因编辑技术特别是CRISPR/Cas9在靶向敲除毒性成分相关基因、优化生产菌株以提高制霉菌素产量和纯度方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或临床研究结果的量化分析 | 为制霉菌素的进一步研究和临床应用提供参考，展望通过结构优化、创新递送系统和合成生物学策略提高其安全性和疗效的未来发展方向 | 制霉菌素的多组分化学性质、作用机制、毒性成分RT6、质量控制方法、临床应用、生物合成途径及基因编辑技术 | NA | 浅表真菌感染、口腔疾病、阴道炎、外耳炎 | CRISPR/Cas9, I型聚酮合酶途径 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 制霉菌素A的I型聚酮合酶组装机制及其后续修饰过程 | 医学 |
| 100 | 2026-06-06 |
Stem cells in organogenesis and regeneration
2026-Jan-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04889-z
PMID:41549301
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综述 | 综述了干细胞在器官发生与再生中的主要类型、来源、调控信号通路及临床转化进展 | 整合胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞及类器官模型，结合CRISPR、3D生物打印和合成生物学等前沿技术，全面探讨干细胞生物学与临床转化潜力 | 未详细讨论具体实验局限性或定量比较不同干细胞疗法的效果 | 概述干细胞在器官发生与再生中的关键作用、调控机制及临床转化进展 | 干细胞（胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞）及类器官 | 机器学习 | NA | CRISPR, 3D生物打印, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR, 3D生物打印, 合成生物学 | NA | NA | 医学 |