合成生物学相关文章
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当前共找到 249 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-02-08 |
From Atoms to Cells: AI-Based Structure Prediction Fueling Molecular Dynamics Simulations in Computational Structural Biology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-07511-6_2
PMID:41652159
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综述 | 本章探讨了人工智能与分子动力学模拟如何结合，从静态结构预测推进到动态细胞过程模拟，为全细胞模拟铺平道路 | 利用AI（如AlphaFold）快速准确预测蛋白质结构，结合分子动力学模拟，将模拟范围从单个生物分子扩展到复杂组装和整个细胞环境 | 仅结构预测不足以捕捉生物功能，需依赖分子动力学模拟揭示动态变化；模拟整个细胞过程仍面临计算资源和模型精度的挑战 | 通过AI与分子动力学模拟的融合，实现从原子到细胞的生物系统模拟，以推动计算结构生物学发展 | 蛋白质结构、生物分子组装、细胞过程及动态行为 | 计算结构生物学 | NA | 分子动力学模拟、AI结构预测（如AlphaFold） | AI模型（如AlphaFold） | 结构数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 生物研究、药物发现、合成生物学 |
| 102 | 2026-02-07 |
Engineered probiotics platform for oral delivery of antibody as a high-compliance alternative for immune-mediated inflammatory diseases
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102523
PMID:41421354
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研究论文 | 本研究开发了一种名为AIDEN的工程化益生菌平台，用于口服递送治疗性抗体，以改善免疫介导炎症性疾病的治疗依从性 | 首次构建了能够口服递送单链可变片段抗体的工程化益生菌平台，实现了肠道稳定定植和原位抗体持续生产 | 研究仅在鼠类模型中进行，尚未进行人体临床试验；系统IL-17A水平仅中度降低 | 开发一种高依从性的口服抗体递送平台，用于治疗免疫介导炎症性疾病 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917（EcN）益生菌平台及其分泌抗IL-17A单链可变片段的变体AIDEN-IL17 | 合成生物学 | 银屑病，炎症性肠病 | 合成生物学技术 | NA | NA | 鼠类模型 | 合成生物学 | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 抗体分泌系统，可模块化适配多种抗体治疗 | 医学 |
| 103 | 2026-02-06 |
Corrigendum to "Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications" [Biotechnology Advances 86 (2026) 108748]
2026-Jan-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108816
PMID:41611037
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2026-02-06 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
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研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶，能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸为三磷酸盐，并展示了其在体外转录中的应用潜力 | 开发了一种具有广泛底物谱的通用多磷酸激酶，突破了现有PPKs底物限制，实现了对嘌呤和嘧啶单磷酸及二磷酸的高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于通用多磷酸激酶的一锅法体外转录系统 | 工业生物技术 |
| 105 | 2026-02-06 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
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综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属（类金属）生物修复中的应用，探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了一个整合CRISPR编辑、多组学、合成生物学和新兴CRISPR生物传感器的统一路线图，用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前面临的生态风险、技术难题、法规问题以及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性，以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 106 | 2026-02-06 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
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综述 | 本文综述了细菌在转录水平精确控制蛋白质亚基化学计量的机制，并探讨了这些机制在合成生物学中的应用 | 超越经典的转录调控，重点阐述了转录后精细调控机制（如内部转录终止子和选择性RNA加工与稳定系统）在控制化学计量中的作用，并展示了如何利用这些机制设计可编程的合成基因电路 | NA | 探索细菌精确控制转录化学计量的机制及其在合成生物学中的应用 | 细菌的RNA水平调控机制及合成基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 启动子库、工程化终止子、基于RNase的加工模块、合成基因电路 | 生物技术、生物医学 |
| 107 | 2026-02-05 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用，包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 全面探讨了AI在单细胞分辨率分析、细胞行为建模以及蛋白质结构预测中的创新应用，并强调了工具民主化的未来方向 | NA | 探索人工智能在细胞生物学研究中的转化潜力与应用前景 | 细胞生物学数据、显微镜图像、单细胞转录组学、蛋白质结构 | 机器学习 | NA | 深度学习、高通量技术 | 深度学习 | 图像、生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、基础研究 |
| 108 | 2026-02-05 |
Biological conversion of methane to organic molecules: towards a low-carbon bioeconomy
2026-Jan, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaf547
PMID:41623557
|
综述 | 本文综述了将甲烷生物转化为有机分子的研究进展，旨在推动低碳生物经济的发展 | 提出了一个整合合成生物学、代谢工程和系统生物学的系统性框架，用于设计基于甲烷的生物制造，以开发高效的甲烷同化细胞工厂 | NA | 开发下一代甲烷氧化细胞工厂，克服天然甲烷氧化菌的生理限制，实现甲烷向高价值生物产品的可持续转化 | 甲烷氧化菌及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 甲烷氧化菌 | 甲烷同化途径、中心碳代谢整合 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 109 | 2026-02-02 |
Synthetic biology for heparin biomanufacturing
2026-Jan-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00999-x
PMID:41588187
|
综述 | 本文全面讨论了肝素生物制造技术的最新进展、挑战和未来前景 | 通过酶工程、代谢工程和合成生物学方法系统优化肝素生物合成途径，探索体内/体外组合策略和从头生物合成作为替代生产方法 | NA | 探索肝素生物制造技术以替代动物源提取方法 | 肝素生物合成途径 | 合成生物学 | 炎症、癌症 | 酶工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 肝素生物合成途径 | 医药 |
| 110 | 2026-02-02 |
PanForest: predicting genes in genomes using random forests
2026-Jan-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag005
PMID:41512299
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研究论文 | 本文介绍了PanForest，一种使用随机森林分类器根据基因组中其他基因的存在情况来预测基因存在或缺失的软件工具 | 开发了首个基于随机森林的基因共现与互斥模式预测工具，能够大规模分析泛基因组并量化每个基因对预测其他基因的重要性 | 未明确说明模型在非细菌基因组或其他复杂真核生物中的泛化能力，且分析依赖于现有基因注释的准确性 | 研究基因共现与互斥模式，以揭示基因组组织的基本原理，并应用于进化重建和合成基因组设计 | 大肠杆菌（Escherichia coli）基因组中的12,741个附属基因 | 生物信息学 | NA | 随机森林分类器 | 随机森林 | 基因存在/缺失数据 | 1000个大肠杆菌基因组 | NA | NA | NA | 生物医学科学、合成生物学、分子生态学 |
| 111 | 2026-02-02 |
Protein engineering strategies to optimise recombinant product synthesis and accumulation in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70232
PMID:40577356
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综述 | 本文综述了在植物分子农业中，通过蛋白质工程和亚细胞工程策略优化本氏烟草中重组产品合成与积累的方法 | 讨论了蛋白质工程与亚细胞工程策略的创新结合，以定制本氏烟草用于重组蛋白质、肽和小分子的生产，包括信号序列融合、多功能结构域应用和异源酶共表达 | NA | 优化本氏烟草中重组产品的合成与积累，提高植物分子农业的生产效率 | 本氏烟草中的重组蛋白质、肽和小分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、亚细胞工程、异源酶共表达 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草 | 合成细胞器、正交翻译后修饰途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 112 | 2026-02-02 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达在Nicotiana benthamiana中工程化Solanum家族甾体生物碱和皂苷的生物合成途径，成功生产了多种高价值代谢物 | 发现并利用SlGAME2-NEW木糖基转移酶，首次在异源植物宿主中完整重构了番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷生物合成途径 | NA | 应用合成生物学在异源植物宿主中生产高价值的甾体代谢物 | 番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷，包括α-番茄碱、脱氢番茄碱及其立体异构体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、基因工程 | NA | NA | NA | 基因组合表达 | Nicotiana benthamiana | 甾体生物碱和皂苷的生物合成途径，涉及9至15个基因的组合表达 | 医药 |
| 113 | 2026-02-02 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
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综述 | 本文综述了在烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略，以提升其作为生物工厂的潜力 | 整合了化学/电磁信号传感器、可编程转录因子合成启动子、病毒复制子扩增系统及重组酶处理器等前沿技术，提出植物细胞包和自持生物发光系统等快速原型平台 | 未提供具体实验数据验证所述技术的实际效率与稳定性 | 开发可控制转基因表达的系统以克服烟草生物工厂的规模化限制 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、重组酶技术、病毒复制子技术 | NA | NA | NA | CRISPR, 重组酶系统 | 本氏烟草 | 条件性基因表达电路、信号传感器、合成启动子、转录信号放大系统、细胞记忆模块 | 农业, 工业生物技术 |
| 114 | 2026-02-02 |
A Comprehensive Multiomics Approach Illuminates the Biosynthetic Mechanism of Scoparone in Artemisia capillaris
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70398
PMID:41078345
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研究论文 | 本研究通过多组学方法阐明了茵陈蒿中主要活性成分滨蒿内酯的生物合成机制 | 首次生成了茵陈蒿的全长转录组和整合代谢组数据集，鉴定并表征了催化滨蒿内酯生物合成最后一步的新型O-甲基转移酶AcOMT1 | NA | 阐明茵陈蒿中滨蒿内酯的生物合成途径 | 茵陈蒿（Artemisia capillaris）及其活性成分滨蒿内酯 | 代谢组学 | 肝病 | 全长转录组学、整合代谢组学、加权基因共表达网络分析、系统发育分析、亚细胞定位分析、酶活性测定、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学、代谢工程 | 本氏烟草（Nicotiana benthamiana） | 滨蒿内酯生物合成途径 | 医药 |
| 115 | 2026-01-30 |
Green biomineralization of magnetic metal ions: comparative mechanisms and emerging applications
2026-Jan-28, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb02352a
PMID:41427805
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综述 | 本文系统比较了微生物介导的磁性金属离子生物矿化的三种主要机制，并综述了其在生物医学、环境修复和工业生产等领域的应用与挑战 | 首次系统性地比较和整合了生物控制矿化（BCM）、生物诱导矿化（BIM）和微生物影响矿化（MIM）三种机制，弥补了文献中长期以来对BCM过度关注而对BIM和MIM覆盖不足的失衡问题 | BIM机制的结构精确性较低，MIM机制仍处于早期发展阶段，且整个领域面临规模化、批次一致性和转化障碍等跨领域挑战 | 为微生物介导的磁性生物矿化的工业转化和跨学科发展提供一个全面的指导框架 | 磁性金属离子的微生物介导生物矿化机制 | NA | NA | 生物矿化 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 微生物 | NA | 生物医学, 环境, 工业生物技术 |
| 116 | 2026-01-30 |
Revolutionizing bio-hydrogen production: smart integration of nanotechnology, microbial engineering, and circular waste valorisation
2026-Jan-28, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-01001-4
PMID:41604032
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综述 | 本文全面综述了纳米技术、微生物工程和循环经济原则在生物制氢系统中的革命性整合 | 创新性地将纳米技术、先进微生物工程（包括CRISPR-Cas9合成生物学方法）与循环经济原则相结合，用于提升生物制氢效率和系统稳定性 | NA | 探索可持续能源替代方案，通过生物制氢实现碳中和能源生产并解决有机废物管理问题 | 生物制氢生产系统，包括可再生原料、微生物创新、纳米技术应用及纯化存储技术 | NA | NA | CRISPR-Cas9技术、纳米金属催化剂、酶固定化技术、等离子体纳米颗粒 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 能源、环境 |
| 117 | 2026-01-30 |
Isolation of Antigen-Specific Nanobodies From Synthetic Libraries Using a Protein Selection Strategy That Combines MACS-Based Screening of YSD and FLI-TRAP
2026-Jan-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5570
PMID:41607705
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研究论文 | 本文介绍了一种结合MACS酵母表面展示和FLI-TRAP细菌遗传选择系统的两阶段平台，用于高效筛选和优化抗原特异性纳米抗体 | 创新点在于整合了MACS酵母展示的高通量筛选与FLI-TRAP系统的胞内结合评估，通过Tat途径的共转运机制关联结合亲和力与抗生素抗性，提供了一种成本效益高且严格的胞内兼容性筛选方法 | NA | 研究目标是开发一种高效筛选和工程化高亲和力、特异性且功能表达的胞内蛋白质结合剂的方法 | 研究对象是抗原特异性纳米抗体，通过合成酵母展示库和细菌系统进行筛选 | 合成生物学 | NA | MACS酵母表面展示、FLI-TRAP细菌遗传选择系统、Tat途径共转运 | NA | NA | NA | 酵母表面展示、细菌遗传选择系统 | 酵母、细菌 | 利用Tat信号肽标记的蛋白质与β-内酰胺酶标记的抗原靶点共表达，设计基于共转运的筛选系统，仅高亲和力结合对能共转运至周质并赋予抗生素抗性 | 医学、合成生物学 |
| 118 | 2026-01-30 |
Development of a high-performance synthetic promoter for plant-based bioproduction
2026-Jan-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04925-z
PMID:41553553
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研究论文 | 本研究通过域改组策略开发了一种合成FM启动子，其在植物中的活性比传统CaMV35S启动子高4倍，并成功应用于抗病毒肽的生产 | 通过Figwort花叶病毒和Mirabilis花叶病毒启动子的关键调控区域进行域改组，创建了具有超强活性的紧凑型合成启动子，并验证了其与CRISPR-dCas9转录激活系统的兼容性 | 研究主要在三种植株模型中进行验证，尚未在更多作物品种或田间条件下测试 | 开发高性能植物合成启动子以提高重组蛋白产量 | 植物合成启动子及其在重组蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | 基孔肯雅热 | 域改组、定量GUS检测、qRT-PCR、CRISPR-dCas9/VP64转录激活、体外抗病毒实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质产量数据、抗病毒活性数据 | 三种模型植物（烟草、本氏烟草、矮牵牛）的瞬时表达系统，以及转基因烟草和拟南芥的稳定株系 | CRISPR-dCas9/VP64 | Nicotiana tabacum, Nicotiana benthamiana, Petunia × atkinsiana, Arabidopsis thaliana | 合成启动子（含as-1、G-Box、ABRE顺式元件），用于驱动抗病毒肽scytovirin的表达 | 农业, 医药 |
| 119 | 2026-01-30 |
Research and Application of the Polyene Macrolide Antibiotic Nystatin
2026-Jan-19, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31020330
PMID:41599380
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综述 | 本文系统综述了多烯大环内酯类抗生素制霉菌素的化学特性、作用机制、临床应用、生物合成途径，并展望了通过基因编辑和合成生物学策略提升其安全性与疗效的未来发展方向 | 重点探讨了CRISPR/Cas9等基因编辑技术在靶向敲除有毒成分基因、优化生产菌株以提高制霉菌素产量和纯度方面的最新进展与潜力 | NA | 为制霉菌素的进一步研究和临床应用提供参考，并展望其通过结构优化、创新递送系统和合成生物学策略实现安全性与疗效提升的未来发展 | 多烯大环内酯类抗生素制霉菌素 | NA | 浅表真菌感染、口腔疾病、阴道炎、外耳炎 | CRISPR/Cas9基因编辑技术、I型聚酮合酶途径 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医药 |
| 120 | 2026-01-30 |
A Paradigm Shift in Microbial Protein Manufacturing
2026-Jan-14, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16010129
PMID:41598284
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综述 | 本文系统分析了微生物作为结构材料在应对全球蛋白质危机中的三种关键策略：菌丝固态发酵、细菌纤维素支架和合成生物学设计功能蛋白 | 提出从结构模拟转向功能创造、建立去中心化生产网络以及发展动态4D打印食品的未来突破方向 | 规模化生产和风味优化方面仍存在挑战 | 探讨微生物作为多功能结构材料以解决全球蛋白质危机和替代蛋白质质地限制 | 微生物策略，包括菌丝固态发酵、细菌纤维素支架和合成生物学设计的功能蛋白 | NA | NA | 菌丝固态发酵、细菌纤维素支架技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物（如菌丝、细菌） | 定制功能蛋白的设计 | 食品、农业 |