本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-08-13 |
Strengthening global biosecurity for synthetic nucleic acid technology: from sequence screening to risk-based governance in the AI era
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1820001
PMID:42582258
|
综述 | 本文回顾了合成核酸技术的生物安全治理现状,指出基于序列筛查的现有措施在AI辅助生物设计时代存在结构性局限,并提出一个基于风险的、四维度系统性治理框架和四级升级模型 | 提出将AI辅助设计能力纳入生物安全评估的系统性风险框架,并引入四级治理升级模型,强调公平性和比例原则 | 框架是诊断性和半结构化的,而非定量,可能缺乏精确性 | 加强合成核酸技术的全球生物安全治理,以应对AI时代的挑战 | 合成核酸技术、生物安全治理框架、AI辅助设计工具 | 自然语言处理 | NA | NA | 蛋白质语言模型 | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 102 | 2026-08-13 |
From Mechanism to Clinic: Engineered Bacteria-Nanomaterial Hybrid Systems for Cancer Immunotherapy
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1390
PMID:42582682
|
综述 | 本文综述了工程细菌-纳米材料混合系统在癌症免疫治疗中的应用,涵盖机制、设计策略及临床转化前景 | 系统性地探讨了细菌-纳米材料混合系统如何利用肿瘤相关细菌和物理刺激(如光热、光动力、声动力和磁热效应)增强肿瘤靶向性和抗肿瘤免疫,并总结了从机制到临床的转化路径 | 临床转化需更多关于安全性、可控性、制造一致性和疗效的证据 | 探讨工程细菌-纳米材料混合系统在癌症免疫治疗中的应用机制、设计策略及临床转化的挑战和前景 | 工程细菌-纳米材料混合系统、肿瘤相关细菌、纳米材料及物理刺激 | 纳米医学、合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌(如肿瘤靶向细菌) | NA | 医学 |
| 103 | 2026-08-13 |
Molecular mechanisms of bacteria-mediated cancer immunotherapy: from intratumoral microbiota to engineered therapeutics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1878878
PMID:42582890
|
综述 | 本文综合探讨了细菌介导的癌症免疫疗法(BCIT)的分子机制,包括瘤内菌群对肿瘤的增强或抑制作用,以及通过合成生物学等工程手段将细菌改造为精准递送平台,并评估了临床转化中的障碍和未来方向 | 系统整合了瘤内菌群在癌症免疫中的双重作用机制,并概述了包括群体感应电路、热诱导开关、分子模拟和生物混合微型机器人在内的先进工程策略,提出了AI引导的微生物组整合框架以加速临床转化 | 综述中提到临床转化存在安全性、药代动力学、监管科学和患者间异质性等瓶颈,但未提供解决这些问题的具体实验数据或案例 | 为利用活体细菌疗法将免疫学上“冷”肿瘤转化为“热”肿瘤提供概念框架,并讨论未来微生物组驱动的肿瘤学试验的关键方向 | 瘤内细菌、工程细菌菌株及其在癌症免疫治疗中的应用 | 合成生物学、免疫学、微生物组学 | 癌症 | 合成生物学、单细胞测序、无菌动物建模 | NA | 文献数据、概念数据 | NA | CRISPR-Cas9(提及可编程平台,但未具体指明工具,常涉及)、其他合成生物学工具 | 细菌(共生或减毒病原体) | 群体感应电路、热诱导开关、分子模拟、生物混合微型机器人 | 医学 |
| 104 | 2026-08-08 |
Bioengineering Living Biohybrid Therapeutics for Synergistic H2S Gaseous-Photothermal Cancer Eradication
2026-01, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501621
PMID:40820708
|
研究论文 | 开发了一种整合工程菌与自矿化硫化铜纳米颗粒的活体生物混合治疗平台,用于协同硫化氢气体-光热癌症治疗 | 将工程微生物原位产生硫化氢与自矿化硫化铜纳米颗粒结合,形成活体生物杂化物,首次实现气体与光热疗法的协同癌症治疗 | 未提及 | 开发高效、安全的癌症治疗新方法,通过生物杂交平台实现协同气体-光热治疗 | 工程化兼性厌氧菌Vibrio natriegens,乳腺癌荷瘤小鼠模型 | 合成生物学,纳米技术 | 乳腺癌 | NA | NA | 体内成像数据、肿瘤抑制率数据 | 乳腺癌荷瘤小鼠模型 | NA | Vibrio natriegens | 代谢通路:细菌产生硫化氢并合成硫化铜纳米颗粒 | 医学 |
| 105 | 2026-08-08 |
The promise and peril of mirror bacteria
2026, Acta biochimica Polonica
IF:1.4Q4
DOI:10.3389/abp.2026.16673
PMID:42434594
|
观点文章 | 本文探讨镜像细菌从理论概念走向实际可行性的前景与风险,分析其在应用、伦理、监管和文化层面的影响 | 超越狭隘的生物安全讨论,从更广泛的伦理、监管和文化角度审视镜像细菌,将其视为科学与社会应对创造新型生命责任的罕见测试案例 | 未提供具体实验数据或详细技术方案,属于观点性论述 | 评估镜像细菌的机遇与风险,探讨其伦理、监管和文化影响,并为合成生物学治理框架提供建议 | 镜像细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物工程、信息存储 |
| 106 | 2026-08-08 |
The Enzyme-Bag Platform for Cytochrome P450 Biotransformation and High-Throughput Drug Metabolism Screening
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5190-2_9
PMID:42562981
|
研究论文 | 介绍了一种基于裂殖酵母的酶袋平台,用于细胞色素P450生物转化和高通量药物代谢筛选 | 利用半完整细胞方法(酶袋系统)结合重组人CYP酶,避免了传统微粒体制备和纯化蛋白的繁琐过程,支持所有57种人CYP酶的功能分析,并兼容多种检测方式 | 文中未明确提及研究的局限性 | 开发一种简化且多用途的药物代谢研究平台,以支持药理学、毒理学和精准医学中的酶活性、底物特异性和抑制剂分析 | 人细胞色素P450酶(包括孤儿CYP)、II相酶(UGTs、SULTs)、昆虫P450s,以及裂殖酵母和酿酒酵母等宿主 | 药物代谢研究,合成生物学 | 不适用 | 重组表达、选择性透化处理、生物转化实验、发光检测、色谱和质谱分析 | 不适用 | 实验数据(酶活性、代谢产物谱) | 所有57种人CYP酶及扩展至II相酶和昆虫P450s,未提及具体样本数量 | 不适用 | 裂殖酵母,酿酒酵母 | 生物转化平台,包括CYPome基因文库和酶袋cocktail高通量筛选系统 | 药物代谢,毒理学,合成生物学,药物开发 |
| 107 | 2026-08-08 |
A Physics-Inspired Approach to Improve Oligonucleotide Design and Gene Synthesis
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0189
PMID:42564310
|
研究论文 | 提出一种基于统计物理模型的算法,用于优化聚合酶循环组装(PCA)中的寡核苷酸设计,以改善基因合成的产量和可靠性。 | 采用统计物理模型和转移矩阵形式精确求解低温度解,结合模拟退火修复和密码子重设计,相比启发式方法能更有效地处理短、GC偏向或易形成二聚体的序列。 | 未明确讨论算法在处理复杂异源二聚体相互作用时的计算成本,以及实验验证仅覆盖14个代表性设计,可能不足以全面评估其普遍适用性。 | 改进PCA基因合成中寡核苷酸的设计,确保均匀杂交温度和最小化非特异性二聚体形成,特别是针对困难序列。 | 超过10,000条被认为不适合合成的序列,以及14个代表性设计用于实验验证。 | 合成生物学 | NA | 聚合酶循环组装(PCA)、琼脂糖凝胶电泳 | 统计物理模型、转移矩阵、模拟退火 | 序列数据 | 10,000多条序列(计算评估),14个代表性设计(实验验证) | NA | NA | 寡核苷酸设计 | 合成生物学、自动化基因组装 |
| 108 | 2026-08-08 |
Saccharomyces cerevisiae in cancer research: modeling tumor biology and enabling drug discovery
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.08.885
PMID:42564453
|
综述 | 本文综述了酿酒酵母在癌症研究中的应用,包括模拟肿瘤生物学和促进药物发现。 | 将酿酒酵母作为一种简化和可扩展的真核模型,用于研究癌症相关的保守细胞过程,并作为转化和生物技术应用的平台。 | 未明确提及,但可能包括酵母与哺乳动物系统在癌症复杂性方面的差异。 | 探讨酵母平台在癌症研究中的应用,包括肿瘤生物学建模和药物发现。 | 酿酒酵母及其在癌症研究中的应用。 | 生物技术 | 癌症 | 遗传操作、异源表达、合成生物学、功能基因组学、高通量筛选。 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学技术。 | 酿酒酵母 | 用于研究致癌信号、代谢重编程、应激适应、DNA修复和自噬的工程酵母平台。 | 医学、工业生物技术 |
| 109 | 2026-08-07 |
Gut microecology empowers cancer immunotherapy: commensal microbiota-mediated mechanisms and translational prospects of PD-1/PD-L1 therapy
2026-Jan-29, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
综述 | 本文系统综述了肠道微生物群通过多种机制调节PD-1/PD-L1免疫治疗疗效的潜力,以及基于微生物组的个性化免疫治疗策略的临床前前景 | 从多组学、合成生物学和精准微生物干预的综合视角,系统探讨肠道微生物在PD-1/PD-L1治疗中的调控作用及转化前景 | NA | 探索肠道微生物群在PD-1/PD-L1免疫治疗中的调节机制及微生物组为基础的个性化免疫治疗策略 | 肠道微生物群、PD-1/PD-L1免疫治疗 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 110 | 2026-08-07 |
Darkfield illumination enhancing artificial-intelligence-assisted digital microfluidics for on-site pathogen detection
2026-01-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2025.344831
PMID:41330666
|
research paper | 本文介绍了一种集成暗场照明的数字微流控平台,用于增强人工智能辅助的病原体检测 | 将暗场照明与数字微流控相结合,显著提高液滴对比度,从而提升深度学习模型在目标检测和语义分割中的性能,实现自动化多步病原体检测 | 未提及具体局限性 | 开发一种结合暗场照明的数字微流控平台,以提高AI驱动的液滴操控和病原体检测的准确性和自动化水平 | 暗场照明的数字微流控平台及临床样品中的肺炎支原体 | 计算机视觉、数字微流控 | 肺炎支原体感染 | 数字微流控、暗场照明、荧光显微 | 深度学习模型(目标检测和语义分割) | 液滴图像 | 临床样品(具体数量未提及) | NA | NA | NA | 医学、即时检测 |
| 111 | 2026-08-07 |
Microbiota, fermentation, and metabolite biotransformation: Pathways to functional foods and personalised nutrition
2026, Advances in food and nutrition research
DOI:10.1016/bs.afnr.2026.02.001
PMID:42556887
|
综述 | 本文探讨了微生物组、发酵和代谢物生物转化之间的机制联系,重点介绍了精准发酵技术在功能性食品和个性化营养中的应用 | 将精准发酵与基因组编辑、代谢通量优化和AI辅助途径设计相结合,以实现特定代谢物的可预测产量,并探讨了将代谢物谱与个体微生物组组成匹配的个性化营养策略 | 未明确指出具体局限性 | 探讨微生物代谢与宿主健康之间的机制联系,综述新兴发酵技术用于靶向代谢物生产,并强调从研究到商业应用的转型案例 | 人类肠道微生物群、发酵过程、工程微生物菌株 | 微生物组学、合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢通量优化、AI辅助途径设计、精准发酵 | NA | 文本 | NA | 基因组编辑 | 微生物(具体宿主未指定) | 代谢途径设计 | 食品、医学 |
| 112 | 2026-08-07 |
Engineering Biology in an Age of Convergence: Evolving Research Leadership at the AI-SynBio-Robotics Frontier
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70010
PMID:42559296
|
评论 | 本文探讨人工智能、工程生物学(合成生物学)、自动化与RNA治疗学融合背景下的研究领导力,主张从传统合规导向的监督转向战略性管理方法。 | 首次提出在AI-合成生物学-机器人技术融合前沿,领导者必须采用风险分层、适应性强、透明且国际互操作的战略管理方法,将治理嵌入研究设计上游。 | 未提供具体案例或实证数据支持,主要基于理论论证。 | 论证在融合科学时代,组织高级领导者应如何调整治理方式以支持创新和负责任转化。 | 融合工程生物学研究和开发的组织及其领导者。 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 113 | 2026-08-06 |
From fermentation to function: a critical review of lactic acid bacteria redesign for functional foods and precision nutrition
2026, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2026.2631641
PMID:41712255
|
综述 | 这篇综述全面探讨了乳酸菌从传统食品保藏和风味提升到合成生物学、基因组编辑和人工智能驱动的先进应用的转变,重点评估了其在提高发酵食品质量、个性化营养和精准医学中的潜力 | 该综述创新性地整合了CRISPR-based菌株改良、微流控高通量筛选、AI增强的精准设计和个性化营养框架,并系统讨论了监管、伦理、技术和消费者接受度等多维度挑战 | 文章指出,全球监管差异、基因工程乳酸菌的伦理问题、先进发酵技术放大的技术难题以及消费者接受度是主要限制因素 | 旨在全面评估乳酸菌在功能性食品和精准营养中的应用进展,并提出未来研究方向以促进可持续和消费者友好的创新 | 乳酸菌 | 合成生物学、人工智能 | NA | CRISPR、微流控高通量筛选、AI增强设计 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | NA | 食品工业、医学(精准营养) |
| 114 | 2026-08-06 |
Engineering Organoid Platforms for Pathogenesis Research
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1346
PMID:42553490
|
综述 | 本文系统综述了类器官技术作为病原体研究平台的发展,涵盖感染模型构建、多器官模型、药物筛选及与先进工程策略的结合 | 强调类器官平台与先进工程策略(如共培养、CRISPR-Cas9、器官芯片、3D生物打印)的整合,并探讨人工智能和合成生物学在其中的前沿应用 | 讨论了限制临床转化的主要瓶颈,但未提供具体数据或案例研究 | 评估类器官技术在病原体研究中的发展和应用,以增强对宿主-病原体相互作用的理解和全球病原体应对准备 | 类器官感染模型,包括呼吸道、肠道和神经类器官 | 数字病理学 | 传染病 | 类器官培养、CRISPR-Cas9、器官芯片、3D生物打印 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9, 3D生物打印 | 人类细胞 | 类器官共培养系统、基因扰动回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 115 | 2026-08-04 |
Leveraging synthetic biology for the commercialization of renewable fuels and chemicals aligning sustainable development goals
2026, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2025.2578270
PMID:41191734
|
综述 | 本文综述了合成生物学在可再生燃料和绿色化学品商业化中的应用,重点探讨其如何通过DNA建模、代谢工程和微生物发酵的进步,优化来自非粮食原料(如木质纤维素生物质)的生物燃料生产,并分析行业现状与挑战。 | 从合成生物学视角系统探讨生物燃料和生物化学品商业化的潜力,强调非粮食原料的应用及可持续发展目标的协同,并聚焦菌株工程优化和产业化挑战。 | 综述未包含具体的实验数据或案例量化分析,对生物安全、知识产权等挑战的讨论较为概览性。 | 探讨合成生物学在生物燃料和绿色化学品生产中的作用,评估其实现商业化及支持可持续发展的可能性。 | 产乙醇等生物燃料的工程微生物菌株,包括大肠杆菌和酿酒酵母等。 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、DNA建模、微生物发酵 | NA | 综述性文献 | NA | NA | 大肠杆菌、酿酒酵母 | NA | 能源、工业生物技术 |
| 116 | 2026-08-02 |
Green Drug Discovery: Leveraging Biodiversity for Sustainable Pharmaceutical Solutions
2026-Jan, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202500733
PMID:41504102
|
综述 | 本文探讨了绿色制药的变革潜力,整合生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能,以实现可持续的药物发现与生产 | 提出下一代绿色制药概念,整合生物多样性、绿色化学、生物技术和AI,以促进环保高效的药物生产过程 | 面临生物勘探伦理问题、保护工作和生物多样性资源公平惠益分享等挑战 | 探索绿色制药在推动可持续医药未来中的作用 | 植物、微生物和海洋生物中的生物活性化合物 | 机器学习和人工智能 | 不适用 | CRISPR基因编辑、代谢工程、生物催化、超临界流体萃取 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 不适用 | 不适用 | 医药 |
| 117 | 2026-07-31 |
Microbial remediation of recalcitrant pollutants in soil and geo-environmental engineering systems
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1904267
PMID:42529377
|
综述 | 综述微生物修复土壤中难降解污染物的过程及其在地环境工程系统中的应用 | 综合讨论了难降解污染物类型、土壤微生物群落及关键微生物过程,并批判性地评估了地环境工程应用,如生物刺激、生物强化、根际修复、真菌修复、微生物诱导碳酸盐沉淀和渗透反应性生物屏障,同时指出了合成生物学、工程微生物菌群、纳米生物修复和人工智能等新兴创新 | 未明确提及综述的具体局限性 | 总结微生物修复难降解污染物的原理、过程及地环境工程应用,并展望未来研究方向 | 土壤中难降解污染物(如多环芳烃、石油烃、氯化化合物、农药、药物、全氟和多氟烷基物质及重金属)及微生物群落 | 机器学习和数字病理 | NA | 微生物降解、生物吸附、生物累积、生物转化、生物矿化、共代谢、生物膜介导过程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌、放线菌、微生物菌群 | 生物修复途径(如降解、转化、固定化、解毒) | 环境 |
| 118 | 2026-07-30 |
Next-Generation Immune Checkpoints and Tumor Microenvironment Modulation in Cancer Immunotherapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7864229
PMID:41811823
|
综述 | 全面审查下一代免疫检查点及肿瘤微环境调节在癌症免疫疗法中的作用 | 总结了共抑制性和共刺激性新一代免疫检查点(如LAG-3、TIM-3、ICOS等)的分子机制、临床证据,并整合了免疫代谢、先天免疫传感、细胞因子信号及肠道菌群等互补策略,提出基于多组学和AI的精准免疫肿瘤学框架 | 主要基于现有文献和临床试验,缺乏对长期疗效或毒性比较的直接原始数据,未涉及真实世界患者异质性分析 | 探讨下一代免疫检查点及肿瘤微环境调控策略以提高癌症免疫疗法的疗效和适用范围 | 新一代免疫检查点分子(LAG-3、TIM-3、TIGIT、VISTA、IGSF8等)及TME调节机制(IDO1、CD73、TLRs、IL-2等) | 机器学习, 系统生物学 | 癌症 | NA | NA | 文本, 临床数据 | 大量的临床试验(如LAG-3的6项、TIM-3的4项等) | NA | NA | NA | 医学 |
| 119 | 2026-07-30 |
Evaluating AI-assisted customer verification for synthetic nucleic acid screening
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1819556
PMID:42516423
|
研究论文 | 评估大型语言模型在合成核酸订购客户身份验证中的辅助作用 | 首次系统比较五种大型语言模型与人类专家在合成核酸合法性筛查中的表现,发现AI在准确率上与人类无显著差异,且成本仅为人类的十分之一 | 未提及具体局限性 | 评估AI工具是否能有效辅助合成核酸订购的合法性筛查过程 | 来自全球的生命科学研究人员客户资料 | 自然语言处理 | NA | NA | 大型语言模型(Gemini 2.5 Pro等) | 文本 | 未明确样本数量,涉及全球生命科学研究人员客户资料 | NA | NA | NA | 生物技术安全、公共卫生 |
| 120 | 2026-07-30 |
Synthetic biology and genome engineering in support of human, agricultural, and environmental security
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1820360
PMID:42518765
|
评论文章 | 探讨合成生物学和基因组工程在保障人类、农业和环境安全方面的当前和潜在益处,以平衡生物安全风险讨论 | 强调在生物安全监管辩论中,政策制定者需同时关注合成生物学技术的积极应用价值,提供风险与收益的平衡视角 | NA | 概述合成生物学和基因组工程对人类健康、农业和环境安全的潜在社会、经济和环境价值 | 核酸合成调控、生物安全治理、医疗健康技术、生物制造、食品农业创新、环境生物传感器及生态修复干预 | NA | NA | 核酸合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 环境生物传感器 | 医药, 农业, 环境, 工业生物技术 |