合成生物学相关文章
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当前共找到 215 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-01-21 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Jan-14, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，结合长读和短读测序技术，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱 | CLASSIC平台首次将长读和短读NGS结合，实现对多kb长度基因电路设计的超高通量映射，揭示遗传部件组合规则 | NA | 加速合成生物学，通过筛选基因电路设计并学习'组成到功能'映射，揭示遗传部件组合规则 | 人类细胞中的基因电路设计 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10个基因电路设计（长度5-20 kb） | NA | 人类细胞 | 基因电路设计，包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 102 | 2026-01-21 |
Electrochemical techniques in protein engineering: Innovations in redox-active protein design and electron transfer mechanisms
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149750
PMID:41418956
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综述 | 本文综述了电化学技术在蛋白质工程中的应用，特别是在设计氧化还原活性蛋白和探究电子转移机制方面的创新 | 综述了人工智能与计算建模在识别增强电子转移效率的突变中的应用，以及合成生物学构建人工电子传递途径和纳米结构材料改善蛋白质固定化与电荷传导的最新进展 | 蛋白质稳定性、隧穿效应的精确控制以及有效的电子集成等挑战仍需解决 | 探讨电化学技术如何支持工程化氧化还原蛋白的设计与功能优化，并推动其在生物电子系统中的应用 | 氧化还原活性蛋白及其工程化设计 | 蛋白质工程 | NA | 电化学技术（阻抗谱、循环伏安法、计时电流法、扫描电化学显微镜） | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 人工电子传递途径 | 生物传感、生物电催化、生物电子学、医疗保健监测 |
| 103 | 2026-01-20 |
Phyllosphere microbiome: Exploring the unexplored frontiers for precision agricultural and environmental sustainability
2026-Jan-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04788-2
PMID:41549150
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综述 | 本文综述了叶际微生物组作为地球上最大微生物栖息地之一，在可持续农业和环境健康中的关键作用及其应用潜力 | 系统阐述了叶际微生物组在精准农业和环境可持续性中未被充分探索的前沿领域，并提出了通过组学技术、微生物群落工程和纳米递送系统等新方法克服应用限制的策略 | 叶际微生物的实际应用仍面临环境不稳定性、田间持久性差、功能表征不完整以及叶面微气候多变等挑战 | 探索叶际微生物组在精准农业和环境可持续性中的应用潜力 | 植物叶际（地上部分表面）的微生物群落，包括细菌、真菌和酵母 | NA | NA | 组学技术、微生物群落工程、纳米递送系统 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 环境 |
| 104 | 2026-01-20 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-Jan-19, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
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综述 | 本研究对1994年至2024年全球植物基因工程领域的文献进行了文献计量分析，以揭示其发展趋势、国际合作网络和技术演进 | 通过文献计量学方法系统揭示了全球植物基因工程研究的双核合作结构（中国和美国），并识别了技术生命周期的三个阶段及未来技术轨迹 | NA | 系统考察全球植物基因工程的发展趋势、合作网络和技术演进 | 全球植物基因工程领域的科学文献 | NA | NA | Agrobacterium介导的转化、RNA干扰(RNAi)、CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 烟草植物 | NA | 农业 |
| 105 | 2026-01-20 |
Stem cells in organogenesis and regeneration
2026-Jan-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04889-z
PMID:41549301
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综述 | 本文综述了干细胞在器官发生和再生中的作用，涵盖干细胞类型、关键信号通路、器官形成机制、再生医学应用以及新兴技术 | 系统整合了胚胎干细胞、诱导多能干细胞和间充质干细胞在器官发生与再生中的不同作用，并探讨了CRISPR、3D生物打印和合成生物学等先进技术的应用前景 | NA | 全面概述干细胞生物学及其在器官发生、组织再生和临床转化中的潜力 | 干细胞（胚胎干细胞、诱导多能干细胞、间充质干细胞）、类器官、信号通路 | NA | NA | CRISPR、3D生物打印、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 106 | 2026-01-20 |
Regulation of Single and Multiple Genes in Bacillus amyloliquefaciens by an Evolution System In Vivo
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00480
PMID:41396964
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研究论文 | 本研究开发了一种用于枯草芽孢杆菌单基因和多基因调控的高效体内进化系统，通过CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑器和进化模板设计，成功优化了碱性蛋白酶活性和血红素产量 | 开发了基于CRISPR/Cas9n-AID的体内进化系统，首次在枯草芽孢杆菌中实现单基因和多基因的同时进化调控，并通过扩展sgRNA策略优化进化效率 | NA | 开发一种高效的体内进化系统，用于调控枯草芽孢杆菌中的单基因和多基因，以优化细胞工厂的构建 | 枯草芽孢杆菌及其基因（如碱性蛋白酶基因和血红素代谢网络关键基因） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑、下一代测序、分批补料发酵 | NA | 测序数据、发酵数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 碱基编辑器（Cas9n与AID融合表达）、进化模板（含可编辑RBS序列） | 工业生物技术 |
| 107 | 2026-01-20 |
A Dual CRISPR-Cas/Cre-loxP Genome Engineering Strategy for Stable Uricase Expression in Food-Grade Probiotics
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00774
PMID:41432353
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研究论文 | 本文开发了一种结合CRISPR-Cas9基因敲入与Cre/loxP介导的基因组精简的双重基因组工程策略，用于在食品级益生菌中实现尿酸酶的稳定表达 | 首次将CRISPR-Cas9基因编辑与Cre/loxP系统整合，构建了遗传稳定、生物安全的食品级益生菌底盘，并实现了异源尿酸酶的高效稳定表达 | 研究目前仅在小鼠肠道中验证了定植能力，尚未进行人体临床试验；尿酸降解实验仅在体外条件下完成 | 开发具有定制代谢功能的食品级微生物底盘，用于合成生物学在健康与营养领域的应用 | 乳酸乳球菌NZ9000菌株及其工程改造菌株 | 合成生物学 | 高尿酸血症/痛风 | CRISPR-Cas9基因编辑, Cre/loxP重组系统, 基因组工程 | NA | 酶活性数据, 基因组测序数据, 体内定植数据 | 工程菌株（NZ9000-Δ）及其对照 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 乳酸乳球菌（Lactococcus lactis） | 尿酸酶异源表达系统, 基因组精简设计 | 食品, 医药 |
| 108 | 2026-01-20 |
Synthetic Biology Strategies for Harnessing Bacterial Glucose Oxidation Pathways
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00901
PMID:41494861
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综述 | 本文系统综述了细菌葡萄糖氧化途径的组成、分布、生理功能、关键酶及其代谢产物的工业应用，并重点讨论了通过代谢工程策略优化该途径以生产高价值化合物的潜力 | 系统整合了细菌葡萄糖氧化途径的生物学知识与代谢工程策略，并全面评估了该途径在可持续生产多种高价值化合物（如酒石酸、2,5-呋喃二甲酸、维生素C前体和磷肥）中的应用潜力 | NA | 探讨如何利用合成生物学与代谢工程策略优化细菌的葡萄糖氧化途径，以实现特定高价值化合物的高效、可持续生产 | 细菌的葡萄糖氧化途径及其关键酶（如PQQ依赖型和FAD依赖型葡萄糖酸脱氢酶），以及该途径的代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 葡萄糖氧化途径（涉及葡萄糖酸、5-酮基-D-葡萄糖酸、2-酮基-D-葡萄糖酸和2,5-二酮基-D-葡萄糖酸等中间产物的代谢通路） | 工业生物技术, 农业, 医药 |
| 109 | 2026-01-20 |
A Framework for a Standard-Enabled FAIR Data Management Workflow for Synthetic Biology
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00813
PMID:41498158
|
综述 | 本文提出了一个基于标准的FAIR数据管理框架，用于合成生物学实验室中数据与元数据的整合与标准化工作流 | 通过半结构化访谈分析当前实践，构建了将常见数据类型映射到社区标准的框架，并提供逐步采用指南和软件解决方案目录 | NA | 解决合成生物学数据分散、格式不一致的问题，提升数据的可查找性、可访问性、互操作性和可重用性 | 合成生物学项目生命周期中产生的序列、模型、协议、图像和时间序列测量等数据与元数据 | 合成生物学 | NA | 半结构化访谈 | NA | 序列、模型、协议、图像、时间序列测量 | 美国多个实验室的合成生物学研究人员 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 110 | 2026-01-20 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 本研究探讨了沙雷氏菌（Serratia plymuthica）菌株As3-5a(5)在浮游细胞和生物膜系统中对铜的生物吸附作用，重点关注紧密结合的胞外聚合物物质的关键角色 | 揭示了紧密结合的胞外聚合物物质（尤其是蛋白质组分）在铜生物吸附中的关键作用，并展示了该菌株在强酸性真实电镀废水中仍能实现高效铜去除的潜力 | 研究未在真实工业废水条件下进行规模化验证，未来需要通过合成生物学方法改进铜螯合能力并提升技术成熟度 | 开发高效的重金属生物去除系统，探索可持续的铜修复生物技术方法 | 沙雷氏菌（Serratia plymuthica）菌株As3-5a(5)及其胞外聚合物物质 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附、生物膜培养、废水处理实验 | NA | 实验数据、吸附效率数据 | 使用烧结玻璃生物膜系统和浮游细胞系统进行实验，具体样本数量未明确说明 | 合成生物学方法（未来研究方向） | 沙雷氏菌（Serratia plymuthica） | NA | 环境、工业生物技术 |
| 111 | 2026-01-20 |
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Jan-12, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118391
PMID:41548356
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研究论文 | 本研究构建了一个合成基因电路，将生化信号转换为电信号，用于工程化感官细菌的电化学生物传感 | 设计了一个集成合成基因电路，结合一氧化氮响应模块和PCA合成模块，增强了电信号输出，实现了单细胞水平的高灵敏度检测 | NA | 开发基于工程化电活性微生物的电化学生物传感器，用于细胞内一氧化氮的原位分析 | 工程化的大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | 电化学量化 | NA | 电信号 | NA | 合成生物学工具 | 大肠杆菌 | 集成合成基因电路，包括一氧化氮响应模块和苯二胺-1-羧酸合成模块，用于间接电子传递和信号转换 | 医学 |
| 112 | 2026-01-20 |
Chimeric antigen receptor-based cellular therapy for T-cell malignancies
2026-Jan, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105044
PMID:41285209
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综述 | 本文综述了基于嵌合抗原受体（CAR）的细胞疗法在T细胞恶性肿瘤中的应用，探讨了包括T细胞亚群、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞和γδ T细胞在内的多种免疫效应细胞，并讨论了多抗原靶向、新兴技术和最新临床试验 | 聚焦于CAR疗法在T细胞恶性肿瘤中的挑战，如抗原共享导致的细胞自相残杀和T细胞再生障碍，并探索了多种免疫效应细胞和新兴技术以改善疗效 | NA | 改善复发或难治性T细胞恶性肿瘤的CAR疗法疗效 | T细胞恶性肿瘤患者 | NA | T细胞恶性肿瘤 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞、γδ T细胞 | 嵌合抗原受体（CAR）设计，使用单链可变片段（scFv）识别肿瘤相关抗原 | 医学 |
| 113 | 2026-01-20 |
Toward full automation in synthetic biology: A progressive conceptual framework integrating robotics and intelligent agents
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100378
PMID:41360266
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综述 | 本文探讨了合成生物学中物理（机器人）和认知（智能代理）自动化的进展与前景，并提出了一个双重概念框架 | 提出了一个双重概念框架：一个用于设计-构建-测试-学习（DBTL）周期的完全自动化，另一个适用于不同实验室环境的渐进式自动化 | NA | 支持合成生物学实验室中自动化系统的开发和负责任实施 | 合成生物学中的自动化技术和智能代理 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 114 | 2026-01-20 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为DNA-Diffusion的生成式人工智能框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 首次利用基于DNA可及性数据训练的生成式AI框架设计调控元件，生成的200碱基对合成元件能重现内源性转录因子结合模式并增强细胞类型特异性 | NA | 开发用于精确基因表达控制的合成调控元件设计方法 | 调控元件设计、基因表达控制 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq、EXTRA-seq、DNA可及性数据 | 生成式AI、DNA-Diffusion | DNA序列数据、基因表达数据 | 5,850个元件的STARR-seq文库在三种细胞系中验证 | NA | 多种细胞系 | 合成调控元件设计 | 医学、基因治疗 |
| 115 | 2026-01-19 |
Arabinose-Inducible Univariant Control System (AUCS) for Microbial Production of Proteins, Enzymes, and Metabolites
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00602
PMID:41423945
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研究论文 | 本文介绍了一种阿拉伯糖诱导的单变量控制系统（AUCS），用于微生物生产蛋白质、酶和代谢物，旨在克服现有诱导系统的局限性 | AUCS通过组成型表达阿拉伯糖转运蛋白AraE消除了碳分解代谢物阻遏，并最小化诱导异质性，仅需3 μM l-阿拉伯糖即可实现最大蛋白质输出，显著降低诱导剂成本和环境足迹 | NA | 开发一种稳健、紧密调控且低成本的表达平台，以优化微生物生产中的基因表达控制 | 微生物生产系统，包括蛋白质（如卵清蛋白）、酶（如萜烯合酶、类胡萝卜素裂解双加氧酶）和次级代谢物（如芳樟醇、橙花叔醇和香紫苏醇） | 合成生物学 | NA | 基因表达调控、启动子库定制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 单变量控制系统，包括阿拉伯糖诱导的启动子和阿拉伯糖转运蛋白AraE的组成型表达，用于精确调控多酶操纵子和复杂生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 116 | 2026-01-19 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Jan-16, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
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综述 | 本文综述了利用噬菌体递送CRISPR-Cas效应器的最新进展，旨在通过原位基因编辑工程化微生物群落 | 结合噬菌体工程策略、合成生物学技术和计算工具，实现CRISPR-Cas系统在宿主环境中的精准递送和基因组编辑 | 在系统发育广度部署方面仍面临挑战 | 开发技术以操纵和工程化微生物群落，实现其功能的理性调控 | 微生物群落及其功能角色 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体工程、合成生物学技术、计算工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物群落（未指定具体宿主） | NA | 医学, 食品, 农业 |
| 117 | 2026-01-19 |
SynVectorDB: embedding-based retrieval system for synthetic biology parts
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf088
PMID:41537189
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研究论文 | 本文介绍了SynVectorDB，一个基于嵌入的合成生物学元件检索系统，旨在解决现有数据库数据组织不一致和语义搜索能力有限的问题 | 开发了基于BGE-M3多语言嵌入的可扩展向量数据库架构，实现了语义相似性匹配；提出了新颖的三级层次分类系统；建立了标准化的数据整理工作流程 | NA | 改进合成生物学元件的发现和组织方式，提高检索效率和准确性 | 合成生物学元件（生物部件） | 生物信息学 | NA | 嵌入技术，语义相似性匹配 | BGE-M3嵌入模型 | 文本数据，元数据 | 19,850个生物部件（来自Addgene、iGEM注册库和实验室收集），其中7,656个通过文献验证获得验证状态 | iGEM | NA | NA | 工业生物技术 |
| 118 | 2026-01-19 |
Automated strain-to-peptide conversion: a high-throughput proteome analysis platform empowering rational design of microbial cell factories
2026-Jan-13, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134010
PMID:41539624
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研究论文 | 本文开发了一种名为“菌株到肽转换”的高通量蛋白质组分析平台，用于加速微生物细胞工厂的理性设计 | 提出自动化SPC策略，相比传统SP3方法处理时间减少94%，膜蛋白定量提升28%，并实现96个样品在1小时内处理 | NA | 开发高通量蛋白质组分析平台以支持微生物细胞工厂的理性设计 | 工程化菌株的蛋白质组，特别是大肠杆菌样品 | 合成生物学 | NA | 质谱蛋白质组学，磁固相烷基化 | NA | 蛋白质组数据 | 96个大肠杆菌样品 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 119 | 2026-01-19 |
MGTbind: a comprehensive database of molecular glue ternary interactome
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1075
PMID:41160881
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研究论文 | 本文介绍了一个名为MGTbind的综合性数据库，该数据库专门收集分子胶参与的三元相互作用组数据 | 开发了首个全面整合分子胶三元相互作用组结构数据和实验数据的数据库，并集成了AlphaFold 3预测的结构信息 | 数据库依赖现有实验数据和预测模型，可能无法覆盖所有未知的分子胶相互作用 | 为分子胶的理性设计提供数据资源支持 | 分子胶及其参与的三元蛋白质相互作用 | 生物信息学 | NA | 数据库构建、AlphaFold 3结构预测 | NA | 化学结构数据、蛋白质相互作用数据、生物活性测量数据 | 3093个经人工整理的分子胶，3924个三元相互作用 | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 120 | 2026-01-19 |
GotEnzymes2: expanding coverage of enzyme kinetics and thermal properties
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1053
PMID:41171142
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研究论文 | 本文介绍了GotEnzymes2数据库，这是一个大幅扩展的酶动力学和热性质资源库 | 相比第一版，GotEnzymes2首次整合了催化参数和热参数，实现了kcat、Km、kcat/Km、最适温度和熔解温度的联合预测，创建了迄今最全面的酶动力学和稳定性参数数据库 | NA | 解决酶动力学实验测量参数稀缺的问题，为数据驱动的酶发现、设计和工程提供资源 | 酶动力学参数和热性质参数 | 系统生物学 | NA | 酶动力学参数预测模型 | NA | 酶催化参数和热参数数据库 | 覆盖10,765个物种、730万种酶、5,960万条独特条目 | NA | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 |