合成生物学相关文章
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当前共找到 312 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-06-06 |
YhfH functions as a tri-function RNA in Bacillus thuringiensis BMB171
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1528
PMID:41562254
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研究论文 | 揭示了苏云金芽孢杆菌BMB171中YhfH RNA作为一种三功能RNA的作用机制 | 首次发现YhfH RNA同时具有小RNA、反义RNA和信使RNA三种功能，即三功能RNA | NA | 阐明YhfH RNA的多功能调控机制及其在合成生物学中的应用潜力 | 苏云金芽孢杆菌BMB171菌株中的YhfH RNA | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | RNA数据 | NA | NA | 苏云金芽孢杆菌BMB171 | 三功能RNA调控回路 | 合成生物学 |
| 102 | 2026-06-06 |
Marine-derived antimicrobial peptides (AMPs): Blue biotechnological assets for sustainable healthcare and circular bioeconomy
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.08.002
PMID:41581932
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综述 | 综述海洋源抗菌肽作为可持续医疗和循环生物经济资源的蓝生物技术资产 | 强调了海洋源抗菌肽在应对抗菌素耐药性危机中的独特优势，包括低耐药倾向、多功能生物活性，以及通过基因组学、宏基因组学、机器学习和合成生物学等先进技术推动发现与优化的创新方法 | 讨论了生产可扩展性和监管框架等关键挑战，这些是商业化面临的主要障碍 | 综述海洋源抗菌肽在可持续医疗和循环生物经济中的应用潜力，并为其商业化路径提供清晰方向 | 海洋源抗菌肽，源自无脊椎动物、极端微生物和蓝细菌等海洋生物 | 计算生物学、合成生物学 | NA | 基因组学、宏基因组学、机器学习、合成生物学、异源表达、海洋生物质转化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗、水产养殖、食品安全、环境修复 |
| 103 | 2026-06-06 |
Harnessing Cannabis sativa as a dual-use platform for biohydrogen production and pharmaceutical synthesis: a hypothesis and theory
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1833491
PMID:42245109
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假设与理论 | 提出一种利用工程化大麻进行生物氢生产和药物合成的双用途生物炼制范式 | 提出利用工程化大麻的光合作用驱动绿色氢生产，同时保持其药用价值，并利用现有受控环境农业基础设施 | NA | 探索大麻作为双用途平台在生物氢生产和药物合成中的应用 | 工程化大麻 | 合成生物学 | NA | 光合电子流重定向、氢化酶活性工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、氢化酶工程 | 大麻 (Cannabis sativa) | 光合电子流重定向至氧保护氢化酶通路，用于分子氢生成 | 能源、医药、工业生物技术 |
| 104 | 2026-06-05 |
Microbial-driven nature-based solutions for environmental antimicrobial resistance and emerging contaminants: mechanisms, platform trade-offs, and decision framework
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1804764
PMID:42238881
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综述 | 本文综述了微生物驱动的自然解决方案在应对环境抗菌素耐药性和新兴污染物中的机制、平台权衡及决策框架 | 提出了一个连接环境来源、微生物机制、平台设计和监测指标的微生物自然解决方案决策框架，并整合了微生物生态学、合成生物学和组学方法的设计思路 | 面临可扩展性、长期性能、生态风险和监管接受度方面的挑战 | 探讨微生物驱动的自然解决方案在环境抗菌素耐药性和新兴污染物缓解中的应用与决策框架 | 抗菌素耐药性和新兴污染物（包括药物、个人护理产品、微塑料和内分泌干扰物） | 机器学习 | NA | 微生物生态学、合成生物学、组学方法 | NA | NA | 2000年至2024年间发表的文献 | NA | NA | NA | 环境 |
| 105 | 2026-06-05 |
Diterpenoids in medicinal plants: structure, distribution, biological activities, biosynthesis, and bioengineering prospects
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1833614
PMID:42239869
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综述 | 系统总结药用植物中二萜类化合物的结构、分布、生物活性、生物合成途径及生物工程前景 | 全面整合了二萜类化合物的结构分类、功能机制与合成生物学应用，并提出了机器学习在药理学和酶工程中的未来方向 | 未深入讨论具体化合物的临床前或临床试验数据，可能缺乏实际应用案例的定量分析 | 系统梳理二萜类化合物的研究现状，为发现新活性化合物、阐明完整生物合成途径及可持续生产提供基础 | 药用植物中的二萜类化合物 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 106 | 2026-06-04 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的应用，以推动农业、环境及未来技术的发展 | 利用新基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能实现“智能植物”与微生物群落协同工程，突破传统单基因改造限制 | 未具体说明现有技术在实际应用中的生物安全风险或规模化部署的挑战 | 推动合成生物学驱动下一次农业革命，并拓展植物工程在制造、基础设施、传感和修复领域的应用 | 植物（核、叶绿体、线粒体基因组）及其相关微生物（真菌、细菌、古菌） | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物, 真菌, 细菌, 古菌 | 环境响应电路、形态改变电路、威胁响应电路 | 农业, 环境, 制造, 基础设施, 传感, 修复 |
| 107 | 2026-06-04 |
Yeast Biosensors for the Safety of Fermented Beverages
2026-Jan-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16010064
PMID:41590316
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综述 | 综述酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的应用与发展 | 系统总结了酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的优势，包括实时检测、低成本、可集成于发酵系统，以及利用酵母的GRAS特性确保安全 | 酵母生物传感器仍主要停留在实验室规模，与工业广泛应用之间存在明显差距，需进一步研究其鲁棒性、可扩展性和监管整合 | 探讨酵母生物传感器在发酵饮料生产中保障安全性和品质的潜力，推动更安全、更高质量产品的制造 | 酵母生物传感器及其在啤酒、葡萄酒、康普茶等发酵饮料中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 报告系统（如荧光、颜色变化或电信号） | 食品 |
| 108 | 2026-06-04 |
The synergy of foundation technologies and computer sciences advances microbial expression systems in biomedical genetic engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.007
PMID:42191273
|
综述 | 基础技术与计算机科学的协同作用推动了生物医学基因工程中微生物表达系统的发展 | 系统阐述了合成生物学、CRISPR-Cas9等基因组编辑工具、下一代测序与组学技术、人工智能以及系统生物学与代谢建模等多学科技术的协同潜力，并提出克服当前障碍的策略 | 仍存在脱靶效应、代谢负担和放大生产限制等挑战 | 探讨基础生物技术与计算科学如何协同推进生物医学基因工程中微生物表达系统的进步 | 微生物表达系统 | 机器学习 | NA | 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 医学 |
| 109 | 2026-06-04 |
Protein Design Enters the Artificial Intelligence Era: Foundations, Tools, and Emerging Paradigms
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0105
PMID:42231905
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综述 | 本文综述了人工智能在蛋白质设计领域的应用，涵盖深度学习、蛋白质语言模型和知识图谱等技术，以及它们在序列-结构-功能关系解析中的进展 | 系统总结了AI在蛋白质设计中的新范式，包括AlphaFold2的结构预测精度和Transformer模型从头序列设计，突出了计算与实验整合的趋势 | 模型可解释性不足、训练数据存在偏差以及实验验证率较低仍是主要挑战 | 分析人工智能驱动蛋白质设计的计算方法、基准指标及机器学习与实验管线的整合 | 蛋白质序列、结构和功能关系，以及相关计算工具和模型 | 机器学习 | NA | 深度学习, 蛋白质语言模型, 知识图谱, AlphaFold2, Transformer | 深度学习模型, 蛋白质语言模型, Transformer | 蛋白质序列数据, 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 110 | 2026-06-03 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 探究普城沙雷氏菌胞外聚合物在浮游和生物膜系统中对铜离子吸附的关键作用 | 首次揭示普城沙雷氏菌As3-5a(5)菌株中紧密结合型胞外聚合物的蛋白组分对铜离子高效吸附的贡献，并定量比较浮游细胞与生物膜系统的吸附效率 | 未通过合成生物学方法优化铜离子固定能力，且系统在真实工业废水条件下的技术成熟度尚需提升 | 阐明细菌胞外聚合物在铜离子生物吸附中的核心机制并开发工业废水处理应用 | 普城沙雷氏菌As3-5a(5)菌株的浮游细胞和生物膜系统 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附 | NA | 浓度数据 | 铜离子初始浓度3.14 mM（实验室体系）和40 mM（电镀废水） | NA | 普城沙雷氏菌 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 111 | 2026-06-03 |
Engineering Trichoderma-mediated plant defense against bacterial phytopathogens: Micro-and nanobiotechnological strategies
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026002
PMID:41938783
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综述 | 该文章综述了利用木霉介导的植物防御对抗细菌性植物病原体的微生物与纳米生物技术策略 | 将纳米技术与CRISPR基因编辑和合成生物学相结合，构建木霉作为下一代精准作物保护平台 | 田间转化、生物安全性和监管方面仍存在挑战 | 综述木霉在防控细菌性植物病害中的微生物与纳米生物技术策略 | 木霉属真菌及细菌性植物病原体（如XXX、XXX等） | NA | 细菌性植物病害 | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米技术、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 木霉 | 工程化生物防治菌株 | 农业 |
| 112 | 2026-06-03 |
Engineering the holobiont: Synthetic biology strategies for reversing bioenergetic collapse in radiation enteritis
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026003
PMID:41938784
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略工程化肠道微生物组，以逆转放射场肠炎中生物能量崩溃的方法 | 提出从经验性益生菌补充转向理性微生物组工程，包括热力学工程、遗传驯化和布尔逻辑门生物计算机设计，以解决当前治疗的局限性 | 目前仍处于概念性路线图阶段，缺乏大规模人体临床验证和安全性评估的具体数据 | 通过合成生物学方法重建肠道稳态，实现放射场肠炎的治疗并改善癌症长期生存率 | 肠道微生物组，特别是工程化共生菌和宿主-微生物互作网络 | 合成生物学 | 放射场肠炎 | 合成生物学，基因编辑，微生物工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程化共生菌（如大肠杆菌），肠道微生物组 | 布尔逻辑门，热力学工程，遗传驯化（如磺酸酶删除），生物计算机，STALEMATE生物防护系统 | 医学，肿瘤放疗 |
| 113 | 2026-06-02 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-01-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
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综述 | 综述了液-液相分离驱动生物分子凝聚体形成的分子机制、设计策略及其在合成生物学中的转化前景 | 将液-液相分离原理从细胞组织引申至合成平台，系统归纳了利用内在无序蛋白、模块化互作基序和RNA支架设计功能性凝聚体的策略 | 未涉及合成凝聚体在体内复杂环境中的长期稳定性及潜在脱靶效应 | 总结液-液相分离介导的凝聚体分子机制与工程设计方法，促进细胞生物物理学与生物工程的交叉研究 | 液-液相分离形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 合成凝聚体（用于增强催化、代谢控制、靶向药物递送和生物传感） | 医学, 工业生物技术 |
| 114 | 2026-06-02 |
Chemically synthesized high-fidelity oligos ≤ 600 nt as building blocks to accelerate complex gene construction in synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag005
PMID:42222009
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研究论文 | 报道一种名为UCOS的新型平台，用于高效合成长度≤600个核苷酸、具有复杂重复序列和碱基分布不均特征的高保真寡核苷酸 | 采用非多孔硅微球替代传统可控孔玻璃作为固相载体，结合5'侧翼序列杂交的全长富集和错误去除酶，显著提升复杂超长寡核苷酸的合成保真度 | NA | 开发能够高效合成复杂、超长DNA片段的方法，以支持合成生物学和基因工程应用 | 超长复杂寡核苷酸（≤600 nt），包括串联重复序列和碱基分布不均的序列 | 合成生物学 | NA | UCOS（超长复杂寡核苷酸合成） | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、合成基因组学 |
| 115 | 2026-06-01 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 介绍了DNA-Diffusion，一种基于生成式人工智能的框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用机器学习基于多种细胞系的DNA可及性数据生成200碱基对的合成调控元件，重构内源转录因子结合语法，并增强细胞类型特异性 | 未提及在体内长期稳定性或脱靶效应的评估 | 开发生成式AI方法以设计用于精确基因表达控制的调控元件 | 合成调控元件及其在不同细胞系中的功能验证 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式人工智能框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件的STARR-seq文库，在三种细胞系中验证 | NA | 人类细胞系 | 合成调控元件 | 医学, 基因治疗 |
| 116 | 2026-05-29 |
High-Throughput Stationary 13C-Based Metabolic Flux Analysis of Pichia pastoris Strains
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4779-0_9
PMID:41028460
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研究论文 | 描述了一种利用高通量培养平台对毕赤酵母菌株进行静态碳代谢流分析的方法 | 提出高通量平台用于大规模工程菌株的代谢流特征分析，加速菌株工程循环 | NA | 实现高通量的13C代谢流分析，以表征工程菌株的细胞内代谢反应速率 | 毕赤酵母（Komagataella phaffii）菌株 | 代谢工程 | NA | 13C代谢流分析 | NA | 代谢通量数据 | 一组工程菌株 | NA | 毕赤酵母（Komagataella phaffii） | NA | 工业生物技术 |
| 117 | 2026-05-27 |
New frontiers and applications of cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.002
PMID:41581983
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综述 | 该文章概述了无细胞系统及其在合成生物学中的应用 | 强调了无细胞系统在消除细胞膜屏障、实现高通量蛋白质合成、非规范氨基酸掺入、生物传感、药物发现和代谢工程中的创新应用 | 未明确提及局限性 | 突出无细胞系统的基础及其在生物技术和工业中的快速、适应性解决方案 | 无细胞系统及其应用案例 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | 原核生物、真核生物 | NA | 生物技术, 生物医学, 环境可持续性 |
| 118 | 2026-05-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
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综述 | 全面概述基于无细胞系统的低成本诊断技术的原理、设计方法和突破 | 系统性地总结了无细胞诊断平台在资源贫乏环境中的应用，包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物和PURE系统，并融合合成生物学基因回路、CRISPR-Cas工具和RNA适体以提高诊断灵敏度和特异性 | 试剂稳定性、可扩展性和监管问题仍是主要挑战 | 阐明无细胞系统在低成本诊断中的潜力，推动即时诊断和全球健康改善 | 基于无细胞表达的诊断平台 | 数字病理学 | 未提及 | 无细胞表达，CRISPR-Cas，RNA适体 | 未提及 | 未提及 | 未提及 | CRISPR-Cas | 大肠杆菌，小麦，纯化系统 | 基因回路，生物传感器 | 医学 |
| 119 | 2026-05-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
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研究论文 | 提供无细胞蛋白合成系统的制备方案，包括细胞提取物制备、反应优化及蛋白质表征方法 | 详细阐述了从宿主菌选择、机械裂解到能量离子平衡优化的完整流程，并整合了常见瓶颈的解决方案，为无细胞系统在合成生物学和诊断领域的应用提供了可复现的标准化方法 | 未涉及大规模生产中的成本控制问题，且对复杂蛋白质（如膜蛋白）的合成效率优化讨论有限 | 建立高效制备无细胞蛋白合成系统的标准化协议，并展望其与机器学习结合的未来应用 | 无细胞蛋白合成系统（细胞提取物、反应体系优化及蛋白质功能分析） | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | 实验数据（蛋白质表达与功能分析） | NA | NA | 大肠杆菌 | 无细胞表达反应体系（代谢通路） | 合成生物学，诊断，生物制造，食品，医疗 |
| 120 | 2026-05-27 |
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.010
PMID:41581989
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综述 | 综述无细胞系统在合成生物学中的应用和进展 | 强调了无细胞系统在快速原型构建、与人工智能和微流控技术集成以及实现去中心化、可编程生物技术方面的范式转变 | 仍面临试剂成本高、批次差异大和可扩展性有限等挑战 | 系统阐述无细胞系统在合成生物学中的变革性作用及其未来发展方向 | 无细胞系统技术及其应用场景 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | 无细胞系统, PURE系统 | NA | 基因回路, 代谢途径, 生物传感器 | 医学, 环境, 工业生物技术 |