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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-03-15 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的致癌机制,并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合新兴诊断生物标志物(如病毒microRNAs)与下一代治疗策略(包括基因编辑和合成生物学方法),强调精准医学在改善疾病检测、治疗特异性和患者预后方面的机遇 | 当前KS诊断主要依赖组织病理学和LANA免疫染色,这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要限制,且KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗,临床结果仍不理想 | 理解KSHV驱动的致癌机制,并为未来诊断和治疗创新提供关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)及其相关的癌症,如卡波西肉瘤(KS)、原发性渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心性Castleman病(MCD) | NA | 卡波西肉瘤 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 122 | 2026-03-11 |
Cytochrome P450 gene family: cross-pathway functional conservation, novel catalytic reactions, and synthetic biology-driven applications in plant secondary metabolism
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1765290
PMID:41799975
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综述 | 本文综述了细胞色素P450(CYPs)基因家族在植物次级代谢中的功能保守性、新型催化反应以及合成生物学驱动的应用 | 提出了结合CYP酶工程与代谢途径优化的综合策略,并展望了合成生物学与机器学习等新兴技术如何推动CYP功能表征与规模化生产 | CYP的精确催化机制和调控网络仍未被充分解析,当前功能表征存在局限 | 总结CYP家族在植物次级代谢中的作用,探讨其应用潜力与未来研究方向 | 植物细胞色素P450(CYPs)基因家族及其催化的次级代谢产物(萜类、生物碱、黄酮类等) | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢途径优化、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径优化 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 123 | 2026-03-11 |
Muribaculum intestinale in brain-gut axis regulation: promises and limitations for therapeutic applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1723051
PMID:41800404
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综述 | 系统综述了肠道微生物Muribaculum intestinale在肠脑轴调控中的作用机制及其与多种疾病的关联 | 首次系统总结了Muribaculum intestinale作为肠道微生物新成员在肠脑轴调控中的独特生物学特性及潜在治疗价值 | 临床转化仍面临技术瓶颈和个体差异等挑战 | 探讨Muribaculum intestinale在肠脑轴调控中的作用及治疗应用前景 | Muribaculum intestinale微生物及其代谢产物 | NA | 神经退行性疾病, 精神疾病, 代谢疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学修饰 | 小鼠, 人类 | NA | 医学 |
| 124 | 2026-03-09 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2026, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
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综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略,包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助,旨在优化SELEX方法 | 通过整合理性库设计、新颖筛选意识和先进筛选设备,显著减少筛选轮数至<8轮,部分方法实现单轮筛选,整体时间缩短至<3周,同时提升适配体性能 | NA | 优化适配体筛选方法,提高SELEX效率,以应对初始库盲目、过程耗时和适配体性能不足等挑战 | 适配体(短单链核酸)及其筛选方法SELEX | 合成生物学 | NA | SELEX(配体指数富集系统进化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器、疾病治疗、合成生物学 |
| 125 | 2026-03-08 |
PIONEER: A periplasmic display platform for synthetic biology-based screening of genetically encoded protein regulators
2026-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
|
研究论文 | 本文介绍了PIONEER平台,一种用于合成生物学中遗传编码蛋白调节剂筛选的酵母周质展示系统 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现稳定配体保留和稳健自分泌信号,首次实现基于信号而非仅结合的功能优先筛选 | 尽管已应用于G蛋白偶联受体,但平台可适应更广泛的膜蛋白和可溶性蛋白靶标,具体扩展性未在文中详细验证 | 开发一个模块化平台,用于筛选和研究遗传编码的蛋白调节剂,以直接探究膜蛋白功能 | 肽、蛋白质和纳米抗体,针对人类G蛋白偶联受体等膜蛋白 | 合成生物学 | NA | 酵母周质展示技术 | NA | 遗传序列和蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 自分泌信号系统,用于配体活性和纳米抗体调节剂分类 | 医学, 工业生物技术 |
| 126 | 2026-03-03 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将小鼠H3K9甲基转移酶和HP1引入酿酒酵母,探究H3K9甲基化及其阅读器分子HP1对转录和染色质压缩的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基转移酶和HP1,以简化系统研究其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行,可能不适用于其他生物或染色质区域;H3K9甲基化和HP1单独不足以改变高阶染色质结构 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的重要性及其对转录和染色质结构的影响 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 引入小鼠H3K9甲基转移酶和HP1以模拟异染色质表观基因组系统 | 基础生物学研究 |
| 127 | 2026-03-03 |
Imagining an ethics for synthetic biology
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1746379
PMID:41767306
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2026-03-01 |
Exploring structural, functional, evolutionary, and genetic characteristics of sugar transporters in maize and their roles in abiotic stress tolerance
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342990
PMID:41746965
|
研究论文 | 本文通过生物信息学分析鉴定了玉米中的60个糖转运蛋白,并研究了它们在非生物胁迫耐受性中的潜在作用 | 首次在玉米中系统鉴定和表征糖转运蛋白家族,并通过干湿实验结合的方法揭示了它们在非生物胁迫响应中的调控机制 | 研究主要基于生物信息学预测和初步实验验证,需要进一步的体内功能验证来确认转运蛋白的具体作用机制 | 探索玉米糖转运蛋白的结构、功能和进化特征,及其在非生物胁迫耐受性中的作用 | 玉米糖转运蛋白家族 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq, qRT-PCR, 系统发育分析, 共表达分析, 分子对接 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质序列数据 | 60个玉米糖转运蛋白 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 129 | 2026-02-25 |
Genetic make-up and regulation of the L-lysine biosynthesis pathway in Vibrio natriegens
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.02.867
PMID:41732680
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研究论文 | 本研究分析了Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径的组成与调控,为将其开发为氨基酸过量生产菌株提供基础 | 发现了一种新的单功能天冬氨酸激酶同工酶Vn.LysC2,该酶对所有L-天冬氨酸家族氨基酸的变构抑制不敏感,并鉴定了L-天冬氨酸半醛脱氢酶和二氢二吡啶酸合酶的功能重复基因 | NA | 分析Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关氨基酸生物合成途径的遗传组成与调控机制,以支持未来的代谢工程应用 | Vibrio natriegens DSM759菌株及其L-赖氨酸和L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | RNA测序、基因删除突变体生长表型分析、酶活性测定 | NA | 基因组测序数据、转录组数据 | NA | NA | Vibrio natriegens | L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 130 | 2026-02-24 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
|
研究论文 | 本研究在嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae中建立了高通量核基因组工程框架,并验证了基因组位置对转基因表达效率无显著影响 | 首次通过实验验证了C. merolae中40个基因间位点作为中性整合位点,并建立了机器人辅助的高通量转化方法 | 研究仅针对C. merolae这一特定藻类物种,结论在其他生物中的普适性尚未验证 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响,建立合成生物学底盘生物的基因组工程平台 | 嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人技术、异源蛋白和代谢产物检测 | NA | 基因组数据、蛋白质表达数据、代谢产物数据 | 40个基因间位点(覆盖16条染色体),验证了38个位点 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae(嗜热嗜酸红藻) | 异源异戊二烯合酶表达系统 | 工业生物技术 |
| 131 | 2026-02-23 |
Bio-Oil from Phototrophic Microorganisms: Innovative Technologies and Strategies
2026-Jan-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010011
PMID:41718349
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综述 | 本文综述了利用光养微生物生产生物油的技术与策略,重点讨论了热化学转化技术和生物优化方法的进展 | 强调将先进热化学转化技术与定向生物优化策略有效结合,是实现光养微生物规模化生产生物油的最有前景途径 | NA | 探讨利用光养微生物生产液体生物燃料的可行技术与策略,以支持低碳能源系统转型 | 光养微生物(特别是微藻)及其生物油生产 | NA | NA | 水热液化、快速热解、催化提质(加氢脱氧等)、菌株优化、胁迫诱导、共培养、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 光养微生物(微藻) | NA | 能源 |
| 132 | 2026-02-21 |
Editorial: Advancing plant defense: genome editing, RNAi, and synthetic biology for sustainable pest control
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1785705
PMID:41717108
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2026-02-20 |
Integrated omics analysis of the cellulose co-degradation network of Chaetomium thermophilum
2026-Jan-24, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02741-x
PMID:41580774
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研究论文 | 本研究通过整合组学分析揭示了嗜热毛壳菌纤维素共降解网络的协同机制,包括核心转录因子调控、酶分泌级联模式及糖酸代谢网络的作用 | 首次在嗜热真菌中发现CtClr-2作为核心转录因子驱动LPMOs、CDH和CBH等关键基因共表达,并揭示氧化酶与水解酶的三阶段级联分泌模式使还原糖产量提升60.6% | 研究聚焦于单一嗜热真菌物种,其机制在其他工业相关真菌中的普适性仍需验证;合成生物学工程改造仅停留在理论建议阶段 | 解析嗜热真菌高效降解纤维素的系统机制,为生物燃料工业化生产提供菌株改造靶点 | 嗜热毛壳菌(Chaetomium thermophilum)的纤维素降解网络 | 合成生物学 | NA | 整合组学分析(包括转录组、蛋白质组) | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学 | 嗜热毛壳菌 | 纤维素降解网络(包含转录调控模块、酶分泌级联模块、糖酸代谢模块) | 能源 |
| 134 | 2026-02-19 |
T cell immunotherapy for solid tumors: limitations, progress, and future prospects
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755751
PMID:41694348
|
综述 | 本文全面综述了针对实体瘤的T细胞免疫疗法的现状、挑战与未来前景 | 系统梳理了CAR-T、TCR-T和TIL疗法在实体瘤中的最新进展,并重点讨论了克服抗原异质性、肿瘤微环境抑制等障碍的新兴策略 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据或临床结果,主要基于现有文献进行分析 | 总结T细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的进展、挑战及未来发展方向 | 针对实体瘤的T细胞免疫疗法,包括CAR-T细胞、TCR-T细胞和肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 实体瘤 | 合成生物学工具、基因编辑技术、多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 嵌合抗原受体、T细胞受体工程 | 医学 |
| 135 | 2026-02-19 |
Elucidation of the pramanicin biosynthetic pathway reveals a DUF2306 family membrane protein involved in terminal epoxidation
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1765828
PMID:41695960
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研究论文 | 本研究阐明了真菌代谢产物pramanicin的生物合成途径,并首次揭示了DUF2306家族膜蛋白在终端环氧化反应中的功能 | 首次鉴定了pramanicin的生物合成基因簇,并发现DUF2306家族膜蛋白PraC在天然产物生物合成中的环氧化功能 | NA | 解析pramanicin的生物合成途径 | 真菌代谢产物pramanicin及其生物合成基因 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组合表达、饲喂实验 | NA | NA | NA | 异源表达 | 真菌、Aspergillus nidulans | pramanicin生物合成途径(包含PKS-NRPS杂合酶、单加氧酶、短链脱氢酶/还原酶及膜蛋白环氧化酶) | 医药 |
| 136 | 2026-02-19 |
KmPred: prediction of Michaelis constants (Km) using an integrative machine learning framework
2026, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2026.1711471
PMID:41696044
|
研究论文 | 本文提出了一个名为KmPred的集成机器学习框架,用于预测酶动力学参数米氏常数(Km) | 整合了最先进语言模型的蛋白质序列嵌入与底物SMILES描述的分子描述符,构建了多模态特征融合的预测框架 | NA | 开发一个计算预测方法,以替代传统耗时费力的体外实验测定酶动力学参数 | 酶-底物相互作用的米氏常数(Km) | 机器学习 | NA | 机器学习 | LSTM, Transformer, XGBoost | 蛋白质序列, 化学描述符 | MPEK数据集和Kroll等人组装的独立数据集 | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药物发现 |
| 137 | 2026-02-19 |
Tripterygium glycosides: recent advances in mechanisms, therapeutic applications, and safety optimization
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1728162
PMID:41704700
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综述 | 本文综述了雷公藤多苷在药理机制、临床应用及安全性优化方面的最新进展 | 强调了通过单体分离、结构优化、前药策略和创新递送系统来克服雷公藤多苷治疗窗口窄的问题,并介绍了新兴衍生物如LLDT-8和雷公藤内酯的减毒增效特性 | NA | 总结雷公藤多苷的药理机制、治疗应用及安全性优化策略 | 雷公藤多苷及其衍生物 | NA | 系统性红斑狼疮、糖尿病肾病、类风湿关节炎、银屑病 | 系统药理学、合成生物学、AI辅助药物设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 138 | 2026-02-17 |
Mining the Hidden Pharmacopeia: Fungal Endophytes, Natural Products, and the Rise of AI-Driven Drug Discovery
2026-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031365
PMID:41683797
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综述 | 本文综述了真菌内生菌天然产物的化学与生物合成多样性,并探讨了人工智能如何将天然产物发现从经验筛选转变为具有直接工业应用价值的预测性学科 | 将真菌内生菌这一进化优化的天然产物宝库与人工智能、机器学习及多组学整合技术相结合,实现了对隐蔽生物合成基因簇的预测、激活及从头设计,推动了药物发现向预测性、工程化方向转型 | NA | 探讨人工智能如何加速真菌内生菌天然产物的发现、设计与工业化应用,以应对生物医学和可持续性挑战 | 真菌内生菌产生的天然产物(如聚酮、生物碱、萜类、肽类)及其生物合成基因簇 | 机器学习 | NA | 多组学整合、基因组挖掘、代谢组学注释 | 深度学习、生成式AI、扩散模型 | 基因组数据、代谢组数据、生物合成基因簇数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 139 | 2026-02-17 |
Phage Therapy in Plant Disease Management: 110 Years of History, Current Challenges, and Future Trends
2026-Jan-24, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15030368
PMID:41681534
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综述 | 本文回顾了噬菌体疗法在植物病害管理中110年的发展历史,分析了当前面临的挑战,并探讨了未来的发展趋势 | 全面梳理了噬菌体疗法在植物病害管理领域的完整历史脉络,并前瞻性地讨论了合成生物学、先进递送系统与人工智能等前沿技术的整合潜力 | NA | 回顾噬菌体疗法在植物病害管理领域的发展历程,并展望其未来趋势 | 噬菌体及其在植物病害管理中的应用 | NA | 植物病害 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 140 | 2026-02-16 |
Membrane and proteome allocation constraints in Escherichia coli models during overflow metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
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研究论文 | 本研究开发了膜相关约束通量平衡分析模型,以探究大肠杆菌在溢流代谢中膜资源分配的关键作用 | 引入了可调节的膜蛋白质量约束,首次在基因组尺度模型中整合膜分配限制,提高了溢流代谢预测的准确性 | 模型可能未涵盖所有膜相关生物物理因素,且主要基于大肠杆菌,在其他微生物中的普适性有待验证 | 探究膜资源分配如何与整体蛋白质组限制共同调控细菌生理和溢流代谢 | 大肠杆菌的代谢策略和膜蛋白表达 | 代谢工程 | NA | 通量平衡分析 | MAFBA | 基因组尺度代谢模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |