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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-01-25 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
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研究论文 | 本文提出了一种利用工程化乳酸杆菌表达肿瘤杀伤细胞因子(如IL-12、IL-15和TRAIL)的新型生物治疗方法,旨在克服系统性细胞因子疗法的毒性问题 | 将免疫疗法与微生物组工程相结合,开发出局部作用、低毒性的工程化益生菌作为抗肿瘤生物治疗剂 | 研究目前主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发一种新型的低毒性抗肿瘤生物治疗方法 | 工程化乳酸杆菌及其表达的肿瘤杀伤细胞因子 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具(诱导型启动子、生物安全杀死开关) | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | 细胞因子表达系统(IL-12、IL-15、TRAIL表达通路) | 医学 |
| 122 | 2026-01-25 |
Structure of Chlamydomonas reinhardtii LciA guided the engineering of FNT family proteins to gain bicarbonate transport activity
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02200-9
PMID:41507353
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研究论文 | 本研究解析了莱茵衣藻LciA蛋白的结构,并基于结构指导成功改造了FNT家族蛋白,使其获得碳酸氢盐转运活性 | 首次报道了莱茵衣藻LciA的冷冻电镜结构,揭示了碳酸氢盐选择性的分子机制,并成功通过定点突变将细菌FNT家族亚硝酸盐通道改造为碳酸氢盐通道 | NA | 增强光合作用效率,为将CO2浓缩机制引入C3作物提供分子工具 | 莱茵衣藻LciA蛋白、细菌FNT家族蛋白NirC、莱茵衣藻亚硝酸盐通道NAR1.1/NAR1.5 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、定点突变、生长测定 | NA | 结构数据、功能数据 | NA | 定点突变 | 莱茵衣藻、细菌 | 碳酸氢盐转运通道 | 农业 |
| 123 | 2026-01-24 |
Microbial and molecular approaches for PFAS transformation in soils: prospects and limitations
2026-Jan-16, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d5ra07508d
PMID:41561006
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综述 | 本文综述了微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的潜力与限制 | 评估了微生物介导的PFAS转化、多组学研究提出的酶候选机制,以及分子工程和合成生物学的前景 | 尚无实验验证的酶能高效催化全氟C-F键断裂,转化多涉及前体化合物而非终端PFAS,环境因素、慢动力学和机制不确定性限制实际应用 | 探讨微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的科学发展和应用前景 | 全氟和多氟烷基物质(PFAS)及其在土壤中的转化 | 环境生物技术 | NA | 多组学、计算建模、分子工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 124 | 2026-01-23 |
Advancing cellulose degradation through synthetic biology: engineered pathways and microbial systems for sustainable biomass conversion
2026-Jan-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01328-0
PMID:41555463
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综述 | 本文综述了合成生物学在改善纤维素降解方面的最新进展,并强调了这些工具如何优化可持续农业和工业应用中的纤维利用 | 结合人工智能,合成生物学实现了微生物菌株的预测筛选和精准工程,以高效降解纤维素 | NA | 克服纤维素降解中的关键技术障碍,以支持循环生物经济原则 | 纤维素,作为植物纤维的主要成分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法,包括工程基因、合成调节因子和优化酶的引入 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物系统 | 多酶复合物的理性重新设计,以改善纤维素酶的分泌和催化效率 | 农业, 工业生物技术 |
| 125 | 2026-01-23 |
Recoded Bacteriophage Genome for Bio-Orthogonal-Enabled Concentration and Detection of E. coli in Drinking Water
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00665
PMID:41436063
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研究论文 | 本研究通过高复杂度Golden Gate组装技术重新编码噬菌体基因组,开发了一种基于噬菌体的生物传感器,用于饮用水中大肠杆菌的浓缩和检测 | 利用HC-GGA技术直接合成噬菌体基因组,实现快速、准确、灵活的基因组修饰,并通过生物正交反应结合磁性纳米颗粒,显著提高检测效率和灵敏度 | NA | 开发一种基于合成生物学的噬菌体工程方法,以应对饮用水中有害病原体和指示性非致病菌的检测挑战 | 大肠杆菌作为饮用水中的指示生物 | 合成生物学 | NA | 高复杂度Golden Gate组装技术 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 生物传感器设计,通过基因组重编码实现炔烃修饰非经典氨基酸的掺入,并与叠氮化物共轭磁性纳米颗粒进行生物正交环加成反应 | 环境监测, 公共卫生 |
| 126 | 2026-01-23 |
Artificial Multidomain Ribosomally Synthesized and Post-translationally Modified Peptide Enzymes for Farnesylated Peptide Library Generation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00613
PMID:41451912
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研究论文 | 本文开发了一种人工多结构域核糖体合成和翻译后修饰肽酶系统,用于生成法尼基化肽库 | 设计了一种简单而稳健的方法,通过融合多个生物合成基因到一个高表达、可溶的构建体中,实现了大环肽的生产和酪氨酸侧链上C、C或C类异戊二烯的选择性修饰 | NA | 开发合成生物学方法以创建具有药物特性的肽基化学库 | 蓝细菌素生物合成途径及其酶 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)途径 | NA | NA | 估计最大规模为260万肽衍生物的库 | Gibson Assembly, BioBrick | 活体生物(未具体指定) | 多结构域酶融合构建体,用于大环化和异戊二烯化 | 药物发现 |
| 127 | 2026-01-22 |
High-throughput mechanical characterization of giant unilamellar vesicles by real-time deformability cytometry
2026-Jan-21, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01140j
PMID:41416886
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研究论文 | 本研究将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的高通量力学表征,并开发了基于模拟的模型和拟合策略来提取囊泡的面积膨胀模量 | 首次将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的力学表征,开发了两种互补的拟合策略和一种组合拟合方法,实现了无接触、高通量的囊泡群体力学分析 | NA | 开发一种高通量、无接触的方法来表征巨单层囊泡的力学性质 | 巨单层囊泡 | 软物质研究 | NA | 实时变形流式细胞术、相场模拟 | 基于模拟的力学模型 | 变形数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质研究 |
| 128 | 2026-01-22 |
From edits to insights: precision microbial engineering for systems biology
2026-Jan-19, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102705
PMID:41558158
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综述 | 本文综述了精准微生物工程在系统生物学中的应用,重点探讨了从基因编辑到系统洞察的技术进展 | 强调了精准扰动策略(如序列变异分析)在揭示基因水平扰动无法触及的生物学原理方面的创新,包括蛋白质序列-功能图谱和途径变异影响 | NA | 通过精准工程方法提升对生物功能的理解,并加速生物技术和合成生物学的进展 | 微生物系统,包括其基因组和细胞机制 | 系统生物学 | NA | 基因敲除文库、CRISPRi/a文库、精准扰动策略 | NA | 基因组序列数据、变异数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物(如细菌、酵母) | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 129 | 2026-01-22 |
InSillyClo, a User-Friendly Web Application to Assist Large-Scale Golden Gate Cloning and MoClo Workflows
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00553
PMID:41404662
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研究论文 | 本文介绍了InSillyClo,一个开源网络应用程序,用于辅助大规模Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | InSillyClo是首个专门处理大规模克隆工作流程中耗时且易错任务的软件工具,提供用户友好的界面和自动化数据生成 | NA | 开发一个工具来简化和自动化大规模克隆工作流程中的计算任务 | Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆,Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 支持用户定义的遗传设计和工作流程生成 | 工业生物技术 |
| 130 | 2026-01-22 |
Force Transmission by Minimal Focal Adhesion Complexes Induces Synthetic Cell Deformation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00645
PMID:41407554
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研究论文 | 本研究通过重构最小黏着斑样复合物于巨型单层囊泡中,揭示了仅由特定蛋白质-膜相互作用即可实现肌动蛋白募集、力传递及结构稳定性,为探究机械传感和工程化力响应仿生系统提供了可控合成生物学平台 | 首次在合成系统中重构了包含kindlin-2、talin-1等核心蛋白的最小黏着斑复合物,并展示了其能独立介导肌动蛋白网络形成、力传递及囊泡变形,无需完整细胞环境 | 研究基于简化合成系统,可能未完全模拟天然细胞中黏着斑的复杂调控机制和动态相互作用 | 探究黏着斑复合物进行力传递和机械传感的最小物理要求 | 由kindlin-2、talin-1、FAK、paxillin、zyxin和VASP等蛋白质与含PIP和整合素β1尾的膜组成的合成黏着斑样复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重构与膜锚定技术 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | 巨型单层囊泡(GUVs) | 黏着斑样复合物作为力传感与传递模块,结合肌动蛋白网络和非肌肉肌球蛋白IIa形成收缩系统 | 医学、工业生物技术 |
| 131 | 2026-01-22 |
Synthetic Biology Strategies for Activating Cryptic BGCs in Streptomyces: Engineering Native and Synthetic Promoters for Antibiotic Discovery
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c08473
PMID:41552574
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综述 | 本文综述了在链霉菌中利用天然和合成启动子工程激活隐性生物合成基因簇以发现新型抗生素的策略 | 系统整合了CRISPR激活系统和机器学习引导的启动子设计等前沿技术,用于激活隐性基因簇 | NA | 为天然产物发现提供启动子工具的系统级理解和转化应用指南 | 链霉菌中的隐性生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、CRISPR激活系统、机器学习引导设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 启动子重构(组成型和诱导型)用于激活隐性生物合成基因簇 | 医药 |
| 132 | 2026-01-22 |
CRISPR/Cas9-Mediated Metabolic Engineering of Endophytic Pseudomonas loganensis sp. nov. for the Production of Nutritionally Valuable Carotenoids
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05877
PMID:41552580
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9技术对内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov.进行代谢工程改造,以生产具有营养价值的类胡萝卜素 | 首次将内生细菌作为微生物底盘用于类胡萝卜素生产,并利用CRISPR-Cas9技术敲除关键基因构建了能生产多种类胡萝卜素的工程菌株 | 未提及大规模发酵的可行性及生产成本评估 | 开发可持续且环境友好的类胡萝卜素生物生产方法 | 内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov. | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、HPLC分析、响应面方法学 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas loganensis sp. nov. | 代谢途径工程(敲除类胡萝卜素合成关键基因,引入过表达质粒) | 食品、饲料、制药、化妆品 |
| 133 | 2026-01-22 |
Yohimban acetylation in Rauvolfia is mediated by a leaf-specific acetyltransferase in reserpine biosynthetic gene cluster
2026-Jan, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110714
PMID:41289712
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研究论文 | 本研究在萝芙木中鉴定并表征了育亨宾O-乙酰转移酶(YAT),揭示了其在育亨宾生物碱代谢中的关键作用及叶特异性表达模式 | 首次在利血平生物合成基因簇中发现并表征了叶特异性乙酰转移酶YAT,阐明了育亨宾乙酰化的酶学基础及其在生物碱多样性演化中的意义 | 研究主要基于Rauvolfia serpentina,未在其他物种中广泛验证;对YAT的调控机制和进化路径的探索仍有限 | 解析萝芙木中单萜吲哚生物碱(MIAs)的生物合成途径,特别是育亨宾乙酰化的酶学机制与进化动态 | 萝芙木(Rauvolfia serpentina)中的育亨宾O-乙酰转移酶(YAT)及其在育亨宾和别育亨宾乙酰化中的作用 | 合成生物学 | NA | 同源建模、底物对接实验、基因表达分析 | NA | 基因序列、酶活性数据、表达模式数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 134 | 2026-01-22 |
Cell-free immuno-profiling on a genetically programmed biochip
2026-Jan, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-02058-0
PMID:41372446
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研究论文 | 本研究开发了一种基于无细胞合成生物学的微流控生物芯片平台,用于定量分析抗体与抗原的相互作用,实现快速免疫分析 | 扩展了先前开发的微流控生物芯片平台,通过局部基因刷在图案化隔室中创建连续抗原密度梯度,实现单次芯片上同时合成多种抗原并生成多个抗体结合曲线 | 未明确说明样本处理的通量限制或芯片的可扩展性 | 开发一种无需蛋白纯化步骤的快速定量方法,用于分析复杂蛋白质相互作用,特别是针对人类免疫分析和新兴病原体应对 | SARS-CoV-2抗原、单克隆抗体、多克隆抗体、人类血清样本、人类ACE2受体 | 合成生物学 | COVID-19 | 无细胞合成生物学、光刻图案化、微流控技术 | NA | 蛋白质相互作用数据 | 1微升人类血清(未明确总样本数) | 基因刷、光刻图案化 | 无细胞系统 | 抗原梯度生成系统、受体-配体相互作用重建系统 | 医学 |
| 135 | 2026-01-22 |
Deciphering the molecular roles of antimicrobial peptides in plant innate immunity and their potential applications in crop protection
2026-Jan, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110961
PMID:41422562
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综述 | 本文综述了植物抗菌肽在先天免疫中的作用及其在作物保护中的潜在应用 | 整合多组学技术与合成生物学,加速了抗菌肽的理性设计及其在农业中的生态友好型应用 | 存在病原体快速进化抗性、目标特异性不足、田间条件下肽不稳定性、潜在植物毒性以及复杂监管审批路径等挑战 | 探讨植物抗菌肽的分子角色及其在可持续作物保护中的应用潜力 | 植物抗菌肽及其在先天免疫系统中的作用 | NA | NA | 多组学技术(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)与合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 136 | 2026-01-21 |
CRISPR-Based Approaches to Engineer Nonmodel Bacteria for Bioproduction and Biotherapeutics
2026-Jan-20, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.5c00613
PMID:41488985
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综述 | 本文综述了基于CRISPR-Cas系统在非模式细菌工程化中的应用,以开发生物生产和生物治疗产品 | 强调利用CRISPR效应蛋白相对独立于宿主辅助因子的特性,克服物种特异性障碍,实现对难以工程化的非模式微生物(如C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌和肠道共生菌)的精确基因操作,从而拓展其独特的代谢和生物合成潜力 | 文中提及当前工具在非模式微生物中的应用仍存在局限性,但未具体说明是哪些技术或生物学障碍 | 探讨如何利用CRISPR-Cas系统扩展微生物工程的范围,以开发可持续生物制造、天然产物发现和下一代活体生物治疗剂 | 非模式细菌,特别是C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌和肠道共生菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非模式细菌,包括C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌、肠道共生菌 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 137 | 2026-01-21 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
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研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析由两性霉素B与麦角固醇相互作用引起的纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C的效果 | 首次开发了通过浓度依赖性释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂活性的分析系统,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 分析脂质体膜上纳米孔形成的特性,并开发用于筛选膜活性化合物的实用系统 | 脂质体膜上的纳米孔形成,涉及两性霉素B、麦角固醇和shodoamide C的相互作用 | NA | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像数据 | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 138 | 2026-01-21 |
Extended Dissipative Analysis for Uncertain Delayed Genetic Regulatory Networks via Interval Type-2 T-S Fuzzy Framework
2026-Jan-19, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2026.3652172
PMID:41553905
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研究论文 | 本研究在区间二型T-S模糊框架下,对不确定时滞基因调控网络进行扩展耗散性分析 | 首次利用区间二型模糊集捕捉基因调控网络的复杂动态和参数不确定性,并通过构建新型Lyapunov-Krasovskii泛函获得最大允许时滞界限的显式推导 | NA | 为基因调控网络开发鲁棒控制策略的理论理解和实际设计 | 不确定时滞基因调控网络 | 机器学习 | NA | 区间二型T-S模糊框架,Lyapunov-Krasovskii泛函方法 | T-S模糊模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 139 | 2026-01-21 |
Electrochemical techniques in protein engineering: Innovations in redox-active protein design and electron transfer mechanisms
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149750
PMID:41418956
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综述 | 本文综述了电化学技术在蛋白质工程中的应用,特别是在设计氧化还原活性蛋白和探究电子转移机制方面的创新 | 综述了人工智能与计算建模在识别增强电子转移效率的突变中的应用,以及合成生物学构建人工电子传递途径和纳米结构材料改善蛋白质固定化与电荷传导的最新进展 | 蛋白质稳定性、隧穿效应的精确控制以及有效的电子集成等挑战仍需解决 | 探讨电化学技术如何支持工程化氧化还原蛋白的设计与功能优化,并推动其在生物电子系统中的应用 | 氧化还原活性蛋白及其工程化设计 | 蛋白质工程 | NA | 电化学技术(阻抗谱、循环伏安法、计时电流法、扫描电化学显微镜) | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 人工电子传递途径 | 生物传感、生物电催化、生物电子学、医疗保健监测 |
| 140 | 2026-01-20 |
Bibliometric-Based Analysis of Global Trends and Collaborative Networks in Plant Genetic Engineering (1994-2024)
2026-Jan-19, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70550
PMID:41553078
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综述 | 本研究对1994年至2024年全球植物基因工程领域的文献进行了文献计量分析,以揭示其发展趋势、国际合作网络和技术演进 | 通过文献计量学方法系统揭示了全球植物基因工程研究的双核合作结构(中国和美国),并识别了技术生命周期的三个阶段及未来技术轨迹 | NA | 系统考察全球植物基因工程的发展趋势、合作网络和技术演进 | 全球植物基因工程领域的科学文献 | NA | NA | Agrobacterium介导的转化、RNA干扰(RNAi)、CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 烟草植物 | NA | 农业 |