合成生物学相关文章
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当前共找到 249 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-01-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
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综述 | 本章节全面概述了无细胞系统作为低成本诊断平台的基本原理、设计方法、技术突破及其在即时诊断中的应用 | 系统性地整合了无细胞诊断平台的生化基础、合成生物学工具（如基因电路、CRISPR-Cas、RNA适配体）以及新兴技术（纸基检测、微流控/可穿戴生物传感器），并探讨了AI辅助系统设计等前沿趋势 | 作为综述章节，未提供原始实验数据，且重点讨论技术原理与应用前景，对具体实施细节和商业化路径的覆盖可能有限 | 总结无细胞系统在低成本诊断领域的发展现状、技术原理与应用潜力，旨在推动该技术在医疗资源匮乏地区的普及 | 无细胞诊断系统（包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物、PURE系统等平台）及其在即时诊断中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统、CRISPR-Cas工具、RNA适配体技术、纸基检测、微流控生物传感、可穿戴生物传感 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 基因电路 | 大肠杆菌, 小麦胚芽 | 用于提高诊断灵敏度与特异性的基因电路 | 医学 |
| 142 | 2026-01-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
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研究论文 | 本文提供了无细胞蛋白质合成（CFPS）系统的完整制备协议，包括高活性细胞提取物的制备、蛋白质表达反应系统的优化以及蛋白质表达与功能的评估方法 | 详细介绍了宿主菌株选择、机械裂解、提取物澄清以及能量与离子平衡优化的逐步协议，并探讨了将机器学习与冻干格式CFPS结合的未来集成流程 | 协议可能面临mRNA降解、蛋白质错误折叠和污染等常见瓶颈，导致产量损失 | 开发高效的无细胞蛋白质合成系统，用于快速、模块化的蛋白质生产 | 无细胞蛋白质合成系统的制备与优化 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成（CFPS）、SDS-PAGE、Western印迹分析、荧光检测 | NA | 实验协议 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、诊断领域、按需生物制造、食品、医疗保健、工业 |
| 143 | 2026-01-27 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
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综述 | 本文综述了无细胞转录翻译系统的发展历程、优势、应用及面临的挑战与未来方向 | 系统总结了无细胞转录翻译系统从E. coli提取物到多物种提取物的演变，并强调了其在合成蛋白质方面的快速、高效和化学耐受性优势 | 高成本、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定性 | 探讨无细胞转录翻译系统在分子生物学、合成生物学和生物技术中的应用潜力与改进方向 | 无细胞转录翻译系统及其在蛋白质合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | NA | E. coli, 细菌, 酵母, 真核生物 | NA | 生物技术, 生物制药 |
| 144 | 2026-01-27 |
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.009
PMID:41581993
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综述 | 本章探讨了人工智能与无细胞系统的整合，重点关注其在合成生物学中的最新进展、工业应用及未来方向 | 利用人工智能（包括机器学习、深度学习和生成模型）优化无细胞系统，实现了抗菌肽的发现和蛋白质产量的显著提升 | 面临数据需求、模型可转移性和可扩展性等挑战 | 优化无细胞系统以加速生物过程测试和反应条件控制 | 无细胞系统中的蛋白质合成、代谢和反应条件 | 合成生物学 | NA | 细胞游离蛋白质合成 | 机器学习、深度学习、生成模型、贝叶斯优化、神经网络 | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 生物制造、制药、诊断 |
| 145 | 2026-01-27 |
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.010
PMID:41581989
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综述 | 本文综述了无细胞系统在合成生物学中的发展、优势、应用及挑战 | 阐述了无细胞系统如何通过消除细胞膜限制，实现对生化条件的空前控制，并加速设计-构建-测试周期，代表了向去中心化、可编程生物技术的范式转变 | 面临试剂成本高、批次间差异和规模化等挑战 | 探讨无细胞系统作为合成生物学变革性工具的原理、进展与应用前景 | 无细胞系统及其相关技术与平台 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统，PURE系统，冻干技术，可编程生物合成平台 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | NA | 遗传电路，代谢途径，生物传感器 | 医学，环境，工业生物技术 |
| 146 | 2026-01-26 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-Jan-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
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研究论文 | 本文报道了一种中性双组分系统，首次在生理pH下实现了cAMP和AMP跨脂质体膜的促进运输 | 首次展示了使用中性双组分系统促进cAMP和AMP跨膜运输，通过合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物配对提高运输效率 | NA | 研究核苷酸跨膜运输机制，探索小分子系统在药物递送和合成生物学中的应用潜力 | cAMP和AMP核苷酸 | 合成生物学 | NA | 脂质体荧光实验、P NMR实验 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 合成生物学 |
| 147 | 2026-01-26 |
Engineering bacteriophages for gut health: precision antimicrobials and beyond
2026-Jan-22, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04038-5
PMID:41566387
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道健康中的应用，涵盖合成生物学和纳米技术进展，并探讨其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的治疗潜力 | 利用合成生物学和纳米技术重新设计噬菌体，增强其特异性、功能性和稳定性，作为微生物群中心疗法的多功能工具 | 面临长期稳定性、耐药性发展和规模化生产等挑战 | 探讨工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道疾病治疗中的应用，以应对微生物失调、抗生素耐药性和宿主-微生物相互作用破坏 | 工程化噬菌体及其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病、结直肠癌、感染性肠炎 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 148 | 2026-01-26 |
YhfH functions as a tri-function RNA in Bacillus thuringiensis BMB171
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1528
PMID:41562254
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研究论文 | 本研究揭示了枯草芽孢杆菌BMB171菌株中的YhfH RNA具有三重功能：作为小RNA调控嘧啶生物合成、作为反义RNA调控LipR表达、以及作为mRNA编码抑制自身转录的肽YhfH-P | 首次发现单个RNA分子（YhfH）同时具备小RNA、反义RNA和mRNA三重调控功能，并阐明其通过编码肽YhfH-P实现自我反馈抑制的新机制 | 研究局限于枯草芽孢杆菌BMB171菌株，尚未在其他细菌中验证YhfH功能的保守性；YhfH-P抑制ilv-leu操纵子的具体结构机制有待进一步解析 | 探究枯草芽孢杆菌中YhfH RNA的多重调控功能及其分子机制 | 枯草芽孢杆菌BMB171菌株的YhfH RNA及其编码肽YhfH-P | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 三重功能RNA调控网络（包含自我抑制反馈环路、代谢途径交叉调控） | 合成生物学 |
| 149 | 2026-01-26 |
Contrasting genome composition and codon usage in Listeria monocytogenes temperate versus virulent phages
2026, Virus evolution
IF:5.5Q1
DOI:10.1093/ve/veaf100
PMID:41573078
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研究论文 | 本研究比较了单核细胞增生李斯特菌温和噬菌体与烈性噬菌体的基因组组成和密码子使用模式 | 首次系统比较了单核细胞增生李斯特菌中温和与烈性噬菌体的基因组大小、基因长度及密码子使用偏好的差异，揭示了噬菌体生活方式对密码子使用的塑造作用 | 研究仅针对单核细胞增生李斯特菌噬菌体，结论在其他细菌噬菌体中的普适性有待验证 | 探究噬菌体生活方式（温和型 vs 烈性）对基因组结构和密码子使用模式的影响 | 单核细胞增生李斯特菌的温和噬菌体（686个）和烈性噬菌体（1516个）的编码序列 | 微生物基因组学 | NA | 基因组比较分析、密码子适应指数计算 | NA | 基因组序列数据 | 2202个噬菌体编码序列（686个温和型 + 1516个烈性型） | NA | 单核细胞增生李斯特菌 | NA | 生物技术、合成生物学、治疗应用、生物防治 |
| 150 | 2026-01-25 |
ACCU-RATES: A web tool for accurate enzyme kinetics and initial reaction rate measurements
2026-Jan-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169654
PMID:41577122
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研究论文 | 开发了一个名为ACCU-RATES的网络工具，用于精确分析酶动力学数据和测定初始反应速率 | 采用微分形式的米氏方程对反应进程曲线进行数值拟合，无需依赖线性反应阶段，在数据噪声和低采样率条件下仍能提供可靠参数估计 | 需要至少两个时间点的产物积累或底物消耗曲线数据 | 开发精确测定酶初始反应速率和动力学参数的工具 | 酶反应进程曲线 | 生物信息学 | NA | 数值拟合方法 | 微分形式的米氏方程 | 酶反应动力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,医学（抑制剂发现和生物标志物检测） |
| 151 | 2026-01-25 |
The Importance of Being Imperfect: Structure and Function of Bacterial Amyloid
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517090
PMID:41347620
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综述 | 本文综述了细菌功能性淀粉样蛋白（FuBAs）的结构、组装和功能，强调其作为进化中间体和生物材料工程平台的潜力 | 通过冷冻电镜和计算研究揭示了FuBAs（如CsgA和FapC）的β-螺旋折叠结构，由不完美重复序列稳定，具有高稳定性和低多态性，并展示了其内在催化活性和分层机械性能 | NA | 探讨细菌功能性淀粉样蛋白的结构与功能关系及其在生物材料和合成生物学中的应用 | 细菌功能性淀粉样蛋白，特别是大肠杆菌的curli（CsgA）和假单胞菌的FapC | NA | NA | 冷冻电镜（cryo-EM）、整合计算研究 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌（Escherichia coli）、假单胞菌（Pseudomonas） | NA | 生物材料工程、合成生物学、催化、生物膜控制 |
| 152 | 2026-01-25 |
Engineered food-borne probiotics delivering checkpoint-inhibitor modulators
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004399
PMID:41497008
|
研究论文 | 本文探讨了工程化食源性益生菌作为递送检查点抑制剂调节剂的新型策略，结合合成生物学、营养学和癌症免疫疗法 | 开发了工程化食源性益生菌，通过分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2等分子，在临床前模型中显示出显著的抗肿瘤效果，并首次在非小细胞肺癌的I期试验中验证了其安全性和有效性 | 存在定植和生物安全性方面的挑战 | 研究工程化食源性益生菌作为低毒性免疫治疗平台的潜力 | 工程化食源性益生菌、检查点抑制剂调节剂、癌症免疫疗法 | 合成生物学 | 肺癌 | 工程化益生菌、可控基因电路 | NA | 临床前模型数据、临床荟萃分析、I期试验数据 | 临床前小鼠模型、非小细胞肺癌I期试验患者 | 可控基因电路 | 食源性益生菌 | 分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2的生物传感器或递送系统 | 医学 |
| 153 | 2026-01-25 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
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研究论文 | 本文提出了一种利用工程化乳酸杆菌表达肿瘤杀伤细胞因子（如IL-12、IL-15和TRAIL）的新型生物治疗方法，旨在克服系统性细胞因子疗法的毒性问题 | 将免疫疗法与微生物组工程相结合，开发出局部作用、低毒性的工程化益生菌作为抗肿瘤生物治疗剂 | 研究目前主要基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发一种新型的低毒性抗肿瘤生物治疗方法 | 工程化乳酸杆菌及其表达的肿瘤杀伤细胞因子 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具（诱导型启动子、生物安全杀死开关） | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | 细胞因子表达系统（IL-12、IL-15、TRAIL表达通路） | 医学 |
| 154 | 2026-01-25 |
Structure of Chlamydomonas reinhardtii LciA guided the engineering of FNT family proteins to gain bicarbonate transport activity
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02200-9
PMID:41507353
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研究论文 | 本研究解析了莱茵衣藻LciA蛋白的结构，并基于结构指导成功改造了FNT家族蛋白，使其获得碳酸氢盐转运活性 | 首次报道了莱茵衣藻LciA的冷冻电镜结构，揭示了碳酸氢盐选择性的分子机制，并成功通过定点突变将细菌FNT家族亚硝酸盐通道改造为碳酸氢盐通道 | NA | 增强光合作用效率，为将CO2浓缩机制引入C3作物提供分子工具 | 莱茵衣藻LciA蛋白、细菌FNT家族蛋白NirC、莱茵衣藻亚硝酸盐通道NAR1.1/NAR1.5 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、定点突变、生长测定 | NA | 结构数据、功能数据 | NA | 定点突变 | 莱茵衣藻、细菌 | 碳酸氢盐转运通道 | 农业 |
| 155 | 2026-01-24 |
Microbial and molecular approaches for PFAS transformation in soils: prospects and limitations
2026-Jan-16, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d5ra07508d
PMID:41561006
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综述 | 本文综述了微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的潜力与限制 | 评估了微生物介导的PFAS转化、多组学研究提出的酶候选机制，以及分子工程和合成生物学的前景 | 尚无实验验证的酶能高效催化全氟C-F键断裂，转化多涉及前体化合物而非终端PFAS，环境因素、慢动力学和机制不确定性限制实际应用 | 探讨微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的科学发展和应用前景 | 全氟和多氟烷基物质（PFAS）及其在土壤中的转化 | 环境生物技术 | NA | 多组学、计算建模、分子工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 156 | 2026-01-23 |
Advancing cellulose degradation through synthetic biology: engineered pathways and microbial systems for sustainable biomass conversion
2026-Jan-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01328-0
PMID:41555463
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综述 | 本文综述了合成生物学在改善纤维素降解方面的最新进展，并强调了这些工具如何优化可持续农业和工业应用中的纤维利用 | 结合人工智能，合成生物学实现了微生物菌株的预测筛选和精准工程，以高效降解纤维素 | NA | 克服纤维素降解中的关键技术障碍，以支持循环生物经济原则 | 纤维素，作为植物纤维的主要成分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，包括工程基因、合成调节因子和优化酶的引入 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物系统 | 多酶复合物的理性重新设计，以改善纤维素酶的分泌和催化效率 | 农业, 工业生物技术 |
| 157 | 2026-01-23 |
Recoded Bacteriophage Genome for Bio-Orthogonal-Enabled Concentration and Detection of E. coli in Drinking Water
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00665
PMID:41436063
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研究论文 | 本研究通过高复杂度Golden Gate组装技术重新编码噬菌体基因组，开发了一种基于噬菌体的生物传感器，用于饮用水中大肠杆菌的浓缩和检测 | 利用HC-GGA技术直接合成噬菌体基因组，实现快速、准确、灵活的基因组修饰，并通过生物正交反应结合磁性纳米颗粒，显著提高检测效率和灵敏度 | NA | 开发一种基于合成生物学的噬菌体工程方法，以应对饮用水中有害病原体和指示性非致病菌的检测挑战 | 大肠杆菌作为饮用水中的指示生物 | 合成生物学 | NA | 高复杂度Golden Gate组装技术 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 生物传感器设计，通过基因组重编码实现炔烃修饰非经典氨基酸的掺入，并与叠氮化物共轭磁性纳米颗粒进行生物正交环加成反应 | 环境监测, 公共卫生 |
| 158 | 2026-01-23 |
Artificial Multidomain Ribosomally Synthesized and Post-translationally Modified Peptide Enzymes for Farnesylated Peptide Library Generation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00613
PMID:41451912
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研究论文 | 本文开发了一种人工多结构域核糖体合成和翻译后修饰肽酶系统，用于生成法尼基化肽库 | 设计了一种简单而稳健的方法，通过融合多个生物合成基因到一个高表达、可溶的构建体中，实现了大环肽的生产和酪氨酸侧链上C、C或C类异戊二烯的选择性修饰 | NA | 开发合成生物学方法以创建具有药物特性的肽基化学库 | 蓝细菌素生物合成途径及其酶 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成和翻译后修饰肽（RiPP）途径 | NA | NA | 估计最大规模为260万肽衍生物的库 | Gibson Assembly, BioBrick | 活体生物（未具体指定） | 多结构域酶融合构建体，用于大环化和异戊二烯化 | 药物发现 |
| 159 | 2026-01-22 |
High-throughput mechanical characterization of giant unilamellar vesicles by real-time deformability cytometry
2026-Jan-21, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01140j
PMID:41416886
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研究论文 | 本研究将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的高通量力学表征，并开发了基于模拟的模型和拟合策略来提取囊泡的面积膨胀模量 | 首次将实时变形流式细胞术应用于巨单层囊泡的力学表征，开发了两种互补的拟合策略和一种组合拟合方法，实现了无接触、高通量的囊泡群体力学分析 | NA | 开发一种高通量、无接触的方法来表征巨单层囊泡的力学性质 | 巨单层囊泡 | 软物质研究 | NA | 实时变形流式细胞术、相场模拟 | 基于模拟的力学模型 | 变形数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质研究 |
| 160 | 2026-01-22 |
From edits to insights: precision microbial engineering for systems biology
2026-Jan-19, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102705
PMID:41558158
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综述 | 本文综述了精准微生物工程在系统生物学中的应用，重点探讨了从基因编辑到系统洞察的技术进展 | 强调了精准扰动策略（如序列变异分析）在揭示基因水平扰动无法触及的生物学原理方面的创新，包括蛋白质序列-功能图谱和途径变异影响 | NA | 通过精准工程方法提升对生物功能的理解，并加速生物技术和合成生物学的进展 | 微生物系统，包括其基因组和细胞机制 | 系统生物学 | NA | 基因敲除文库、CRISPRi/a文库、精准扰动策略 | NA | 基因组序列数据、变异数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物（如细菌、酵母） | NA | 生物技术、合成生物学 |