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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-03-24 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2026-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
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综述 | 本文综述了抗体-药物偶联物(ADCs)的当前成就与未解决问题,并强调了基于全基因编码蛋白质构建体的创新方向,特别是双功能嵌合蛋白,为下一代蛋白质治疗药物奠定基础 | 强调双功能嵌合蛋白作为ADCs的替代方案,结合支架靶向域和肽衍生细胞毒性模块,具有高选择性、紧凑结构、低免疫原性和细菌表达兼容性,并利用合成生物学、展示系统和机器学习加速优化 | NA | 探索超越ADCs的可编程治疗蛋白质,以解决其成本高、生产系统依赖、分子异质性、系统毒性和治疗窗口窄等局限性 | 抗体-药物偶联物(ADCs)及其替代方案,特别是双功能嵌合蛋白质构建体 | 个性化医疗 | 肿瘤学 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 162 | 2026-03-22 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了配体响应的液-液相分离凝聚物,用于基因调控和转录放大 | 创新点包括利用内源性信号分子(如激素和药物)构建化学诱导二聚化系统,以及设计配体控制的液-液相分离凝聚物以实现可调谐的转录控制,实现高达数百倍的激活效果 | NA | 研究目的是开发与内源性生理信号整合的合成生物学工具,用于基因调控和转录控制 | 研究对象包括核受体(如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)的配体结合域、TIF2共激活因子肽,以及相关的激素和药物配体 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化、液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 双输入转录开关、配体响应的液-液相分离凝聚物 | 医学、基因电路、生物传感、治疗学 |
| 163 | 2026-03-22 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了口腔链球菌中的一种三重酶复合物,该复合物通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变,从原始的HMG-CoA合成功能进化获得Friedel-Crafts C-酰化新功能的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特殊功能,阐明酶功能多样化的进化机制 | 口腔链球菌来源的三重酶复合物(SmaATase),包含HMGS、ACAT和DUF35蛋白 | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌(Streptococcus macacae) | NA | 合成生物学(为C-C键形成催化剂工程提供模板) |
| 164 | 2026-03-20 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jan, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
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综述 | 本文全面综述了细菌来源的胞外保护剂Ectoine作为后生元疗法的机制、应用及未来发展方向 | 系统阐述了Ectoine在神经退行性疾病、自身免疫病和代谢综合征等新治疗领域的潜力,并探讨了纳米载体、水凝胶等先进递送系统与植物化学物的协同增效策略 | Ectoine在真核细胞中生物利用度低、工业化生产可扩展性受限、合成生物学方法成本高昂 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂的潜力,探索其在多种疾病治疗中的应用前景 | Ectoine(一种细菌来源的胞外保护化合物) | NA | 鼻窦炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫病、代谢综合征 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 165 | 2026-03-19 |
Decoding signaling architectures: CAR versus TCR dynamics in solid tumor immunotherapy
2026-01-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025190
PMID:41132090
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综述 | 本文比较了T细胞受体(TCR)和嵌合抗原受体(CAR)在信号传导架构上的差异,并总结了针对实体瘤免疫治疗中CAR-T细胞功能提升的最新策略 | 系统性地解码了CAR与TCR在信号动力学上的差异,并强调了通过工程化优化CAR设计、增强免疫突触形成、调整ITAM数量/强度以及整合新型共刺激域等突破性策略,以缩小实体瘤与血液肿瘤疗效差距 | NA | 旨在改善CAR-T细胞在实体瘤免疫治疗中的疗效,通过理解信号传导机制并开发创新策略来克服现有障碍 | T细胞受体(TCR)、嵌合抗原受体(CAR)及其在实体瘤免疫治疗中的应用 | 免疫学 | 实体瘤 | 合成生物学工具、表观遗传重编程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 可调/逻辑门控的CAR激活 | 医学 |
| 166 | 2026-03-19 |
The Role of Bacterial Outer Membrane Vesicles in Tumor Development: Facts, Potential Applications and Future Perspectives
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S582600
PMID:41847176
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综述 | 本文综述了细菌外膜囊泡在肿瘤发展中的作用,包括其促进或抑制肿瘤的机制,以及作为工程化纳米疫苗和免疫治疗剂的转化潜力 | 系统性地将OMVs的作用与癌症的14个标志对齐,并探讨了其作为可编程纳米平台的工程化应用前景 | NA | 探讨细菌外膜囊泡在肿瘤生物学中的角色及其在癌症预防、诊断和治疗中的潜在应用 | 细菌外膜囊泡及其在肿瘤发展中的机制 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌 | 可编程囊泡设计 | 医学 |
| 167 | 2026-03-18 |
Molecular adaptations and engineering of extremophiles for synthetic biology and biotechnological applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1754802
PMID:41834871
|
综述 | 本文综述了极端微生物的分子适应机制及其在合成生物学和生物技术应用中的工程化研究 | 整合了系统发育学、比较基因组学以及CRISPR/Cas基因组编辑、基因组尺度代谢模型等前沿技术,探讨了极端微生物在可持续工业生物技术和气候变化缓解中的潜力 | NA | 探讨极端微生物的适应机制,并研究如何通过工程化手段将其特性应用于合成生物学和生物技术 | 极端微生物(包括古菌、细菌和真核生物)及其酶(极端酶) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑,基因组尺度代谢模型,比较基因组学 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜温生物 | NA | 工业生物技术,环境 |
| 168 | 2026-03-18 |
A protein-fragment complementation assay to quantify synthetic protein scaffold efficiency
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag003
PMID:41836103
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研究论文 | 本研究开发了一种基于二氢叶酸还原酶蛋白质片段互补分析(DHFR PCA)的方法,用于量化合成蛋白质支架在酵母中的效率 | 首次将DHFR PCA应用于酵母中蛋白质支架效率的定量研究,并识别了影响支架效率的关键因素,如PBD-肽相互作用强度和结合可用性 | 研究主要聚焦于酵母模型,可能不直接适用于其他生物系统,且支架表征依赖于生长速率耦合,可能受其他因素影响 | 探索和量化合成蛋白质支架在酵母中的效率,以优化支架设计工具 | 肽结合域(PBD)和肽的相互作用、支架架构和表达水平 | 合成生物学 | NA | 蛋白质片段互补分析(DHFR PCA) | NA | 生长速率数据 | NA | 蛋白质支架设计 | 酵母 | 蛋白质支架,用于诱导酶的空间接近性 | 工业生物技术 |
| 169 | 2026-03-15 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的致癌机制,并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合新兴诊断生物标志物(如病毒microRNAs)与下一代治疗策略(包括基因编辑和合成生物学方法),强调精准医学在改善疾病检测、治疗特异性和患者预后方面的机遇 | 当前KS诊断主要依赖组织病理学和LANA免疫染色,这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要限制,且KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗,临床结果仍不理想 | 理解KSHV驱动的致癌机制,并为未来诊断和治疗创新提供关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)及其相关的癌症,如卡波西肉瘤(KS)、原发性渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心性Castleman病(MCD) | NA | 卡波西肉瘤 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 170 | 2026-03-11 |
Cytochrome P450 gene family: cross-pathway functional conservation, novel catalytic reactions, and synthetic biology-driven applications in plant secondary metabolism
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1765290
PMID:41799975
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综述 | 本文综述了细胞色素P450(CYPs)基因家族在植物次级代谢中的功能保守性、新型催化反应以及合成生物学驱动的应用 | 提出了结合CYP酶工程与代谢途径优化的综合策略,并展望了合成生物学与机器学习等新兴技术如何推动CYP功能表征与规模化生产 | CYP的精确催化机制和调控网络仍未被充分解析,当前功能表征存在局限 | 总结CYP家族在植物次级代谢中的作用,探讨其应用潜力与未来研究方向 | 植物细胞色素P450(CYPs)基因家族及其催化的次级代谢产物(萜类、生物碱、黄酮类等) | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢途径优化、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径优化 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 171 | 2026-03-11 |
Muribaculum intestinale in brain-gut axis regulation: promises and limitations for therapeutic applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1723051
PMID:41800404
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综述 | 系统综述了肠道微生物Muribaculum intestinale在肠脑轴调控中的作用机制及其与多种疾病的关联 | 首次系统总结了Muribaculum intestinale作为肠道微生物新成员在肠脑轴调控中的独特生物学特性及潜在治疗价值 | 临床转化仍面临技术瓶颈和个体差异等挑战 | 探讨Muribaculum intestinale在肠脑轴调控中的作用及治疗应用前景 | Muribaculum intestinale微生物及其代谢产物 | NA | 神经退行性疾病, 精神疾病, 代谢疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学修饰 | 小鼠, 人类 | NA | 医学 |
| 172 | 2026-03-09 |
Strategies for Improving Aptamer Screening Efficiency: Library Design, Awareness Innovation, and Instrument Assistance
2026, Critical reviews in analytical chemistry
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/10408347.2024.2411244
PMID:39378058
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综述 | 本文综述了提高适配体筛选效率的策略,包括库设计、筛选意识创新和仪器辅助,旨在优化SELEX方法 | 通过整合理性库设计、新颖筛选意识和先进筛选设备,显著减少筛选轮数至<8轮,部分方法实现单轮筛选,整体时间缩短至<3周,同时提升适配体性能 | NA | 优化适配体筛选方法,提高SELEX效率,以应对初始库盲目、过程耗时和适配体性能不足等挑战 | 适配体(短单链核酸)及其筛选方法SELEX | 合成生物学 | NA | SELEX(配体指数富集系统进化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器、疾病治疗、合成生物学 |
| 173 | 2026-03-08 |
PIONEER: A periplasmic display platform for synthetic biology-based screening of genetically encoded protein regulators
2026-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
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研究论文 | 本文介绍了PIONEER平台,一种用于合成生物学中遗传编码蛋白调节剂筛选的酵母周质展示系统 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现稳定配体保留和稳健自分泌信号,首次实现基于信号而非仅结合的功能优先筛选 | 尽管已应用于G蛋白偶联受体,但平台可适应更广泛的膜蛋白和可溶性蛋白靶标,具体扩展性未在文中详细验证 | 开发一个模块化平台,用于筛选和研究遗传编码的蛋白调节剂,以直接探究膜蛋白功能 | 肽、蛋白质和纳米抗体,针对人类G蛋白偶联受体等膜蛋白 | 合成生物学 | NA | 酵母周质展示技术 | NA | 遗传序列和蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 自分泌信号系统,用于配体活性和纳米抗体调节剂分类 | 医学, 工业生物技术 |
| 174 | 2026-03-03 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将小鼠H3K9甲基转移酶和HP1引入酿酒酵母,探究H3K9甲基化及其阅读器分子HP1对转录和染色质压缩的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基转移酶和HP1,以简化系统研究其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行,可能不适用于其他生物或染色质区域;H3K9甲基化和HP1单独不足以改变高阶染色质结构 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的重要性及其对转录和染色质结构的影响 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 引入小鼠H3K9甲基转移酶和HP1以模拟异染色质表观基因组系统 | 基础生物学研究 |
| 175 | 2026-03-03 |
Imagining an ethics for synthetic biology
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1746379
PMID:41767306
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2026-03-01 |
Exploring structural, functional, evolutionary, and genetic characteristics of sugar transporters in maize and their roles in abiotic stress tolerance
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342990
PMID:41746965
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析鉴定了玉米中的60个糖转运蛋白,并研究了它们在非生物胁迫耐受性中的潜在作用 | 首次在玉米中系统鉴定和表征糖转运蛋白家族,并通过干湿实验结合的方法揭示了它们在非生物胁迫响应中的调控机制 | 研究主要基于生物信息学预测和初步实验验证,需要进一步的体内功能验证来确认转运蛋白的具体作用机制 | 探索玉米糖转运蛋白的结构、功能和进化特征,及其在非生物胁迫耐受性中的作用 | 玉米糖转运蛋白家族 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq, qRT-PCR, 系统发育分析, 共表达分析, 分子对接 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质序列数据 | 60个玉米糖转运蛋白 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 177 | 2026-02-25 |
Genetic make-up and regulation of the L-lysine biosynthesis pathway in Vibrio natriegens
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.02.867
PMID:41732680
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研究论文 | 本研究分析了Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径的组成与调控,为将其开发为氨基酸过量生产菌株提供基础 | 发现了一种新的单功能天冬氨酸激酶同工酶Vn.LysC2,该酶对所有L-天冬氨酸家族氨基酸的变构抑制不敏感,并鉴定了L-天冬氨酸半醛脱氢酶和二氢二吡啶酸合酶的功能重复基因 | NA | 分析Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关氨基酸生物合成途径的遗传组成与调控机制,以支持未来的代谢工程应用 | Vibrio natriegens DSM759菌株及其L-赖氨酸和L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | RNA测序、基因删除突变体生长表型分析、酶活性测定 | NA | 基因组测序数据、转录组数据 | NA | NA | Vibrio natriegens | L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 178 | 2026-02-24 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
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研究论文 | 本研究在嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae中建立了高通量核基因组工程框架,并验证了基因组位置对转基因表达效率无显著影响 | 首次通过实验验证了C. merolae中40个基因间位点作为中性整合位点,并建立了机器人辅助的高通量转化方法 | 研究仅针对C. merolae这一特定藻类物种,结论在其他生物中的普适性尚未验证 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响,建立合成生物学底盘生物的基因组工程平台 | 嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人技术、异源蛋白和代谢产物检测 | NA | 基因组数据、蛋白质表达数据、代谢产物数据 | 40个基因间位点(覆盖16条染色体),验证了38个位点 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae(嗜热嗜酸红藻) | 异源异戊二烯合酶表达系统 | 工业生物技术 |
| 179 | 2026-02-23 |
Bio-Oil from Phototrophic Microorganisms: Innovative Technologies and Strategies
2026-Jan-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010011
PMID:41718349
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综述 | 本文综述了利用光养微生物生产生物油的技术与策略,重点讨论了热化学转化技术和生物优化方法的进展 | 强调将先进热化学转化技术与定向生物优化策略有效结合,是实现光养微生物规模化生产生物油的最有前景途径 | NA | 探讨利用光养微生物生产液体生物燃料的可行技术与策略,以支持低碳能源系统转型 | 光养微生物(特别是微藻)及其生物油生产 | NA | NA | 水热液化、快速热解、催化提质(加氢脱氧等)、菌株优化、胁迫诱导、共培养、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 光养微生物(微藻) | NA | 能源 |
| 180 | 2026-02-21 |
Editorial: Advancing plant defense: genome editing, RNAi, and synthetic biology for sustainable pest control
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1785705
PMID:41717108
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |