本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-01-11 |
Model acetogens as chassis for CO2-driven bioproduction
2026-Jan-08, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103423
PMID:41512746
|
综述 | 本文综述了模型产乙酸菌在厌氧CO2转化中的核心作用,探讨其代谢能力、菌株开发及新兴生物工艺策略,以释放其在低碳生物制造中的潜力 | 强调模型产乙酸菌作为微生物细胞工厂,通过Wood-Ljungdahl途径高效固定CO2,并结合代谢工程和合成生物学扩展生产谱,推动可持续气体发酵 | 与合成气应用相比,纯CO2生物转化在能量上更具挑战性,需在菌株开发、生物工艺优化和可再生能源整合方面创新解决方案 | 探索产乙酸菌作为微生物细胞工厂,通过气体发酵实现可持续生物生产,特别是CO2驱动的低碳生物制造 | 模型产乙酸菌及其代谢途径、生物工艺和工程应用 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、气体发酵 | NA | NA | NA | NA | 产乙酸菌 | Wood-Ljungdahl途径(乙酰辅酶A合成途径),耦合氢或一氧化碳氧化至CO2固定 | 工业生物技术、能源、环境 |
| 162 | 2026-01-11 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Jan-08, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
|
综述 | 本文综述了如何利用合成生物学、基因组学、人工智能和化学等跨学科前沿技术,通过工程化优化生物质来革新可持续生物能源生产,并以自发光植物为例进行了深入案例分析 | 提出了通过整合组学、工程学和农艺学的跨学科方法来解决复杂生物工程问题,并展望了生成式人工智能将推动从特定领域研究向多学科融合整体模型的范式转变 | NA | 探讨如何克服传统生物质转化在效率、成本和多功能性方面的限制,推动可持续生物能源制造 | 能源作物、生物质、自发光植物(特别是利用真菌生物发光途径的植物) | NA | NA | 基因组编辑、人工智能、组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 真菌生物发光途径(FBP),用于将光合作用能量直接转化为可持续可见光的生物传感器/发光途径 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 163 | 2026-01-11 |
Trends in sustainable single-cell protein from non-grain feedstocks
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.018
PMID:40467368
|
综述 | 本文综述了利用非谷物原料通过微生物发酵生产可持续单细胞蛋白(SCP)的趋势、挑战与前景 | 重点探讨了合成生物学在拓展非谷物原料(超越传统甲醇等一碳原料至CO₂)多样性、多功能应用及混合生物系统整合方面的突破 | 当前SCP规模化面临菌株鲁棒性有限、基因组编辑精度不足、低密度非谷物原料物流挑战及电化学能源载体安全风险等制约 | 探索可持续蛋白质生产的替代方案,以应对全球粮食需求增长和环境危机 | 非谷物原料(如CO₂)及通过微生物发酵生产的单细胞蛋白(SCP) | 工业生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 食品、农业、能源、环境 |
| 164 | 2026-01-11 |
Harnessing biotechnology for bee pollinator health
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.027
PMID:40545407
|
综述 | 本文探讨了利用生物技术保护蜜蜂健康、应对多种压力因素的创新解决方案 | 结合人工智能引导的组学工具、分子生物处理及合成生物学,为蜜蜂健康提供精准、非化学的干预措施 | NA | 通过生物技术创新保护蜜蜂种群,确保全球粮食安全和生物多样性 | 蜜蜂及其种群健康 | NA | NA | 组学工具、分子生物处理、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 工程化肠道微生物组、传粉者友好作物、人工饲料 | 农业、环境 |
| 165 | 2026-01-11 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2026-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
|
研究论文 | 本文介绍了一种完全基于蛋白质的三维微打印机器人结构的构建方法,该结构由最小化的肌动球蛋白皮层涂层驱动 | 首次实现了完全由蛋白质材料构建并驱动的三维机器人结构,通过肌动球蛋白皮层实现自主驱动 | 实验过程耗时较长(需15天完成),且需要用户在生物材料领域具备专业知识 | 将生物分子活动组装并放大至人造设备中以执行工作,推动合成生物学在机器人技术中的应用 | 基于蛋白质的三维微打印机器人结构 | 合成生物学 | NA | 三维微打印技术、肌动球蛋白涂层组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 机器人技术、合成细胞组装、智能三维微芯片 |
| 166 | 2026-01-11 |
Exploring Fecal Microbiota Transplantation: Potential Benefits, Associated Risks, and Challenges in Cancer Treatment
2026-Jan, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70455
PMID:41496455
|
综述 | 本文综述了粪菌移植在癌症治疗中的潜在益处、相关风险与挑战 | 系统总结了粪菌移植在肿瘤学中的最新证据,并探讨了精准微生物联合体、合成生物学等新兴创新技术以解决现有局限 | 标准化不足、监管框架不完善、机制理解不充分,以及病原体传播、免疫失调等风险限制了其临床转化 | 评估粪菌移植在调节肠道微生物组及改善癌症治疗效果中的作用与前景 | 粪菌移植在肿瘤治疗中的应用 | NA | 癌症 | 粪菌移植 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 167 | 2026-01-11 |
A reversible genetic NOR gate in plants using translational repression
2026-Jan, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.004
PMID:41058342
|
研究论文 | 本文介绍了一种在烟草植物中实现的可逆遗传NOR逻辑门电路,利用Cas6翻译抑制系统,以雌二醇和乙醇为输入,GFP表达为输出 | 采用Cas6翻译抑制系统实现可逆遗传逻辑电路,设计方法类似电子电路中的PMOS传输门逻辑,简化了复杂逻辑电路的设计 | NA | 开发一种在植物中实现可逆遗传逻辑电路的方法,降低合成生物学应用门槛 | 烟草植物 | 合成生物学 | NA | Cas6翻译抑制系统 | 数学建模 | 实验数据 | NA | Cas6 | 烟草植物 | 布尔NOR逻辑门,使用雌二醇和乙醇作为输入,GFP表达作为输出 | 农业 |
| 168 | 2026-01-10 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
|
研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶,能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸,并展示了其在体外转录中的生物技术应用 | 开发了一种通用多磷酸激酶,突破了现有PPKs底物谱受限的限制,实现了对多种核苷酸的同时高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用潜力 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 169 | 2026-01-10 |
Advances in natural product discovery: strategies, technologies, and insights
2026-Jan-07, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-025-00556-1
PMID:41495363
|
综述 | 本文综述了天然产物发现领域的最新进展,包括策略、技术和见解 | 整合了生物信息学、化学信息学、先进分析方法、合成生物学工具包和优化的微生物培养等突破性技术,克服了20世纪90年代和2000年代的研究瓶颈 | 讨论了当前理性天然产物发现的局限性 | 提供天然产物发现的更新、简明路线图 | 天然产物及其类似物 | NA | 代谢紊乱、癌症耐药性、传染病 | 生物信息学、化学信息学、先进分析方法、合成生物学工具包、高通量去重复工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具包 | 微生物 | 生物合成基因簇的精确调控和优化 | 医药 |
| 170 | 2026-01-10 |
A synthetic biology roadmap for sustainable production of the plant-originated anti-cancer drug paclitaxel
2026-Jan-07, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.013
PMID:41506928
|
综述 | 本文综述了合成生物学在可持续生产植物源抗癌药物紫杉醇方面的路线图,探讨了当前面临的挑战和未来策略 | 提出了利用非经典底盘(如植物相关蓝细菌和丝状真菌)增强P450相容性,并整合无细胞系统、合成微生物群落、混合化学酶法合成和机器学习等前沿工具的实用框架 | 紫杉醇的异源生物合成仍受限于途径复杂性、P450表达差和代谢通量效率低等关键瓶颈 | 通过合成生物学方法实现紫杉醇等天然产物的可持续生产 | 紫杉醇(植物源抗癌药物)及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、异源生物合成、细胞游离系统、混合化学酶法合成、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物相关蓝细菌, 丝状真菌 | 紫杉醇生物合成途径的重建与优化 | 医药 |
| 171 | 2026-01-10 |
Decoding life: A detailed examination of program collection
2026-Jan-05, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105693
PMID:41500378
|
综述 | 本文提出并详细阐述了'生命是程序集合'的理论,认为生命是由遗传、代谢、发育和神经认知等程序构成的复杂有序系统 | 提出'生命是程序集合'这一跨学科理论框架,将生命现象系统性地解释为多种程序的集合与协同运作 | 面临意识难题(hard problem of consciousness)的挑战以及相关的伦理争议 | 探讨生命的本质,构建一个理解生命现象的跨学科理论范式 | 生命系统(包括其遗传、代谢、发育和神经认知等层面) | NA | NA | 单细胞组学、人工智能建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 172 | 2026-01-10 |
Green Drug Discovery: Leveraging Biodiversity for Sustainable Pharmaceutical Solutions
2026-Jan, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202500733
PMID:41504102
|
综述 | 本文探讨了绿色药物发现如何利用生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能实现可持续制药转型 | 整合生物多样性、绿色化学、生物技术和人工智能,推动制药行业向可持续方向转型 | 面临生物勘探伦理、资源保护及公平利益分享等挑战 | 探索绿色制药在减少环境危害同时促进药物创新的潜力 | 植物、微生物和海洋生物等生物多样性资源 | NA | NA | 合成生物学、CRISPR基因编辑、代谢工程、生物催化、超临界流体提取 | 人工智能、机器学习 | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医药 |
| 173 | 2026-01-09 |
Integrating synthetic biology and process engineering for enhanced isobutanol biosynthesis yield and sustainability
2026-Jan-08, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02720-8
PMID:41501833
|
综述 | 本文综述了异丁醇生物合成的最新进展,并从生物学和工程学角度探讨了提高产量的策略 | 整合合成生物学与过程工程,以提升异丁醇生物合成的产量和可持续性,强调酶途径优化、代谢工程和细胞工程的多学科方法 | 异丁醇的细胞毒性和挥发性导致生产过程中的损失,且酶和代谢途径的修改仍需进一步优化以提高效率和产量 | 提高异丁醇作为生物燃料和平台化学品的生物合成产量和可持续性 | 异丁醇生物合成过程,包括酶途径、代谢工程、细胞工程和发酵技术 | NA | NA | 代谢工程、细胞工程、高通量筛选技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 能源、医药、精细化学品、工业生物技术、环境 |
| 174 | 2026-01-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
|
综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 强调了AI在单细胞分辨率分析、细胞行为建模以及蛋白质结构预测方面的突破性进展 | 讨论了数据质量要求、模型可解释性以及AI工具普及化等关键挑战 | 探索人工智能如何推动细胞生物学的基础研究和治疗应用 | 细胞生物学中的复杂生物数据,如细胞图像、转录组学和蛋白质相互作用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、基础研究 |
| 175 | 2026-01-09 |
Rapid evolution of a highly efficient RNA polymerase by homologous recombination
2026-Jan-07, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02124-7
PMID:41501182
|
研究论文 | 本文通过同源重组和定向进化,将高选择性DNA聚合酶转化为具有高效RNA合成活性的非天然同源物 | 利用单细胞液滴微流体选择策略,在短进化路径中成功开发出C28聚合酶,该酶能以约3 nt/s的速率合成高保真度RNA,并接受多种修饰RNA类似物 | 未明确提及具体限制,但可能涉及工程聚合酶在复杂生物环境中的稳定性和应用范围 | 将DNA聚合酶重编程为高效RNA合成酶,以推动生物技术和医学应用 | DNA聚合酶家族及其非天然同源物C28 | 合成生物学 | NA | 同源重组、定向进化、单细胞液滴微流体选择、PCR | NA | NA | NA | 同源重组 | NA | NA | 生物技术, 医学 |
| 176 | 2026-01-08 |
The multifaceted significance of phosphoinositides in endocytic trafficking
2026-Jan-07, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70268
PMID:41496670
|
综述 | 本文综述了磷酸肌醇作为细胞区室“脂质编码”在内存运输中的多种作用,并探讨了相关技术进展及其在人类疾病中的意义 | 系统整合了磷酸肌醇在内存运输各环节(内存作用、内体分选、降解与回收)的功能,并强调了新兴技术(如荧光生物传感器、超分辨率显微镜、光遗传学与合成生物学)在解析其动态中的作用 | NA | 阐明磷酸肌醇在内存运输中的功能及其与人类疾病的关联,探索潜在治疗靶点 | 磷酸肌醇及其代谢酶(激酶与磷酸酶)、内存运输过程 | NA | 癌症、神经退行性疾病 | 荧光生物传感器、超分辨率显微镜、光遗传学、合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 177 | 2026-01-08 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
|
综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属(类金属)生物修复中的应用,探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了将CRISPR编辑与多组学、合成生物学及新兴CRISPR生物传感器整合的统一路线图,用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前存在的生态风险、技术难题、法规问题及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性,以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 178 | 2026-01-08 |
Intracellular biosensors by functional nanomaterial-integrated CRISPR technologies for real-time molecular sensing
2026-Jan-06, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc05016b
PMID:41277417
|
综述 | 本文综述了基于CRISPR技术和纳米材料集成的细胞内生物传感器的最新进展,用于实时分子传感 | 将CRISPR系统的可编程性和靶向特异性与纳米材料(如金纳米颗粒、量子点、DNA纳米结构)相结合,以增强细胞内递送效率、信号放大和传感器稳定性,并实现多模态传感和单细胞分辨率分析 | NA | 开发用于实时、动态监测细胞过程和分子事件的细胞内生物传感器 | 细胞内信号,包括核酸、非编码RNA和小分子代谢物 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术(Cas9、Cas12、Cas13),纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13 | NA | 生物传感器 | 医学, 合成生物学 |
| 179 | 2026-01-08 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-Jan-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
|
研究论文 | 本文通过合成生物学方法重构了DELTA-NOTCH信号通路,以研究脊椎动物胚胎体节分割时钟中的振荡性细胞间通讯 | 首次在DELTA缺陷的体节前中胚层类器官中整合合成DELTA-NOTCH通路,并利用光遗传学激活揭示配体呈现动力学对细胞通讯的关键作用 | 研究基于类器官模型,与完整胚胎环境存在差异;合成通路的长期稳定性未充分验证 | 探究振荡性细胞间信号在发育过程中的作用机制 | 脊椎动物胚胎的体节前中胚层类器官 | 合成生物学 | NA | 合成生物学重构、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 脊椎动物胚胎类器官 | 合成DELTA-NOTCH信号通路,具备光遗传学可调控的配体呈现功能 | 基础发育生物学研究 |
| 180 | 2026-01-08 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Jan-05, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
|
综述 | 本文综述了微生物如何通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境,并探讨了合成生物学在构建遗传电路以模拟和增强微生物计算能力方面的进展 | 首次系统性地比较了自然微生物的计算能力与合成生物学中人工设计的遗传电路,并提出了弥合两者复杂性差距的新思路 | 主要聚焦于细菌,未全面涵盖其他微生物类群(如古菌、真菌)的计算特性 | 探讨微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算性能 | 自然微生物的计算机制与合成生物学中设计的遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔逻辑门、组合输入处理电路、时序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路、细胞群体分布式计算 | 环境 |