合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 249 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-01-22 |
InSillyClo, a User-Friendly Web Application to Assist Large-Scale Golden Gate Cloning and MoClo Workflows
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00553
PMID:41404662
|
研究论文 | 本文介绍了InSillyClo，一个开源网络应用程序，用于辅助大规模Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | InSillyClo是首个专门处理大规模克隆工作流程中耗时且易错任务的软件工具，提供用户友好的界面和自动化数据生成 | NA | 开发一个工具来简化和自动化大规模克隆工作流程中的计算任务 | Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 支持用户定义的遗传设计和工作流程生成 | 工业生物技术 |
| 162 | 2026-01-22 |
Force Transmission by Minimal Focal Adhesion Complexes Induces Synthetic Cell Deformation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00645
PMID:41407554
|
研究论文 | 本研究通过重构最小黏着斑样复合物于巨型单层囊泡中，揭示了仅由特定蛋白质-膜相互作用即可实现肌动蛋白募集、力传递及结构稳定性，为探究机械传感和工程化力响应仿生系统提供了可控合成生物学平台 | 首次在合成系统中重构了包含kindlin-2、talin-1等核心蛋白的最小黏着斑复合物，并展示了其能独立介导肌动蛋白网络形成、力传递及囊泡变形，无需完整细胞环境 | 研究基于简化合成系统，可能未完全模拟天然细胞中黏着斑的复杂调控机制和动态相互作用 | 探究黏着斑复合物进行力传递和机械传感的最小物理要求 | 由kindlin-2、talin-1、FAK、paxillin、zyxin和VASP等蛋白质与含PIP和整合素β1尾的膜组成的合成黏着斑样复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重构与膜锚定技术 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | 巨型单层囊泡（GUVs） | 黏着斑样复合物作为力传感与传递模块，结合肌动蛋白网络和非肌肉肌球蛋白IIa形成收缩系统 | 医学、工业生物技术 |
| 163 | 2026-01-22 |
Synthetic Biology Strategies for Activating Cryptic BGCs in Streptomyces: Engineering Native and Synthetic Promoters for Antibiotic Discovery
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c08473
PMID:41552574
|
综述 | 本文综述了在链霉菌中利用天然和合成启动子工程激活隐性生物合成基因簇以发现新型抗生素的策略 | 系统整合了CRISPR激活系统和机器学习引导的启动子设计等前沿技术，用于激活隐性基因簇 | NA | 为天然产物发现提供启动子工具的系统级理解和转化应用指南 | 链霉菌中的隐性生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、CRISPR激活系统、机器学习引导设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 启动子重构（组成型和诱导型）用于激活隐性生物合成基因簇 | 医药 |
| 164 | 2026-01-22 |
CRISPR/Cas9-Mediated Metabolic Engineering of Endophytic Pseudomonas loganensis sp. nov. for the Production of Nutritionally Valuable Carotenoids
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05877
PMID:41552580
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9技术对内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov.进行代谢工程改造，以生产具有营养价值的类胡萝卜素 | 首次将内生细菌作为微生物底盘用于类胡萝卜素生产，并利用CRISPR-Cas9技术敲除关键基因构建了能生产多种类胡萝卜素的工程菌株 | 未提及大规模发酵的可行性及生产成本评估 | 开发可持续且环境友好的类胡萝卜素生物生产方法 | 内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov. | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、HPLC分析、响应面方法学 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas loganensis sp. nov. | 代谢途径工程（敲除类胡萝卜素合成关键基因，引入过表达质粒） | 食品、饲料、制药、化妆品 |
| 165 | 2026-01-22 |
Yohimban acetylation in Rauvolfia is mediated by a leaf-specific acetyltransferase in reserpine biosynthetic gene cluster
2026-Jan, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110714
PMID:41289712
|
研究论文 | 本研究在萝芙木中鉴定并表征了育亨宾O-乙酰转移酶（YAT），揭示了其在育亨宾生物碱代谢中的关键作用及叶特异性表达模式 | 首次在利血平生物合成基因簇中发现并表征了叶特异性乙酰转移酶YAT，阐明了育亨宾乙酰化的酶学基础及其在生物碱多样性演化中的意义 | 研究主要基于Rauvolfia serpentina，未在其他物种中广泛验证；对YAT的调控机制和进化路径的探索仍有限 | 解析萝芙木中单萜吲哚生物碱（MIAs）的生物合成途径，特别是育亨宾乙酰化的酶学机制与进化动态 | 萝芙木（Rauvolfia serpentina）中的育亨宾O-乙酰转移酶（YAT）及其在育亨宾和别育亨宾乙酰化中的作用 | 合成生物学 | NA | 同源建模、底物对接实验、基因表达分析 | NA | 基因序列、酶活性数据、表达模式数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 166 | 2026-01-22 |
Cell-free immuno-profiling on a genetically programmed biochip
2026-Jan, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-02058-0
PMID:41372446
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于无细胞合成生物学的微流控生物芯片平台，用于定量分析抗体与抗原的相互作用，实现快速免疫分析 | 扩展了先前开发的微流控生物芯片平台，通过局部基因刷在图案化隔室中创建连续抗原密度梯度，实现单次芯片上同时合成多种抗原并生成多个抗体结合曲线 | 未明确说明样本处理的通量限制或芯片的可扩展性 | 开发一种无需蛋白纯化步骤的快速定量方法，用于分析复杂蛋白质相互作用，特别是针对人类免疫分析和新兴病原体应对 | SARS-CoV-2抗原、单克隆抗体、多克隆抗体、人类血清样本、人类ACE2受体 | 合成生物学 | COVID-19 | 无细胞合成生物学、光刻图案化、微流控技术 | NA | 蛋白质相互作用数据 | 1微升人类血清（未明确总样本数） | 基因刷、光刻图案化 | 无细胞系统 | 抗原梯度生成系统、受体-配体相互作用重建系统 | 医学 |
| 167 | 2026-01-22 |
Deciphering the molecular roles of antimicrobial peptides in plant innate immunity and their potential applications in crop protection
2026-Jan, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110961
PMID:41422562
|
综述 | 本文综述了植物抗菌肽在先天免疫中的作用及其在作物保护中的潜在应用 | 整合多组学技术与合成生物学，加速了抗菌肽的理性设计及其在农业中的生态友好型应用 | 存在病原体快速进化抗性、目标特异性不足、田间条件下肽不稳定性、潜在植物毒性以及复杂监管审批路径等挑战 | 探讨植物抗菌肽的分子角色及其在可持续作物保护中的应用潜力 | 植物抗菌肽及其在先天免疫系统中的作用 | NA | NA | 多组学技术（包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学）与合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 168 | 2026-01-21 |
CRISPR-Based Approaches to Engineer Nonmodel Bacteria for Bioproduction and Biotherapeutics
2026-Jan-20, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.5c00613
PMID:41488985
|
综述 | 本文综述了基于CRISPR-Cas系统在非模式细菌工程化中的应用，以开发生物生产和生物治疗产品 | 强调利用CRISPR效应蛋白相对独立于宿主辅助因子的特性，克服物种特异性障碍，实现对难以工程化的非模式微生物（如C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌和肠道共生菌）的精确基因操作，从而拓展其独特的代谢和生物合成潜力 | 文中提及当前工具在非模式微生物中的应用仍存在局限性，但未具体说明是哪些技术或生物学障碍 | 探讨如何利用CRISPR-Cas系统扩展微生物工程的范围，以开发可持续生物制造、天然产物发现和下一代活体生物治疗剂 | 非模式细菌，特别是C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌和肠道共生菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 非模式细菌，包括C1气体固定产乙酸菌、抗生素生产菌、肠道共生菌 | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 169 | 2026-01-21 |
Extended Dissipative Analysis for Uncertain Delayed Genetic Regulatory Networks via Interval Type-2 T-S Fuzzy Framework
2026-Jan-19, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2026.3652172
PMID:41553905
|
研究论文 | 本研究在区间二型T-S模糊框架下，对不确定时滞基因调控网络进行扩展耗散性分析 | 首次利用区间二型模糊集捕捉基因调控网络的复杂动态和参数不确定性，并通过构建新型Lyapunov-Krasovskii泛函获得最大允许时滞界限的显式推导 | NA | 为基因调控网络开发鲁棒控制策略的理论理解和实际设计 | 不确定时滞基因调控网络 | 机器学习 | NA | 区间二型T-S模糊框架，Lyapunov-Krasovskii泛函方法 | T-S模糊模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 170 | 2026-01-21 |
Electrochemical techniques in protein engineering: Innovations in redox-active protein design and electron transfer mechanisms
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149750
PMID:41418956
|
综述 | 本文综述了电化学技术在蛋白质工程中的应用，特别是在设计氧化还原活性蛋白和探究电子转移机制方面的创新 | 综述了人工智能与计算建模在识别增强电子转移效率的突变中的应用，以及合成生物学构建人工电子传递途径和纳米结构材料改善蛋白质固定化与电荷传导的最新进展 | 蛋白质稳定性、隧穿效应的精确控制以及有效的电子集成等挑战仍需解决 | 探讨电化学技术如何支持工程化氧化还原蛋白的设计与功能优化，并推动其在生物电子系统中的应用 | 氧化还原活性蛋白及其工程化设计 | 蛋白质工程 | NA | 电化学技术（阻抗谱、循环伏安法、计时电流法、扫描电化学显微镜） | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 人工电子传递途径 | 生物传感、生物电催化、生物电子学、医疗保健监测 |
| 171 | 2026-01-20 |
Regulation of Single and Multiple Genes in Bacillus amyloliquefaciens by an Evolution System In Vivo
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00480
PMID:41396964
|
研究论文 | 本研究开发了一种用于枯草芽孢杆菌单基因和多基因调控的高效体内进化系统，通过CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑器和进化模板设计，成功优化了碱性蛋白酶活性和血红素产量 | 开发了基于CRISPR/Cas9n-AID的体内进化系统，首次在枯草芽孢杆菌中实现单基因和多基因的同时进化调控，并通过扩展sgRNA策略优化进化效率 | NA | 开发一种高效的体内进化系统，用于调控枯草芽孢杆菌中的单基因和多基因，以优化细胞工厂的构建 | 枯草芽孢杆菌及其基因（如碱性蛋白酶基因和血红素代谢网络关键基因） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑、下一代测序、分批补料发酵 | NA | 测序数据、发酵数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 碱基编辑器（Cas9n与AID融合表达）、进化模板（含可编辑RBS序列） | 工业生物技术 |
| 172 | 2026-01-20 |
A Dual CRISPR-Cas/Cre-loxP Genome Engineering Strategy for Stable Uricase Expression in Food-Grade Probiotics
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00774
PMID:41432353
|
研究论文 | 本文开发了一种结合CRISPR-Cas9基因敲入与Cre/loxP介导的基因组精简的双重基因组工程策略，用于在食品级益生菌中实现尿酸酶的稳定表达 | 首次将CRISPR-Cas9基因编辑与Cre/loxP系统整合，构建了遗传稳定、生物安全的食品级益生菌底盘，并实现了异源尿酸酶的高效稳定表达 | 研究目前仅在小鼠肠道中验证了定植能力，尚未进行人体临床试验；尿酸降解实验仅在体外条件下完成 | 开发具有定制代谢功能的食品级微生物底盘，用于合成生物学在健康与营养领域的应用 | 乳酸乳球菌NZ9000菌株及其工程改造菌株 | 合成生物学 | 高尿酸血症/痛风 | CRISPR-Cas9基因编辑, Cre/loxP重组系统, 基因组工程 | NA | 酶活性数据, 基因组测序数据, 体内定植数据 | 工程菌株（NZ9000-Δ）及其对照 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 乳酸乳球菌（Lactococcus lactis） | 尿酸酶异源表达系统, 基因组精简设计 | 食品, 医药 |
| 173 | 2026-01-20 |
Synthetic Biology Strategies for Harnessing Bacterial Glucose Oxidation Pathways
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00901
PMID:41494861
|
综述 | 本文系统综述了细菌葡萄糖氧化途径的组成、分布、生理功能、关键酶及其代谢产物的工业应用，并重点讨论了通过代谢工程策略优化该途径以生产高价值化合物的潜力 | 系统整合了细菌葡萄糖氧化途径的生物学知识与代谢工程策略，并全面评估了该途径在可持续生产多种高价值化合物（如酒石酸、2,5-呋喃二甲酸、维生素C前体和磷肥）中的应用潜力 | NA | 探讨如何利用合成生物学与代谢工程策略优化细菌的葡萄糖氧化途径，以实现特定高价值化合物的高效、可持续生产 | 细菌的葡萄糖氧化途径及其关键酶（如PQQ依赖型和FAD依赖型葡萄糖酸脱氢酶），以及该途径的代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 葡萄糖氧化途径（涉及葡萄糖酸、5-酮基-D-葡萄糖酸、2-酮基-D-葡萄糖酸和2,5-二酮基-D-葡萄糖酸等中间产物的代谢通路） | 工业生物技术, 农业, 医药 |
| 174 | 2026-01-20 |
A Framework for a Standard-Enabled FAIR Data Management Workflow for Synthetic Biology
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00813
PMID:41498158
|
综述 | 本文提出了一个基于标准的FAIR数据管理框架，用于合成生物学实验室中数据与元数据的整合与标准化工作流 | 通过半结构化访谈分析当前实践，构建了将常见数据类型映射到社区标准的框架，并提供逐步采用指南和软件解决方案目录 | NA | 解决合成生物学数据分散、格式不一致的问题，提升数据的可查找性、可访问性、互操作性和可重用性 | 合成生物学项目生命周期中产生的序列、模型、协议、图像和时间序列测量等数据与元数据 | 合成生物学 | NA | 半结构化访谈 | NA | 序列、模型、协议、图像、时间序列测量 | 美国多个实验室的合成生物学研究人员 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 175 | 2026-01-20 |
A synthetic gene circuit to convert biochemical signals to electrical signal in engineered sensory bacteria for electrochemical biosensing
2026-Jan-12, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118391
PMID:41548356
|
研究论文 | 本研究构建了一个合成基因电路，将生化信号转换为电信号，用于工程化感官细菌的电化学生物传感 | 设计了一个集成合成基因电路，结合一氧化氮响应模块和PCA合成模块，增强了电信号输出，实现了单细胞水平的高灵敏度检测 | NA | 开发基于工程化电活性微生物的电化学生物传感器，用于细胞内一氧化氮的原位分析 | 工程化的大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | 电化学量化 | NA | 电信号 | NA | 合成生物学工具 | 大肠杆菌 | 集成合成基因电路，包括一氧化氮响应模块和苯二胺-1-羧酸合成模块，用于间接电子传递和信号转换 | 医学 |
| 176 | 2026-01-20 |
Chimeric antigen receptor-based cellular therapy for T-cell malignancies
2026-Jan, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105044
PMID:41285209
|
综述 | 本文综述了基于嵌合抗原受体（CAR）的细胞疗法在T细胞恶性肿瘤中的应用，探讨了包括T细胞亚群、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞和γδ T细胞在内的多种免疫效应细胞，并讨论了多抗原靶向、新兴技术和最新临床试验 | 聚焦于CAR疗法在T细胞恶性肿瘤中的挑战，如抗原共享导致的细胞自相残杀和T细胞再生障碍，并探索了多种免疫效应细胞和新兴技术以改善疗效 | NA | 改善复发或难治性T细胞恶性肿瘤的CAR疗法疗效 | T细胞恶性肿瘤患者 | NA | T细胞恶性肿瘤 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞、γδ T细胞 | 嵌合抗原受体（CAR）设计，使用单链可变片段（scFv）识别肿瘤相关抗原 | 医学 |
| 177 | 2026-01-20 |
Toward full automation in synthetic biology: A progressive conceptual framework integrating robotics and intelligent agents
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100378
PMID:41360266
|
综述 | 本文探讨了合成生物学中物理（机器人）和认知（智能代理）自动化的进展与前景，并提出了一个双重概念框架 | 提出了一个双重概念框架：一个用于设计-构建-测试-学习（DBTL）周期的完全自动化，另一个适用于不同实验室环境的渐进式自动化 | NA | 支持合成生物学实验室中自动化系统的开发和负责任实施 | 合成生物学中的自动化技术和智能代理 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 178 | 2026-01-19 |
Arabinose-Inducible Univariant Control System (AUCS) for Microbial Production of Proteins, Enzymes, and Metabolites
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00602
PMID:41423945
|
研究论文 | 本文介绍了一种阿拉伯糖诱导的单变量控制系统（AUCS），用于微生物生产蛋白质、酶和代谢物，旨在克服现有诱导系统的局限性 | AUCS通过组成型表达阿拉伯糖转运蛋白AraE消除了碳分解代谢物阻遏，并最小化诱导异质性，仅需3 μM l-阿拉伯糖即可实现最大蛋白质输出，显著降低诱导剂成本和环境足迹 | NA | 开发一种稳健、紧密调控且低成本的表达平台，以优化微生物生产中的基因表达控制 | 微生物生产系统，包括蛋白质（如卵清蛋白）、酶（如萜烯合酶、类胡萝卜素裂解双加氧酶）和次级代谢物（如芳樟醇、橙花叔醇和香紫苏醇） | 合成生物学 | NA | 基因表达调控、启动子库定制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 单变量控制系统，包括阿拉伯糖诱导的启动子和阿拉伯糖转运蛋白AraE的组成型表达，用于精确调控多酶操纵子和复杂生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 179 | 2026-01-19 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Jan-16, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
|
综述 | 本文综述了利用噬菌体递送CRISPR-Cas效应器的最新进展，旨在通过原位基因编辑工程化微生物群落 | 结合噬菌体工程策略、合成生物学技术和计算工具，实现CRISPR-Cas系统在宿主环境中的精准递送和基因组编辑 | 在系统发育广度部署方面仍面临挑战 | 开发技术以操纵和工程化微生物群落，实现其功能的理性调控 | 微生物群落及其功能角色 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体工程、合成生物学技术、计算工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物群落（未指定具体宿主） | NA | 医学, 食品, 农业 |
| 180 | 2026-01-19 |
SynVectorDB: embedding-based retrieval system for synthetic biology parts
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf088
PMID:41537189
|
研究论文 | 本文介绍了SynVectorDB，一个基于嵌入的合成生物学元件检索系统，旨在解决现有数据库数据组织不一致和语义搜索能力有限的问题 | 开发了基于BGE-M3多语言嵌入的可扩展向量数据库架构，实现了语义相似性匹配；提出了新颖的三级层次分类系统；建立了标准化的数据整理工作流程 | NA | 改进合成生物学元件的发现和组织方式，提高检索效率和准确性 | 合成生物学元件（生物部件） | 生物信息学 | NA | 嵌入技术，语义相似性匹配 | BGE-M3嵌入模型 | 文本数据，元数据 | 19,850个生物部件（来自Addgene、iGEM注册库和实验室收集），其中7,656个通过文献验证获得验证状态 | iGEM | NA | NA | 工业生物技术 |