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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议,用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统,结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育,通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株,具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 182 | 2026-03-04 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Mar-02, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 本文综述了通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展(GCE)的进展,重点关注非标准氨基酸(nsAAs)的生物合成及其在合成生物学中的应用 | 整合代谢工程与GCE,实现nsAAs的生物合成,减少对化学合成补充的依赖,拓展蛋白质化学功能 | 现有GCE方法通常依赖细胞培养基中化学合成nsAAs的补充,这限制了其应用范围 | 克服GCE中nsAAs来源的限制,通过代谢工程实现nsAAs的生物合成,以促进合成生物学应用 | 遗传密码扩展(GCE)、非标准氨基酸(nsAAs)、活细胞中的蛋白质翻译 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展(GCE) | NA | NA | NA | NA | 活细胞(未指定具体宿主) | 生物合成途径设计,用于生产非标准氨基酸(nsAAs) | 医学、工业生物技术 |
| 183 | 2026-03-04 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-Mar-02, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化非核糖体肽合成以优化抗生素生产的进展 | 聚焦于通过工程化前体代谢物、改变代谢流、引入强启动子和调控因子以及重定向代谢至生物合成基因簇,以提高非核糖体肽的产量和生物活性 | NA | 利用合成生物学优化非核糖体肽的合成,以增强其作为抗生素的医药应用 | 非核糖体肽合成酶及其产生的肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成基因簇的工程化表达 | 医药 |
| 184 | 2026-03-03 |
Metabolomics-guided engineering of drought-resilient crops: Integrating multi-omics and AI for climate-smart agriculture
2026-Apr, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2026.113025
PMID:41662977
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综述 | 本文综述了代谢组学在指导抗旱作物工程化中的应用,重点探讨了其与多组学、CRISPR基因编辑、合成生物学及人工智能等前沿技术的整合,旨在构建一个面向气候智能型农业的转化框架 | 强调将代谢组学从诊断工具发展为预测性和规范性平台,并系统整合了单细胞/空间代谢组学、生态代谢组学及AI驱动建模等新兴前沿方向,以连接实验室发现与田间应用 | NA | 构建一个整合多组学、基因编辑、合成生物学和人工智能的转化框架,以培育抗旱作物,应对全球粮食安全威胁 | 作物(特别是面临干旱胁迫的作物)及其在干旱响应中的代谢物 | NA | NA | 代谢组学,多组学整合,CRISPR基因编辑,通路工程,合成生物学,人工智能 | AI驱动的预测模型 | 代谢组学数据,多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物(植物) | 通路工程 | 农业 |
| 185 | 2026-03-03 |
Synthetic biology for heterologous expression and engineering of fungal polyketide synthases
2026-Mar-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00020c
PMID:41770117
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综述 | 本文综述了真菌聚酮合酶(PKS)的异源表达与工程化策略,包括宿主选择、工程策略及未来发展方向 | 系统总结了真菌PKS工程化的两大关键设计原则(宿主选择与工程策略),并提出了整合先进计算工具等未来方向 | NA | 探讨真菌聚酮合酶的异源表达与工程化方法,以拓展聚酮类天然产物的应用潜力 | 真菌聚酮合酶(PKS)及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 异源表达、点突变、结构域交换 | NA | NA | NA | NA | 酵母、丝状真菌 | 聚酮合酶工程化(包括起始单元选择、点突变、结构域交换) | 医药、农业、生物技术 |
| 186 | 2026-03-03 |
Molecular characterization following expression analysis of sugar transporters in passion fruit to explore their roles in fruit development and abiotic stress tolerance
2026-Mar, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04707-0
PMID:41768418
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研究论文 | 本研究通过全基因组分析鉴定百香果中的55个糖转运蛋白,探究其在果实发育和非生物胁迫耐受中的功能 | 首次在百香果中进行糖转运蛋白的全基因组鉴定,结合分子对接、动力学模拟和表达分析揭示其功能多样性及胁迫响应机制 | NA | 探索百香果糖转运蛋白在果实发育和非生物胁迫耐受中的潜在作用 | 百香果(Passiflora edulis)中的糖转运蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组分析、RNA-seq、实时定量PCR、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 基因组序列、RNA-seq数据、蛋白质序列 | NA | 合成生物学 | 百香果(植物) | 合成生物学指导的电路设计,用于开发多重非生物胁迫耐受的高糖百香果 | 农业 |
| 187 | 2026-03-03 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将小鼠H3K9甲基转移酶和HP1引入酿酒酵母,探究H3K9甲基化及其阅读器分子HP1对转录和染色质压缩的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基转移酶和HP1,以简化系统研究其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行,可能不适用于其他生物或染色质区域;H3K9甲基化和HP1单独不足以改变高阶染色质结构 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的重要性及其对转录和染色质结构的影响 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 引入小鼠H3K9甲基转移酶和HP1以模拟异染色质表观基因组系统 | 基础生物学研究 |
| 188 | 2026-03-03 |
Imagining an ethics for synthetic biology
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1746379
PMID:41767306
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2026-03-02 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering of Microalgae for Sustainable Lipid and Terpenoid Production: An Updated Perspective
2026-Mar, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70405
PMID:41117552
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综述 | 本文是一篇关于微藻合成生物学与代谢工程用于可持续生产脂质和萜类化合物的最新进展的综述 | 整合并批判性评估了关键微藻模型(如莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻)的最新研究进展,重点介绍了加速设计-构建-测试-学习(DBTL)循环的新型遗传工具包、基因组规模代谢建模的突破,以及用于高价值化合物细胞器靶向生物合成的创新策略 | NA | 评估微藻合成生物学与代谢工程的最新进展,以推动其作为可持续生产脂质和萜类化合物的生物平台 | 微藻,特别是莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻等关键模型 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、基因组规模代谢建模 | NA | NA | NA | NA | Chlamydomonas reinhardtii, Nannochloropsis spp., Phaeodactylum tricornutum | 用于高价值化合物(如多不饱和脂肪酸和萜类)生物合成的代谢途径 | 食品, 燃料, 生物制造 |
| 190 | 2026-03-02 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Mar-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
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综述 | 本文综述了超声响应型工程菌在肿瘤靶向治疗中的策略、机制与应用进展 | 聚焦于将外源性响应调控因子(如超声)与微生物疗法相结合,为肿瘤治疗提供更智能、精准的治疗策略 | NA | 总结工程菌在肿瘤治疗中的核心改造方法、作用机制及主要应用策略,并重点阐述超声与工程菌结合的形式与相互作用机制 | 工程菌及其与超声结合的系统 | 合成生物学 | 肿瘤 | 生物与物理化学方法的功能修饰与工程化 | NA | NA | NA | NA | 多种来源的细菌 | NA | 医学 |
| 191 | 2026-03-02 |
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70061-7
PMID:41764153
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研究论文 | 本文提出了一种基于蛋白质的数据存储与检索方法,通过将数字数据编码为氨基酸序列并利用大肠杆菌表达,实现高容量和稳定性的数据存储 | 通过将数据编码到胶原样蛋白质模板中,利用大肠杆菌表达非天然蛋白质,并结合胰蛋白酶消化与LC-MS/MS分析实现精确数据检索,同时展示了比DNA更高的稳定性以及随机访问和加密数据保护功能 | NA | 开发一种基于蛋白质的高容量、稳定数据存储与检索系统 | 非天然蛋白质及其在数据存储中的应用 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS分析,胰蛋白酶消化 | NA | 数字数据,蛋白质序列 | NA | NA | 大肠杆菌 | 数据编码的胶原样蛋白质模板 | 数据存储,合成生物学 |
| 192 | 2026-03-02 |
Artificial Intelligence and the Discovery of Antibiotics: Reinventing with Opportunities, Challenges, and Clinical Translation
2026-Feb-23, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15020233
PMID:41750530
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综述 | 本文综述了人工智能在加速和优化抗生素发现过程中的作用,包括虚拟筛选、新分子设计和早期测试等环节 | 系统性地探讨了人工智能与合成生物学、纳米技术和多组学数据的协同作用,作为下一代抗菌方法的核心组成部分 | 存在数据缺乏、算法偏见以及研究与临床应用之间的转化鸿沟等问题 | 探讨人工智能在应对抗菌素耐药性威胁、加速新型抗生素发现中的应用与挑战 | 小分子抗生素和抗菌肽 | 机器学习 | NA | 机器学习、深度学习、自然语言处理、生成模型 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 193 | 2026-03-02 |
Preclinical Evaluation of Synthetic Biology-Driven Engineered Escherichia coli Nissle 1917 as a Living Therapeutic for Sustained L-DOPA Delivery
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00786
PMID:41628253
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法开发了一种基于益生菌的活体生物治疗系统,用于持续稳定地递送L-DOPA,以缓解帕金森病的运动症状 | 首次构建了基于质粒的L-DOPA表达型大肠杆菌Nissle 1917益生菌株,实现了在体内持续稳定地递送L-DOPA,相比传统口服给药方式具有更好的治疗效果 | 研究仅在临床前小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验;工程菌株的长期安全性和稳定性需要进一步评估 | 开发一种用于帕金森病治疗的、基于工程化益生菌的活体生物治疗系统 | 帕金森病小鼠模型 | 合成生物学 | 帕金森病 | 合成生物学方法 | NA | NA | 小鼠模型 | 质粒工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | L-DOPA表达系统 | 医学 |
| 194 | 2026-03-02 |
From Waste to Worth: The Role of Fermentation in a Sustainable Future
2026-Feb-12, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040664
PMID:41750856
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综述 | 本文综述了发酵技术在可持续生物技术中的作用,重点介绍了其如何将农业和食品废弃物转化为高附加值产品,并探讨了其在循环生物经济、健康调节以及未来可持续食品系统中的潜力 | 系统阐述了发酵技术如何整合环境、营养和经济挑战,并强调了精准发酵和合成生物学在无动物、非传统农业方式生产特定食品成分方面的突破性进展 | 指出了限制该技术规模化应用的关键技术和监管障碍 | 探讨发酵技术在可持续未来中的作用,特别是其在废弃物资源化、循环生物经济及健康促进方面的应用 | 发酵过程、有机废弃物(农业和食品残留物)、高附加值产品(生物活性化合物、有机酸、生物燃料、酶、蛋白质)以及相关微生物 | NA | NA | 发酵技术、精准发酵、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 食品, 医疗保健, 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 195 | 2026-03-02 |
Light-Controlled Membrane Fusion in Synthetic Cells
2026-Feb-12, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16020317
PMID:41752955
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综述 | 本文综述了光控膜融合技术在合成细胞构建和功能化中的应用进展 | 利用光敏分子和光遗传学工具实现时空可控的脂质与聚合物囊泡融合,提高了合成细胞组装的动态性和可控性 | 当前方法在效率和生物相容性方面仍面临挑战 | 探讨光诱导膜融合技术在合成生物学平台中的应用潜力 | 脂质和聚合物囊泡的膜融合过程 | 合成生物学 | NA | 光敏分子和光遗传学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 生物传感 |
| 196 | 2026-03-02 |
Flavonoids in Medicine and Food Homology Substances: Structure-Activity Relationship, Application Challenges, and Cutting-Edge Technological Breakthroughs
2026-Feb-11, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15040658
PMID:41750850
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综述 | 本文综述了药食同源物质中黄酮类化合物的结构-活性关系、应用挑战及前沿技术突破 | 系统整合了人工智能、合成生物学和材料科学等前沿技术,以解决黄酮类化合物在药食同源应用中的瓶颈问题 | NA | 为药食同源物质中黄酮类化合物的基础研究和应用开发提供参考 | 药食同源物质中的黄酮类化合物 | NA | NA | 超声波/微波辅助提取、超临界CO2提取、UHPLC-MS、指纹图谱构建 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品 |
| 197 | 2026-03-02 |
SUPER: Upcycling Genetic Parts for Precise Gene Expression Control, Leakage Minimization, and Genetic Circuit Stability
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514653
PMID:41397952
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SUPER的模块化平台,用于升级改造遗传部件,以精确控制基因表达、最小化泄漏并提高遗传电路稳定性 | 提出了一种无需修改目标调控元件序列、通过小RNA作为附加控制器来调节基因表达模式的新方法,显著提升了多种响应型调控器的性能 | NA | 开发一种系统性的遗传电路构建框架,以解决合成生物学中因序列上下文依赖导致的动态范围窄和泄漏表达问题 | 遗传部件(RNA响应、化学响应、温度响应和蛋白质响应调控器)及合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | 小RNA调控技术 | NA | NA | NA | SUPER平台 | NA | 基于Holin表达的kill switch电路、与TlpA36环境传感器结合的化学-温度双输入kill switch电路 | 生物技术 |
| 198 | 2026-03-01 |
"Lys-Leu" Motif Empowers Expedient OaAEP1-Catalyzed Generation of N‑Terminal Cysteine Recombinant Proteins for Bioconjugation and Semisynthesis
2026-Feb-23, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01395
PMID:41755832
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研究论文 | 本研究报道了一种基于“Lys-Leu”基序辅助的AEP1酶催化切割方法,用于高效生成N端半胱氨酸重组蛋白,以用于生物偶联和半合成应用 | 该方法显著提高了P2'位所有20种天然氨基酸的切割效率,兼容多种底物(包括难处理的包涵体蛋白),并实现了一步法原位生成与功能化 | NA | 开发一种高效、通用的位点特异性蛋白质修饰平台 | N端半胱氨酸重组蛋白 | 合成生物学与化学生物学 | NA | AEP1酶催化切割 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(活细胞成像、治疗开发) |
| 199 | 2026-03-01 |
Exploring structural, functional, evolutionary, and genetic characteristics of sugar transporters in maize and their roles in abiotic stress tolerance
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342990
PMID:41746965
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析鉴定了玉米中的60个糖转运蛋白,并研究了它们在非生物胁迫耐受性中的潜在作用 | 首次在玉米中系统鉴定和表征糖转运蛋白家族,并通过干湿实验结合的方法揭示了它们在非生物胁迫响应中的调控机制 | 研究主要基于生物信息学预测和初步实验验证,需要进一步的体内功能验证来确认转运蛋白的具体作用机制 | 探索玉米糖转运蛋白的结构、功能和进化特征,及其在非生物胁迫耐受性中的作用 | 玉米糖转运蛋白家族 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq, qRT-PCR, 系统发育分析, 共表达分析, 分子对接 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质序列数据 | 60个玉米糖转运蛋白 | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 200 | 2026-02-28 |
Preparation strategies and biomedical applications of DNA hydrogels
2026-Feb-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc08190d
PMID:41657654
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综述 | 本文总结了DNA水凝胶的制备策略及其在细胞培养、药物递送和组织工程等生物医学领域的应用进展 | 系统性地将DNA纳米技术与合成生物学相结合,利用DNA作为结构框架或交联剂构建具有生物组织相似性的三维网络结构,并突出其高生物相容性、可编程响应性和特异性识别功能 | 讨论了DNA水凝胶发展当前面临的挑战,但未在摘要中具体说明 | 总结DNA水凝胶的制备策略,分析其应用优势,并展望未来研究方向 | DNA水凝胶 | 材料科学 | NA | DNA纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |