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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-10-23 |
Dissecting the functional and spatial roles of peroxiredoxins as H2O2 scavengers and redox transducers
2026-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06356-1
PMID:42897284
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研究论文 | 本文通过合成生物学策略将Tpx1的过氧化物酶清除功能与氧化还原信号转导功能分离,研究其在亚细胞区室中的作用 | 采用合成生物学策略在不同亚细胞区室中表达Tpx1或过氧化氢酶Ctt1,成功分离了Prx的过氧化物酶清除功能与信号转导功能 | 研究仅使用裂殖酵母模型,未涉及哺乳动物或其他高等生物的Prx功能验证 | 解析过氧化物还原蛋白作为H2O2清除剂和氧化还原传感器的功能与空间角色 | 裂殖酵母中的主要过氧化物还原蛋白Tpx1及过氧化氢酶Ctt1 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、亚细胞定位表达、H2O2生物传感器 | NA | NA | NA | NA | 裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe) | 亚细胞区室靶向表达系统(线粒体靶向、核靶向的Tpx1或Ctt1) | 医学 |
| 182 | 2026-10-22 |
Catalysis and allostery in bacterial ATP phosphoribosyltransferases
2026-Oct-20, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70769
PMID:42899706
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综述 | 本文综述了细菌ATP磷酸核糖基转移酶(ATPPRT)的结构、催化机制和别构调控机制 | 系统总结了近期关于ATPPRT催化、别构调节、抑制和激活的发现,并讨论了该领域的开放性问题及可能的工业和生物医学应用 | 作为一篇综述,未提供新的实验数据,主要基于已有文献进行归纳总结 | 概述别构概念,综述细菌ATPPRT的结构、催化和别构机制,并探讨其作为药物靶点和合成生物学靶点的应用前景 | 细菌ATP磷酸核糖基转移酶(ATPPRT),包括长型和短型两种形式 | 合成生物学, 结构生物学, 酶学 | 结核病, 鲍曼不动杆菌感染 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 183 | 2026-10-22 |
From genome editing to chromosome engineering in plants
2026-Oct-20, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.09.024
PMID:42901830
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综述 | 综述植物大片段基因组工程与染色体工程的主要策略、优缺点及其在基础植物生物学和作物育种中的应用 | 系统整合双链断裂、先导编辑、重组酶和转座酶四类技术,实现从千碱基到兆碱基DNA片段的可编程删除、插入、替换、重复、倒位和易位,并提出人工智能加速大片段基因组工程优化 | 未涉及具体实验验证数据,缺乏对各策略在不同植物物种中效率与脱靶效应的定量比较,人工智能整合尚处于展望阶段 | 总结植物大片段基因组工程策略并推动从基因组编辑向染色体工程的转变 | 植物基因组大片段DNA及染色体 | 植物基因组工程 | NA | 双链断裂技术、先导编辑、重组酶、转座酶 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 先导编辑, 重组酶, 转座酶 | 植物 | NA | 农业, 医学 |
| 184 | 2026-10-22 |
Programmable bacterial vaccine vectors: A Design-Build-Control framework for precision immune engineering
2026-Oct-18, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109078
PMID:42893711
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综述 | 提出一个源自合成生物学的设计-构建-控制(DBC)框架,将细菌载体工程统一为可系统设计的问题,并综述了各阶段策略、平台类别、材料配方、转化决定因素及人工智能应用 | 将细菌疫苗载体工程重构为统一的生物技术问题,并引入设计-构建-控制(DBC)框架系统评估生物安全、可制造性和临床转化 | 人工智能在细菌载体设计中的应用部分仍属前瞻性,尚需实验验证 | 为可编程细菌疫苗载体的精准免疫工程提供系统化的设计-构建-控制框架 | 活细菌疫苗载体,包括减毒革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌、益生菌底盘,以及外膜囊泡、细菌幽灵和孢子等非复制系统 | 合成生物学 | 传染病, 肿瘤, 兽医疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 革兰氏阴性菌, 革兰氏阳性菌, 益生菌 | 诱导型启动子, 群体感应回路, 杀伤开关, 平衡致死系统, 无抗生素质粒维持系统 | 医学, 农业 |
| 185 | 2026-10-22 |
From oleaginous microalga to marine chassis: synthetic biology and process-aware biomanufacturing in Nannochloropsis
2026-Oct-17, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109079
PMID:42892548
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综述 | 本文系统评述了海洋微藻Nannochloropsis从产油微藻向海洋光合生物制造底盘发展的合成生物学工具与过程感知制造进展 | 提出并评估Nannochloropsis作为可预测、可复用、过程感知的海洋底盘是否成熟,强调基因组架构、细胞器靶向规则、动态调控与迭代DBTL表型分析的重要性,并主张产品特异性底盘配置优于通用菌株 | 结果仍受基因组位点、菌株背景、胞内区室、生理状态和培养条件强烈影响,缺乏可复用基因组架构、可靠的细胞器靶向规则、动态调控和适配迭代DBTL的表型分析,且菌株设计与培养、收获、产物回收及部署耦合不足 | 评估现有合成生物学与过程感知生物制造进展是否足以支撑Nannochloropsis成为可预测、可复用、过程感知的海洋光合生产底盘 | 海洋微藻Nannochloropsis属 | 合成生物学 | NA | 基因组资源、核转化、同源重组、CRISPR/Cas编辑、标记回收、定点整合、模块化多基因组装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Nannochloropsis | 代谢途径工程(碳分配、三酰甘油积累、EPA合成与脂质类别分配、类胡萝卜素代谢、重组蛋白生产、特种代谢物合成) | 医药, 工业生物技术, 食品 |
| 186 | 2026-10-22 |
Engineering the microbial architects: a genetic revolution in bio-electrochemical hydrogen production
2026-Oct-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109076
PMID:42874939
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综述 | 综述合成生物学、生物电催化和反应器工程在可持续生物制氢中的融合框架 | 将合成生物学、生物电催化与反应器工程整合为生物制氢框架,并强调CRISPR-Cas9多重基因组编辑相较传统诱变在通路优化中的精准优势 | 存在可扩展性、技术经济可行性等技术瓶颈 | 探讨微生物生物电化学制氢的工程化改造与系统集成策略 | 产电微生物类群及生物电化学系统(BESs) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑, 合成生物学, 生物电催化 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 调控网络重连, 代谢通路优化 | 能源, 环境 |
| 187 | 2026-10-21 |
Designer Enzymes: Food-System-Oriented Biocatalysts for Mitigating Mycotoxin Contamination and Reducing Postharvest Grain Loss
2026-Oct-04, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15193538
PMID:42883645
|
综述 | 本文综述了用于缓解霉菌毒素污染和减少采后粮食损失的食品体系导向的设计酶,并提出了一个五维框架来评估其从实验室到实际应用的转化瓶颈 | 提出了“设计酶”这一面向部署的工程概念,即在优化前先定义预期使用条件,并以此指导分子、制造、制剂、安全和监管决策;同时构建了包含机理理解、预测设计整合、多目标优化、部署就绪性以及安全与监管准备度的五维定性诊断框架 | 五维框架仅作为定性诊断工具而非经过正式验证的数值评分系统;综述基于文献证据而非原始实验数据,可能受限于已发表研究的偏倚和覆盖范围 | 批判性审视基于酶的霉菌毒素解毒技术从实验室表征到实际食品或饲料应用的转化差距,并提出结构化的路线图以指导有前景的解毒酶走向可信、安全且可规模化的应用 | 主要霉菌毒素类别包括黄曲霉毒素、脱氧雪腐镰刀菌烯醇及相关单端孢霉烯族毒素、玉米赤霉烯酮、赭曲霉毒素A和伏马毒素,以及针对这些毒素的天然酶和工程化变体 | 食品科学, 蛋白质工程, 合成生物学 | NA | 蛋白质工程, 结构引导工程, AI辅助突变优先排序, 稳定性优化, Design-Build-Test-Learn工作流, 合成生物学, 多酶系统 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 多酶系统 | 食品, 饲料, 农业 |
| 188 | 2026-10-21 |
A Review of Nuclear-Organellar Communication in Response to Heat Stress
2026-Sep-30, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15192995
PMID:42884859
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综述 | 本文综述了植物在热胁迫下细胞核与各细胞器之间通过次级信使、蛋白质和逆行信号进行通讯协调的机制 | 系统整合了从质膜/胞质热信号感知到核转录重编程及细胞器逆行反馈的核-细胞器通讯网络,并提出了不同细胞器中候选热感受蛋白及膜接触位点等尚未解决的关键问题 | 文章为综述性总结,未提供新的实验数据,且对叶绿体和线粒体内在热感受能力、细胞器间次级信使动态协调及膜接触位点的生物学功能等关键机制仍缺乏深入解析 | 总结植物通过核-细胞器通讯维持细胞稳态以响应热胁迫的机制,并指出未来研究方向以助力耐热作物育种 | 植物(热胁迫响应下的细胞核、内质网、叶绿体和线粒体) | 植物分子生物学、细胞信号传导 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 189 | 2026-10-21 |
Microbially Induced Carbonate Precipitation (MICP) as a Sustainable Technology, Mechanism and Application: A Review
2026-Sep-22, Materials (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ma19194051
PMID:42882553
|
综述 | 系统综述微生物诱导碳酸盐沉淀(MICP)的生化机制、关键影响因素及近期工程应用进展 | 对比MICP与传统化学方法的成本与可持续性,识别当前技术瓶颈并提出合成生物学优化菌株和人工智能辅助设计等未来研究方向 | 当前存在反应效率低和材料脆性等技术瓶颈 | 为MICP的基础研究提供理论框架,推动其在可持续技术领域的创新和规模化应用 | 微生物诱导碳酸盐沉淀(MICP)技术及其生化机制、影响因素和工程应用 | 环境生物技术, 岩土工程, 材料科学 | NA | 微生物诱导碳酸盐沉淀(MICP),涉及脲酶和碳酸酐酶(CA)驱动的代谢途径 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | 环境修复, 岩土工程, 材料科学, 医学(重金属和放射性核素固定), 建筑, 土壤稳定, 二氧化碳封存, 生物材料 |
| 190 | 2026-10-21 |
Programmable plant chassis for sustainable biomanufacturing of high-value natural products
2026-Sep-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109044
PMID:42735758
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综述 | 本文综述了可编程植物底盘在可持续生物制造高价值天然产物方面的最新进展,包括遗传元件、生物合成途径解析与优化以及未来挑战 | 系统整合了植物底盘开发所需的天然与合成遗传元件,并重点总结了生物碱、萜类和苯丙素类化合物生物合成途径的解析、重建与优化策略,强调提高生产率的途径工程方法 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于文献综述,缺乏对植物底盘大规模工业应用瓶颈的定量分析 | 总结植物底盘在可持续生物制造高价值天然产物方面的最新进展,并为推动植物底盘从实验室研究走向可持续工业应用提供概念指导和实践见解 | 植物底盘(植物系统)及其用于生产的天然产物,包括生物碱、萜类和苯丙素类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、途径工程、遗传元件工程 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | 生物合成途径(生物碱、萜类、苯丙素类代谢途径) | 医药,工业生物技术 |
| 191 | 2026-10-21 |
Harnessing synthetic circuits to illuminate microbial electron transfer: a perspective on engineered metabolism
2026-Apr-30, Journal of microbiology & biology education
IF:1.6Q2
DOI:10.1128/jmbe.00290-25
PMID:41627025
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评论 | 本文是一篇关于利用合成基因回路增强微生物胞外电子传递的展望文章,重点评述了近期一项通过工程化微生物生产并释放氧化还原介体来提升产电性能的研究 | 将合成生物学回路设计与微生物电子传递研究相结合,并强调其作为氧化还原平衡、基因调控和代谢工程教学案例的教育价值 | 作为展望文章,未提供原始实验数据,主要基于已有研究进行评述,缺乏系统性实验验证 | 探讨合成回路如何阐明微生物电子传递机制,并推动生物电子设计与跨学科教学 | 工程化微生物及其合成的氧化还原活性代谢物(吩嗪-1-羧酸) | 合成生物学 | NA | 合成基因回路 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 合成基因回路(用于生产并释放吩嗪-1-羧酸) | 能源,环境,医学 |
| 192 | 2026-10-21 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
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综述 | 本文综述了无细胞转录翻译(TXTL)系统的发展历程、组成、优势、应用及面临的挑战与未来方向 | 系统梳理了从1960年代基于大肠杆菌提取物到如今涵盖细菌、酵母和真核生物提取物的TXTL平台演进,并全面总结了其相对于细胞法的优势与待解决问题 | TXTL系统仍存在成本高、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定等限制 | 总结无细胞转录翻译系统的发展现状,探讨其优势、应用领域及未来改进方向 | 无细胞转录翻译(TXTL)系统及其提取物(包括细菌、酵母和真核生物来源) | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译(TXTL) | NA | 文本 | NA | NA | 大肠杆菌, 酵母, 真核生物 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 193 | 2026-10-19 |
Microalgae-based removal and biodegradation of antibiotics: mechanisms, synergistic consortia, and engineering prospects
2026-Oct-17, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10393-9
PMID:42891879
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综述 | 综述微藻去除与生物降解抗生素的机制、藻菌协同 Consortium 及工程化前景 | 将藻菌颗粒污泥协同、藻际界面耐药基因调控与合成生物学、机器学习等工程工具整合为系统框架 | 固定化、合成生物学与机器学习等新兴工具的可扩展性与长期性能尚未验证 | 总结微藻去除抗生素的机制并探索可持续低碳生物修复技术路线 | 微藻、藻际共生细菌、藻菌颗粒污泥系统及抗生素污染物 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附、酶介导转化、共代谢、固定化、合成生物学、机器学习 | 机器学习 | 文本 | NA | 固定化, 合成生物学, 机器学习 | 微藻, 细菌 | NA | 环境, 医学 |
| 194 | 2026-10-19 |
Smart carrier-engineered microbial consortia for precision nutrient delivery in next- generation biofertilizers
2026-Oct-17, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01613-z
PMID:42891916
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综述 | 本文综述了工程化微生物联合体与智能载体系统在下一代生物肥料中的最新进展,重点讨论封装技术和控释系统以提高养分利用效率 | 将合成生物学工程化的微生物联合体与先进智能载体技术(如生物聚合物水凝胶、纳米材料、响应性封装基质)相结合,实现微生物的保护、控释和土壤持久性 | 传统微生物接种剂田间表现不稳定,微生物在田间条件下存活率有限,环境因素影响大,养分释放控制不佳 | 探讨工程化微生物联合体、先进封装技术和控释系统在提高下一代生物肥料养分利用效率方面的应用 | 工程化微生物联合体、智能载体系统、生物肥料 | 合成生物学, 农业生物技术 | NA | 合成生物学, 微生物工程, 生物材料, 封装技术(喷雾干燥、离子凝胶化、挤出、微流控封装) | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 195 | 2026-10-19 |
Immuno-metabolic crosstalk in osteoarthritis: from mechanisms to therapies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1946261
PMID:42889420
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综述 | 本文综述了骨关节炎中免疫与代谢过程之间的双向交互作用及其机制,并探讨了针对该交互的新兴治疗策略 | 系统整合了免疫细胞激活与代谢功能障碍在骨关节炎中的双向串扰,并提出了结合多组学、人工智能和个性化医学的免疫代谢治疗新框架 | 为叙述性综述,未进行系统性文献检索与定量分析;免疫代谢过程的因果相关性及相对贡献在不同骨关节炎表型间存在差异,相关证据仍不充分 | 总结骨关节炎进展过程中免疫与代谢过程的双向串扰,并探讨靶向免疫代谢通路的治疗策略 | 骨关节炎及其炎症型和代谢失调型亚型 | 医学 | 骨关节炎 | 多组学技术 | NA | 文本 | NA | 基因编辑 | NA | NA | 医学 |
| 196 | 2026-10-18 |
Targeted immune modulation through smart biomaterials and programmable biopharmaceuticals: A review
2026-Oct-16, Journal of biomaterials applications
IF:2.3Q4
DOI:10.1177/08853282261483961
PMID:42886884
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综述 | 本文综述了通过智能生物材料和可编程生物制药实现靶向免疫调节的最新进展,包括混合生物材料-生物制剂系统 | 系统总结了能响应疾病微环境信号(如pH变化、缺氧、氧化应激和炎症酶)的智能生物材料,以及通过工程化生物机制指导免疫细胞行为和分子信号的可编程生物制药,并强调了混合平台将环境响应性与生物治疗效力相结合的优势 | 存在生物复杂性、制造可扩展性、长期安全性评估和监管转化等挑战 | 探讨通过智能生物材料、可编程生物制药及混合系统实现靶向免疫调节,推动从传统全身免疫调节向自适应和位点特异性免疫控制转变 | 免疫介导疾病相关的免疫调节疗法、智能生物材料、可编程生物制药及混合生物材料-生物制剂系统 | 免疫工程 | 免疫介导疾病 | NA | NA | 文本 | 2022年至2026年间发表的同行评议研究 | NA | NA | NA | 医学 |
| 197 | 2026-10-18 |
Intratumoral microbiota in cancer immunotherapy: metabolic-epigenetic crosstalk and engineered bacterial therapeutics
2026-Oct-16, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00840-x
PMID:42888465
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综述 | 文章综述了肿瘤内微生物群通过代谢-表观遗传互作影响免疫治疗疗效的机制,以及工程化细菌作为可编程活体疗法在癌症免疫治疗中的应用 | 系统整合了肿瘤内微生物群代谢产物(短链脂肪酸、次级胆汁酸、氧化三甲胺、色氨酸衍生物)通过DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA重塑宿主表观遗传并调控抗肿瘤免疫的机制;同时总结了合成生物学工程菌实现肿瘤特异性定植、可控药物释放及多模式功能(细胞因子分泌、免疫检查点阻断、STING通路激活、代谢重编程)的治疗策略 | 存在异质性、抗载体免疫和制造复杂性等临床转化挑战 | 阐明肿瘤内微生物群在癌症免疫治疗中的代谢-表观遗传串扰机制,并探讨靶向肿瘤内微生物群的工程化细菌治疗策略 | 肿瘤内微生物群、微生物代谢产物、宿主免疫微环境、表观遗传景观、工程化细菌 | 肿瘤免疫学, 微生物组学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 工程化细菌 | 工程化细菌活体治疗系统(肿瘤特异性定植、可控药物释放、细胞因子分泌、免疫检查点阻断、STING通路激活、代谢重编程) | 医学 |
| 198 | 2026-10-18 |
The Potential of Self-Maintainable Living Materials
2026-Oct-14, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.78082
PMID:42873924
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综述 | 本文综述了工程活体材料(ELMs)的设计原理、当前挑战及转化路径,探讨其作为自维持自主系统的潜力 | 将自主性定位为下一代活体材料的定义性能力,系统整合合成生物学中的可编程基因电路、群体感应通信和代谢工程,实现闭环决策与最小外部输入下的功能维持 | 在进化稳定性、生物防护、长期存活性和可规模化制造方面仍存在关键挑战 | 考察自维持自主活体材料的设计原理、当前挑战和转化路径,以实现其在真实环境中的持续运行 | 工程活体材料(ELMs),包括整合了微生物、真菌、藻类和哺乳动物细胞的結構支架系统 | 合成生物学 | NA | 可编程基因电路,群体感应通信,代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物,真菌,藻类,哺乳动物细胞 | 可编程基因电路,群体感应通信,闭环决策系统 | 建筑,农业,环境修复,生物能源,生物医学 |
| 199 | 2026-10-18 |
Synthetic Approaches as Empirical Tools for Testing Evolutionary Theory
2026-Oct-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag245
PMID:42817818
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综述 | 综述合成方法(如深度突变扫描、祖先序列重建、受控进化和合成生物学)如何作为实证工具检验进化理论的基本问题 | 系统梳理高通量图谱、重建实验、受控进化和合成生物学等方法在检验突变效应分布、适应度地形、可进化性、发育约束、历史偶然性等进化理论问题中的新发现 | 作为综述,未提供原始实验数据,且合成方法在模拟自然进化复杂性方面仍存在局限 | 探讨合成方法如何重塑和扩展进化生物学的基础理论问题 | 进化理论中的核心问题,包括突变效应分布、适应度地形结构、可进化性、发育约束、历史偶然性和进化系统工程 | 进化生物学 | NA | 深度突变扫描、祖先序列重建、受控进化、合成生物学 | NA | 序列、表型 | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 200 | 2026-10-18 |
Evolutionary chemical learning in dimerization networks
2026-Sep, Physical review. E
DOI:10.1103/bszq-gftl
PMID:42888651
|
研究论文 | 本文提出了基于竞争性二聚化网络(CDN)的化学学习框架,通过定向进化在体外训练网络,实现多类分类等学习任务 | 利用分子物种间的可逆二聚化作为可调突触权重,通过定向进化(突变、选择、扩增)在无数字硬件和无需预知所有微观结合常数的情况下训练网络完成学习任务,并引入对比增强损失函数提升性能 | 研究基于数值模拟,尚未进行实际体外实验验证;依赖定向进化过程可能耗时且受实验条件限制 | 探索竞争性二聚化网络作为化学学习平台的可行性,实现模拟物理计算并连接合成生物学与机器学习 | 竞争性二聚化网络(CDN),由蛋白质或DNA-RNA寡聚体等分子物种组成 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 定向进化, 数值模拟 | 竞争性二聚化网络(CDN) | 数值模拟数据, 分子结合亲和力数据 | NA | 定向进化, 突变, 选择, 扩增 | NA | 竞争性二聚化网络(CDN),分子物种类似神经元,结合亲和力作为可调突触权重 | 医学, 工业生物技术 |