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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-07-21 |
Bioactive Peptides for Oral Diseases: Biomaterial-Assisted Therapeutics and Translational Applications
2026-Jul-20, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00571
PMID:42411007
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综述 | 综述生物活性肽在口腔疾病中的生物材料辅助治疗策略及转化应用 | 整合生物活性肽与生物材料平台(纳米颗粒、水凝胶、涂层、黏膜黏附系统)的设计与功能修饰,提出基于人工智能和合成生物学的下一代口腔治疗框架 | 临床转化受限于酶不稳定性、短停留时间、口腔微环境中渗透有限以及递送效率低 | 总结生物活性肽在口腔疾病中的研究进展,强调生物材料辅助治疗策略并讨论转化挑战 | 生物活性肽及生物材料递送系统 | 机器学习, 自然语言处理 | 牙龈疾病、牙周炎、口腔黏膜炎症、种植体周围感染、口腔组织缺损 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物材料 |
| 202 | 2026-07-21 |
Enabling Clinical Translation of Oral Probiotics Through Formulation Engineering and Scalable Manufacturing
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70253
PMID:42226613
|
综述 | 系统综述了口服益生菌的配方工程和可扩展制造技术,旨在推动其临床转化 | 强调配方工程中功能输出替代单纯结构保护,并整合合成生物学驱动菌株工程与规模化制造平台 | 各技术的临床可行性评估缺乏具体动物或人体数据支持,且综述未涉及剂量优化和长期安全性分析 | 推动口服益生菌从基础研究向临床应用转化,实现精准医疗中安全有效的个性化治疗 | 口服益生菌的配方策略和制造平台技术 | NA | 结直肠癌、炎症性肠病、代谢紊乱、神经炎症疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 口服益生菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 203 | 2026-07-21 |
Butyrate-Producing Bacteria in Intestinal Disease Therapy: Potential and Challenges
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70260
PMID:42307077
|
综述 | 综述了产丁酸细菌在肠道疾病治疗中的潜在作用和面临的挑战 | 系统整合了产丁酸细菌通过多种机制维持肠道健康的最新认识,并评估了丁酸疗法从炎症性肠病到结直肠癌及新兴应用的转化路径 | 丁酸疗法的转化面临极端氧敏感性、跨界营养网络复杂性以及宿主环境依赖性等关键瓶颈 | 探讨产丁酸细菌在肠道疾病治疗中的应用潜力与挑战 | 产丁酸细菌(包括普拉梭菌、罗斯氏菌属和直肠真杆菌) | 微生物组学 | 炎症性肠病、结直肠癌、辐射损伤、感染、移植物抗宿主病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 人类肠道 | NA | 医学 |
| 204 | 2026-07-21 |
Metabolic and Synthetic Biology Strategies for Enhancing Single-Cell Protein Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70273
PMID:42345366
|
综述 | 本文综述了以酿酒酵母为底盘细胞,利用代谢和合成生物学策略提高单细胞蛋白产量和细胞生物量的方法 | 系统总结了通过代谢工程与合成生物学手段提升酿酒酵母单细胞蛋白含量的最新策略,并强调其在全球粮食安全和碳中和目标中的应用前景 | 未涉及大规模生产的实际成本和产业化挑战评估 | 提高酿酒酵母单细胞蛋白产量以实现可持续规模化生产 | 酿酒酵母作为单细胞蛋白生产的底盘细胞 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | NA | 饲料、食品 |
| 205 | 2026-07-21 |
Meta-analysis of fruit waste-derived single-cell protein for programmable nutrition via synthetic biology in sustainable food systems
2026-May-09, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-026-00850-3
PMID:42106370
|
meta-analysis | 系统综述了水果加工废弃物转化为单细胞蛋白的研究,评估了其作为可持续蛋白质替代品的潜力 | 首次通过荟萃分析整合了水果废弃物生产单细胞蛋白的生物量产率与蛋白质含量数据,并探讨了合成生物学在营养编程中的应用前景 | 直接针对水果废渣基质验证的工程菌研究有限,缺乏人体临床或体内数据支持 | 评估水果废弃物来源单细胞蛋白在可持续食品系统中的营养可编程性及环境效益 | 水果加工废弃物(年产量超5亿吨)和微生物蛋白生产平台 | NA | NA | 合成生物学、精准发酵 | NA | NA | 符合PRISMA标准的同行评审研究(未明确具体数量) | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN (推测用于工程菌改造) | 酿酒酵母(S. cerevisiae)、大肠杆菌(E. coli)等微生物 | 营养强化通路(如赖氨酸、蛋氨酸生物合成) | 食品、环境、工业生物技术 |
| 206 | 2026-07-21 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-03-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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research paper | 通过重新定位前体肽的引导序列,展示了在Graspetide生物合成中保持底物选择性修饰的可能性,并构建了嵌合RiPP产物 | 首次将fuscimiditide前体肽的N末端引导序列重新定位至核心肽C末端,仍能保持ThfB介导的翻译后修饰活性,并通过双引导序列策略生成包含套索肽和Graspetide家族酶修饰的机械互锁肽产物 | 重新定位引导序列后酶促修饰速率降低约2倍,可能限制在高通量应用中的效率 | 探索通过重新定位引导序列扩展核糖体合成及翻译后修饰肽(RiPPs)结构多样性的策略 | fuscimiditide前体肽及其引导序列、ThfB合成酶、套索肽和Graspetide家族修饰酶 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成及翻译后修饰(RiPPs)生物合成途径重构 | NA | NA | 多个前体肽变体用于酶动力学和嵌合产物分析 | NA | NA | 嵌合RiPP生物合成途径(含N端和C端双重引导序列) | 工业生物技术、药物开发 |
| 207 | 2026-07-21 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-03-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
|
研究论文 | 报告一种基于合成生物学的无细胞生物报告器,用于环境中的四环素和大环内酯类抗生素检测 | 开发了一种无需活细胞的无细胞生物报告系统,消除了生物安全问题,具有高灵敏度、特异性和准确性,且可通过冻干长期保存,适用于现场部署 | 未提及具体局限性 | 开发一种便携、易用且适合现场部署的抗生素检测工具,用于环境监测 | 四环素和大环内酯类抗生素 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录反应,抗生素响应转录因子,RNA聚合酶,工程DNA转录模板 | NA | 荧光信号 | 真实水样(具体数量未提及) | NA | NA | 抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程DNA转录模板组成的无细胞生物报告电路 | 环境 |
| 208 | 2026-07-20 |
Artificial Intelligence and Protein Design: A retrospective study on 20-year emerging trends and core research areas from bibliometric perspectives
2026-Jul-18, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11131-6
PMID:42470596
|
回顾性研究 | 对人工智能与蛋白质设计领域二十年来研究趋势与核心领域进行文献计量分析 | 通过文献计量方法系统揭示AI驱动蛋白质设计的发展轨迹、国家影响力差异及三大知识聚类,并指出未被充分讨论的局限性 | 模型对稳定可结晶结构的依赖性、静态预测忽略构象动态变化、计算机模拟置信度与湿实验结果脱节,且需要双向耦合高通量实验反馈 | 从文献计量视角分析AI与蛋白质设计交叉领域的发展趋势和核心研究方向 | 2006-2025年间Web of Science数据库中的蛋白质设计相关文献 | 人工智能,文献计量学 | NA | 文献计量分析 | 深度学习模型(如AlphaFold2, RoseTTAFold, ProteinMPNN, RFdiffusion) | 文献元数据(引用、共被引、关键词等) | Web of Science数据集(2006-2025年) | NA | NA | NA | 合成生物学,药物发现,生物工程 |
| 209 | 2026-07-19 |
Genome position does not impact transgene expression efficiency in the ancient red alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.05.004
PMID:42107704
|
研究论文 | 研究了古红藻Cyanidioschyzon merolae中基因组位置对转基因表达效率的影响 | 首次在C. merolae中建立并验证了一组中性整合位点,发现基因组位置对转基因表达无显著影响 | 仅针对单一宿主和特定转基因进行分析,可能不适用于其他基因或物种 | 探究基因组位置对转基因表达的影响并建立可重复的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae的40个基因间位点 | 合成生物学 | NA | 同源重组, 自动化转化, 报告基因分析 | NA | 基因表达数据, 代谢物产量数据 | 38个经验证的整合位点,涵盖16条染色体 | 同源重组, 机器人辅助转化 | Cyanidioschyzon merolae | 异源异戊二烯合酶表达回路 | 工业生物技术 |
| 210 | 2026-07-19 |
Evaluation of Ogataea polymorpha DUR31 TPP riboswitch as a tool to downregulate gene expression in the yeast Komagataella phaffii
2026-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.06.009
PMID:42372865
|
研究论文 | 评估了Ogataea polymorpha DUR31 TPP核糖开关在Komagataella phaffii中作为基因表达下调工具的适用性 | 首次将来自多形汉逊酵母的TPP核糖开关应用于毕赤酵母Komagataella phaffii,补充了该宿主中有限的合成生物学调控工具 | 核糖开关存在显著的基础渗漏表达,不能作为严格的分子开关;剪接效率受局部序列上下文强烈影响 | 评估异源TPP核糖开关在K. phaffii中调控基因表达的可行性 | Komagataella phaffii酵母 | 工业生物技术 | NA | 流式细胞术、RT-PCR | NA | 荧光表达数据、转录本剪接数据 | NA | NA | Komagataella phaffii | TPP核糖开关,通过GAP启动子调控EGFP和UBIYΔkGFP*报告基因表达 | 工业生物技术 |
| 211 | 2026-07-19 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
|
观点文章 | 提出纳米流体学作为自下而上无细胞分子系统合成生物学的变革性平台 | 利用纳米限域效应和精准质量传输实现分子构建块的主动组装,构建有序时空结构 | 纳米流体技术构建下一代单分子分辨率无细胞分子系统仍面临关键挑战 | 推动自下而上无细胞分子系统的合成生物学发展 | 无细胞分子系统的分子构建块 | 合成生物学 | NA | 纳米流体学 | NA | NA | NA | NA | NA | 分子主动组装系统 | 合成生物学 |
| 212 | 2026-07-19 |
A Comprehensive Review on Metabolomics-Guided Metabolite Production in Plant Tissue Culture: Integrating Omics and Synthetic Biology for Enhanced Yields
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00352
PMID:42301185
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综述 | 回顾了将代谢组学与合成生物学及多组学框架相结合,推动植物组织培养中次生代谢产物生产的进展 | 将植物组织培养从试错实践转变为预测性系统工程领域,整合代谢组学作为决策层,连接代谢表型与理性途径设计 | 仍面临分析覆盖度、培养稳定性和代谢可预测性等挑战 | 探索代谢组学引导下植物组织培养中代谢产物生产的综合策略 | 植物组织培养体系中的次生代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢组学, 合成生物学, 多组学整合 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成启动子, 模块化基因电路 | 植物细胞 | 代谢途径编辑, 异源表达系统, 生物传感器 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 213 | 2026-07-19 |
SARGE: Serine Integrase-Assisted Rapid Genome Integration through Cassette Exchange in Escherichia coli
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00334
PMID:42319839
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研究论文 | 本研究报道了SARGE,一种丝氨酸整合酶辅助的快速基因组整合平台,通过盒交换实现大肠杆菌中大型DNA片段的迭代插入 | 结合正交丝氨酸整合酶PhiC31和Bxb1与理性供体质粒设计,无需抗性标记切除即可实现快速可编程整合循环,并采用双荧光报告系统实现裸眼菌落筛选 | 未明确说明局限性 | 开发一种高效、可扩展的迭代基因组整合平台,简化大肠杆菌的基因组工程流程 | 大肠杆菌基因组整合过程 | 合成生物学 | NA | 丝氨酸整合酶介导的盒交换 | NA | NA | NA | PhiC31整合酶, Bxb1整合酶, 双荧光报告系统 | 大肠杆菌 | 双荧光报告系统(sfGFP和mKate) | 合成生物学, 基因组工程 |
| 214 | 2026-07-19 |
Metabolic Engineering of Microbial Cell Factories for Sustainable Production of Glycolic Acid: Pathways, Chassis, and Strategies toward Poly(glycolic acid) Bioplastics
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00078
PMID:42340804
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综述 | 系统总结了通过微生物细胞工厂可持续生产乙醇酸的最新进展,并探讨了生产聚乙醇酸生物塑料的策略 | 全面综述了乙醇酸生物合成的多种途径、底盘生物及代谢工程策略,并整合了系统代谢工程与AI辅助设计及过程优化的未来方向 | 未详细讨论具体实验验证数据,仅基于文献综述,可能缺乏实际工业应用中的技术细节和成本分析 | 探索通过微生物发酵可持续生产乙醇酸的途径和策略,以支持聚乙醇酸生物塑料的工业化和循环生物经济 | 微生物细胞工厂、乙醇酸生物合成途径、微生物底盘生物、基于乙醇酸的生物塑料 | 合成生物学, 代谢工程, 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本和综述数据 | NA | NA | 微生物, 例如大肠杆菌、酵母等 | 乙醛酸旁路、C5-糖裂解途径、新型生物合成途径 | 材料, 工业生物技术, 环境 |
| 215 | 2026-07-19 |
Microfluidics-Based Engineering of Molecular Self-Assembly and Manufacturing for Artificial Cell Systems
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00249
PMID:42358072
|
观点文章 | 探讨微流控技术与分子自组装协同构建人工细胞系统的工程策略 | 提出微流控不应仅替代生物调控,而应作为提供外在物理边界条件的平台,引导和放大分子自组装的潜力 | 仅停留在概念框架层面,未提供具体实验验证或量化分析 | 构建功能化、可规模化的人工细胞系统 | 人工细胞系统 | 合成生物学 | NA | 微流控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 216 | 2026-07-19 |
Rapid and Continuous Directed Evolution in Vibrio natriegens Utilizing an In Vivo Hypermutation System
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00936
PMID:42362483
|
研究论文 | 在最快生长的非致病菌Vibrio natriegens中建立基于胞苷脱氨酶-T7 RNA聚合酶融合蛋白(MutaT7)的体内超突变系统,实现蛋白质的快速连续定向进化 | 首次在Vibrio natriegens中建立MutaT7系统(VnMutaT7),利用其极快生长速度(倍增时间仅为大肠杆菌一半),在36小时内实现TEM-1蛋白质对头孢他啶的高水平抗性进化 | 未明确说明系统的脱靶效应、突变谱局限性或对宿主基因组的潜在影响 | 在Vibrio natriegens中建立快速连续定向进化平台,加速蛋白质工程 | MutaT7系统、Vibrio natriegens宿主菌、TEM-1模型蛋白 | 合成生物学 | NA | 体内超突变系统、定向进化 | NA | NA | NA | MutaT7 | Vibrio natriegens | MutaT7系统(胞苷脱氨酶与T7 RNA聚合酶融合蛋白) | 工业生物技术 |
| 217 | 2026-07-19 |
Beyond Compartmentalization: Deciphering Reaction Kinetics in Liquid-Liquid Phase Separation for Rational Biotechnological Design
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00259
PMID:42350320
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综述 | 综合阐述液-液相分离如何通过反应物浓度、反应-扩散耦合、微环境工程和酶活性调控等机制影响反应动力学,并总结其在生物催化、代谢工程、诊断、治疗及人工细胞构建等领域的应用 | 首次系统整合蛋白质介导和非蛋白质介导的液-液相分离,深入解析其对反应动力学的精确调控机制,并提供理性设计下一代合成生物学应用的设计指南 | 当前对液-液相分离如何精确调控反应动力学尚缺乏完整的机制理解,阻碍了基于相分离的应用的理性设计和优化 | 填补液-液相分离在反应动力学调控机制方面的知识空白,为合成生物学应用提供设计原理 | 液-液相分离系统及其对生物反应过程的调控 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 代谢工程, 诊断, 治疗, 人工细胞构建, 生命起源研究 |
| 218 | 2026-07-19 |
Probiotics unveiled: bridging general health benefits to the era of precision medicine
2026-Jul-17, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05143-1
PMID:42463603
|
综述 | 该文章综述了益生菌从一般健康增强剂向精准医疗中靶向疗法的转变过程 | 该文整合了精神生物学、下一代益生菌、改良菌株、人工智能和合成生物学技术,重新定义了益生菌在个性化医疗中的作用 | NA | 探讨益生菌从一般健康促进到精准医疗时代靶向疗法的转变及其机制 | 益生菌及其在精准医疗中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 医疗 |
| 219 | 2026-07-19 |
Protein engineering: Status report
2026-Jul-17, Protein engineering, design & selection : PEDS
DOI:10.1093/protein/gzag020
PMID:42466865
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综述 | 提供蛋白质工程领域的及时概览,涵盖核心方法和主要应用领域 | 强调机器学习与人工智能方法的日益增长的影响,并指出蛋白质工程正迅速发展的黄金时代 | 尽管进展迅速,但设计、筛选和实际应用方面仍面临重大挑战 | 概述蛋白质工程领域的最新进展与未来方向 | 通过对蛋白质进行工程改造以创建新型或改进的蛋白质 | NA | NA | 计算生物学、分子生物学、结构引导、进化与合成方法 | 机器学习与人工智能模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 制药、分子成像、诊断、塑料回收、工业化学 |
| 220 | 2026-07-19 |
γ-Class carbonic anhydrases: Ancient enzymes at the interface of early earth metabolism, microbial physiology, and modern biochemical innovation
2026-Jul-17, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153551
PMID:42468588
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综述 | 综述γ-类碳酸酐酶的进化、结构、机制及其在微生物生理和生物技术中的应用 | 强调了γ-类碳酸酐酶作为最古老碳酸酐酶谱系的地位,揭示了其催化可塑性和在工业CO₂捕获及合成生物学中的新应用 | 关于CamH亚类催化机制和催化混杂性的未解决问题仍然存在 | 系统总结γ-类碳酸酐酶的结构、机制和功能知识,勾勒未来研究方向 | γ-类碳酸酐酶及其在古菌和细菌中的生理功能 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 原核生物(如古菌、霍乱弧菌等) | CO₂水合酶系统 | 医学、环境、工业生物技术 |