合成生物学相关文章

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当前共找到 1806 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
201 2026-10-18
The plant Golden Gate toolkit: compatibility, interoperability, and harmonized assembly in plant synthetic biology
2026-Jul-21, Plant methods IF:4.7Q1
综述 该综述全面概述了超过25种成熟的植物特异性Golden Gate克隆试剂盒,深入探讨了其模块的兼容性,并提出了提高系统协调性的关键方法 系统梳理了植物特异性Golden Gate克隆试剂盒的兼容性与互操作性,提出了包括驯化策略、甲基化酶辅助的分级DNA组装以及多克隆位点在内的系统协调化方法 作为综述文章,未提供新的实验数据验证所提出的协调化策略 改善植物合成生物学中Golden Gate克隆试剂盒之间的兼容性与互操作性,简化克隆工作流程并降低新技术门槛 超过25种植物特异性Golden Gate克隆试剂盒及其模块 合成生物学 NA Golden Gate克隆 NA 文本 超过25种植物特异性Golden Gate克隆试剂盒 Golden Gate Assembly 植物 遗传模块和转录单元的标准化组装 农业
202 2026-10-17
DNA Nanotechnology-Based Robotic Devices for Frontier Applications in Healthcare
2026-Oct-16, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
综述 本文综述了基于DNA纳米技术的机器人设备(DNRDs)在医疗保健领域的发展、设计原理、机制基础及前沿应用 系统总结了DNA折纸、DNA步行器和分子逻辑电路驱动的动态刺激响应系统,涵盖逻辑门控纳米药丸、精准生物传感器和自主治疗剂等新兴应用,并提出了提升安全性、稳健性和临床可转化性的新兴策略 在复杂生理环境中的结构稳定性难以维持,可扩展且低成本的制造困难,以及免疫原性、毒性、脱靶活性、意外激活、生物分布和长期生物命运等监管与安全问题限制临床转化 全面讨论DNRDs的演化、设计原则和机制基础,评估其在诊断、治疗和合成生物学中的作用,并探讨转化局限与未来发展方向 基于DNA纳米技术的机器人设备(DNRDs),包括DNA折纸、DNA步行器和分子逻辑电路 合成生物学 NA DNA折纸,DNA步行器,分子逻辑电路 NA 文本 NA DNA折纸,DNA步行器,分子逻辑电路 NA 分子逻辑电路,逻辑门控纳米药丸,生物传感器 医学,合成生物学
203 2026-10-17
Engineering root development with high precision
2026-Oct-16, The New phytologist
综述 该文章讨论了如何利用单细胞技术、空间转录组学和合成生物学整合谱系追踪、发育历史遗传记录、细胞类型特异性工程和可编程遗传回路,以理解和控制植物根系结构 提出整合谱系追踪、发育历史遗传记录、细胞类型特异性工程和可编程遗传回路来理解和控制根系结构,并强调工程化自适应和情境依赖发育行为的新兴策略,包括历史依赖和可逆响应程序以及重连根系-环境相互作用 未提及 探讨如何整合多种前沿技术来理解和精确工程化植物根系发育 植物根系发育 合成生物学 NA 单细胞技术、空间转录组学、合成生物学 NA NA NA 可编程遗传回路 植物 可编程遗传回路、历史依赖和可逆响应程序 农业
204 2026-10-17
Building Capacity for the Engineering of Biology and Biomanufacturing in Finland
2026 Jan-Dec, Engineering biology
综述 本文综述了芬兰在工程生物学与生物制造领域的发展历程、产业现状及未来机遇,重点关注工业生物技术中的微生物生产食品组分和药物产品 系统梳理了芬兰从1980年代基因工程投资到合成生物学与生物铸造厂活动的演进路径,并首次将代谢工程、系统生物学、组学技术与生物信息学整合视角用于分析国家生物经济发展 文章为综述性总结,缺乏原始实验数据,未涉及具体技术细节或定量模型验证 总结芬兰在工程生物学和生物制造领域的能力建设历程与产业影响,为绿色转型和生物经济背景下的发展提供参考 芬兰生物技术产业、工业生物技术、医学生物技术、植物生物技术及相关研究机构与企业 合成生物学 NA 代谢工程, 系统生物学, 基因组学, 组学技术, 生物信息学, 细胞水平建模 NA 文本 830余家生物技术公司,营业额71亿欧元,约19400名从业人员 NA NA NA 工业生物技术, 医药, 食品, 生物经济, 农业
205 2026-10-17
Integrated multi-omics and genome mining strategies for activating cryptic polyketide biosynthetic gene clusters in Streptomyces: an overview
2026, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2
综述 本文综述了整合多组学和基因组挖掘策略激活链霉菌中隐秘聚酮生物合成基因簇的方法,并提出了一个整合计算预测、多组学验证和精准工程的框架。 提出了一个整合计算BGC预测、多组学验证和精准工程(包括启动子工程、转录因子诱饵、底盘菌株优化)的框架来优先激活链霉菌中的隐秘聚酮途径;讨论了AI设计的启动子、CRISPR碱基编辑、染色质拓扑重连等新技术在激活BGC中的应用。 文章为综述,未提供原始实验数据;所提出的整合框架仍需实验验证。 总结并展望激活链霉菌中隐秘聚酮生物合成基因簇的策略,推动从描述性BGC目录向可扩展的预测模型转变,以促进新一代药物发现。 链霉菌中的聚酮生物合成基因簇 合成生物学, 基因组挖掘, 多组学 NA 多组学整合, 基因组挖掘, 合成生物学方法, 精准基因组编辑工具, CRISPR-Cas系统(包括碱基编辑), AI设计的启动子 NA 基因组数据, 多组学数据 NA CRISPR-Cas9, 碱基编辑 链霉菌 NA 医药, 农业
206 2026-10-16
Enhancing the Secretion Systems: Genetic Engineering of Super Bioagents for Effective Plant Disease Control
2026-Nov, Biotechnology and bioengineering IF:3.5Q2
综述 本文综述了通过CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白酶工程和合成生物学改造微生物分泌系统,开发超级生物制剂用于植物病害防控的研究进展 提出通过合理定量的微生物分泌系统工程将传统生物防治剂转化为超级生物制剂的假设,并构建了连接分泌效率、调控和田间表现的系统级生物工程框架 生物防治剂大规模部署仍面临挑战,超级生物制剂的田间适应性和有效性有待进一步验证 探索微生物分泌系统的分子机制及超级生物制剂作为植物病害管理前沿的潜力 微生物分泌系统、传统生物防治剂、超级生物制剂、植物微生物组 合成生物学 植物病害 CRISPR/Cas基因组编辑, 蛋白酶工程, 合成生物学 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 NA 增强型分泌系统 农业
207 2026-10-16
CLEAN Database: providing enzyme function coverage for over 55 million sequences
2026-Oct-15, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 该文章介绍了一个名为CLEAN Database的综合数据库,包含超过5500万条酶功能注释,覆盖1,098,305个菌株,由CLEAN AI模型预测,并提供网页界面和突变效应预测功能 利用AI模型CLEAN对超过5500万条序列进行酶功能注释,覆盖超过100万个菌株,并基于蛋白质语言模型提供突变效应预测的交互式可视化 酶功能注释基于AI预测而非实验验证,可能包含预测错误 提供全面的酶功能注释资源,促进酶发现及其在合成生物学、代谢工程等领域的应用 酶蛋白序列 机器学习 NA 蛋白质语言模型 CLEAN AI模型 文本 55,000,000条酶功能注释,来自1,098,305个菌株 NA NA NA 医学, 工业生物技术
208 2026-10-16
Elucidating the molecular mechanism of tryptophan-derived indole metabolite biosynthesis in Lactiplantibacillus plantarum DPUL-S164
2026-Oct-14, Journal of the science of food and agriculture IF:3.3Q2
研究论文 该研究通过基因组功能注释、生物信息学分析、高效液相色谱和实时荧光定量PCR,系统阐明了植物乳杆菌DPUL-S164代谢色氨酸产生吲哚-3-乳酸、吲哚-3-乙酸的分子调控机制 首次鉴定gene0696和gene0697作为植物乳杆菌DPUL-S164中参与色氨酸代谢生产吲哚-3-乳酸途径的功能代谢基因簇,并系统揭示了多基因模块协同调控色氨酸代谢的分子机制 摘要中未明确提及研究局限性 系统阐明植物乳杆菌DPUL-S164代谢色氨酸产生吲哚-3-乳酸、吲哚-3-羧醛和吲哚-3-乙酸的分子调控机制 植物乳杆菌DPUL-S164及其色氨酸代谢产物吲哚-3-乳酸、吲哚-3-乙酸和吲哚-3-羧醛 微生物学, 代谢组学, 合成生物学 NA 全基因组功能注释, 生物信息学分析, 高效液相色谱, 实时荧光定量PCR NA 基因序列, 代谢物定量数据, 基因表达数据 NA NA 植物乳杆菌DPUL-S164 色氨酸代谢途径(涉及芳香族氨基酸转氨酶、乳酸脱氢酶和醛脱氢酶的多基因模块协同调控) 医学, 食品, 工业生物技术
209 2026-10-16
Engineering microbial platforms for diversified biosynthesis of antidepressant tryptophan-derived neuroactive compounds
2026-Oct-09, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文综述了通过合成生物学、代谢工程和酶工程构建微生物细胞工厂,用于高效生物合成色氨酸衍生的抗抑郁神经活性化合物(如血清素、褪黑素、5-HTP、裸盖菇素等)的最新进展 聚焦于细菌血红素依赖型色氨酸羟化酶的新兴作用,以及AI辅助的酶和通路工程在扩展生物合成工具箱中的应用,并提出了将智能菌株设计与先进生物过程工程相结合的前瞻性思路 当前生产仍受限于低可持续性、选择性差和制造成本高;综述本身未提供原始实验数据,主要基于现有文献总结 总结和展望微生物平台合成色氨酸衍生抗抑郁神经活性化合物的研究进展,包括色氨酸过量生产、羟基化生物催化剂、下游生物合成途径和辅因子工程 色氨酸衍生的神经活性化合物,包括血清素、褪黑素、5-羟色氨酸(5-HTP)、裸盖菇素及相关吲哚衍生物 合成生物学,代谢工程 抑郁症,神经精神疾病 合成生物学,代谢工程,酶工程,AI辅助酶和通路工程 NA 文本 NA NA 微生物(具体宿主未明确) 色氨酸过量生产、羟基化生物催化、下游生物合成途径、辅因子工程等代谢通路 医学,工业生物技术
210 2026-10-16
Nanoparticles and the gut-microbiome: a dual strategy for oral brain delivery
2026-Sep-30, International journal of pharmaceutics IF:5.3Q1
综述 本文综述了口服脑部递送策略,提出将血脑屏障视为肠-微生物-脑轴动态系统的一部分,并重点探讨纳米颗粒和细菌胞外囊泡在克服肠道和血脑屏障中的作用 提出将血脑屏障视为受肠-微生物-脑轴影响的连续动态系统的一部分,并强调微生物组组成和代谢功能的个体差异对口服脑部递送的影响,倡导精准微生物组药理学 未涉及具体原始实验数据,主要基于现有文献的批判性评价和概念框架的提出 探讨口服脑部递送中纳米颗粒和肠道微生物组的双重策略,以克服血脑屏障和上游肠道屏障 口服脑部递送平台、纳米颗粒、细菌胞外囊泡、肠道微生物组 机器学习和其它 神经退行性疾病和精神疾病 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学
211 2026-10-16
Biocatalytic and synthetic biology strategies for S-type lignin valorization
2026-Sep-15, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
综述 本文综述了S型木质素单体生物转化为高价值产品的生物催化与合成生物学策略,重点分析了O-去甲基化和开环反应的代谢瓶颈及相关关键酶 系统聚焦于S型木质素单体(3,5-二甲氧基取代)的微生物代谢瓶颈,突出Rieske非血红素铁单加氧酶、四氢叶酸依赖型O-去甲基酶和细胞色素P450过氧化酶在去甲基化中的关键作用,并整合代谢工程策略解决辅因子失衡和中间体毒性问题 现有O-去甲基酶底物谱较窄,宿主对木质素衍生流股的耐受性不足,缺乏真实木质素衍生流股的验证,工业转化尚不成熟 总结木质素解聚、生物漏斗和合成生物学驱动的S型木质素单体转化路径设计的最新进展,提出未来研究方向以推动可持续生物经济和工业转化 木质素衍生的S型(紫丁香基)单体及其微生物生物转化途径 合成生物学,代谢工程 NA 生物催化,代谢工程,合成生物学,酶工程 NA 文本 NA NA NA 木质素解聚途径,生物漏斗途径,O-去甲基化代谢途径,合成生物学驱动的代谢通路 能源,材料,工业生物技术,环境
212 2026-10-16
Synthetic horizontal gene transfer for ecosystem restoration
2026-Aug-14, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过构建消费者-资源模型,探究合成水平基因转移对生态 consortium 中生物多样性和生物量恢复的影响 首次在多种群生态群落模型中研究工程质粒水平转移对生态系统恢复的机制与最优条件 基于理论模型,缺乏实验验证,且未考虑自然环境中的复杂因素 探索合成水平基因转移在生态系统恢复中的潜力和应用条件 土壤微生物群落生态 consortium 模型 机器学习 NA NA 消费者-资源模型 NA NA NA NA NA 环境
213 2026-10-16
A signal peptide-guided approach towards in situ functionalization of bacterial nanocellulose in Komagataeibacter rhaeticus
2026-Jul-17, Journal of biological engineering IF:5.7Q1
研究论文 该研究在Komagataeibacter rhaeticus中系统评估了信号肽介导的蛋白质转运机制,建立了单底盘细菌纳米纤维素原位功能化的合成生物学框架 首次在K. rhaeticus中全基因组鉴定Sec转运系统并系统性基准测试信号肽介导的蛋白质转运,实现了单底盘同时合成细菌纳米纤维素和原位功能化,开发了渗透休克释放策略将酶活性提高30% 重组蛋白被滞留在周质空间中,限制了其胞外可用性,影响了功能化效率 建立单底盘系统实现细菌纳米纤维素合成与原位功能化的同步进行,推动可编程生物工程活材料的发展 Komagataeibacter rhaeticus iGEM菌株及其产生的细菌纳米纤维素 合成生物学 NA 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、SignalP 5.0预测、荧光成像 NA 蛋白质组数据、荧光图像 NA NA Komagataeibacter rhaeticus 信号肽介导的蛋白质转运通路 材料、医学
214 2026-10-16
Cannabichromene (CBC): a comprehensive review of biosynthesis, pharmacology, therapeutic potential, and translational perspectives
2026-Jul-16, Journal of cannabis research IF:4.1Q1
综述 本文对大麻色烯(CBC)的生物合成、药理作用、治疗潜力及转化前景进行了全面综述 系统性整合了CBC在生物合成途径、独特受体作用谱(如TRPV通道激动及内源性大麻素再摄取抑制)及治疗应用方面的最新进展,并首次提出将纳米递送、合成生物学与多组学整合作为推动CBC临床转化的关键方向 缺乏临床试验数据,制剂局限性明显,监管体系碎片化,且现有研究多为临床前证据 全面梳理CBC的生物合成、药理特性、治疗潜力及转化挑战,明确其作为高潜力但研究不足的植物大麻素的地位 大麻色烯(CBC)及其生物合成途径、药理靶点、临床前疗效与转化应用 药理学与治疗学 炎症性疾病, 疼痛, 感染性疾病, 癌症, 神经退行性疾病, 抑郁症, 皮肤病 文献综述, 生物合成途径分析, 药代动力学分析, 分子药理学评估 NA 文本 NA NA NA NA 医药
215 2026-10-16
Multi-omics analyses reveal cellular responses to biosynthesis of the non-natural cofactor nicotinamide cytosine dinucleotide
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
研究论文 通过多组学分析非天然辅因子NCD生物合成对细胞的影响 首次利用多组学分析NCD生物合成对细胞的影响,发现NCD(H)的氧化还原状态与天然辅因子隔离 未明确说明样本量及具体组学数据规模 研究非天然辅因子NCD生物合成对细胞的生物学效应 能够自主合成NCD的细胞株 合成生物学 NA 多组学分析、蛋白质组学、通量分析 NA 组学数据 NA NA NA NA 医学, 合成生物学
216 2026-10-16
Programmable synthetic engineering of adaptive microbial cell factories: from amide transforming enzymes to advanced biocatalytic systems
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
综述 本文综述了从酰胺转化酶到先进生物催化系统的可编程合成工程,重点探讨了微生物转谷氨酰胺酶(MTGase)作为微生物细胞工厂中蛋白质水平控制组件的潜力 将MTGase定位为合成生物学中可控的蛋白质水平平台,系统整合了蛋白质工程、合成基因电路、CRISPR调控、纳米生物材料和空间生物催化等前沿技术,并区分了前瞻性应用与已确立能力 存在胞内脱靶交联、蛋白质稳态负担、交联化学计量比可变、MTGase活性时间控制有限、底盘依赖性和工业放大等关键未解决障碍 探讨酰胺转化酶向工程化生物催化系统的转变,评估MTGase如何作为微生物细胞工厂中蛋白质水平控制组件被利用 酰胺酶、天冬酰胺酶、谷氨酰胺酶、腈水解酶、腈水合酶、酰基转移酶、氨甲酰酶,特别是微生物转谷氨酰胺酶(MTGase) 合成生物学 NA 蛋白质工程、合成基因电路、CRISPR调控、代谢控制、纳米生物材料、空间生物催化、AlphaFold辅助结构预测、分子对接、分子动力学、机器学习引导的诱变、代谢建模 机器学习 文本 NA CRISPR-Cas9 微生物 合成基因电路、代谢途径 医学, 工业生物技术
217 2026-10-15
Evolution, structural diversity and functional plasticity of plant derived multifunctional proteases and α-amylases inhibitors
2026-Oct-13, Plant molecular biology IF:3.9Q1
综述 本文综述了植物来源多功能蛋白酶和α-淀粉酶抑制剂的进化、结构多样性和功能可塑性,涵盖其结构组织、抑制机制、进化多样化、计算结构生物学进展以及农业和生物技术应用 提出了扩展的多功能抑制剂定义,将作用于同一底物途径的抑制剂(如α-淀粉酶/α-葡萄糖苷酶和胰蛋白酶/胰凝乳蛋白酶系统)纳入范畴,并系统整合了AlphaFold等计算结构生物学新进展与结构导向工程改造策略 结构和体内验证方面仍存在空白,昆虫适应性、抗性进化、生物安全性和生态影响等挑战尚未充分解决,多功能抑制剂向可持续农业和生物技术应用的转化仍需进一步研究 综述植物来源多功能蛋白酶和α-淀粉酶抑制剂的结构、功能、进化及应用,提出扩展定义并探讨其向可持续农业和生物技术应用转化的前景与挑战 植物来源多功能抑制剂(MFIs),包括Bowman-Birk家族、Kunitz型家族和谷物胰蛋白酶/α-淀粉酶抑制剂 结构生物学 NA 分子对接,分子动力学模拟,基于AlphaFold的蛋白质结构预测,蛋白质工程,重组表达,合成生物学,基因组编辑 AlphaFold 文本 NA CRISPR-Cas9 NA NA 农业,食品,工业生物技术
218 2026-10-15
Engineering of bacterial outer membrane vesicles for biotechnological applications
2026-Oct-13, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文综述了细菌外膜囊泡(OMVs)的底盘工程和功能多样化,从合成生物学角度探讨其作为模块化可编程系统的应用 提出了五种诱导超囊泡化的策略和两种构建合成囊泡的框架,并展望了刺激响应型囊泡、自组装结构和混合生物合成材料等未来创新方向 OMVs存在产量低、组成异质性和货物装载随机性等固有挑战 总结OMV底盘工程和功能多样化的最新进展,为其在生物技术领域的应用提供合成生物学视角 革兰氏阴性菌分泌的外膜囊泡(OMVs) 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA 革兰氏阴性菌 NA 医学, 环境修复, 先进材料科学
219 2026-10-14
Expanding global access to synthetic biology
2026-Oct, Nature biotechnology IF:33.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
220 2026-10-15
Integrated multi-omics analysis reveals a pH-driven metabolic and translational switch in Ureaplasma parvum
2026-08-04, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 该研究通过整合蛋白质组学、代谢组学和RNA修饰分析,构建了微小脲原体(Ureaplasma parvum)在pH适应过程中的系统级模型 首次在基因组极度缩减的微小脲原体中揭示了由pH驱动的代谢和翻译转换策略,并强调了表观转录组在适应性调控中的关键作用 研究主要基于组学数据构建模型,缺乏直接的遗传学功能验证实验 构建微小病原体pH适应的系统级模型,揭示基因组缩减生物如何实现适应性可塑性 微小脲原体(Ureaplasma parvum) 多组学整合分析 泌尿生殖道感染 蛋白质组学,代谢组学,RNA修饰测序 NA 组学数据 NA NA NA NA 医学,合成生物学
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