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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-01-09 |
Integrating synthetic biology and process engineering for enhanced isobutanol biosynthesis yield and sustainability
2026-Jan-08, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02720-8
PMID:41501833
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综述 | 本文综述了异丁醇生物合成的最新进展,并从生物学和工程学角度探讨了提高产量的策略 | 整合合成生物学与过程工程,以提升异丁醇生物合成的产量和可持续性,强调酶途径优化、代谢工程和细胞工程的多学科方法 | 异丁醇的细胞毒性和挥发性导致生产过程中的损失,且酶和代谢途径的修改仍需进一步优化以提高效率和产量 | 提高异丁醇作为生物燃料和平台化学品的生物合成产量和可持续性 | 异丁醇生物合成过程,包括酶途径、代谢工程、细胞工程和发酵技术 | NA | NA | 代谢工程、细胞工程、高通量筛选技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌、哺乳动物细胞、植物 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 能源、医药、精细化学品、工业生物技术、环境 |
| 202 | 2026-01-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-Jan-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文综述了人工智能在细胞生物学中的多样化应用,包括显微镜成像、药物发现和合成生物学等领域 | 强调了AI在单细胞分辨率分析、细胞行为建模以及蛋白质结构预测方面的突破性进展 | 讨论了数据质量要求、模型可解释性以及AI工具普及化等关键挑战 | 探索人工智能如何推动细胞生物学的基础研究和治疗应用 | 细胞生物学中的复杂生物数据,如细胞图像、转录组学和蛋白质相互作用 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、基础研究 |
| 203 | 2026-01-09 |
Rapid evolution of a highly efficient RNA polymerase by homologous recombination
2026-Jan-07, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02124-7
PMID:41501182
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研究论文 | 本文通过同源重组和定向进化,将高选择性DNA聚合酶转化为具有高效RNA合成活性的非天然同源物 | 利用单细胞液滴微流体选择策略,在短进化路径中成功开发出C28聚合酶,该酶能以约3 nt/s的速率合成高保真度RNA,并接受多种修饰RNA类似物 | 未明确提及具体限制,但可能涉及工程聚合酶在复杂生物环境中的稳定性和应用范围 | 将DNA聚合酶重编程为高效RNA合成酶,以推动生物技术和医学应用 | DNA聚合酶家族及其非天然同源物C28 | 合成生物学 | NA | 同源重组、定向进化、单细胞液滴微流体选择、PCR | NA | NA | NA | 同源重组 | NA | NA | 生物技术, 医学 |
| 204 | 2026-01-08 |
The multifaceted significance of phosphoinositides in endocytic trafficking
2026-Jan-07, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70268
PMID:41496670
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综述 | 本文综述了磷酸肌醇作为细胞区室“脂质编码”在内存运输中的多种作用,并探讨了相关技术进展及其在人类疾病中的意义 | 系统整合了磷酸肌醇在内存运输各环节(内存作用、内体分选、降解与回收)的功能,并强调了新兴技术(如荧光生物传感器、超分辨率显微镜、光遗传学与合成生物学)在解析其动态中的作用 | NA | 阐明磷酸肌醇在内存运输中的功能及其与人类疾病的关联,探索潜在治疗靶点 | 磷酸肌醇及其代谢酶(激酶与磷酸酶)、内存运输过程 | NA | 癌症、神经退行性疾病 | 荧光生物传感器、超分辨率显微镜、光遗传学、合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 205 | 2026-01-08 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
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综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属(类金属)生物修复中的应用,探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了将CRISPR编辑与多组学、合成生物学及新兴CRISPR生物传感器整合的统一路线图,用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前存在的生态风险、技术难题、法规问题及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性,以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 206 | 2026-01-08 |
Intracellular biosensors by functional nanomaterial-integrated CRISPR technologies for real-time molecular sensing
2026-Jan-06, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc05016b
PMID:41277417
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综述 | 本文综述了基于CRISPR技术和纳米材料集成的细胞内生物传感器的最新进展,用于实时分子传感 | 将CRISPR系统的可编程性和靶向特异性与纳米材料(如金纳米颗粒、量子点、DNA纳米结构)相结合,以增强细胞内递送效率、信号放大和传感器稳定性,并实现多模态传感和单细胞分辨率分析 | NA | 开发用于实时、动态监测细胞过程和分子事件的细胞内生物传感器 | 细胞内信号,包括核酸、非编码RNA和小分子代谢物 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术(Cas9、Cas12、Cas13),纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12, CRISPR-Cas13 | NA | 生物传感器 | 医学, 合成生物学 |
| 207 | 2026-01-08 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-Jan-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法重构了DELTA-NOTCH信号通路,以研究脊椎动物胚胎体节分割时钟中的振荡性细胞间通讯 | 首次在DELTA缺陷的体节前中胚层类器官中整合合成DELTA-NOTCH通路,并利用光遗传学激活揭示配体呈现动力学对细胞通讯的关键作用 | 研究基于类器官模型,与完整胚胎环境存在差异;合成通路的长期稳定性未充分验证 | 探究振荡性细胞间信号在发育过程中的作用机制 | 脊椎动物胚胎的体节前中胚层类器官 | 合成生物学 | NA | 合成生物学重构、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 脊椎动物胚胎类器官 | 合成DELTA-NOTCH信号通路,具备光遗传学可调控的配体呈现功能 | 基础发育生物学研究 |
| 208 | 2026-01-08 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Jan-05, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
|
综述 | 本文综述了微生物如何通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境,并探讨了合成生物学在构建遗传电路以模拟和增强微生物计算能力方面的进展 | 首次系统性地比较了自然微生物的计算能力与合成生物学中人工设计的遗传电路,并提出了弥合两者复杂性差距的新思路 | 主要聚焦于细菌,未全面涵盖其他微生物类群(如古菌、真菌)的计算特性 | 探讨微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算性能 | 自然微生物的计算机制与合成生物学中设计的遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔逻辑门、组合输入处理电路、时序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路、细胞群体分布式计算 | 环境 |
| 209 | 2026-01-07 |
Gene silencing regulated by aggregates of Corn aptamer at 3' UTR of mRNA
2026-Jan-05, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00510h
PMID:41148632
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过在mRNA的3'非翻译区引入核酸自组装模块来实现基因沉默的策略,该模块通过形成RNA聚集体在真核细胞中展现出显著的基因沉默效果 | 创新点在于将核酸自组装模块整合到mRNA的3' UTR中,通过形成高阶RNA结构来调控翻译效率,并可与经典5' UTR元素结合构建多维转录后调控网络 | NA | 研究目的是开发一种简单有效的基因沉默策略,并探索其在合成生物学中的应用潜力 | 研究对象是mRNA的3'非翻译区及其调控机制,以及真核细胞中的基因表达 | 合成生物学 | NA | 基因沉默技术,包括CRISPR-Cas9和核酸自组装模块 | NA | mRNA和蛋白质表达水平的定量数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 真核细胞 | 通过3' UTR中的核酸自组装模块形成RNA聚集体,构建多维转录后调控网络,包括与TOP序列等5' UTR元素的整合 | 医学,合成生物学 |
| 210 | 2026-01-07 |
Programmable cell-cell adhesion in synthetic yeast communities for improved bioproduction
2026-Jan-05, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-02081-1
PMID:41491832
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研究论文 | 本研究开发了一个用于模块化细胞间粘附和共培养的酵母合成工具箱,旨在克服现有方法缺乏遗传特异性和控制的局限性 | 创建了具有七个主要絮凝和凝集基因缺失的模型酵母菌株007Δ,建立了三种不同的粘附配对系统,并成功展示了利用合成共培养结合细胞粘附系统增强高价值食品抗氧化剂白藜芦醇的生物生产 | NA | 开发用于合成酵母群落的可编程细胞间粘附系统,以改进生物生产 | 酵母细胞 | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 细胞间粘附系统,包括酵母絮凝和凝集蛋白质以及酵母表面展示系统 | 工业生物技术 |
| 211 | 2026-01-07 |
Probiotic-Based Materials as Living Therapeutics
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508500
PMID:40999775
|
综述 | 本文综述了基于基因工程益生菌与基质结合的益生菌活性材料(PLMs)作为活体治疗平台在生物医学应用中的潜力、进展与挑战 | 提出了“益生菌活性材料(PLMs)”这一新概念,以区别于传统的活体生物治疗产品(LBPs),并系统阐述了其在多种疾病治疗中的靶向和动态治疗潜力 | PLMs在临床转化中面临多重挑战,包括缺乏稳健的益生菌基因工程工具包、生物安全性担忧(如水平基因转移)、临床前结果向人体转化的困难以及缺乏明确的临床使用监管指南 | 探讨工程化活体材料(ELMs)在生物医学领域的应用,特别是益生菌活性材料(PLMs)作为靶向治疗平台的设计、应用与监管挑战 | 基于基因工程益生菌与基质结合的益生菌活性材料(PLMs) | 合成生物学 | 感染、骨修复、伤口愈合、阴道失衡、肠道相关疾病、癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | 生物传感器、治疗性代谢通路 | 医学 |
| 212 | 2026-01-07 |
Expanding frontiers: harnessing plant biology for space exploration and planetary sustainability
2026-Jan, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70662
PMID:41295882
|
观点文章 | 本文提出了一个集体愿景,概述了利用植物科学支持人类太空探索新前沿的优先事项 | 引入了一种新的作物生物再生生命支持系统准备水平框架,扩展了现有的作物准备水平,以帮助建立有弹性和可持续的作物生产 | NA | 利用植物生物学支持太空探索和地球的可持续性 | 植物 | NA | NA | 预测建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 太空探索、农业、环境 |
| 213 | 2026-01-06 |
Beyond Tanacetum cinerariifolium: Advances in Pyrethrins Biosynthesis and Prospects for Engineered Cell Factories
2026-Jan-04, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01549-8
PMID:41485148
|
综述 | 本文综述了除虫菊酯生物合成的研究进展,并探讨了利用合成生物学和代谢工程构建工程细胞工厂以实现规模化、可持续生产的潜力 | 提出了从传统花卉种植转向工程细胞工厂的新生产策略,以解决除虫菊酯农业生产的限制 | NA | 探讨除虫菊酯生物合成途径及利用合成生物学实现可持续生产的可能性 | 除虫菊酯的生物合成途径、关键酶及其异源合成 | 合成生物学 | NA | 异源合成、代谢工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 214 | 2026-01-06 |
Advances in tailoring camelina and pennycress oilseeds for specialty metabolites
2026-Jan-03, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103422
PMID:41485390
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和基因组编辑技术改造亚麻荠和遏蓝菜油料作物,以生产特种代谢物的最新进展 | 通过基因组编辑重编程内源脂质代谢以消除竞争途径,并结合生物勘探筛选更高效的酶,显著提高了目标产物的产量 | 仍面临实现细胞类型特异性表达和开发可扩展的途径基因表达控制策略等挑战 | 开发油料作物作为生产下一代生物产品的多功能平台 | 亚麻荠和遏蓝菜油料作物 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、生物勘探 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Camelina sativa, Thlaspi arvense | 外源途径扩展油脂多样性、内源脂质代谢重编程 | 农业, 工业生物技术 |
| 215 | 2026-01-06 |
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Jan-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102701
PMID:41485423
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综述 | 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法,结合简单实验与热力学框架来优化启动子功能 | 提出了一种基于转录因子的上下文最小化、测量优先的方法,通过序列占用和功能概念来设计可调控启动子 | NA | 设计具有特定功能输出的可调控启动子,以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的启动子序列设计 | 合成生物学 | NA | 热力学框架、简单实验 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 可调控启动子设计,涉及动态范围、泄漏性和敏感性等特征 | 工业生物技术 |
| 216 | 2026-01-06 |
Long noncoding RNA regulation of immunity
2026-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02355-9
PMID:41482550
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA(lncRNA)在哺乳动物免疫系统中的调控作用,包括其在免疫细胞分化、功能及疾病关联中的机制 | 文章强调了lncRNA在代谢途径、细胞表面糖基化非编码RNA及抗原性细胞外核糖核蛋白复合物中的新型调控机制,并特别关注了女性特异性lncRNA XIST在自身免疫性疾病中的性别偏向作用 | NA | 探讨lncRNA在免疫系统调控中的角色及其在免疫相关疾病中的影响 | 长链非编码RNA(lncRNA)及其在免疫细胞和免疫反应中的功能 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 高通量功能基因组学、人类遗传学、分子互作图谱、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 217 | 2026-01-06 |
Structure-Guided Engineering of 2-Oxoglutarate-Dependent Oxygenases: Principles, Case Studies, and Emerging Opportunities
2026, Chemical & pharmaceutical bulletin
IF:1.5Q3
DOI:10.1248/cpb.c25-00652
PMID:41485885
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综述 | 本文综述了2-酮戊二酸依赖性非血红素铁加氧酶(2OGX)的结构引导工程原理、案例研究及新兴机遇 | 系统总结了基于2OGX保守结构基序(如CLip、CLid、SL、DL及β-折叠框架)进行理性重编程以改变反应性的策略,展示了将羟化酶转化为卤化酶、重定向真菌酶构建非天然萜类支架等创新案例 | NA | 探讨如何通过结构引导的蛋白质工程策略,理性改造2OGX酶的功能,拓展其在生物催化中的应用 | 2-酮戊二酸依赖性非血红素铁加氧酶(2OGX)及其结构-功能关系 | 合成生物学 | NA | 结构生物学、计算设计、蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、天然产物发现、药物开发 |
| 218 | 2026-01-05 |
The role of gut microbiome in aging-associated diseases: where do we stand now and how technology will transform the future
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2607076
PMID:41454672
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综述 | 本文综述了肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用,并探讨了新兴技术如何推动该领域的研究和干预措施开发 | 提出了整合微生物组科学、衰老生物学和新兴技术的PRIME框架,为推进精准医学和促进健康老龄化提供了全面蓝图 | NA | 探讨肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用,以及如何利用技术推动相关研究和临床干预 | 肠道微生物组及其与衰老相关疾病的关联 | NA | 衰老相关疾病(包括感染性疾病、自身免疫病、神经退行性疾病、精神疾病、癌症、代谢性疾病、肾脏疾病、心血管疾病、骨骼和肌肉疾病等) | 功能多组学、合成生物学、人工智能驱动分析、生物样本库、自体粪便微生物群移植 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 219 | 2026-01-05 |
Enhancing delta-tocotrienol production in Saccharomyces cerevisiae via metabolic engineering strategies in conjunction with the mutagenesis of tocopherol cyclase
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.013
PMID:41480008
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和酶工程策略,成功提高了酿酒酵母中δ-生育三烯酚的产量 | 结合酶融合构建底物通道、优化转运蛋白表达以及通过半理性蛋白质设计突变关键限速酶,显著提升了δ-生育三烯酚的微生物异源生产 | NA | 构建高效的微生物细胞工厂以生产δ-生育三烯酚,补充或替代维生素E供应链 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶工程、半理性蛋白质设计、发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 通过PaCrtE和SyHPT酶的顺序融合构建底物通道,优化MGGBQ前体供应;表达转运蛋白PDR1以增强产物外排 | 食品、化妆品、制药 |
| 220 | 2026-01-04 |
pH-Responsive Biomineralized Probiotic for Self-Amplifying Mucosal Vaccination: Gut-Engineered Antigen Factories Drive Targeted Cervical Tumor Regression
2026-Jan-02, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202510404
PMID:41482692
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研究论文 | 本研究开发了一种口服生物混合疫苗,利用pH响应性生物矿化枯草芽孢杆菌在肠道建立抗原工厂,实现持续HPV16 E7抗原生产,从而驱动靶向宫颈肿瘤消退 | 通过合成生物学与刺激响应生物材料结合,首创了自复制、可黏膜部署的活体生物治疗新范式,利用pH响应性矿物涂层增强胃酸抗性和肠道滞留,实现长期抗原递送 | 研究主要在TC-1小鼠模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;长期安全性和免疫耐受性需进一步评估 | 开发一种口服黏膜疫苗,用于宫颈癌的精准免疫治疗 | HPV16 E7抗原、TC-1宫颈肿瘤模型、免疫细胞(T细胞、B细胞、抗原呈递细胞) | 合成生物学 | 宫颈癌 | 生物矿化技术、免疫组化分析、流式细胞术 | NA | 实验数据、免疫学数据、肿瘤体积数据 | TC-1小鼠模型(具体数量未明确说明) | 合成生物学方法 | 枯草芽孢杆菌 | 肠道抗原工厂系统,用于持续生产HPV16 E7抗原 | 医学 |