合成生物学相关文章
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当前共找到 555 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-02-25 |
Genetic make-up and regulation of the L-lysine biosynthesis pathway in Vibrio natriegens
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.02.867
PMID:41732680
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研究论文 | 本研究分析了Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径的组成与调控，为将其开发为氨基酸过量生产菌株提供基础 | 发现了一种新的单功能天冬氨酸激酶同工酶Vn.LysC2，该酶对所有L-天冬氨酸家族氨基酸的变构抑制不敏感，并鉴定了L-天冬氨酸半醛脱氢酶和二氢二吡啶酸合酶的功能重复基因 | NA | 分析Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关氨基酸生物合成途径的遗传组成与调控机制，以支持未来的代谢工程应用 | Vibrio natriegens DSM759菌株及其L-赖氨酸和L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | RNA测序、基因删除突变体生长表型分析、酶活性测定 | NA | 基因组测序数据、转录组数据 | NA | NA | Vibrio natriegens | L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 222 | 2026-02-24 |
Construction and analysis of a cell factory for terpenoid biosynthesis in Pichia pastoris via metabolic engineering and metabolomics
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.015
PMID:41725898
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和代谢组学方法，在毕赤酵母中构建并分析了一个用于萜类化合物生物合成的通用细胞工厂 | 开发了一种“即插即用”的细胞工厂，通过增强MVA途径表达和减少分支途径分流策略，实现了多种萜类化合物的高效合成，并利用系统生物学分析揭示了关键蛋白拷贝数增加对精氨酸等代谢途径的影响 | 菌株的鲁棒性和紧密调控的代谢网络限制了理性代谢工程改造的潜力 | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 毕赤酵母作为宿主细胞，用于生产β-榄香烯、β-法尼烯、(+)-瓦伦烯、(-)-α-红没药醇等萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、代谢组学、系统生物学分析 | NA | 代谢物数据 | 不同工程菌株 | 代谢工程 | 毕赤酵母 | 增强MVA途径表达和减少分支途径分流的通用萜类化合物生物合成细胞工厂 | 医药、保健品、香料 |
| 223 | 2026-02-24 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Feb-22, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
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研究论文 | 本文报道了通过共递送短双链非同源寡核苷酸（dsNHO）可显著提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas介导的基因敲除效率 | 发现了非同源寡核苷酸增强（NOE）现象，可将基因敲除效率提高高达100倍，并揭示了其通过干扰DNA双链断裂传感通路来促进易错修复的机制 | 研究主要基于莱茵衣藻模型，在其他生物中的普适性需进一步验证 | 提高CRISPR/Cas系统在莱茵衣藻中的基因敲除效率，以促进合成生物学应用 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | NA | 工业生物技术 |
| 224 | 2026-02-24 |
Harnessing endophytes and Multi-Omics for sustainable Colchicine biosynthesis
2026-Feb-18, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04790-8
PMID:41706338
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综述 | 本文综述了利用内生菌和多组学技术促进濒危药用植物Gloriosa superba可持续生产秋水仙碱的系统性策略 | 提出将内生菌生物学与多组学技术、合成生物学整合的系统级合成框架，将秋水仙碱生物合成重新定义为植物-微生物协同代谢网络 | NA | 开发可持续、可扩展的秋水仙碱生产方法，同时支持Gloriosa superba的保护 | Gloriosa superba（植物）、其相关的内生真菌和细菌 | 合成生物学 | 痛风、关节炎、癌症、炎症性疾病 | 多组学分析（转录组学、蛋白质组学、代谢组学）、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | 异源微生物宿主 | 秋水仙碱合成途径重建 | 医药 |
| 225 | 2026-02-24 |
T Cell Receptor Co-Stimulation Through Magnetogenetic Tools: A Platform for Wireless Rewiring of Cellular Signaling
2026-Feb-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c10000
PMID:41726657
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研究论文 | 本文介绍了一种用于T细胞受体共刺激的磁遗传学平台，利用磁场实现T细胞的无创激活 | 开发了一种无线、磁控的磁遗传学工具，作为TCR信号的可调共刺激器，结合抗原刺激增强T细胞激活 | NA | 探索合成生物学策略以控制细胞功能，用于治疗应用，特别是免疫细胞行为的精确调控 | HEK293细胞、Jurkat细胞和原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | 钙成像、qPCR、蛋白质组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | HEK293, Jurkat, 原代人T细胞 | 磁遗传学平台，涉及工程化TRPV1、TRPV4和电磁感知基因（EPG）构建体 | 医学 |
| 226 | 2026-02-24 |
APMSR: an intelligent QA system for synthetic biology empowered by adaptive prompting and multi-source knowledge retrieval
2026-Feb-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-38006-8
PMID:41644613
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研究论文 | 本文提出了一种名为APMSR的优化策略，通过自适应提示生成与多源知识检索相结合，构建了一个面向合成生物学领域的智能问答系统 | 提出了结合自适应提示生成与基于LinUCB算法的动态多源知识检索的优化策略，有效平衡探索与利用，提升了领域特定信息检索的相关性和精确度 | NA | 解决合成生物学领域专业问答中大型语言模型存在的知识鸿沟和幻觉问题，提升问答系统的准确性和鲁棒性 | 面向合成生物学领域的智能问答系统 | 自然语言处理 | NA | 自适应提示生成、多源知识检索、LinUCB算法 | 大型语言模型 | 文本 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 227 | 2026-02-24 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
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研究论文 | 本研究在嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae中建立了高通量核基因组工程框架，并验证了基因组位置对转基因表达效率无显著影响 | 首次通过实验验证了C. merolae中40个基因间位点作为中性整合位点，并建立了机器人辅助的高通量转化方法 | 研究仅针对C. merolae这一特定藻类物种，结论在其他生物中的普适性尚未验证 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响，建立合成生物学底盘生物的基因组工程平台 | 嗜热嗜酸红藻Cyanidioschyzon merolae | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人技术、异源蛋白和代谢产物检测 | NA | 基因组数据、蛋白质表达数据、代谢产物数据 | 40个基因间位点（覆盖16条染色体），验证了38个位点 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae（嗜热嗜酸红藻） | 异源异戊二烯合酶表达系统 | 工业生物技术 |
| 228 | 2026-02-24 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程化细菌在癌症治疗中的最新进展，重点探讨了遗传电路设计如何提升肿瘤特异性、调控治疗递送和激活宿主免疫系统 | 通过组合遗传电路策略实现细菌疗法的可编程时空控制和群体行为调控，推动细菌从简单定植剂向多功能治疗平台的转变 | 未提及具体实验数据或临床转化中的具体技术障碍细节 | 探讨如何通过理性工程化设计下一代微生物癌症疗法 | 工程化细菌及其遗传电路在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 肿瘤特异性靶向电路、治疗载荷释放调控电路、免疫调节电路、时空控制电路和群体行为电路 | 医学 |
| 229 | 2026-02-23 |
Exosome precision engineering: A comprehensive method for targeted gene and drug delivery
2026-Apr, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156369
PMID:41619536
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综述 | 本文综述了外泌体精准工程作为靶向基因和药物递送载体的最新方法、进展与挑战 | 整合了合成生物学与外泌体工程的最新策略，包括表面靶向修饰、先进装载技术（如远程装载、刺激响应系统）以及用于递送CRISPR/Cas9的基因工程方法 | 面临大规模生产、免疫安全性以及监管审批等挑战 | 探讨工程化外泌体作为多功能平台在精准医疗和疾病治疗中的应用潜力 | 外泌体（作为药物和基因递送载体） | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9，远程装载，刺激响应系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 生物传感器（通过表面配体、抗体或肽实现靶向），刺激响应递送系统 | 医学 |
| 230 | 2026-02-23 |
Energy-driven innovations in computational de novo protein engineering
2026-Mar, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.01.005
PMID:41570866
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综述 | 本文系统回顾了能量模型在计算从头蛋白质工程中的关键作用及其驱动创新的方式 | 提出了一个基于精度-成本-通量权衡的方法选择决策框架，并整合了经典力场、量子力学方法与AI驱动预测，为治疗性和工业蛋白质设计提供了协同的物理基础与数据驱动策略路线图 | NA | 推动计算从头蛋白质工程的发展，以设计具有定制功能的新型蛋白质 | 蛋白质 | 计算生物学 | NA | 分子动力学(MD)、热力学积分、蒙特卡洛采样、机器学习(ML)、深度学习(DL) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学, 合成生物学 |
| 231 | 2026-02-23 |
Bio-Oil from Phototrophic Microorganisms: Innovative Technologies and Strategies
2026-Jan-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010011
PMID:41718349
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综述 | 本文综述了利用光养微生物生产生物油的技术与策略，重点讨论了热化学转化技术和生物优化方法的进展 | 强调将先进热化学转化技术与定向生物优化策略有效结合，是实现光养微生物规模化生产生物油的最有前景途径 | NA | 探讨利用光养微生物生产液体生物燃料的可行技术与策略，以支持低碳能源系统转型 | 光养微生物（特别是微藻）及其生物油生产 | NA | NA | 水热液化、快速热解、催化提质（加氢脱氧等）、菌株优化、胁迫诱导、共培养、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 光养微生物（微藻） | NA | 能源 |
| 232 | 2026-02-23 |
Breaking the cell wall for efficient DNA delivery to diatoms
2026-Jan-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68562-6
PMID:41571648
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研究论文 | 本文提出了针对硅藻（特别是三角褐指藻和假微型海链藻）的高效DNA递送方法，包括优化的电穿孔和PEG转化技术 | 开发了高效的DNA递送方法，首次实现Cas9核糖核蛋白复合体在硅藻中的高效递送，并发现硅藻体内组装（DIVA）新机制 | NA | 开发适用于硅藻的遗传工程工具，以提升其作为细胞工厂的利用潜力 | 三角褐指藻（Phaeodactylum tricornutum）和假微型海链藻（Thalassiosira pseudonana） | 合成生物学 | NA | 电穿孔、PEG转化、Cas9核糖核蛋白复合体递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻, 假微型海链藻 | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 233 | 2026-02-22 |
Design and Modeling of Biosensor-Driven Encapsulation Systems for Systemic Delivery of Bacterial Cancer Therapy
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00598
PMID:41528100
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研究论文 | 本文设计并建模了用于细菌癌症疗法系统递送的生物传感器驱动的封装系统 | 开发了基于群体感应或酸感应的生物传感器驱动封装系统，可自主控制细菌荚膜多糖表达以改善药代动力学特性，并首次建立了双状态药代动力学模型来模拟活体治疗剂的动态行为 | 未在临床环境中验证，模型基于假设参数，需要进一步实验验证 | 改进细菌癌症疗法的系统递送安全性和有效性 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、药代动力学建模 | 双状态药代动力学模型 | 实验数据、模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 生物传感器驱动的基因回路，包含群体感应和酸感应模块，用于自主控制荚膜多糖表达 | 医学 |
| 234 | 2026-02-22 |
Conformation-programmed DNA computing
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8383
PMID:41706864
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研究论文 | 本文提出了一种基于构象编程的DNA计算框架，通过整合序列可编程性与构象动力学实现多级信号处理 | 首次将序列可编程性与构象动态信号整合于DNA计算中，通过多聚胸腺嘧啶环实现构象信号编码与放大，并构建了可区分7-15个核苷酸环长的构象感知DNA神经网络 | 未明确说明系统在复杂生物环境中的稳定性与长期运行效果 | 开发能够整合序列与构象维度的自适应DNA计算系统 | DNA分子网络与构象信号处理机制 | 合成生物学 | NA | DNA计算、构象编程、催化发夹组装 | DNA神经网络 | 分子构象信号 | NA | DNA自组装 | NA | 变构DNA计算框架、催化发夹组装系统、microRNA响应型基因调控回路 | 医学、合成生物学 |
| 235 | 2026-02-22 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 开发了针对Bacteroides thetaiotaomicron的合成生物学工具包，用于构建体内吸收不良生物传感器 | 首次为Bacteroides thetaiotaomicron开发了包含可抑制启动子、DNA调控系统、模块化转录报告电路和替代质粒整合模式的遗传工具包 | 工具包仅在体外和小鼠模型中验证，尚未在人体中测试 | 开发用于肠道环境监测的非侵入性生物传感器 | Bacteroides thetaiotaomicron细菌及其遗传调控系统 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 遗传工程、荧光报告系统 | 生物传感器电路 | 荧光图像数据 | 小鼠模型 | 合成生物学工具包（包含启动子工程、DNA调控系统、报告电路设计） | Bacteroides thetaiotaomicron | 模块化荧光转录报告电路，用于检测肠道渗透压变化 | 医学（肠道健康监测） |
| 236 | 2026-02-22 |
Xeno-nucleic acids support formation of Ag(I)-mediated duplexes and silver nanoclusters
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag132
PMID:41705510
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研究论文 | 本文研究了异源核酸（XNAs）在银离子介导下形成双链结构的能力及其对银纳米簇的光学性质调控作用 | 首次系统探索了不同骨架化学的XNAs与银离子的相互作用，揭示了骨架化学（而非仅碱基序列）可作为调控核酸-银纳米簇性质的新工具 | 未深入探讨XNAs-银纳米簇在生物体系中的实际应用性能，且未与其他金属离子进行系统性比较 | 探索异源核酸在金属介导的核酸结构和纳米材料领域的性质与应用潜力 | 具有不同骨架化学的异源核酸（XNAs）、银离子、银纳米簇 | 合成生物学、纳米材料 | NA | 圆二色光谱、质谱分析 | NA | 光谱数据、质谱数据 | 多种不同骨架组成的XNAs样本 | NA | NA | NA | 材料、纳米技术 |
| 237 | 2026-02-21 |
Gene insertion and transcriptional regulation of Escherichia coli based on CRISPR-associated transposases
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149850
PMID:41628878
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研究论文 | 本研究基于CRISPR相关转座酶开发了可编程工具MUSCULAR-CAST，实现了多顺反子表达盒的高效基因组整合，并开发了基因抑制工具Tn-CRISPRi，用于合成生物学中的底盘菌株工程 | 开发了基于IF型CRISPR相关转座酶系统Tn6677的可编程工具MUSCULAR-CAST，能够高效整合不同大小的多顺反子表达盒，并基于其靶向模块开发了具有广泛PAM序列适应性的基因抑制工具Tn-CRISPRi | 未明确说明工具在其他宿主生物中的适用性或大规模工业应用中的稳定性验证 | 开发高效的基因组整合和转录调控工具，以促进合成生物学中微生物细胞工厂的构建 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | 合成生物学 | NA | CRISPR相关转座酶系统 | NA | NA | 涉及多种多顺反子表达盒（1-10K）及17个基因的抑制实验 | CRISPR-Cas9, CAST系统 | 大肠杆菌 | 多顺反子表达盒整合系统、基因抑制调控回路 | 工业生物技术 |
| 238 | 2026-02-21 |
Advancing Fast-Track Genome Engineering in Bacillus subtilis Phages
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00727
PMID:41538882
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研究论文 | 本文介绍了一种名为QuickPhage的快速、精确且成本效益高的噬菌体基因组工程方法，利用CRISPR-Cas9作为反选择系统，在Bacillus subtilis噬菌体SPP1中实现高效基因编辑 | 开发了QuickPhage方法，使用短至40个核苷酸的同源修复片段进行高效基因组编辑，能在一天内完成精确编辑，并成功应用于必需和非必需基因的删除及报告基因的插入 | NA | 加速噬菌体生物学研究、新功能发现和创新基因工程工具的开发 | Bacillus subtilis的模型裂解性siphovirus噬菌体SPP1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Bacillus subtilis | 使用诱导系统合成调控蛋白质生产（如GFP），实现高达400倍的诱导水平 | 医学, 工业生物技术 |
| 239 | 2026-02-21 |
Biosynthesis of Indigoidine in Microorganisms: Strategies and Applications
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00800
PMID:41576205
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综述 | 本文系统回顾了微生物中靛蓝苷的生物合成策略与应用，重点关注合成生物学技术在提高产量和拓展应用方面的进展 | 整合了微生物宿主系统、代谢与酶工程以及合成生物学技术，为靛蓝苷的工业化生产提供了全面的路线图 | 存在途径优化、产量提升和应用多样性方面的持续挑战 | 探讨微生物合成靛蓝苷的策略及其作为可持续蓝色染料替代品的应用 | 靛蓝苷及其在微生物中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶（NRPSs）介导的生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 微生物底盘菌株 | 靛蓝苷生物合成途径 | 纺织工业 |
| 240 | 2026-02-21 |
Miniaturized CRISPR: Ultra Compact Systems for In Vivo Delivery and Portable Diagnostics
2026-Feb-19, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-026-04046-4
PMID:41712125
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综述 | 本文综述了小型化CRISPR系统（如Cas12f、CasX和迷你Cas9）在体内基因编辑和便携式诊断中的应用进展 | 总结了超紧凑CRISPR系统如何通过降低分子量和简化结构，克服传统SpCas9的递送和尺寸限制，并探讨AI辅助蛋白质设计和合成生物学带来的未来机遇 | NA | 综述小型化CRISPR系统在基因治疗和便携诊断中的进展与挑战 | 紧凑型Cas蛋白、引导RNA优化和小型化递送载体 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cas12f, CasX | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |