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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-07-19 |
A signal peptide-guided approach towards in situ functionalization of bacterial nanocellulose in Komagataeibacter rhaeticus
2026-Jul-17, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00734-w
PMID:42469887
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研究论文 | 本研究通过信号肽引导的蛋白质转运策略,在Komagataeibacter rhaeticus中实现细菌纳米纤维素的原位功能化,建立了一个单底盘合成生物学框架 | 首次在K. rhaeticus中系统评估信号肽介导的蛋白质转运,建立了单个底盘细胞同时进行生物聚合物合成和原位功能化的合成生物学框架 | 重组蛋白被滞留于周质空间,限制了胞外可用性;通过渗透压休克后处理可使酶活性提高30%,但仍需优化以实现高效胞外释放 | 建立K. rhaeticus作为单底盘平台用于功能性生物工程活材料的合成生物学框架 | Komagataeibacter rhaeticus iGEM菌株 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-串联质谱法, SignalP 5.0预测 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | 信号肽介导的蛋白质转运 | Komagataeibacter rhaeticus | 信号肽−蛋白转运回路 | 材料科学, 生物技术 |
| 222 | 2026-07-19 |
PromoterAtlas: decoding regulatory sequences across Gammaproteobacteria using a transformer model
2026-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72837-3
PMID:42140912
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research paper | 介绍PromoterAtlas,一种基于Transformer模型用于解码Gammaproteobacteria调控序列的工具 | 使用1.8M参数的Transformer模型,在3371种γ变形菌的900万调控序列上训练,实现了跨物种的启动子识别、全基因组注释及调控功能预测 | 未明确提及模型对非γ变形菌的适用性或实验验证中的假阳性率 | 开发跨物种的细菌启动子预测工具,提升对调控序列的理解和工程化能力 | Gammaproteobacteria的调控序列,包括核糖体结合位点、启动子、转录因子结合位点和终止子 | machine learning | NA | Transformer模型、全基因组注释 | Transformer | 序列数据 | 3371个物种的900万调控序列 | NA | Gammaproteobacteria(γ变形菌) | NA | 合成生物学、细菌生物学、比较基因组学 |
| 223 | 2026-07-19 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-04-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
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综述 | 该综述评估了利用基因工程和合成生物学开发微生物作为癌症治疗药物的潜力 | 探讨了工程微生物精准检测疾病标志物并递送治疗载荷到肿瘤部位的新策略 | 存在个体间差异、安全性问题和监管障碍等挑战 | 评估微生物作为治疗剂在癌症治疗中的应用前景 | 工程微生物及多种癌症类型(胰腺癌、乳腺癌、肺癌和结直肠癌) | 机器学习 | 胰腺癌, 乳腺癌, 肺癌, 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物 | 生物传感器, 代谢通路 | 医学 |
| 224 | 2026-07-19 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 本文综述了PANoptosis的分子架构及作为药物发现框架的潜力,探讨了其在多种疾病中的治疗意义 | 将PANoptosis从细胞死亡机制提升为药物发现框架,提出临床极性和时间模型,并整合了新兴生物标志物和前沿药物策略 | 未详细讨论体内实验数据,且对特定疾病模型的验证仍需进一步研究 | 推动PANoptosis作为治疗靶点和辅助框架在感染、炎症、肿瘤及神经退行性疾病中的应用 | PANoptosis相关分子(ZBP1、AIM2、NLRP3、Pyrin、ASC、RIPK1、FADD、caspase-1/8、RIPK3-MLKL、gasdermins)及临床干预策略 | 临床药理学 | 感染、炎症、肿瘤、神经退行性疾病 | 小分子抑制剂、生物制剂、核酸治疗 | NA | 临床前及临床试验数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 225 | 2026-07-19 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-03, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 利用DNA折纸膜自组装形成细胞尺度的容器 | 模仿脂质结构和相互作用,设计径向对称的DNA折纸亚基,形成可编程的DNA折纸单层膜,并能自组装成囊泡或中空管,尺寸范围从100纳米到1微米以上 | 未提及具体局限性 | 在自下而上的合成生物学中实现新型的区室化方法 | DNA折纸亚基及其自组装形成的膜结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | DNA折纸 | NA | DNA折纸单层膜 | 生物学、软体机器人 |
| 226 | 2026-07-18 |
Microbial factories for lipid: Engineering synthetic routes and regulatory networks for Triacylglycerol biosynthesis
2026-Oct, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2026.105136
PMID:42215216
|
综述 | 综述微生物合成三酰甘油(TAG)的最新进展及未来研究方向 | 系统整合合成生物学与代谢工程策略,提出工业规模微生物TAG生物制造的技术路线图 | 未讨论非模式微生物的基因编辑工具局限性及扩大化生产的经济可行性 | 促进可持续脂质来源的微生物系统开发 | 产油微生物(油质微生物)及其三酰甘油合成途径 | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物(产油微生物) | 三酰甘油生物合成路径(如TAG组装途径、代谢网络调控) | 生物能源,食品工业,工业生物技术 |
| 227 | 2026-07-18 |
From fermentation to pharmabiotics: engineering kefir-derived Lactobacillus for targeted intratumoral immunotherapy in colorectal Cancer
2026-Sep-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117032
PMID:42289150
|
综述 | 本文综述了从发酵到药物生物的流程,将开菲尔中的乳杆菌工程改造为用于结直肠癌靶向瘤内免疫治疗的活体生物治疗产品 | 提出了将开菲尔来源的乳杆菌通过合成生物学改造为肿瘤靶向活体药物,实现局部免疫微环境重塑和协同免疫检查点抑制剂治疗 | 面临生物遏制、生产放大和监管审批等转化挑战 | 开发基于工程化乳杆菌的活体生物治疗产品用于结直肠癌靶向免疫治疗 | 开菲尔中的乳杆菌菌株 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳杆菌 | 肿瘤低氧区域靶向生物传感器、体内原位生物反应器、纳米抗体和细胞因子释放回路 | 医学 |
| 228 | 2026-07-18 |
Multilevel Metabolic Engineering of Probiotic Escherichia coli Nissle 1917 for Antibiotic-Free Production of β-Alanine
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00228
PMID:42270566
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研究论文 | 通过多层级代谢工程改造益生菌大肠杆菌Nissle 1917,实现无抗生素生产β-丙氨酸 | 首次研究了TdcC、SstT、SdaC和RhaT转运蛋白在β-丙氨酸积累中的作用,并实现了益生菌EcN生产β-丙氨酸的最高产量 | 未提及明确局限,但可能涉及发酵过程的规模化挑战或长期稳定性 | 开发益生菌EcN作为微生物细胞工厂,实现β-丙氨酸的无抗生素高效生产 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA(涉及5升生物反应器中的发酵过程) | NA(多层级代谢工程策略,包括异源酶引入、通路强化等) | 大肠杆菌Nissle 1917 | β-丙氨酸生物合成途径,包括前体L-天冬氨酸供应双通路强化、竞争通路动态调控、中枢代谢重编程和转运系统工程化 | 工业生物技术 |
| 229 | 2026-07-18 |
Tardigrade-Derived Strategy for Low-Cost Storage of Cell-Free Expression Lysates
2026-Jul-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00281
PMID:42319881
|
研究论文 | 提出一种利用缓步动物来源的CAHS蛋白保护无细胞表达系统在室温干燥下稳定的方法 | 首次利用缓步动物来源的CAHS蛋白作为单一添加剂,无需其他成分即可在低成本室温干燥条件下保护无细胞表达系统的蛋白合成活性 | 未明确说明CAHS蛋白对其他类型无细胞系统或更复杂生物过程的保护效果,以及长期储存稳定性 | 开发低成本的室温储存方法,提高无细胞表达系统的可及性和便携性 | 无细胞表达系统以及缓步动物来源的胞质丰富热溶性(CAHS)蛋白 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 230 | 2026-07-18 |
Bacteria mediated tumor therapy recent advances challenges and future perspectives
2026-Jul-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05611-y
PMID:42467272
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综述 | 系统综述细菌介导肿瘤治疗的历史发展、内在抗肿瘤机制、基因工程策略和多模式生物混合系统 | 提出下一代智能、可控、临床可转化的细菌衍生活体抗肿瘤系统的合理设计策略 | 临床转化仍受制于生物安全性控制不足、脱靶定植、不受控制的增殖、免疫清除以及缺乏标准化制造和监管指南 | 综述细菌介导肿瘤治疗的研究进展、挑战和未来展望 | 工程化细菌及基于细菌的生物混合系统 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 厌氧菌、兼性厌氧菌 | 环境响应可编程表达、细胞毒性蛋白生产、多模式联合治疗 | 医学 |
| 231 | 2026-07-18 |
Metabolic engineering of Komagataella phaffii for enhanced production of heterologous proteins and small molecules: key strategies and future directions
2026-Jul-16, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00110-26
PMID:42461011
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综述 | 对Komagataella phaffii代谢工程用于提高异源蛋白和小分子产量的关键策略和未来方向进行综述 | 系统总结了代谢工程在Komagataella phaffii中的应用,涵盖代谢流控制、动态控制、系统建模等多个核心优化策略 | 未提供具体实验数据,作为综述存在局限 | 概述Komagataella phaffii代谢工程的最新进展和未来方向 | Komagataella phaffii的代谢工程策略 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | Komagataella phaffii | NA | 工业生物技术 |
| 232 | 2026-07-18 |
Light-directed biofilm formation reveals the functional contributions of periplasmic cytochromes to the electrochemical activity of Shewanella oneidensis
2026-Jul-16, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01264-26
PMID:42461042
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研究论文 | 利用光诱导生物膜形成方法,揭示了周质细胞色素对希瓦氏菌电化学活性的功能贡献 | 结合靶向基因敲除与光诱导生物膜图案化技术,克服了周质细胞色素网络复杂性和原生生物膜变异性带来的挑战,实现了对周质细胞色素在向外电子传递和生物膜传导中不同功能的区分 | 未明确提及但可能包括:仅使用单一突变体组合、未在非电极环境验证、长期稳定性未评估 | 阐明希瓦氏菌周质细胞色素在向外电子传递和生物膜传导中的具体功能角色 | 希瓦氏菌MR-1的周质细胞色素突变体 | 合成生物学, 微生物电化学 | NA | 光诱导生物膜图案化, 伏安法测量, 电化学栅控测量 | NA | 电化学信号, 生物膜图像 | 多种周质细胞色素基因敲除菌株的图案化生物膜,具体数量未给出 | 靶向基因敲除, 光诱导图案化 | 希瓦氏菌 MR-1 | 光诱导生物膜形成系统(可能基于光敏蛋白调控) | 生物能源, 环境修复 |
| 233 | 2026-07-18 |
Cannabichromene (CBC): a comprehensive review of biosynthesis, pharmacology, therapeutic potential, and translational perspectives
2026-Jul-16, Journal of cannabis research
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s42238-026-00454-4
PMID:42464425
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综述 | 全面综述大麻色烯(CBC)的生物合成、药理学、治疗潜力及转化前景 | 系统整合了CBC的生物合成途径、独特的受体相互作用谱(如TRP通道激动剂)及非精神活性优势,并提出纳米递送系统、合成生物学等未来方向 | 缺乏临床试验数据,口服生物利用度低,监管碎片化,且现有证据仅基于临床前研究 | 评估CBC作为治疗候选分子的现状,并识别转化研究中的关键挑战 | 大麻色烯(CBC)及其前体大麻色烯酸(CBCA) | 药物化学 | 炎症、疼痛、癌症、神经退行性疾病、抑郁症、皮肤病 | 高效液相色谱、质谱、酶活性测定、分子生物学 | NA | 生物化学数据、药理学数据、毒理学数据 | NA | NA | 大麻(Cannabis sativa L.) | 大麻素生物合成途径(聚酮/甲羟戊酸/MEP途径) | 医学 |
| 234 | 2026-07-18 |
Programmable regenerative tissues: Converging mammalian synthetic biology and tissue engineering
2026-Jul-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101672
PMID:42456647
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评论 | 讨论将合成生物学与组织工程相结合,以构建可编程再生组织 | 提出将合成生物学电路与组织工程整合,通过紧凑且上下文感知的电路靶向血管化和免疫整合,实现自适应移植物 | 仅基于评论性分析,未提供实验数据或验证 | 探索合成生物学在再生医学中的应用,特别是通过工程化组织实现适应性再生反应 | 合成生物学电路与工程化组织 | 合成生物学, 组织工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 上下文感知电路,用于感知胁迫并协调再生反应 | 再生医学 |
| 235 | 2026-07-18 |
De novo synthesis of large-scale metabolic pathways for natural products and their optimization strategies
2026-Jul-10, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135370
PMID:42431421
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综述 | 系统分析了利用合成生物学在微生物细胞工厂中重建大规模代谢通路(≥10个酶促步骤)的核心策略与前沿技术 | 整合智能算法与多学科工具,提出结合理性设计、动态控制和模块化共培养策略以突破天然产物生物制造瓶颈的综合框架 | NA | 实现高价值天然产物在微生物细胞工厂中的高效可持续生产 | 天然产物大规模代谢通路的重建策略与优化技术 | NA | NA | 合成生物学、系统生物学建模、机器学习 | NA | NA | NA | 高级克隆方法、蛋白质/DNA支架、核糖开关、生物传感器 | 微生物细胞工厂 | 模块化通路设计、动态调控机制(启动子工程、核糖开关、基于生物传感器的反馈控制)、共培养系统分工优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 236 | 2026-07-18 |
Exploration of multifunctional characteristics and regulatory mechanism of promoter G-quadruplexes
2026-Jun-26, Pharmacological reviews
IF:19.3Q1
DOI:10.1016/j.pharmr.2026.100151
PMID:42462488
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综述 | 综述启动子G-四链体的多功能特征与调控机制 | 首次提出启动子G-四链体的8大特征(广泛分布、位置特异性、结构多样性、精确调控、遗传可修饰性、动态可逆性、信号响应性及协同调控),并系统总结了其调控因子和表征方法 | 未明确提及局限性 | 系统梳理启动子G-四链体的特性、调控因子、表征方法及其在疾病诊断、生物成像、合成生物学、靶向治疗和抗病毒等方面的应用潜力 | 启动子G-四链体及其调控因子(天然产物、转录因子、小分子配体、核酸等) | 分子生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物成像, 合成生物学 |
| 237 | 2026-07-18 |
From feeding cell to fruiting body: Multidrug transport in the life cycle of Dictyostelium discoideum
2026, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2026.02.002
PMID:42203389
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综述 | 本文综述了盘基网柄菌生命周期中多药转运蛋白的功能及其在进化保守机制中的作用 | 首次系统整合盘基网柄菌中多种多药耐药蛋白家族(ABC、MFS、MATE等)的遗传学数据和转录组学信息,并探讨其在趋化、协同和细胞分化中的潜在角色 | 现有实验表征的转运蛋白数据稀疏,缺乏对该生物膜运输机制的全面功能验证 | 阐明盘基网柄菌多药转运蛋白在生命周期中的功能及其与人类疾病病理和合成生物学的关联 | 盘基网柄菌中的多药耐药蛋白及其生命周期中的运输机制 | 微生物学、合成生物学 | 耐药感染、人类疾病病理 | RNA-seq转录组学、共表达分析、生物信息学 | NA | 转录组数据 | NA(基于已发表数据整合) | NA | 盘基网柄菌 | NA | 医药、合成生物学 |
| 238 | 2026-07-17 |
Rewiring cellular immunotherapy: From CAR evolution to circuit innovations across diseases
2026-Jul-09, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108980
PMID:42425236
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综述 | 将基于嵌合抗原受体的免疫疗法重新定义为生物信号处理系统,并系统梳理其从线性受体架构到可编程免疫电路的演变过程 | 将CAR免疫疗法概念化为生物信号处理系统,超越传统的静态受体视角,强调可编程免疫电路的设计原则,并系统比较不同免疫细胞类型和基因递送平台 | NA | 回顾和总结CAR免疫疗法从线性受体到可编程电路的演变,探讨体外和体内免疫细胞重编程策略、病毒与非病毒基因递送平台以及跨疾病环境的电路CAR设计原则 | 基于嵌合抗原受体的免疫疗法,包括T细胞、自然杀伤细胞和巨噬细胞等多种免疫细胞类型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 可编程免疫电路,如多输入整合、逻辑运算、上下文依赖输出 | 医学 |
| 239 | 2026-07-17 |
A breakthrough in synthetic biology: industrial scaling-up flavonoid C-glycoside production in yeast
2026-Jul-09, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-026-3333-2
PMID:42449065
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2026-07-17 |
Chassis selection and metabolic fine-tuning enable efficient in planta betalain production
2026-Jul-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag337
PMID:42261105
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研究论文 | 通过底盘选择和代谢微调,在三种不同植物中高效生产甜菜红素 | 比较了拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘,并通过推拉策略(push+ pull)优化甜菜红素生物合成途径,实现高产且不影响大豆生长 | 强启动子驱动的推拉株系在拟南芥和烟草中导致矮化,仅在大豆中无严重生长缺陷,表明底盘耐受性差异 | 优化植物底盘选择和代谢平衡,实现甜菜红素的高效生产 | 拟南芥、烟草和大豆三种植物底盘 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 三种植物物种(拟南芥、烟草、大豆)的转基因株系 | NA | 拟南芥、烟草、大豆 | 甜菜红素生物合成途径(RUBYv2构建体)包含推拉策略:额外DODA酶(拉)和通过不同启动子调节酪氨酸前体供应(推) | 食品工业、生物技术 |