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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-12-10 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将小鼠的H3K9甲基化酶和HP1引入酿酒酵母,探究H3K9甲基化及其阅读分子HP1对转录和染色质结构的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基化酶和HP1,以克服系统冗余问题,直接评估其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行,可能无法完全反映H3K9甲基化和HP1在高等生物中的全部功能,且未观察到对转录或染色质三维结构的显著影响 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的具体作用机制 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 引入小鼠H3K9甲基化酶催化H3K9甲基化及HP1蛋白 | 基础研究 |
| 242 | 2025-12-08 |
Creating a novel halotolerant whole-cell biosensor for efficient degradation and precise quantification of p-nitrophenol-substituted organophosphate pesticides in hypersaline ecosystems
2026-Feb-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118240
PMID:41285662
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研究论文 | 本研究构建了一种新型耐盐全细胞生物传感器,用于高盐环境中对硝基酚取代的有机磷农药的高效降解和精确定量 | 首次利用耐盐底盘Halomonas cupida J9构建了耐盐全细胞生物传感器,通过动态调控PobR表达水平显著降低了背景荧光,并将优化的生物传感电路引入具有降解功能的底盘,实现了检测与降解的双重功能 | 生物传感器仅对pNP取代的有机磷农药(如甲基对硫磷和杀螟硫磷)具有特异性,对非pNP取代的有机磷农药(如毒死蜱)无响应 | 开发适用于高盐环境的有机磷农药检测与降解技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药(如甲基对硫磷) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、全细胞生物传感器构建、HPLC分析 | NA | 荧光信号、浓度测量数据 | 海水、高盐度河水、盐碱土样品 | BioBrick | Halomonas cupida J9 | 基于pNP响应转录调节因子PobR及其同源启动子与GFP报告基因融合的生物传感电路,结合有机磷农药降解通路 | 环境 |
| 243 | 2025-12-06 |
Microbial-mycotoxin interactions in food: A review of ecotoxicological implications and omics approaches for understanding detoxification mechanisms
2026-Apr, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2025.104955
PMID:41344758
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综述 | 本文综述了食品中微生物与霉菌毒素的相互作用,重点关注其生态毒理学影响以及利用组学方法阐明微生物解毒机制 | 系统整合了微生物解毒机制(吸附与酶促降解)与多组学技术(宏基因组学、基因组学、转录组学)的应用,并展望了合成生物学、CRISPR基因编辑和机器学习辅助生物信息学等未来方向 | 微生物解毒效率存在可变性、作用机制尚不明确、面临监管障碍,以及在复杂食品基质中检测掩蔽型霉菌毒素存在挑战 | 探讨食品系统中微生物与霉菌毒素的相互作用,以开发可持续的解毒策略,保障食品安全并降低生态毒理学影响 | 霉菌毒素(如黄曲霉毒素、赭曲霉毒素A、伏马菌素、单端孢霉烯族毒素、玉米赤霉烯酮)及其与微生物的相互作用 | NA | NA | 宏基因组学、基因组学、转录组学、多组学整合分析 | NA | NA | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | 食品、农业、环境 |
| 244 | 2025-12-06 |
Fusarium-responsive materials: A next-generation strategy for sensing, actuation, and sustainable crop protection
2026-Feb-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2025.128967
PMID:41061457
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综述 | 本文探讨了融合纳米技术、化学传感和智能驱动技术,构建能够实时识别病原体并自主干预的镰刀菌响应材料,以应对全球农业中镰刀菌属病原体带来的威胁 | 提出了“镰刀菌响应材料”这一新范式,将病原体特异性生物传感与刺激响应型纳米载体递送系统相结合,并展望了与机器学习、自供能传感器及合成生物学融合的智能、精准、可持续作物保护框架 | 本文是一篇展望性综述,主要提出概念框架和研究方向,未报告具体的实验数据或验证结果 | 旨在为应对镰刀菌属病原体对全球农业、粮食安全和可持续性的威胁,探索一种集实时传感与自主干预于一体的下一代作物保护策略 | 镰刀菌属病原体及其相关的生化特征,如挥发性有机化合物、霉菌毒素和酶标记物 | NA | NA | 电化学传感、光学传感、等离子体传感、机器学习算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 245 | 2025-12-05 |
Marine-derived natural products as anti-osteoporosis agents
2026-Jan-15, European journal of medicinal chemistry
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ejmech.2025.118284
PMID:41138334
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综述 | 本文系统总结了152种具有抗骨质疏松活性的海洋天然产物,并探讨了其生物合成途径、全合成策略及临床转化挑战 | 首次系统梳理海洋来源(主要为海洋真菌)的抗骨质疏松天然产物,并整合基因组挖掘与合成生物学等新兴技术推动临床转化 | 未涉及具体临床实验数据,转化路径中的药效学与毒理学评估仍需深入 | 加速海洋天然产物在骨质疏松治疗领域的药物开发 | 海洋来源的天然产物(以聚酮类和萜类为主) | NA | 骨质疏松症 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | 文献数据、化合物结构信息 | 152种海洋天然产物 | NA | 海洋真菌 | NA | 医药 |
| 246 | 2025-12-04 |
Darkfield illumination enhancing artificial-intelligence-assisted digital microfluidics for on-site pathogen detection
2026-Jan-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2025.344831
PMID:41330666
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研究论文 | 本研究提出了一种集成暗场照明的数字微流控平台,通过人工智能辅助增强液滴检测性能,用于现场病原体检测 | 开发了具有可切换双模式光学系统的ITO-DMF平台,利用暗场成像显著提升液滴对比度,优化AI驱动的液滴识别和特征提取 | NA | 提高数字微流控系统中基于人工智能的液滴识别精度,实现自动化病原体检测 | 数字微流控平台中的液滴,以及临床样本中的肺炎支原体 | 计算机视觉 | 肺炎 | 暗场成像,荧光成像,qPCR | 深度学习模型 | 图像 | 临床样本 | NA | NA | NA | 医学 |
| 247 | 2025-12-03 |
Revolutionizing recombinant protein production in prokaryotic platforms - Methodologies and advances
2026-Feb, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2025.110778
PMID:41207077
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综述 | 本文综述了原核系统中重组蛋白生产的传统和新兴策略,包括遗传工程和合成生物学的最新进展 | 强调了新兴策略如改进的表达载体、工程化宿主、高通量筛选平台,以及融合标签、密码子偏好消除、启动子和RBS工程、伴侣蛋白辅助折叠等优化方法 | NA | 优化重组蛋白在原核系统中的表达,以满足各领域日益增长的需求 | 重组蛋白在原核平台的生产 | NA | NA | 遗传工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌等原核生物 | 生物传感器、代谢途径 | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 248 | 2025-12-03 |
Microplastics and microbial interactions in marine environments: A critical review on biogeochemical cycling and ecological impacts
2026-Jan, Marine pollution bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.marpolbul.2025.118891
PMID:41166776
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综述 | 本文通过文献计量分析和机制综述,系统探讨了海洋环境中微塑料与微生物之间的双向相互作用及其对生物地球化学循环和生态的影响 | 整合了文献计量分析(2015-2025)与机制综述,系统性地阐述了微塑料与微生物的双向相互作用及其对海洋生物地球化学循环的级联效应 | 在将分子水平机制与生态系统尺度结果(尤其是在深海和沉积物生境中)联系起来方面仍存在关键空白 | 研究海洋微塑料污染及其与微生物的相互作用对生物地球化学循环和生态系统的影响 | 海洋环境中的微塑料和微生物 | NA | NA | 文献计量分析,多组学技术,沉积物微生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 249 | 2025-11-22 |
Virus-like particles as versatile scaffolds for nanobiosensors and nanoreactors: Design, applications, and future perspectives
2026-Feb-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118156
PMID:41172906
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综述 | 系统探讨病毒样颗粒作为纳米支架在纳米生物传感器和纳米反应器中的设计、应用及未来发展方向 | 提出将人工智能、先进材料和刺激响应设计整合以开发下一代智能纳米器件 | 在可扩展性、功能精确性和体内兼容性方面仍存在挑战 | 研究病毒样颗粒在纳米生物传感器和纳米反应器中的应用潜力 | 病毒样颗粒的结构与理化特性 | NA | NA | 光学传感(荧光、化学发光、表面等离子共振)、电化学传感(伏安法、电位法、阻抗法)、场效应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶途径空间组织、级联反应 | 医学诊断、治疗、可持续催化、生物催化、合成生物学 |
| 250 | 2025-11-21 |
Engineering heterologous core promoters to optimize the SES expression system for Pichia pastoris
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.10.005
PMID:41245009
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研究论文 | 通过工程化异源核心启动子优化毕赤酵母SES表达系统 | 首次从解脂耶氏酵母中筛选214个候选启动子,成功构建41个性能提升达5.4倍的SES系统,并结合CRISPR/Cas9多拷贝整合策略 | 未在更广泛的工业应用场景中验证系统稳定性 | 优化毕赤酵母合成表达系统(SES)的转录调控能力 | 毕赤酵母表达系统及其异源核心启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9, 荧光筛选 | NA | 基因表达数据, 荧光强度数据 | 214个合成启动子,54个功能验证,41个性能提升系统 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 毕赤酵母 | 合成表达系统(SES), 核心启动子工程 | 工业生物技术, 医药 |
| 251 | 2025-11-21 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
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综述 | 本文综述了基因表达与蛋白质丰度之间关系的研究进展,重点关注不同实验环境和细胞背景下两者的关联性 | 系统分类和比较了基于不同相关性度量方法的研究,并整合了单细胞分析等最新技术进展 | 主要依赖相关性分析,对因果关系的解释有限 | 探讨基因表达与蛋白质丰度之间的关联程度及其在生物技术中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的关系研究 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、代谢工程、合成生物学 |
| 252 | 2025-11-21 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
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综述 | 探讨细菌通过RNA水平机制精确控制蛋白质亚基化学计量比及其在合成生物学中的应用 | 超越经典转录调控,聚焦转录后精细调控机制,并展示如何将这些天然策略转化为可编程的合成基因电路设计 | NA | 解析细菌控制转录化学计量比的机制并开发合成生物学应用工具 | 细菌转录调控机制和合成基因电路 | 合成生物学 | NA | RNA水平调控分析、合成基因电路设计 | NA | NA | NA | 启动子文库、工程化终止子、RNase处理模块 | 细菌 | 合成基因电路、代谢途径工程、蛋白质组装系统 | 生物技术、生物医学 |
| 253 | 2025-11-21 |
Synthetic biology for scalable production of medical polyhydroxyalkanoates: Advances and applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108722
PMID:41046988
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综述 | 本文综述了合成生物学在医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产中的进展与应用 | 系统整合了CRISPR/Cas基因组编辑、启动子工程、核糖体结合位点优化等合成生物学技术,并引入嗜盐菌下一代工业生物技术提升生产经济性 | 未提供具体实验数据验证技术改进效果,主要基于现有研究进展的总结分析 | 探讨合成生物学技术促进医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产的进展与前景 | 聚羟基脂肪酸酯及其生产工艺 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, 启动子工程, 核糖体结合位点优化, 代谢通路优化, 形态工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 254 | 2025-11-18 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
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研究论文 | 本研究在热纤维梭菌中开发了一种热稳定的L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在热纤维梭菌中构建了具有175倍诱导动态范围和可忽略背景表达的热稳定L-阿拉伯糖诱导系统 | 未在其他梭菌属微生物中进行广泛验证 | 开发适用于热纤维梭菌的热稳定诱导表达系统 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | 合成生物学 | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | L-阿拉伯糖诱导系统,包含来自嗜热脂肪地芽孢杆菌T-6的诱导型启动子P和阻遏蛋白AraR | 工业生物技术, 能源 |
| 255 | 2025-11-18 |
Edible fungus Fusarium venenatum: advances, challenges, and engineering strategies for future food production
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.009
PMID:41015229
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综述 | 系统总结食用真菌Fusarium venenatum在合成生物学工具开发、底盘工程及应用方面的最新进展,探讨未来食品生物制造的挑战与发展策略 | 首次针对Fusarium venenatum菌株的系统性综述,填补了该领域在合成生物学工具开发和底盘工程应用方面的综述空白 | NA | 为基于Fusarium venenatum的未来食品生产系统开发提供思路和指导 | 食用丝状真菌Fusarium venenatum | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | Fusarium venenatum | NA | 食品, 农业 |
| 256 | 2025-11-16 |
Integrated base editing and microfluidics boost microbial lipid production from lignin
2026-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133441
PMID:41045995
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研究论文 | 本研究通过整合碱基编辑和微流控技术,开发了一种提升真菌利用木质素生产微生物油脂的方法 | 建立了铜诱导的MCM5-AID碱基编辑器实现全基因组C-to-T/G-to-A诱变,并结合微流控技术进行超高通量筛选 | NA | 提升微生物利用木质素生产油脂的能力 | 弯曲孢子菌Curvularia clavata J1 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑, 微流控技术, 转录组学, 基因组测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | 碱基编辑 | 弯曲孢子菌 | 铜诱导的MCM5-AID碱基编辑系统 | 能源, 工业生物技术 |
| 257 | 2025-11-16 |
Efficient biosynthesis of retinal from Escherichia coli by metabolic engineering
2026-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133501
PMID:41093029
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造大肠杆菌,实现了从生物资源高效合成视网膜的目标 | 采用系统与合成生物学方法构建高效视网膜生物合成细胞工厂,整合酶工程、翻译工程、膜工程和中心碳代谢重构等多层次工程策略 | 膜工程和NADPH再生的尝试未能提高视网膜产量 | 开发高效的视网膜生物合成方法 | 大肠杆菌BL21(DE3)工程菌株 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、酶工程、定向进化、RBS优化、膜工程 | NA | NA | 4-L生物反应器规模 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 甲羟戊酸途径代谢工程、中心碳代谢重构、β-胡萝卜素合成途径、视网膜生物合成途径 | 医药, 工业生物技术 |
| 258 | 2025-11-14 |
Harnessing synthetic biology for tetraterpenoid astaxanthin production: Recent advances and challenges
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.005
PMID:41208949
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术生产四萜类虾青素的最新进展与挑战 | 提出从'点'(关键酶活性调控)、'线'(途径空间协调)和'面'(系统代谢平衡)三个维度系统分析合成生物学在虾青素生产中的应用 | 未涉及具体实验验证,主要基于文献综述分析 | 探讨利用合成生物学技术实现虾青素可持续生产的策略 | 虾青素及其微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢重编程 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物细胞 | 代谢途径工程、人工细胞工厂 | 医药、营养补充剂 |
| 259 | 2025-11-14 |
CRISPR-based synthetic biology toolkit development in Candida viswanthii and functional analysis of the stress responsive Ena1-like protein
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.09.021
PMID:41208948
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研究论文 | 本研究开发了针对维斯瓦尼假丝酵母的CRISPR合成生物学工具包,并分析了应激响应蛋白g144的功能 | 结合CRISPR/Cas9和Cre/loxP系统建立了高效基因组编辑策略,实现100%编辑效率并在6天内完成快速迭代编辑 | NA | 开发维斯瓦尼假丝酵母的合成生物学操作工具并研究应激响应蛋白功能 | 维斯瓦尼假丝酵母工业菌株及其Ena1-like蛋白g144 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Cre/loxP, 基因组编辑 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | Candida viswanthii | 多重编辑和多拷贝基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 260 | 2025-11-02 |
A highly biosimilar synthetic Calculus Bovis enhances cerebral blood flow and provides neuroprotection against ischemic stroke
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120602
PMID:40945882
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研究论文 | 本研究评估了高度生物相似性合成牛黄在缺血性脑卒中中的神经保护作用及改善脑血流的效果 | 首次通过合成生物学方法制备高度生物相似性合成牛黄,并证实其在缺血性脑卒中治疗中的有效性和作用机制 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠模型,未涉及其他物种或性别差异研究 | 评估合成牛黄对缺血性脑损伤的治疗效果及改善脑血流的作用 | 雄性C57BL/6J小鼠的缺血性脑卒中模型 | 生物医学工程 | 缺血性脑卒中 | 色谱指纹图谱分析、Fluoro-Jade B染色、尼氏染色、激光散斑对比成像 | NA | 生物化学数据、组织学图像、血流动力学数据 | 使用不同剂量合成牛黄处理的tMCAO模型小鼠 | 合成生物学 | NA | NA | 医药 |