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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-02-20 |
Synthesis of 4-hydroxybenzoic Acid in Escherichia coli by a Modular co-culture System
2026-Feb, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05501-z
PMID:41452415
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研究论文 | 本研究通过构建模块化共培养系统,利用大肠杆菌生产4-羟基苯甲酸 | 首次报道使用葡萄糖作为唯一碳源,通过模块化共培养技术合成4-羟基苯甲酸,扩展了该技术的应用范围 | NA | 开发模块化共培养策略以减轻宿主细胞的代谢负担,并高效生产4-羟基苯甲酸 | 4-羟基苯甲酸的生物合成途径及其在大肠杆菌中的模块化表达 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、模块化共培养 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 将完整的4-羟基苯甲酸合成途径在莽草酸节点分割为上游和下游模块,分别构建于不同大肠杆菌菌株中 | 食品、医药、化妆品 |
| 262 | 2026-02-20 |
Gut microecology empowers cancer immunotherapy: commensal microbiota-mediated mechanisms and translational prospects of PD-1/PD-L1 therapy
2026-Jan-29, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文系统探讨了肠道菌群在调节PD-1/PD-L1免疫疗法反应中的关键作用及其转化前景 | 综述了肠道菌群通过代谢物产生和免疫通路激活等多机制增强PD-1/PD-L1疗法疗效,并探讨了基于菌群的个性化免疫治疗策略的临床前前景 | NA | 探讨肠道菌群在PD-1/PD-L1免疫疗法中的调控作用及转化应用 | 肠道共生微生物及其与PD-1/PD-L1免疫疗法的相互作用 | NA | 癌症 | 多组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 263 | 2026-02-20 |
Integrated omics analysis of the cellulose co-degradation network of Chaetomium thermophilum
2026-Jan-24, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02741-x
PMID:41580774
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研究论文 | 本研究通过整合组学分析揭示了嗜热毛壳菌纤维素共降解网络的协同机制,包括核心转录因子调控、酶分泌级联模式及糖酸代谢网络的作用 | 首次在嗜热真菌中发现CtClr-2作为核心转录因子驱动LPMOs、CDH和CBH等关键基因共表达,并揭示氧化酶与水解酶的三阶段级联分泌模式使还原糖产量提升60.6% | 研究聚焦于单一嗜热真菌物种,其机制在其他工业相关真菌中的普适性仍需验证;合成生物学工程改造仅停留在理论建议阶段 | 解析嗜热真菌高效降解纤维素的系统机制,为生物燃料工业化生产提供菌株改造靶点 | 嗜热毛壳菌(Chaetomium thermophilum)的纤维素降解网络 | 合成生物学 | NA | 整合组学分析(包括转录组、蛋白质组) | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学 | 嗜热毛壳菌 | 纤维素降解网络(包含转录调控模块、酶分泌级联模块、糖酸代谢模块) | 能源 |
| 264 | 2026-02-19 |
Engineering delivery platforms for CRISPR-Cas and their applications in healthcare, agriculture and beyond
2026-Feb-17, Nanoscale advances
IF:4.6Q2
DOI:10.1039/d5na00535c
PMID:41640466
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统的递送平台挑战及其在医疗、农业等领域的应用 | 全面概述了CRISPR技术递送的关键挑战及当前与新兴的递送策略,包括病毒载体、非病毒物理方法和纳米颗粒基模态 | 递送系统面临组织细胞特异性、细胞内环境差异、编辑效率可变及脱靶风险等障碍 | 探讨CRISPR-Cas系统的递送平台及其在医疗、农业等领域的应用 | CRISPR-Cas系统及其递送策略 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统,包括碱基编辑器和先导编辑器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医疗, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 265 | 2026-02-19 |
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre
IF:2.9Q1
DOI:10.1159/000550994
PMID:41701651
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综述 | 本文综述了生物膜与合成生物学交叉领域的最新进展,探讨了利用合成生物学工具调控生物膜行为以促进生物技术应用并应对相关挑战的策略 | 系统整合了生物膜工程与合成生物学的前沿工具,包括噬菌体疗法、电遗传系统、微生物群落设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰和抗菌肽涂层表面等,实现对生物膜结构、组成和代谢产物的精确操控 | 仍面临生物安全性、异质性、可扩展性和监管合规性等挑战 | 探索生物膜与合成生物学交叉领域的技术进展,推动生物膜在生物技术中的应用 | 生物膜(微生物群落)及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 噬菌体疗法、电遗传系统、群体感应调控、遗传电路工程、胞外聚合物修饰 | NA | NA | NA | 遗传电路 | 微生物群落 | 遗传电路、群体感应调控系统、电遗传系统 | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 266 | 2026-02-19 |
Design prokaryotic cis-regulatory elements using language model
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag122
PMID:41693567
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研究论文 | 本研究开发了一个名为PromoGen2的语言模型,用于设计原核生物的顺式调控元件(CREs),无需先验实验数据,并在多个物种中验证了其功能性和应用潜力 | 提出了一个基于语言模型的平台PromoGen2,能够为零数据的原核生物设计功能性启动子,显著提高了跨物种启动子强度的零样本预测相关性,并开发了Promoter-Factory框架和PromoGen2-proka分类感知模型 | NA | 开发一个广泛适用的平台,用于为数千种原核生物设计功能性顺式调控元件(CREs),以支持合成生物学和微生物学研究 | 原核生物的顺式调控元件(CREs),包括启动子,涉及物种如大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、根癌农杆菌以及新分离的嗜盐细菌Jejubacter sp. L23 | 自然语言处理 | NA | 语言模型,深度学习 | 语言模型(PromoGen2,PromoGen2-proka) | 文本(顺式调控元件序列) | 源自17,000个原核基因组的CREs | NA | 大肠杆菌,枯草芽孢杆菌,地衣芽孢杆菌,根癌农杆菌,Jejubacter sp. L23 | 顺式调控元件(CREs)设计,包括启动子,用于驱动番茄红素过量生产 | 工业生物技术,合成生物学 |
| 267 | 2026-02-19 |
T cell immunotherapy for solid tumors: limitations, progress, and future prospects
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755751
PMID:41694348
|
综述 | 本文全面综述了针对实体瘤的T细胞免疫疗法的现状、挑战与未来前景 | 系统梳理了CAR-T、TCR-T和TIL疗法在实体瘤中的最新进展,并重点讨论了克服抗原异质性、肿瘤微环境抑制等障碍的新兴策略 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据或临床结果,主要基于现有文献进行分析 | 总结T细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的进展、挑战及未来发展方向 | 针对实体瘤的T细胞免疫疗法,包括CAR-T细胞、TCR-T细胞和肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 实体瘤 | 合成生物学工具、基因编辑技术、多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 嵌合抗原受体、T细胞受体工程 | 医学 |
| 268 | 2026-02-19 |
Elucidation of the pramanicin biosynthetic pathway reveals a DUF2306 family membrane protein involved in terminal epoxidation
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1765828
PMID:41695960
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研究论文 | 本研究阐明了真菌代谢产物pramanicin的生物合成途径,并首次揭示了DUF2306家族膜蛋白在终端环氧化反应中的功能 | 首次鉴定了pramanicin的生物合成基因簇,并发现DUF2306家族膜蛋白PraC在天然产物生物合成中的环氧化功能 | NA | 解析pramanicin的生物合成途径 | 真菌代谢产物pramanicin及其生物合成基因 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组合表达、饲喂实验 | NA | NA | NA | 异源表达 | 真菌、Aspergillus nidulans | pramanicin生物合成途径(包含PKS-NRPS杂合酶、单加氧酶、短链脱氢酶/还原酶及膜蛋白环氧化酶) | 医药 |
| 269 | 2026-02-19 |
KmPred: prediction of Michaelis constants (Km) using an integrative machine learning framework
2026, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2026.1711471
PMID:41696044
|
研究论文 | 本文提出了一个名为KmPred的集成机器学习框架,用于预测酶动力学参数米氏常数(Km) | 整合了最先进语言模型的蛋白质序列嵌入与底物SMILES描述的分子描述符,构建了多模态特征融合的预测框架 | NA | 开发一个计算预测方法,以替代传统耗时费力的体外实验测定酶动力学参数 | 酶-底物相互作用的米氏常数(Km) | 机器学习 | NA | 机器学习 | LSTM, Transformer, XGBoost | 蛋白质序列, 化学描述符 | MPEK数据集和Kroll等人组装的独立数据集 | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药物发现 |
| 270 | 2026-02-19 |
Tripterygium glycosides: recent advances in mechanisms, therapeutic applications, and safety optimization
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1728162
PMID:41704700
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综述 | 本文综述了雷公藤多苷在药理机制、临床应用及安全性优化方面的最新进展 | 强调了通过单体分离、结构优化、前药策略和创新递送系统来克服雷公藤多苷治疗窗口窄的问题,并介绍了新兴衍生物如LLDT-8和雷公藤内酯的减毒增效特性 | NA | 总结雷公藤多苷的药理机制、治疗应用及安全性优化策略 | 雷公藤多苷及其衍生物 | NA | 系统性红斑狼疮、糖尿病肾病、类风湿关节炎、银屑病 | 系统药理学、合成生物学、AI辅助药物设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 271 | 2026-02-18 |
Advances and applications in tumor organoid research Harnessing human tumor organoids for cancer modeling and precision therapy
2026-Feb-16, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag007
PMID:41698840
|
综述 | 本文综述了人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的应用,包括其生成技术、微环境模拟及临床转化潜力 | 将人类肿瘤类器官定位为连接基础研究与临床转化的变革性临床前平台,并整合芯片平台、三维生物打印和人工智能分析等新兴技术 | 完全模拟肿瘤微环境仍具挑战性,特别是在复制血管复杂性和系统性免疫反应方面 | 探索人类肿瘤类器官在癌症建模、精准治疗和临床转化中的应用 | 人类肿瘤类器官及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 272 | 2026-02-18 |
Peimine: A comprehensive review of its botanical distribution, biosynthesis, pharmacological effects and pharmacokinetics
2026-Feb-13, Fitoterapia
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.fitote.2026.107140
PMID:41692275
|
综述 | 本文全面综述了贝母碱的植物分布、生物合成、药理作用和药代动力学研究进展 | 系统总结了贝母碱的物种特异性分布、多靶点药理活性及基于合成生物学的生产潜力 | 口服生物利用度低且药代动力学特征不明确,限制了其临床应用 | 支持贝母碱的合理开发与利用 | 贝母碱(一种主要存在于贝母属植物中的甾体生物碱) | NA | 呼吸系统疾病 | 基因组学、酶表征 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 273 | 2026-02-17 |
Application of Biotechnology in Marine-Derived Fermented Foods: Technological Evolution and Future Prospects
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70422
PMID:41693674
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综述 | 本文综述了现代生物技术在海洋源发酵食品中的应用进展、技术演变及未来展望 | 系统比较了新型生物技术与传统发酵技术的差异,并为海洋生物发酵产品的产业化提供了创新视角 | 讨论了生物技术在海洋源发酵食品应用中面临的挑战与限制 | 探讨现代生物技术在海洋源发酵食品领域的应用轨迹与发展方向 | 海洋生物资源(如鱼类、甲壳类、贝类、大型藻类)及其发酵食品 | NA | NA | 微生物组学、多组学分析、合成生物学、基因组编辑、精准发酵、测序技术、智能发酵控制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 274 | 2026-02-17 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-Feb-15, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 本文概述了利用合成微生物工程生产可持续消费油脂的新方法,以推动向微生物生物制造经济的转型 | 提出了利用合成生物学和自动化生物铸造平台开发微生物作为可持续油脂来源的新策略,以应对传统作物依赖带来的环境问题 | NA | 探讨如何通过合成微生物工程实现消费油脂的可持续生产 | 微生物油脂及其在食品、营养品、塑料、化妆品、药品和燃料等产品中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造技术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 食品, 营养品, 塑料, 动物饲料, 化妆品, 药品, 燃料 |
| 275 | 2026-02-17 |
Mining the Hidden Pharmacopeia: Fungal Endophytes, Natural Products, and the Rise of AI-Driven Drug Discovery
2026-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031365
PMID:41683797
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综述 | 本文综述了真菌内生菌天然产物的化学与生物合成多样性,并探讨了人工智能如何将天然产物发现从经验筛选转变为具有直接工业应用价值的预测性学科 | 将真菌内生菌这一进化优化的天然产物宝库与人工智能、机器学习及多组学整合技术相结合,实现了对隐蔽生物合成基因簇的预测、激活及从头设计,推动了药物发现向预测性、工程化方向转型 | NA | 探讨人工智能如何加速真菌内生菌天然产物的发现、设计与工业化应用,以应对生物医学和可持续性挑战 | 真菌内生菌产生的天然产物(如聚酮、生物碱、萜类、肽类)及其生物合成基因簇 | 机器学习 | NA | 多组学整合、基因组挖掘、代谢组学注释 | 深度学习、生成式AI、扩散模型 | 基因组数据、代谢组数据、生物合成基因簇数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 276 | 2026-02-17 |
Phage Therapy in Plant Disease Management: 110 Years of History, Current Challenges, and Future Trends
2026-Jan-24, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15030368
PMID:41681534
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综述 | 本文回顾了噬菌体疗法在植物病害管理中110年的发展历史,分析了当前面临的挑战,并探讨了未来的发展趋势 | 全面梳理了噬菌体疗法在植物病害管理领域的完整历史脉络,并前瞻性地讨论了合成生物学、先进递送系统与人工智能等前沿技术的整合潜力 | NA | 回顾噬菌体疗法在植物病害管理领域的发展历程,并展望其未来趋势 | 噬菌体及其在植物病害管理中的应用 | NA | 植物病害 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 277 | 2026-02-16 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究通过分析本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源,建立了变异模型并提出了减少变异性的实验设计指南 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行了全面建模分析,并基于三年纵向数据提出了量化实验设计指南 | 研究主要针对本氏烟草系统,结论可能不直接适用于其他植物瞬时表达系统 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源并建立减少变异性的实验设计方法 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异模型、功效分析 | 实验数据 | 1915株植物(三年纵向数据) | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 瞬时表达系统 | 农业、工业生物技术 |
| 278 | 2026-02-16 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Ouroborosyn-ssDNA的NEAR平台,通过酶工程与计算优化相结合,实现了长单链DNA的高纯度合成,并应用于活细胞的高精度诊疗一体化 | 结合phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶于甲酸盐缓冲液中,显著提升了ssDNA的合成长度(达15000 nt)和产率(提升4.73倍),并利用机器学习优化了镁离子动态和热调制等关键参数 | NA | 解决当前DNA纳米技术在合成长单链DNA时面临的高纯度与均质性不足的挑战 | 长单链DNA(ssDNA)的合成技术及其在活细胞诊疗一体化中的应用 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 切口酶辅助复制(NEAR)、固相合成、机器学习优化 | NA | NA | NA | CRISPR | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物,用于核仁素靶向的基因组编辑 | 医学 |
| 279 | 2026-02-16 |
LINC00973/DTX3L Axis Promotes Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Serves as a Therapeutic Target
2026-Feb, Smart medicine
DOI:10.1002/smmd.70029
PMID:41684454
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA LINC00973在非小细胞肺癌中通过稳定DTX3L蛋白并激活AKT信号通路促进肿瘤进展的机制,并开发了基于外泌体递送siRNA的靶向治疗策略 | 首次发现LINC00973/DTX3L轴在非小细胞肺癌中的致癌作用,并创新性地采用RGD修饰外泌体和合成生物学策略实现靶向治疗 | 未明确LINC00973在肺癌亚型中的特异性表达差异,临床前模型的长期安全性尚未验证 | 探究LINC00973在非小细胞肺癌中的生物学功能及治疗靶点价值 | 非小细胞肺癌组织样本、肺癌细胞系、小鼠肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 高通量测序、功能获得/缺失实验、外泌体递送技术、合成生物学 | NA | RNA测序数据、临床病理数据、体内外实验数据 | 配对的NSCLC肿瘤组织与癌旁组织样本(具体数量未说明) | 合成生物学技术 | 小鼠模型、肝脏细胞(用于外泌体生产) | 基于肝脏生产携带靶向siRNA外泌体的合成生物学系统 | 医学 |
| 280 | 2026-02-16 |
Membrane and proteome allocation constraints in Escherichia coli models during overflow metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
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研究论文 | 本研究开发了膜相关约束通量平衡分析模型,以探究大肠杆菌在溢流代谢中膜资源分配的关键作用 | 引入了可调节的膜蛋白质量约束,首次在基因组尺度模型中整合膜分配限制,提高了溢流代谢预测的准确性 | 模型可能未涵盖所有膜相关生物物理因素,且主要基于大肠杆菌,在其他微生物中的普适性有待验证 | 探究膜资源分配如何与整体蛋白质组限制共同调控细菌生理和溢流代谢 | 大肠杆菌的代谢策略和膜蛋白表达 | 代谢工程 | NA | 通量平衡分析 | MAFBA | 基因组尺度代谢模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |