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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-06-05 |
Microbial-driven nature-based solutions for environmental antimicrobial resistance and emerging contaminants: mechanisms, platform trade-offs, and decision framework
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1804764
PMID:42238881
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综述 | 本文综述了微生物驱动的自然解决方案在应对环境抗菌素耐药性和新兴污染物中的机制、平台权衡及决策框架 | 提出了一个连接环境来源、微生物机制、平台设计和监测指标的微生物自然解决方案决策框架,并整合了微生物生态学、合成生物学和组学方法的设计思路 | 面临可扩展性、长期性能、生态风险和监管接受度方面的挑战 | 探讨微生物驱动的自然解决方案在环境抗菌素耐药性和新兴污染物缓解中的应用与决策框架 | 抗菌素耐药性和新兴污染物(包括药物、个人护理产品、微塑料和内分泌干扰物) | 机器学习 | NA | 微生物生态学、合成生物学、组学方法 | NA | NA | 2000年至2024年间发表的文献 | NA | NA | NA | 环境 |
| 322 | 2026-06-05 |
Diterpenoids in medicinal plants: structure, distribution, biological activities, biosynthesis, and bioengineering prospects
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1833614
PMID:42239869
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综述 | 系统总结药用植物中二萜类化合物的结构、分布、生物活性、生物合成途径及生物工程前景 | 全面整合了二萜类化合物的结构分类、功能机制与合成生物学应用,并提出了机器学习在药理学和酶工程中的未来方向 | 未深入讨论具体化合物的临床前或临床试验数据,可能缺乏实际应用案例的定量分析 | 系统梳理二萜类化合物的研究现状,为发现新活性化合物、阐明完整生物合成途径及可持续生产提供基础 | 药用植物中的二萜类化合物 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 323 | 2026-06-04 |
Semi-rational engineering of terminal deoxynucleotidyl transferase for high-efficiency enzymatic de novo DNA synthesis
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.009
PMID:41938127
|
研究论文 | 通过半理性工程改造末端脱氧核苷酸转移酶(TdT),实现了高效、可扩展的酶促DNA从头合成 | 通过UniProt数据库挖掘发现BtTdT并对其功能进行特性表征,结合AlphaFold3预测结构进行结构域截短和理性突变,获得显著提升3'-ONH-dNTP掺入活性的五重突变体M5 | 论文未说明该方法在长链DNA合成中的实际保真度和序列长度限制,也缺乏与现有磷酰胺酯方法的全面对比 | 开发高效、环保的酶促DNA合成技术,实现工业级DNA制造 | 末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)及其突变体 | 生物技术 | NA | 酶促DNA合成, NGS(间接通过数据库挖掘), 计算机模拟(AlphaFold3) | AlphaFold3 | 序列数据(蛋白质序列) | 多种突变体评估(具体样本量未明确报告) | NA | NA | NA | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 324 | 2026-06-04 |
Filamentous fungal synthetic biology: Current applications and ongoing developments
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108912
PMID:42069191
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综述 | 综述丝状真菌合成生物学在当前应用与未来发展 | 探讨丝状真菌在食品、医药、材料科学和生物修复等领域的新兴应用,并结合基因测序和计算技术促进合成生物学标准化 | 指出研究领域中的挑战和研究空白,如标准化语言创新不足 | 促进丝状真菌合成生物学在多种工程和应用领域的理解与标准化 | 丝状真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 丝状真菌 | NA | 食品, 医药, 材料科学, 生物修复 |
| 325 | 2026-06-04 |
Toward synthetic biology in mushroom-forming Agaricomycete fungi: from tools to applications
2026-Jun-03, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00178-25
PMID:42233661
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综述 | 回顾了蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌合成生物学的研究进展,并指出了限制可预测遗传工程的主要障碍以及未来优先发展方向 | 首次系统总结蘑菇生物学特有的工程约束(如复杂有性周期、异核体特性及转化过程中的菌株不稳定性),并深入分析了基因表达瓶颈(如启动子和终止子表征不足、基因组浓缩导致基因整合困难、内含子和特定序列基序的影响),同时提出了未来优先发展方向包括遗传部件跨物种评估、更先进基因编辑策略、高通量筛选方法及建立统一模型系统 | 未详细讨论具体实验案例或应用效果,主要基于已有文献综述和推理 | 推动蘑菇形成菌纲真菌合成生物学发展,使其成为可持续生物制造、设计生物材料、气候解决方案和真菌生物学机制研究的可编程平台 | 蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9等基因编辑策略 | 蘑菇形成菌纲(Agaricomycetes)真菌 | NA | 可持续生物制造, 设计生物材料, 气候解决方案, 机械真菌生物学研究 |
| 326 | 2026-06-04 |
Expanding the genetic toolset: Using serine recombinases to integrate riboregulatory elements into industrially relevant microbial chassis
2026-Jun-02, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuag015
PMID:42228948
|
研究论文 | 本研究展示了将核糖调控元件通过丝氨酸重组酶整合到工业相关微生物底盘中的方法 | 同时利用顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程两种合成生物学工具,实现多个宿主的通用基因组操作和精确基因表达 | 未明确说明局限性 | 扩展工业微生物在生物制造中的应用工具集 | 顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程在荧光报告系统中的功能 | 合成生物学 | NA | SAGE, 丝氨酸重组酶 | NA | 荧光强度数据 | 三种工业相关宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、嗜氢贪铜菌 | 丝氨酸重组酶, SAGE | 恶臭假单胞菌, 谷氨酸棒杆菌, 嗜氢贪铜菌 | 顺式抑制子调控元件与荧光报告基因的整合系统 | 工业生物技术, 生物制造 |
| 327 | 2026-06-04 |
Biosynthesized Silk-Amyloid-Mussel Proteins as Dissolution Recyclable Materials With Tunable Supercontraction
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.73200
PMID:42051062
|
研究论文 | 本文通过蛋白质工程和合成生物学设计了一种可溶解回收的丝-淀粉样蛋白-贻贝融合蛋白材料,兼具高机械性能和完全可回收性 | 首次通过理性设计平衡相互作用力与溶剂可及性,实现了高强韧蛋白材料的完全溶解回收,并发现回收后材料仍保持优异性能且可再加工成水下粘附水凝胶 | 未详细阐述材料在极端环境(如强酸强碱、高温)下的长期稳定性以及规模化生产的可行性 | 设计一种可溶解回收、高性能且可持续的蛋白质基材料 | 丝-淀粉样蛋白-贻贝(SAM)融合蛋白及其纤维和水凝胶 | 合成生物学 | NA | NGS | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料科学,环境工程 |
| 328 | 2026-06-04 |
Enabling Clinical Translation of Oral Probiotics Through Formulation Engineering and Scalable Manufacturing
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70253
PMID:42226613
|
综述 | 系统综述了口服益生菌在配方工程和可规模化制造方面的进展,以推动其临床转化 | 强调益生菌配方的功能输出(而非单纯结构保护)作为核心治疗驱动力,并评估了多种前沿技术(如合成生物学驱动菌株工程、微流控封装)在临床相关疾病中的应用 | 综述性质,未提供实验数据;各技术平台的优缺点仅基于文献评估,缺乏直接比较 | 推动口服益生菌在精准医学中的临床应用 | 口服益生菌配方及相关工程技术 | 机器学习和数字病理信息不足,主要涉及微生物学和生物工程,可选“合成生物学” | 结直肠癌,炎症性肠病,代谢紊乱,神经炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,微流控封装,高密度发酵 | NA(益生菌泛指,未特指具体宿主) | NA(未描述具体生物电路) | 医学 |
| 329 | 2026-06-04 |
High-resolution melting analysis for rapid and cost-effective detection of unnatural base pairs
2026-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100090
PMID:42233153
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研究论文 | 建立高分辨率熔解分析作为快速低成本检测非天然碱基对的方法 | 首次将高分辨率熔解分析应用于非天然碱基对的检测,基于短扩增子的熔解温度差异,可直接整合到标准PCR流程中,使用常见qPCR仪器实现快速筛选 | 未明确说明,但可能涉及对特定非天然碱基对(NaM-TPT3)的优化,通用性需进一步验证 | 开发一种快速、可及且成本有效的非天然碱基对检测方法,以支持合成生物学和基因字母扩展研究 | 非天然碱基对NaM-TPT3在DNA中的掺入和稳定性 | 合成生物学、生物技术 | NA | 高分辨率熔解分析(HRM)、聚合酶链反应(PCR)、液相色谱-质谱联用(LC-MS) | NA | 熔解曲线数据 | 未明确说明,涉及非扩增DNA对照和定义变异混合物 | NA | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程、生物防护 |
| 330 | 2026-06-04 |
Enhancement Strategies for Bioelectrocatalytic Conversion of Organic Waste
2026-May-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00179
PMID:42232028
|
综述 | 系统综述生物电催化转化有机废弃物的基本原理、发展历程、微生物工程策略及过程优化方向 | 独特整合生物创新与过程工程进展,从分子、微生物和反应器尺度提供协同优化的整体视角,并明确连接微生物碳/电子流工程与生物反应器设计及过程耦合 | NA | 建立加速生物电催化技术工业化应用的全面路线图 | 有机废弃物的生物电催化转化过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 微生物 | 生物电催化回路 | 环境, 工业生物技术 |
| 331 | 2026-06-04 |
Modular Biosurface Engineering of Magnetotactic Bacteria for Multimodal Synergistic Cancer Therapy
2026-May-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00177
PMID:42232030
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研究论文 | 介绍一种可扩展的模块化生物表面工程平台,用于功能化野生型趋磁细菌,实现多模态协同癌症治疗 | 提出模块化生物表面工程平台,实现趋磁细菌的多功能化,整合小分子、聚合物、纳米颗粒和金属有机框架等多种材料,并以AMB-1@Fe-PDA为例展示肿瘤靶向递送、免疫抑制微环境重编程、先天免疫激活与光热-化学动力学治疗的协同机制 | 临床转化前需进一步评估长期生物安全性和有效性,以及规模化生产的可行性 | 开发一种可规模化、模块化的趋磁细菌生物表面工程平台,用于癌症治疗 | 趋磁细菌(AMB-1菌株) | 合成生物学 | 乳腺癌 | 纳米材料修饰 | 小鼠模型 | 实验数据 | 小鼠模型中两个治疗周期,中位生存期从45天延长至67天 | NA | 趋磁细菌 | Fe-PDA涂层与趋磁细菌结合的模块化生物表面工程平台 | 医学 |
| 332 | 2026-06-04 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Apr-27, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
|
研究论文 | 基于GP35重组酶的基因编辑工具,用于反刍动物支原体的靶向基因编辑 | 首次将噬菌体SPP1的GP35重组酶应用于牛支原体,实现基于质粒的长单链DNA重组工程,达到77.78%-100%的正向编辑率,且消除了随机脱氨风险 | 目前仅针对牛支原体验证,尚未在其它反刍动物支原体中进行广泛测试,且结构保守性分析有待进一步实验证实 | 开发针对反刍动物支原体的高效基因编辑工具,以推动病原机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体病菌,尤其是牛支原体 | 合成生物学 | 牛支原体病,牲畜疾病 | 重组酶介导的基因编辑 | NA | 生物序列数据 | 多个牛支原体突变株,具体数量未明确提及 | GP35重组酶 | 牛支原体,反刍动物支原体 | 基于质粒的GP35-ssDNA重组系统,用于基因插入和缺失 | 医学,农业 |
| 333 | 2026-06-04 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
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综述 | 评估工程微生物作为靶向癌症治疗药物的应用潜力 | 系统总结工程微生物在肿瘤微环境靶向治疗和抗肿瘤免疫增强中的最新进展 | 仍面临个体间差异、安全性问题和监管障碍等挑战 | 探讨微生物组在癌症治疗中的治疗潜力 | 工程微生物及其对胰腺癌、乳腺癌、肺癌和结直肠癌等的作用 | 合成生物学 | 胰腺癌,乳腺癌,肺癌,结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学 |
| 334 | 2026-06-04 |
Prolyl hydroxylase-dependent proteolysis enables the orthogonal hypoxia responses in plants
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71366-3
PMID:41957032
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研究论文 | 该研究通过工程化三组分系统,在植物中实现了氧依赖性蛋白降解,从而模拟动物缺氧响应机制 | 首次在植物中构建了基于脯氨酰羟化酶的氧依赖性蛋白降解系统,实现了植物与动物缺氧响应机制的功能性整合 | 人工系统仅部分恢复缺氧响应,且主要验证了转录调控功能,未全面测试对其他细胞过程的影响 | 利用合成生物学重新编程植物信号通路,探索植物与动物缺氧响应机制的同源性 | 拟南芥中的转录因子和报告蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白降解工程、转录调控分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(推断用于突变体构建) | 拟南芥 | 氧依赖蛋白降解系统(三组分:脯氨酰羟化酶、底物标签、泛素连接酶) | 农业、作物改良 |
| 335 | 2026-06-04 |
In Situ Synthesis of Glycosaminoglycan-Mimicking Coatings Driven by Local Pathological Microenvironment: Boosting Bladder Mucosal Regeneration and Barrier Function
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202505017
PMID:41589795
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研究论文 | 利用内源性病理微环境触发原位合成糖胺聚糖模拟涂层,促进膀胱黏膜再生和屏障功能恢复 | 首次利用内源性过氧化氢和过氧化氢酶驱动原位聚合反应,在膀胱黏膜表面构建糖胺聚糖模拟涂层,实现抗炎和屏障功能修复的协同作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行验证,未评估在大型动物或人类中的效果和安全性 | 开发一种利用局部病理微环境驱动的原位合成策略,用于膀胱黏膜修复和屏障功能恢复 | 膀胱黏膜损伤的大鼠模型(环磷酰胺诱导的间质性膀胱炎) | 合成生物学、生物材料 | 间质性膀胱炎 | 内源性酶驱动聚合 | NA | 组织学图像、分子表达数据 | 多个大鼠模型样本,未具体说明数量 | NA | 大鼠 | 海藻酸寡糖-聚多巴胺共聚物的原位合成路径,用于模拟糖胺聚糖涂层 | 医学 |
| 336 | 2026-06-04 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
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综述 | 本文综述了利用微生物作为生物传感器将环境信息转化为可检测信号的创新技术 | 通过整合电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等新型读取方法,以及利用宏基因组数据挖掘和变构蛋白开关设计来扩展传感组件 | 大部分生物传感器在难以成像的环境(如土壤、沉积物和废水)中应用存在严重限制 | 探讨如何编程微生物细胞和群落作为传感器,以在复杂环境中实现环境信息的转化和读取 | 微生物细胞和群落的生物传感器系统 | 合成生物学 | NA | 电化学、气相色谱、高光谱成像、下一代测序 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, mammalian cells, plants | 生物传感器、环境响应电路 | 环境监测, 农业, 工业生物技术 |
| 337 | 2026-06-04 |
Development of microbial chassis for production of fungal natural products
2026-Mar, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2608895
PMID:41592899
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综述 | 综述了用于真菌天然产物生产的微生物底盘开发 | 系统评估了多种微生物底盘的特征和途径重构策略,以提高异源表达效率 | 未提供具体实验数据,仅基于现有文献进行分析 | 优化微生物底盘以更有效地生产真菌天然产物 | 真菌天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘 | 代谢途径重构 | 医药 |
| 338 | 2026-06-04 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
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综述 | 本文综述了合成构建物对酵母细胞造成的胁迫及其应对策略 | 提出了胁迫感知型设计原则,并总结了新兴缓解方法如CRISPR回路重连、适应性实验室进化、合成细胞器构建和数据驱动菌株工程 | 未提供具体实验数据或定量比较,仅基于文献总结 | 理解合成构建物与酵母胁迫通路的相互作用,开发更稳健的酵母系统 | 酿酒酵母中异源构建物引起的胁迫反应 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 胁迫感知回路设计 | 工业生物技术 |
| 339 | 2026-06-04 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 开发了一套用于多形拟杆菌的合成生物学工具包,并利用其构建了检测肠道渗透压改变的生物传感器 | 首次在拟杆菌中构建了模块化的荧光转录报告电路,并利用工程菌实现了长期非侵入性的肠道渗透压监测 | 传感器仅在泄剂诱导的渗透性腹泻小鼠模型中验证,未在自然疾病状态或人体中测试 | 开发适用于肠道共生菌的遗传工具,构建用于监测肠道微环境变化的生物传感器 | 多形拟杆菌工程菌株及其在体外和小鼠肠道中的传感性能 | 合成生物学 | 肠道疾病 | 荧光蛋白表达、DNA调控系统、质粒整合 | 报告电路(转录调控) | 单细胞荧光信号 | 小鼠模型(泄剂诱导的腹泻组与对照组) | NA | 多形拟杆菌 | 可抑制启动子、DNA调控模块、荧光转录报告电路 | 医学 |
| 340 | 2026-06-04 |
Gut microecology empowers cancer immunotherapy: commensal microbiota-mediated mechanisms and translational prospects of PD-1/PD-L1 therapy
2026-Jan-29, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 系统探讨共生微生物群在PD-1/PD-L1免疫治疗中的调控作用及其转化前景 | 通过多机制解析肠道微生物增强PD-1/PD-L1阻断疗效,包括代谢产物重塑肿瘤微环境和激活免疫通路,并整合多组学、合成生物学及精准干预策略 | 临床研究有限,基于微生物组的个性化免疫治疗策略仍需进一步验证 | 阐明肠道微生物群通过代谢产物和免疫途径调控PD-1/PD-L1免疫治疗效果的机制,并评估粪便微生物移植和益生菌干预的转化潜力 | 肠道共生微生物与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 机器学习 | 癌症 | 粪菌移植、益生菌干预、多组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |