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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-03-28 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
|
综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新进展 | 整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学,以挖掘植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探索植物肽在植物生长、发育、免疫和环境适应中的调控作用及其应用潜力 | 植物肽,包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学和质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 322 | 2026-03-28 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2026-Jan-19, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
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研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备,用于分析纳米孔形成特性,并评估了增强剂shodoamide C对两性霉素B活性的影响 | 首次开发了一种分析系统,通过浓度依赖的释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂的活性,为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 研究纳米孔在脂质体膜上的形成特性,并开发一种用于分析膜活性化合物(如两性霉素B及其增强剂)的新系统 | 脂质体膜、两性霉素B、麦角固醇、shodoamide C | 合成生物学 | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像 | NA | NA | NA | NA | 医药、药物发现、合成生物学 |
| 323 | 2026-03-25 |
[Biomanufacturing driven by engineered organisms (2026)]
2026-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260153
PMID:41873064
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综述 | 本文回顾了2025年合成生物学与生物制造在智能化集成、系统优化及多元化应用方面的显著进展,并展望了该领域的未来发展方向 | 人工智能从辅助工具演变为核心驱动力,推动研究范式从“经验驱动”向“数据和模型驱动”的根本转变;环境生物修复从功能菌株工程转向合成微生物群落的理性设计,标志着可预测、可控修复策略的新时代 | NA | 总结合成生物学与生物制造领域的最新进展,并展望其未来发展趋势 | 合成生物学与生物制造领域的技术、应用及发展趋势 | NA | NA | 人工智能、酶工程、蛋白质设计、细胞工厂构建、合成微生物群落设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 传统及新兴底盘宿主 | 细胞工厂、合成微生物群落、人工细胞 | 工业生物技术、环境、能源、医药 |
| 324 | 2026-03-25 |
[Recent advances in the application value and biosynthesis of chiral reticuline]
2026-Mar-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250432
PMID:41873066
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综述 | 本文系统总结了手性网状碱作为苄基异喹啉生物碱核心骨架的应用价值、合成途径及最新研究进展 | 揭示了具有(-)-立体化学偏好的研究,为合成(-)-构型苄基异喹啉生物碱提供了新途径 | (-)-网状碱的生物合成仍受关键酶立体选择性的限制,需通过酶工程和途径重构等策略解决 | 为开发下一代高效、高选择性的苄基异喹啉生物碱提供理论支持和实践指导 | 手性网状碱及其在苄基异喹啉生物碱生物合成中的应用 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 酶工程、途径重构 | NA | NA | NA | NA | 微生物宿主 | 苄基异喹啉生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 325 | 2026-03-25 |
Charting the path for L-tyrosine derivatives: from engineering strategies to microbial cell factories
2026-Mar-24, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00091b
PMID:41873744
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综述 | 本文系统总结了利用合成生物学策略在微生物细胞工厂中生物合成L-酪氨酸及其衍生物(如酪醇、对香豆酸和L-多巴)的工程策略、最新进展及未来挑战 | 聚焦于近五年(2021-2025)的最新进展,以酪醇、对香豆酸和L-多巴为关键节点,系统总结了从酶、代谢到细胞水平的工程策略,并提出了加速L-酪氨酸衍生物生物制造的路线图 | NA | 加速L-酪氨酸及其衍生物的绿色、可规模化生物制造 | L-酪氨酸及其衍生物(如酪醇、对香豆酸、L-多巴) | 合成生物学 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 代谢通路工程,生物合成途径设计 | 医药, 食品, 化学工业 |
| 326 | 2026-03-25 |
Engineering ligands for theophylline riboswitches expands its regulatory dynamic range in prokaryotic and eukaryotic systems
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70870-w
PMID:41872214
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研究论文 | 本文通过结构导向设计合成4-喹唑啉酮衍生物,显著提升茶碱核糖开关在多种生物系统中的结合与功能激活性能,扩展其调控动态范围 | 首次报道合成配体在茶碱核糖开关中实现高达30倍亲和力提升,并在原核与真核系统中将基因表达激活倍数扩展至380倍,远超传统茶碱配体 | 未在动物模型中进行体内验证,且配体合成与优化过程可能增加应用复杂性 | 通过配体工程优化核糖开关性能,实现更精确的基因调控 | 茶碱核糖开关及其合成配体在细菌、分枝杆菌和真核生物系统中的调控功能 | 合成生物学 | NA | 结构导向配体设计、CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA | 核糖开关、CRISPR-Cas9 | 细菌、分枝杆菌、真核细胞 | 配体响应型核糖开关调控的基因表达系统 | 生物医学工程 |
| 327 | 2026-03-25 |
The Prebiotic and Techno-Functional Potential of Microbial Exopolysaccharides for Human Health and Food Systems
2026-Mar, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70406
PMID:41619217
|
综述 | 本文综述了微生物胞外多糖作为益生元候选物和食品技术功能添加剂的双重功能,探讨了其对人类健康和食品系统的潜在应用 | 提出了“EPS-微生物群-宿主轴”概念,并系统区分了微生物群介导的效应与直接生物活性机制,同时探讨了合成生物学在定制化多糖设计中的应用潜力 | 未提供具体的实验数据或案例研究,主要基于现有文献的综合分析 | 阐明微生物胞外多糖在功能性食品成分开发中的双重作用及其应用前景 | 微生物胞外多糖 | NA | 糖尿病, 肥胖症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药 |
| 328 | 2026-03-25 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
|
综述 | 本文对2004年至2024年间发表的450多项研究进行了全面分析,总结了链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用趋势、关键成功因素和技术进展 | 首次提供了该领域二十年发展历程的定量视角,系统分析了表达趋势、宿主偏好及影响因素,并整合了合成生物学工具与基因组工程在克服表达障碍中的作用 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成基因簇表达中的应用潜力与技术进展 | 链霉菌宿主平台及异源表达的微生物生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、组合生物合成 | NA | 文献数据 | 超过450项同行评议研究 | 合成生物学工具 | 链霉菌 | 生物合成基因簇表达平台 | 药物发现 |
| 329 | 2026-03-25 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2026-02-25, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
|
综述 | 本文综述了非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统在天然产物发现与工程化中的最新进展,强调计算工具与合成生物学方法的整合 | 提出将计算建模(如同源建模、分子对接、分子动力学模拟)和深度学习策略与传统技术相结合,加速定制化天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造NRPS和PKS生物合成途径,以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、去重复分析、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 330 | 2026-03-25 |
STRAIGHT-IN: a platform for rapidly generating panels of genetically modified human pluripotent stem cell lines
2026-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01039-2
PMID:39179886
|
研究论文 | 介绍了一种名为STRAIGHT-IN的平台,用于快速生成基因修饰的人类多能干细胞系 | 开发了结合丝氨酸和酪氨酸重组酶的高通量基因整合平台,能够高效整合大于50 kb的大片段DNA,并实现100%的正确靶向富集 | NA | 克服哺乳动物细胞中大片段DNA靶向整合的挑战 | 人类多能干细胞 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、标准细胞培养技术 | NA | NA | NA | Bxb1整合酶,Cre重组酶 | 人类多能干细胞 | 基因整合平台,包含着陆垫序列和辅助DNA序列切除机制 | 医学,药物发现 |
| 331 | 2026-03-25 |
Automated workflow for genotyping individual transposon library variants
2026-Jan-12, BMC methods
DOI:10.1186/s44330-025-00054-3
PMID:41869086
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研究论文 | 本文介绍了一种用于转座子插入库个体变异基因分型的自动化工作流程,利用开源OT-2液体处理器和自定义Python包实现 | 开发了模块化、标准化的自动化工作流程,结合开源液体处理器和自定义软件,提高了基因分型的可靠性和可重复性 | 工作流程的吞吐量受液体处理器平台容量限制,需通过多次运行或多台设备并行处理来扩展 | 为基因组工程和合成生物学中的高通量筛选提供自动化、可扩展的个体变异基因分型解决方案 | 转座子插入库中的个体克隆变异 | 合成生物学 | NA | 转座子插入、PCR分析、测序 | NA | 测序数据 | 46个变异体(其中40个成功鉴定) | OT-2液体处理器 | 恶臭假单胞菌KT2440 | NA | 工业生物技术 |
| 332 | 2026-03-25 |
Three-dimensional robotic structures fabricated and powered entirely with proteins
2026-01, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01186-0
PMID:40604266
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研究论文 | 本文报道了构建完全基于蛋白质的微三维打印机器人结构的过程,这些结构由最小化肌动球蛋白皮层涂层并驱动 | 首次实现了完全由蛋白质材料构建和驱动的三维机器人结构,结合了三维打印技术和肌动球蛋白主动涂层 | 需要生物材料专业知识,完成过程耗时15天,可能限制广泛采用 | 将生物分子活动组装和放大以在人造设备中执行工作,推动合成生物学应用 | 蛋白质基三维打印机器人结构、肌动球蛋白皮层 | 合成生物学 | NA | 三维打印、肌动球蛋白涂层组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 333 | 2026-03-24 |
Advances in the combined treatment of solid tumors with nanodelivery systems based on engineered bacteria-TME modulation
2026-Jun, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2026.115558
PMID:41707370
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综述 | 本文综述了基于工程化细菌-TME调控与纳米递送系统的联合疗法在实体瘤治疗中的最新研究进展 | 聚焦于工程化细菌与纳米载体系统的联合应用,通过协同反馈机制实现精准递送、可控释放和多模式治疗,为克服传统疗法疗效有限、副作用大和耐药性等问题提供了新思路 | NA | 总结并探讨工程化细菌与纳米递送系统联合治疗实体瘤的研究进展与未来前景 | 实体瘤 | 合成生物学与纳米技术交叉领域 | 实体瘤 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具(文中未具体指定) | 工程化细菌(文中未具体指定菌种) | 具有原位定植、可编程修饰和靶向特性的工程化细菌,用于重塑肿瘤微环境、穿透屏障并激活免疫反应 | 医学 |
| 334 | 2026-03-24 |
Magneto-Photonic Gene Circuit for Minimally Invasive Control of Gene Expression in Mammalian Cells
2026-Mar-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c13335
PMID:41867604
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研究论文 | 本文开发了一种结合磁和光刺激的基因电路,用于在哺乳动物细胞中实现微创控制基因表达 | 利用生物发光酶在细胞内直接产生光,并结合磁敏感蛋白设计分裂蛋白版本,实现由光和磁双重刺激激活的基因电路 | 未在深层组织或活体动物中验证其有效性,且磁刺激强度(50 mT)可能限制其在某些应用中的穿透性 | 开发一种无需外部光源的基因表达控制系统,以克服光遗传学系统中光传递效率低的限制 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、分子生物学、光遗传学、磁刺激技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 结合生物发光酶和光敏感转录因子的基因电路,以及由磁刺激驱动的分裂蛋白重构系统 | 医学、基因治疗 |
| 335 | 2026-03-24 |
Engineering class I terpene synthases for skeletal diversity: strategies and applications
2026-01-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00066a
PMID:41369946
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综述 | 本文综述了工程化I类萜烯合酶以生成多样化萜烯骨架的策略与应用 | 整合了结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程及活性位点外修饰等多种策略,并展望了机器学习与代谢工程等未来方向 | 萜烯合酶催化复杂性及序列-功能相关性弱带来了显著的工程挑战 | 工程化I类萜烯合酶以实现萜烯骨架的多样性,这是合成生物学的关键目标 | I类萜烯合酶 | 合成生物学 | NA | 结构引导设计、进化方法、机制聚焦工程、半理性与随机方法(如丙氨酸扫描、饱和诱变、定向进化)、计算建模、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医药、农业、香料工业 |
| 336 | 2026-03-24 |
Challenges and opportunities beyond antibody-drug conjugates: Toward a new era of programmable therapeutic proteins
2026-01-01, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.153018
PMID:41297517
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综述 | 本文综述了抗体-药物偶联物(ADCs)的当前成就与未解决问题,并强调了基于全基因编码蛋白质构建体的创新方向,特别是双功能嵌合蛋白,为下一代蛋白质治疗药物奠定基础 | 强调双功能嵌合蛋白作为ADCs的替代方案,结合支架靶向域和肽衍生细胞毒性模块,具有高选择性、紧凑结构、低免疫原性和细菌表达兼容性,并利用合成生物学、展示系统和机器学习加速优化 | NA | 探索超越ADCs的可编程治疗蛋白质,以解决其成本高、生产系统依赖、分子异质性、系统毒性和治疗窗口窄等局限性 | 抗体-药物偶联物(ADCs)及其替代方案,特别是双功能嵌合蛋白质构建体 | 个性化医疗 | 肿瘤学 | 合成生物学、展示系统、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 337 | 2026-03-23 |
Modular metabolic engineering of Yarrowia lipolytica and semi-rational design of CYP716A520 for enhanced betulinic acid biosynthesis
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134364
PMID:41802472
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研究论文 | 本研究通过模块化代谢工程改造Yarrowia lipolytica,并结合半理性设计优化CYP716A520酶,以增强桦木酸(betulinic acid)的生物合成 | 首次在Yarrowia lipolytica中通过模块化代谢工程将角鲨烯产量提升813倍,并采用结合计算工具与进化信息的半理性设计策略,成功优化植物来源的P450酶CYP716A520,其L359V变体活性和特异性分别提高4倍和3倍 | 未在摘要中明确提及具体局限性,但可能涉及微生物宿主中植物P450酶的适应性挑战或规模化生产的潜在问题 | 开发可持续且成本效益高的桦木酸微生物生产方法,以替代传统的植物提取 | Yarrowia lipolytica酵母和植物来源的P450酶CYP716A520 | 合成生物学 | NA | 模块化代谢工程、半理性设计、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能涉及,但未在摘要中明确指定,因此输出NA) | Yarrowia lipolytica | 代谢途径工程,包括角鲨烯前体供应路径和P450酶催化系统 | 医药 |
| 338 | 2026-03-23 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
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综述 | 本文综述了增强聚乳酸(PLA)生物降解的微生物和生物技术策略的最新进展,包括微生物群落筛选、宏基因组学、酶工程和人工智能引导方法 | 强调了将生态筛选与计算酶工程相结合的多学科策略,特别是利用人工智能进行结构预测和机器学习平台设计高性能PLA降解酶 | NA | 加速聚乳酸在工业堆肥、废水处理和生物修复中的降解,推动可持续的PLA废物管理 | 聚乳酸(PLA)及其在各种生态系统中的生物降解过程 | NA | NA | 宏基因组学、环境DNA(eDNA)工具、定向进化、人工智能(AI)结构预测、机器学习 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 339 | 2026-03-23 |
CRISPR-enhanced microalgae biosynthesis: a promising approach for future functional feed ingredients
2026-Mar-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01367-1
PMID:41857689
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综述 | 本文综述了利用CRISPR系统增强微藻生物合成以生产功能性饲料成分的当前应用、构建策略及未来展望 | 重点探讨了基于CRISPR的基因组编辑技术在优化微藻营养特性方面的突破性进展 | NA | 通过合成生物学策略提升微藻细胞工厂的生产力,以满足日益增长的功能性饲料原料市场需求 | 微藻及其合成的高价值生物活性化合物(如优质蛋白质、多不饱和脂肪酸、色素和维生素) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 微藻细胞工厂中的关键通路节点优化 | 农业, 食品 |
| 340 | 2026-03-23 |
Repositioning the Leader Peptide in Graspetide Biosynthesis
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c21135
PMID:41789461
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研究论文 | 本研究通过重新定位前导肽序列在graspetide生物合成中的位置,探索了合成生物学中组合酶法生成非天然产物的策略 | 通过将前导肽序列从N端重新定位到C端,保留了graspetide合成酶ThfB的底物选择性修饰能力,并实现了两种不同家族酶(套索肽和graspetide)对嵌合RiPP产物的共同修饰 | 前导肽重新定位后,酶修饰速率降低了约2倍,可能影响合成效率 | 旨在通过工程化前导肽序列,扩展核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPPs)的结构多样性,生成自然界中未见的机械互锁肽产物 | 以fuscimiditide前体肽为研究对象,聚焦其前导肽序列的重新定位及其对graspetide合成酶ThfB功能的影响 | 合成生物学 | NA | 酶法重组、前导肽工程、翻译后修饰分析 | NA | 生化实验数据 | NA | 前导肽工程策略 | NA | 通过重新定位前导肽序列,设计嵌合RiPP生物合成途径,实现套索肽和graspetide家族酶的共同修饰 | 工业生物技术 |