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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
321 2026-07-10
pH-Tolerant Tripeptide Coacervates as Biomimetic Catalytic Microreactors
2026-Jul-08, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 构建基于三肽的凝聚液滴作为仿生催化微反应器,具备广泛的pH和盐浓度耐受性 通过将芳香族残基和低聚乙二醇基团整合到最小肽序列中,设计出环境耐受性强的三肽凝聚液滴,实现高效催化和多功能应用 未提及具体局限性 开发环境稳定且功能多样的仿生催化微反应器,用于增强化学反应效率 三肽凝聚液滴及其在催化反应中的应用 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA 凝聚液滴微反应器 合成生物学,前生物化学
322 2026-07-10
Protein Turnover in Plants - Cost of Synthesis, Repair and Crop Engineering Opportunities
2026-Jul-08, Plant physiology IF:6.5Q1
综述 本文探讨植物蛋白质周转的代价,包括合成、修复及作物工程机会 强调化学损伤作为蛋白质周转的重要原因,并系统分析其呼吸成本对作物产量的影响,提出利用修复机制改善作物性能的新策略 未详细讨论不同植物物种中蛋白质修复机制的差异,以及实际田间应用面临的挑战 理解蛋白质损伤的原因、能量后果及修复机制,为提高作物产量提供工程策略 植物中的蛋白质周转过程,包括损伤、修复和合成 植物生物学 NA NA NA NA NA 合成生物学 植物 蛋白质修复机制及代谢途径优化 农业
323 2026-07-10
Engineering commensal microbes for host health
2026-Jul-08, Cell host & microbe IF:20.6Q1
综述 总结工程化活体生物治疗产品(eLBPs)在多种疾病中的应用进展 提出了下一代eLBPs理性设计的框架,综合了底盘选择、DNA递送、治疗表达调控和生物遏制系统的进展 在实现可预测定植、持久治疗活性和体内稳健生物遏制方面仍存在挑战 综述工程共生微生物在宿主健康中的应用,并推动eLBPs从实验系统向临床应用的转化 工程化活体生物治疗产品(eLBPs)及其在炎症性疾病、代谢疾病、癌症和感染性疾病中的应用 合成生物学 炎症性疾病、代谢疾病、癌症、感染性疾病 合成生物学 NA NA NA NA 共生微生物 感知和响应宿主生理信号的微生物疗法 医学
324 2026-07-10
A portable Cas6f-based system for multiplex translational repression in bacteria
2026-Jul-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出了一种基于Cas6f的紧凑型系统MORTISE,用于革兰氏阴性菌中可编程、可调谐的多重翻译抑制 该系统不依赖宿主Hfq或RNase因子,能在不同细菌物种中稳健运行,同时实现单启动子多重敲低和一步法组装多达九个引导序列 NA 开发一种紧凑、正交且可移植的多重翻译抑制系统,以解决合成生物学中精准调控的挑战 革兰氏阴性菌中的翻译抑制 合成生物学 NA Cas6f系统 NA NA NA Cas6f 大肠杆菌, 恶臭假单胞菌 多重翻译抑制系统MORTISE 工业生物技术, 代谢工程
325 2026-07-10
The human microbiome as a source of novel bioactive natural products: structures, bioactivities, and biosynthetic insights
2026-Jul, Journal of natural medicines IF:2.5Q3
综述 综述人类微生物组作为新型生物活性天然产物来源的结构、生物活性及生物合成见解 从共进化视角系统总结人类微生物组中生物活性天然产物的结构多样性、生物合成途径及治疗潜力,并整合宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学等多组学策略以加速发现 未提及具体局限性,可能包括微生物组中大量不可培养微生物的限制及临床转化的挑战 概述人类微生物组中发现的关键代谢物的结构特征、生物合成途径和生物活性,以及发现策略和治疗应用前景 人类微生物组中的微生物及其产生的生物活性天然产物 机器学习和深度学习 免疫相关疾病、感染性疾病、神经系统疾病 宏基因组学、单细胞基因组学、合成生物学、组学整合分析、基因组挖掘 NA 基因组数据、代谢组数据 NA 合成生物学 人类微生物组(肠道、口腔、皮肤、阴道) NA 医学、药物开发
326 2026-07-10
Salt as a Master Regulator of Microbial Assembly and Metabolic Pathways in Fermented Fish: From Preservation to Flavor Innovation
2026-Jul, Comprehensive reviews in food science and food safety IF:12.0Q1
综述 本文综述了盐度作为发酵鱼中微生物组装和代谢途径的主调控因子的作用,探讨了从传统防腐到风味创新的转变 提出从经验加工转向精准代谢调控的范式转变,通过整合多组学与合成生物学重建微生物网络,以解决减盐带来的安全与风味挑战 未提供具体实验数据或案例验证,仅基于现有文献提出概念框架 分析盐度调控发酵鱼中微生物群落组装和代谢轨迹的机制,并探索减盐条件下的安全与风味创新策略 发酵鱼中的微生物群落(如嗜盐菌、乳酸菌、酵母)及其代谢产物 食品生物技术 NA 多组学、合成生物学 NA 文献综述数据 NA NA NA 微生物代谢网络重建 食品工业
327 2026-07-10
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering IF:5.7Q1
综述 综述了甲基单胞菌DH-1菌株遗传和代谢工程生物技术方法的最新进展 系统总结了针对DH-1菌株的分子工具开发,包括优化转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子库和合成小调控RNA平台 未明确提及局限性 促进甲基单胞菌DH-1菌株作为甲烷利用底盘细胞的代谢工程和合成生物学研究 甲基单胞菌DH-1菌株 机器学习 NA NA NA NA NA Cre重组酶 甲基单胞菌DH-1 可调启动子库、合成小调控RNA平台 工业生物技术, 环境
328 2026-07-10
CellTarget: a convex optimisation approach to discover cellular objectives
2026-04-03, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 提出一种名为CellTarget的凸优化算法,用于从实验通量数据中推断细胞目标 CellTarget结合凸通量平衡分析模块和误差最小化模块,通过隐式微分实现目标系数的反向传播和联合优化,解决了哺乳动物细胞代谢模型中目标函数未知的难题 细胞目标存在显著的非可识别性,预测准确性更多地受网络约束而非目标特异性驱动 开发一种从实验通量数据中推断细胞目标的算法,提高哺乳动物细胞代谢模型的预测能力 中国仓鼠卵巢细胞系 数字病理学 NA 通量平衡分析 凸优化模型 通量数据 生产者与非生产者中国仓鼠卵巢细胞系,多个生长期 NA 中国仓鼠卵巢细胞 NA 医学
329 2026-07-10
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-03-17, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 提出一种基于人工神经网络的框架,用于在酿酒酵母中实现上下文感知的合成启动子设计,从而重编程真核转录网络 首次开发了可预测最优转录因子结合位点插入位置及启动子重写程度的神经网络工具,无需前期实验表征即可实现高达98.4%的抑制率 研究仅在本模式生物酿酒酵母中验证,且依赖已知转录因子结合位点数据,通用性及跨物种应用需进一步探索 开发可扩展的计算方法用于人工启动子工程,实现转录网络的精确重编程 酿酒酵母 (Saccharomyces cerevisiae) 的天然启动子及TetR、Mig1转录因子结合位点 合成生物学 NA 人工神经网络、启动子工程、转录因子结合位点重组 ANN (人工神经网络) DNA序列数据 分析6,011个天然酵母启动子,实验验证了部分设计启动子 NA 酿酒酵母 合成启动子-转录因子结合位点重组电路,包含TetR和Mig1响应元件 生物技术
330 2026-07-10
Generative AI for synthetic biology: Designing biological parts, circuits, and genomes
2026-Feb-18, Cell systems IF:9.0Q1
综述 探讨生成式人工智能与合成生物学的融合,聚焦其在生物元件、基因线路和基因组设计中的创新应用 首次系统综述生成式AI在合成生物学中的前沿应用,提出从数据驱动设计到可预测、可编程生物系统的路线图 未深入涉及具体算法的实现细节或实验验证案例 评估生成式AI如何变革合成生物学的设计方法论并展望未来发展 合成生物学中的生物元件、基因线路和基因组 合成生物学 NA 生成式AI NA NA NA NA NA 基因线路、基因组 医药、工业生物技术
331 2026-07-10
Challenges and opportunities in cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 评估无细胞系统技术面临的挑战与机遇 全面评估CFS技术挑战,并突出其在合成生物学中的巨大潜力 未具体说明CFS的详细技术限制,仅概述宏观问题 探讨无细胞系统的技术挑战及未来应用机遇 无细胞系统(CFS) 合成生物学 NA 无细胞系统 NA NA NA NA NA NA 医疗
332 2026-07-10
Cell-free systems for production of therapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 探讨无细胞系统(CFS)在治疗性生物分子生产中的概念、技术、工程和应用 通过合成生物学、代谢工程、冻干制剂和系统优化等进展,显著提升了无细胞平台的性能和适用性,使其适用于高通量筛选、快速原型设计和按需生物制造 可扩展性、成本效益和翻译后修饰问题仍需解决 评估无细胞系统在治疗性生物分子生产中的潜力及其未来发展方向 无细胞系统(CFS),包括大肠杆菌、小麦胚芽和哺乳动物细胞来源的系统 合成生物学 NA 无细胞表达系统 NA NA NA 合成生物学、代谢工程、冻干制剂 大肠杆菌、小麦胚芽、哺乳动物细胞 无细胞生物合成系统 医学
333 2026-07-10
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 综述活体生物治疗产品的研究现状、作用机制、临床进展及未来发展方向 系统分析活体生物治疗产品从单菌株到工程菌群、天然制剂的新兴趋势,并整合精准医学、合成生物学、CRISPR基因组编辑和多组学技术对其设计的影响 临床开发面临菌株筛选、复杂制造、易感人群安全性问题及监管框架不确定等挑战 全面概述活体生物治疗产品的当前应用、作用模式、监管差异及未来在代谢、神经和免疫介导疾病中的拓展潜力 活体生物治疗产品(包括单菌株、工程微生物群落及天然制剂) NA 胃肠道疾病、代谢性疾病、神经系统疾病、免疫介导疾病 CRISPR基因组编辑,多组学技术 NA NA NA CRISPR-Cas9 NA NA 医药
334 2026-07-10
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 综述用于开发重组活体生物治疗剂的技术进展 整合合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法设计重组活体生物治疗剂,以提升疗效、监管接受度和临床转化 规模化生产、安全性和临床应用方面仍面临重大挑战 概述重组活体生物治疗剂的发展现状、挑战与机遇,推动其作为下一代治疗剂的转化 重组活体生物治疗剂,包括基因和代谢工程改造的微生物物种 NA NA 合成生物学、基因工程、多组学、人工智能/机器学习 NA NA NA NA NA NA 医学
335 2026-07-10
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 探讨人类生殖道微生物组作为新型活体生物治疗剂的来源,分析其组成、功能及治疗潜力 首次系统性地将人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂的新型来源进行探索,突破传统益生菌仅维持健康的概念 未提及具体局限性 研究人类生殖道微生物组作为活体生物治疗剂候选源的潜力及其治疗方法 人类生殖道微生物群落,特别是阴道微生物组 微生物组学 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、早产 NA NA NA NA 合成生物学、基因工程 人类阴道微生物组 NA 医学
336 2026-07-10
Recent advances of microbial medicine to prevent and treat cardiovascular disease
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述文章 综述微生物医学在心血管疾病预防和治疗中的最新进展,重点阐述肠道微生物群作为关键调节因子的作用及相关干预策略 系统整合了益生菌、益生元、后生元、粪菌移植及合成生物学工程菌等多种微生物干预策略,并强调其向精准、整体和个体化治疗范式的转变 面临菌株特异性、递送系统和监管框架等挑战,且多数干预仍处于临床前或早期临床阶段 探索微生物医学在心血管疾病管理和治疗中的应用前景 肠道微生物群及其代谢物(短链脂肪酸、TMAO、吲哚衍生物)与心血管健康的关系 微生物组学 心血管疾病 NA NA NA NA 合成生物学 人体肠道微生物 工程菌递送治疗分子 医学
337 2026-07-10
Recombinant live biotherapeutics and synthetic biology: Recent advancement and perspective
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 综述合成生物学在重组活体生物治疗产品开发中的应用进展与前景 系统阐述了活体生物治疗产品(LBPs)的设计原理、宿主-微生物互作机制及合成生物学在精准调控中的应用 未提及具体实验验证数据或临床转化中的技术瓶颈 探讨合成生物学在活体生物治疗产品开发中的关键作用及未来发展方向 活体生物治疗产品(LBPs)及肠道微生物群落 合成生物学 代谢疾病、感染性疾病、炎症性肠病、癌症 NA NA NA NA 合成生物学基因工程工具(未具体指定工具) 工程微生物(未具体指定宿主) 基于合成生物学的遗传回路设计 医学
338 2026-07-10
Live biotherapeutics in cancer therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
综述 综述活体生物治疗药物在癌症治疗中的应用、优势与挑战 系统阐述了整合微生物学、免疫学、合成生物学和肿瘤学的跨学科方法,以及工程化细菌和病毒作为下一代癌症治疗策略的潜力 安全性、制造工艺、监管及个性化方面仍存在挑战 探讨活体生物治疗药物在癌症治疗中的机制、应用现状及未来发展 活体生物治疗产品(包括天然和工程化细菌及病毒) 合成生物学 癌症(结肠癌、胃癌、胰腺癌、肝癌) 合成生物学、组学技术 NA NA NA 合成生物学工具 细菌、病毒 抗肿瘤载荷递送系统(如免疫调节剂、毒素、癌症抗原) 医学
339 2026-07-10
Design of Conditional Guide RNAs for the Logical Regulation of Gene Expression
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍条件向导RNA(cgRNA)的设计方法,用于逻辑调控基因表达 通过设计强发夹结构阻断gRNA活性,直到特定触发RNA存在时才激活,实现逻辑门控信号处理和大动态范围调控 主要在大肠杆菌中进行体内表征,未提及在其他宿主或体内的广泛验证 描述cgRNA的设计并提供体内表征的详细方案 条件向导RNA及触发RNA 合成生物学 NA CRISPR干扰 NA NA NA CRISPR-Cas9 大肠杆菌 条件向导RNA逻辑门控电路 工业生物技术
340 2026-07-10
Reimagining the Synthetic Biology DBTL Cycle with Machine Learning
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 探讨机器学习在合成生物学DBTL循环中的应用,并介绍CLASSIC平台构建电路库和训练模型的方法 提出通过高通量建库和测序生成高质量数据集,结合机器学习/人工智能加速合成电路工程,并定义将ML/AI整合到设计/构建/测试/学习循环中的通用原则 目前缺乏高质量训练数据集是限制ML/AI用于电路设计的主要瓶颈 阐述如何利用机器学习克服合成生物学中电路工程的不可预测性,并推进数据驱动设计 合成生物电路工程中的设计-构建-测试-学习循环 机器学习 NA 下一代测序, ONT, RNA-seq 机器学习模型 文本 NA CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick NA 合成调控电路 工业生物技术, 医学
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