合成生物学相关文章
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当前共找到 1386 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-07-10 |
A Golden Gate-Compatible CRISPR-Associated Transposon Tool for Multiplexed Bacterial Genome Editing
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_2
PMID:42420722
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研究论文 | 提出一种名为pSPIN-GG的改进型CRISPR相关转座子工具，用于简化细菌基因组的多重编辑 | 包含Golden Gate兼容的启动子、引导和负载模块，以及用于快速验证引导替换的绿色荧光蛋白剔除盒，并测试了大肠杆菌BL21染色体上的多个位点以支持基因剂量调控 | NA | 简化基于CAST系统的细菌基因组工程，提高多重编辑的可及性 | 大肠杆菌BL21菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR相关转座酶（CAST）、Golden Gate组装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌（E. coli） | RNA引导的DNA插入工具（pSPIN-GG系统），包含启动子、引导和负载模块 | 工业生物技术 |
| 342 | 2026-07-10 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Design Principles and Applications
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_6
PMID:42420726
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综述 | 本文综述了合成生物分子凝聚体的设计原理及其在细胞控制中的应用 | 提出利用合成内在无序蛋白构建可编程凝聚系统，为合成生物学提供新的细胞调控层级 | 未涉及在哺乳动物等复杂宿主中的应用验证及长期稳定性评估 | 设计可调控的合成生物分子凝聚体以实现细胞过程的空间组织与调控 | 合成内在无序蛋白和基于合成基因回路的大肠杆菌系统 | 合成生物学 | NA | 基因合成、蛋白质表达纯化、生物物理表征 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 合成基因回路（调控转录和翻译） | 合成生物学 |
| 343 | 2026-07-10 |
Cell-Free Genetic Circuits: Extract and Template Preparation
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_9
PMID:42420729
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综述 | 详细描述无细胞基因回路的细胞提取物和DNA模板制备方法 | 系统总结了无细胞系统在合成生物学中的方法学优化，特别是标准化提取物和模板制备策略 | 未提及具体实验数据验证或跨实验室比较的局限性 | 优化无细胞合成基因回路的可靠性和效率 | 无细胞系统、细胞提取物、DNA模板 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 实验方法 | NA | NA | NA | 无细胞合成基因回路 | 合成生物学 |
| 344 | 2026-07-10 |
Characterization of Synthetic Gene Circuits with Absolute Quantification in Continuous Culture
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_8
PMID:42420728
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研究论文 | 提出一种结合数学建模、连续培养和绝对定量方法，用于表征合成基因回路行为的方法 | 通过绝对定量技术结合连续培养和数学模型，解决了合成基因回路表征中缺乏标准化方法和长期行为难以复现的问题 | 未详细讨论该方法在不同细胞背景或复杂回路中的通用性及潜在局限性 | 开发标准化方法以可重复地表征合成基因回路在复杂细胞环境和长时间尺度上的行为 | Chi.Bio生物反应器平台上的简单小RNA回路 | 合成生物学 | NA | 绝对定量、数学建模、连续培养 | 数学模型 | 蛋白质和细胞数量的绝对定量数据 | 未明确提及样本数量 | Chi.Bio生物反应器 | 未明确提及宿主生物 | 小RNA合成基因回路 | 工业生物技术 |
| 345 | 2026-07-10 |
Programming RNA Trans-Splicing for Versatile Gene Regulation and Complex Cellular Logic Computation
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_10
PMID:42420730
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研究论文 | 介绍利用分割内含子介导的反式剪接核糖调节器进行基因调控和复杂细胞逻辑计算的方法与策略 | SENTR具有低泄漏表达、宽动态范围、高可预测性和正交性，并可与分割内含子等调控模态组合，实现单个调控基因处理多达六个输入的复杂细胞逻辑计算 | 文中未明确提及限制，但可能受限于对多种基因和应用的验证范围 | 实现高效基因调控和复杂细胞逻辑计算 | 十种基因，包括荧光蛋白、转录因子和ncRNA | 合成生物学 | NA | 反式剪接核糖调节器、分割内含子、机器学习预测 | NA | NA | 十种基因 | NA | NA | 反式剪接核糖调节器遗传电路 | 医学、生物传感 |
| 346 | 2026-07-10 |
From Negative Feedback to Integrated Control: Recombinase-Based Strategies for Mitigating Resource Competition
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_14
PMID:42420734
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综述 | 本文讨论了基于重组酶的调控策略，包括负反馈控制器和集成了负反馈与前馈的双重控制器，以应对合成生物学中由资源竞争导致的模块间干扰 | 提出利用重组酶介导的启动子翻转实现负反馈和前馈联合调控，平衡资源分配并提高系统可预测性 | 未涉及具体实验验证或实际应用中的局限性，如控制器的复杂性和宿主细胞代谢负担 | 开发基于重组酶的调控策略以减轻合成生物学中的资源竞争问题 | 重组酶控制器及合成基因电路 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的启动子翻转 | NA | NA | NA | 重组酶 | 宿主细胞（未具体指定） | 负反馈控制器（Re-NF控制器）和集成了负反馈与前馈的控制器（Re-NF-FF控制器） | 合成生物学，生物工程 |
| 347 | 2026-07-10 |
Coupled Perturbations of Gene Circuit Dynamics by Resource Competition and Growth Dilution
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_19
PMID:42420739
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研究论文 | 提出一个实验流程，研究大肠杆菌中基因电路动力学如何受资源竞争和生长稀释的耦合影响 | 通过实验解耦并定量分析资源竞争与生长介导稀释对抑制性基因级联电路动力学的联合效应 | 仅限于抑制性级联电路，未涵盖其他电路类型，且实验在E. coli中完成，可能无法直接推广到其他宿主 | 探究合成基因电路中资源竞争和生长稀释两种上下文因素的耦合效应对电路行为的影响 | 抑制性级联电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 荧光强度数据 | 未明确提及 | Golden Gate Assembly, Gibson Assembly | E. coli | 抑制性级联电路（含可调启动子强度、核糖体结合位点强度和质粒拷贝数） | 工业生物技术 |
| 348 | 2026-07-09 |
Gene expression in synthetic biology: Going with the light
2026-Sep, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.06.010
PMID:42276281
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综述 | 本文综述了利用光诱导基因表达在合成生物学中的应用，重点探讨了光遗传学方法与基因回路设计的结合 | 系统总结了光敏启动子、光调节转录因子和光笼诱导剂等光诱导基因表达元件，并首次将光作为二进制输入函数与逻辑门设计相结合，阐明了光遗传学与合成生物学之间的关联 | 主要聚焦于原核生物，对真核系统仅作简要比较，可能限制了在高等生物中的应用推广 | 综述光诱导基因表达在合成生物学中的关键元件和逻辑门设计，促进光遗传学与合成生物学的融合 | 原核生物为主，兼与真核基因表达系统比较 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | 光诱导基因表达回路, 逻辑门 | 生物技术, 医学 |
| 349 | 2026-07-09 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品中农药残留酶降解策略的最新进展，重点讨论工程化手段提升催化性能与应用转化 | 系统整合天然酶、纳米酶、多酶/杂化级联体系，并引入人工智能辅助设计与合成生物学新兴方法 | 实际食品基质中酶稳定性、可重复使用性及规模化应用存在障碍，监管不确定性尚未解决 | 探讨酶催化降解农药的工程化策略及其在食品体系中的实际应用潜力 | 农药残留物及相关酶类（天然酶、纳米酶、级联系统） | 机器学习 | NA | 生物催化、纳米技术、人工智能设计、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 人工智能辅助设计, 合成生物学工具 | NA | 多酶或杂化级联系统 | 食品, 农业 |
| 350 | 2026-07-09 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Terpenoid Biosynthesis: Advances and Perspectives
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c03926
PMID:42362489
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综述 | 系统回顾基因组规模代谢模型在萜类化合物生物合成中的进展 | 综述了GSMM在典型萜类生产微生物（包括模式和非模式微生物）中的应用，并讨论了多约束模型及机器学习与合成生物学整合等未来方向 | 主要关注四种微生物，可能未覆盖所有萜类生产宿主 | 为萜类细胞工厂的智能设计和高效构建提供理论参考 | 四种典型萜类生产微生物：大肠杆菌、酿酒酵母、蓝细菌和另一种非模式微生物 | 机器学习, 系统生物学 | NA | NA | 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 蓝细菌 | 萜类生物合成途径 | 医学, 农业, 能源, 食品 |
| 351 | 2026-07-09 |
Complete remediation of a mixture of 5 acetophenone derivatives by multi-modular engineered Escherichia coli: Avoiding intermediate toxicity from incomplete degradation
2026-Jul-07, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120464
PMID:42413334
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研究论文 | 通过构建多模块工程大肠杆菌，实现5种苯乙酮衍生物混合物的完全降解，避免不完全降解产生的中间体毒性 | 首次利用合成生物学方法将14个结构优化基因整合为4个分解代谢模块，构建了可完全降解5种苯乙酮衍生物及其混合物的工程菌株，并验证了其有效解毒能力和广泛底物范围 | 未详细评估工程菌株在复杂自然环境中的长期稳定性和生态影响，以及降解产物对土壤微生物群落的影响 | 解决微生物不完全降解苯乙酮衍生物产生有毒中间体积累的环境污染问题 | 5种苯乙酮衍生物（苯乙酮、对羟基苯乙酮、对羟基苯丙酮、对羟基苯甲醛和邻羟基苯乙酮）及其混合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、同位素标记追踪、斑马鱼毒性测试 | NA | 降解动力学数据、同位素标记数据、毒性测试数据 | 5种苯乙酮衍生物，每种1 mM浓度，混合降解实验 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | 多模块分解代谢通路（4个模块，整合14个结构优化基因） | 环境修复 |
| 352 | 2026-07-09 |
From tumor targeting to tumor accessibility: surface-engineered bacteria as precision living therapeutics for translational medicine
2026-Jul-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01827-1
PMID:42415153
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综述 | 该文章以临床转化视角审视细菌疗法，提出“精准活体治疗”新范式，并系统综述细菌表面工程策略以提高肿瘤可及性 | 首次提出“肿瘤可及性”概念，强调其在当前治疗应用中的关键瓶颈，并从临床转化角度借鉴抗体药物偶联物成功经验，提出从局部修饰设计转向系统性可及性整体考虑的新范式 | 未详细讨论细菌表面工程策略在人体临床试验中的实际效果及潜在安全性问题 | 探讨细菌疗法从实验室到临床转化的关键障碍，特别是肿瘤可及性不足的问题，并综述表面工程策略以推动精准活体治疗发展 | 细菌表面工程策略及其在肿瘤、炎症性疾病和代谢疾病中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 细菌表面工程（包括共价偶联、细胞膜封装、生物素-链霉亲和素系统等） | 医学 |
| 353 | 2026-07-09 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
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综述 | 综述了黄曲霉在食品安全威胁与生物技术资源方面的双重角色，重点探讨其次级代谢多样性及调控机制 | 将黄曲霉重新定义为双用途生物体，既关注生物安全风险又突显其可开发的化学多样性，并系统概述了CRISPR等新兴生物技术策略在激活隐秘代谢产物方面的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同调控机制的效果，可能缺乏对实际应用挑战的深入分析 | 总结黄曲霉次级代谢组的知识，探索其生物技术潜力以促进制药和农业创新 | 黄曲霉的次级代谢产物，包括黄曲霉毒素、环匹阿尼酸、曲酸、黄曲霉震颤素及隐秘代谢产物 | 机器学习 | NA | 基因组挖掘、CRISPR、异源表达、合成生物学 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学平台 | 黄曲霉 | 生物合成基因簇激活、异源表达途径 | 农业, 制药, 食品, 工业生物技术 |
| 354 | 2026-07-09 |
One Yeast, Sixteen Synthetic Chromosomes, Infinite Possibilities
2026-Jul, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70026
PMID:42152749
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评论文章 | 本文回顾了合成酵母基因组计划（Sc2.0）的进展，该计划已构建所有16条酵母染色体的合成版本，并探讨了未来新染色体的潜力 | 通过设计-构建-测试-学习循环重新定义了对真核生物基因组的理解，并将酵母基因组视为动态可修改系统，而非静态蓝图；同时提出了正交于天然基因组的模块化合成染色体（新染色体）的概念 | 作为一篇短评，未深入讨论技术挑战或潜在局限性 | 庆祝《酵母》期刊40周年，概述酵母遗传学在Sc2.0项目及后续工作中的关键概念和技术进步 | 酿酒酵母及其合成染色体 | 合成生物学 | NA | 合成基因组组装, 设计-构建-测试-学习循环 | NA | 基因组序列 | 所有16条酵母染色体的合成版本 | NA | 酿酒酵母 | 新染色体 | NA |
| 355 | 2026-07-09 |
EL222-Based Optogenetic Gene Regulation in Methylotrophic Yeasts: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jul, Yeast (Chichester, England)
DOI:10.1002/yea.70025
PMID:42126106
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综述 | 综述了基于EL222的光遗传学基因调控在甲基营养酵母中的机制、应用和未来方向 | 聚焦EL222系统在毕赤酵母中的光控异源蛋白生产，及其在酿酒酵母合成生物学和代谢工程中的广泛应用，展示了光遗传学作为无化学诱导剂替代方案的潜力 | 文中未明确指出具体局限性，但可能包括光穿透深度、光敏蛋白稳定性或大规模发酵中的光传递效率等实际问题 | 总结酵母光遗传学领域的关键进展，特别是EL222系统在甲基营养酵母中实现光控基因调控，推动更安全、可控和节能的基因调控策略 | 甲基营养酵母如毕赤酵母，以及酿酒酵母 | 合成生物学 | 不适用 | 光遗传学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 毕赤酵母, 酿酒酵母 | 基于EL222的光控基因调控回路 | 工业生物技术, 合成生物学, 代谢工程 |
| 356 | 2026-07-09 |
Enhancing CRISPR/Cas-Mediated Gene Knockout With Short Non-Homologous Oligonucleotides
2026-Jun, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70548
PMID:41725298
|
research paper | 本研究报道了通过共递送CRISPR-Cas基因编辑试剂与短双链非同源寡脱氧核苷酸（dsNHO）可显著提高莱茵衣藻的基因敲除效率 | 发现非同源寡核苷酸增强（NOE）现象，可将基因敲除效率提高高达100倍，并阐明其通过破坏细胞DSB感知通路将DNA修复从经典的NHEJ转向易错的MMEJ机制 | NOE效应受dsNHO长度、结构和化学修饰的显著影响，且具体机制仍需进一步验证 | 提高莱茵衣藻中CRISPR/Cas介导的基因敲除效率 | 莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑, 非同源寡核苷酸增强（NOE） | NA | NA | 未明确样本数量 | CRISPR-Cas | 莱茵衣藻 | NA | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 357 | 2026-07-09 |
In Vivo Tracking Modalities for Oncolytic Reovirus: Principles, Clinical Applications, and Translational Integration
2026-Jun, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-026-02092-x
PMID:41963749
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综述 | 批判性评估溶瘤呼肠孤病毒（特别是Pelareorep）的体内追踪策略，强调其临床转化和实施 | 整合了光学、核素、磁共振、超声/光声等多种模态成像及纳米技术、分子报告基因等先进工具，并引入合成生物学、AI、液体活检等新兴策略，提供了患者特异性追踪的规模化方案 | 病毒基因组容量限制、免疫介导清除以及信号穿透深度不足等挑战仍然存在 | 评估溶瘤呼肠孤病毒（尤其Pelareorep）的体内追踪技术，促进临床优化设计和个性化治疗 | 溶瘤呼肠孤病毒（Pelareorep）及其在肿瘤治疗中的体内分布和疗效监测 | 数字病理学 | 肿瘤 | 光学成像、核素成像、磁共振成像、超声/光声成像、纳米技术、分子报告基因、CRISPR、AI图像分析、液体活检 | NA | 图像 | NA | CRISPR回路、病毒条形码 | 人类细胞 | 合成生物学报告基因回路 | 医学 |
| 358 | 2026-07-09 |
Cotranslational Assembly of Oligomeric Proteins
2026-06, Annual review of biochemistry
IF:12.1Q1
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综述 | 本文综述了寡聚蛋白的共翻译组装机制，探讨其与合成、折叠和亚基组装的紧密耦合，以及其在人类疾病、进化意义和合成生物学中的潜力 | 颠覆了寡聚蛋白组装是翻译后随机碰撞的传统观点，系统阐述了共翻译组装作为一种根本不同机制在空间时间协调、层次化组装、结构多样性及进化功能中的创新性影响 | 未提供具体实验数据支持，且共翻译组装在不同蛋白系统中的普遍性和具体调控机制仍需进一步验证 | 阐述共翻译组装的分子机制、细胞需求及功能意义，并讨论其在人类疾病、进化以及合成生物学中的应用潜力 | 寡聚蛋白的共翻译组装过程及其涉及的亚基 | 合成生物学 | 人类疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 重组蛋白生产 |
| 359 | 2026-07-09 |
Rare-codon-tuned fluorescent biosensor for high-throughput selection of Escherichia coli strain capable of L-arginine overproduction
2026-05-12, BMC microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12866-026-05154-w
PMID:42121024
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研究论文 | 开发一种稀有密码子调控的荧光生物传感器，用于高通量筛选能够过量生产L-精氨酸的大肠杆菌菌株 | 该传感器利用稀有密码子AGG编码的富含L-精氨酸肽模块与StayGold荧光蛋白融合，建立荧光强度与胞内L-精氨酸水平的严格关联，无需正交翻译系统即可在野生型菌株中应用 | 未具体说明局限性，但可能包括传感器对特定代谢物的特异性及长期稳定性待验证 | 开发高通量表型分析方法以加速菌株优化和生物制造 | 大肠杆菌ARG文库及其突变菌株 | 合成生物学 | NA | 紫外线诱变、荧光激活细胞分选、基因组分析 | NA | 基因组序列和荧光数据 | 大肠杆菌ARG文库（未指定具体数量），以及分离的菌株ARG-B10和B10 | NA | 大肠杆菌 | 稀有密码子依赖的荧光生物传感器，包含AGG稀有密码子富集的L-精氨酸肽模块与StayGold融合基因 | 工业生物技术 |
| 360 | 2026-07-09 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-03-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
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综述 | 综述了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型，以及通过Shokat系统和磷酸化蛋白质组学等工具解析有丝分裂阈值和减数分裂特异性的研究进展 | 结合化学生物学、合成生物学和磷酸化蛋白质组学方法，系统阐述了Cdk1活性调控的定量与定性机制，并拓展到减数分裂的特异性调控 | 主要基于酵母模型（芽殖酵母和裂殖酵母）的研究，对脊椎动物等更复杂体系的整合有限，且未涉及哺乳动物中的细节机制 | 阐明Cdk1活性调控的定量阈值与定性功能在细胞周期进程（有丝分裂和减数分裂）中的作用机制 | 酵母模型（芽殖酵母和裂殖酵母）以及脊椎动物相关研究 | 细胞生物学 | NA | Shokat系统（类似物敏感性等位基因）、质谱分析、合成生物学、磷酸化蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母、脊椎动物细胞 | NA | 基础生物学 |