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当前共找到 1806 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-09-25 |
The iModulon framework: how x-AI reveals microbial regulatory logic
2026-Sep-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00228-26
PMID:42584158
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综述 | 该文章综述了基于独立成分分析（ICA）的iModulon框架，用于从大规模原核转录组数据中分解出独立调控的基因集，并介绍了iModulonDB 3.0数据库及其跨物种比较应用 | 提出了iModulonDB 3.0，包含53个物种、71个ICA分解和33,062个RNA-seq样本，并首次系统性地进行跨物种iModulon结构比较，发现了13个保守的调控模块 | 文章讨论了iModulon重建和计算的设计原则与局限性，但未具体说明 | 综述基于ICA的转录组分解的数据科学原理、计算工作流程及iModulonDB基础设施，并展示跨物种比较的应用 | 原核生物转录组数据，包括53个物种的33,062个RNA-seq样本 | 机器学习 | NA | RNA-seq | ICA | 文本 | 33,062个RNA-seq样本，涵盖53个物种 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 342 | 2026-09-25 |
Microbial partnerships and molecular mechanisms in plant stress physiology for climate-resilient and sustainable farming
2026-Sep-08, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-05140-6
PMID:42709227
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综述 | 本文综述了植物-微生物伙伴关系及其分子机制在提高作物养分获取和胁迫耐受性中的作用，并探讨了多组学、人工智能和合成生物学在设计微生物接种剂和合成微生物群落中的应用 | 将生态学、生理学和分子视角相整合，提出利用人工智能和大数据分析优化基于微生物组的策略，以应对气候变化的可持续农业新前沿 | 未涉及具体的实验验证数据，主要基于现有文献的综述分析 | 探讨植物-微生物相互作用及其分子机制在植物胁迫生理中的作用，为气候适应型和可持续农业提供理论依据 | 植物、植物相关微生物群落、作物 | 机器学习 | NA | 多组学，包括基因组学、转录组学、代谢组学、宏基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业，环境 |
| 343 | 2026-09-25 |
Bacterial degradation of aromatic ester pollutants in agro-ecosystems: implications for bioremediation
2026-Jul-01, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13916-9
PMID:42387175
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综述 | 本文综述了农业生态系统中芳香酯类污染物的细菌降解机制及其在生物修复中的应用 | 整合了细菌降解芳香酯的遗传、代谢和进化机制与合成生物学方法，并提出了生态生理特性与合成生物学相结合以增强原位降解的新视角 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且主要聚焦于细菌降解，可能未全面涵盖真菌或其他微生物的降解途径 | 探讨芳香酯类污染物在农业生态系统中的细菌降解途径及生物修复策略 | 芳香酯类污染物（芳香酸酯和芳香醇酯）及其降解细菌 | 环境微生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 环境, 农业 |
| 344 | 2026-09-25 |
Heterologous production of a plant biostimulant in Streptomyces albidoflavus
2026-Jun-20, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13915-w
PMID:42322407
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研究论文 | 该研究通过直接克隆68-kb的I型聚酮合酶生物合成基因簇，在Streptomyces albidoflavus宿主中建立了植物生物刺激素pteridic acids F和H的异源生产平台 | 首次建立了PTA生物合成的功能性异源生产平台，将合成生物学与基因组规模代谢模型相结合，通过CAPTURE技术直接克隆BGC、CRISPR-Cas9介导的基因组整合、启动子工程及GEM指导的培养基优化，实现了比天然生产菌株超过20倍的产量提升 | 异源表达初始阶段仅检测到elaiophylin而未检测到PTA，启动子工程后PTA产量仍低于定量限，最终补料分批发酵产量仅为1.7-2.8 mg/L，产量仍然较低 | 建立PTA的异源生产平台以提高其产量，解决天然生产菌株产量极低（约0.08和0.02 mg/L）限制进一步开发和应用的问题 | Pteridic acids F和H（PTA-F和PTA-H）聚酮化合物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | CAPTURE直接克隆技术、CRISPR-Cas9基因组编辑、启动子工程、基因组规模代谢模型、补料分批发酵 | 基因组规模代谢模型（GEM） | 基因组序列、代谢模型、发酵产量数据 | 2株异源宿主菌株（J1074-PTA-kasOp*和NBC1270-PTA-kasOp*）的发酵实验 | CRISPR-Cas9, CAPTURE, Cre-lox重组 | Streptomyces albidoflavus, Streptomyces iranensis | 68-kb I型聚酮合酶生物合成基因簇的异源表达，kasOp*强组成型启动子工程 | 农业, 医学 |
| 345 | 2026-09-25 |
CAX1 beyond calcium transport: evidence for a transport-independent regulatory module in plants
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1937940
PMID:42769593
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综述 | 本文综述了植物CAX1的结构、调控和生理功能，并评估了其氨基端具有不依赖转运的调节模块的证据。 | 提出CAX1的氨基端结构可能作为一个控制模块，整合环境和细胞信号以影响胁迫响应，拓展了CAX1的功能范围 beyond 离子交换。 | 基于现有遗传学和合成生物学证据的综述，缺乏直接证明CAX1氨基端不依赖转运功能的分子机制实验。 | 总结CAX1结构、调控和生理功能，评估支持氨基端不依赖转运活性的证据。 | 植物CAX1蛋白及其氨基端调控区域。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 346 | 2026-09-25 |
Engineering probiotic consortia to improve chemotherapy tolerance and reduce toxicity in breast cancer patients: a new frontier in supportive precision oncology
2026, Oncology reviews
IF:3.1Q2
DOI:10.3389/or.2026.1909404
PMID:42774746
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综述 | 本文综述了工程化益生菌联合体在改善乳腺癌患者化疗耐受性和减轻毒性方面的机制、临床前与临床证据及转化前景 | 提出工程化益生菌联合体作为支持性精准肿瘤学的新策略，通过合成生物学和微生物组工程精确设计多菌株群落以恢复微生物平衡、增强化疗耐受性 | 主要基于临床前和初步临床研究，缺乏大规模随机对照试验验证，工程菌联合体的长期安全性和生态稳定性仍需进一步评估 | 探讨工程化益生菌联合体在改善乳腺癌化疗耐受性和减轻毒性中的作用及转化应用 | 乳腺癌患者、肠道微生物组、工程化益生菌联合体 | 微生物组工程、合成生物学、肿瘤学 | 乳腺癌 | 微生物组工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 多菌株益生菌联合体 | 医学、工业生物技术 |
| 347 | 2026-09-25 |
Optimization Strategies and Synergistic Applications of Engineered Salmonella Typhimurium in Cancer Therapy: From Synthetic Biology to Nanobiotechnology
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S632739
PMID:42775009
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综述 | 系统综述了工程化鼠伤寒沙门氏菌在肿瘤治疗中的应用进展，包括其内在抗肿瘤机制、靶向修饰策略、基于纳米生物技术的表面工程策略以及联合治疗方案 | 总结了四种基于纳米生物技术的表面工程策略（化学偶联、生物矿化、物理吸附、仿生或聚合物涂层），并提出了细菌-纳米材料混合系统与基因编辑工程的协同互补，以及多机制联合治疗模式突破单药治疗瓶颈 | 存在种间模型差异、给药途径限制和工业化生产障碍等临床转化瓶颈 | 系统综述工程化鼠伤寒沙门氏菌在肿瘤治疗中的应用进展，分析其抗肿瘤机制、修饰策略和联合治疗方案，并探讨临床转化面临的核心问题 | 鼠伤寒沙门氏菌及其工程化改造菌株、细菌-纳米材料混合系统 | 肿瘤学、合成生物学、纳米生物技术 | 癌症、实体瘤 | 合成生物学、纳米生物技术、基因编辑工程、化学偶联、生物矿化、物理吸附、仿生或聚合物涂层 | NA | 文本 | NA | 基因编辑工程 | 鼠伤寒沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 348 | 2026-09-24 |
Predicting transcriptional regulators in plants in the era of artificial intelligence
2026-Oct, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102955
PMID:42648065
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综述 | 本文综述了在人工智能时代，如何利用多组学整合和AI技术预测植物中的转录调控因子及其靶标 | 系统总结了从单基因研究到网络水平调查的转变，并探讨了多组学与AI（包括机器学习和深度学习及基础模型）如何重塑植物转录调控预测 | 未具体说明现有方法在植物调控网络预测中的准确性、可解释性和泛化能力等方面的局限 | 总结网络赋能的基因发现进展，讨论多组学和AI如何改变转录靶标预测，并展望其在作物改良和合成生物学中的应用 | 植物转录调控因子及其靶标、调控网络 | 机器学习 | NA | 多组学整合、机器学习、深度学习、基础模型 | 机器学习、深度学习、基础模型 | 多组学数据、测序数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业、合成生物学 |
| 349 | 2026-09-24 |
[Research progress in synthesis of cordycepin by microorganisms]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260120
PMID:42773651
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综述 | 系统综述了虫草素生产从传统发酵到合成生物学制造的发展历程，重点分析了微生物细胞工厂构建和虫草素合成的突破性进展 | 从合成生物学视角系统梳理虫草素生物制造的发展轨迹，提出利用酶工程和合成生物学构建高效、环保、智能化虫草素生物制造技术的展望 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，主要基于现有文献分析，缺乏对具体技术路线的实验验证 | 综述虫草素生物合成的研究进展，为构建高产虫草素菌株提供理论支持和技术参考，促进虫草素产业化 | 虫草素及其微生物生产体系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、酶工程、发酵工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药、工业生物技术 |
| 350 | 2026-09-24 |
[Recent progress in algal-bacterial symbiotic and mutualistic systems]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260133
PMID:42773652
|
综述 | 该综述系统总结了藻菌共生和互惠系统的基本互作类型、调控机制、使能技术及其在环境修复和生物制造中的应用 | 聚焦于工程化互惠菌群的理性重构使能技术，整合了单细胞动态监测、人工智能驱动设计平台以及自上而下与自下而上相结合的合成群落工程策略 | 目前在机制理解、物种特异性、长期系统稳定性和生态风险评估方面仍存在研究挑战 | 为推进合成生物学驱动的资源利用和绿色生物制造提供理论指导和技术支撑 | 藻菌共生和互惠系统 | 合成生物学 | NA | 单细胞动态监测、多组学分析、计算建模 | 人工智能驱动设计平台 | NA | NA | NA | 藻类，细菌 | 合成菌群工程（互惠菌群的理性重构） | 环境，能源，工业生物技术 |
| 351 | 2026-09-24 |
[Research progress and prospects of cyanobacterial cell factories for ethylene production]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260210
PMID:42773649
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综述 | 系统总结了利用光合蓝细菌细胞工厂实现太阳能驱动CO2直接转化为乙烯的研究进展，涵盖EFE催化机制、关键遗传元件筛选优化、代谢工程策略及培养工艺优化 | 全面整合了蓝细菌乙烯合成领域的最新进展，从EFE核心催化机制到代谢工程策略（基因拷贝数扩增、前体供给增强、碳通量重定向、副产物抑制缓解）及培养工艺优化，并系统提出未来发展方向 | 蓝细菌乙烯产量和效率低、遗传稳定性不足、大规模培养存在瓶颈 | 为建立稳健高效的蓝细菌乙烯生产细胞工厂提供理论基础，推动其实际应用 | 光合蓝细菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 蓝细菌 | 乙烯合成代谢途径 | 工业生物技术、能源 |
| 352 | 2026-09-24 |
[Microenvironmental regulation strategies and applications of yeast surface display systems]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260250
PMID:42773648
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综述 | 系统阐述酵母表面展示（YSD）微环境的组成、调控策略及其在工业生产、生物医学和环境修复中的应用 | 从细胞壁、胞内环境和胞外区室三层微环境协同调控的角度系统总结YSD性能优化策略 | 当前微环境调控在精准性、兼容性和稳定性方面仍面临挑战 | 总结YSD微环境的核心组成与靶向调控策略，推动其性能优化和工业转化 | 酵母表面展示系统及其三层微环境（细胞壁、胞内环境、胞外区室） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 酵母 | 多酶共展示的空间排列 | 工业生物技术, 医学, 环境 |
| 353 | 2026-09-24 |
[Construction of an anti-phage network system based on synergistic mechanisms and its applications in synthetic biology]
2026-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260142
PMID:42773658
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研究论文 | 该研究通过整合受体工程与协同防御机制，构建了一个高效、广谱、低毒的噬菌体防御网络系统，并应用于工业发酵菌株以抵抗噬菌体污染。 | 首次发现Shedu与Septu之间的协同抗噬菌体机制，并结合受体工程构建了抗噬菌体网络系统，显著提高了对多种噬菌体的广谱抗性。 | 未明确提及该系统在更广泛工业环境中的长期稳定性及对未知噬菌体的防御效果。 | 解决单一抗噬菌体策略易被噬菌体自发突变逃逸、保护效果有限且适用性差的问题，提高工业发酵过程的稳定性。 | 工业发酵菌株（如核黄素和L-亮氨酸生产菌株）及多种噬菌体（T4、λ、P251、P255、T1、T7）。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业发酵菌株（如核黄素和L-亮氨酸生产菌株） | 抗噬菌体网络系统（整合Shedu和Septu协同防御机制及受体工程） | 工业生物技术 |
| 354 | 2026-09-24 |
Inhibitors of nutrient pathways: nature's overlooked antibiotic arsenal
2026-Sep-23, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00036c
PMID:42387997
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综述 | 本文综述了靶向细菌营养代谢途径的天然产物抗生素，将其分为生物合成抑制剂、抗代谢物、前抗代谢物和核糖开关抑制剂四类。 | 系统整合了73类被忽视的靶向营养代谢的天然产物抗生素，提出了四类机制分类，并指出了营养丰富筛选培养基导致此类活性被掩盖的方法学偏见。 | 作为综述文章，未提供原始实验数据；所述化合物的体内疗效和临床转化潜力仍需进一步验证。 | 呼吁将营养途径抑制剂重新纳入抗生素发现管线，以拓展抗菌靶点空间并应对耐药性挑战。 | 靶向细菌营养生物合成和利用途径的天然产物抗生素 | 药物发现 | 细菌感染 | NA | NA | 文本 | 73类化合物 | NA | NA | NA | 医学 |
| 355 | 2026-09-24 |
Protein turnover in plants-cost of synthesis, repair, and crop engineering opportunities
2026-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag481
PMID:42418770
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综述 | 该综述探讨了植物中蛋白质周转的碳成本，包括合成、修复和降解，并讨论了通过合成生物学改善作物性能的机会 | 强调化学损伤导致的蛋白质周转在植物生物学中研究不足，并系统量化了其能量成本，提出了合成生物学策略来利用修复机制而非再合成 | 作为综述，未提供原始实验数据，且对具体修复机制的分子细节和工程化应用的可行性分析有限 | 理解蛋白质损伤的原因、能量后果和修复机制，以指导作物改良策略 | 植物中的蛋白质，特别是受化学损伤和逆境胁迫影响的蛋白质 | 植物生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 356 | 2026-09-24 |
Devising a divisome for synthetic cells
2026-09, Nature reviews. Chemistry
DOI:10.1038/s41570-026-00848-1
PMID:42443379
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综述 | 本文综述了在体外部分重构细胞分裂蛋白机器以构建合成细胞分裂体（divisome）的当前策略，涵盖对称性破缺、膜变形和最终离断等关键阶段 | 系统性地评述了模拟细胞分裂关键阶段（对称性破缺定义分裂位点、膜变形驱动缢缩和最终离断）的现有策略，并讨论了整合多个模块以实现合成细胞最小功能性分裂系统的可能性 | 目前仅实现了细胞分裂蛋白机器的部分体外重构，各策略均存在各自的局限性，尚未能实现完整的合成细胞分裂功能 | 综述在自下而上合成生物学中构建合成细胞分裂体（divisome）的当前策略，评估其成功与不足，并探讨整合多模块实现最小功能性分裂系统的途径 | 合成细胞（人工构建的功能性细胞）及其分裂系统 | 合成生物学 | NA | 体外蛋白质机器重构 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 357 | 2026-09-24 |
Identification and catalytic optimization of pinene oxidases in paeoniflorin biosynthetic pathway
2026-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag669
PMID:42740699
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研究论文 | 该文章确认芍药苷的生物合成起源于α-蒎烯，并鉴定出三种新型细胞色素P450酶催化蒎烯氧化，通过定点突变优化CYP71AN126的催化特异性 | 首次确认芍药苷生物合成起源于α-蒎烯，鉴定出三种新型CYP450酶（CYP71AN126和CYP76A225/226）催化蒎烯氧化，并发现L493是调控CYP71AN126催化位点特异性和底物特异性的关键残基 | 芍药苷完整生物合成途径尚未完全解析，仅确定了C4氧化为关键限速步骤，下游途径仍有待阐明 | 解析芍药苷生物合成途径中蒎烯氧化步骤，鉴定关键酶并优化其催化性能 | 芍药属植物中芍药苷生物合成途径的蒎烯氧化酶（CYP71AN126和CYP76A225/226） | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默（VIGS）、蛋白结构预测、定点突变 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | 定点突变 | NA | NA | 医药 |
| 358 | 2026-09-24 |
AlloPool is a deep learning framework that infers protein allostery from molecular dynamics simulations
2026-Sep, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3004002
PMID:42766632
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研究论文 | 该文章提出了AlloPool，一个基于图神经网络的深度学习框架，通过迭代剪枝残基-残基相互作用，从分子动力学模拟中推断蛋白质变构通信网络和构象动态 | 首次将时间注意力机制与图聚合相结合，从平衡和非平衡分子动力学模拟中学习演化交互图，能够推断控制蛋白质构象动态的最小时间分辨交互网络，并在动态轨迹重建方面优于现有机器学习方法 | 依赖于分子动力学模拟数据，而高分辨率实验数据稀缺可能限制模型的训练和验证；未明确讨论计算成本及在大规模蛋白质系统上的可扩展性 | 开发一个通用框架，从分子动力学模拟中解释蛋白质动态并推断变构通信通路 | 多种动态蛋白质系统，包括结合结构域、机械传感器、信号受体和酶 | 机器学习 | NA | 分子动力学模拟 | GNN, 时间注意力机制 | 分子动力学模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 359 | 2026-09-24 |
Cross incompatibility restricting genome exchange and diversification of primary gene pool in plants: challenges and opportunities
2026-Aug-25, TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik
DOI:10.1007/s00122-026-05347-x
PMID:42642494
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综述 | 该综述探讨了植物种间杂交中存在的合子前和合子后障碍，这些障碍限制了基因组交换和初级基因库的多样化 | 综合阐述了克服杂交不亲和性的生物技术方法，并提出了利用合成生物学将生殖障碍重编程为可控性状的新视角 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，且对合成生物学方法的具体应用仍停留在理论展望阶段 | 探讨植物种间杂交不亲和性的遗传因素和克服策略，以充分利用作物野生近缘种的遗传多样性 | 植物种间杂交中的合子前和合子后生殖障碍 | 植物遗传学与育种 | NA | 体细胞杂交, 胚拯救技术 | NA | 文本 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 360 | 2026-09-24 |
A programmable fungal platform for engineered living textiles
2026-Jul-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed6937
PMID:42497282
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研究论文 | 该论文报道了一种基于真菌菌丝体的工程活材料平台，通过低能耗工艺制备保持代谢活性的宏观凝聚膜，实现环境响应、原位图案化和紫外线防护等功能 | 将菌丝体的代谢活性保留在宏观凝聚膜中，实现结构组装与细胞活力的统一；模块化设计将结构制备与遗传功能化解耦；与产色素菌和黑化菌共培养实现原位图案化和内置紫外线屏蔽；41天内近完全形态降解 | 未明确说明可扩展性、长期稳定性以及遗传改造的效率和范围 | 开发一种可编程的真菌基活材料平台，解决工程活材料中宏观结构组装与持续细胞活力及可编程功能的无缝集成挑战 | 真菌菌丝体（mycelia）、产色素微生物、黑化微生物 | 合成生物学、工程活材料 | NA | 共培养、低能耗薄膜制备工艺 | NA | NA | NA | NA | 真菌（菌丝体） | 模块化共培养系统（结构菌丝体与功能微生物共培养） | 材料、医学（紫外线防护） |