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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-07-09 |
Synthetic gene circuits that selectively target RAS-driven cancers
2026-Feb-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104320
PMID:41733988
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研究论文 | 介绍一种合成基因回路,能够选择性靶向RAS驱动型癌症 | 通过组合多个RAS传感器构建基因回路,实现了前所未有的高选择性输出蛋白表达 | 暂无明确限制说明 | 开发一种高选择性的合成基因回路,用于靶向RAS突变驱动的癌症治疗 | RAS突变型癌细胞 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成基因回路 | NA | RAS靶向基因回路,包含多个RAS传感器和一个输出蛋白表达模块 | 医学 |
| 362 | 2026-07-08 |
Exploring Neurological Disorder Therapeutics: The Progress and Future Prospects of Proteins and Peptides Derived from Blue Foods
2026-Jul-06, Current protein & peptide science
IF:1.9Q4
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综述 | 探讨蓝色食物来源的蛋白质和肽在神经疾病治疗中的进展与未来前景 | 综述了蓝色食物生物活性分子在神经保护中的多机制作用,并展望了纳米制剂、合成生物学和人工智能在肽发现中的新方法 | 临床转化面临提取标准化、生物利用度、批次差异、过敏原性和复杂监管要求等挑战 | 总结蓝色食物来源蛋白质和肽在神经疾病治疗中的研究进展,并评估其临床应用潜力 | 海洋鱼类、藻类和无脊椎动物等蓝色食物中的生物活性蛋白质和肽 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 363 | 2026-07-08 |
Machine learning-guided discovery of poly(ethylene terephthalate)-binding modules to enhance durable whole-cell degradation
2026-Jul-01, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135279
PMID:42385911
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研究论文 | 利用机器学习引导发现聚对苯二甲酸乙二醇酯结合模块,以增强耐用全细胞降解 | 提出机器学习辅助管道,结合隐马尔可夫模型同源性搜索和监督式PET水解酶机器学习模型(PETML),从天然蛋白质架构中发现了新型PET结合模块,并展示了其在全细胞催化降解PET中的优越性能 | 未明确说明局限性,但研究主要基于计算预测和体外实验,可能缺乏体内实际环境验证 | 开发可增强PET酶降解效率的结合模块,实现耐用全细胞催化系统 | PET结合模块候选物,特别是tCBM13-1,以及大肠杆菌表面展示系统 | 机器学习,合成生物学 | NA | 机器学习,分子对接,分子动力学模拟,表面展示 | 隐马尔可夫模型,PETML | 蛋白质序列数据,分子对接数据,实验测量数据 | 197个非冗余候选模块,重点研究tCBM13-1 | CRISPR-Cas9(可能用于展示系统建设) | Escherichia coli | 双锚定系统(OmpA和EhaA)用于表面共展示FAST-PETase和tCBM13-1 | 环境,工业生物技术 |
| 364 | 2026-07-08 |
Machine learning-optimized long single-stranded DNA synthesis technology empowers high-precision diagnostic-therapeutic integration in living cells
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag131
PMID:41674382
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研究文章 | 开发了一种结合机器学习优化的长单链DNA合成技术,实现了活细胞中高精度诊疗一体化 | 通过Phi29 DNA聚合酶和Nb.BbvCI切口酶在甲酸盐缓冲液中的协同作用,实现了长达15000 nt的高保真单链DNA合成,并结合机器学习优化镁离子动力学和热调节参数,以及硫醇-金固定模板的固相纯化方法,显著提升了产率和纯化回收率 | 主要局限在于酶促反应随机性和产物异质性,但通过缓冲液工程和计算优化已克服这些挑战 | 发展并验证一种高纯度、高产率的长单链DNA合成技术,用于精准纳米医学的诊疗应用 | 宫颈癌细胞及其基因组编辑 | 合成生物学, 机器学习 | 宫颈癌 | 酶促复制(NEAR), 固相合成, 机器学习优化 | 机器学习模型 | 序列数据, 实验参数 | NA | CRISPR, 切口酶Nb.BbvCI, Phi29 DNA聚合酶 | 宫颈癌细胞 | 六螺旋束DNA折纸-CRISPR复合物用于靶向核仁素的基因组编辑和诊断治疗偶联 | 医学, 合成生物学, 分子数据存储 |
| 365 | 2026-07-07 |
Stable, micron-scale lipocondensates achieving prolonged circulation without PEGlyated lipids
2026-Jul-06, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d6bm00335d
PMID:42405635
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研究论文 | 该论文报道了稳定的微米级脂质凝聚体,无需聚乙二醇化脂质即可实现长效循环 | 首次发现仅由天然脂质组成的凝聚体可形成细胞尺寸的稳定结构,其循环半衰期远超现有脂质涂层凝聚体系统,且与纳米级聚乙二醇化系统相当 | 未提及长期稳定性及体内递送效率的具体验证 | 探索脂质凝聚体的分子组成对脂质组织和界面行为的影响,开发新型递送平台 | 脂质凝聚体(LipCons)的结构与功能特性 | 合成生物学 | NA | SAXS, FRAP | NA | 图像 | NA | NA | NA | 脂质凝聚体(LipCon)结构 | 医学, 合成生物学 |
| 366 | 2026-07-07 |
Applications of Recombinant DNA Technology in Medicine: A Comprehensive Review
2026-Jul-05, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-026-01595-w
PMID:42402538
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综述 | 综述重组DNA技术在医学领域的应用,涵盖治疗、诊断和预防 | 系统总结rDNA技术在生物制药、重组疫苗、基因治疗、分子诊断及个性化医学中的最新进展,并探讨伦理与未来技术方向 | NA | 总结重组DNA技术在医学中的应用及未来潜力 | 重组DNA技术及其在医学中的应用 | 机器学习 | NA | 重组DNA技术,基因克隆,载体设计,CRISPR,PCR,qPCR | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 367 | 2026-07-07 |
Recombinant Protein Drugs: A 2025 Update
2026-Jul, BioDrugs : clinical immunotherapeutics, biopharmaceuticals and gene therapy
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s40259-026-00783-z
PMID:42129013
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综述 | 综述2025年重组蛋白药物的进展,涵盖生产平台、蛋白质工程和监管科学 | 综合了合成生物学、宿主工程和工艺优化的创新,以及模块化蛋白质工程带来的下一代格式如双特异性抗体和纳米抗体 | 未提及具体局限性 | 提供重组蛋白药物领域的最新更新,概述技术如何塑造下一代生物制剂 | 重组蛋白药物及其生产平台、工程技术和监管框架 | NA | 肿瘤、炎症、代谢性疾病等 | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物菌株、哺乳动物细胞、植物平台 | 模块化蛋白质工程,如双特异性抗体、纳米抗体、融合蛋白、自组装生物材料 | 医学 |
| 368 | 2026-07-07 |
Vanadium-dependent haloperoxidases: Recent advances and perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108797
PMID:41506498
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综述 | 本文综述了钒依赖卤过氧化物酶(VHPOs)在发现、结构功能关系、机制阐明及各种合成应用方面的最新进展 | 重点介绍了对VHPOs卤离子和底物特异性的最新突破,包括底物通道识别和酶结合卤化机制,这些发现挑战了传统的扩散性HOX模型并实现了理性酶工程 | NA | 总结VHPOs在有机合成中的快速进展,并展望其在合成生物学、材料科学和环境生物技术中的应用前景 | 钒依赖卤过氧化物酶(VHPOs) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | NA | 合成生物学, 材料科学, 环境生物技术 |
| 369 | 2026-07-07 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 综述了合理工程化组合细菌疗法在癌症治疗中的应用 | 聚焦于通过合成生物学工具实现细菌的时空控制和群体行为编程,提升肿瘤特异性和免疫调节能力 | 当前临床转化的障碍尚待克服,如安全性、递送效率和免疫逃逸问题 | 探讨合理工程化如何指导下一代微生物疗法 | 工程化细菌作为癌症治疗载体 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 遗传电路(包括衰减、载荷释放、免疫调节) | 医学 |
| 370 | 2026-07-07 |
A cybernetic framework for synthetic biological intelligence in the era of neural tissue engineering
2026, Npj unconventional computing
DOI:10.1038/s44335-026-00077-1
PMID:42404109
|
综述 | 提出在神经组织工程时代构建合成生物智能的控制论框架 | 首次将控制论原理系统应用于合成生物智能的设计,结合神经组织工程实现基于活体生物计算的认知系统 | NA | 探索利用合成生物学和组织工程技术从零开始设计神经结构,解决人工智能的局限性 | 合成生物智能系统、活体生物计算模块 | 合成生物学、神经工程、控制论 | NA | 神经组织工程、合成生物学组装技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 神经回路、生物计算模块 | 医学、人工智能 |
| 371 | 2026-07-07 |
Engineering Biology's Vital Role for Climate Mitigation
2026 Jan-Dec, Engineering biology
DOI:10.1049/enb2.70009
PMID:42404380
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评论 | 本文探讨工程生物学通过在燃料、化学品、材料和食品系统中去化石化的方式在气候缓解中的潜在作用 | 强调工程生物学在去化石化能源、化学品、材料和食品系统方面可能提供变革性技术选项和商业机会 | 指出约束包括原料可用性、可持续性问题、资本密集度、认证要求和政策不确定性,且工程生物学的贡献不仅取决于技术发展和投资,还依赖于经济可行的供应链和稳定的长期政策框架 | 评估工程生物学在气候缓解中的潜在贡献,并识别其商业挑战和机遇 | 化石燃料、化学品、材料和食品系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 372 | 2026-07-07 |
Metabolic engineering of Pichia pastoris for sustainable production of 1,8-cineole from methanol
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1866106
PMID:42404784
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研究论文 | 通过代谢工程改造毕赤酵母,实现从甲醇可持续生产1,8-桉叶素 | 首次在毕赤酵母中实现从甲醇高效合成单萜烯1,8-桉叶素,通过重构甲醇同化途径和调节磷酸戊糖途径非氧化分支显著提高产量 | 未提及产业化规模产量及长期稳定性评估 | 建立基于甲醇同化的高效合成1,8-桉叶素的代谢工程平台,为萜烯绿色生物制造提供新策略 | 毕赤酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 浓度数据 | 5升生物反应器中的工程菌株 | NA | 毕赤酵母 | 代谢途径重建:引入外源1,8-桉叶素合酶、增强MVA途径、抑制竞争途径、重建甲醇同化途径、调节磷酸戊糖途径非氧化分支、强化甲酸向丝氨酸转化 | 工业生物技术 |
| 373 | 2026-07-06 |
Advancing synthetic biology with engineered chemically inducible gene regulatory systems
2026-Jul-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108963
PMID:42392239
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综述 | 系统梳理了化学诱导基因调控系统的最新进展,重点介绍以启动子为中心的工程设计及其在合成生物学中的核心作用 | 提出五种核心设计原则(正交性、可逆响应、剂量依赖、模块兼容性和序列依赖的结构调控),并重点介绍AI驱动的启动子预测、G-四链体等新型DNA开关以及工程化受体通路等新兴策略 | 存在诱导剂渗透性、交叉反应和可扩展性等挑战 | 综述工程化化学诱导基因调控系统的最新进展,推动合成生物学发展 | 化学诱导基因调控系统中的工程化启动子及相关调控元件 | 合成生物学 | NA | AI驱动启动子预测、高通量筛选、启动子重塑、转录因子工程、G-四链体系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢途径优化、精准基因治疗、生物传感器、可编程合成电路 | 生物制造、治疗学、智能细胞系统 |
| 374 | 2026-07-06 |
Riboregulation in bacteria: From simple switches to complex regulatory networks
2026-06-07, Postepy biochemii
DOI:10.18388/tkbrr231
PMID:42400427
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综述 | 本文综述了细菌中核糖调控从简单开关到复杂调控网络的作用机制和应用 | 系统总结了核糖调控的多层网络特性,包括sRNA结合蛋白和RNA海绵的调控作用,并强调了Hfq-CLASH等现代方法在体内识别这些相互作用的应用 | 未提供具体实验数据或定量分析来支持所述机制 | 阐述细菌核糖调控在适应性中的关键作用及其在合成生物学和抗抗生素耐药性中的应用 | 细菌的核糖调控元件,包括核糖开关、温度传感器、反义RNA和sRNA网络 | 合成生物学 | NA | Hfq-CLASH | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 核糖调控网络,包括开关、传感器和调控回路 | 合成生物学, 医学 |
| 375 | 2026-07-06 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Apr-08, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
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综述 | 综述了mRNA化学和拓扑工程的最新进展,涵盖酶促、化学和混合方法扩展修饰库、线性/环状/分支mRNA拓扑合成策略、结构-活性关系及下一代mRNA治疗应用 | 首次系统性整合mRNA的化学可编程性与拓扑工程(如环状RNA、分支结构、合成套索结构)两个维度,突破传统序列设计范式 | 部分拓扑结构(如合成套索)的体内稳定性与免疫原性数据尚不充分,大规模临床应用仍需验证 | 系统阐述化学与拓扑工程如何调控mRNA稳定性、免疫原性和翻译效率,推动下一代mRNA疗法发展 | 信使RNA(mRNA)分子及其化学修饰与拓扑结构 | 数字生物学, 合成生物学 | 传染病, 肿瘤, 遗传病 | 化学合成, 酶促修饰, 拓扑工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 环状RNA, 分支mRNA, 合成套索结构 | 医学 |
| 376 | 2026-07-06 |
Ultrasound-Responsive Engineered Bacteria for Targeted Cancer Therapy: Strategies, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202523952
PMID:41764403
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综述 | 本文综述了超声响应工程菌在靶向癌症治疗中的策略、机制及应用 | 首次系统整合超声与工程菌联合应用的交互机制,提出超声调控生物活性分子和智能药物递送系统的新方向 | 该综述主要总结当前研究进展,未包含具体实验数据或临床验证案例 | 全面理解工程菌修饰方法、作用机制及其与超声联合应用的交互机制,为开发超声响应智能治疗系统提供理论基础 | 工程菌与超声联合应用于肿瘤治疗的研究进展 | 合成生物学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 377 | 2026-07-06 |
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70061-7
PMID:41764153
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研究论文 | 通过大肠杆菌表达的人工随机序列蛋白质实现数据存储与检索 | 将数字数据编码为氨基酸序列并整合到类胶原蛋白模板中,利用大肠杆菌表达实现数据存储;通过胰蛋白酶消化结合LC-MS/MS分析实现完整数据恢复,并展示蛋白质比DNA更高的稳定性以及利用亲和标签实现随机访问和加密数据保护 | 文中未明确提及局限性 | 建立基于蛋白质的数据存储框架,实现高效、稳定的数据存储与检索 | 人工随机序列蛋白质、类胶原蛋白模板、大肠杆菌表达系统 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | 氨基酸序列、数字数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 数据存储、合成生物学、蛋白质工程 |
| 378 | 2026-07-05 |
The critical patch size problem on networks
2026-Sep, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109749
PMID:42320745
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研究论文 | 研究网络环境中人口持续存活的临界斑块大小问题 | 首次在图论框架内系统研究临界斑块大小,推导出随机网络中保证种群持久生存的谱图参数界限 | 分析依赖于线性化算子特征值条件,可能未完全捕捉非线性动态行为的复杂性 | 探讨强异质介质(网络)中种群动态的临界斑块大小及其影响因素 | 离散晶格、多连接晶格及随机网络上的种群动态 | 网络科学 | NA | NA | 图拉普拉斯算子 | 网络结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生态网络、合成生物学、脑连接组神经退行性疾病传播建模 |
| 379 | 2026-07-04 |
Deploying Artificial Metalloenzymes in Complex Environments: Strategies and Applications
2026-Jul-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70446
PMID:42390013
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综述 | 本文综述了人工金属酶在复杂环境(细胞裂解液、全细胞催化剂和活体动物)中部署的策略与应用,重点讨论了其设计原则、瓶颈和机遇 | 系统总结了人工金属酶在三种复杂生物环境(细胞裂解液、全细胞催化剂和活体动物)中的稳定化策略和适应方法,突出了其作为鲁棒工具的设计突破 | 人工金属酶在复杂环境中的组装困难、金属辅因子不稳定及细胞组分干扰仍是主要挑战 | 推动人工金属酶在合成生物学、化学生物学和生物医学等领域的实际应用 | 人工金属酶 (ArMs) | 合成生物学, 化学生物学 | NA | 金属蛋白工程, 辅因子修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 化学生物学, 生物医学 |
| 380 | 2026-07-04 |
A caspase-3-activated protein expression system for apoptosis visualization and apoptosis-pyroptosis conversion to boost antitumor activity
2026-Jul-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.06.009
PMID:42392927
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研究论文 | 开发了一种由caspase-3激活的蛋白表达系统,用于凋亡可视化和凋亡-焦亡转换以增强抗肿瘤活性 | 首次利用caspase-3作为开关设计可编程合成生物学平台,实现凋亡的高分辨率活细胞成像和体内肿瘤生物发光成像,并通过工程化表达焦亡效应子实现凋亡偶联的焦亡,增强抗癌效果 | 摘要未提及明显局限性 | 开发一种由caspase-3激活的蛋白表达系统,用于凋亡检测及凋亡-焦亡转换以增强抗肿瘤疗效 | caspase-3激活的蛋白表达系统及其在癌症治疗中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 荧光蛋白、荧光素酶成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | caspase-3激活的蛋白表达系统 | 医学 |