本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-05-31 |
Bacillus methanolicus as an emerging platform for energy-efficient biomanufacturing from one-carbon and marine resources
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103500
PMID:42056785
|
综述 | 本文综述了嗜热甲醇芽孢杆菌作为一种新兴的生物制造平台,能够高效利用甲醇和甘露醇进行可持续化学生产 | 强调了该菌株在热生长、海水适应性和能量高效甲醇同化途径方面的固有优势,并总结了合成生物学工具的最新进展以实现理性菌株工程 | 讨论了从甲醇和甘露醇进行生物制造面临的挑战,但未深入量化实际瓶颈 | 探讨嗜热甲醇芽孢杆菌作为连接一碳和海洋衍生底物与可持续化学合成的多功能平台的潜力 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 甲醇和甘露醇代谢路径 | 工业生物技术 |
| 382 | 2026-05-31 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
|
综述 | 本文概述了人工智能驱动工程生物学与新兴技术的融合,推动全球网络化自主生物工厂的发展 | 提出AI驱动的全自主生物工厂概念,整合计算设计、自动化制造和数据驱动学习,实现自我改进的设计-构建-测试-学习循环 | NA | 综述塑造AI驱动合成生物学的技术,强调其与自动化、数字化和小型化的融合趋势 | AI驱动的合成生物学技术,包括全细胞建模、数字孪生及自动化生物工厂 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 383 | 2026-05-31 |
Systems-level regulation principles for microbial lignin valorization
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103479
PMID:41875688
|
综述 | 系统总结微生物木质素增值的调控原理,涵盖代谢调控、转录因子调控和动态生物传感器调控 | 首次从系统层面整合代谢调控、转录因子工程和动态传感器调控,提出提升木质素生物转化效率的集成框架 | 未涉及具体实验验证,且对工业规模化应用的挑战分析有限 | 阐述微生物木质素增值的系统级调控原理 | 微生物细胞工厂及木质素衍生的芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、环境 |
| 384 | 2026-05-31 |
The TfoX revolution: a review of genetic engineering in Vibrio natriegens
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103506
PMID:42119170
|
综述 | 本文综述了Vibrio natriegens的基因工程工具发展,特别是TfoX介导的自然转化能力如何推动其成为合成生物学底盘 | 系统梳理了TfoX介导的遗传能力机制如何突破V. natriegens的基因改造瓶颈,将其转变为可编程底盘 | 仍面临基因组编辑效率和规模化应用的挑战 | 概述V. natriegens基因工程方法的演进及应用潜力 | V. natriegens菌株及其TfoX调控机制 | 合成生物学 | NA | TfoX介导的自然转化 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 385 | 2026-05-31 |
A guide to Direct Pathway Cloning (DiPaC) for natural product discovery
2026-May-29, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250016
PMID:42210810
|
综述 | 介绍直接通路克隆(DiPaC)作为一种合成生物学方法,用于天然产物发现中的生物合成基因簇克隆和重构 | DiPaC结合长片段PCR和体外DNA组装,无需中间文库构建、大量体内重组或多个抗生素选择标记,即可同时克隆和重构生物合成通路 | 未明确提及,但可推断对复杂序列的扩增和组装仍存在技术障碍 | 提供DiPaC方法在天然产物发现中的指导和应用综述 | 天然产物生物合成基因簇(BGCs) | 合成生物学 | NA | 长片段PCR、体外DNA组装 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas9 | 多种微生物和环境中 | 生物合成通路重构、启动子交换、调控元件移除、模块化通路重建 | 医药、生物技术 |
| 386 | 2026-05-31 |
Synthetic DNA circuits for programming cell functions
2026-May-29, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102701
PMID:42214130
|
综述 | 综述合成DNA电路在编程细胞功能中的最新进展,重点介绍其在细胞环境中实现逻辑门控控制的策略 | 强调了从体外演示向原位功能实现的范式转变,以及DNA电路与内源性通路整合的策略 | 未明确讨论当前技术瓶颈或局限性 | 阐述基于核酸的逻辑网络在合成生物学中用于构建智能细胞系统的潜力 | 合成DNA电路及其在细胞功能编程中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 逻辑门、放大器、神经形态架构、链置换网络 | 医学, 工业生物技术 |
| 387 | 2026-05-31 |
Self-driving medicine: closed-loop therapeutics for autonomous disease control
2026-May-28, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.003
PMID:42209322
|
综述 | 综述了由合成生物学驱动的闭环基因电路在自主疾病控制中的应用,迈向自动驾驶医疗 | 将治疗剂量定义为对生理状态的连续计算响应而非固定方案,通过反馈控制实现自稳态维持 | NA | 探讨闭环基因电路在自主疾病控制中的原理与实现路径 | 模块化传感器、处理器和效应器组成的反馈控制疗法 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 闭环基因电路(包含传感器、处理器和效应器) | 医学 |
| 388 | 2026-05-31 |
A T7 RNAP regulatory toolbox for cell-free network engineering and biosensing applications
2026-May-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73811-9
PMID:42209525
|
研究论文 | 在无细胞系统中工程化T7 RNAP调控工具箱,实现可编程合成抑制子、激活子和生物传感器,用于基因网络构建和生物分子检测 | 首次系统构建T7 RNAP的模块化调控工具箱,结合蛋白质设计流程和全合成结合子开发生物传感器,并实现多种生物分子(小分子药物、抗体、蛋白质)的一管式多重检测 | NA | 开发一种灵活可扩展的无细胞系统,用于构建响应多种生物分子的基因电路并实现即时诊断应用 | T7 RNA聚合酶及其调控元件(合成抑制子、激活子、生物传感器) | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、蛋白质设计、酶扩增 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 基因调控网络(抑制子、激活子、生物传感器) | 医学、诊断 |
| 389 | 2026-05-31 |
Next-generation strategies for PLA degradation: microbial consortia, metagenomics, enzyme engineering and AI-guided approaches
2026-Mar-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04726-8
PMID:41863619
|
综述 | 总结微生物与生物技术策略增强聚乳酸(PLA)生物降解的最新进展 | 该综述系统整合了从自然微生物群落筛选、宏基因组学探索到合成生物学、酶工程与人工智能驱动的酶设计的多学科策略,提出基于AI的结构预测和机器学习平台用于开发高性能PLA降解酶 | 未提及具体实验验证或定量比较不同策略的效率,重点在于概念性综述而非深入技术评估 | 概述加速PLA生物降解的多学科方法,为工业堆肥、废水处理和生物修复提供路线图 | PLA降解微生物群落、酶及降解机制 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | NA | 宏基因组数据, 环境DNA数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, 定向进化 | 细菌, 真菌 | 代谢途径设计,反馈调节回路 | 工业生物技术, 环境修复 |
| 390 | 2026-05-30 |
Current Progress and Future Outlook for Synthetic Gene Circuits in Cardiovascular Therapy
2026-May-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16050754
PMID:42194102
|
综述 | 该综述总结了合成基因回路在心血管治疗中的当前进展,并展望了未来发展方向 | 首次系统性地从直接心脏应用、间接靶向心血管疾病和未来潜在应用三个维度梳理合成基因回路,并提出改进的设计-构建-测试-学习框架以促进临床转化 | NA | 探讨合成基因回路在心血管治疗中的现状与未来前景 | 合成基因回路及其在心血管治疗中的应用 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 甲基化测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞, 植物 | 诱导开关, 分类器系统, 代谢通路 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 391 | 2026-05-30 |
Bioengineered Silver Nanoparticles: Next-Generation Biogenic Synthesis Strategies for Precision Biomedical Applications
2026-May-20, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering13050587
PMID:42194344
|
综述 | 本文综述了利用生物工程策略合成银纳米颗粒的新一代方法及其在精准生物医学中的应用 | 不同于传统综述聚焦绿色合成方法,本文重点突出了新兴的生物工程范式,如代谢工程、合成生物学、微流控辅助合成和人工智能引导工艺优化,实现了可编程、可规模化及精密可控的生物源银纳米颗粒制备 | 纳米-生物相互作用、毒理学安全性、监管合规性和转化可扩展性方面仍存在关键挑战,且银纳米颗粒与杂原子掺杂碳纳米点组成的生物源复合材料需要深入研究 | 探讨下一代生物合成银纳米颗粒的范式与策略,阐明其形成的分子机制,突出新兴功能化与生物医学应用范式,并讨论当前转化障碍 | 银纳米颗粒及其生物工程合成策略 | 机器学习 | 癌症 | 生物合成 | NA | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 | 植物,微生物,真菌,藻类 | NA | 医学 |
| 392 | 2026-05-30 |
Classical Phytohormones and Peptide Plant Hormones in Abiotic Stress Tolerance: Crosstalk, Physiological Integration, and Crop Improvement
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101538
PMID:42197671
|
综述 | 本文综述了经典植物激素与肽类植物激素在非生物胁迫耐受中的相互作用、生理整合及作物改良应用 | 首次综合阐述了植物褪黑素作为整合枢纽在经典激素与肽激素网络中的双重作用(直接抗氧化和双向调控经典激素信号) | 存在网络复杂性、激素响应的上下文依赖性、实验室到田间应用的转化差距,以及多胁迫条件下肽激素作用机制理解不完整等问题 | 探讨植物激素信号网络在非生物胁迫适应中的作用,并提出利用这些网络改良作物的策略 | 植物激素信号通路及其在非生物胁迫响应中的整合网络 | 植物生物学 | NA | 转录组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,代谢组学,系统生物学,CRISPR基因编辑 | NA | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 激素信号调控网络(包括褪黑素抗氧化级联、CEP通路等) | 农业 |
| 393 | 2026-05-30 |
The NRT1.1-NLP7 Nexus: An Integrative Signaling Nexus from Nitrate Sensing to Systemic Adaptation and Structure-Guided Engineering
2026-May-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101539
PMID:42197673
|
综述 | 该文章综述了植物中硝酸盐感知与系统性适应中的NRT1.1-NLP7整合信号中枢,并提出了结构引导的工程改造框架 | 揭示了NRT1.1和NLP7形成整合信号中枢的新机制,并提出了三层次理性设计框架,将作物改良从经验选择转向结构引导设计 | 该研究为综述性质,未提供实验验证数据,缺乏对跨物种保守性差异的定量分析 | 探讨硝酸盐感知与核内转录反应之间的耦合机制,并提出利用结构生物学和合成生物学设计提高氮利用效率的作物工程策略 | 植物中的NRT1.1和NLP7蛋白及其相互作用网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 氮响应回路改造 | 农业 |
| 394 | 2026-05-30 |
Biotic Stress Resistance in Sweet Potato: Mechanisms, Perspectives, and Sustainable Production Strategies
2026-May-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15101504
PMID:42197638
|
综述 | 本文综述了甘薯生物胁迫抗性的机制、挑战及可持续生产策略,重点分析了真菌、病毒、线虫、害虫和细菌等胁迫的防御机制及分子调控网络 | 首次从多维度系统剖析甘薯防御机制,并提出了结合人工智能、基因编辑、新型组学和合成生物学等新兴技术的十年品种改良路线图 | 未提供具体的实验验证数据,且对多种胁迫交叉作用的分子机制仍缺乏深入解析 | 总结过去两年甘薯生物胁迫抗性研究的最新进展,提出可持续生产策略和品种改良路线 | 甘薯(Ipomoea batatas)及其生物胁迫因子(真菌、病毒、线虫、害虫、细菌) | 数字病理学 | 植物病害 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 甘薯(Ipomoea batatas) | NA | 农业 |
| 395 | 2026-05-30 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-May-14, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
|
综述 | 综述了食品体系中农药降解的工程生物催化策略,从催化性能到实际应用 | 重点介绍了通过工程策略提升酶降解性能和稳定性的进展,包括天然酶、纳米酶及多酶或杂合级联系统,并讨论了基于人工智能辅助设计和合成生物学的新兴方法 | 实验室系统向实际食品基质转化面临关键障碍,包括有限催化效率、稳定性不足、可重复使用性差、规模化限制以及监管不确定性 | 提供关于酶法降解农药的应用导向综述,重点探讨工程策略以提升性能和鲁棒性 | 天然酶、纳米酶、多酶或杂合级联系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工智能辅助设计 | NA | 多酶或杂合级联系统 | 食品, 农业 |
| 396 | 2026-05-30 |
Advances in Functional Genomics and Biotechnology for Enhancing Therapeutic Potential of Medicinal Plants
2026-May-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104245
PMID:42196225
|
综述 | 综述了功能基因组学和植物生物技术在提升药用植物治疗潜力方面的最新进展 | 提出了一个整合框架,将功能基因组发现与途径工程、合成生物学、人工智能辅助预测及可扩展生产系统相关联 | 对基因组发现如何与途径工程、规模化生产系统和医疗应用相联系的综合理解仍不充分,限制了分子见解向可持续生产转化的有效性 | 提供药用植物研究中前沿方法的全面概述,重点关注通过功能基因组学和生物技术优化关键生物活性化合物的生产 | 药用植物中的关键生物活性化合物,包括青蒿素、大麻素、人参皂苷和紫杉醇 | 机器学习 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学, 代谢工程 | 植物 | 代谢途径, 合成途径设计 | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 397 | 2026-05-30 |
Rethinking Microbial Chemical Ecology: Secondary Metabolites as Concentration-Dependent Signaling Hubs with Implications for Anti-Virulence Intervention
2026-May-09, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14051074
PMID:42197459
|
综述 | 提出将微生物次级代谢产物视为浓度依赖性信号中枢的综合信号网络框架,并探讨其对抗毒力干预的启示 | 突破传统线性信号模型,将次级代谢产物重新定义为连接微生物集体行为与环境适应的关键节点,并引入空间组学和合成生物学工具 | 未给出具体实验验证,主要基于理论框架和已有研究的整合分析 | 重新认识微生物化学生态学,建立动态信号网络视角以指导抗毒力干预和应用 | 微生物次级代谢产物及其在群体感应中的双重功能 | 微生物组学 | 抗生素耐药性 | 空间组学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物 | 信号网络解耦 | 工业生物技术, 环境生物修复, 医学 |
| 398 | 2026-05-30 |
Engineering and Biological Mechanisms of Microalgal CO2 Fixation: A Review from Molecular Regulation to System Optimization
2026-Apr-29, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14050999
PMID:42197385
|
综述 | 综述了微藻CO₂固定的工程与生物机制,涵盖从分子调控到系统优化的多尺度整合 | 全面整合了多尺度视角,从气液传质、CO₂同化途径、关键酶系统到代谢调控和工程策略,并提出了合成生物学、人工智能与系统工程融合的未来路线图 | 未提供定量比较或实验验证,仅基于文献总结,可能缺乏具体数据支持 | 为开发高效、智能和可持续的微藻CO₂固定系统提供理论框架和前瞻视角 | 微藻的CO₂固定机制,包括碳浓缩机制、Rubisco和碳酸酐酶系统等 | 机器学习 | NA | 代谢通量分析、系统建模 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微藻 | CO₂固定途径、碳浓缩机制 | 环境、能源、工业生物技术 |
| 399 | 2026-05-29 |
Micropeptides in Cancer and Immunity: Diagnostic, Therapeutic, and Synthetic Biology Frontiers
2026-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150217
PMID:42140456
|
综述 | 综述微肽在癌症和免疫中的功能,以及作为诊断、治疗和合成生物学前沿工具的潜力 | 揭示微肽作为隐藏的蛋白质组新层,重新定义编码和非编码基因组区域的界限,并整合单细胞蛋白质基因组学、核糖体图谱、质谱和深度学习进行发现 | 未明确讨论微肽检测的标准化挑战、体内递送效率及临床转化的障碍 | 探索微肽在癌症和免疫中的双重作用,并评估其在诊断、治疗和合成生物学中的应用前景 | 微肽(包括癌基因微肽如SMIM30、circPDHK1-241aa、PDL1P41,以及肿瘤抑制微肽如HOXB-AS3、CIP2A-BP、SPAR、ASRPS) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞蛋白质基因组学, 核糖体图谱, 质谱, 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | CRISPR激活的肽回路, 靶向肽嵌合物 | 医学, 免疫治疗 |
| 400 | 2026-05-29 |
Regulatory mechanisms of secondary metabolite biosynthesis in medicinal plants under drought: advances and perspectives
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158246
PMID:42068881
|
综述 | 总结干旱条件下药用植物中萜类、苯丙素类和生物碱等次生代谢物生物合成的转录调控最新进展 | 提供了揭示转录调控网络的新见解,并为药用植物生物学、天然产物化学和作物逆境生理学领域的研究者提供实际启示 | 未提及具体实验验证或定量分析 | 总结干旱条件下药用植物次生代谢物生物合成的转录调控机制,以筛选候选标记基因和挖掘双功能基因 | 药用植物中的萜类、苯丙素类和生物碱 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 药用植物 | NA | 农业, 食品, 医学, 化妆品 |