合成生物学相关文章
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当前共找到 821 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-03-14 |
"Microbial metabolites in cardioprotection: an immune-engineered framework for heart failure and post-ischemic remodeling: a narrative review"
2026-Feb, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004529
PMID:41675890
|
综述 | 本文是一篇叙述性综述，探讨了肠道微生物代谢物通过免疫工程化框架在心力衰竭和缺血后心脏重塑中的心脏保护潜力 | 提出了一个整合微生物代谢物、分子通路和合成生物学工具的“免疫工程化框架”，用于靶向调控肠道-心脏轴，并强调了后生元制剂和新型递送系统等创新干预策略 | 存在显著的转化障碍，包括药代动力学差异、微生物群异质性以及临床验证和监管标准化不足 | 客观评估肠道微生物代谢物的心脏保护潜力，探讨其分子通路、治疗选择及转化障碍 | 肠道微生物代谢物（如短链脂肪酸、尿石素、吲哚、氧化三甲胺、硫化氢）及其对心脏保护、炎症、纤维化和免疫代谢的影响 | NA | 心血管疾病 | 系统文献检索（PubMed, Scopus, Web of Science），叙述性综合分析 | NA | 文本（文献数据） | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 402 | 2026-03-13 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
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研究论文 | 本文提出了一种基于AND门布尔逻辑的多键滚环扩增策略，用于降低核酸检测生物传感器中的假阳性率 | 引入AND门布尔逻辑创建Multi-Key RCA，通过检测多个核酸序列作为扩增前提，显著减少假阳性，并实现高特异性单核苷酸多态性检测 | NA | 提高生物传感器的特异性，减少假阳性，特别针对即时诊断应用 | 滚环扩增技术及其在核酸检测生物传感器中的应用 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增，等温扩增，侧向层析检测 | NA | 核酸序列 | NA | NA | NA | AND门逻辑电路，多输入生物传感器 | 医学 |
| 403 | 2026-03-13 |
Molecular Dialogue Across Kingdoms: The Role of Trans-Kingdom Peptides in Plant-Associated Interactions
2026-Apr, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70378
PMID:41527218
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综述 | 本文提出并定义了跨界肽（TKPs）的概念，总结了其在植物与微生物相互作用中的功能，并探讨了其在农业和生物医学等领域的应用潜力 | 首次提出并系统定义跨界肽（TKPs）作为跨物种生物活性肽的新概念，整合了植物、微生物、病毒和昆虫来源的肽在多种生态互作中的作用 | NA | 探讨跨界肽在植物相关相互作用中的生物学功能和跨物种通讯机制 | 植物、微生物、病毒和昆虫来源的跨界肽及其在共生、寄生和免疫调控中的作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 生物医学, 合成生物学, 环境可持续性 |
| 404 | 2026-03-13 |
From sequence to structure: A comprehensive review of deep learning models for RNA structure prediction
2026-Apr, Current opinion in structural biology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.sbi.2025.103216
PMID:41650708
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综述 | 本文全面回顾了从传统物理方法到当前深度学习模型在RNA二级和三级结构预测中的演变 | 系统梳理了三种深度学习范式：基于语言模型的方法、端到端结构预测器以及几何距离预测方法，并提出了针对数据稀缺和模型可解释性的未来研究方向 | RNA结构预测仍面临训练数据有限、复杂非规范相互作用和构象灵活性等独特挑战 | RNA结构预测，以理解基因调控、药物设计和合成生物学 | RNA的二级和三级结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习 | 语言模型、端到端结构预测器、几何距离预测模型 | RNA序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2026-03-13 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 本文综述了ATP生产人工细胞的仿生构建策略及其应用，重点关注模型膜、质子泵和ATP酶的协同整合 | 系统整合了三种构建策略的最新进展，包括绕过膜蛋白组装挑战的直接封装完整细胞器或构建非经典系统，为从基础研究转向实际应用提供指导 | NA | 探索ATP生产人工细胞的构建策略及其在合成生物学、靶向药物递送、再生疗法和生物混合能量转换设备等工程应用中的潜力 | 人工细胞，特别是基于脂质体、聚合物体、融合液滴、油包水胶束和金属有机框架等自下而上模型构建的ATP生产系统 | 合成生物学 | NA | 自下而上构建策略，包括封装完整线粒体、类囊体或构建非经典系统如精氨酸降解途径 | NA | NA | NA | NA | NA | 模拟氧化/光合磷酸化以维持ATP合成的仿生能量转换系统，包括质子泵和ATP酶的级联能量转换 | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 406 | 2026-03-13 |
Hybrid seed production: new paradigms and challenges in the twenty-first century
2026-Mar-11, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04959-3
PMID:41811507
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综述 | 本文综述了二十一世纪杂交种子生产的新范式与挑战，重点探讨了先进基因组学、人工智能育种与政策整合对可持续生产气候适应性杂交种子的影响 | 系统整合了CRISPR/Cas、基因组选择等现代基因组工具与人工智能/机器学习、表观遗传学等新兴技术，提出通过多领域协作解决杂交技术可扩展性与可及性瓶颈的创新框架 | 未提供具体作物的量化对比数据，对小型农户采纳障碍的解决方案探讨较为宏观，缺乏区域性政策差异的深度分析 | 探讨整合先进技术与政策以可持续生产气候适应性杂交种子的路径 | 杂交种子生产技术体系及其相关作物案例 | 农业生物技术 | NA | CRISPR/Cas, 标记辅助选择, 基因组选择, 人工智能/机器学习, 表观遗传学 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | NA | 农业 |
| 407 | 2026-03-13 |
Microbial computing: Review and Perspectives
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
|
综述 | 本文回顾了微生物计算领域的发展历程，概述了现有策略及其局限性，并提出了基于储层计算的新视角 | 引入了基于储层计算的自上而下新框架，利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 现有的自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探讨微生物计算的发展策略与未来方向 | 微生物计算机（生物计算机） | 合成生物学 | NA | NA | 储层计算、模拟计算、神经形态架构 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌（E. coli）、酿酒酵母（S. cerevisiae）、枯草芽孢杆菌（B. subtilis）、哺乳动物细胞、植物 | 数字逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器、代谢通路 | 生物生产、生物修复、生物医学 |
| 408 | 2026-03-13 |
Microbial electrochemical synergy: A mechanistic framework for enhanced bioelectrochemical remediation of halogenated organic pollutant in soil-water matrices
2026-Mar-01, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2026.141415
PMID:41690271
|
综述 | 本文提出了一个名为“微生物电化学协同作用”的概念框架，用于系统解析生物电化学系统在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的性能，并探讨了通过整合机器学习、多组学和合成生物学工具来设计和调控下一代BES技术的潜力 | 提出了一个整合性的“微生物电化学协同作用”机制框架，该框架从电子流效率、功能微生物生态位分配和界面微环境特征三个维度系统解析BES性能，并首次倡导协同利用机器学习、多组学和合成生物学工具进行理性设计 | 本文是一篇综述，未提供具体的实验数据或案例验证所提框架的有效性 | 旨在通过提出一个整合性机制框架，提升基于生物电化学系统的卤代有机污染物修复策略的可扩展性和可持续性 | 生物电化学系统及其在土壤-水基质中修复卤代有机污染物的应用 | 环境生物技术 | NA | 机器学习， 多组学， 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 409 | 2026-03-13 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb-19, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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综述 | 本文系统综述了虫媒病毒病的进化机制、宿主-媒介相互作用及新兴控制策略，以应对其在全球变化背景下的公共卫生挑战 | 整合了基因组分析、元流行病学综合和预测建模，并重点评估了CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预和RNAi抗病毒药物等新型控制策略的潜力 | 纳入的研究数量有限（仅12篇），且涉及基因编辑和微生物干预的伦理、生态和监管问题仍需审慎考量 | 理解虫媒病毒的进化机制、传播动力学并评估新兴控制策略，以有效缓解疾病负担 | 登革热病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒和西尼罗河病毒等虫媒病毒及其传播媒介（如蚊、蜱） | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 410 | 2026-03-13 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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研究论文 | 本文提供了进行ENGRAM实验和分析数据的逐步协议，并讨论了该系统的设计考虑、优势、局限性和应用 | 利用prime editing介导的插入实现多路复用信号记录，并与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 需要基本的分子生物学、哺乳动物细胞培养和DNA测序分析技能，实验周期为5-6周 | 开发用于测量生物学时间动态的分子记录系统 | 顺式调控元件（CREs）的活性记录 | 合成生物学 | NA | DNA测序，prime editing | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9（prime editing） | 哺乳动物细胞 | 增强子介导的基因组记录电路（ENGRAM），可将瞬时CRE活性转换为稳定的基因组记录 | 医学，工业生物技术 |
| 411 | 2026-03-13 |
Ultra-high-throughput mapping of genetic design space
2026-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09933-9
PMID:41535463
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CLASSIC的遗传筛选平台，结合长读和短读测序技术，用于高通量评估任意长度基因构建体的表达谱，以加速合成生物学设计 | CLASSIC平台首次结合长读和短读NGS技术，实现了对超过10^6个基因电路设计（长度5-20 kb）在单次实验中的定量评估，揭示了基因部件可组合性规则 | NA | 加速合成生物学，通过高通量筛选基因电路设计并学习“组合到功能”映射，以揭示基因部件可组合性规则 | 基因电路设计，包含多种基因部件组合的构建体 | 合成生物学 | NA | 长读和短读下一代测序（NGS） | 机器学习模型 | 测序数据 | 超过10^6个基因电路设计，长度从5到20 kb | NA | 人类细胞 | 基因电路，包括多种遗传部件组合 | 工业生物技术 |
| 412 | 2026-03-13 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-01-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 本研究探讨了沙雷氏菌（Serratia plymuthica）菌株As3-5a(5)在浮游细胞和生物膜系统中对铜的生物吸附作用，重点关注紧密结合的胞外聚合物（EPS）的关键角色 | 揭示了紧密结合的胞外聚合物（尤其是蛋白质组分）在铜生物吸附中的关键作用，并展示了该菌株在极端酸性工业废水（pH 1.9）中仍能实现高效铜去除（97%）的强效潜力 | 研究未涉及合成生物学方法改进铜螯合能力，且系统在真实工业废水条件下的可扩展性及技术成熟度需进一步验证 | 开发高效的重金属生物去除系统，探索可持续的铜修复生物技术方法 | 沙雷氏菌（Serratia plymuthica）菌株As3-5a(5)及其胞外聚合物（EPS） | NA | NA | 生物吸附实验、电镀废水处理 | NA | 实验数据 | 使用烧结玻璃生物膜系统及浮游细胞系统进行测试 | NA | 沙雷氏菌（Serratia plymuthica） | NA | 环境修复、工业废水处理、循环经济中的金属回收 |
| 413 | 2026-03-13 |
Next-Generation Immune Checkpoints and Tumor Microenvironment Modulation in Cancer Immunotherapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7864229
PMID:41811823
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综述 | 本文全面回顾了下一代免疫检查点及肿瘤微环境调控在癌症免疫治疗中的最新进展 | 系统梳理了共抑制性和共刺激性两类下一代免疫检查点的分子机制与临床证据，并探讨了整合代谢通路、先天免疫感知、细胞因子信号及微生物组等多元化TME重塑策略 | NA | 探索扩展癌症免疫治疗临床获益的新靶点与组合策略 | 免疫检查点通路、肿瘤微环境组分及免疫调节机制 | NA | 癌症 | 多组学分析、系统生物学、人工智能 | NA | 临床数据、分子机制数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 414 | 2026-03-11 |
PrimeRoot: a cutting-edge technology designed to achieve precise and targeted large DNA insertion in plants
2026-Apr, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04723-0
PMID:41804348
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综述 | 本文综述了PrimeRoot技术，一种用于在植物中实现精确、靶向大DNA插入的尖端技术 | PrimeRoot编辑器通过整合增强的PegRNA设计、改进的植物prime editor系统和先进重组酶，实现了高达11.1 kb DNA片段的精确插入，第三代编辑器进一步提高了不同基因递送系统下的转化精度和效率 | NA | 开发并推广PrimeRoot技术，以支持合成生物学和植物育种中大型DNA插入的染色体整合需求 | 植物基因组 | 合成生物学 | NA | PrimeRoot技术，包括CRISPR、prime editing guide RNA (PegRNA)设计和重组酶 | NA | NA | NA | CRISPR, PrimeRoot editors | 植物 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 415 | 2026-03-11 |
CRISPR/dCas9-Mediated BRL3 Activation Enhances Growth and Metabolic Resilience Under Osmotic Stress in Nicotiana tabacum
2026 Mar-Apr, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70816
PMID:41804827
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/dCas9转录激活系统上调烟草中的BR受体NtBRL3，并评估其对渗透胁迫耐受性的影响 | 首次在烟草中利用CRISPR/dCas9系统激活BRL3受体，并发现其能通过协调生物量恢复、氧化应激缓解、渗透调节物稳态和组织重塑来增强渗透胁迫耐受性 | 研究采用瞬时转化系统，未进行稳定遗传转化；功能验证主要在烟草中进行，在其他作物中的普适性有待验证 | 探究BR受体BRL3在渗透胁迫下的功能，并开发增强作物胁迫耐受性的合成生物学方法 | 烟草（Nicotiana tabacum）及其BR受体NtBRL3 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas9转录激活系统（CRISPRa）、Loop Assembly、RT-qPCR、组织学分割 | NA | 基因表达数据、生物量数据、生化指标数据、组织学图像 | 烟草叶片（通过农杆菌介导的瞬时转化） | CRISPR-Cas9, Loop Assembly | 烟草（Nicotiana tabacum） | 由组成型（CaMV35S）或ABA诱导型（SlAREB）启动子驱动的dCas9-6TAL-VP128模块，与靶向NtBRL3启动子的双sgRNA配对 | 农业 |
| 416 | 2026-03-11 |
Characterization of phage AbpL with a terminally redundant genome and its therapeutic potential against drug-resistant Acinetobacter baumannii infections
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1760018
PMID:41798749
|
研究论文 | 本研究分离并全面表征了一种新型裂解性噬菌体AbpL，评估其对多重耐药鲍曼不动杆菌感染的体外和体内治疗潜力 | AbpL噬菌体具有独特的400 bp末端冗余基因组，这为未来通过合成生物学方法进行工程化改造提供了有价值的平台 | NA | 开发针对多重耐药鲍曼不动杆菌感染的新型有效治疗策略 | 新型裂解性噬菌体AbpL及其对多重耐药鲍曼不动杆菌的抗菌活性 | NA | 鲍曼不动杆菌感染 | 噬菌体分离、形态学表征、生长特性分析、基因组测序、时间-杀灭试验、生物膜破坏实验、小鼠败血症模型 | NA | 基因组数据、体外实验数据、体内实验数据 | 从污水样本中分离的噬菌体AbpL，以及临床多重耐药鲍曼不动杆菌分离株 | NA | NA | NA | 医学 |
| 417 | 2026-03-11 |
Cytochrome P450 gene family: cross-pathway functional conservation, novel catalytic reactions, and synthetic biology-driven applications in plant secondary metabolism
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1765290
PMID:41799975
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综述 | 本文综述了细胞色素P450（CYPs）基因家族在植物次级代谢中的功能保守性、新型催化反应以及合成生物学驱动的应用 | 提出了结合CYP酶工程与代谢途径优化的综合策略，并展望了合成生物学与机器学习等新兴技术如何推动CYP功能表征与规模化生产 | CYP的精确催化机制和调控网络仍未被充分解析，当前功能表征存在局限 | 总结CYP家族在植物次级代谢中的作用，探讨其应用潜力与未来研究方向 | 植物细胞色素P450（CYPs）基因家族及其催化的次级代谢产物（萜类、生物碱、黄酮类等） | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢途径优化、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径优化 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 418 | 2026-03-11 |
Muribaculum intestinale in brain-gut axis regulation: promises and limitations for therapeutic applications
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1723051
PMID:41800404
|
综述 | 系统综述了肠道微生物Muribaculum intestinale在肠脑轴调控中的作用机制及其与多种疾病的关联 | 首次系统总结了Muribaculum intestinale作为肠道微生物新成员在肠脑轴调控中的独特生物学特性及潜在治疗价值 | 临床转化仍面临技术瓶颈和个体差异等挑战 | 探讨Muribaculum intestinale在肠脑轴调控中的作用及治疗应用前景 | Muribaculum intestinale微生物及其代谢产物 | NA | 神经退行性疾病, 精神疾病, 代谢疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学修饰 | 小鼠, 人类 | NA | 医学 |
| 419 | 2026-03-10 |
Microbial medicines: Unlocking the therapeutic potential of the microbiome in cancer treatment
2026-Apr-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114720
PMID:41690480
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综述 | 本文综述了利用基因工程和合成生物学开发的工程微生物作为癌症治疗剂的潜力 | 探讨了工程微生物作为靶向疾病治疗的新兴应用，特别是在癌症治疗中检测疾病标志物并精确递送治疗载荷的能力 | 存在个体间变异性、安全性问题和监管障碍等挑战 | 评估微生物作为治疗剂在癌症治疗中的应用潜力 | 工程微生物及其在癌症治疗中的作用 | 合成生物学 | 胰腺癌、乳腺癌、肺癌、结直肠癌 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 420 | 2026-03-10 |
Next generation CAR-T cells to tackle solid tumors
2026-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114650
PMID:41570863
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综述 | 本文综述了下一代CAR-T细胞在克服实体瘤治疗挑战方面的创新设计，包括抗原特异性改进、肿瘤微环境重塑等 | 系统性地比较和概述了针对实体瘤的下一代CAR-T细胞设计，如逻辑门控系统、装甲CAR和免疫抑制抵抗受体，为未来研究提供前瞻性框架 | NA | 探讨如何通过合成生物学方法改进CAR-T细胞疗法，以应对实体瘤治疗中的挑战 | CAR-T细胞疗法及其在实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 人类T细胞 | 逻辑门控系统、多输入CAR设计、细胞因子受体共表达、装甲CAR、嵌合开关或显性负性受体 | 医学 |