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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-07-03 |
Acoustic cavitation-enhanced lymphatic trafficking of inhaled bacterial-sourced biohybrid vaccines for antitumor immunity
2026-Jul-01, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.06.007
PMID:42386468
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研究论文 | 提出一种结合合成生物学与声学工程的生物杂交纳米疫苗平台,实现非侵入性气道至淋巴结的疫苗接种策略以增强抗肿瘤免疫 | 利用工程化非致病性大肠杆菌作为活体抗原工厂,结合超声响应性锰螯合细菌膜纳米囊泡,通过低频超声触发声学液滴汽化,实现空化增强的淋巴转运,克服肺部生理屏障 | 可能涉及工程菌株的安全性和超声设备的临床转化挑战 | 开发下一代个性化免疫治疗的吸入式疫苗 | 工程化大肠杆菌TOP10菌株、肿瘤抗原、小鼠肺部淋巴结 | 合成生物学 | 癌症 | 声学液滴汽化、纳米囊泡包裹 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌TOP10 | 细菌膜纳米囊泡作为抗原递送载体 | 医学 |
| 402 | 2026-07-03 |
Advances, challenges, and opportunities in engineering C5 and C6 sugar transporters in yeast for bio-based industrial biotechnology
2026-Jul-01, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2680416
PMID:42386498
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综述 | 综述了酵母中工程化C5和C6糖转运蛋白的进展、挑战和机遇,以用于生物基工业生物技术 | 总结了C5糖转运的主要瓶颈,并强调了通过理性蛋白质工程、定向进化和机器学习等方法扩展C5转运蛋白库的突破性进展 | 尽管已取得重要突破,但C5糖的高效转运仍是主要限制,包括转运蛋白对C5糖亲和力低、受葡萄糖强烈抑制及降解等问题 | 综述酵母中糖转运蛋白工程的最新进展,以解决C5糖高效转运的瓶颈,推动可持续生物基生产 | 酵母细胞及其中C5和C6糖转运蛋白 | 机器学习 | NA | 理性蛋白质工程、定向进化、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢路径工程 | 工业生物技术, 生物能源, 农业, 生物医学 |
| 403 | 2026-07-03 |
Bacterial degradation of aromatic ester pollutants in agro-ecosystems: implications for bioremediation
2026-Jul-01, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13916-9
PMID:42387175
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综述 | 本文综述了农业生态系统中芳香酯类污染物的细菌降解机制及其在生物修复中的应用 | 结合合成生物学方法和细菌生态生理特性,提出增强原位降解的新策略 | 未提供具体的实验数据或定量分析,缺乏实际应用案例验证 | 阐述细菌降解芳香酯类污染物的遗传、代谢和进化机制,以及合成生物学在修复中的应用前景 | 芳香酯类污染物(芳香酸酯和芳香醇酯)及降解细菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 农业, 环境 |
| 404 | 2026-07-03 |
Towards the construction of a virtual yeast
2026-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10574-9
PMID:42387167
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研究论文 | 提出一个名为“虚拟酵母”的AI驱动智能体,通过整合多模态生物数据、机制推理和主动实验,模拟真核细胞行为 | 首次将大语言模型协调层与多个领域特定AI模块结合,构建闭环学习管道自主设计和执行实验,实现细胞行为的计算模拟 | 尚处于概念验证阶段,实际计算复杂度高,依赖数据质量和完整性 | 推进细胞生命计算模拟,优化生物合成途径,加速靶点发现和假设生成 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)作为遗传可操作和数据丰富的模式系统 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | 大语言模型, 生成式模型, 表示学习模型 | 多模态生物数据(包括机制知识、亚细胞结构和动态状态) | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 虚拟细胞模型(功能模块包括遗传、代谢和结构系统) | 合成生物学, 生物技术 |
| 405 | 2026-07-03 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-Jun-17, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
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研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白质,揭示了由细胞穿膜肽介导的细胞内化过程对手性依赖性的差异 | 首次系统研究了货物手性在细胞内化中的作用,通过保持恒定递送载体(cR10细胞穿膜肽)直接评估手性对摄取效率的影响 | 未明确讨论体内环境对手性依赖摄取的潜在影响,且研究仅限于体外细胞系实验 | 探究镜像肽和蛋白质在生物医学应用中,手性对细胞内化效率的影响 | 在L-和D-构型下合成的三种不同大小和结构复杂性的货物蛋白,并与细胞穿膜肽cR10偶联 | 合成生物学 | NA | 化学合成 | NA | 流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜图像 | 多种哺乳动物细胞系,具体样本量未说明 | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 406 | 2026-07-03 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
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研究论文 | 通过合成生物学调控,重组工程益生菌用于尿酸模块化降解及高尿酸血症治疗 | 首次构建表达PucL和PucM酶的重组益生菌株,并通过模块化优化RBS强度、过表达尿酸转运蛋白基因ygfU和过氧化氢降解酶基因katG,显著提高了尿酸降解效率,同时在小鼠模型中验证了其通过调节肠道菌群改善高尿酸血症的机制 | 仅限于体外实验和小鼠模型验证,未进行人体临床试验,且工程菌的长期安全性及稳定性需进一步评估 | 开发一种更安全有效的工程益生菌疗法,用于尿酸降解和高尿酸血症的治疗 | 重组益生菌Escherichia coli Nissle 1917及高尿酸血症小鼠模型 | 合成生物学 | 高尿酸血症 | 合成生物学、RBS优化、基因过表达 | NA | 实验数据 | 小鼠模型,具体数量未说明 | CRISPR-Cas9 | Escherichia coli Nissle 1917 | 尿酸降解模块(pucL和pucM基因)、尿酸转运模块(ygfU基因)和过氧化氢降解模块(katG基因) | 医学 |
| 407 | 2026-07-03 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 本文开发了一套用于脆弱拟杆菌的合成生物学工具包,并构建了体内吸收不良生物传感器,以非侵入方式监测肠道渗透压变化 | 首次为拟杆菌属构建了模块化的合成生物学工具包,包括可抑制启动子、DNA调控系统、模块化荧光转录报告电路及替代质粒整合模式,并验证其在哺乳动物肠道中的长期非侵入性监测能力 | 该生物传感器目前仅针对渗透压诱导的吸收不良模型验证,对其他肠道环境变化(如pH、氧气)的监测能力尚未探索;小鼠模型与人体肠道环境的差异可能限制直接转化 | 开发用于肠道健康诊断的非侵入性监测工具,利用遗传可操作的共生菌构建生物传感器 | 脆弱拟杆菌及小鼠模型中的肠道环境 | 合成生物学 | 吸收不良综合征、渗透性腹泻 | 荧光报告系统、质粒整合 | NA | 荧光数据 | 小鼠模型(泻药诱导渗透性腹泻) | CRISPR-Cas9 | 脆弱拟杆菌 | 可抑制启动子、荧光转录报告电路 | 医学 |
| 408 | 2026-07-03 |
Molecular Lego in the Green Factory: Engineering Plant Metabolism with Golden Gate Assembly
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5384-5_8
PMID:42390748
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研究论文 | 本文报告了一种利用Golden Gate组装技术模块化构建和优化植物代谢途径的合成生物学框架 | 提出了Golden Gate组装在植物代谢工程中的标准化应用方案,能够高效、无缝地同时组装10-20个DNA片段,显著优于传统克隆方法 | 未明确讨论组装效率在更大规模片段或复杂基因组背景下的潜在限制,以及瞬态表达系统的长期稳定性问题 | 开发一种可扩展且通用的策略,用于提高植物中高价值特化代谢物的产量 | 植物特化代谢物的生物合成途径,特别是通过本氏烟草瞬态表达验证 | 合成生物学、植物代谢工程 | NA | Golden Gate组装 | NA | DNA序列、代谢物数据 | 本氏烟草瞬态表达实验,具体样本数量未提及 | Golden Gate Assembly | 本氏烟草、大肠杆菌、酵母 | 植物代谢途径的模块化构建,包括启动子、非翻译区、编码序列和调控元件 | 医药、营养保健品、工业生物技术、农业 |
| 409 | 2026-07-02 |
Advances in the HAK/KUP/KT Potassium Transporter Family in Regulating Na+/K+ Homeostasis and Salt Tolerance in Plants
2026-Jul-01, Annals of botany
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/aob/mcag193
PMID:42384214
|
综述 | 系统综述了植物中HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族在维持Na+/K+稳态和耐盐性中的作用 | 全面阐述了该转运蛋白家族在分类、进化关系和功能特化方面的最新进展,特别关注了盐生植物中特定转运蛋白的功能多样性和适应性进化,以及其在糖植物中可能产生的矛盾效应 | 未提及具体实验验证或定量分析结果,主要基于已有文献总结,缺乏原创性实验数据支持 | 总结HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族在植物耐盐性中的调控机制,为遗传改良提供潜在靶点 | HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族及其在多种植物物种中的功能 | 植物生物学 | NA | 基因编辑、合成启动子、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,合成生物学 | 农作物,木本植物,盐生植物 | NA | 农业 |
| 410 | 2026-07-02 |
Cell-free synthesis and characterization of Salmonella, Escherichia coli, and Shigella-specific bacteriophages
2026-Jun-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03049-z
PMID:42380887
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研究论文 | 利用基于大肠杆菌的无细胞基因表达系统成功合成并表征了七种针对沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌的噬菌体 | 首次报道了五种噬菌体在无细胞系统中的成功合成,并展示了使用无内毒素菌株生产感染性噬菌体的能力,以及完全体外组装噬菌体基因组的可行性 | 无细胞合成噬菌体与宿主来源噬菌体在宿主依赖性感染效率上存在显著差异,可能限制了其在某些应用中的直接替代使用 | 评估基于大肠杆菌的无细胞平台合成多种与食品安全和合成生物学应用相关的噬菌体的能力 | 七种来自四个不同科、针对沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌的噬菌体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达系统 | NA | 噬菌体滴度、感染效率、热稳定性数据 | 七种噬菌体,涉及多个沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌宿主菌株 | NA | 大肠杆菌、ClearColi | NA | 食品, 医学 |
| 411 | 2026-07-02 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
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研究论文 | 介绍了一种基于GP35重组酶的质粒方法,用于实现对反刍动物支原体(如牛支原体)的靶向基因编辑 | 首次将噬菌体SPP1的GP35重组酶用于支原体的长单链DNA重组工程,实现精确的基因插入和缺失,规避了随机脱氨风险,且编辑率高达77.78%-100% | 未明确提及限制条件,可能需进一步验证在其它反刍动物病原中的通用性 | 开发有效的遗传操作工具以促进反刍动物支原体的致病机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体(如牛支原体Mycoplasma bovis) | 基因编辑 | 牛支原体病、羊支原体病 | 重组工程、质粒构建 | NA | 基因序列、突变体数据 | 牛支原体突变体系列(含代谢与毒力基因),编辑率样本覆盖77.78%-100% | GP35重组酶(来自噬菌体SPP1) | 牛支原体(Mycoplasma bovis) | 质粒介导的长单链DNA重组路线 | 农业、医学 |
| 412 | 2026-07-02 |
Tumor-Mimic Artificial Cell Integrated With In Situ Synthetic Biology for Testing of Antitumor Drug Sensitivity
2026-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240134
PMID:42382689
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研究论文 | 通过结合细胞膜仿生技术和原位合成生物学,构建了一种用于评估多种抗肿瘤药物疗效的类肿瘤人工细胞 | 首次将人工细胞技术与原位合成生物学相结合,设计了一种核糖酶可在细胞内催化分子信标裂解产生荧光信号,直接指示药物疗效,并利用3D编码人工细胞分类细胞特异性特征 | 未明确提及,但可能涉及人工细胞与真实生物系统之间的差异以及临床转化的挑战 | 开发一种有效且低成本的人工细胞平台,用于抗肿瘤药物的敏感性测试和药效分析 | 类肿瘤人工细胞,携带药物抗性蛋白的细胞膜,以及3D编码人工细胞 | 合成生物学,生物医学工程 | 肿瘤 | 细胞膜仿生技术,原位合成生物学,荧光成像 | NA | 荧光信号,细胞特征数据 | NA | 人工细胞技术 | NA | 核糖酶催化分子信标裂解的合成生物回路 | 医学 |
| 413 | 2026-07-02 |
Microbial spies and bloggers: programming cells to convert environmental information into discernible signals
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103436
PMID:41616686
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综述 | 综述了利用微生物编程作为环境传感器的最新进展,重点介绍创新输出方式和计算加速的传感组件设计 | 系统总结了新兴技术如何通过电化学、气相色谱、高光谱成像和下一代测序等输出方式解决传统生物传感器在复杂环境中的应用限制,并通过元基因组数据挖掘和别构蛋白开关设计加速传感组件多样化 | 未进行实验验证,基于文献综合分析,未讨论实际部署中成本、稳定性及公众接受度等具体挑战 | 综述利用合成生物学、生物分子设计和微生物组工程编程细胞作为复杂环境(土壤、沉积物、废水)中传感器的创新方法 | 微生物细胞及其群落作为环境信息传感底盘 | 合成生物学,环境科学 | NA | 电化学传感,气相色谱,高光谱成像,下一代测序,元基因组数据挖掘,别构蛋白设计 | NA | 化学信号,物理信号,生物信息 | NA | CRISPR-Cas9(可能)、TALEN(可能)、合成生物学工具 | 未驯化微生物、细菌(如E. coli)、微生物群落 | 生物传感器回路、别构蛋白开关、代谢通路耦联 | 环境监测,农业,工业生物技术 |
| 414 | 2026-07-02 |
Hemoglobin as a Molecular Glue: Toward Potent Inhibition of HbS Polymerization in Sickle Cell Disease
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504346
PMID:41612602
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综述 | 探讨利用血红蛋白作为分子胶来抑制镰状细胞病中HbS聚合的新策略 | 提出将血红蛋白本身重编程为治疗性支架的分子胶范式,结合冷冻电镜结构和人工智能预测模型设计工程化血红蛋白变体以抑制聚合 | 翻译该范式面临的关键挑战包括聚合中间体的精确结构表征、红细胞内高效递送、低氧条件下的时间调控以及免疫原性缓解 | 开发新型治疗策略以抑制镰状细胞病中HbS聚合 | 镰状细胞病中的血红蛋白S及其聚合机制 | 机器学习 | 镰状细胞病 | 冷冻电镜 | NA | 结构数据 | NA | 基因编辑, 合成生物学 | NA | 分子胶 | 医学 |
| 415 | 2026-07-02 |
Stable Coacervate Microdroplets as Robust Microreactors for Enhanced Enzymatic Catalysis
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514871
PMID:41615238
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研究论文 | 开发了由聚乙烯亚胺和硫辛酸钠构成的高稳定凝聚层微滴,作为增强酶催化反应的微反应器 | 通过静电和疏水相互作用构建具有动态分子招募能力的高稳定凝聚层微滴,无需额外稳定剂即可保持结构完整性超过35天,并实现高达53倍的酶催化反应加速 | 未提及具体限制,但可能包括对特定酶或反应条件的依赖性及长期应用中的潜在问题 | 研究凝聚层微滴的稳定机制及其作为高效酶微反应器的应用 | 凝聚层微滴的稳定性、分子招募效率和酶催化反应增强效果 | 合成生物学 | 不适用 | 液-液相分离 | 不适用 | 实验数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学, 生物催化 |
| 416 | 2026-07-02 |
Synthesis of Plant-Inspired O-Acetylated Hemicellulose Structures in the Yeast Yarrowia lipolytica
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00595
PMID:41611228
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研究论文 | 在酵母解脂耶氏酵母中成功重建两种植物半纤维素骨架结构及其O-乙酰化变体的生物合成 | 首次在微生物系统中实现了植物来源O-乙酰化半纤维素结构(包括β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖及其乙酰化变体)的从头合成,超越了天然存在的结构多样性 | 未明确讨论产量优化或大规模生产可行性,可能受限于微生物宿主中多糖合成效率及后修饰调控的复杂性 | 利用合成生物学方法在微生物工厂中重建植物半纤维素生物合成途径,生产具有定制化理化性质的功能化多糖 | β-葡甘露聚糖和β-葡聚糖骨架及其O-乙酰化变体 | 合成生物学 | NA | 糖基转移酶表达, 乙酰转移酶表达, 寡糖质谱分析, 组成及糖苷键分析 | NA | 质谱数据, 组成分析数据 | NA | NA | 解脂耶氏酵母 (Yarrowia lipolytica) | 植物来源糖基转移酶及乙酰转移酶表达路径 | 生物材料, 医药, 工业生物技术 |
| 417 | 2026-07-02 |
Yeast Stress Response to Synthetic Constructs
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00715
PMID:41615018
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综述 | 综述酵母在合成生物学改造中产生的应激响应及缓解策略 | 提出了应激感知设计原则,涵盖CRISPR电路重连、适应性实验室进化、合成细胞器构建及数据驱动菌株工程等新兴方法 | 未提及具体实验验证或定量比较不同缓解策略的效果 | 理解合成构建体与酵母应激通路相互作用,开发更稳健的酵母菌株 | 酿酒酵母作为底盘细胞的应激响应机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 应激响应调控回路 | 工业生物技术 |
| 418 | 2026-07-02 |
Enhancing Stress Tolerance of Probiotics: Mechanisms, Strategies, and Translational Challenges
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12872
PMID:41614565
|
综述 | 系统总结了益生菌应激耐受的分子机制及增强策略,并探讨了转化应用中的挑战 | 首次系统整合CRISPR基因编辑、合成生物学和纳米材料辅助递送等新兴技术,提出克服益生菌应激耐受性转化瓶颈的解决方案 | 监管审批和大规模制造等挑战仍需进一步解决 | 阐释益生菌应激耐受机制并评估增强策略,推动其工业应用转化 | 益生菌(包括食品、制药和农业领域使用的菌株) | NA | NA | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米材料辅助递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌(如乳酸菌等) | 应激响应代谢通路、基因调控回路 | 食品, 制药, 农业 |
| 419 | 2026-07-02 |
Classification, Pharmacological Properties, and Applications of Bioactive Constituents in Mentha Species
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13261
PMID:41614637
|
综述 | 本文综述了薄荷属植物中生物活性成分的分类、药理特性及其在食品、医药和现代农业等领域中的应用 | 重点探讨了利用合成生物学方法生产薄荷醇以应对传统生产方法的可持续性挑战 | 未具体说明研究方法的局限性,可能缺乏对现有研究不足的深入分析 | 总结薄荷属生物活性成分的分类、药理特性及其工业应用,并探讨合成生物学在解决资源约束方面的潜力 | 薄荷属植物及其生物活性成分(如薄荷醇和黄酮类) | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 医药, 现代农业 |
| 420 | 2026-07-02 |
Characterization of the Key Enzymes and a Gene Pair in Triterpenoid Biosynthesis of Ficus microcarpa
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12253
PMID:41615816
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研究论文 | 表征了榕树中八种氧化角鲨烯环化酶的功能,揭示了关键酶和一对基因在五环三萜生物合成中的作用 | 首次鉴定出桑科植物中罕见的多功能ψ-蒲公英甾醇合酶FmOSC1,并确定了区分FmOSC1与主要产生α-香树脂醇的FmOSC2的关键氨基酸残基,同时发现了具有广泛底物适应性的细胞色素P450酶FmCYP716A520 | 仅在一个植物物种中进行研究,未涉及体内验证或更广泛的进化分析 | 阐明榕树五环三萜生物合成的关键酶和分子机制,为合成生物学提供生物催化工具 | 榕树的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450酶 | NA | NA | 功能表征、酶活性分析 | NA | 序列数据、酶产物数据 | 8种氧化角鲨烯环化酶和1个细胞色素P450酶,以及5个其他植物物种的同源蛋白 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |