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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-07-02 |
Next-generation fermented foods: engineering the future of functional nutrition and emerging food safety challenges
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1869717
PMID:42382342
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综述 | 回顾下一代发酵食品在功能性营养和食品安全方面的最新进展与挑战 | 将传统发酵与先进微生物学和合成生物学结合,探讨新型生产技术的应用及其带来的生物化学风险 | 未提供具体的实验数据或案例研究,侧重于概念性讨论和监管框架 | 评估最新微生物选择策略和生物技术创新,强调全球监管机构在制定安全标准中的关键作用 | 发酵食品及其生产过程中的微生物、代谢产物和风险因素 | 机器学习 | NA | 精密发酵、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物(如转基因微生物) | 代谢工程路径 | 食品 |
| 422 | 2026-07-01 |
Microbial Metabolic Strategies for Environmental Detoxification: From Enzymatic Mechanisms to Synthetic Biology and Omics
2026-Jun-29, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05797-5
PMID:42371328
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综述 | 探讨微生物利用代谢途径降解污染物的酶学机制及合成生物学与组学技术的应用 | 整合合成生物学、代谢工程与多组学方法,系统分析微生物群落协同作用及生物修复策略的优化路径 | 环境限制因素、监管问题及可持续性挑战被重点讨论 | 阐明微生物代谢用于环境解毒的机制与工程化策略 | 微生物酶系统、生物修复策略、微生物群落及组学方法 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程 | 微生物 | 生物修复代谢通路 | 环境, 工业生物技术 |
| 423 | 2026-07-01 |
Spontaneous Non-Catalyzed Molecular Reactions and Interactions in the Human Body: Biomedical Implications
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524277
PMID:42183827
|
综述 | 综述了人体内自发非催化分子反应与相互作用及其生物医学应用 | 系统总结生理条件下无酶介导的自发非催化反应,并探讨其在疾病诊断、药物递送和再生工程中的新兴机会 | 未提及具体实验验证或定量分析,可能缺乏对反应动力学和选择性的深入讨论 | 探讨非催化分子反应在生物医学中的潜在应用 | 人体内的小分子、蛋白质、细胞等组分间的非催化反应与相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 免疫工程 |
| 424 | 2026-07-01 |
Genome mining and phylogenomics reveal diverse biosynthetic gene clusters in desert Actinobacteria
2026-Jun, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.001764
PMID:42376834
|
研究论文 | 通过基因组挖掘和系统发育基因组学方法,研究从埃及西奈沙漠分离的放线菌中多样化的生物合成基因簇 | 首次系统分析西奈沙漠放线菌的基因组,发现多个与已知参考序列相似度低的未知生物合成基因簇,揭示其作为新型抗菌和抗肿瘤代谢物来源的潜力 | 仅为基因组分析,缺乏实验验证和化学表征 | 探索沙漠放线菌中新型生物活性化合物的生物合成潜力 | 从西奈沙漠分离的放线菌菌株 | 天然产物发现 | NA | 基因组测序, 系统发育基因组学, 基因组挖掘 | NA | 基因组序列 | 多个来自西奈沙漠的放线菌菌株 | NA | 放线菌 | NA | 医学, 合成生物学 |
| 425 | 2026-07-01 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-05, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
|
评论文章 | 探讨RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中尚未探索的交叉领域 | 首次系统提出RNA修饰可能影响适配体折叠或结合,以及适配体可用于检测或调节表观转录组状态,为合成生物学和RNA治疗提供跨学科整合的新思路 | 直接调控联系尚未完全阐明,目前主要基于概念推测而非实验验证 | 激发RNA适配体与表观转录组学研究社区之间的讨论,吸引对未探索前沿领域的关注 | RNA适配体与表观转录组修饰(如m6A、假尿苷、5-甲基胞嘧啶)的相互作用 | 分子生物学 | NA | SELEX | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 426 | 2026-07-01 |
Toward sustainable production of bulnesol and elemol enabled by synthetic biology in Saccharomyces cerevisiae
2026-Apr-16, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04893-8
PMID:41989556
|
研究论文 | 利用合成生物学在酿酒酵母中实现布尼索尔和埃雷莫尔的可持续生产 | 首次证明了pH对萜烯合酶在体内产物谱的影响 | 布尼索尔/埃雷莫尔产量较低,工业化规模生产有待进一步优化 | 构建酿酒酵母工程菌株,实现布尼索尔和埃雷莫尔的可持续生产 | 布尼索尔和埃雷莫尔的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、发酵工程 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 酿酒酵母 | 萜烯生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 427 | 2026-06-30 |
Gnotobiology: from 19th-century global foundations to 21st-century omics - six decades of Czech contribution to microbiome research
2026-Jun-29, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01536-9
PMID:42371248
|
综述 | 本文回顾了捷克六十年来的无菌生物学研究,从1962年启动项目到21世纪与组学技术结合,探讨了无菌动物模型在微生物组研究中的关键作用 | 首次系统梳理了捷克无菌生物学的发展历程及其对全球微生物组研究的贡献,特别是结合高-throughput测序和代谢组学等技术,将研究重点从微生物组编目转向宿主-微生物相互作用的机制解析 | 未提及 | 追溯捷克无菌生物学六十年发展,并探讨其与组学技术整合后对宿主-微生物相互作用研究的影响 | 无菌猪、大鼠、兔和小鼠等动物模型,以及人类代谢、免疫介导、肿瘤和神经精神疾病的模型 | 微生物组研究 | 免疫疾病、代谢疾病、肿瘤、神经精神疾病 | 高通量测序、代谢组学、组学技术 | NA | 微生物组数据、代谢组数据 | 未提及 | NA | 猪、大鼠、兔、小鼠 | NA | 医学、个性化医疗、合成生物学 |
| 428 | 2026-06-30 |
CREAT: A CRISPR-Based Genome Trimming Strategy for Systematic Identification of Dispensable Regions and Rapid Genome Reduction
2026-Jun-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76042
PMID:42371672
|
研究论文 | 提出一种基于CRISPR的基因组修剪策略(CREAT),用于系统鉴定可删除区域并快速缩减基因组 | 整合CRISPR靶向基因组切割与同源臂步进法,实现一次分类必需与非必需基因亚区域,并设计合成基因盒进行一步替换,从而简化最小基因组构建流程 | 未详细说明在不同微生物中的通用性验证范围及潜在脱靶效应 | 开发一种可扩展且通用的方法,快速构建多种微生物的最小基因组 | Saccharolobus islandicus、枯草芽孢杆菌、大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、λ-Red重组酶 | NA | 基因组序列 | 八轮CREAT修剪实验 | CRISPR-Cas9, λ-Red重组酶 | Saccharolobus islandicus, 枯草芽孢杆菌, 大肠杆菌 | 合成基因盒 | 合成生物学,微生物工程 |
| 429 | 2026-06-30 |
Rational assembly of synthetic marine biofilm community with chitinase production
2026-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9419003/v1
PMID:42282017
|
研究论文 | 本文提出了一种自上而下的组装方法,利用天然海洋细菌设计具有几丁质酶生产功能的多物种生物膜群落 | 通过营养条件调控和竞争排除策略,成功构建了高物种多样性且具有目标功能的生物膜群落,并发现多物种群落能增强生物膜的入侵抵抗力和稳定功能输出 | 研究仅限于17种初始分离菌株,且未探索长期生态稳定性及大规模应用中的潜在问题 | 设计并组装具有几丁质酶生产功能的合成海洋生物膜群落 | 天然海洋细菌群落及多物种生物膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 17种海洋细菌分离株 | NA | 天然海洋细菌 | 几丁质酶生产途径 | 海洋生物技术, 环境工程 |
| 430 | 2026-06-30 |
Coupled intracellular redox and extracellular respiration sensing for quantitative oxidative stress profiling
2026-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.727573
PMID:42282784
|
研究论文 | 开发了一种结合基因编码氧化还原生物传感器和光学氧传感器的双荧光传感平台,用于工业酵母系统中细胞内氧化还原状态和细胞外呼吸活性的并行定量检测 | 首次将细胞内氧化还原生物传感器与细胞外氧气传感器集成在一个平台上,实现了对工业酵母氧化应激的实时、非侵入性测量,并揭示了不同酵母的氧化还原-呼吸表型差异 | 未在摘要中明确提及研究限制 | 实现细胞氧化应激的定量评估,需要同时测量细胞内氧化还原状态和细胞外呼吸活性,并开发集成的传感方法 | 工业酵母系统,包括Crabtree阳性酵母和专性呼吸酵母 | 机器学习和生物学交叉应用 | NA | 基因编码氧化还原生物传感器,光学氧传感,荧光成像 | NA | 荧光强度,氧气消耗率 | 两种酵母菌株(具体数量未提及) | NA | 工业酵母(Crabtree阳性酵母和专性呼吸酵母) | 双荧光传感平台,包含roGFP2 Tsa2ΔC氧化还原生物传感器和嵌入式氧传感器 | 生物制造,合成生物学 |
| 431 | 2026-06-30 |
Nitrogenase regulation in Vibrio natriegens differs from other γ-proteobacteria
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.30.728972
PMID:42282805
|
研究论文 | 本文研究了固氮弧菌中固氮酶的调控机制,发现其与其他γ-变形菌存在差异 | 首次揭示固氮弧菌中NifA可不依赖NtrBC直接激活固氮酶表达,且P蛋白GlnB和GlnK对NtrBC的冗余抑制更接近非固氮大肠杆菌 | 仅关注NH4与N2条件下的调控,未探索其他环境因素对固氮酶调控的影响 | 阐明固氮弧菌固氮酶的调控网络,为利用廉价氮源生产铵提供基础 | 固氮弧菌中的固氮酶调控蛋白 | 合成生物学 | NA | 功能基因组学、靶向突变、报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种突变株(如ΔntrBC、ΔglnBΔglnK等) | NA | 固氮弧菌 | 固氮调控通路(NtrBC-NifA固氮酶体系) | 工业生物技术、农业 |
| 432 | 2026-06-30 |
Combinatorial and Inducible CRISPRa/i Enables Canalized hiPSC Forward Programming and Iterative Refinement via Single-Cell Genomics
2026-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.31.729073
PMID:42282825
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研究论文 | 开发了一种名为CIRI的组合型可诱导CRISPRa/i平台,用于人类诱导多能干细胞的前向编程和通过单细胞基因组学的迭代优化 | 在人类诱导多能干细胞中建立了可编程的合成基因调控逻辑,通过模块化RNA适配体实现正交CRISPR激活和干扰,并利用组合双向导RNA的单细胞RNA测序筛选识别肌肉分化成熟的关键调控因子 | NA | 在人类诱导多能干细胞及其衍生细胞中建立可编程的合成基因调控框架,实现前向编程和迭代优化 | 人类诱导多能干细胞、hiPSC来源的心脏类器官、骨骼肌细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPRa/i, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 人类诱导多能干细胞 | 四环素响应型单导RNA与模块化RNA适配体组合,形成正交CRISPR激活和干扰回路 | 医学, 再生医学 |
| 433 | 2026-06-30 |
Antimicrobial peptides: emerging next-generation strategy for sustainable plant disease management
2026, Frontiers in antibiotics
DOI:10.3389/frabi.2026.1766594
PMID:41958967
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综述 | 本文综述了抗菌肽作为可持续植物病害管理的新一代策略,重点讨论了其机制、多样性及农业应用潜力 | 系统总结了抗菌肽模拟抗生素的机制、结构与功能多样性,并评估其作为化学农药和抗菌剂环境友好型替代品的可行性 | 标题和摘要中未明确提及局限性 | 评估抗菌肽作为替代化学农药和抗菌剂的潜力,用于可持续植物病害管理 | 抗菌肽,包括植物来源的防御素、硫素、环肽、脂质转移蛋白、snakin和橡胶素样肽,以及微生物来源的细菌素和脂肽 | NA | 植物病害 | 分子生物学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 434 | 2026-06-29 |
Optimizing Bispecific Antibody Expression via Multi-Omics Analysis and Vector Redesign
2026-Jul, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70228
PMID:42089360
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研究论文 | 通过多组学分析和载体重新设计,优化双特异性抗体在CHO细胞中的表达 | 首次整合多组学分析(RNA测序、剪接预测、密码子优化评估和基序筛选)来识别双特异性抗体低表达机制,并通过靶向工程改造实现11倍表达滴度提升 | 未提及 | 解决双特异性抗体在CHO细胞中表达低下的问题,提供通用框架来改善复杂生物制剂的可制造性 | 三种IgG-scFv格式的双特异性抗体 | 合成生物学,生物信息学 | NA | RNA测序,多组学分析 | NA | 序列数据,表达数据 | 三种双特异性抗体候选分子 | 蛋白质工程,DNA序列工程 | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 435 | 2026-06-29 |
Decoding heavy metal tolerance in rice: Nucleic acid-based technologies shaping global food security
2026-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152693
PMID:42190784
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综述 | 综述了核酸技术在破解水稻重金属耐受性中的应用,从发现到部署的全流程 | 系统梳理了从QTL定位、全基因组关联分析到CRISPR基因组编辑的技术演进,强调了核酸技术在大米重金属治理中的可用方案性质 | 特异性与必需性权衡、多金属拮抗(镉/砷氧化还原冲突)以及国际监管分歧(SDN-1豁免与转基因分类)仍是主要障碍 | 探讨核酸技术如何重塑水稻重金属耐受性的研究与应用流程 | 水稻重金属耐受性机制及低积累品种开发 | 基因组编辑、计算生物学 | 无 | QTL定位、全基因组关联分析、泛基因组学、CRISPR基因组编辑、转录组学、表观基因组学、宏基因组学 | 无 | 基因组数据、转录组数据、表观组数据、宏基因组数据 | 无 | CRISPR-Cas9 | 水稻 | 无 | 农业、食品安全、环境 |
| 436 | 2026-06-29 |
Metabolic Engineering for Biotechnological Production of Bioactive Methylated Flavonoids and Stilbenes: Progress and Perspectives
2026-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05658-1
PMID:41964842
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综述 | 综述利用代谢工程和合成生物学在微生物中生产甲基化类黄酮和二苯乙烯类化合物的最新进展 | 系统总结了甲基化修饰对类黄酮和二苯乙烯类化合物的生物活性增强作用,以及通过代谢工程策略(如途径优化、SAM再生、酶工程和CRISPR基因编辑)提高产量的方法 | 仍存在酶特异性、代谢瓶颈和下游加工等挑战 | 探讨甲基化修饰对类黄酮和二苯乙烯类化合物的药理学意义,以及利用工程微生物平台可持续规模化生产这些化合物的潜力 | 甲基化类黄酮(如樱花素、金合欢素、异鼠李素)和甲基化二苯乙烯类(如紫檀芪) | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、酶工程、CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR基因编辑 | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 链霉菌属 | 甲基化代谢途径 | 医药, 营养品 |
| 437 | 2026-06-29 |
Bioorthogonal chemistry-driven multi-enzyme strategy for efficient terpenoid biosynthesis
2026-Jun-24, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135232
PMID:42341954
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研究论文 | 开发了一种基于生物正交化学的体外多酶级联策略,用于高效合成萜类化合物 | 利用生物正交蛋白质配对技术将六个缩短的甲羟戊酸途径酶组装成有序交联酶复合物,实现了空间有序组织,并展示出模块化设计和通用适用性 | 目前仅测试了β-法尼烯和紫杉二烯两种产物,且仍存在一定酶活性损失(保留62±9%) | 开发一种高效、可重复使用的体外萜类生物合成平台 | β-法尼烯合酶和紫杉二烯合酶相关的多酶级联系统 | 合成生物学 | 不适用 | 生物正交化学、多层荧光标记技术 | 不适用 | 不适用 | 单个实验重复测量8次(n=8) | 生物正交蛋白质配对 | 大肠杆菌 | 有序交联酶复合物(甲羟戊酸途径级联) | 工业生物技术, 医药 |
| 438 | 2026-06-29 |
Recent advances in protein engineering and synthetic applications of amino acid oxidases
2026-Jun-23, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135229
PMID:42336113
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综述 | 系统综述了氨基酸氧化酶的催化机制、蛋白质工程改造策略及合成应用进展 | 首次全面整合定向进化、理性/半理性设计及AI引导等蛋白质工程策略在氨基酸氧化酶改造中的应用,并系统总结其在化学酶级联反应、多酶级联去消旋化和动力学拆分等拓展合成应用 | 部分新兴蛋白质工程策略(如AI引导方法)的实际应用案例有限,缺乏大规模工业应用验证 | 总结氨基酸氧化酶的催化机制和活性测定方法,阐述蛋白质工程改造策略(包括定向进化、理性/半理性和AI引导方法)及其在合成生物学中的应用进展 | 氨基酸氧化酶(D型和L型) | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质工程, 定向进化, 理性设计, AI引导方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 化学酶级联反应, 多酶级送去消旋化, 动力学拆分 | 制药, 农用化学品, 工业生物技术 |
| 439 | 2026-06-29 |
Decoding and exploiting intratumoral microbiota: from microenvironment modulation to clinical intervention
2026-Apr-25, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-11858-z
PMID:42033527
|
综述 | 总结肿瘤内微生物群在肿瘤微环境中的调控作用及其作为临床干预靶点的潜力 | 系统阐述了肿瘤内微生物群调控肿瘤微环境的多重机制,并提出整合空间多组学、合成生物学和纳米技术的精准治疗新范式 | 肿瘤内微生物群时空动态解析不足,与宿主细胞相互作用机制未明确,临床转化安全性和有效性仍存挑战 | 探索肿瘤内微生物群在肿瘤微环境中的调控机制及临床干预策略 | 肿瘤内微生物群、肿瘤微环境中的免疫细胞(如CD8+T细胞、Tregs、MDSCs)和信号通路(如PI3K-AKT、NF-κB) | 数字病理学 | 肺癌、前列腺癌、心血管疾病、老年病 | NA | NA | NA | NA | 工程细菌、噬菌体疗法、细菌胞外囊泡 | NA | NA | 医学 |
| 440 | 2026-06-29 |
Engineering strategies for the biosynthesis of rare sugars in microbial cell factories
2026-Apr-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04975-1
PMID:42033624
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综述 | 本文综述了稀有糖类的生理功能、应用及微生物细胞工厂生物合成策略的进展 | 系统整合了代谢工程、酶工程、生物催化和发酵过程优化等多层次工程策略,以提升稀有糖类的生产效率和工业可行性 | 未提供具体实验数据或定量比较,主要依赖文献总结,可能受限于综述时点的研究进展 | 总结稀有糖类在微生物细胞工厂中的生物合成进展,并提出未来发展方向 | 稀有糖类(包括D-阿洛酮糖、D-塔格糖、D-阿洛糖、L-核糖、L-核酮糖和L-木酮糖) | 合成生物学,代谢工程 | NA | 代谢工程,酶工程,生物催化,发酵工艺优化 | NA | NA | NA | NA | 微生物(如大肠杆菌、酵母等) | 生物合成途径(如稀有糖代谢通路) | 食品,医药,健康相关产业 |