合成生物学相关文章
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当前共找到 1106 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-05-27 |
Approaches to deorphanize secretome: Classical, computational, and next generation strategies to reveal ligand-receptor networks
2026, EXO : beyond the cell
DOI:10.70401/EXO.2026.0008
PMID:42181609
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综述 | 综述当前用于解析分泌蛋白配体-受体网络的经典、计算和下一代策略 | 系统总结并比较了生化、遗传筛选和AI驱动计算三种去孤儿化策略的优势与局限，并提出了未来发展方向 | 未详细讨论每种技术的具体实施细节和实验验证案例 | 推动分泌蛋白去孤儿化从经典方法向可扩展、上下文感知框架的转变，以解码器官间通信 | 分泌蛋白及其未知受体 | 机器学习 | NA | 亲和纯化-质谱、交联受体捕获、RNA干扰、CRISPR、AI蛋白结构建模 | AI蛋白结构模型 | 蛋白质组学数据、空间转录组数据 | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 442 | 2026-05-26 |
Development of an efficient genome editing system using recombinase-mediated cassette exchange in E. coli Nissle 1917 for large gene cluster integration and heterologous astaxanthin production
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.020
PMID:42182969
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研究论文 | 通过优化电转和重组酶介导的盒式交换，在Nissle 1917中建立了高效基因编辑系统，用于大基因簇整合和异源虾青素生产 | 首次在EcN中系统优化电转条件和RMCE系统，实现了大片段（29 kb）基因簇的高效整合，并成功用于异源虾青素生产 | 未详细评估RMCE系统在长期培养中的稳定性及对宿主细胞生长的影响 | 建立高效的EcN基因编辑系统以促进异源天然产物合成 | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的盒式交换（RMCE）、电穿孔 | NA | DNA | NA | CRISPR-Cas9（未明确提及，但RMCE依赖重组酶） | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 虾青素生物合成操纵子 | 工业生物技术、医学 |
| 443 | 2026-05-26 |
Combination of adaptive laboratory evolution and metabolic engineering on Vibrio natriegens for efficient production of 3-hydroxypropionic acid from ethanol
2026-Sep, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134757
PMID:42067166
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研究论文 | 通过适应性实验室进化和代谢工程改造Vibrio natriegens，实现从乙醇高效生产3-羟基丙酸 | 首次利用适应性实验室进化筛选出能利用乙醇的Vibrio natriegens菌株，并通过启动子优化、背景菌株理性设计和添加浅蓝菌素显著提升3-羟基丙酸产量 | 未提及乙醇利用效率低和耐受性差的具体机制，以及工业化规模放大的可行性 | 开发一种高效从乙醇生产3-羟基丙酸的Vibrio natriegens工程菌株 | Vibrio natriegens菌株及3-羟基丙酸生物合成途径 | NA | NA | 适应性实验室进化、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | 3-羟基丙酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 444 | 2026-05-26 |
RNA-based cancer immunotherapy: Harnessing the power of RNA nanoparticles for melanoma treatment
2026-Aug, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156512
PMID:42119359
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综述 | 本文综述了基于RNA的癌症免疫疗法在黑色素瘤治疗中的应用，重点介绍了RNA纳米颗粒的作用 | 总结了环状RNA、PIWI相互作用RNA和自扩增RNA等新型RNA在黑色素瘤免疫治疗中的机制，并探讨了RNA纳米颗粒在递送中的创新作用 | NA | 综合评估基于RNA的癌症免疫疗法在黑色素瘤治疗中的机制、临床前和临床证据，并突出RNA纳米颗粒的潜力 | 黑色素瘤和RNA纳米颗粒 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序、信使RNA疫苗、小干扰RNA、微小RNA、环状RNA、PIWI相互作用RNA、自扩增RNA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 445 | 2026-05-26 |
Functions and optimization of soft law in the international governance of synthetic biology: The predicament of hard law vs. the rise of soft law
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.005
PMID:42179736
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研究论文 | 探讨合成生物学国际治理中软法与硬法的功能分工与协作模式，指出软法在应对伦理风险方面的优势及与硬法协同的必要性 | 提出“软法引导、硬法固化、软法反馈”的混合治理模型，强调软法在技术适应性、共识构建和灵活性方面的不可替代作用 | 未具体讨论软法实施效果和定量评估指标，缺乏对各国实际采纳情况的实证分析 | 分析合成生物学国际治理中软法与硬法的现有困境，提出优化协作的治理框架 | 合成生物学领域的国际法律体系（BWC、CBD）及软法工具（伦理指南、政策建议、行为准则） | 政策与法律研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学国际治理 |
| 446 | 2026-05-26 |
Transcriptome-Guided Identification of N-Acetyltransferases Involved in Melatonin Biosynthesis in a Streptomyces-Based Cell Factory
2026-May-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70390
PMID:42178992
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研究论文 | 通过转录组引导挖掘，鉴定了链霉菌细胞工厂中参与褪黑素生物合成的N-乙酰转移酶，并优化菌株实现产量提升65% | 首次利用转录组引导方法鉴定链霉菌中参与褪黑素生物合成的内源N-乙酰转移酶，并通过工程改造显著提高产量 | 未明确说明局限性 | 开发可持续的微生物褪黑素生物合成方法 | 工程改造的白色链霉菌（Streptomyces albus）菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组引导挖掘、基因工程 | NA | 转录组数据 | 一个工程菌株及多个衍生菌株 | 基因敲除、过表达 | 白色链霉菌（Streptomyces albus） | 从头合成的褪黑素生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 447 | 2026-05-26 |
Spontaneous Non-Catalyzed Molecular Reactions and Interactions in the Human Body: Biomedical Implications
2026-May-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524277
PMID:42183827
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综述 | 综述人体内自发非催化分子反应与相互作用的生物医学应用 | 系统总结了无酶介导下自发发生的分子反应与相互作用，并探讨其在疾病诊断、药物递送、再生工程及合成生物学中的新兴机遇 | 未深入讨论这些反应与相互作用的体内定量分析及长期安全性问题 | 阐明非催化分子反应在生物医学领域的应用前景 | 人体内小分子、蛋白质、细胞等组分间的非催化反应与相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类 | NA | 医学 |
| 448 | 2026-05-26 |
Exploring specialized metabolic pathways in medicinal plants with single-cell and spatial omics
2026-May, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.12.023
PMID:42180555
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综述 | 探讨单细胞和空间组学技术在药用植物特殊代谢途径研究中的应用 | 综述了单细胞和空间组学技术在解析药用植物细胞类型特异性代谢途径中的前沿进展，如单萜吲哚生物碱和紫杉醇的生物合成研究 | 未明确指出技术应用的具体局限性，但隐含了当前方法在数据处理和成本方面的潜在挑战 | 总结单细胞和空间组学技术进展，评估其在代谢途径发现和分区中的应用，并探讨其在植物合成生物学和代谢工程中的未来方向 | 药用植物中特殊代谢物的生物合成途径 | 数字病理学 | NA | 单细胞组学、空间组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 药用植物 | NA | 医药、合成生物学 |
| 449 | 2026-05-26 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
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综述 | 系统综述虫媒病毒在气候变化背景下的进化动态、宿主-媒介互作及新型防控策略 | 整合基因组分析、元流行病学综合与预测建模的多学科框架，系统阐述CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预及mRNA疫苗等新型防控策略 | 伦理、生态和监管问题（如基因编辑和微生物干预）需进一步考量 | 理解虫媒病毒进化机制、宿主-媒介互作及新型控制策略以有效缓解疾病 | 登革病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒等虫媒病毒及其媒介（蚊、蜱） | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | 文献数据 | 从16320篇初始文献中筛选出12项高质量同行评审研究 | CRISPR基因驱动 | 蚊、蜱 | 基因驱动回路、基于RNAi的抗病毒回路 | 医学 |
| 450 | 2026-05-26 |
Next-Generation Probiotics: From Traditional Strains to Personalized Therapeutics
2026-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70339
PMID:41327880
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review | 本文综述了从传统益生菌到下一代益生菌的演变，重点比较了机制差异和功能进步，并探讨了合成生物学、人工智能和微生物组分析在个性化益生菌治疗中的潜力 | 系统对比传统益生菌与下一代益生菌在机制上的区别，引入合成生物学可编程基因电路和人工智能驱动的个性化治疗策略 | 广泛临床应用仍处于早期阶段，面临安全性、监管和转化方面的挑战 | 比较传统与下一代益生菌，探讨个性化治疗的前沿进展 | 传统益生菌（如乳杆菌属、双歧杆菌属）与下一代益生菌（如阿克曼氏菌、普拉梭菌） | NA | 代谢性疾病、炎症性疾病、神经系统疾病 | 合成生物学、微生物组分析 | NA | NA | NA | 可编程基因电路 | 人体肠道微生物 | 可编程基因电路 | 医学、营养学 |
| 451 | 2026-05-26 |
Gut-engineered Bacillus subtilis-mediated BAMBI delivery for the treatment of thioacetamide-induced liver fibrosis through mechanotransduction inhibition
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1817519
PMID:42183058
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研究论文 | 利用肠道工程化枯草芽孢杆菌递送BAMBI蛋白治疗硫代乙酰胺诱导的肝纤维化 | 首次采用遗传工程枯草芽孢杆菌通过肠-肝轴持续递送BAMBI蛋白，同时抑制生化信号和机械传导，创新性地将合成生物学与机械生物学相结合治疗肝纤维化 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证；需评估长期口服活菌的安全性和潜在副作用 | 开发一种基于工程微生物的肝纤维化治疗方法，通过抑制机械传导来逆转肝纤维化 | 经硫代乙酰胺诱导肝纤维化的小鼠模型 | 合成生物学 | 肝纤维化 | 遗传工程、口服给药、组织分析、血清标志物检测 | NA | 实验数据（组织学评分、血清生化指标、蛋白表达数据） | 小鼠模型，具体数量未在摘要中说明 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 构建持续分泌BAMBI蛋白的基因电路 | 医学 |
| 452 | 2026-05-25 |
Bacillus-derived antimicrobial peptides as alternatives to antibiotics in poultry: mechanisms, applications, and future prospects- a review
2026-May-23, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04941-3
PMID:42176025
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综述 | 综述了芽孢杆菌源抗菌肽作为家禽中抗生素替代品的机制、应用及未来前景 | 系统总结了芽孢杆菌源抗菌肽（包括核糖体合成细菌素和非核糖体合成脂肽）的结构多样性、多机制作用（膜靶向、生物膜调节、免疫调节及霉菌毒素相关肠道保护）以及其在替代抗生素中的潜力与挑战 | 抗菌肽活性受肽类、配方、微生物生态和宿主生理因素影响，可能存在适应性或基因编码耐药性，且面临肽不稳定性、体内疗效差异、菌株特异性差异、安全性问题及缺乏标准化比较模型等转化挑战 | 评估芽孢杆菌源抗菌肽作为家禽中抗生素替代品的可行性，并探讨其作用机制、应用限制及未来发展方向 | 家禽病原菌及芽孢杆菌源抗菌肽 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品 |
| 453 | 2026-05-25 |
Bacterial 3D genome architecture: organization, regulation, and synthetic biology applications
2026-May-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04117-8
PMID:42177580
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综述 | 综述细菌三维基因组结构的组织、调控机制及其在合成生物学中的应用 | 整合染色体构象捕获与成像研究的见解，突出基因组架构对环境信号的动态响应，并探讨三维基因组学在合成生物学中的潜在应用 | 细菌基因组架构及其调控的详细原则尚未完全阐明 | 理解细菌三维基因组的结构组织、调控因素以及在合成生物学中的应用前景 | 细菌三维基因组架构及其调控因子 | NA | NA | 染色体构象捕获, 成像 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 合成生物学, 医学 |
| 454 | 2026-05-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-04-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
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研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中利用Cre-lox系统实现可调低速率基因组重组的方法，应用于厌氧环境生物传感和合成生物学 | 开发了严格调控、可滴定的Cre重组酶系统，实现了低重组率和最小基础活性，并展示了其在厌氧砷检测中的实用性 | 论文未明确说明系统的长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发可用于环境生物传感和合成生物学的可调低速率基因组重组工具 | 大肠杆菌及基于重组的砷生物传感器 | 合成生物学 | NA | Cre-lox位点特异性重组 | NA | NA | 未明确样本数量 | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的砷响应生物传感器电路 | 环境监测, 合成生物学 |
| 455 | 2026-05-25 |
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre
IF:2.9Q1
DOI:10.1159/000550994
PMID:41701651
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综述 | 本文综述了生物膜工程与合成生物学交叉领域的最新进展，重点介绍了调控生物膜行为以用于生物技术应用和解决相关挑战的策略 | 整合了噬菌体疗法、电遗传系统、微生物联合体设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰和抗菌肽涂层表面等多种策略，实现了对生物膜结构、组成和代谢输出的精确调控 | 存在生物安全性、异质性、可扩展性和监管合规性等挑战 | 探讨合成生物学工具在生物膜工程中的应用，以优化生物膜在废水处理、生物修复、生物能源和诊断等领域的性能，并控制致病性生物膜 | 生物膜及其工程化系统 | 机器学习 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 遗传电路 | 环境, 能源, 医学 |
| 456 | 2026-05-25 |
Predicting lasso peptide structure with LassoPred
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.037
PMID:42177065
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研究论文 | 提出LassoPred，一个基于机器学习的模块化计算流程，用于从序列预测套索肽的三维结构 | LassoPred通过整合ESM2嵌入训练的支持向量机分类器注释关键拓扑特征（异肽环和塞子残基），并采用拓扑感知的结构构建器组装和优化原子模型，实现了近实验精度，同时将预测时间缩短至分钟级，并将已知套索肽结构覆盖率从不足50个扩展至超过4000个基因组挖掘模型 | 输入标题与摘要中未明确提及局限性 | 从序列准确预测套索肽的三维结构，桥接序列发现与结构洞察的差距 | 套索肽（LaPs） | 机器学习 | NA | 机器学习、同源建模、能量最小化 | 支持向量机 | 序列数据 | 超过4000个基因组挖掘模型 | NA | NA | NA | 酶学、结构生物学、合成生物学、治疗学设计 |
| 457 | 2026-05-24 |
Unveiling the adaptive structure-function synergy in thermophilic translation initiation factor 1: A molecular dynamics framework
2026-Aug, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2026.107644
PMID:42085878
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研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示嗜热翻译起始因子1的结构-功能协同适应性机制 | 首次通过全原子分子动力学模拟系统比较嗜热与中温翻译起始因子1的动态特性，揭示嗜热因子通过扩展氢键和盐桥网络增强结构刚性的分子机制 | 仅基于计算机模拟，缺乏体外实验验证；仅研究了单一嗜热菌株的IF1蛋白 | 阐明嗜热细菌翻译起始因子1的热稳定性分子机制，为工程化耐热蛋白建立框架 | 嗜热菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum的IF1蛋白（TT_IF1）与中温菌Flavobacterium kingsejongi的IF1蛋白（FK_IF1） | 分子生物学 | 不适用 | 分子动力学模拟，主成分分析 | 不适用 | 模拟轨迹数据 | 每种IF1蛋白3次独立模拟，每次1000纳秒 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学，工业生物技术 |
| 458 | 2026-05-24 |
PURE makes PURE: reconstitution of the PURE cell-free system from self-synthesized proteins
2026-May-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73337-0
PMID:42173857
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研究论文 | 本研究展示了PURE无细胞系统可以从其自身合成的蛋白质中重建，实现非核糖体蛋白质组分的自我再生 | 首次证明PURE系统中的36种非核糖体蛋白质可以完全通过该系统自身合成，并重建出功能完整的PURE系统，标志着向通用生化构建器迈出关键一步 | 尚未完全实现整个系统（包括核糖体和其他复杂组分）的自主复制，未提及长期稳定性和实际应用中的瓶颈 | 探索无细胞系统自我再生能力，推动通用生化构建器的实现 | PURE无细胞系统中36种非核糖体蛋白质 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞系统，蛋白质纯化 | NA | NA | 36种非核糖体蛋白质及其组合 | NA | E. coli（用于制备PURE系统组分） | 自我再生回路（PURE系统组分自我合成与重建） | 合成生物学，生物技术 |
| 459 | 2026-05-24 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
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研究论文 | 揭示了RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制，类似于GntR阻遏物中的DNA操纵子位点识别 | 首次解析了SELEX衍生的RNA适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构，发现其识别模式与DNA双链结合高度相似，并基于结构设计出新型适配体Dap1m1，实现了对同源蛋白NagR的调控 | 未提及实验的局限性，如适配体设计仅针对少数位点随机化，或对其他GntR家族成员的通用性有待验证 | 研究RNA适配体与细菌阻遏蛋白的相互作用，并探索设计新型适配体-蛋白相互作用对 | RNA适配体Dap1及其靶标GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR，以及同源蛋白NagR | 合成生物学 | NA | X射线晶体学、SELEX | NA | 三维结构数据 | NA | SELEX | NA | RNA适配体调控回路（适配体-阻遏蛋白相互作用对） | 合成生物学、医学（基因调控应用） |
| 460 | 2026-05-23 |
Common γ-chain cytokines in brain tumor immunotherapy: Biological barriers and advances in macromolecular delivery systems
2026-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152288
PMID:42092664
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综述 | 本文综述了常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的应用，重点讨论了生物屏障和基于大分子的递送系统的进展 | 系统阐述了血脑屏障和血液肿瘤屏障对免疫治疗的阻碍，并总结了纳米颗粒、外泌体和细胞载体等递送平台在增强细胞因子稳定性、肿瘤选择性和降低系统毒性方面的创新应用 | 未明确提及具体局限性，但暗示细胞因子疗法仍面临生物屏障、半衰期短和脱靶毒性等挑战 | 探讨常见γ链细胞因子在脑肿瘤免疫治疗中的潜力，并分析递送系统如何克服生物屏障以改善治疗效果 | 脑肿瘤（尤其是胶质瘤）及其免疫抑制微环境 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 纳米颗粒、外泌体、细胞载体 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |