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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-06-28 |
From Discovery to Manufacturing: A Quantitative Review of Phosphonates and Strategies for High-Titer Production
2026-May-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061170
PMID:42354795
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综述 | 对膦酸酯天然产物的发现趋势、生物活性和规模化生产进行定量综述 | 首次系统整合71份膦酸酯发现报告,定量分析发现模式、生物活性谱和生产菌分类,并总结构效关系和工程化策略 | 未明确提及局限性,可能受限于已报道数据的完整性和多样性 | 加速新型膦酸酯的发现,并通过生产技术改进提高其可及性 | 1959年至今报道的71种膦酸酯天然产物(主要来自细菌) | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、生物催化级联 | NA | 文本 | 71份膦酸酯天然产物报告 | NA | 细菌 | NA | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 462 | 2026-06-28 |
Therapeutic Applications of Natural Products in Biomedicine and Pharmacotherapy
2026-May-22, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16060873
PMID:42355401
|
综述 | 对天然产物在生物医药和药物治疗中应用的关键性和综合性分析 | 整合结构、功能与转化的分析框架,重点关注结构分析、骨架设计和机制理解,并探讨基因组挖掘、合成生物学和网络药理学等新兴领域的角色和局限 | 天然产物的药代动力学和ADMET特性分析标准化不足,影响研究重现性;新兴领域在增强发现流程中存在局限性 | 综合化学、药理学和转化方法,提出克服天然产物开发挑战的有效策略,推动其成为下一代精准医疗治疗药物 | 天然产物,如紫杉醇、青蒿素和姜黄素等代表性化合物 | 机器学习, 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 463 | 2026-06-28 |
Recent strategies in synthetic food production for sustainable food security: applications and challenges
2026, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2026.1829214
PMID:42358301
|
综述 | 探讨合成食品生产的最新技术策略及其在可持续粮食安全中的应用与挑战 | 综合分析了细胞培养技术、基因改造、微生物发酵、植物蛋白工程、人工智能等先进技术在合成食品生产中的创新应用,并强调了其在营养、安全和规模化生产方面的潜力 | 面临生产成本高、技术优化不足、监管复杂及合成食品安全使用等挑战 | 解决传统农业资源限制与环境变化带来的粮食需求问题,推动可持续粮食体系发展 | 合成食品产品,如培养肉、人造甜味剂、微生物蛋白、新型脂肪、强化及合成乳制品、功能性食品成分等 | 机器学学,数字病理学 | NA | 细胞培养技术、微生物发酵技术、植物蛋白工程、人工智能 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、食品、工业生物技术 |
| 464 | 2026-06-26 |
Prediction of gene expression levels in Saccharomyces cerevisiae based on chromatin accessibility using multiple machine learning models
2026-08, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 基于染色质可及性,使用多种机器学习模型预测酿酒酵母基因表达水平 | 首次开发了一种利用染色质可及区域中的k-mer特征预测基因表达水平的监督学习模型Yeast-Gene,并揭示了与mRNA剪接相关的高影响基序 | 未明确说明模型的局限性,如泛化能力或数据集大小的影响 | 研究染色质可及性与基因表达水平之间的关联,并开发预测模型 | 酿酒酵母的染色质可及性区域 | 机器学习 | NA | 染色质可及性测序 | 监督学习,k-mer特征模型 | 序列数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学 |
| 465 | 2026-06-26 |
Toward synthetic biology in mushroom-forming Agaricomycete fungi: from tools to applications
2026-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00178-25
PMID:42233661
|
综述 | 回顾了蘑菇形成型伞菌纲真菌合成生物学的研究进展,并概述了限制可预测基因工程的主要障碍 | 强调了蘑菇生物学特有的工程限制,包括复杂的有性周期、异核现象以及转化和生长过程中的菌株不稳定性,并提出了该领域优先发展方向 | 尚未全面解决基因表达瓶颈,如启动子和终止子表征不足、基因组致密性导致的基因整合挑战以及内含子和特定序列基序的影响 | 推动伞菌纲真菌作为可持续生物制造、设计生物材料、气候解决方案和真菌生物学机制研究的可编程平台 | 蘑菇形成型伞菌纲真菌 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 伞菌纲真菌 | NA | 可持续生物制造, 设计生物材料, 气候解决方案, 真菌生物学 |
| 466 | 2026-06-26 |
[Research progress in inducible expression regulation systems in photosynthetic cyanobacteria]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260030
PMID:42343792
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综述 | 综述了光合蓝细菌中诱导型表达调控系统的研究进展 | 系统比较了化学诱导系统和光遗传控制系统在多种蓝细菌菌株中的适用性及调控特性,并展望了通过合成生物学构建新型诱导表达系统、模块化调控电路和环境响应表达系统的未来趋势 | 未提供实验数据验证各系统性能差异的定量比较 | 总结并分析蓝细菌中诱导型基因表达调控系统的研究现状,为构建更高效、可控且环境友好的基因表达调控系统提供参考 | 光合蓝细菌中的诱导型表达调控系统,包括化学诱导系统和光遗传控制系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 光合蓝细菌 | 诱导型表达系统、光遗传控制系统、模块化调控电路、环境响应表达系统 | 绿色生物制造 |
| 467 | 2026-06-26 |
[Advances in genome editing technologies in Komagataella phaffii and their applications in biomanufacturing]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250908
PMID:42343789
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综述 | 系统总结了Komagataella phaffii中基因组编辑技术的发展历程及其在生物制造中的应用 | 全面梳理了从传统重组方法到下一代精确编辑工具的演变,重点介绍了CRISPR/Cas系统的最新进展、优化策略和工程实践 | 未明确提及具体局限性,但指出了提高编辑效率、快速组装复杂代谢途径和加速工业转化等方面的挑战与机遇 | 为Komagataella phaffii的理性工程改造及其在合成生物学和生物制造中的广泛应用提供参考 | Komagataella phaffii | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas,基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | Komagataella phaffii | NA | 工业生物技术,生物制造 |
| 468 | 2026-06-26 |
[Neo-chemical industry: a new perspective for understanding biomanufacturing industry]
2026-Jun-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260154
PMID:42343785
|
评论文章 | 引入‘新化工’视角重新理解生物制造产业,分析其工业化挑战与战略路径 | 将生物制造重新定义为合成生物学驱动的化工产业范式重构,构建了涵盖原料、工艺和技术的三维分析框架 | 基于单一案例(l-丙氨酸厌氧发酵)进行理论推导,缺乏对不同类型生物制造过程的系统验证 | 澄清生物制造产业性质,提供理解其本质和价值的直观框架 | 生物制造产业及其工业化过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境, 材料 |
| 469 | 2026-06-26 |
Engineering growth independent production: programmable control loops for high-titer rhamnolipids for improved green surfactant sustainability
2026-Jun-25, Bioprocess and biosystems engineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s00449-026-03375-x
PMID:42347958
|
综述 | 综合讨论了鼠李糖脂生物表面活性剂的工程化生产进展,重点关注生长非依赖型生产、高产策略及可持续性 | 将代谢途径优化与生长-生产解耦的动态调控系统相结合,并整合了过程强化技术,为工业部署提供技术经济与生命周期评估框架 | 识别了代谢图谱与规模放大实施之间的关键研究空白,但未提供具体实验验证数据 | 提高鼠李糖脂产量、速率和收益率(TRY),降低下游回收成本,解决生物安全性限制,推动绿色表面活性剂商业化 | 鼠李糖脂生物表面活性剂的生产工艺与工程化策略 | 合成生物学、工业生物技术 | NA | 代谢工程、高通量细胞培养、原位泡沫控制、膜分离 | NA | 文本综述数据 | NA | 代谢途径优化、辅因子再平衡、动态调控系统 | NA | 生长非依赖型生产调控回路(如动态开关、反馈控制系统) | 农业、个人护理、环境修复、医疗保健 |
| 470 | 2026-06-26 |
Transcription Factors: A Promising Third-Generation Core Sensing Element for Developing Low-Cost, On-Site Rapid Detection Technologies for Food Contaminants
2026-Jun-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14507
PMID:42262033
|
综述 | 综述了转录因子作为第三代核心传感元件在开发低成本、现场快速检测食品污染物技术中的应用 | 提出了近端诱变策略并整合人工智能辅助分析来优化转录因子及其DNA结合位点 | 仍面临优化和实际应用挑战,具体局限性未详细说明 | 总结转录因子在食品安全监测中的传感应用及其工程化进展 | 转录因子及其用于检测食品中小分子和重金属离子的传感器平台 | 机器学习(与合成生物学交叉) | NA | 转录因子工程, 人工辅助分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物系统 | 生物传感器 | 食品安全 |
| 471 | 2026-06-26 |
Bioengineered bacteria in cancer immunotherapy: mechanistic advances, therapeutic strategies and clinical potential
2026-Jun-24, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-05030-1
PMID:42340392
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综述 | 综述工程化细菌在癌症免疫治疗中的机制进展、治疗策略和临床潜力 | 系统地总结了合成生物学、基因工程和物理化学修饰手段设计可编程细菌系统的最新进展,并阐述了化学、物理和生物修饰细菌与多种疗法的多模态协同效应 | 免疫清除、遗传稳定性、毒性风险和肿瘤微环境异质性限制了临床转化 | 综述工程化细菌在癌症免疫治疗中的进展,为下一代持久个性化活体治疗设计提供见解 | 工程化细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因工程、物理化学修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 细菌 | 群体感应电路、缺氧响应启动子、毒性减退、配体-受体靶向 | 医学 |
| 472 | 2026-06-26 |
Microbial Degradation of Plastics: Mechanisms, Pathways, and Multiomics Insights
2026-06-23, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c02515
PMID:42258349
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review | 综述了微生物降解塑料的机制、途径及多组学见解 | 整合了微生物分类学、酶解聚和多组学功能分析,提出了连接微生物特性与塑料降解四个关键阶段的框架,并批判性评估了降解指标的稳健性和可比性 | 现有研究碎片化,降解效率、机制和实际应用报告不一致,聚合物特性、实验条件和评估方法的变异性严重阻碍了跨研究比较和实验室向实际应用的转化 | 梳理微生物降解塑料的最新进展,弥合实验室发现与实际生物降解策略之间的差距 | 塑料降解微生物及相关酶 | NA | NA | 多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 合成微生物联合体 | 环境 |
| 473 | 2026-06-26 |
RATEX: A Scalable RNA-Based Platform for Logical and Multi-Layered Cellular Programming
2026-06-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202520600
PMID:42083989
|
研究论文 | 介绍了一种可扩展的基于RNA的逻辑和多层细胞编程平台RATEX | 通过整合翻译到转录的转换器与合成RNA调控因子,实现了紧凑且可扩展的RNA编程电路架构,能够利用大型翻译调控因子库和核糖体介导的环境输入感知,实现多输入逻辑处理与信号放大 | 构建具有宽动态范围和多重调控级联的合成RNA电路仍然具有挑战性 | 开发可扩展的遗传电路以实现活细胞中的复杂功能 | RNA调控因子和核糖体介导的传感机制 | 合成生物学 | NA | RNA调控 | NA | NA | NA | RATEX平台 | 活细胞 | 逻辑门(6输入OR逻辑门、混合3输入逻辑门、3输入AND门),信号放大级联 | 合成生物学, 生物技术 |
| 474 | 2026-06-26 |
The Gut Microbiome Dependency Continuum in Drug Discovery: A Unified Pharmacology Framework Linking Clinical Drugs, Natural Products, and Engineered Microbial Therapeutics
2026-Jun-10, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15020043
PMID:42346015
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综述 | 提出肠道微生物组依赖性连续谱框架,整合临床药物、天然产物和工程微生物疗法,揭示微生物组在药理学中的关键作用 | 首次提出四层肠道微生物组依赖性连续谱框架,将微生物组从被动调节剂重新定义为可编程治疗平台,系统整合药物发现中的微生物组依赖性层次 | NA | 构建统一药理学框架,阐述肠道微生物组在药物发现和治疗功能中不同深度依赖性,推动微生物组感知的药物发现和精准工程微生物疗法开发 | 肠道微生物组及其与药物的相互作用(包括粪便微生物移植、微生态制剂、代谢调节药物、天然产物和工程微生物疗法) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 肠道微生物组 | 可编程微生物系统、工程益生菌、微生物组响应药物递送系统、合成微生物群落 | 医学 |
| 475 | 2026-06-26 |
Advances in UDP-Glycosyltransferases from Medicinal Plants: Discovery, Catalytic Mechanism, Engineering and Biosynthetic Application
2026-Jun-10, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16060402
PMID:42346382
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综述 | 系统总结了药用植物UDP-糖基转移酶的最新全球研究进展,涵盖发现、催化机制、工程改造及生物合成应用 | 首次系统整合多组学、人工智能辅助基因挖掘与蛋白质工程优化策略,构建了包括体外多酶级联、微生物细胞工厂和植物悬浮细胞培养的全谱生物制造体系框架 | 工业化放大、监管合规和临床转化是核心挑战 | 为药用植物UDP-糖基转移酶的工程应用提供完整技术框架,支持稀有天然治疗性糖苷的绿色规模化生产 | 药用植物UDP-糖基转移酶 | 机器学习 | NA | 多组学, 人工智能, 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物悬浮细胞 | 体外多酶级联、微生物细胞工厂、植物悬浮细胞培养系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 476 | 2026-06-26 |
Pharmaco-microdynamics (PMD): Redefining dose, exposure, and control for living drug carriers
2026-Jun-09, Annales pharmaceutiques francaises
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.pharma.2026.06.002
PMID:42264080
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综述 | 提出药效微动力学(PMD)框架,用于量化活体药物载体的剂量、暴露与控制 | 首次将药代动力学/药效学(PK/PD)框架扩展到活体药物系统,定义了功能暴露积分、定植效率等新指标,并整合药理学、微生物生态学、合成生物学等多学科原理 | 框架尚处于理论阶段,需大量实验验证;边界条件(如非复制型微生物干预)下经典PK/PD仍适用,PMD的适用范围存在局限 | 建立定量递送科学体系,重新定义活体治疗药物的暴露与控制 | 活体药物载体(如益生菌、工程微生物治疗剂、活体生物治疗产品) | 机器学习 | 苯丙酮尿症、复发性艰难梭菌感染 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 477 | 2026-06-26 |
Transcriptome-Guided Identification of N-Acetyltransferases Involved in Melatonin Biosynthesis in a Streptomyces-Based Cell Factory
2026-May-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70390
PMID:42178992
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研究论文 | 通过转录组引导挖掘,在链霉菌细胞工厂中鉴定参与褪黑素生物合成的N-乙酰转移酶,并优化产量 | 首次利用转录组引导策略在链霉菌中鉴定参与褪黑素合成的内源N-乙酰转移酶,并通过工程改造显著提高褪黑素产量 | 未提及具体局限性 | 实现微生物中褪黑素的高效生物合成 | 工程链霉菌白色亚种菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组测序、基因工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除、基因过表达 | 链霉菌白色亚种 | 褪黑素从头合成途径 | 医药,工业生物技术 |
| 478 | 2026-06-26 |
Spatial Regulation of CAR Signaling Enables Logic-Gated Activity
2026-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.726983
PMID:42239424
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研究论文 | 设计了一种通过空间调控CAR信号实现逻辑门控活性的新型受体MANTIS | 利用细胞外受体维度差异来空间调控CAR信号,通过空间位阻和抗原顺序结合实现AND门控逻辑 | 可能涉及复杂的工程化设计及体内应用的潜在挑战 | 开发一种新型AND门控受体,使CAR T细胞更特异性识别癌细胞,减少对正常细胞的杀伤 | CAR T细胞及其对癌细胞的杀伤活性 | 合成生物学 | 癌症 | CAR技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 逻辑门控受体MANTIS | 医学 |
| 479 | 2026-06-26 |
Emerging Applications of CAR-T Cell Therapy in Overcoming Resistance and Expanding Targets in Hematologic Malignancies: Insights from Recent Research
2026-May-23, Current treatment options in oncology
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s11864-025-01371-z
PMID:42176091
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综述 | 总结CAR-T细胞疗法在克服血液恶性肿瘤耐药性和扩展靶点方面的最新研究进展 | 提出CRISPR增强型CAR和基于合成生物学的异体系统以提高CAR-T疗法的疗效和可及性 | 未明确说明具体局限性,但指出抗原逃逸、T细胞耗竭及在急性髓系白血病和T细胞白血病中疗效有限等问题仍存在 | 总结2015年以来的人类试验成果,重点关注近两年创新,探讨克服耐药性策略及提升安全性和可及性的方法 | 血液恶性肿瘤患者,包括B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤和多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 多靶点CAR、下一代构建体、合成生物学异体系统 | 医学 |
| 480 | 2026-06-26 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
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研究论文 | 研究RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制,揭示其模拟DNA操纵子位点识别,并指导新型适配体设计 | 首次解析SELEX衍生适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构,发现RNA适配体与蛋白的相互作用高度模仿DNA-蛋白识别模式,并基于结构信息设计出靶向同源蛋白NagR的新型适配体 | 未明确提及在更广泛的阻遏蛋白家族中的适用性验证,适配体设计策略的普适性有待进一步探索 | 阐释RNA适配体与细菌阻遏蛋白的分子识别机制,推动合成生物学中新型适配体-蛋白互作对的设计 | RNA适配体Dap1及其突变体Dap1m1、GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR和NagR | 合成生物学 | NA | 晶体结构解析、SELEX、定点突变 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | SELEX | 细菌(未明确具体菌种) | 基因表达调控回路(基于适配体诱导的阻遏蛋白去抑制) | 合成生物学、生物技术 |