合成生物学相关文章
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当前共找到 1106 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-05-18 |
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00700-6
PMID:42143386
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综述 | 综述了用于Methylomonas sp. DH-1遗传和代谢工程的生物技术方法进展 | 总结了针对该菌株优化的转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子文库和合成小调控RNA平台等新型遗传工具，以及适应性实验室进化、合成菌群和系统生物学等互补策略 | NA | 概述Methylomonas sp. DH-1的遗传和代谢工程方法进展，为甲烷氧化菌的代谢工程和合成生物学奠定基础 | Methylomonas sp. DH-1（一种革兰氏阴性甲烷氧化细菌） | 合成生物学 | NA | 基因组工程， 转化， 可调启动子文库， 合成小调控RNA， 适应性实验室进化 | NA | NA | NA | Cre重组酶 | Methylomonas sp. DH-1 | 合成小调控RNA平台， 可调启动子文库 | 工业生物技术， 环境 |
| 502 | 2026-05-18 |
Discovery and engineering of polymerases and ligases for the synthesis of modified nucleic acids
2026-May-15, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102697
PMID:42143538
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综述 | 本文综述了利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的最新方法 | 聚焦于工程化聚合酶和连接酶在非天然寡核苷酸合成中的应用，并提供了加速核酸修饰酶发现与工程化的计算工具及网络应用程序 | 未明确提及具体局限性 | 综述利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的研究进展 | 工程化聚合酶和连接酶 | 合成生物学 | NA | 酶促合成 | NA | NA | NA | NA | NA | 非天然核酸聚合物合成通路 | 医学, 诊断, 合成生物学 |
| 503 | 2026-05-17 |
PromoterAtlas: decoding regulatory sequences across Gammaproteobacteria using a transformer model
2026-May-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72837-3
PMID:42140912
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研究论文 | 提出基于Transformer的模型PromoterAtlas，从3371种γ-变形菌的900万调控序列中学习，实现全基因组启动子注释 | 首次使用大规模跨物种调控序列训练Transformer模型，实现启动子序列的跨物种进化关系聚类与转录/翻译水平预测 | 模型训练数据仅限于γ-变形菌，可能无法直接推广到其他细菌类群 | 开发能识别多种调控元件并预测转录/翻译水平的通用启动子注释工具 | γ-变形菌的调控序列 | 机器学习 | NA | Transformer深度学习模型 | Transformer | 基因组序列 | 3371种细菌的900万条调控序列 | NA | NA | NA | 合成生物学, 比较基因组学 |
| 504 | 2026-05-17 |
A synthetic cell microreactor with two types of interacting dynamic DNA-based pores
2026-May-15, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02124-7
PMID:42141071
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研究论文 | 构建了一个含有两种动态DNA基孔的双颈合成细胞微反应器，用于模拟和扩展天然细胞系统的功能复杂性 | 创新地利用巨型单层囊泡膜动力学介导的信号通路，协调光响应小孔与自组装可密封大孔之间的相互作用，实现具有高时空精度的按需顺序递送分子反应物 | NA | 在合成生物学中重建细胞复杂性，通过动态DNA基孔实现膜渗透性的可控调节 | 巨型单层囊泡膜上的动态DNA基孔系统 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | 图像 | NA | DNA折纸 | NA | 光响应小孔和自组装可密封大孔的信号通路，以及酶联反应、细胞骨架模拟和细胞外无细胞系统 | 生物技术, 纳米技术 |
| 505 | 2026-05-17 |
Abiotic Stress Sensing in Plants: Biochemical and Biophysical Basis
2026-May-14, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.05.007
PMID:42141723
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综述 | 综述植物感知非生物胁迫的生化和生物物理机制，并讨论主要未解决问题和新兴研究方法 | 系统整合温度、干旱、盐碱、洪涝及土壤压实等多种胁迫的感知机制，强调生物物理过程与化学信号编码的逻辑，并引入AI建模、单细胞技术等前沿方法 | 未明确定量描述各感知机制的相对贡献，缺乏在单细胞或全株水平上空间组织的实验证据 | 阐明植物将环境胁迫从物理化学信号转化为生物信号的分子逻辑 | 植物（模式植物及农作物）中感知多种非生物胁迫的分子机制 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 506 | 2026-05-17 |
TargetGAN: A generative AI framework for the design of plant core promoters with targeted activity
2026-May-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101851
PMID:41981910
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研究论文 | 提出TargetGAN，一个基于生成对抗网络和预训练活性预测器的深度学习框架，用于设计具有目标活性的植物核心启动子 | 首次将GAN与活性预测器结合，实现用户自定义活性的植物核心启动子从头设计，并发现合成启动子可超越天然启动子的活性上限 | 预测活性与实验活性仅为中等相关性，且STARR-seq验证后只有约55%的合成启动子成功表征 | 开发一个能够设计具有目标活性的植物核心启动子的通用框架 | 植物核心启动子的设计和功能验证 | 机器学习 | NA | STARR-seq，荧光素酶报告基因检测，深度测序 | 生成对抗网络 (GAN) 和预训练活性预测器 | DNA序列 | 训练集包含76,851个天然启动子；生成了55,296个合成启动子，其中5,250个用于高通量功能验证，2,909个成功表征 | NA | 植物（拟南芥原生质体用于STARR-seq验证） | 植物核心启动子设计（包含激活基序的精确排列） | 农业，合成生物学 |
| 507 | 2026-05-17 |
Growth versus decline: root aging and plant performance
2026-May-05, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag115
PMID:41990352
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综述 | 综述根老化对植物生长的影响及延迟根老化的潜在策略 | 首次从概念上桥接根系生长调节与根老化过程，并提出利用遗传学和合成生物学方法延迟根老化以提升作物生产力 | 由于技术挑战，对老根采样和分析的研究有限 | 探讨根老化机制及其对植物生长的影响，并评估延迟根老化的策略在提高作物产量和应对气候变化中的潜力 | 根系 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 延迟根老化或再激活老根生长的遗传和合成生物学回路 | 农业, 环境 |
| 508 | 2026-05-17 |
RNA Aptamers and Epitranscriptomics: Charting Unexplored Territories in RNA Biology
2026-May, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-026-00841-w
PMID:41838348
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评论文章 | 探讨RNA适配体与表观转录组学在RNA生物学中的交叉领域及其潜在应用 | 首次系统性地提出RNA适配体与表观转录组学之间的相互作用，包括RNA修饰如何影响适配体折叠或结合，以及适配体如何用于检测或调节表观转录组状态 | 这两个领域之间的直接调控联系尚未完全阐明，内容主要基于概念性探讨而非实验验证 | 激发RNA适配体和表观转录组学领域之间的跨学科讨论，并吸引对这些交叉领域进行未来研究 | RNA适配体和表观转录组学修饰（如N6-甲基腺苷、假尿苷和5-甲基胞嘧啶） | 分子生物学, 合成生物学 | NA | SELEX | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 合成生物学 |
| 509 | 2026-05-17 |
Engineering ligands for theophylline riboswitches expands its regulatory dynamic range in prokaryotic and eukaryotic systems
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70870-w
PMID:41872214
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研究论文 | 通过结构设计合成4-喹唑啉酮衍生物，显著提升茶碱核糖开关在原核和真核系统中的调控动态范围 | 首次通过结构导向方法设计合成4-喹唑啉酮衍生物，使茶碱适配体结合亲和力提升30倍，基因表达动态范围在细菌中达到380倍 | 未说明 | 提升茶碱核糖开关的调控动态范围，以增强生物技术应用中基因调控的精确性 | 茶碱核糖开关及其在细菌、分枝杆菌和真核系统中的调控性能 | 合成生物学 | 未适用 | 结构导向配体设计、核糖开关调控 | 未适用 | 未适用 | 未适用 | CRISPR-Cas9 | 细菌、分枝杆菌、真核细胞 | 核糖开关介导的条件性基因表达 | 生物医学工程 |
| 510 | 2026-05-16 |
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2670832
PMID:42093635
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研究论文 | 评估利用长链非编码RNA MALAT1来源的3'端序列替代poly(A)尾实现人类细胞中转基因表达的功能 | 首次系统比较了MALAT1来源的三螺旋结构与经典poly(A)尾在合成mRNA表达中的功能差异 | MALAT1来源序列的表达效率始终低于经典poly(A)尾，需优化三螺旋序列和折叠以增强翻译能力 | 探索poly(A)尾的替代策略，用于合成生物学和RNA治疗中的功能性转基因表达 | MALAT1来源的3'端序列基序与经典poly(A)尾 | 分子生物学 | NA | 合成mRNA递送 | NA | NA | NA | NA | 人细胞 | NA | 合成生物学, RNA治疗 |
| 511 | 2026-05-16 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
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综述 | 本文综述了苔藓植物在植物合成生物学作为新型工具、系统和机遇平台的最新进展 | 强调苔藓植物作为替代实验平台可弥补被子植物系统复杂性限制，推动跨植物谱系的通用和协同生物工程方法建立 | 未明确提及具体限制 | 突出苔藓植物作为植物合成生物学系统的重要性，并讨论其技术发展与应用前景 | 苔藓植物（包括藓类、角苔类和地钱类），特别是作为主要模型的物种 | NA | NA | 模块化克隆、基因回路、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 苔藓植物（藓类、角苔类、地钱类） | 基因回路 | 农业, 工业生物技术 |
| 512 | 2026-05-16 |
Engineering Rapamycin-Induced Dimerization for Control of Gene Expression in Plants
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00125
PMID:41990133
|
研究论文 | 开发了一种雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统，用于植物中基因表达的精确控制 | 通过系统优化多种DNA结合域、FRB重复序列和启动子架构，将诱导倍数提升至87倍，且诱导表达水平超过2×CaMV35S组成型启动子；雷帕霉素可通过简单喷洒或土壤施用实现控制 | 研究提及现有化学诱导系统的局限性，但未明确阐述本系统在非目标植物或环境中的潜在风险如持久性 | 实现植物基因表达的时间、空间和定量精确控制，替代现有诱导系统缺陷 | 植物（具体物种未明述，但数据表型涉及叶、土壤施用等通用植物模型） | 合成生物学 | NA | 雷帕霉素诱导系统、分裂转录因子系统 | NA | 基因表达数据、应用方法数据 | NA | NA | 植物（具体物种未明述） | 雷帕霉素诱导的二聚化分裂转录因子系统；包含hFRB-结合域和hFKBP12-转录激活域的回路设计 | 农业、生物技术 |
| 513 | 2026-05-16 |
Construction and Application of a Multicolor Bactosensor for Detecting Bioavailable Antibiotic Mixtures in the Environment
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00891
PMID:42027138
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研究论文 | 构建了一种多色细菌传感器，用于同时检测环境中的四环素和红霉素 | 首次将两个基于转录因子的传感模块整合到一个质粒中，并通过引入抗生素抗性基因提升性能，实现了通过智能手机图像颜色差异定量区分二元抗生素混合物 | 主要针对两种抗生素的检测，对于更复杂混合物的适用性未在论文中明确讨论 | 开发一种可现场部署的细菌传感器，用于环境中抗生素混合物的定量检测 | 四环素和红霉素 | NA | NA | 合成生物学、荧光传感 | NA | 图像 | 真实水样（未明确数量） | NA | 大肠杆菌 | 多色细菌传感器，包含基于转录因子的四环素和红霉素传感模块 | 环境监测 |
| 514 | 2026-05-16 |
Metabolic Engineering of Bacillus subtilis for High-Level Production of Salidroside from Potato Starch
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00803
PMID:42048483
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研究论文 | 通过代谢工程手段，在枯草芽孢杆菌中利用马铃薯淀粉高效生产红景天苷 | 首次在枯草芽孢杆菌中引入芳香醛合酶合成酪醇，结合群体感应动态调控系统优化红景天苷生产，并利用马铃薯淀粉作为碳源实现高效发酵 | 目前仅在摇瓶发酵水平实现生产，未提及工业规模放大及成本分析 | 开发可持续的红景天苷生产方法，推动天然产物生物合成的工业化应用 | 枯草芽孢杆菌工程菌株 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、发酵工程 | NA | 实验数据 | 工程菌株BS18及其他中间菌株 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 异源芳香醛合酶合成酪醇途径、内源醇脱氢酶筛选、群体感应动态调控系统、磷酸葡萄糖变位酶和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶过表达 | 生物医药，化妆品，工业生物技术 |
| 515 | 2026-05-16 |
A Streamlined and High-Osmolarity Bacillus subtilis Cell-Free Platform for Rapid Characterization of Genetic Regulatory Elements
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00165
PMID:42052911
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研究论文 | 建立了一种简化且高渗透压的枯草芽孢杆菌无细胞平台，用于快速表征遗传调控元件 | 系统重新评估了传统的提取制备和反应环境，省略了常规所需的流出培养和透析步骤，并通过将钾谷氨酸浓度提高至400 mM并添加渗透保护剂甜菜碱，显著增强了翻译能力 | 未提及具体局限性 | 开发一种简化的枯草芽孢杆菌无细胞系统，用于快速表征遗传调控元件 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统中的遗传调控元件 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 遗传调控元件，包括启动子强度分析和catabolite抑制子CcpA介导的阻遏 | 合成生物学、工业生物技术 |
| 516 | 2026-05-16 |
Multiplexed Engineering of Salmonella Typhimurium for Targeted Cancer Therapies
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00119
PMID:42085230
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综述 | 提出一个系统性工程框架，用于将鼠伤寒沙门氏菌改造为有效的抗癌活体生物治疗产品 | 提出了一个多模块协同工程框架，涵盖菌株减毒、靶向增强、定植优化、治疗生产、裂解控制释放和辅助模块，将鼠伤寒沙门氏菌从病原体转化为抗肿瘤载体 | 工程化鼠伤寒沙门氏菌在遗传稳定性和临床转化方面存在挑战和瓶颈 | 总结通过合成生物学方法工程化鼠伤寒沙门氏菌用于靶向癌症治疗的关键方法，并推动其临床应用 | 鼠伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学重组 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Golden Gate Assembly | 鼠伤寒沙门氏菌 | 多模块协同工程回路，包括减毒回路、靶向增强回路、定植优化回路、治疗生产回路、裂解控制释放回路和辅助模块 | 医学 |
| 517 | 2026-05-16 |
Modeling of Conjugative- and Phage- Mediated CRISPR-based System against Antimicrobial Resistant Bacteria
2026-May-14, IEEE transactions on bio-medical engineering
DOI:10.1109/TBME.2026.3693402
PMID:42133510
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研究论文 | 利用系统生物学方法建立数学模型，模拟结合型和噬菌体介导的CRISPR系统对抗抗菌耐药细菌的动态过程 | 通过数学建模整合突变效应和传递系统动力学，比较了工程化益生菌和噬菌体在CRISPR切割与CRISPR干扰两种抗菌执行器中的表现，为合成生物学抗耐药策略提供了定量优化框架 | 模型基于数学假设，未在真实生物系统中验证；参数简化可能忽略宿主免疫反应等复杂生物学因素 | 评估工程化结合型益生菌和噬菌体通过CRISPR系统沉默耐药基因或直接切割基因组来对抗抗菌耐药细菌的潜力 | 耐药细菌、工程化益生菌和工程化噬菌体组成的递送系统及抗菌执行器（CRISPR切割与CRISPR干扰） | 系统生物学 | 抗菌耐药感染 | 数学建模 | 动力学模型 | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR干扰 | 益生菌, 噬菌体 | CRISPR基因编辑和基因沉默回路 | 医学 |
| 518 | 2026-05-16 |
Understanding Cell Wall Enzyme Function: From Classical Approaches to New Biotechnology
2026-May-14, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag227
PMID:42135035
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综述 | 综述了植物细胞壁相关碳水化合物活性酶的功能研究方法，从经典技术到合成生物学和人工智能等新兴工具 | 整合了经典生化与遗传方法以及高通量筛选、无细胞系统、微生物宿主、植物平台和CRISPR/Cas9等合成生物学工具，并强调了AI蛋白质模型和实验室自动化的潜力 | 未提及具体实验结果或定量比较不同方法的效率 | 提供研究植物细胞壁相关CAZymes功能的策略概述，以推动食品、生物能源和生物产品应用 | 植物细胞壁中碳水化合物活性酶 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选，无细胞系统，CRISPR/Cas9基因组编辑，碱基编辑，AI蛋白质模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9，碱基编辑 | 微生物宿主，植物 | NA | 食品，生物能源，生物产品，材料 |
| 519 | 2026-05-16 |
Harnessing biosynthetic logic for next-generation ADC payloads
2026-May-12, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs01487e
PMID:42015662
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综述 | 本文综述了基于生物合成逻辑开发新一代抗体药物偶联物（ADC）载药的研究进展 | 通过基因组挖掘和合成生物学方法揭示临床载药的生物合成基因簇和酶学逻辑，拓展载药化学空间，并讨论非毒素模式以补充传统细胞毒素 | 未明确说明该领域的当前挑战或未来研究的具体局限性 | 总结临床载药的发现、生物合成和生产进展，利用生物合成知识推动更安全、高效和机制复杂的ADC疗法 | 抗体药物偶联物及其载药 | 合成生物学 | 肿瘤 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 520 | 2026-05-16 |
Recent advances in decoding biosynthetic pathways and synthetic biology approaches for plant alkaloids
2026-May-12, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00089k
PMID:42132682
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综述 | 综述2018至2025年间植物生物碱生物合成途径解析与合成生物学方法的最新进展 | 对主要类别的代表性植物生物碱的途径解析挑战（立体化学控制、重要环化、定制修饰）及长途径解码创新方法进行系统总结，并讨论合成生物学与代谢工程策略在微生物高效生产中的应用 | 未具体说明局限性，但该领域对特定酶催化步骤和途径完整性的理解仍存在挑战 | 促进植物生物碱功能基因表征、合成生物系统开发、产量优化和药物创新，加速高价值植物生物碱的发现和规模化生产 | 单萜吲哚生物碱、四氢异喹啉生物碱、托品烷生物碱等主要类别的代表性植物生物碱 | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 微生物生产 | NA | NA | NA | NA | 微生物（大肠杆菌、酵母等） | 生物合成途径重构 | 药学, 药物发现, 可持续生产 |