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当前共找到 1386 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-06-23 |
Heterologous production of a plant biostimulant in Streptomyces albidoflavus
2026-Jun-20, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13915-w
PMID:42322407
|
研究论文 | 本研究通过异源生产平台在Streptomyces albidoflavus中生产植物生物刺激素pteridic acids F和H，并显著提高了产量 | 首次建立pteridic acids (PTA)的功能性异源生产平台，结合Cas12a辅助的精确靶向克隆、CRISPR-Cas9基因组整合和启动子工程，以及基因组规模代谢模型指导的培养基优化，实现超过20倍的产量提升 | 初始异源表达仅产生可检测的elaophylin而非PTA，且经过启动子工程后PTA产量仍低于定量限 | 建立Pteridic acids (PTA)的异源生产平台并优化产量，以开发植物生长促进剂应对非生物胁迫 | Pteridic acids F和H（植物生长促进聚酮化合物） | 合成生物学 | NA | Cas12a辅助精确靶向克隆（CAPTURE）, CRISPR-Cas9, 基因组规模代谢模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cre-lox重组 | Streptomyces albidoflavus J1074, NBC1270 | PTA生物合成基因簇异源表达系统，包括kasOp*启动子工程 | 农业, 生物技术 |
| 502 | 2026-06-23 |
Strategies for enhancing specificity and efficacy of oncolytic viruses in cancer treatment
2026-Jun, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2026.110708
PMID:41999961
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综述 | 综述了增强溶瘤病毒在癌症治疗中特异性和功效的策略 | 系统总结了转录靶向、微小RNA去靶向、病毒进入重定向等多层次逻辑门调控系统，以及免疫调节、纳米包裹、载体细胞运输等最新工程技术进展 | 虽然综述了多种策略，但未讨论这些方法在临床试验中的实际转化障碍或长期安全性数据 | 分析当前溶瘤病毒工程化进展，以解决肿瘤选择性不足和治疗效果有限的问题 | 溶瘤病毒及其工程化改造策略 | 机器学, 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 哺乳动物细胞 | 逻辑门调控系统, 开关, 代谢通路 | 医学 |
| 503 | 2026-06-23 |
Engineering Lactobacillus for therapeutic delivery and biosensing: lessons from niche adaptation
2026-Jun, Future microbiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1080/17460913.2026.2686558
PMID:42288957
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review | 综述了乳酸杆菌的工程化改造及其在治疗递送和生物传感中的应用，重点讨论了其生态位适应机制带来的启示 | 系统总结了乳酸杆菌通过合成生物学工具（如CRISPR-Cas系统）从传统益生菌向多功能治疗递送和生物传感平台转化的最新进展 | 工程化乳酸杆菌的稳定性和法规监管方面仍存在挑战 | 探讨乳酸杆菌作为活体生物治疗产品和生物传感器的工程化应用潜力 | 乳酸杆菌及其工程化改造产物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 基因工程, 包囊技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸杆菌 | 治疗递送系统（重组蛋白、疫苗、细胞因子、靶向酶、多肽），生物传感器（全细胞或无细胞平台检测病原体、毒素、临床生物标志物） | 医学, 食品安全, 环境监测, 诊断 |
| 504 | 2026-06-23 |
HySimODE: a hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
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研究论文 | 提出了HySimODE，一个用于生物系统多尺度模型的混合随机-确定性模拟框架 | 利用机器学习分类器自动将生化物种分配到随机或确定性状态，避免了手动指定区域和模型重构 | 标题和摘要未明确提及局限性 | 为基于常微分方程的生化模型提供自动化混合模拟方法，支持数据驱动的随机-确定性分区 | 涉及生化系统的混合模拟，包括合成生物学的宿主-电路相互作用模型和神经生物学的长期突触增强模型 | 计算生物学 | NA | 混合随机-确定性模拟、常微分方程求解、机器学习分类器 | 机器学习分类器、常微分方程求解器 | 生化常微分方程模型数据 | 多样化的生化常微分方程模型数据集，跨越多种动力学区域 | NA | NA | NA | 合成生物学、神经生物学 |
| 505 | 2026-06-23 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
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研究论文 | 提出通过逆转录和同源重组实现RNA模板化多样性生成的进化假说 | 首次系统提出逆转录酶介导的多样性生成机制，认为细胞或外源RNA通过逆转录和同源重组整合入基因组，从而利用模块化遗传信息偏向性地改变序列空间的探索分布 | 该机制目前仅为进化假说，缺乏直接实验证据支持，且逆转录活性的细胞调控频率尚不清楚 | 探讨RNA介导的多样性生成机制及其在基因组进化和遗传变异中的作用 | 多样性生成逆转录元件、逆转录转座子、端粒酶、体细胞高频突变等生物机制，以及转录假基因和重复序列 | 进化生物学 | NA | 逆转录、同源重组 | NA | NA | NA | AutoDiMe方法 | NA | NA | 医学 |
| 506 | 2026-06-23 |
Synthetic control of implanted engineered liver tissue growth
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz8362
PMID:41996502
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研究论文 | 提出一种通过合成生物学控制植入工程肝组织原位生长的策略，以解决组织工程移植物的尺寸限制问题 | 首次将合成生物学与组织工程结合，通过YAP和生长因子信号通路实现植入后肝组织的按需扩展 | 研究尚处于概念验证阶段，需进一步评估长期安全性和临床应用可行性 | 开发一种基因策略，通过合成生物学触发实现工程肝组织在体内外可控扩增，以生成大型器官植入物 | 工程化肝组织 | 合成生物学、组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具、组织工程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类细胞 | YAP与生长因子信号通路调控回路 | 医学 |
| 507 | 2026-06-23 |
Global reports on Glutamicibacter: a mini review
2026-Feb-28, Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France)
DOI:10.14715/cmb/2025.72.2.2
PMID:42322567
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综述 | 这篇综述全面整合了最新关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识 | 提供关于谷氨酸杆菌这一稀有放线菌群的综合当代视角，并指出通过基因组挖掘、代谢组学和合成生物学方法开展未来研究的方向 | 大多数物种中的生物合成基因簇尚未表征，植物-微生物和昆虫-微生物相互作用的机制了解有限，酶和代谢产物的工业开发受到限制 | 整合关于谷氨酸杆菌的分类、生态、形态、基因组和代谢知识，并识别未来研究前景 | 谷氨酸杆菌物种 | NA | NA | 16S rRNA测序, 系统基因组学, 基因组挖掘, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 生态数据 | NA | NA | 谷氨酸杆菌（Glutamicibacter） | NA | 食品安全, 农业, 生物修复, 治疗 |
| 508 | 2026-06-23 |
Bacteriophage therapy against multidrug resistant bacterial infections demonstrates clinical advances and engineering innovations between 2020-2026
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1865548
PMID:42326420
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综述 | 本文综述了2020至2026年间噬菌体疗法对抗多重耐药细菌感染的临床进展和工程创新 | 系统总结了噬菌体疗法的最新临床经验、基因工程进展（包括CRISPR系统）、组合疗法及合成噬菌体颗粒等创新技术 | 随机对照试验数据有限，监管标准、规模化生产和耐药管理仍面临挑战 | 评估噬菌体疗法作为多重耐药细菌感染治疗策略的潜力 | 多重耐药细菌感染的噬菌体疗法 | 机器学习 | 多重耐药细菌感染 | NA | NA | 文献 | NA | CRISPR-Cas系统 | 噬菌体 | 噬菌体递送的CRISPR抗菌剂、杂交递送平台、合成噬菌体颗粒 | 医学 |
| 509 | 2026-06-22 |
Deep learning on protein language model embeddings unlocks accurate prediction of protein solubility
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1716930
PMID:41953440
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研究论文 | 提出了一种基于蛋白质语言模型嵌入的深度学习模型DeepSolNet，用于准确预测蛋白质溶解度 | 利用先进的蛋白质语言模型ESM Cambrian结合双向长短期记忆网络、卷积神经网络和注意力机制的多模块架构，显著提升了溶解度预测性能 | 在独立测试集上的准确率仅为0.53，性能仍有提升空间 | 提高蛋白质溶解度的预测准确性，以促进合成生物学和蛋白质工程中的应用 | 蛋白质溶解度预测相关的序列数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, 注意力机制 | 序列 | 验证集和独立测试集包含γ-抗体、转谷氨酰胺酶和醛脱氢酶序列 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 510 | 2026-06-21 |
Efficient site-specific gene addition using R2 retrotransposons in tobacco and rice
2026-Jun-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03181-6
PMID:42321491
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研究论文 | 本文介绍了一种利用R2逆转录转座子在烟草和水稻中进行高效位点特异性基因添加的方法 | 首次在植物中重建非长末端重复R2逆转录转座子活性，实现无双链断裂的RNA模板化多位点基因整合，效率高达75% | 仅针对rDNA位点进行整合，可能存在位置效应，且转化效率在愈伤组织中最高仅为17% | 开发一种高效、精确的植物基因整合技术，用于作物改良和合成生物学 | 烟草（Nicotiana benthamiana）和水稻（Oryza sativa） | 合成生物学 | NA | R2逆转录转座子、重组RNA病毒介导的供体递送 | NA | NA | 烟草和水稻细胞及愈伤组织，具体数量未明确 | R2逆转录转座子 | 烟草（Nicotiana benthamiana），水稻（Oryza sativa） | 位点特异性基因整合系统（含R2逆转录转座酶和重组酶兼容着陆垫） | 农业, 合成生物学 |
| 511 | 2026-06-21 |
Recent advances in bioengineering and functional applications of microbial biocomposites: integrating bacterial cellulose, fungal mycelium and synthetic biology
2026-May-19, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-05021-w
PMID:42154349
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综述 | 该综述综合了2020-2026年微生物生物复合材料在制备、修饰及功能应用方面的最新进展，重点涉及细菌纤维素和真菌菌丝体 | 将微生物生物复合材料与合成生物学、3D打印和矿物功能化等新兴方法相结合，突出了跨学科协同创新的潜力 | 讨论了当前工业规模化、功能稳定性和批次间标准化方面的监管和技术挑战 | 为应用微生物学、材料科学和工业生物技术领域的研究人员和专业人士提供关键且全面的视角，强调微生物生物复合材料作为可持续性、功能创新和仿生设计交汇平台的潜力 | 微生物生物复合材料，重点包括细菌纤维素和真菌菌丝体 | 材料科学，应用微生物学 | NA | 3D打印，合成生物学，矿物功能化 | NA | NA | NA | NA | Komagataeibacter spp., Ganoderma spp. | NA | 医药，环境，工业生物技术 |
| 512 | 2026-06-20 |
Bacterial mRNA Vaccines: Programming Immunity Against Antimicrobial Resistance
2026-Aug, Drug development research
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/ddr.70335
PMID:42318873
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综述 | 这篇综述概述了细菌mRNA疫苗在应对抗菌药物耐药性方面的最新进展，包括抗原设计、mRNA工程和递送平台优化 | 整合了人工智能引导的抗原发现、合成生物学和下一代递送系统以加速临床转化，强调克服现有障碍以建立mRNA疫苗作为对抗耐药感染的可行策略 | 细菌抗原结构的复杂性、实现有效黏膜和细胞递送的挑战、诱导平衡Th1/Th17主导免疫反应的困难以及免疫持久性问题 | 应对抗菌药物耐药性威胁，开发细菌mRNA疫苗 | 结核分枝杆菌、铜绿假单胞菌、肺炎链球菌等关键细菌病原体 | 合成生物学， 疫苗学 | 细菌感染性疾病， 抗菌药物耐药性 | mRNA工程， 脂质纳米颗粒递送， 人工智能引导的抗原发现， 合成生物学 | NA | NA | NA | 脂质纳米颗粒， 人工智能， 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 513 | 2026-06-20 |
Repurposing the Diatom Periplastidial Compartment for Heterologous Terpenoid Production
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00919
PMID:42101919
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研究论文 | 通过系统分析硅藻中不同细胞区室的萜类合成能力，提出周质体腔（PPC）作为可工程化的细胞内空间用于异源萜类生产 | 首次系统评估硅藻周质体腔（PPC）作为工程化细胞区室的萜类合成潜力，揭示其与MVA和MEP途径的代谢交换界面 | 未提及大规模生产或工业应用验证，需进一步优化工程策略 | 探索硅藻周质体腔（PPC）用于异源萜类生产的可行性与工程化潜力 | 硅藻周质体腔（PPC）、细胞质、叶绿体中的萜类合酶靶向表达 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢物定量数据 | 未明确样本数量 | NA | 硅藻 | 萜类合成代谢途径（包括半萜、单萜、倍半萜和四萜的合酶靶向表达） | 工业生物技术 |
| 514 | 2026-06-20 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00171
PMID:42112575
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research paper | 提出了一种用于评估合成基因电路性能的线性混合效应模型 | 首次应用线性混合效应模型来统计评估布尔逻辑门性能，并提供可量化的固定效应点估计β̂作为门行为的统一描述符 | 对多输入多输出逻辑的扩展验证尚需更多实验数据支撑 | 标准化合成基因电路统计评估方法 | 合成基因电路中的布尔逻辑门 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型, 蒙特卡洛模拟, k-means聚类 | 线性混合效应模型, k-means | 模拟数据与实验数据 | 144个已发表布尔逻辑门 | NA | NA | 布尔逻辑门（OR、AND等） | 合成生物学应用（计算、生物传感、人类健康） |
| 515 | 2026-06-20 |
Temporal Programming of Cell-Free Transcription Using Orthogonal Enzyme-Responsive DNA Blockers
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00147
PMID:42137991
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研究论文 | 设计正交的酶驱动DNA转录定时器，实现无细胞转录的时间延迟精确编程 | 利用正交酶响应性DNA阻断链，通过选择性酶切实现多个转录模板的独立时间控制，并展示下游Cas12a活性的时序调控 | 未明确提及，但可能涉及阻断链设计与酶特异性的进一步优化 | 建立无细胞合成生物学中时间分辨转录和基因表达的通用框架 | 正交酶响应性DNA阻断链、RNase H、尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)和甲酰胺嘧啶DNA糖基化酶(Fpg)等酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录、酶切动力学调控 | NA | 转录时间曲线数据 | NA | DNA阻断链设计、酶驱动定时器 | 无细胞系统 | 基于DNA阻断链的转录定时器、Cas12a酶切活性调控回路 | 合成生物学、生物技术 |
| 516 | 2026-06-20 |
Streptomyces Autoregulator Biosensors from Natural Product Cluster-Situated Regulators
2026-Jun-19, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.6c00061
PMID:42117380
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研究论文 | 开发了八种基于簇定位调节因子的自诱导物生物传感器，并探索其在合成生物学中的应用 | 首次将多个预测的群体感应自诱导物回路工程化为可诱导表达系统，并验证了生物传感器间的正交性和共培养能力 | 未提及 | 开发基于链霉菌自诱导物的生物传感器，用于天然产物调控机制研究和合成生物学应用 | 链霉菌中的簇定位调节因子及其自诱导物配体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 八种生物传感器，多种配体浓度测试 | NA | 链霉菌属 | 群体感应调控回路、正交信号系统、多输入遗传电路 | 工业生物技术 |
| 517 | 2026-06-20 |
Bottom-Up Creation of Virus-like Particles via Post-Insertion of Protein-Lipid Conjugates
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00172
PMID:42160665
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研究论文 | 提出一种通过后插入蛋白-脂质偶联物自下而上构建病毒样颗粒的方法 | 创新性地利用SNAP-tag/BG生物正交反应将蛋白质共价偶联到脂质上，实现无需去垢剂的脂质体膜插入，解耦了蛋白质设计与脂质体设计，便于快速系统优化VLP | 未提及具体限制，但可能涉及蛋白质-脂质偶联效率、颗粒稳定性及体内应用时的免疫原性问题 | 开发一种模块化、可优化的病毒样颗粒构建策略，用于疫苗、药物递送和合成生物学应用 | GFP蛋白和SARS-CoV-2 Spike蛋白 | 合成生物学 | 新型冠状病毒病 | SNAP-tag/BG反应、流式细胞术、负染色透射电子显微镜、酶联免疫吸附测定 | NA | 图像（电子显微镜）、荧光信号（流式细胞术） | 研究所用样本包括GFP蛋白和Spike蛋白修饰的脂质体，具体数量未提及 | SNAP-tag/BG反应 | Expi293F细胞 | 蛋白-脂质偶联物构建及后插入脂质体形成病毒样颗粒 | 医学, 合成生物学 |
| 518 | 2026-06-20 |
Systematic Reprogramming of Rhodobacter sphaeroides for Efficient Biosynthesis of Coenzyme Q10 and Porphyrins
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00032
PMID:42186703
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综述 | 系统综述了通过代谢工程和合成生物学方法改造光合细菌Rhodobacter sphaeroides以高效合成辅酶Q10和卟啉类化合物的研究进展 | 首次全面总结了利用Rhodobacter sphaeroides作为底盘生物生产辅酶Q10和卟啉的工程策略，包括前体供应增强、代谢路径优化、氧化还原和能量平衡调控、全局调控系统操纵及发酵控制 | 未提及具体实验数据或定量比较不同工程策略的效果，主要基于文献综述 | 梳理Rhodobacter sphaeroides的代谢特性、天然调控网络和工程方法，突出其作为合成生物学底盘生产辅酶Q10和卟啉类化合物的潜力 | Rhodobacter sphaeroides紫色非硫光合细菌 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Rhodobacter sphaeroides | 萜类和四吡咯生物合成途径的优化 | 工业生物技术, 医药 |
| 519 | 2026-06-20 |
Diterpene Synthases as Gatekeepers of Bioactive Diterpenoids: A Resource for Discovery and Engineering toward Efficient Synthesis
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00190
PMID:42215860
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综述 | 该文章综述了二萜合酶在生物活性二萜类化合物合成中的关键作用，并建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的数据库，为通过合成生物学和代谢工程高效生产二萜类化合物提供了资源 | 首次建立了一个包含562个功能表征二萜合酶的综合性功能数据库，并通过整合生物信息学分析阐明了不同功能类别二萜合酶的催化机制、产物多样性及系统发育分布，为二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的开发提供了新方向 | 未提及具体局限性，但可能包括数据库的更新频率、部分二萜合酶功能验证的局限性以及实际工业生产中面临的产量和纯度挑战 | 总结代表性二萜类化合物的生物活性和应用，建立功能二萜合酶数据库，并探讨二萜合酶作为合成生物学核心功能元件的未来发展方向 | 二萜合酶和二萜类化合物 | 机器学习和数字病理学之外的合成生物学与代谢工程领域 | 不适用 | 合成生物学、代谢工程、生物信息学分析 | 不适用 | 序列和功能数据（562个功能表征的二萜合酶） | 562个功能表征的二萜合酶 | 不适用 | 微生物细胞工厂（具体未指定，如大肠杆菌、酿酒酵母等） | 二萜类化合物生物合成途径 | 医药、农业、化妆品、食品 |
| 520 | 2026-06-20 |
Evaluating DNA Function Understanding in Genomic Language Models Using Evolutionarily Implausible Sequences
2026-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00024
PMID:42260904
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研究论文 | 提出Nullsettes评估框架，测试基因组语言模型对合成表达盒中功能丧失突变的预测能力 | 通过进化上不可信的序列设计，区分模型对序列功能的理解与对天然基因组模式的记忆 | 未能检测到强功能丧失突变，预测准确性严重依赖进化模式匹配而非基因表达机制理解 | 评估基因组语言模型对DNA序列功能的理解程度 | 合成表达盒中的功能丧失突变序列 | 机器学习 | NA | 基因组语言模型 | Transformer | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |