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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-05-16 |
Probiotics and the Human Microbiome: Classical Functions, Emerging Systemic Roles, and Future Therapeutic Frontiers
2026-Apr-23, Biology
DOI:10.3390/biology15090665
PMID:42117804
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综述 | 系统综合益生菌在维持肠道稳态、免疫调节、感染预防等经典功能及肠脑轴、肠皮轴等新兴系统作用方面的证据 | 采用系统级框架关联益生菌作用与共享机制(如微生物代谢物信号、病原体竞争排斥、屏障强化及免疫神经内分泌调节),并整合翻译进展(靶向递送平台、工程化菌株、后生元策略)及未来方向(精准微生物组干预、合成生物学、AI辅助多组学分析) | 未提及具体研究的样本量或实验验证,且作为综述依赖现有文献证据,可能忽略特定菌株或宿主环境的异质性 | 系统综述益生菌的经典功能与新兴系统作用,并提出未来治疗前沿方向 | 益生菌与人体微生物组互作网络 | 微生物组学 | NA | NA | NA | 文献证据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 522 | 2026-05-16 |
Enzymatic and microbial routes to bioplastics: The green chemistry frontier of biopolymers
2026-Apr, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70241
PMID:41891232
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综述 | 全面综述微生物和酶法在聚羟基脂肪酸酯生物塑料生产中的代谢途径、结构特性及技术创新 | 整合生化、结构与生物加工见解,强调工程酶和无细胞系统在生物塑料可扩展、可定制生产中的应用 | 未讨论具体技术经济挑战和监管框架的详细解决方案 | 为酶法生物塑料作为可循环生物经济中的可持续替代品提供战略方向 | 聚羟基脂肪酸酯类生物塑料及其微生物和酶法合成路径 | 合成生物学 | NA | PHA合成酶、无细胞代谢工程、酶固定化、表面展示 | NA | 综述性文献 | NA | NA | 细菌 | 聚羟基脂肪酸酯生物合成途径、体外酶促聚合系统 | 环境、工业生物技术 |
| 523 | 2026-05-16 |
Jumping Over Hurdles: Challenges and Solutions in Phage Therapy
2026-Mar, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251409584
PMID:42130959
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综述 | 综述了噬菌体疗法在应对抗生素耐药性中的潜力、现有进展及面临挑战 | 总结了基因组学、合成生物学和CRISPR技术对噬菌体工程的推动作用,以及个性化噬菌体疗法基于微生物组特征的应用前景 | 存在监管障碍、安全性问题及噬菌体耐药性出现等挑战,且缺乏标准化临床试验验证疗效 | 评估噬菌体疗法作为抗生素替代方案的现状、进展与未来发展路径 | 噬菌体及其在抗感染治疗中的应用 | NA | 慢性多药耐药感染 | CRISPR相关蛋白9、合成生物学、基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 工程化噬菌体(广宿主范围、改良安全性)、噬菌体文库 | 医学 |
| 524 | 2026-05-16 |
Achieving bottom-up ethical, legal, and societal implications and responsible research and innovation in the synthetic biology research community from the Japanese context
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1716198
PMID:41923881
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研究论文 | 本文探讨日本合成生物学研究社区中实现自下而上的伦理、法律及社会影响与负责任研究与创新的途径 | 强调学术界缺乏自下而上的ELSI措施,提出三项关键行动领域以推动生物制造和合成生物学领域的负责任创新 | NA | 从日本背景出发,探讨如何在合成生物学研究社区中加强自下而上的伦理、法律及社会影响与负责任研究与创新 | 日本合成生物学研究社区的伦理、法律及社会影响与负责任研究创新实践 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 政策 |
| 525 | 2026-05-16 |
Synthetic immunomodulators: Revolutionizing immunotherapy
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2026.02.002
PMID:42134885
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综述 | 本文综述了合成免疫调节剂在免疫治疗中的应用,重点介绍其通过化学、合成生物学和纳米技术实现更精准免疫调控的策略 | 系统分类了合成免疫调节剂(小分子、合成肽、细胞因子模拟物、核酸类调节剂和合成检查点调节剂),并强调其在时空和细胞类型精度上的优势 | 临床转化面临递送和生物分布、过度激活导致的毒性上限以及生物标志物指导的患者选择和测序需求等瓶颈 | 探讨合成免疫调节剂如何通过精密调控免疫活动来改善肿瘤、自身免疫和慢性炎症疾病的治疗效果 | 合成免疫调节剂的各种类型(小分子、合成肽、细胞因子模拟物等)及其在免疫治疗中的应用 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 526 | 2026-05-16 |
A new era of natural killer cell immunotherapy in tumor treatment: latest advances and cutting-edge perspectives from basic research to clinical practice
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1795143
PMID:42136666
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综述 | 系统综述自然杀伤细胞免疫疗法在肿瘤治疗中的最新进展,从基础研究到临床实践的多维度分析 | 综合分析了CAR-NK细胞疗法、双特异性/三特异性抗体招募策略、ADCC增强技术及CIML-NK细胞等多种增强策略,并聚焦实体瘤治疗中的核心挑战与协同策略 | NK细胞疗法在实体瘤中存在肿瘤浸润不足、肿瘤微环境强抑制及持久性有限的瓶颈,且临床转化仍需克服诸多障碍 | 为NK细胞疗法从实验室到广泛临床应用提供全面且具有前瞻性的参考 | 自然杀伤细胞及其在肿瘤治疗中的应用 | 数字病理学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 527 | 2026-05-16 |
Engineering glowing plants: recent progress and future directions for application-oriented design
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1819614
PMID:42137625
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综述论文 | 综述了发光植物工程的最新进展,强调从底物依赖型报告系统向自发光系统的转变,并探讨了应用导向的设计方向 | 首次系统总结了真菌生物发光途径在高等植物中的重建,提出了与非转基因纳米材料发光策略的比较,并强调了向观赏园艺、艺术装置和环境传感等实际应用的扩展 | 包括代谢负担、发育和环境条件下的稳定性差异,以及生态和监管约束 | 总结发光植物工程的最新进展,突出早期与当前系统在应用准备方面的差异,并概述未来应用导向研究的关键挑战和方向 | 发光植物(高等植物) | 合成生物学 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 高等植物 | 真菌生物发光途径重建 | 观赏园艺,教育,艺术,环境传感 |
| 528 | 2026-05-15 |
Structure-function relationships and industrial integration of extremophilic xylanases for sustainable xylo-oligosaccharide production
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134751
PMID:42067162
|
综述 | 系统总结了利用蛋白质工程和合成生物学策略工程化改造极端微生物木聚糖酶,以实现从木质纤维素生物质中可持续生产低聚木糖的研究进展 | 全面分析了极端微生物木聚糖酶在不同严苛条件下的结构适应性(如离子对网络、疏水核心和表面静电)及其在工业整合中的技术经济与生命周期评估 | 未来仍需进一步努力增强极端微生物木聚糖酶的商业化应用以实现可持续生物加工 | 探索极端微生物木聚糖酶的结构功能关系及其工业整合,以实现可持续的低聚木糖生产 | 极端微生物木聚糖酶(来源于嗜热、嗜盐、嗜酸/嗜碱微生物)及其在低聚木糖生产中的应用 | NA | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 | 嗜热微生物, 嗜盐微生物, 嗜酸/嗜碱微生物 | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 529 | 2026-05-15 |
Base modifications shift tertiary structure and activity in synthetic RNA origami and a natural ribozyme
2026-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72891-x
PMID:42128887
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研究论文 | 研究碱基修饰对合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶的三级结构折叠及功能的影响 | 首次揭示5-甲基胞嘧啶和N1-甲基假尿苷等碱基修饰通过影响碱基堆积能量而非碱基配对,改变RNA折叠景观和结构-功能关系,对合成生物学和治疗用RNA设计具有指导意义 | 未探讨其他碱基修饰类型或更高阶结构对RNA折叠的影响,且实验温度依赖性机制尚需进一步验证 | 阐明碱基修饰对RNA三级结构折叠和功能的影响机制 | 合成RNA折纸纳米结构和天然四膜虫核酶 | 合成生物学,结构生物学 | NA | 低温电子显微镜(cryo-EM),荧光共振能量转移(FRET),生化分析 | NA | 图像,荧光数据,生化数据 | NA | NA | NA | NA | 医学,合成生物学 |
| 530 | 2026-05-15 |
Recombinant Protein Drugs: A 2025 Update
2026-May-13, BioDrugs : clinical immunotherapeutics, biopharmaceuticals and gene therapy
IF:5.4Q1
DOI:10.1007/s40259-026-00783-z
PMID:42129013
|
综述 | 本文对2025年重组蛋白药物领域进行综述,整合了生产平台、蛋白质工程和监管科学的进展 | 强调蛋白质从替代疗法向多功能治疗平台的转变,涵盖下一代蛋白格式如双特异性抗体、纳米抗体和自组装生物材料 | 未提及具体临床失败案例或新兴技术的潜在风险 | 更新重组蛋白药物的现状,并概述塑造下一代生物制剂的技术 | 重组蛋白药物及其生产平台、工程策略和监管框架 | 机器学习 | 肿瘤、炎症、代谢性疾病 | 重组蛋白生产 | NA | 文本 | NA | NA | 微生物菌株、哺乳动物细胞、植物平台 | 双特异性抗体、纳米抗体、融合蛋白、自组装生物材料 | 医学 |
| 531 | 2026-05-15 |
Reset-free DNA logic circuits for real-time input processing and memory
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb1699
PMID:41921006
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研究论文 | 提出一种基于立足点介导链反应的无复位DNA逻辑电路,用于实时输入处理和记忆存储 | 首次实现无需复位操作的DNA逻辑电路,通过连续可逆链迁移机制支持实时数据处理和记忆功能,并基于DNA折纸平台构建多种组合逻辑门和记忆元件 | NA | 开发无复位DNA逻辑电路,实现实时输入处理和记忆功能 | DNA逻辑电路元件(逻辑门、触发器、寄存器) | 合成生物学 | NA | 立足点介导链反应(TCR)、DNA折纸 | NA | NA | NA | NA | NA | 组合逻辑门(AND、OR)、置位复位触发器、数据锁存器、级联寄存器 | 生物传感、诊断、合成生物学 |
| 532 | 2026-05-15 |
Functional organization and regulatory logic of the ped gene cluster in Pseudomonas species
2026-03-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00046-26
PMID:41705821
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综述 | 综述了假单胞菌属中ped基因簇的功能组织与调控逻辑 | 首次系统整合假单胞菌属中ped基因簇的遗传组织、酶学功能和多层调控机制,并比较了不同物种间的进化保守性与适应性差异 | 未涉及实验验证,主要基于现有文献的总结与分析 | 建立ped基因簇作为模块化平台在应用微生物学中的参考框架 | 假单胞菌属中的ped基因簇及其编码的PQQ依赖性脱氢酶 | 合成生物学, 环境微生物学 | NA | 比较基因组学, 信号转导网络分析 | NA | 基因序列, 调控元件 | NA | NA | 假单胞菌属(KT2440和PAO1) | 基于PQQ依赖性脱氢酶的氧化途径,包含调节组件(如Fe依赖的YiaY脱氢酶和PP_2683组氨酸激酶) | 合成生物学, 环境修复, 生物生产 |
| 533 | 2026-05-15 |
Expanding the genetic code: phage-driven evolution of pyrrolysyl-synthetase for site-specific incorporation of synthetic phenylalanine and tyrosine derivatives
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1737987
PMID:41924351
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研究论文 | 本研究利用噬菌体辅助非连续进化技术对吡咯赖氨酰-tRNA合成酶进行定向进化,以增强其对苯丙氨酸和酪氨酸衍生物等非经典氨基酸的识别与掺入能力 | 首次将噬菌体辅助非连续进化应用于PylRS工程化,高效获得了底物特异性显著增强的突变体,并揭示了底物结合口袋的关键突变区域 | 未对进化后变体的体内蛋白质表达效率进行全面评估,也未探讨其在复杂细胞环境中的长期稳定性 | 拓展PylRS底物谱,实现酪氨酸和苯丙氨酸衍生物在蛋白质中的位点特异性掺入 | 来源于Methanosarcina mazei的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶及其突变体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体辅助非连续进化, 荧光掺入检测, 质谱分析 | NA | 测序数据, 荧光定量数据 | 未明确样品数量,涉及PylRS突变文库及多个进化变体 | PANCE | 噬菌体 | NA | 合成生物学 |
| 534 | 2026-05-12 |
Epigenome regulators imbue a single eukaryotic promoter with diverse gene expression dynamics
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115805
PMID:42111206
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研究论文 | 通过筛选80种染色质相关蛋白,研究单个真核启动子如何产生多样的基因表达动态 | 首次揭示单个基因可驱动丰富多样的动态表达谱,并建立了三状态启动子动力学模型 | 研究仅在酵母中进行,可能无法直接推广到其他真核生物 | 探索单个真核启动子产生多样基因表达动态的机制 | 酿酒酵母中的染色质相关蛋白 | 机器学习 | NA | 活细胞显微成像 | 动力学模型 | 图像, 时间序列数据 | 80种染色质相关蛋白在单细胞水平进行分析 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学 |
| 535 | 2026-05-12 |
Synthesis of Amines for Active Pharmaceutical Ingredients Using the Whole-Cell Factory Saccharomyces Cerevisae
2026-May-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500898
PMID:42107106
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综述 | 该综述总结了利用全细胞工厂酿酒酵母合成活性药物成分中胺类化合物的最新进展 | 系统总结了代谢工程和基因工程策略,包括基因组编辑、基因表达优化和代谢通路平衡,以克服酶基因表达、辅因子再生和前体通道化等瓶颈 | 当前挑战包括系统生物学和合成生物学工具的整合,以实现酿酒酵母作为工业胺生产可扩展平台的目标 | 回顾酿酒酵母在胺类生物催化中的工程化策略,并展望其工业应用前景 | 酿酒酵母工程菌株及其合成的胺类、氨基醇、氨基酸和复杂生物碱化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 基因工程, 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母 | 代谢通路 | 医药, 工业生物技术 |
| 536 | 2026-05-12 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-May-08, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.05.004
PMID:42107704
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研究论文 | 本研究在古老红藻 Cyanidioschyzon merolae 中验证了基因组位置不影响转基因表达效率 | 首次在 C. merolae 中建立并验证了一组中性整合位点,证明基因组位置对转基因表达影响极小,并开发了高通量转化协议 | 未提及明显的局限性 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响,并为 C. merolae 开发可扩展的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae(古老红藻) | 合成生物学 | NA | 同源重组、机器人辅助转化、生物信息学分析、气相色谱分析 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | 40个候选中性位点(分布于16条染色体),其中38个通过转化验证 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae | 异源异戊二烯合酶表达通路 | 工业生物技术 |
| 537 | 2026-05-12 |
Advances in anthocyanins: Chemical foundations, synthetic biology, molecular mechanisms, physicochemical properties, and applications in the food industry
2026-May, Food chemistry: X
DOI:10.1016/j.fochx.2026.103938
PMID:42111325
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综述 | 综述花青素从化学合成到食品工业应用的最新进展,重点关注结构修饰、生物合成机制和食品化学挑战 | 整合了化学、合成生物学、机制研究和应用领域知识,强调AI辅助设计和高通量工程在解决生产效率和稳定性瓶颈中的作用 | 研究在化学、合成、机制和应用领域仍然分散,阻碍了功能性食品、智能材料和个性化健康的整合发展 | 总结花青素化学、生物合成、健康机制和工业应用,特别关注食品相关限制如pH驱动降解、抗坏血酸诱导氧化还原反应和蛋白质-多酚相互作用 | 花青素的结构工程、合成生物学生产和食品配方挑战 | 数字病理学 | NA | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 538 | 2026-05-12 |
Leveraging pre-trained AI models for robust promoter sequence design in synthetic biology
2026-Apr-30, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240033
PMID:42109830
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研究论文 | 利用预训练AI模型实现合成生物学中稳健启动子序列的设计 | 首次将预训练模型概念应用于启动子序列分析,通过创新的预训练与微调范式,结合基础突变模型,实现高效筛选高表达且抗突变的启动子 | 依赖预训练模型(如DNABERT)的性能,可能受限于训练数据质量和模型泛化能力 | 探索预训练AI模型在合成生物学启动子设计中的应用,减少对传统实验方法的依赖 | 酵母启动子序列及其表达水平 | 机器学习 | NA | DNABERT预训练模型,基础突变模拟 | DNABERT, Pymaker | 序列数据 | 多种数据集规模下的启动子样本 | NA | 酿酒酵母 | NA | 生物制药 |
| 539 | 2026-05-12 |
Rhodo-Box: A Synthetic Biology Toolbox to Facilitate Metabolic Engineering of Rhodobacter sphaeroides
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00808
PMID:41832780
|
研究论文 | 介绍了一种针对荚膜红细菌的合成生物学工具箱Rhodo-Box,旨在促进其代谢工程改造 | 通过适应和扩展Zymo-Parts模块化克隆框架,开发了首个针对荚膜红细菌的标准化基因元件工具集,包括多种复制起点、启动子、诱导系统、核糖体结合位点和转录终止子,并引入了半自动化的克隆方法 | 未对工具在复杂代谢途径中的应用效果进行验证,也未评估长期稳定性 | 开发标准化遗传工具以推进荚膜红细菌在可持续生物制造中的应用 | 荚膜红细菌及其遗传元件 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆框架、半自动化克隆方法 | NA | NA | NA | Zymo-Parts模块化克隆框架 | 荚膜红细菌 | 基因表达调控线路(启动子、RBS、终止子等) | 工业生物技术 |
| 540 | 2026-05-12 |
Vacuum and Sonication Treatment Enable Efficient Transient Gene Expression in Various Monocot and Eudicot Plant Seedlings
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00855
PMID:41865287
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研究论文 | 介绍VAST(真空与超声辅助瞬时转化)方法,显著增强单子叶和双子叶植物幼苗的基因表达效率与通用性 | 通过系统优化植物生长条件并结合真空渗透和超声预处理,在减少组织损伤的同时大幅提升瞬时基因表达效率,成功转化番茄、谷子、柳枝稷、玉米和小麦等多种重要作物 | 未明确说明,但可能需进一步验证在大规模或更复杂植物体系中的适用性及长期效果 | 开发高效、通用且简单的植物瞬时转化方法,以支持功能基因组学、合成生物学和生物技术研究 | 多种单子叶与双子叶植物幼苗(如拟南芥、番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等) | 分子生物学 | NA | 真空渗透与超声处理辅助的瞬时转化 | NA | 基因表达数据 | 多种植物幼苗样本,具体数量未明确说明 | NA | 植物(番茄、谷子、柳枝稷、玉米、小麦等) | 硝酸盐响应基因表达分析(跨物种比较) | 农业、生物技术 |