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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-12-03 |
Revolutionizing recombinant protein production in prokaryotic platforms - Methodologies and advances
2026-Feb, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2025.110778
PMID:41207077
|
综述 | 本文综述了原核系统中重组蛋白生产的传统和新兴策略,包括遗传工程和合成生物学的最新进展 | 强调了新兴策略如改进的表达载体、工程化宿主、高通量筛选平台,以及融合标签、密码子偏好消除、启动子和RBS工程、伴侣蛋白辅助折叠等优化方法 | NA | 优化重组蛋白在原核系统中的表达,以满足各领域日益增长的需求 | 重组蛋白在原核平台的生产 | NA | NA | 遗传工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌等原核生物 | 生物传感器、代谢途径 | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 542 | 2025-12-03 |
Microplastics and microbial interactions in marine environments: A critical review on biogeochemical cycling and ecological impacts
2026-Jan, Marine pollution bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.marpolbul.2025.118891
PMID:41166776
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综述 | 本文通过文献计量分析和机制综述,系统探讨了海洋环境中微塑料与微生物之间的双向相互作用及其对生物地球化学循环和生态的影响 | 整合了文献计量分析(2015-2025)与机制综述,系统性地阐述了微塑料与微生物的双向相互作用及其对海洋生物地球化学循环的级联效应 | 在将分子水平机制与生态系统尺度结果(尤其是在深海和沉积物生境中)联系起来方面仍存在关键空白 | 研究海洋微塑料污染及其与微生物的相互作用对生物地球化学循环和生态系统的影响 | 海洋环境中的微塑料和微生物 | NA | NA | 文献计量分析,多组学技术,沉积物微生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 543 | 2025-11-22 |
Virus-like particles as versatile scaffolds for nanobiosensors and nanoreactors: Design, applications, and future perspectives
2026-Feb-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118156
PMID:41172906
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综述 | 系统探讨病毒样颗粒作为纳米支架在纳米生物传感器和纳米反应器中的设计、应用及未来发展方向 | 提出将人工智能、先进材料和刺激响应设计整合以开发下一代智能纳米器件 | 在可扩展性、功能精确性和体内兼容性方面仍存在挑战 | 研究病毒样颗粒在纳米生物传感器和纳米反应器中的应用潜力 | 病毒样颗粒的结构与理化特性 | NA | NA | 光学传感(荧光、化学发光、表面等离子共振)、电化学传感(伏安法、电位法、阻抗法)、场效应系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶途径空间组织、级联反应 | 医学诊断、治疗、可持续催化、生物催化、合成生物学 |
| 544 | 2025-11-21 |
Engineering heterologous core promoters to optimize the SES expression system for Pichia pastoris
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.10.005
PMID:41245009
|
研究论文 | 通过工程化异源核心启动子优化毕赤酵母SES表达系统 | 首次从解脂耶氏酵母中筛选214个候选启动子,成功构建41个性能提升达5.4倍的SES系统,并结合CRISPR/Cas9多拷贝整合策略 | 未在更广泛的工业应用场景中验证系统稳定性 | 优化毕赤酵母合成表达系统(SES)的转录调控能力 | 毕赤酵母表达系统及其异源核心启动子 | 合成生物学 | NA | RNA-seq, CRISPR/Cas9, 荧光筛选 | NA | 基因表达数据, 荧光强度数据 | 214个合成启动子,54个功能验证,41个性能提升系统 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 毕赤酵母 | 合成表达系统(SES), 核心启动子工程 | 工业生物技术, 医药 |
| 545 | 2025-11-21 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
|
综述 | 本文综述了基因表达与蛋白质丰度之间关系的研究进展,重点关注不同实验环境和细胞背景下两者的关联性 | 系统分类和比较了基于不同相关性度量方法的研究,并整合了单细胞分析等最新技术进展 | 主要依赖相关性分析,对因果关系的解释有限 | 探讨基因表达与蛋白质丰度之间的关联程度及其在生物技术中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的关系研究 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、代谢工程、合成生物学 |
| 546 | 2025-11-21 |
Synthetic biology for scalable production of medical polyhydroxyalkanoates: Advances and applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108722
PMID:41046988
|
综述 | 本文综述了合成生物学在医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产中的进展与应用 | 系统整合了CRISPR/Cas基因组编辑、启动子工程、核糖体结合位点优化等合成生物学技术,并引入嗜盐菌下一代工业生物技术提升生产经济性 | 未提供具体实验数据验证技术改进效果,主要基于现有研究进展的总结分析 | 探讨合成生物学技术促进医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产的进展与前景 | 聚羟基脂肪酸酯及其生产工艺 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, 启动子工程, 核糖体结合位点优化, 代谢通路优化, 形态工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 547 | 2025-11-18 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
|
研究论文 | 本研究在热纤维梭菌中开发了一种热稳定的L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在热纤维梭菌中构建了具有175倍诱导动态范围和可忽略背景表达的热稳定L-阿拉伯糖诱导系统 | 未在其他梭菌属微生物中进行广泛验证 | 开发适用于热纤维梭菌的热稳定诱导表达系统 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | 合成生物学 | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | L-阿拉伯糖诱导系统,包含来自嗜热脂肪地芽孢杆菌T-6的诱导型启动子P和阻遏蛋白AraR | 工业生物技术, 能源 |
| 548 | 2025-11-18 |
Edible fungus Fusarium venenatum: advances, challenges, and engineering strategies for future food production
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.009
PMID:41015229
|
综述 | 系统总结食用真菌Fusarium venenatum在合成生物学工具开发、底盘工程及应用方面的最新进展,探讨未来食品生物制造的挑战与发展策略 | 首次针对Fusarium venenatum菌株的系统性综述,填补了该领域在合成生物学工具开发和底盘工程应用方面的综述空白 | NA | 为基于Fusarium venenatum的未来食品生产系统开发提供思路和指导 | 食用丝状真菌Fusarium venenatum | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | Fusarium venenatum | NA | 食品, 农业 |
| 549 | 2025-11-16 |
Integrated base editing and microfluidics boost microbial lipid production from lignin
2026-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133441
PMID:41045995
|
研究论文 | 本研究通过整合碱基编辑和微流控技术,开发了一种提升真菌利用木质素生产微生物油脂的方法 | 建立了铜诱导的MCM5-AID碱基编辑器实现全基因组C-to-T/G-to-A诱变,并结合微流控技术进行超高通量筛选 | NA | 提升微生物利用木质素生产油脂的能力 | 弯曲孢子菌Curvularia clavata J1 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑, 微流控技术, 转录组学, 基因组测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | 碱基编辑 | 弯曲孢子菌 | 铜诱导的MCM5-AID碱基编辑系统 | 能源, 工业生物技术 |
| 550 | 2025-11-16 |
Efficient biosynthesis of retinal from Escherichia coli by metabolic engineering
2026-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133501
PMID:41093029
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程改造大肠杆菌,实现了从生物资源高效合成视网膜的目标 | 采用系统与合成生物学方法构建高效视网膜生物合成细胞工厂,整合酶工程、翻译工程、膜工程和中心碳代谢重构等多层次工程策略 | 膜工程和NADPH再生的尝试未能提高视网膜产量 | 开发高效的视网膜生物合成方法 | 大肠杆菌BL21(DE3)工程菌株 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、酶工程、定向进化、RBS优化、膜工程 | NA | NA | 4-L生物反应器规模 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 甲羟戊酸途径代谢工程、中心碳代谢重构、β-胡萝卜素合成途径、视网膜生物合成途径 | 医药, 工业生物技术 |
| 551 | 2025-11-14 |
Harnessing synthetic biology for tetraterpenoid astaxanthin production: Recent advances and challenges
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.005
PMID:41208949
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学技术生产四萜类虾青素的最新进展与挑战 | 提出从'点'(关键酶活性调控)、'线'(途径空间协调)和'面'(系统代谢平衡)三个维度系统分析合成生物学在虾青素生产中的应用 | 未涉及具体实验验证,主要基于文献综述分析 | 探讨利用合成生物学技术实现虾青素可持续生产的策略 | 虾青素及其微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、代谢重编程 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物细胞 | 代谢途径工程、人工细胞工厂 | 医药、营养补充剂 |
| 552 | 2025-11-14 |
CRISPR-based synthetic biology toolkit development in Candida viswanthii and functional analysis of the stress responsive Ena1-like protein
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.09.021
PMID:41208948
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研究论文 | 本研究开发了针对维斯瓦尼假丝酵母的CRISPR合成生物学工具包,并分析了应激响应蛋白g144的功能 | 结合CRISPR/Cas9和Cre/loxP系统建立了高效基因组编辑策略,实现100%编辑效率并在6天内完成快速迭代编辑 | NA | 开发维斯瓦尼假丝酵母的合成生物学操作工具并研究应激响应蛋白功能 | 维斯瓦尼假丝酵母工业菌株及其Ena1-like蛋白g144 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Cre/loxP, 基因组编辑 | NA | 基因组数据, 表型数据 | NA | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | Candida viswanthii | 多重编辑和多拷贝基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 553 | 2025-11-02 |
A highly biosimilar synthetic Calculus Bovis enhances cerebral blood flow and provides neuroprotection against ischemic stroke
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120602
PMID:40945882
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研究论文 | 本研究评估了高度生物相似性合成牛黄在缺血性脑卒中中的神经保护作用及改善脑血流的效果 | 首次通过合成生物学方法制备高度生物相似性合成牛黄,并证实其在缺血性脑卒中治疗中的有效性和作用机制 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠模型,未涉及其他物种或性别差异研究 | 评估合成牛黄对缺血性脑损伤的治疗效果及改善脑血流的作用 | 雄性C57BL/6J小鼠的缺血性脑卒中模型 | 生物医学工程 | 缺血性脑卒中 | 色谱指纹图谱分析、Fluoro-Jade B染色、尼氏染色、激光散斑对比成像 | NA | 生物化学数据、组织学图像、血流动力学数据 | 使用不同剂量合成牛黄处理的tMCAO模型小鼠 | 合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 554 | 2025-10-30 |
An efficient CRISPR-Cas12a tool for iterative genome editing, streamlined minimization, and payload engineering of Pseudomonas phage S1
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.09.019
PMID:41141487
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研究论文 | 开发了一种用于假单胞菌噬菌体S1的高效CRISPR-Cas12a基因组编辑工具 | 实现了近乎完全效率的基因编辑,完成了噬菌体领域最大的基因组缩减(13.9 kb) | NA | 推进噬菌体生物技术和治疗开发 | 假单胞菌噬菌体vB_PaeM_SCUT-S1 (S1) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas12a | 假单胞菌噬菌体 | 双质粒系统,支持基因删除、点突变、基因插入和替换 | 医药, 工业生物技术 |
| 555 | 2025-10-05 |
High-Throughput Stationary 13C-Based Metabolic Flux Analysis of Pichia pastoris Strains
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4779-0_9
PMID:41028460
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研究论文 | 本文描述了使用高通量培养平台对Komagataella phaffii菌株进行基于13C的代谢通量分析的详细实验方案 | 开发了适用于高通量培养平台的13C代谢通量分析方案,能够快速表征大量工程菌株 | NA | 建立高通量代谢通量分析方案以加速菌株工程循环 | Komagataella phaffii(毕赤酵母)工程菌株 | 代谢系统工程 | NA | 13C代谢通量分析(C-MFA)、高通量培养技术 | NA | 代谢通量数据 | 多株工程菌株 | 合成生物学工具 | Komagataella phaffii(毕赤酵母) | NA | 工业生物技术 |