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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-05-12 |
Vibrio natriegens, a Promising Chassis from Strain Property to Protein Expression: A Review
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00761
PMID:41886740
|
综述 | 系统介绍Vibrio natriegens的基本生物学特性及其在蛋白质表达中的应用进展 | 重点关注Vibrio natriegens在蛋白质表达中的最新研究与应用成就,弥补了以往综述中对该方面的关注不足 | 未明确提及具体限制 | 为研究人员提供使用Vibrio natriegens进行蛋白质表达的综合概述,突出其优势和应用前景,并提出挑战和未来展望 | Vibrio natriegens菌株及其工程化底盘 | 合成生物学 | NA | 蛋白质表达技术 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 合成生物学 |
| 542 | 2026-05-12 |
Multifunctional Roles and Microbial Production Bottlenecks of Ergothioneine
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00735
PMID:41919719
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综述 | 综述麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 总结了麦角硫因生物合成和分解代谢途径中关键酶的发现与鉴定进展,以及代谢工程策略的最新成果,并介绍了化学酶促级联合成路径实现最高产量 | 未明确提及研究限制,但可能包括异源生产中的代谢负担和产量优化挑战 | 探讨麦角硫因的多功能角色及其微生物生产瓶颈 | 麦角硫因及其关键酶 | 机器学 | NA | 代谢工程 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 食品, 化妆品, 医药 |
| 543 | 2026-05-12 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-04-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 介绍NUPACK 4软件套件,用于核酸结构、装置和系统的分析与设计 | NUPACK 4在物理模型、计算速度、可扩展性、材料混合和序列约束方面实现了全面升级 | NA | 为核酸纳米技术、分子编程、合成生物学和生命科学领域提供计算工具 | 核酸结构和装置 | 分子编程 | NA | NUPACK算法,核酸设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 动态杂交级联反应通路,结构工程(含假结) | 合成生物学,纳米技术 |
| 544 | 2026-05-12 |
Coevolution of plant-microbe interactions, friend-foe continuum, and microbiome engineering for a sustainable future
2026-04-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2026.01.010
PMID:41618562
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综述 | 本文综述了植物-微生物共进化在约4.5亿年间的历程,并提出了一个基于共进化原理的工程框架,用于可持续农业发展 | 该文创新性地构建了一个基于深层时间、三支柱框架(细胞器发生、根系进化和免疫门控)的植物-微生物共进化整合框架,并提出了从共进化原则转化为功能蓝图的预测性、进化知情的策略 | NA | 将植物-微生物共进化原理转化为可持续农业的工程策略,以改善作物性能 | 植物-微生物互作关系及其共进化机制 | 机器学习,合成生物学,基因组编辑 | NA | 基因组编辑,合成生物学,AI,微生物组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,基因组编辑工具 | 植物,微生物 | 合成微生物群落,免疫受体工程,代谢开关 | 农业,可持续农业 |
| 545 | 2026-05-12 |
Research Progress and Prospects of Open-Chain Flavonoid Biosynthesis
2026-03-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00926
PMID:41810537
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综述 | 本文综述了开链黄酮类化合物的结构特征、分类、生物合成途径及催化机制,并探讨了代谢工程和微生物生产策略的研究进展与未来展望 | 系统总结了开链黄酮类化合物的生物合成逻辑、催化机制及调控特征,并强调了新兴的代谢工程和合成生物学方法在该领域的应用 | 未提及具体实验验证或定量分析结果,对开链黄酮类化合物的药理活性及应用潜力仅作简要提及 | 总结开链黄酮类化合物的生物合成研究进展,并展望其未来在代谢工程和生物技术中的应用 | 开链黄酮类化合物及其生物合成途径中的酶与调控元件 | NA | NA | 代谢组学、结构酶学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物开发、生物技术 |
| 546 | 2026-05-12 |
CRISPR-Based Approaches to Engineer Nonmodel Bacteria for Bioproduction and Biotherapeutics
2026-01-20, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.5c00613
PMID:41488985
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综述 | 总结了CRISPR-Cas工具箱及其在非模式微生物工程中的应用,重点讨论生物制造和生物治疗领域的创新 | 强调了CRISPR系统对传统难以改造的非模式微生物(如C1-气体固定醋杆菌、抗生素链霉菌和肠道共生菌)的适应性,并提出了基因组编辑、合成生物学和系统方法整合的新方向 | 讨论了当前限制,如非模式微生物中CRISPR工具效率不足、宿主依赖性问题及未来改进机会 | 综述CRISPR在非模式微生物工程中的应用,推动可持续生物制造、天然产物发现和下一代活体生物治疗的发展 | 非模式微生物,包括C1-气体固定醋杆菌、抗生素链霉菌和肠道共生菌 | 微生物工程 | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,CRISPR-Cas12,CRISPR-Cas13,CRISPRi,CRISPRa | C1-气体固定醋杆菌,抗生素链霉菌,肠道共生菌 | 代谢途径工程,天然产物合成回路,活体生物治疗回路 | 生物制造,天然产物发现,生物治疗 |
| 547 | 2026-05-12 |
Living materials for gas therapy
2026-01, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115738
PMID:41248756
|
综述 | 综述了基于活体材料的气体疗法在肿瘤、炎症和组织再生中的最新进展 | 提出了利用活体材料的生物活性(如疾病趋向性、免疫调节和动态响应性)实现智能气体生成和控释的创新范式 | 活体材料的生物安全性和规模化生产是主要挑战 | 系统总结基于活体材料的气体疗法进展,强调工程化设计原理与治疗效果 | 基于生物实体(如细菌、细胞、藻类)及其仿生衍生物构建的活体材料 | 生物医学工程 | 癌症、炎症性疾病、组织再生 | 基因编程、混合架构设计 | NA | NA | NA | NA | 细菌、细胞、藻类 | 基因回路用于自主气体生产,刺激响应释放架构 | 医学 |
| 548 | 2026-05-12 |
Omics Technologies-Driven Research and Applications of Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5264-0_16
PMID:42108303
|
综述 | 系统阐述多组学、空间组学和培养组学等组学技术如何驱动合成生物学的研究与应用,涵盖从功能预测到社区构建的全链条解决方案 | 提出多组学整合为合成生物学提供从功能预测、动态调控、功能验证到群落构建的全链条解决方案,强调空间组学解析空间互作机制和培养组学突破培养瓶颈的新思路 | NA | 探讨组学技术如何深入整合合成生物学,解决合成系统功能稳定性差、代谢途径适应性不足和自然微生态互作模拟困难等挑战 | 合成生物系统、合成菌群、底盘菌株 | 合成生物学 | NA | 微生物组学、多组学、空间组学、培养组学 | NA | 多组学数据、空间分布数据、培养数据 | NA | NA | NA | NA | 生物制造、环境修复、医疗健康 |
| 549 | 2026-05-11 |
Meta-analysis of fruit waste-derived single-cell protein for programmable nutrition via synthetic biology in sustainable food systems
2026-May-09, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-026-00850-3
PMID:42106370
|
meta-analysis | 通过荟萃分析系统评估水果废弃物来源的单细胞蛋白在可持续食品系统中的生产潜力,并探讨合成生物学在可编程营养中的应用 | 首次通过荟萃分析整合水果废弃物单细胞蛋白生产数据,结合合成生物学框架提出可编程营养系统概念 | 工程菌株验证缺乏水果废渣直接数据,人类临床或体内数据缺失,底物异质性和高能耗预处理影响结果泛化 | 评估水果废弃物单细胞蛋白作为可持续蛋白质替代品的潜力,并探索合成生物学在优化营养方面的应用 | 水果加工残渣及微生物单细胞蛋白生产系统 | 机器学习 | NA | meta分析 | NA | NA | 来源多个同行评审研究的生物量0.24-37.40克/升和蛋白质含量20.58-54.74%数据 | NA | 多种微生物平台 | NA | 食品, 环境, 农业 |
| 550 | 2026-05-11 |
Genetic basis of phytoalexin-mediated chemical defense in plants
2026-May-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.04.021
PMID:42105761
|
研究论文 | 该文章揭示了植物中基于植物抗毒素的化学防御机制的遗传基础 | 首次阐明了debneyol的完整生物合成途径及其关键调控因子MCD1,并证明了MCD1能增强酶活性从而提升植物对多种病原体的抗性 | 未涉及MCD1在非模型植物中的适用性或大规模田间验证 | 解析植物抗毒素介导的化学防御的遗传机制 | 烟草等植物中的debneyol生物合成途径及其调控因子 | 分子生物学 | 植物病害 | 生物合成途径分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(烟草等) | NA | 农业,生物技术 |
| 551 | 2026-05-11 |
Plant formins pave the way for endosymbiosis
2026-May-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.04.017
PMID:42106252
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研究论文 | 本文揭示了formin蛋白在豆科植物根瘤菌侵染和多种植物菌根共生中协调细胞骨架重排的机制 | 发现单个formin蛋白能同时协调根瘤菌侵染和菌根形成两种不同的内共生过程,为工程化微生物进入作物提供新靶点 | 未提供具体实验数据或工程应用验证,仅基于Qiao等人研究进行概念阐述 | 阐明植物formin蛋白在有益微生物内共生中的核心作用机制 | 豆科植物和多种植物的根细胞,涉及根瘤菌和丛枝菌根真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 豆科植物、多种植物 | 内共生信号通路调控模块(formin介导的细胞骨架重排途径) | 农业, 合成生物学 |
| 552 | 2026-05-10 |
Prediction of gene expression levels in Saccharomyces cerevisiae based on chromatin accessibility using multiple machine learning models
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 基于染色质可及性使用多种机器学习模型预测酿酒酵母基因表达水平 | 首次使用染色质可及区域的k-mer特征通过监督机器学习模型预测基因表达,并发现与mRNA剪接相关的关键基序 | NA | 从染色质可及区域预测基因表达水平 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的染色质可及区域和基因表达 | 机器学习 | NA | 机器学习建模、染色质可及性分析 | 监督机器学习模型(Yeast-Gene) | 序列数据(k-mer特征) | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 合成生物学 |
| 553 | 2026-05-10 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
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研究论文 | 研究发现海绵来源的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO)能裂解番茄红素和β-胡萝卜素生成藏花素前体,实现藏花素在番茄果实中的积累 | 首次揭示海洋海绵来源的CCD酶具有意外的酶促可塑性,能够将植物类胡萝卜素代谢重定向至藏花素生物合成途径,而非预期的视黄醇生成 | 未明确探讨SdCDO在天然海绵宿主中的生理功能,且研究仅在单一种植物(番茄)中进行验证 | 探索海洋海绵中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能多样性及其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO) | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢组学分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢物数据、转录组数据 | 大肠杆菌和番茄果实样本 | NA | 大肠杆菌, 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 554 | 2026-05-10 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
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研究论文 | 本研究通过合成磷酸肽和化学蛋白质组学方法,探究了志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性,发现其不仅能修饰MAPK家族蛋白,还能作用于多种细胞靶标 | 首次揭示OspF对MAPK家族内部的底物选择性,并发现其修饰范围远超MAPK家族,包括Rab1A和酪蛋白激酶2β等新靶标 | 未完全阐明OspF在志贺氏菌感染中的全部功能角色,需要进一步研究 | 研究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性及其在宿主细胞中的修饰靶标 | 志贺氏菌分泌的磷酸苏氨酸裂合酶OspF | 微生物学, 化学生物学 | 细菌感染性疾病 | 合成磷酸肽分析, 化学蛋白质组学, 亲核膦化学探针 | NA | 蛋白质组数据 | 细胞裂解液样本和志贺氏菌感染样本 | NA | 志贺氏菌, 宿主细胞(被感染细胞) | NA | 医学, 化学生物学, 合成生物学 |
| 555 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 556 | 2026-05-10 |
Subcellular localization of enzymes involved in the biosynthesis of digoxin in Digitalis lanata
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1703671
PMID:41884437
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研究论文 | 本文鉴定了毛地黄中地高辛生物合成三种已知酶的亚细胞定位 | 首次揭示了地高辛生物合成途径中P450酶定位在内质网,而3HSD和P5R2定位在细胞质,并发现毛地黄P450与哺乳动物同源酶(CYP11A1)的线粒体定位不同 | 研究仅限于烟草叶片中的瞬时表达,未在毛地黄原生细胞中验证;仅覆盖三种已知酶,途径的其他未知酶尚未涉及 | 阐明地高辛生物合成途径的空间组织,为合成生物学和代谢工程提供指导 | 毛地黄中地高辛生物合成的三种酶(P450、3HSD、P5R2) | 合成生物学 | 心血管疾病 | 荧光标记与共聚焦显微镜 | NA | 图像 | 烟草叶片中的瞬时表达实验 | NA | 烟草 | 地高辛生物合成途径 | 医药 |
| 557 | 2026-05-09 |
Engineering Corynebacterium glutamicum as a multifunctional biofactory for living therapeutic materials and controlled ectoine delivery
2026-Aug, Biomaterials advances
IF:5.5Q2
DOI:10.1016/j.bioadv.2026.214847
PMID:41950672
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研究论文 | 将谷氨酸棒杆菌工程化为多功能生物工厂,用于活体治疗材料和受控的依克多因递送 | 首次将谷氨酸棒杆菌作为多功能平台开发用于活体治疗材料,整合了生物感应、报告和依克多因生产功能,并实现了在聚合物基质中的封装与受控释放 | 未明确讨论在体内环境中的长期稳定性和免疫原性等潜在挑战 | 设计和构建工程化谷氨酸棒杆菌,用于活体治疗材料的开发及相关应用 | 谷氨酸棒杆菌菌株及基于聚合物的活体材料(膜-凝胶贴片和核壳水凝胶系统) | 合成生物学 | 炎症及应激相关疾病 | 合成生物学 | NA | 生物传感数据 | NA | 合成生物学 | Corynebacterium glutamicum | 生物传感器、报告系统、依克多因合成通路 | 医学, 环境 |
| 558 | 2026-05-09 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
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研究论文 | 通过合成生物学调控构建重组益生菌株,实现对尿酸的模块化降解,并用于高尿酸血症治疗 | 创新性地通过调节不同强度的核糖体结合位点实现尿酸降解模块的优化,并过表达尿酸转运蛋白和过氧化氢降解酶以提高降解效率 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化尚需进一步验证 | 开发安全有效的微生物策略用于高尿酸血症治疗 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株及其对高尿酸血症小鼠模型的治疗作用 | 机器学 | 高尿酸血症 | 合成生物学 | NA | 基因序列 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 尿酸降解模块 | 医学 |
| 559 | 2026-05-09 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
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研究论文 | 文章讨论混合人工智能在合成生物学中应用于农业的潜力 | 提出混合AI能够更有效地处理多组学复杂性,用于工程化气候智能、高产量作物,超越传统数据驱动方法 | 发挥全部潜力需要清晰的流程、精选的数据集和自动化平台 | 探索混合AI在合成生物学中推动农业转型的作用 | 多基因组、多性状、多环境数据以及作物工程 | 机器学习 | NA | NA | 混合AI | 多组学数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 560 | 2026-05-09 |
Rewiring holobiont systems with synthetic biology
2026-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.017
PMID:41109795
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综述 | 本文综述了合成生物学如何帮助理解和操控全生物体(宿主及其微生物群组成的复杂群落)中的相互作用 | 提出了de novo全生物设计这一新领域,整合全生物研究与合成生物学,并重点介绍了细菌生物传感器、跨王国通讯工程、表面展示及CRISPR系统等前沿技术 | 未提及具体局限性 | 探索合成生物学在解析和操控全生物体相互作用中的应用,推动生物技术新前沿 | 全生物体(宿主与微生物群)及其相互作用 | 合成生物学 | NA | 细菌生物传感器设计、跨王国通讯工程、表面展示、CRISPR系统 | NA | NA | NA | CRISPR系统 | NA | 细菌生物传感器、跨王国通讯回路 | 生物技术 |