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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-06-18 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 本文综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 系统阐述了后生元在免疫调节、抗炎和屏障增强方面的独特机制,并总结了其在脆弱人群中的安全优势 | 标准化和监管协调方面仍存在挑战 | 评估后生元作为微生物组靶向干预策略的临床应用前景 | 后生元(非活菌微生物细胞或其成分) | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、内脏脂肪堆积、抗生素相关菌群失调 | 宏基因组学、新一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | 嗜酸乳杆菌、副干酪乳杆菌、植物乳杆菌、双歧杆菌 | NA | 医学, 食品 |
| 542 | 2026-06-18 |
Engineered live bacteria for liver diseases and gut-liver axis disorders: from genetic modification to advanced delivery systems
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04483-2
PMID:42057131
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综述 | 综述了工程化活菌在治疗肝脏疾病及肠肝轴疾病中的应用,涵盖从基因修饰到先进递送系统的进展 | 系统总结了内部基因修饰和外部共价连接两种策略,并详述了胶囊、微囊和纳米制剂等新型剂量形式在活菌递送中的应用 | 未讨论工程化活菌在临床应用中的具体安全性评估和长期稳定性问题 | 探讨工程化活菌作为靶向肝脏和肠道疾病的新型治疗方法的潜力 | 工程化活菌菌株(如双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉氏酵母菌、罗伊氏乳杆菌)及其递送系统 | 微生物工程 | 肝细胞癌、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | 双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉氏酵母菌、罗伊氏乳杆菌 | 治疗性分子递送通路、内部基因修饰、外部共价连接 | 医学 |
| 543 | 2026-06-18 |
Molecular kinetics dictate population dynamics in CRISPR-based plasmid defense
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525424123
PMID:41911458
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研究论文 | 通过成像方法揭示CRISPR质粒防御中分子动力学如何决定群体动态 | 首次将分子动力学、单细胞变异和空间结构多尺度结合,量化CRISPR-Cas系统对质粒传播的影响,并提出基于单细胞参数的预测模型 | 实验基于特定质粒RP4和CRISPR-Cascade系统,可能不适用于其他系统或环境 | 研究分子动力学如何决定细菌群体中CRISPR质粒防御的动态 | 结合质粒RP4和CRISPR-Cascade复合物的细菌群体 | 合成生物学 | NA | 荧光标记、时序成像、单细胞追踪 | 基于智能体的空间模型 | 图像 | 未明确样本数量,涉及细菌群体、单细胞水平分析 | CRISPR-Cas | 细菌 | CRISPR-Cascade质粒防御系统 | 合成生物学, 农业, 医学 |
| 544 | 2026-06-18 |
Editorial: Biofabrication and synthetic biology for enhanced medicinal plant bioproduction
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1876560
PMID:42306426
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 545 | 2026-06-17 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-07-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
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研究论文 | 基于肠道共生菌Bacteroides thetaiotaomicron的工程化细菌系统用于结直肠肿瘤靶向药物递送 | 首次利用人体肠道天然共生菌Bacteroides thetaiotaomicron作为底盘细胞,通过筛选表面锚定蛋白建立高效展示系统,实现肿瘤靶向蛋白HlpA的表面展示及结直肠肿瘤特异性靶向 | NA | 开发基于肠道共生菌的安全靶向癌症治疗策略 | Bacteroides thetaiotaomicron工程化菌株及结直肠肿瘤模型 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Bacteroides thetaiotaomicron | 肿瘤靶向蛋白HlpA表面展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |
| 546 | 2026-06-17 |
In vivo genetic circuit drives systemic PARP1 siRNA assembly into small extracellular vesicles for BRCA2-deficient breast cancer therapy
2026-07-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114973
PMID:42097228
|
研究论文 | 设计体内遗传电路驱动系统性的PARP1 siRNA组装到小细胞外囊泡中,用于BRCA2缺陷型乳腺癌治疗 | 创新性地利用肝脏作为生物工厂,通过遗传电路重新编程肝细胞,将PARP1 siRNA包装到内源性小细胞外囊泡中,实现系统性递送,克服了传统PARP抑制剂疗法的系统毒性和获得性耐药问题 | 该研究的局限性可能包括需要进一步验证在人体中的安全性和有效性,以及遗传电路递送和表达的长期稳定性问题 | 开发一种非病毒性、系统性的RNA干扰递送平台,通过选择性抑制BRCA2缺陷型乳腺癌中的PARP1,以克服当前PARP抑制剂治疗的局限性 | BRCA2缺陷型乳腺癌小鼠模型(E0771和HCC1599) | 合成生物学 | 乳腺癌 | RNA干扰 | NA | NA | 两个原位乳腺癌小鼠模型(免疫健全的BRCA2缺陷型E0771模型和免疫缺陷的BRCA2突变异种移植HCC1599模型) | NA | 小鼠肝细胞 | 遗传电路,包含CMV启动子控制下的pre-miR-155骨架中嵌入的PARP1特异性siRNA | 医学 |
| 547 | 2026-06-17 |
Status, scale-up and microbial genes perspective in microbial electrosynthesis for multi-step carbon dioxide upgrading to value-added products
2026-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04902-z
PMID:42299337
|
综述 | 本文综述了微生物电合成在二氧化碳多步升级为高附加值产品方面的现状、规模化进展及微生物基因研究视角 | 结合合成生物学、基因工程和反应器设计的最新进展,系统探讨了微生物电合成提升二氧化碳转化速率和选择性的潜力,并指出了未来研究方向 | 规模化、长期稳定性、最优微生物菌株选择、实现净负碳排放及操作限制等挑战尚未解决 | 探索微生物电合成在二氧化碳升级策略中的变革潜力与最新进展,识别过程决定因素和未来研究方向 | 微生物电合成系统及其在二氧化碳转化中的应用 | 微生物电化学技术 | NA | 微生物电合成 | NA | NA | NA | 合成生物学, 基因工程 | 电极上的微生物 | 微生物电合成系统 | 工业生物技术, 环境 |
| 548 | 2026-06-17 |
Empirical evaluation of all unique Cas9 protospacers in E. coli reveal widespread functionality and rules for gRNA design
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag548
PMID:42258532
|
研究论文 | 系统评估大肠杆菌中463,000个独特gRNA的Cas9活性,发现93%以上功能正常,仅0.3%无效 | 首次大规模实证验证大肠杆菌中几乎所有独特gRNA均具有功能性,并揭示无效gRNA的间隔区自相互作用规律,提出简单设计规则和修复方法 | 研究仅限于大肠杆菌K12 MG1655菌株,未扩展至其他细菌种类 | 评估大肠杆菌中Cas9 gRNA的特异性与功能性,解决现有研究中关于无效gRNA比例的争议 | 463,000个独特gRNA在大肠杆菌K12 MG1655基因组上的活性 | 计算生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 序列数据 | 463,000个独特gRNA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 549 | 2026-06-17 |
Rare functional groups and unique scaffolds in Streptomyces natural products
2026-Jun-08, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00012f
PMID:42300430
|
综述 | 综述链霉菌天然产物中罕见官能团、独特骨架和非典型修饰的结构特征及其生物合成机制 | 将稀有结构特征(如罕见官能团、独特分子骨架、非典型修饰)与合成生物学应用及高效细胞工厂设计相联系 | 仅涵盖截至2025年12月的数据,可能遗漏近期文献 | 探讨链霉菌天然产物的结构多样性如何为合成生物学和药物发现提供灵感 | 链霉菌天然产物及其生物合成酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 550 | 2026-06-17 |
Synthetic biology as a game-changer for endangered medicinal orchids: biosynthesis, engineering and conservation
2026-Jun-02, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00027d
PMID:42300065
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综述 | 本文综述了合成生物学如何通过模块化设计、异源重构和代谢工程等手段,推动濒危药用兰花的可持续利用与保护 | 创新性地将合成生物学引入濒危药用兰花保护领域,通过解耦供应与生态提取实现可持续生产,并整合多组学、人工智能和基因编辑加速工程化循环 | 未明确讨论合成生物学应用的潜在生态风险或大规模生产的经济可行性 | 探讨合成生物学在濒危药用兰花生物合成、工程化及保护中的变革性作用 | 濒危药用兰花及其高价值代谢物(如天麻素、石斛碱) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、异源表达、定向进化、多组学、基因编辑、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 微生物(如大肠杆菌、酿酒酵母)、植物底盘 | 生物合成途径模块化设计、振荡器、生物传感器、代谢途径 | 医药、农业、工业生物技术 |
| 551 | 2026-06-17 |
The division of vesicles requires the fission of closed membrane necks but does not require active processes
2026-Jun-02, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d6sm00283h
PMID:42300069
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研究论文 | 通过理论、实验和模拟分析,证明囊泡分裂需要闭合膜颈的裂变,但不需要主动过程 | 首次明确表明囊泡分裂不需要化学机械耦合的主动过程(如核苷酸水解),仅需闭合膜颈的形成与裂变,并提出了由自发曲率或应力不对称控制收缩力的机制 | 主要基于作者团队的研究结果,可能未涵盖所有类型的囊泡分裂机制;主动过程在自然界中的角色未被完全排除 | 阐明囊泡分裂的物理机制,并验证其是否依赖于主动过程 | 巨型囊泡和纳米囊泡的膜分裂过程 | 软物质科学、合成生物学 | NA | NA | 理论模型、计算机模拟 | 实验数据、模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质工程 |
| 552 | 2026-06-17 |
p-Benzoyl-l-phenylalanine as a Multifunctional Noncanonical Amino Acid in Synthetic Biology: Photoprobing, Photocatalysis, and Structural Programming for Biocontainment
2026-03-16, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202525502
PMID:41664298
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综述 | 系统总结p-苯甲酰-L-苯丙氨酸作为多功能非经典氨基酸在合成生物学中用于光探测、光催化和生物防护结构编程的研究进展 | 首次全面阐述pBzF的三重态光化学特性及其在蛋白质工程中的多功能应用,包括光交联、光催化及构建人工光合系统 | 未提及实际应用中可能存在的细胞毒性、光损伤或体内转化效率限制 | 综述pBzF在合成生物学中作为光化学和结构基序的多样化应用,为构建非天然光响应催化功能蛋白提供框架 | p-苯甲酰-L-苯丙氨酸及其在蛋白质工程中的应用案例 | 合成生物学 | NA | 非经典氨基酸定向进化、遗传密码扩展 | NA | NA | NA | 非经典氨基酸定向进化 | NA | 光响应蛋白、光催化系统、人工光合系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 553 | 2026-06-17 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-01-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
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研究论文 | 报道首个在生理pH下利用中性双组分系统辅助环磷酸腺苷和磷酸腺苷穿过脂质体膜转运的研究 | 首次实现中性小分子系统对环磷酸腺苷和磷酸腺苷的跨膜转运,采用磷酸基团靶向合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物协同作用提高转运效率 | 仅基于脂质体模型验证,未在活细胞体系中测试,且转运机制细节尚需进一步阐明 | 开发小分子系统实现核苷酸跨膜转运,探索在药物递送和合成生物学中的应用 | 环磷酸腺苷和磷酸腺苷的跨膜转运过程 | 合成生物学 | NA | 荧光检测、磷核磁共振 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量,涉及脂质体模型和多种小分子化合物 | NA | 脂质体(模拟膜系统) | 双组分小分子转运系统:合成阴离子载体(氟化方酰胺)与胸腺嘧啶衍生物协同作用 | 药物递送, 合成生物学 |
| 554 | 2026-06-16 |
Engineered bacteria in disease diagnosis and therapy: A synthetic biology perspective
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.028
PMID:42293685
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综述 | 这篇综述从合成生物学角度总结了工程菌在疾病诊断和治疗中的应用进展 | 系统梳理了合成生物学技术(如CRISPR/Cas9、DNA组装、定向进化及人工智能集成)如何赋能工程菌作为“活体传感器”和定制化治疗载体,并讨论了提升安全性和有效性的工程策略 | 工程菌的临床转化仍面临稳定定植、免疫原性控制、大规模生产标准化及监管伦理框架等挑战 | 优化细菌功能以拓展其在诊断和精准医学中的潜力 | 工程菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA组装, 定向进化, 人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 生物传感器, 靶向药物递送, 免疫调控, 微生物组调节 | 医学 |
| 555 | 2026-06-16 |
Identification of a thermotolerant strain of Aureobasidium melanogenum DA22 and functional analysis of Spt23 as a key transcriptional regulator in high-temperature polymalic acid fermentation
2026-Oct, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134956
PMID:42176819
|
研究论文 | 鉴定了一株耐热菌株 Aureobasidium melanogenum DA22,并分析了转录调控因子 Spt23 在高温聚苹果酸发酵中的关键作用 | 发现并鉴定了天然耐热菌株 DA22,并过表达膜相关转录因子 SPT23 基因构建耐热微生物细胞工厂,在高温下显著提高聚苹果酸产量 | 未说明长期工业化条件下的稳定性和成本效益 | 构建耐热微生物细胞工厂,实现高温下高效有机酸生产 | 耐热菌株 Aureobasidium melanogenum DA22 及转录因子 Spt23 | 合成生物学 | NA | 过量表达、基因敲除、RT-qPCR、发酵工程 | NA | 生长曲线、发酵滴度、基因表达水平、形态观察 | 筛选120株野生型分离株,其中DA22为耐热菌株 | 过量表达、基因敲除 | Aureobasidium melanogenum | 过表达SPT23基因的合成生物学回路,用于增强耐热性和有机酸生产 | 工业生物技术 |
| 556 | 2026-06-16 |
Xeno nucleic acids (XNAs): advances in synthesis, diagnostics, and therapeutics
2026-Sep-05, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2026.110000
PMID:42160832
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综述 | 全面综述异源核酸(XNA)的合成、表征及其在诊断和治疗中的应用 | 系统性地概述了多种异源核酸变体的合成方法、结构特性及临床转化潜力,强调其在分子诊断和精准医学中的变革性作用 | 当前面临可规模化合成、有效递送系统及全面结构-功能理解的挑战 | 总结异源核酸(XNA)的化学修饰、合成方法、表征技术及生物医学应用 | 锁核酸、肽核酸、己糖醇核酸、氟阿拉伯糖核酸、吗啉代寡聚体等异源核酸变体 | 分子生物学、生物技术 | NA | 磷酰胺化学法、工程聚合酶酶促合成法、热熔融分析、圆二色光谱、核磁共振、质谱、测序方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(精准医学、分子诊断、治疗)、生物技术 |
| 557 | 2026-06-16 |
Deep learning unlocks sequence-divergent synthetic promoters to empower Streptomyces natural product engineering
2026-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.05.009
PMID:42208848
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研究论文 | 利用深度学习设计序列发散的合成启动子,增强链霉菌天然产物工程 | 首次为链霉菌建立AI生成的启动子库,深度学习赋能设计效率、序列多样性和性能精确调控 | NA | 开发深度学习驱动的合成启动子设计方法,克服链霉菌遗传工具开发的限制,提升天然产物产量 | 链霉菌合成启动子及其对天然产物工程的影响 | 机器学习 | NA | 深度学习,深度生成模型 | NA | 序列数据 | 10亿个计算机设计的启动子序列,其中100个候选启动子经实验验证 | NA | 链霉菌 | 合成启动子文库 | 工业生物技术,医药 |
| 558 | 2026-06-16 |
Substrate Specificity of B12-Depedent Ribonucleotide Reductases: Biotechnology and Metabolic Implications
2026-Jun-15, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500344
PMID:42290402
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研究论文 | 研究了两类热稳定性核糖核苷酸还原酶对多种天然和非天然核苷酸的底物特异性,评估其生物技术应用潜力 | 首次系统性地研究了核糖核苷酸还原酶对非经典核苷酸的底物特异性,发现酶倾向于转化带有修饰官能团的核苷碱基底物,揭示了生物技术和合成生物学应用中的潜力与限制 | 仅聚焦于两种热稳定性RNR,未涵盖其他来源或类型的RNR;对非天然核苷酸的转化效率及体内应用验证不足 | 探索核糖核苷酸还原酶的底物混杂性及其在生物技术中的应用潜力,同时增进对天然核苷酸代谢的理解 | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶及其对多种天然和非天然核苷酸的转化 | 合成生物学 | NA | 酶活性测定、底物特异性分析 | NA | 实验数据(酶动力学参数) | 两种热稳定性核糖核苷酸还原酶,测试了多种核苷酸底物 | NA | NA | NA | 生物技术、合成生物学 |
| 559 | 2026-06-16 |
A Modular PLUG-IN Photosynthetic Chassis With Tunable Thermal Control for Mammalian Systems
2026-Jun-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76102
PMID:42294635
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研究论文 | 开发一种热调控的模块化“即插即用”光合底盘,实现微藻代谢输出与细胞完整性的可编程控制 | 首次实现跨真核生物界的热调控模块化合成生物学底盘,在微藻和哺乳动物宿主中均保持功能,并耦合代谢工程与细胞壁工程实现无研磨脂质回收 | 未明确讨论热诱导系统在长期培养中的稳定性及可能的代谢负担,未评估大规模工业应用中的热控制成本 | 开发一种与哺乳动物系统兼容的热调控光合底盘,同步控制生长、生产与细胞壁重构 | 海洋微藻(Nannochloropsis oceanica)和哺乳动物宿主 | 合成生物学 | NA | 转录组学比较分析、热诱导启动子工程、基因沉默 | NA | 转录组数据 | NA | 热激活基因扩增系统、基因沉默 | Nannochloropsis oceanica, 哺乳动物细胞 | 热调控代谢模块(AtWRI1表达增强三酰甘油和EPA积累)与细胞壁模块(CesA1沉默导致细胞壁弱化)耦合 | 工业生物技术, 医药 |
| 560 | 2026-06-16 |
SynBio-DSP: an integrated synthetic biology platform with fed-batch fermentation and continuous downstream processing for sustainable production of thermostable cellulases
2026-Jun-14, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02783-1
PMID:42289753
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研究论文 | 开发了一种整合合成生物学、机器学习引导的生物过程优化和连续下游处理的平台,用于可持续生产耐热纤维素酶 | 首次提出了QLM自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化策略,并结合高斯过程回归和高通量微型生物反应器优化发酵,以及新型脉冲电场辅助协同裂解系统实现高效酶回收 | sfGFP融合导致比活性降低8.3%,可能需要进一步优化融合标签设计 | 通过协同优化细胞设计和工艺配置,实现可持续且经济可行的生物催化剂生产 | 枯草芽孢杆菌底盘细胞以及超耐热纤维素酶CtCel9A | 合成生物学 | NA | 合成生物学、CRISPRi、高通量发酵、响应面法、多目标优化 | 高斯过程回归、响应面法、NSGA-III算法 | 实验数据和过程参数 | NA | CRISPR-Cas9, 脉冲电场 | 枯草芽孢杆菌 | 群体感应裂解调制自诱导系统和CRISPRi介导的细胞壁弱化回路 | 工业生物技术, 能源 |