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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-09-05 |
Metabolic engineering of Taxus chinensis suspension cell lines for overproduction of paclitaxel reveals insights into pathway regulation
2026-Aug-22, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102524
PMID:42628595
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研究论文 | 本文通过代谢工程改造红豆杉悬浮细胞系,过表达紫杉醇生物合成途径中的四个关键基因,显著提高紫杉醇产量,并揭示了途径调控机制 | 首次在红豆杉植物细胞培养中通过遗传工程方法过表达多个紫杉醇合成途径基因,发现DBAT是调控紫杉醇及其他紫杉烷类化合物合成的关键限速步骤,并揭示了途径基因的协同激活模式 | 研究主要集中于特定细胞系和所选基因,可能未涵盖全部调控因素,且过表达DBAT导致紫杉烷杂质增加,需进一步优化以降低杂质 | 通过代谢工程和合成生物学手段优化红豆杉植物细胞培养,以提高紫杉醇产量并理解途径调控机制 | 红豆杉(Taxus chinensis)悬浮细胞系 | 代谢工程 | 癌症 | 基因过表达 | NA | 基因表达数据 | 四种转基因红豆杉细胞系 | 农杆菌介导转化 | 红豆杉(Taxus chinensis) | 紫杉醇生物合成途径的基因过表达 | 医药 |
| 542 | 2026-09-05 |
Scientometric analysis of mycosporine-like amino acids from 1989 to 2025: Current trends and applications
2026-Aug-22, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.135690
PMID:42632472
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研究论文 | 对1989年至2025年间类菌孢素氨基酸研究的科学计量分析,揭示其发展趋势、研究主题和应用前景 | 首次对类菌孢素氨基酸研究进行全面的科学计量分析,覆盖1989至2025年,识别出四个研究主题并指出合成生物学和组学方法的新兴趋势 | 数据仅来源于Web of Science核心合集,可能遗漏其他数据库中的相关文献 | 评估类菌孢素氨基酸研究的全球发展态势,绘制知识结构图,并为其商业化发展提供路线图 | 类菌孢素氨基酸相关的研究文献 | 科学计量学 | NA | 科学计量分析 | NA | 文献数据 | 859篇文献 | NA | NA | NA | 海洋生物学, 生物化学, 环境科学, 生物技术, 医学 |
| 543 | 2026-09-05 |
[Pharmacological effects, biosynthesis, and production of coumarin compounds: a review]
2026-Aug, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了香豆素类化合物的药理作用、生物合成途径及生物制造方法,并重点介绍了提高香豆素产量的策略。 | 系统总结了基于定向进化的酶工程、代谢工程和发酵工程在提高香豆素产量中的应用策略。 | 未提及具体限制。 | 为香豆素的绿色、高效和可持续生产提供重要参考,促进新型香豆素类药物开发。 | 香豆素类化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物开发 |
| 544 | 2026-09-05 |
Engineered Biocatalytic Strategies for Pesticide Degradation in Food Systems: From Catalytic Performance to Practical Applications
2026-Jul-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c01905
PMID:42133536
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综述 | 综述了食品系统中农药降解的工程化生物催化策略,从催化性能到实际应用进行了全面概述。 | 强调工程策略提升酶性能与稳定性,并探讨人工智能辅助设计和合成生物学等新兴方法。 | 实际应用中存在酶催化效率有限、稳定性不足、可重复使用性差、规模化受限以及监管不确定性等障碍。 | 为食品系统中农药酶促降解提供应用导向的综述,重点介绍工程化策略并分析转化瓶颈。 | 食品系统中的农药残留及降解用酶(天然酶、纳米酶、多酶或混合级联系统)。 | 合成生物学 | NA | 人工智能辅助设计、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联系统、纳米酶和混合级联系统 | 食品加工、食品保鲜、食品安全 |
| 545 | 2026-09-05 |
From tumor targeting to tumor accessibility: surface-engineered bacteria as precision living therapeutics for translational medicine
2026-Jul-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-026-01827-1
PMID:42415153
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综述 | 本文从临床视角探讨细菌疗法在转化医学中的瓶颈,提出“肿瘤可及性”概念,并系统总结细菌表面工程策略及联合治疗应用。 | 首次提出“肿瘤可及性”概念,指出其不足是当前细菌疗法临床应用的关键瓶颈,并借鉴抗体药物偶联物精确递送经验,提出“精准活体治疗”新范式。 | 摘要未明确提及具体局限性,但从全文推断可能包括缺乏临床数据支持、技术转化难度大等。 | 从临床导向角度分析细菌疗法转化鸿沟,强调表面工程在提升肿瘤可及性、免疫逃逸和治疗效果中的作用,并提出未来应注重系统可及性。 | 表面工程细菌,包括化学偶联(如SpyTag/SpyCatcher)、物理包被(如细胞膜封装)、生物策略(如基因调控表面结构)。 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 细菌 | 细菌表面工程 | 医学 |
| 546 | 2026-09-04 |
Microbial remodeling of bile acids: emerging engineering strategies for precision fermentation and functional food innovation
2026-Oct, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103572
PMID:42628489
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综述 | 本文综述了胆汁酸的微生物重塑,重点介绍了合成生物学在精确发酵和功能性食品创新中的工程策略 | 提出通过合成生物学模块化重构胆汁酸代谢通路,实现可编程的胆汁酸组成控制,并整合计算设计、生物传感器和封装等新兴技术 | 未提及具体局限性 | 探讨微生物重塑胆汁酸的工程策略及其在精准发酵和功能性食品创新中的应用潜力 | 肠道微生物及其胆汁酸代谢通路 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 功能性食品, 医学, 个性化医学 |
| 547 | 2026-09-04 |
Sustainable Biocatalytic Cascades: A Versatile Tool in the Synthesis of Natural Products With Therapeutic Potential
2026-Sep-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70492
PMID:42673276
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综述 | 本文综述了生物催化级联反应在合成具有治疗潜力的天然产物中的应用,强调其在可持续化学和药物发现中的重要性 | 系统总结了生物催化级联反应在复杂天然产物和药物合成中的最新进展,展示了蛋白质工程和合成生物学如何扩展其应用范围 | 未具体讨论级联反应的工业化挑战或经济可行性限制 | 探讨生物催化级联反应作为可持续合成工具在药物发现和化学制造中的潜力 | 生物催化级联反应及其在合成多酮化合物、生物碱、药物活性成分和杂环化合物中的应用 | 合成生物学 | 不适用 | 蛋白质工程、定向进化、计算酶设计、合成生物学 | 不适用 | 文献数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 药物、工业生物技术 |
| 548 | 2026-09-04 |
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.12.023
PMID:41786536
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综述 | 本文综述了正交策略在微生物合成生物学中的应用,包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建,并探讨了未来研究方向。 | 系统性地总结了正交策略在微生物合成生物学中的最新进展和应用,涵盖多个层面的正交系统,并展望了未来研究趋势。 | 由于是综述,未涉及具体的实验验证,可能缺乏对实际应用中挑战的深入分析。 | 总结正交策略在微生物合成生物学中的应用进展,探讨减少代谢系统复杂性和不可预测性的方法,为未来研究提供参考。 | 微生物细胞及其合成生物学工程系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 正交遗传系统、正交代谢途径、正交能量系统、正交调控系统 | 工业生物技术 |
| 549 | 2026-09-04 |
Navigating regulatory fragmentation in the convergence of synthetic biology, artificial intelligence, and automation
2026-08-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77338-x
PMID:42668325
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研究论文 | 本文分析了合成生物学、人工智能和自动化融合(SynBioxAI)领域面临的监管碎片化问题,并提出一个七透镜的制度框架(RIOT)以帮助研究机构高效、透明地应对监管分歧 | 首次对SynBioxAI融合领域的监管格局进行跨十六国的全面分析,并提出监管摩擦是乘性而非加性的观点,同时开发了实用的RIOT框架 | 由于本文为政策分析类研究,未涉及具体的实验或技术验证,其局限性可能在于框架的实际应用效果尚未经过实证检验 | 探讨合成生物学、人工智能和自动化融合领域监管碎片化带来的挑战,并提出解决方案 | 十六国的监管框架以及七个现实合作场景中的SynBioxAI研究活动 | 政策分析 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 文本 | 十六个国家及七个合作场景 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生物安全、人工智能治理、出口管制、数据主权 |
| 550 | 2026-09-04 |
Peptide barcoding: an alternative to the phenotype-genotype problem
2026-Aug-23, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2026.08.007
PMID:42633869
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综述 | 综述了肽条形码技术的最新进展及其在结合亲和力筛选、脂质纳米颗粒、mRNA非翻译区和设计蛋白文库等领域的应用,并讨论了条形码设计、文库构建和质谱方法中的关键挑战 | 提出肽条形码作为基因型-表型映射的概念转变,强调其在AI驱动的蛋白质工程、递送技术和合成生物学中的重要作用 | 未详细说明 | 总结肽条形码技术的进展并展望其在蛋白质工程和合成生物学中的应用前景 | 肽条形码技术及其在蛋白质和文库筛选中的应用 | 合成生物学 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 医学 |
| 551 | 2026-09-04 |
Uniform Microscale Thermoresponsive Liposomes for Controlled Release Above Body Temperature
2026-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.74496
PMID:42434866
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研究论文 | 本文提出了一种利用电晕放电处理的PDMS双乳液装置规模化制备单分散热响应脂质体的方法,实现了在高于体温(约41-45°C)时的触发释放。 | 首次实现了可规模化生产均匀热响应脂质体,这些脂质体在高于体温时发生突然释放,解决了现有方法中生物相容性差、响应慢和不可扩展的问题。 | 未提及具体局限性。 | 开发一种可扩展的方法,用于生成在体温以上激活的均匀热敏脂质体,以用于药物递送、生物传感和合成生物学。 | 热响应脂质体及其释放行为。 | 纳米技术 | NA | 双乳液微流控、溶剂萃取 | NA | 实验数据 | 涉及不同厚度的脂质体样本,具体数量未说明。 | NA | NA | 热响应脂质体释放系统 | 医学、生物技术 |
| 552 | 2026-09-04 |
Engineered strains as living factories: efficient biosynthesis and modification of natural products via synthetic biology and one-pot chemical tandem reactions
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1891602
PMID:42682720
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综述 | 本文综述了如何将工程菌株作为活体工厂,结合一锅化学串联反应,实现天然产物的高效生物合成与化学多样化修饰,并探讨了多种集成范式与工业化路径 | 提出了三种集成范式(发酵后修饰、一锅化学酶偶联、开放式无细胞制造),并系统比较了不同天然产物类别的瓶颈及一锅反应机制 | 未提供实验数据,仅基于文献总结,工业放大和监管评估仍处于概念阶段 | 探讨如何将生物合成精确性与化学多样化相结合,以克服传统代谢工程的局限性,推动可持续天然产物生产 | 工程菌株、天然产物、一锅化学串联反应 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术、医药 |
| 553 | 2026-09-03 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-12, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
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综述 | 本文系统综述了生长因子(GFs)的分类、基础研究进展及其在神经退行性疾病、骨再生和代谢紊乱等领域的应用,分析了临床转化中的主要挑战及相应解决方案 | 总结了通过蛋白质工程、化学修饰、智能响应递送系统及多因子序贯释放技术等创新策略,以克服生长因子临床转化瓶颈的进展 | 高成本、复杂的大规模生产过程及体内微环境的复杂性限制了生长因子的临床转化范围 | 为加速下一代生长因子疗法的开发提供全面路线图和技术参考,推动其在再生医学、肿瘤学和代谢调节等领域的应用 | 生长因子(GFs)及其在神经退行性疾病、骨再生和代谢紊乱等疾病中的应用 | 再生医学 | 神经退行性疾病, 骨再生, 代谢紊乱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 554 | 2026-09-03 |
Metabolic engineering of Candida yeasts for biotechnological applications
2026-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102522
PMID:42580625
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综述 | 本文系统综述了假丝酵母菌属代谢工程用于生物技术应用的最新进展,重点涵盖遗传工具扩展、非常规碳源利用及高价值化合物合成,并提出基于生物安全的分类框架以支持其安全工业应用 | 提出了生物安全导向的假丝酵母菌分类框架,并强调了合成生物学与人工智能驱动设计相结合以解锁其生物技术潜力 | 存在机会性致病性担忧和历史遗传操作工具缺乏等障碍,导致代谢潜力与实际应用之间存在显著差距 | 总结假丝酵母菌代谢工程进展并探讨其在可持续生产化学品、燃料和蛋白质方面的潜力 | 假丝酵母菌属物种 | 合成生物学 | NA | 功能基因组学、基因组编辑、系统代谢工程 | NA | NA | NA | 基因组编辑工具 | 假丝酵母菌属 | 微生物细胞工厂 | 工业生物技术, 可持续化学品生产 |
| 555 | 2026-09-03 |
A dual-dimensional CRISPR toolkit enables one-step high-efficiency multiplex genome editing in Komagataella phaffii
2026-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102525
PMID:42595042
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR的双维度工具包EMGES 3.0,用于在Komagataella phaffii中实现一步高效的多重基因组编辑和大片段整合 | 首次实现超长片段(>16 kb)的一步整合,效率达14.8%,并通过底盘工程和载体优化的协同作用大幅提升了编辑效率 | 未明确说明局限性,但超长片段整合效率相对较低(14.8%) | 解决K. phaffii中多重基因编辑和精确大片段整合效率低、流程繁琐的问题,推动C1生物经济工业化 | 甲醇利用型酵母Komagataella phaffii(及其工程改造菌株) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 基因组编辑效率数据、代谢产物产量数据(如游离脂肪酸、白藜芦醇) | 具体样本数未明确,涉及多个工程菌株(如Y09)的编辑效率和产物产量测试 | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii(库德里阿兹威氏毕赤酵母) | 双锤头核酶-单链导向RNA-丁型肝炎病毒核酶(dHgH)介导的引导RNA表达系统 | 工业生物技术 |
| 556 | 2026-09-03 |
Microbial growth control: integrating protein abundance and activity
2026-Oct, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102803
PMID:42497777
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综述 | 本文综述了微生物生长控制的最新定量研究,重点探讨了蛋白质丰度控制和活性控制两个关键调控层次,并展望了整合这些原理对合成生物学设计的指导意义 | 提出微生物生长控制不仅涉及基于蛋白质丰度的资源分配,还包含活性控制(如核糖体延伸速率、代谢酶效率和活性翻译核糖体比例)这一新的调控层次,强调了两者的整合对理解微生物生理型和指导合成生物学设计的重要性 | 摘要未提及具体的局限性 | 整合蛋白质丰度控制和活性控制的定量原理,以全面理解微生物在不同生态位中的生理型形成,并指导合成生物学的理性设计 | 微生物细胞及其生理型 | 系统生物学 | NA | 定量生物学分析 | NA | 定量数据 | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术, 系统生物学 |
| 557 | 2026-09-03 |
Interactions between fungi, algae, and bacteria: multispecies engineered living materials leverage function and structure
2026-Oct, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102806
PMID:42556013
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综述 | 本文综述了真菌、藻类和细菌之间的自然互作关系,并探讨如何利用这些关系设计以丝状真菌为结构骨架的多物种工程活体材料(ELMs),同时讨论了其在工业过程和未来应用中的潜力。 | 提出利用多物种联合体(真菌、藻类、细菌)构建工程活体材料,以引入动态功能和光合特性,突破单一真菌支架的功能限制。 | 未提及具体的实验验证或量化分析,主要基于现有文献的综述,可能缺乏实证数据支持。 | 探讨如何利用真菌、藻类和细菌的自然互作来设计和实现多物种工程活体材料,并分析其在工业中的应用和未来挑战。 | 丝状真菌、藻类和细菌的多物种联合体及其在工程活体材料中的应用。 | 合成生物学、材料科学 | NA | 合成生物学、生物技术 | NA | 文献资料 | NA | NA | 丝状真菌、藻类、细菌 | NA | 工业生物技术、环境、材料 |
| 558 | 2026-09-03 |
A standardized SBML/PRISM benchmark library for stochastic model checking in synthetic biology
2026-Sep-02, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2026-0002
PMID:42683627
|
研究论文 | 本文介绍了一个标准化的SBML/PRISM基准库,用于合成生物学中的随机模型检验,以支持软件开发、比较和可重复性 | 提供了首个经整理的基准库,包含生物学启发的无限状态空间随机模型,并以SBML和PRISM两种格式提供,以增强互操作性和社区贡献 | 未明确说明局限性,但可能受限于有限案例数量和状态空间增长的扩展性 | 支持随机模型检验软件在合成生物学中的开发,提高可重复性、工具比较和基础设施稳健性 | 合成生物学中的随机模型,包括化学反应网络 | 合成生物学 | NA | 随机模型检验 | 随机过程模型 | 模型文件(SBML和PRISM格式) | 多个案例研究,具体数量未说明 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 559 | 2026-09-03 |
Light governed plant-microbe interactions: the role of light in biotic stress resilience
2026-Sep, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-026-01806-3
PMID:42676416
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综述 | 本文综述了光在植物-微生物相互作用中对生物胁迫抗性的调控作用,探讨了光如何影响植物免疫、次生代谢及微生物群落行为,并提出了整合光生物学与微生物组研究以开发抗病和气候智能作物的策略 | 将光生物学与微生物组研究相结合,提出利用光响应途径开发抗病和气候智能作物的新思路 | 未提供具体实验数据,仅基于现有研究进行综述,缺乏实证支持 | 探讨光作为调控信号在植物-微生物相互作用中的作用,并评估其在生物胁迫抗性中的潜在应用 | 植物、植物相关微生物组、病原体 | 植物科学、微生物学、光生物学 | 植物病害(由病原体引起的生物胁迫) | 未明确提及 | 未明确提及 | 文献资料 | 不适用(综述文章) | 未明确提及 | 植物 | 未涉及合成生物电路设计 | 农业 |
| 560 | 2026-09-03 |
Enzymatic depolymerization of laboratory waste DNA to a dGMP-containing pool and analytical assessment of dGTP in a crude-lysate guanylate kinase system
2026-Sep-01, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12693-y
PMID:42678604
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研究论文 | 本研究探究了从实验室废弃DNA中通过酶促解聚和粗裂解液酶联反应生成dGTP的可行性,并进行了分析验证。 | 首次利用废弃DNA作为底物,通过简化粗裂解液酶级联反应实现dGMP的生成并确认dGTP的存在。 | dGTP的DNA依赖性生成未能证实,且未进行定量分析,仅为概念验证。 | 探索将实验室废弃DNA转化为脱氧鸟苷三磷酸(dGTP)的酶促方法。 | 实验室废弃DNA、重组酿酒酵母鸟苷酸激酶(GUK1)、E. coli BL21(DE3)表达系统、S1核酸酶、粗裂解液。 | 合成生物学 | NA | S1核酸酶水解、重组蛋白表达(SDS-PAGE)、离子对HPLC、高分辨Q-TOF LC-MS/MS、酶联反应。 | NA | 色谱图、质谱数据 | 3个生物重复(用于比较重组GUK1和空载体对照)。 | 重组蛋白表达(异源表达) | 大肠杆菌(E. coli BL21(DE3)) | 粗裂解液酶级联反应(包括GUK1、内源NDPK和丙酮酸激酶/PEP ATP再生系统)。 | 工业生物技术 |