合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1106 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-05-09 |
Transforming toxic element remediation: a necessary path for 21st-century food security
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.10.008
PMID:41139567
|
综述论文 | 探讨利用基因编辑、合成生物学和混合技术修复有毒元素污染，以保障21世纪粮食安全 | 提出基因编辑和合成生物学等新兴技术可实现可扩展、永久性的土壤解毒和污染土地恢复，超越传统临时修复方法 | NA | 阐述新兴修复技术在应对全球有毒元素污染和保障粮食安全方面的潜力和必要性 | 有毒元素污染的土壤和农业系统 | 数字病理学 | NA | 基因编辑、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物 | 修复途径、生物传感器 | 农业, 环境 |
| 562 | 2026-05-09 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
|
研究论文 | 提出一种基于人工神经网络（ANN）的框架，用于酿酒酵母中情境感知的合成启动子设计，实现转录网络的重新编程 | 首次实现启动子与转录因子结合位点的情境感知重组，无需先验实验表征即可实现高达98.4%的抑制率，并成功重编程酵母转录网络 | 未提及模型的可推广性至其他物种或复杂多转录因子系统的验证，且筛选的启动子数量有限 | 开发可扩展的预测方法用于工程化调控序列和重编程转录逻辑 | 酿酒酵母天然启动子与TetR和Mig1转录因子结合位点的兼容性 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络（ANN） | ANN | 序列数据 | 共筛选6,011个天然酵母启动子 | 启动子工程 | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组，葡萄糖依赖性基因调控回路 | 工业生物技术 |
| 563 | 2026-05-09 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
|
protocol | 提供ENGRAM实验的逐步操作协议及数据分析方法，阐述其设计要点、优势与局限，并展示在多路信号记录和高通量CRE筛选中的应用 | ENGRAM利用引物编辑介导的插入记录顺式调控元件活性，支持高多重性（如4碱基对插入可代表多达256种不同CRE），并与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 未明确提及自身局限，但可能包括对分子生物学和细胞培养技能的要求，以及实验周期约5-6周 | 通过ENGRAM实现生物信息的多通道基因组记录，为研究时间动态生物学提供新范式 | 顺式调控元件及其在哺乳动物细胞中的活性 | 合成生物学 | NA | 引物编辑、DNA测序 | NA | 基因组序列数据 | NA | 引物编辑 | 哺乳动物细胞 | ENGRAM记录电路（增强子介导的多路活动基因组记录） | 分子记录、高通量筛药 |
| 564 | 2026-05-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-01-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
|
综述 | 本文探讨了人工智能在细胞生物学发现中的应用，涵盖显微镜、成像、药物发现和合成生物学等领域 | 系统总结了AI在单细胞分辨率分析、复杂模式识别和细胞行为预测方面的进展 | 数据质量要求高、模型可解释性不足以及AI工具普及性有限 | 综述AI在细胞生物学中的应用与未来方向 | 细胞生物学数据、显微图像、转录组数据等 | 机器学习和数字病理学交叉领域 | 不适用 | 深度学习、单细胞转录组分析 | CNN | 图像、文本、基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 医学, 基础研究 |
| 565 | 2026-05-09 |
The renaissance of Salmonella-based cancer therapy: convergence of AI, synthetic circuits, and TME remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1790215
PMID:42099610
|
综述 | 综述沙门氏菌癌症治疗领域的复兴，探讨人工智能、合成电路和肿瘤微环境重塑如何克服历史障碍 | 提出从静态减毒到动态理性设计的转变，强调合成生物学和人工智能工具（如Cello和SHASI-ML）如何使沙门氏菌成为智能微机器人，实现安全递送和精准免疫刺激 | 未明确讨论免疫原性-安全性权衡中仍存在的挑战或大规模临床转化的潜在障碍 | 阐述下一代工程沙门氏菌作为免疫调节因子将冷肿瘤转变为热环境，增强检查点抑制剂和化疗效果的潜力 | 减毒沙门氏菌及其在肿瘤微环境中的工程化应用 | 合成生物学, 人工智能 | 癌症 | 合成生物学, 人工智能 | Cello, SHASI-ML | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cello | 沙门氏菌 | 同步裂解系统、缺氧响应逻辑门、代谢通路（如天冬酰胺耗竭） | 医学 |
| 566 | 2026-05-09 |
BPP Bioportide™-mediated (genetic) transformation in cyanobacteria: a rapid and simplified approach for efficient molecular translocation and genome modification
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1812316
PMID:42100039
|
研究论文 | 本文系统评估了一种基于蛋白质的DNA递送系统BPP Bioportide™在多种蓝藻菌株中的转化效率，并优化了关键因素 | 首次将BPP Bioportide™蛋白递送系统应用于蓝藻基因工程，实现低DNA输入量（10 ng）下的高效转化，并成功改造了非模式菌株 | DNA摄取窗口较窄，且转化效率受DNA类型、宿主倍性和筛选条件等多因素影响 | 开发一种快速、简化且广谱的蓝藻遗传转化方法 | 蓝藻菌株包括集胞藻PCC 6803、聚球藻PCC 7942和蓝丝藻UTEX 3153 | 合成生物学 | NA | BPP Bioportide™介导的DNA递送、同源重组、菌落PCR | NA | NA | 三种蓝藻菌株 | BPP Bioportide™蛋白递送系统 | 集胞藻PCC 6803, 聚球藻PCC 7942, 蓝丝藻UTEX 3153 | NA | 工业生物技术, 碳中和生物技术 |
| 567 | 2026-05-09 |
Plant microbiome engineering: from inoculation to genome editing
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1781381
PMID:42100688
|
综述 | 整合分子遗传学、微生物生态学和系统级微生物组设计，将植物及其微生物组视为可工程化的全生物，并探讨从接种到基因组编辑的微生物组工程策略 | 首次在一个统一的概念框架内整合CRISPR介导的植物-微生物工程、微生物组的生态稳定性以及气候适应性农业应用，并提出AI辅助决策框架和全生物工程化视角 | 生态稳定性、性状权衡、生物安全和监管挑战限制了大规模部署 | 提出一个从经验性接种向预测性、可持续和社会责任性农业生物技术转变的整合框架 | 植物相关微生物组及其与植物的相互作用 | 机器学习, 数字农业 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, RNA干扰, 合成微生物群落设计, 多组学分析, 机器学习和生态建模 | 机器学习模型, 生态模型 | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, RNA干扰 | 植物, 微生物 | NA | 农业 |
| 568 | 2026-05-08 |
Peptide-Ligand Cooperative Interplay Drives Gold Nanoparticle Encapsulation by Protein Cages
2026-May-07, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73690
PMID:42093323
|
研究论文 | 揭示多肽与配体协同作用驱动金纳米颗粒被蛋白质笼包裹的分子机制 | 通过实验与分子动力学模拟相结合，首次揭示了盐浓度、配体和肽段协同控制金纳米颗粒在包裹蛋白笼中包裹的分子尺度自由能景观，阐明了包裹鲁棒性的分子基础 | NA | 理解金纳米颗粒在包裹蛋白笼中包裹的分子机制，指导生物启发纳米笼的理性设计 | 包裹蛋白笼和金纳米颗粒 | 合成生物学、生物催化、治疗递送 | NA | 分子动力学模拟 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物催化、治疗递送 |
| 569 | 2026-05-08 |
Engineering an Optogenetic pH-Modulator in Bacteria
2026-May-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202524319
PMID:42095488
|
研究论文 | 在细菌中工程化一种光遗传pH调节器，实现细胞外pH的动态可逆切换 | 首次在合成生物学中实现光诱导的微生物pH双向调控系统，结合基因电路、降解标签和环境优化实现长期稳定运行 | 系统在非典型实验室环境中的性能尚需验证，pH调节范围可能受限于细菌代谢特性 | 工程化一种能自动切换细胞外高/低pH状态的微生物系统 | 大肠杆菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 光遗传学调控 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 光诱导启动子控制脲酶表达的基因回路，结合脲酶降解标签 | 工业生物技术, 环境保护 |
| 570 | 2026-05-08 |
A bacterial-derived quorum-sensing platform enables dynamic metabolic control in yeast
2026-May-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.007
PMID:42091429
|
研究论文 | 在酿酒酵母中建立基于细菌的群体感应平台，实现对代谢途径的动态调控 | 通过改造非经典的RpaI/RpaR系统，克服了细菌群体感应在真核生物中功能化的代谢障碍，构建了低泄漏、高灵敏度、宽动态范围的工程回路，并结合CRISPR干扰模块实现了自主转录激活和抑制的双功能级联系统 | 未明确说明局限性 | 在真核微生物中建立功能性细菌群体感应系统，用于动态代谢调控以优化微生物生产 | 酿酒酵母中的代谢途径和生产菌株 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统、CRISPR干扰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 群体感应回路、双功能级联系统（包含信号放大和CRISPR干扰模块） | 工业生物技术 |
| 571 | 2026-05-08 |
Specialized proresolving mediator-loaded extracellular vesicles mitigate pulmonary inflammation
2026-May-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
|
研究论文 | 本文提出一种基于合成生物学的新策略，将促消退脂质介质装载到细胞外囊泡中，以减轻肺部炎症 | 首次利用合成生物学方法选择性装载促消退脂质介质（如resolvin D和E系列）到细胞外囊泡中，通过共表达三种生物合成酶（COX-2、5-LOX、15-LOX）实现 | 未明确提及，但可能存在规模化生产及体内递送效率的挑战 | 开发一种可扩展的装载促消退脂质介质的细胞外囊泡平台，用于治疗急性肺损伤等炎症性疾病 | 人胚胎肾293T细胞、THP-1来源的巨噬细胞、脂多糖处理的小鼠 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 多基因表达载体、细胞外囊泡装载技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 多基因表达载体 | 人胚胎肾293T细胞 | 共表达环氧化酶2、5-脂氧合酶和15-脂氧合酶的代谢通路，用于合成resolvin系列脂质介质 | 医学 |
| 572 | 2026-05-08 |
Functional Characterization and Mutagenesis Studies of a Microbial-like Diterpene Synthase from Huperzia serrata
2026-Apr-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31081329
PMID:42076007
|
research paper | 首次鉴定并表征了蛇足石杉中的微生物样二萜合酶MTPSL1，揭示其多产物特性和关键氨基酸残基对骨架多样性的调控机制 | 首次报道蛇足石杉中的微生物样萜类合酶，通过结构导向的诱变研究揭示了酶功能多样性的分子基础，并发现S224A突变使特定二萜产量提升11.6倍 | 未明确说明该酶的底物特异性和体内代谢网络，以及突变体对其他底物和产物的影响未全面评估 | 探究蛇足石杉中微生物样二萜合酶的存在及其功能，并验证突变工程对产物产量的调控潜力 | 蛇足石杉（Huperzia serrata）中的微生物样二萜合酶MTPSL1及其诱变突变体 | 植物功能基因组学、酶工程、天然产物生物合成 | NA | 转录组分析、异源表达、分子克隆、定点诱变、质谱分析、核磁共振 | NA | 转录组数据、化合物结构数据 | 1个MTPSL1酶及其S224A突变体 | 定点诱变、异源表达 | 大肠杆菌（E. coli） | 二萜生物合成途径（针对spatane、prenylkelsoene型和biflorane三类骨架） | 天然产物生物合成、蛋白质工程、合成生物学 |
| 573 | 2026-05-08 |
Identification and characterization of two novel Acinetobacter species capable of degrading polyester
2026-Apr-09, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02491-25
PMID:41954411
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了两株能够降解多种聚酯塑料的新型不动杆菌菌株 | 发现并描述了两个新型不动杆菌分类单元（新种CAAS 2-6和新亚种CAAS 2-13），它们能利用五种主要商品聚酯作为唯一碳源，并鉴定了关键解聚酶多铜氧化酶和烷烃羟化酶 | NA | 鉴定和表征具有聚酯降解能力的新型不动杆菌菌株，扩展其降解塑料的代谢能力并提供生物修复候选菌 | 两株从垃圾渗滤液和草莓农田分离的不动杆菌菌株CAAS 2-6和CAAS 2-13 | 微生物学 | NA | 系统发育分析,基因组比较,酶解聚合实验 | NA | 基因组序列数据 | 两株细菌菌株 | NA | 不动杆菌 | NA | 环境生物修复,工业生物技术 |
| 574 | 2026-05-08 |
A Clozapine-Responsive GPCR-Based Gene Switch for Pharmacological Control of Gene Expression in Mammalian Cells and In Vivo
2026-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083381
PMID:42074026
|
研究论文 | 报道一种基于氯氮平响应性GPCR的基因开关，用于在哺乳动物细胞和体内实现药物可控的基因表达 | 首次将设计药物特异性激活受体与信号依赖性转录控制耦合，构建出临床相关的人源GPCR基因调控平台，并利用口服氯氮平实现体内低剂量有效调控 | 该基因开关的长期稳定性、免疫原性及在复杂疾病模型中的治疗效果尚需进一步验证 | 开发一种安全、临床兼容的药物调控基因表达系统，用于哺乳动物合成生物学和细胞治疗 | 哺乳动物细胞及C57BL/6J小鼠体内的工程化报告细胞 | 合成生物学 | NA | GPCR信号通路、cAMP/钙响应合成启动子 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠体内植入的藻酸盐包封报告细胞 | NA | 哺乳动物细胞、C57BL/6J小鼠 | 氯氮平响应性基因开关，耦合GPCR与cAMP或钙响应合成启动子 | 医学 |
| 575 | 2026-05-08 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
|
研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物狗尾草中构建了配体诱导合成电路，通过远程传感技术检测内源性色素生成 | 首次在单子叶植物中实现配体诱导的内源性花青素通路激活，并结合高光谱成像与判别性目标表征方法进行非破坏性远程检测 | 尚未在更大范围单子叶作物或田间环境中验证系统稳定性和普适性，配体渗透效率可能受物理屏障影响 | 探索单子叶植物中诱导型合成电路的应用，实现内源性色素生成的可控诱导与远程传感 | 狗尾草（Setaria viridis）原生质体及整株植物 | 合成生物学 | NA | 高光谱成像，判别性目标表征 | NA | 高光谱图像 | 狗尾草原生质体及整株植物样本 | 传感器电路构建 | 狗尾草（Setaria viridis） | 配体诱导型传感器电路，激活内源性花青素通路 | 农业 |
| 576 | 2026-05-08 |
Bioorthogonal and synthetic biology-engineered bacterial outer membrane vesicles for enhanced photo-immunotherapy
2026-04, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.02.044
PMID:41740694
|
研究论文 | 工程化细菌外膜囊泡用于增强光免疫治疗 | 结合合成生物学与生物正交化学，双重改造细菌外膜囊泡，同时实现基因工程表达IL-2、载光敏剂ICG及生物正交靶向，形成协同抗肿瘤免疫平台 | 未提及长期安全性评估、大规模制备工艺及临床转化可行性验证 | 开发兼具免疫激活、光热治疗与精准肿瘤靶向的多功能OMV纳米载体，用于增强乳腺癌的光免疫治疗 | 细菌外膜囊泡（OMVs） | 合成生物学 | 乳腺癌 | 电穿孔、代谢糖工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、生物正交化学 | 细菌 | IL-2表达模块、N3/DBCO生物正交标记系统 | 医学 |
| 577 | 2026-05-08 |
3D Expansion-PALM (PhotoActivated Localization Microscopy) Dissects Protein-Protein Interactions Down to the Molecular Scale in Bacteria
2026-Mar-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14040772
PMID:42075168
|
研究论文 | 通过结合膨胀显微镜和光激活定位显微镜，在细菌中实现约3纳米空间分辨率的双色三维单分子定位，用于研究蛋白质-蛋白质相互作用 | 优化细菌中的膨胀显微镜方案实现4倍各向同性膨胀，最小化色差和信号串扰，通过高选择性斜入射照明提高单分子灵敏度 | NA | 发展一种有效方法，用于原核生物和高密度样品中分子组织的研究 | 参与组氨酸生物合成的HisF和HisH蛋白质 | 计算机视觉 | NA | 三维膨胀光激活定位显微镜 | NA | 图像 | 细菌细胞中的HisF和HisH蛋白质 | NA | 细菌 | NA | 微生物学, 合成生物学, 细胞生物物理学 |
| 578 | 2026-05-08 |
Next-Generation Immune Checkpoints and Tumor Microenvironment Modulation in Cancer Immunotherapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7864229
PMID:41811823
|
综述 | 全面探讨下一代免疫检查点和肿瘤微环境调节在癌症免疫治疗中的应用，包括共抑制和共刺激通路、联合治疗策略及精准免疫肿瘤学框架 | 系统总结下一代免疫检查点（如LAG-3、TIM-3、TIGIT等共抑制分子和ICOS、OX40等共刺激分子）的机制与临床证据，并整合免疫代谢、先天免疫感应、细胞因子信号、维生素D和肠道菌群等TME调节策略，提出基于多组学、系统生物学和人工智能的精准免疫肿瘤学框架 | 治疗效益仍局限于部分患者，主要由于免疫逃逸、肿瘤异质性和肿瘤微环境的免疫抑制特性 | 综述下一代免疫检查点和肿瘤微环境调节在癌症免疫治疗中的进展、挑战和未来方向 | 下一代免疫检查点（共抑制和共刺激通路）、肿瘤微环境调节策略（免疫代谢、先天免疫、细胞因子、维生素D、肠道菌群）、临床试验数据 | NA | 多种恶性肿瘤 | 多组学分析、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 579 | 2026-05-07 |
Proanthocyanidins: structure, biosynthesis, regulation, and structure-activity relationships
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100047
PMID:42088953
|
综述 | 综述了原花青素的结构多样性、生物合成途径、调控网络及应用前景 | 系统阐述了原花青素聚合的非酶促机制、MYB-bHLH-WD40核心转录复合物的调控作用，并指出了结构-活性关系的关键知识空白 | 未阐明聚合反应的细胞定位、聚合机制及精确的结构-活性关系 | 总结原花青素研究最新进展，明确未来研究方向 | 原花青素 | NA | NA | 基因编辑， 合成生物学， 纯化技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 医疗， 食品， 动物营养 |
| 580 | 2026-05-07 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-May-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
|
research paper | 通过代谢工程改造出芽短梗霉菌高效生产葡萄糖酸 | 首次通过敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素关键基因并结合过表达内源葡萄糖氧化酶基因，构建出目前报道产量最高的葡萄糖酸生产菌株 | 未提及该工程菌株在工业规模化生产中的长期稳定性和经济性评估 | 高效生产葡萄糖酸 | 出芽短梗霉菌株TSYW-58 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 一个出发菌株和多个工程菌株 | CRISPR-Cas9等基因编辑工具（未明确说明具体工具） | Aureobasidium melanogenum（出芽短梗霉） | 葡萄糖氧化酶过表达及副产物合成通路敲除 | 工业生物技术 |