合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1812 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-09-03 |
ERAD-level gene switches for on-demand protein secretion and rapidly controlled gene therapies
2026-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76203-1
PMID:42669721
|
研究论文 | 本文开发了基于内质网相关降解（ERAD）的基因开关，用于诱导型、可调型和可逆型蛋白分泌，并通过AAV介导实现体内远程调控的基因治疗 | 首次利用ERAD-中心策略设计条件性降解子标签，实现对治疗性蛋白分泌的快速、可逆调控，无需复杂基因电路，且与AAV基因传递系统兼容 | 未明确提及，可能包括需要进一步验证临床安全性和长期效果 | 开发可快速响应、远程控制的基因开关，以按需调控治疗性蛋白分泌，用于基因治疗，特别是心血管疾病和慢性疼痛 | 治疗性蛋白，雄性小鼠，AAV载体，心血管疾病和慢性疼痛 | 基因治疗 | 心血管疾病，慢性疼痛 | AAV介导的基因传递，内质网相关降解（ERAD），条件性降解子系统 | NA | 实验数据（包括体内小鼠数据） | NA（未具体说明） | NA | 小鼠（体内） | 条件性降解子标签结合ERAD的基因开关 | 医学 |
| 562 | 2026-09-03 |
From Negative Feedback to Integrated Control: Recombinase-Based Strategies for Mitigating Resource Competition
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_14
PMID:42420734
|
综述 | 本文讨论了基于重组酶的负反馈与前馈控制策略，用于缓解合成生物学中资源竞争导致的模块间干扰，提高基因系统的稳健性和可预测性。 | 提出了Re-NF和Re-NF-FF控制器，利用重组酶介导的启动子翻转实现负反馈和整合前馈控制，以平衡资源分配并减少串扰。 | 未提及具体局限性。 | 开发并验证重组酶-based 控制策略，以减轻宿主细胞资源竞争对独立基因模块的干扰，提高合成基因线路的模块化、稳健性和可预测性。 | 合成基因线路中的模块控制器（Re-NF和Re-NF-FF）及其在宿主细胞中的性能。 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的启动子翻转 | NA | 文本（概念性综述） | NA | 重组酶 | NA | 负反馈控制器（Re-NF），整合负反馈与前馈的控制器（Re-NF-FF） | 工业生物技术，医学 |
| 563 | 2026-09-03 |
Icariin: Unraveling Ferroptosis Mechanisms, Metabolic Networks, and Innovative Therapy Strategies
2026, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X26500655
PMID:42634093
|
综述 | 本文系统综述了淫羊藿苷（ICA）在铁死亡中的双向调控机制、代谢网络及其创新治疗策略，涵盖从机制到治疗再到代谢的完整谱系 | 首次系统阐明ICA作为铁死亡双向调节剂的“机制-治疗-代谢”连续谱作用，揭示其通过Nrf2/GPX4轴作为氧化还原稳态的“分子开关”，并提出纳米递送和合成生物学策略优化其代谢轮廓 | ICA低系统生物利用度限制临床转化，且缺乏原始数据的非英语研究和会议摘要被排除，可能引入选择偏倚 | 系统阐明ICA在铁死亡中的作用机制、代谢网络及其作为铁死亡靶向治疗策略的潜力，以推动复杂疾病治疗开发 | 淫羊藿苷（ICA）及其在神经退行性疾病和耐药癌症模型中的铁死亡调控作用 | 药理学、系统生物学 | 神经退行性疾病、癌症 | 文献综述（基于PubMed、ScienceDirect、Web of Science和Google Scholar数据库检索） | NA | 文献数据 | NA（综述2015-2025年间相关文献） | NA | NA | NA | 医学 |
| 564 | 2026-09-03 |
New-to-Nature Photoenzymatic Catalysis
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5257-2_2
PMID:42681173
|
研究论文 | 本文描述了一种制备和纯化来自Escherichia coli BL21(DE3)酶的基础实验方案，包括克隆表达、纯化、浓度测定及光酶催化示例反应，为合成生物学研究者提供实用指导。 | 提出了新到自然界的光酶催化实验方法，用于控制光化学和生物催化中的化学选择性和对映选择性，展示了合成化学的新前沿。 | 摘要中未提及具体局限性。 | 为光酶催化提供基础实验方案和实践指导，促进合成生物学研究。 | Escherichia coli BL21(DE3)菌株及其表达的酶。 | 生物技术 | NA | 克隆与表达、蛋白质纯化、浓度测定、光酶催化 | NA | 实验数据 | 未提及具体样本数量，涉及E. coli BL21(DE3)菌株 | NA | 大肠杆菌 (E. coli) | NA | 生物技术、合成化学 |
| 565 | 2026-09-03 |
Fluorescence-Based Assays to Evaluate the Functionality of Phage-Derived Regulatory Elements for Applications in Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5257-2_18
PMID:42681189
|
研究论文 | 提出了一种基于荧光的流程，用于体内表征噬菌体来源的启动子和终止子，以扩展合成生物学工具包 | 利用噬菌体来源的调控元件，结合SEVAtile DNA组装方法，实现对宿主特异和噬菌体特异启动子及终止子的规模化表征，适用于非模式细菌宿主 | 仅以荧光报告基因和板读数器测量为基础，可能无法完全反映体内复杂环境中的调控效果 | 开发可扩展的工作流程，以表征和验证噬菌体来源的调控元件，扩展合成生物学工具包至多样细菌底盘 | 假单胞菌绿针假单胞菌（Pseudomonas chlororaphis）中的噬菌体来源启动子和终止子 | 合成生物学 | NA | 荧光测定 | NA | 荧光测量数据 | 多种启动子和终止子构建体，具体数量未说明 | SEVAtile DNA组装, 电穿孔 | 假单胞菌绿针假单胞菌（Pseudomonas chlororaphis） | 宿主特异和噬菌体特异启动子及终止子构建体，含msfGFP和mCherry报告基因 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 566 | 2026-09-02 |
Engineered bacterial therapeutics from synthetic biology to clinical translation: A multi-database scientometric analysis, 2000-2026
2026-Dec, Human vaccines & immunotherapeutics
IF:4.1Q2
DOI:10.1080/21645515.2026.2720162
PMID:42641146
|
研究论文 | 通过多数据库文献计量分析，描绘了工程细菌疗法从合成生物学到临床转化的知识结构、合作模式和转化方向 | 首次采用多数据库（Web of Science、Scopus、PubMed）结合多种文献计量工具（CiteSpace、VOSviewer、bibliometrix）综合分析工程细菌疗法领域2000至2026年的研究趋势和主题演变 | 仅包含英文文献，且2026年数据不完整；依赖数据库索引，可能遗漏未收录的相关研究 | 绘制工程细菌疗法领域的知识结构、合作模式和转化方向，以指导未来研究和临床转化 | 工程细菌疗法相关的出版物，包括研究论文和综述 | 合成生物学、文献计量学 | 癌症、肠道疾病（涉及） | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 1,730篇英文文章和综述 | NA | 细菌 | 生物电路设计（用于感应、递送、免疫调节等功能） | 医学、工业生物技术 |
| 567 | 2026-09-02 |
Methylotrophic yeast engineering for secreted protein production via precision fermentation: food ingredient proteins and synthetic biology strategies
2026-Aug-29, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102532
PMID:42668082
|
综述 | 本文综述了甲基营养型酵母在精密发酵中用于生产食品蛋白质成分的工程化进展，重点关注Komagataella phaffii，并讨论了合成生物学和代谢工程策略。 | 系统梳理了甲基营养型酵母在食品蛋白生产中的应用，特别聚焦于基因组工程、基因表达工具、蛋白分泌途径工程和糖基化工程，以满足产量和质量的双重目标。 | 未提及具体实验数据或定量比较，可能缺乏对实际生产挑战的深入分析。 | 探讨甲基营养型酵母在食品蛋白生产中的工程化策略，以提升分泌效率和时空产量。 | 甲基营养型酵母，特别是Komagataella phaffii。 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、基因表达工具 | NA | 文献数据、文本 | NA | NA | Komagataella phaffii | 蛋白分泌途径工程、糖基化工程 | 食品工业 |
| 568 | 2026-09-02 |
[Construction and practice of a talent training model for synthetic biology]
2026-Aug-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.260172
PMID:42638071
|
研究论文 | 本文探讨了江南大学在合成生物学人才培养模式上的改革措施，包括课程体系、实践教育体系及数字化平台建设 | 创新性地提出了跨学科融合、工程实践导向和数字化智能化驱动的合成生物学人才培养范式 | 未提及具体局限性 | 总结江南大学合成生物学专业及人才培养模式的改革举措，为同类院校提供参考 | 江南大学合成生物学专业的人才培养体系 | 教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 569 | 2026-08-31 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
|
研究论文 | 本文介绍了iFLinkC-EZ，一种基于iFLinkC框架的可扩展且自动化的方法，用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | 通过遗传手段纯化DNA组装产物，简化了组装过程并使其兼容机器人自动化 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种简化且自动化的DNA组装方法，用于复杂融合蛋白和多基因表达构建体的高效构建 | 多色荧光融合蛋白、多顺反子表达构建体、酵母表面展示重组结合蛋白 | 合成生物学 | NA | iFLinkC克隆技术 | NA | DNA序列 | 未明确说明样本数量，但涉及超过80代的稳定性实验 | iFLinkC-EZ | 酵母 | 多顺反子表达构建体、融合蛋白表达构建体 | 生物技术、基础研究 |
| 570 | 2026-08-31 |
Self-sufficient killing of malignant tumors by an engineered cancer-selective gene circuit
2026-Aug-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102936
PMID:42492518
|
研究论文 | 该论文介绍了一种通过工程化基因电路选择性杀死恶性肿瘤细胞的方法，该电路利用机器学习指导的随机森林框架开发出癌症选择性启动子，并在腺病毒载体中实现肿瘤限制性复制和长期肿瘤抑制。 | 创新点在于利用机器学习指导的随机森林框架设计癌症选择性启动子，该启动子仅在ETS转录因子过表达或基因融合事件中激活，而在正常组织中保持沉默，实现了严格意义上的癌症特异性。 | 论文摘要未明确提及研究局限性。 | 开发一种能够选择性消除肿瘤细胞的基因治疗策略，克服合成生物学和溶瘤病毒疗法的关键障碍。 | ETS转录因子过表达或基因融合的癌细胞，以及携带转移性肺肿瘤的小鼠模型。 | 合成生物学、机器学习、肿瘤学 | 肺癌 | 基因电路工程、腺病毒载体递送 | 随机森林 | 基因组数据、实验数据 | 小鼠模型（具体数量未提及） | 未提及 | 小鼠 | 癌症选择性基因电路，包含癌症选择性启动子P，用于驱动腺病毒复制。 | 医学、肿瘤治疗 |
| 571 | 2026-08-31 |
Synthetically engineered probiotic suppresses colorectal cancer via inhibition of Wnt/β-catenin signaling
2026-Aug-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102913
PMID:42612617
|
研究论文 | 该论文开发了一种合成生物学改造的益生菌，通过抑制Wnt/β-catenin信号通路来治疗结直肠癌，并实现了非侵入性诊断和靶向治疗的结合 | 首次利用鸟氨酸响应性生物发光报告系统和局部释放DKK3的工程益生菌，将诊断与治疗功能整合于单一平台，并在多种临床前模型及患者来源类器官和异种移植模型中验证了其抗癌疗效 | 摘要未提及具体的局限性，如潜在的安全性、长期疗效或临床转化障碍 | 开发一种基于工程益生菌的结直肠癌诊断和治疗平台，通过抑制Wnt/β-catenin信号通路以减缓肿瘤生长，并改善患者预后 | 结直肠癌小鼠模型、结直肠癌患者、工程化大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 合成生物学、肿瘤学 | 结直肠癌 | 粪便代谢组学分析、基因工程改造细菌 | 生物发光报告系统、基因表达系统 | 代谢组学数据、临床前模型数据（小鼠模型、患者来源类器官和异种移植模型） | 涉及结直肠癌小鼠模型和患者样本，具体数量未提及 | 基因工程技术 | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 鸟氨酸响应性生物发光报告系统；局部释放Dickkopf 3（DKK3）的基因回路 | 医学、预防肿瘤学 |
| 572 | 2026-08-31 |
Chemical Synthesis of Mirror-Image Proteins Reveals Chirality-Dependent Cellular Uptake Mediated by a Cell-Penetrating Peptide
2026-08-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c03792
PMID:42307060
|
研究论文 | 通过化学合成镜像蛋白，揭示了细胞穿透肽介导的细胞摄取具有手性依赖性 | 首次系统性地研究货物手性对细胞摄取的影响，同时保持递送载体恒定，发现天然L型货物比镜像D型货物更易被细胞摄取 | 未明确提及研究的局限性 | 探究镜像肽和蛋白质的细胞内摄取效率与天然L-形式相比的情况 | 三种不同大小和结构复杂性的模型货物，包括L型和D型构型，以及环状十精氨酸细胞穿透肽 | 化学生物学 | 不适用 | 化学合成、流式细胞术、凝胶分析、共聚焦显微镜 | 不适用 | 细胞图像、流式细胞术数据 | 多种哺乳动物细胞系 | 化学合成 | 哺乳动物细胞 | 不适用 | 医学、合成生物学 |
| 573 | 2026-06-28 |
Better synthetic biology outcomes through balanced push-pull engineering
2026-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag437
PMID:42361298
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 574 | 2026-08-30 |
Autoinducer 2 as a universal language in microbial consortia: decoding molecular mechanisms, ecological impacts, and application
2026-12-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2615494
PMID:41574816
|
综述 | 本文系统综述了自诱导物2（AI-2）在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用，涵盖其结构动态、受体多样性、信号转导、代谢调控和多种应用领域 | 首次系统整合AI-2的双重结构动态（S-THMF-硼酸/R-THMF互变）及其环境依赖角色，并详细探讨了影响AI-2产生的内外部因素，为微生物通信在化学工程和环境可持续性中的应用提供了路线图 | 文章指出了AI-2介导的空间异质性和多群体感应系统协调方面的知识空白，未提供实验验证 | 解码AI-2在微生物群落中的分子机制、生态影响及应用，为利用微生物通信提供指导 | 自诱导物2（AI-2）及其介导的微生物群落交互 | 微生物学，合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 宿主健康，农业，工业，环境生态 |
| 575 | 2026-08-30 |
Miniaturized CRISPR: Ultra Compact Systems for In Vivo Delivery and Portable Diagnostics
2026-Sep, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-026-04046-4
PMID:41712125
|
综述 | 本文总结了小型化CRISPR系统（如Cas12f、CasX和迷你Cas9）在体内递送和便携式诊断中的应用进展，并讨论了相关挑战与未来机遇。 | 强调了超紧凑CRISPR系统相比传统SpCas9在分子量小、结构简单方面的优势，并探讨了AI辅助蛋白设计和合成生物学在该领域的应用潜力。 | 综述性文章，未包含原始实验数据；讨论了脱靶效应、递送障碍和监管要求等未解决的挑战。 | 总结小型化CRISPR系统在治疗性基因编辑和便携式诊断平台中的应用进展及未来发展方向。 | 小型化CRISPR系统（Cas12f、CasX、迷你Cas9）及其在体内基因编辑和诊断中的应用。 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12f, CRISPR-CasX | NA | NA | 医学, 诊断 |
| 576 | 2026-08-30 |
Advances in prime editing: Molecular innovations, Large-fragment engineering, and AI-driven design
2026-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2026.100104
PMID:42662231
|
综述 | 本文综述了引物编辑技术的最新进展，包括核心组件的分子创新、大片段编辑策略和人工智能驱动的设计工具，并探讨其在医学、农业和合成生物学中的广泛应用。 | 全面总结了引物编辑在Cas蛋白变体、逆转录酶工程和pegRNA设计上的迭代创新，并重点介绍了TwinPE、PASTE和PrimeRoot等大片段编辑平台以及AI驱动的设计工具对编辑效率和可预测性的提升。 | 未明确讨论引物编辑技术当前的局限性，如脱靶效应、递送挑战或临床应用中的障碍。 | 综述引物编辑技术的分子创新、大片段工程和AI设计方法，展示其作为可编程和可扩展基因组编辑平台的潜力。 | 引物编辑技术及其核心组件，包括Cas蛋白、逆转录酶、pegRNA和大片段编辑平台。 | 基因组编辑 | NA | 引物编辑 | NA | NA | NA | NA | 多种生物系统 | NA | 医学, 农业, 合成生物学 |
| 577 | 2026-08-30 |
Revisiting plant-microbe interaction mechanisms for developing efficient biostimulants
2026-Aug-28, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01575-2
PMID:42663807
|
综述 | 本文综述了根际通讯和根系分泌物介导的信号机制，探讨了促进有益植物-微生物互作的策略，并分析了影响其田间应用的技术挑战，旨在开发高效微生物生物刺激素。 | 重新审视植物-微生物互作的基本机制，整合微生物群落、多组学技术、合成生物学和制剂技术等新兴策略，以开发可规模化田间验证的微生物生物刺激素。 | 当前对植物如何与微生物通讯、建立根系定殖和适应田间环境的机制理解不足，导致微生物生物肥料应用效果不稳定。 | 通过深入理解根际通讯和根系分泌物介导的信号机制，开发高效、可持续的微生物生物刺激素，促进可持续农业发展。 | 植物根际微生物互作，包括根际微生物群落、根系分泌物和信号分子。 | 微生物组学 | NA | 多组学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物（根际微生物） | 微生物群落信号通路 | 农业 |
| 578 | 2026-08-30 |
Integrating Machine Learning and Transcriptomics to Enhance β‑Carotene Production in Saccharomyces cerevisiae
2026-Aug-25, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.6c06012
PMID:42662202
|
研究论文 | 本研究利用机器学习指导的组合菌株工程和转录组分析，在酿酒酵母中增强β-胡萝卜素的产量 | 将XGBoost机器学习模型应用于DBTL循环以预测复杂的组合设计，并结合转录组洞察指导铁补充策略，从而显著提高β-胡萝卜素产量 | 未明确说明局限性 | 通过合成生物学和机器学习优化微生物生产，增强β-胡萝卜素在酿酒酵母中的产量 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其甲羟戊酸（MVA）途径 | 合成生物学、机器学习 | NA | 转录组学（RNA-seq） | XGBoost | 转录组数据、产量数据 | 涉及多个菌株变体及培养条件（未提供具体样本数） | 启动子和终止子组合工程 | 酿酒酵母 | MVA途径的限速酶表达微调（通过启动子和终止子组合） | 工业生物技术 |
| 579 | 2026-08-30 |
Closing the Loop with Gates: A Scale-up-Gated Design-Build-Test-Learn Framework for Industrial Fermentation
2026-Aug-19, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14081830
PMID:42655176
|
综述 | 本文提出了一种“放大门控的DBTL”框架，通过在每个迭代阶段设置明确的决策门，以缩小实验室创新与工业发酵生产之间的差距。 | 在DBTL循环的每个阶段强制加入“决策门”，利用规模缩小模拟、下游加工兼容性、工业稳健性、技术经济分析和生命周期评估等指标作为评估和收敛标准，弥补了传统DBTL框架仅追求实验室最优而忽视工业可行性的缺陷。 | 分析基于定性跨部门研究，缺乏定量数据支撑，且所提框架的实际应用效果尚需进一步验证。 | 提出一种“放大门控的DBTL”框架，以促进合成生物学和人工智能在工业发酵中的整合，并从战略层面提出实现自主、规模感知生物制造的前提条件。 | 食品、制药、农业和能源行业的发酵过程。 | 合成生物学、人工智能 | NA | 规模缩小模拟、技术经济分析、生命周期评估 | NA | 定性数据 | NA | NA | NA | NA | 食品、医药、农业、能源 |
| 580 | 2026-08-30 |
Flax Lignans: From Biosynthetic Regulation to Biological Activities
2026-Aug-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27167162
PMID:42653167
|
综述 | 本文综述了亚麻木酚素的生物合成途径、关键酶、调控机制及其多种生物活性，并讨论了工业应用中的限制和未来策略。 | 系统总结了亚麻木酚素的生物合成调控和生物活性，并提出合成生物学、分子育种和绿色提取技术等前沿解决方案，以促进其工业转化。 | 工业应用中存在提取工艺复杂、生产成本高、质量标准不统一和临床证据不足等限制。 | 为亚麻木酚素在食品、制药和化妆品领域的机制研究、产品开发和工业转化提供概念参考。 | 亚麻木酚素，特别是开环异落叶松脂素二葡萄糖苷。 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 亚麻 | NA | 食品、制药、化妆品 |