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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-06-16 |
Transplantation of encapsulated fecal microbiota: research progress and future trends
2026-Jun-13, World journal of pediatrics : WJP
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s12519-026-01056-z
PMID:42288685
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综述 | 综述了封装粪便微生物群移植的研究进展与未来趋势,从经验性转移向工程化生物治疗转变 | 强调封装FMT作为活性生物治疗产品的关键制剂,推动从全群落微生物制剂向合成生物学创新的转变 | 缺乏大规模随机对照试验,尤其是儿科研究;监管定义不一致且国际指南尚未建立 | 总结封装FMT的研究进展和监管挑战,探索未来发展方向以提升标准化和个性化治疗 | 封装粪便微生物群移植的临床研究,包括成人和儿科患者 | NA | 肠道疾病,复发性艰难梭菌感染 | 封装技术 | NA | 文献和数据综合 | NA | NA | 人类肠道微生物群 | NA | 医学 |
| 562 | 2026-06-16 |
Enhancing small-molecule-mediated translational control through multivalent RNA aptamers
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag592
PMID:42273917
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研究论文 | 提出一种基于多价RNA适配体的通用平台,通过剪接调控显著增强小分子介导的翻译控制 | 通过多价适配体设计,将弱适配体(如茶碱或四环素适配体)的诱导水平从不足10倍提升至超过100倍,实现超过一个数量级的改进,并实现多路复用和正交控制 | 未明确说明局限性,可能依赖特定配体-适配体对的优化 | 开发一种通用且可适应的RNA平台,扩展小分子调控蛋白表达的工具箱 | 小分子RNA开关及多价适配体设计 | 合成生物学 | NA | RNA适配体设计、替代剪接调控 | NA | NA | NA | NA | NA | 多价适配体电路,增强配体响应性蛋白表达 | 合成生物学, 医学 |
| 563 | 2026-06-16 |
Cascading recombinase memory switch for programmable and stable gene expression in Pseudomonas putida
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag589
PMID:42268684
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研究论文 | 在恶臭假单胞菌中构建基于整合酶的级联触发开关,实现稳定可控的基因表达 | 首次在非模式细菌恶臭假单胞菌中设计并验证整合酶级联记忆开关,通过串联正交T7 RNA聚合酶系统扩展输出模块性,并应用于连续生物工艺中的催化生物膜控制 | 研究未长期评估开关在复杂工业环境中的稳定性,且当前设计依赖特定诱导物鼠李糖 | 开发可在工业相关微生物中稳定工作的遗传记忆开关,用于生物过程调控 | 恶臭假单胞菌中的基因表达开关系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学遗传电路设计 | NA | NA | NA | Bxb1丝氨酸整合酶 | 恶臭假单胞菌 | 级联触发开关,包含鼠李糖诱导模块、Bxb1整合酶驱动的翻转开关、正交T7 RNA聚合酶基因及PT7驱动的目标模块 | 工业生物技术 |
| 564 | 2026-06-16 |
Ultra-rapid and high-titer biomanufacturing of trehalose 6-phosphate by an in vitro synthetic biology platform
2026-Apr-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01057-w
PMID:42043645
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研究论文 | 利用体外合成生物学平台超快速高滴度生产海藻糖-6-磷酸 | 设计并验证了一条不含辅酶的新型最小酶途径,避免了对ATP或UDP等昂贵辅酶的依赖,实现了海藻糖-6-磷酸的高效生物制造 | 研究未涉及大规模工业应用的长期稳定性或经济可行性评估 | 开发一种可扩展且成本竞争力的体外生物制造方法用于海藻糖-6-磷酸的生产 | 海藻糖-6-磷酸的体外酶催化合成途径 | 合成生物学 | NA | 体外酶学优化、生物反应器放大 | NA | 实验数据(产量、产率等) | NA | 体外合成生物学平台 | NA | 三酶级联途径(包含麦芽糖磷酸化酶、海藻糖-6-磷酸磷酸化酶和多磷酸葡萄糖激酶) | 农业 |
| 565 | 2026-06-16 |
Progress in cell-based immunotherapies for solid tumors
2026-Apr-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05092-z
PMID:42033573
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综述 | 本文综述了基于细胞的免疫疗法在实体肿瘤治疗中的进展,包括CAR-T、NK细胞和TCR-T等疗法 | 全面分析了多种细胞免疫疗法在实体瘤应用中面临的主要障碍和未来突破方向 | 未提供具体的实验数据或比较分析,仅为文献综述 | 总结细胞免疫疗法在实体瘤中的进展、挑战和未来方向 | 实体瘤的细胞免疫疗法 | 数字病理学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 566 | 2026-06-16 |
Gene Exchange Mechanisms in Natural and Engineered Probiotics Within the Human Gut Implications for Antibiotic Resistance and Metabolic Modulation
2026-Apr-22, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11029-3
PMID:42020676
|
综述 | 批判性审视自然与工程益生菌在人体肠道内通过水平基因转移传播抗生素抗性及调节代谢的机制与意义 | 综合论述益生菌基因交换的双重性,既强调益生特性传递也警示抗性基因扩散风险,并提出基于情境的风险评估框架 | 未提供具体实验数据验证风险,主要基于文献综合分析 | 探讨人体肠道中自然与工程益生菌的基因交换机制及其对抗生素抗性传播和代谢调节的影响 | 人体肠道微生物组中的自然益生菌和工程益生菌 | 微生物组学、合成生物学 | NA | 宏基因组学、微生物生态学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 染色体整合、自杀开关、营养缺陷型、正交电路设计 | 肠道微生物(未特指具体宿主) | 生物遏制电路(包括自杀开关、正交电路) | 医学、农业 |
| 567 | 2026-06-16 |
Marine Antimicrobial Peptides: From Ocean Biodiversity to Genome Mining, Multi-Omics Discovery, and Biotechnological Innovation in the Battle Against Antimicrobial Resistance
2026-Apr-07, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10959-2
PMID:41944926
|
综述 | 从海洋生物多样性到基因组挖掘、多组学发现和生物技术创新,全面探讨海洋抗菌肽在应对抗菌素耐药性中的应用 | 综合海洋生物多样性与现代生物技术工具(如组学发现、重组表达系统、肽工程和纳米递送平台)来开发海洋抗菌肽,并提出将海洋AMP应用于生物医药、水产养殖和工业生物技术等领域的创新策略 | 海洋AMP在稳定性、成本和递送方面仍存在挑战 | 综述海洋来源抗菌肽的多样性、类型、作用机制及其在应对抗菌素耐药性中的生物技术创新应用 | 海洋来源的抗菌肽(AMPs) | 数字病理学 | 抗菌素耐药性 | 多组学发现、重组表达系统、肽工程、纳米递送平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌 | 代谢通路 | 生物医药, 水产养殖, 工业生物技术 |
| 568 | 2026-06-16 |
A CURE for synthetic regulation of gene expression: rapid screening of guide RNA efficacy as a framework for enabling undergraduate research in plant synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag007
PMID:42293129
|
研究论文 | 开发并验证了一种基于课程的本科研经历(CURE),通过病毒载体快速筛选导向RNA(gRNA)效率,用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 创新性地将CURE模式应用于植物合成生物学,利用病毒递送gRNA实现高通量快速筛选,解决植物转化周期长的难题 | 未明确说明局限性 | 开发适用于植物合成生物学的CURE框架,快速筛选靶向Cas9转录抑制因子的gRNA | 本科学员及三个基因的启动子区域 | 数字病理学 | NA | 病毒载体递送gRNA, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 12个新gRNA,稳定转基因系 | CRISPR-Cas9 | 植物 | Cas9转录抑制因子回路 | 农业, 工业生物技术 |
| 569 | 2026-06-15 |
Engineering Escherichia coli for high-level poly(3-hydroxybutyrate) production: Recent advances and future perspective
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108858
PMID:41765153
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综述 | 本文综述了工程化大肠杆菌用于高效生产聚(3-羟基丁酸酯)的最新进展,并强调了增强其作为可持续生物塑料生产底盘的新兴策略 | 系统总结了合成生物学和代谢工程在大肠杆菌中优化前体供应、增强还原力、微调途径表达等策略,特别是工程化糖酵解途径、引入还原性甘氨酸和苏氨酸旁路路径、删除竞争途径、表达phasin、优化启动子和辅因子再生策略的协同作用 | NA | 综述工程化大肠杆菌高效生产聚(3-羟基丁酸酯)的研究进展,并展望其作为可持续生物塑料生产平台的未来前景 | 大肠杆菌工程化菌株用于聚(3-羟基丁酸酯)生产 | 合成生物学,代谢工程 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 聚(3-羟基丁酸酯)生物合成途径,包括前体优化、辅因子再生等代谢路径工程 | 工业生物技术,环境,材料 |
| 570 | 2026-06-15 |
From biopolymers to microcompartments: A structured review of protein-based scaffolds for enzyme immobilization
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108851
PMID:41765154
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综述 | 文章综述了从天然生物聚合物到工程蛋白支架,再到细菌微区室等蛋白质基支架在酶固定化中的应用进展 | 采用分层次视角,从天然生物聚合物支架逐步过渡到工程蛋白支架,并最终聚焦细菌微区室作为新兴类细胞器平台的潜力,强调其空间精度和选择性通透性 | 未详细讨论传统载体的某些优势,如成本效益和工业适用性,且对细菌微区室的实际大规模应用挑战提及较少 | 探讨蛋白质基支架在酶固定化中的结构多样性、功能特性及其在生物催化中的应用前景 | 天然生物聚合物支架、工程蛋白支架、细菌微区室等蛋白质基支架系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 多酶级联路径、代谢途径设计 | 工业生物技术、生物医学 |
| 571 | 2026-06-15 |
Programmable AND-gate strategy to reduce false positives in rolling circle amplification
2026-Jun-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118515
PMID:41707426
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研究论文 | 引入AND门布尔逻辑的多钥匙滚环扩增技术,通过检测多个核酸序列作为扩增前提来降低假阳性率 | 首次将AND门布尔逻辑策略应用于滚环扩增,通过多序列检测显著减少假阳性,并在单核苷酸多态性检测中实现高特异性 | 未明确提及,但可能涉及多输入AND门在复杂样本中的扩展性或长期稳定性验证不足 | 开发一种低假阳性率的核酸生物传感器,适用于即时检测场景 | 核酸序列(DNA和RNA)的检测与扩增 | 合成生物学 | NA | 滚环扩增 | NA | 核酸序列数据 | NA | NA | NA | AND门布尔逻辑电路 | 医学诊断 |
| 572 | 2026-06-15 |
Advances in biocontainment strategies of engineered microbes for use in humans
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102727
PMID:41780106
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综述 | 综述了用于人体的工程微生物的生物遏制策略进展 | 全面总结了多种生物遏制策略及其在临床中的应用与局限性,并强调了标准化测试的必要性 | 未提供具体实验数据或案例分析的细节,仅基于现有文献进行讨论 | 探讨用于生物医学应用的工程微生物的生物遏制策略的现状和未来方向 | 工程微生物及其生物遏制策略 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 毒素-抗毒素系统、自杀开关、营养缺陷型、基于CRISPR的靶向DNA降解、非标准氨基酸、物理屏障 | 医学 |
| 573 | 2026-06-15 |
Engineering a Virus-Derived X Family DNA Polymerase FvPolX for de novo DNA Synthesis
2026-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.75017
PMID:41915827
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研究论文 | 报道并理性工程化了一种病毒来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,用于从头DNA合成 | 首次发现并改造了微生物来源的X家族DNA聚合酶FvPolX,显著提升其催化活性,并构建了最小功能化突变体s149FvPolX,拓宽了从头DNA合成的酶工具箱 | 当前研究仅局限于FvPolX酶活性优化,缺乏对更长片段合成、保真度及体内应用的深入验证 | 开发高效、多样化的从头DNA合成酶,克服现有动物来源TdT酶的限制 | Faustovirus来源的X家族DNA聚合酶FvPolX及其工程化变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 从头DNA合成酶 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 574 | 2026-06-15 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 探讨合成微生物工程在生产可持续消费油和脂类中的潜力 | 总结了合成酵母基因组学和自动化生物铸造厂等最新进展,为微生物脂类可持续生产提供新思路 | 未具体讨论实际应用中的技术瓶颈或经济可行性 | 推动可持续微生物脂类生物制造经济的发展 | 微生物脂类及合成生物学方法 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造厂 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 微生物脂类合成途径 | 食品、保健品、塑料、动物饲料、化妆品、制药、燃料 |
| 575 | 2026-06-15 |
Sea buckthorn for future foods: bioactive mechanisms, synthetic biology, and precision delivery systems
2026-Apr-01, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2026.118364
PMID:41763752
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综述 | 系统综述沙棘作为未来食品的生物活性机制、合成生物学应用及精准递送系统 | 整合合成生物学(CRISPR/Cas9代谢工程与精密发酵)、纳米递送技术和个性化营养策略,构建沙棘从传统药用到未来智能食品的转化框架 | 未涉及具体实验验证数据,缺乏不同递送系统效率的定量比较,未讨论沙棘全产业链的技术经济可行性 | 探索沙棘生物活性成分的应用潜力,提出合成生物与食品工程相结合的产业化路径 | 沙棘中的黄酮类、类胡萝卜素、脂肪酸、维生素、多糖等生物活性成分 | 合成生物学, 食品工程 | NA | CRISPR/Cas9介导代谢工程, 精密发酵, 纳米封装技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物(用于精密发酵的工程菌株) | 代谢工程通路优化、营养递送系统(封装、黏膜黏附平台) | 食品, 医药 |
| 576 | 2026-06-15 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
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研究论文 | 通过调节c-di-GMP信号增强氧化亚铁硫杆菌的生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过调控全局调控分子c-di-GMP同时增强生物浸出效率和重金属耐受性,克服了传统单性状改造的局限性 | NA | 探索通过工程化c-di-GMP信号通路来优化生物浸出微生物的多个关键性状 | 氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans) | 合成生物学 | NA | c-di-GMP调控技术 | NA | 转录组数据 | 三种工程菌株S-222、S-306和S-651 | NA | 氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans) | 通过过表达鸟苷酸环化酶基因调控c-di-GMP信号通路 | 工业生物技术, 环境 |
| 577 | 2026-06-15 |
Adenosine Triphosphate-Producing Artificial Cells: Biomimetic Construction Strategies and Applications
2026-Mar-13, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500934
PMID:41773731
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综述 | 该论文系统综述了通过仿生构建策略生产三磷酸腺苷的人工细胞的三种方法及其在生物医学和能源领域的应用 | 创新性地系统整合了三种构建能量自给人工细胞的策略,包括基于质子泵和ATP酶的组装、直接封装细胞器以及非经典系统,并探讨了其催化效率和生物分子封装能力 | 未明确提及当前构建策略在稳定性、可扩展性和成本效益方面的具体挑战 | 探索人工细胞中三磷酸腺苷合成的三种构建策略的最新进展,并推动从基础研究向实际应用的转化 | 人工细胞中的三磷酸腺苷合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | ATP合成途径模拟 | 医学, 环境, 材料 |
| 578 | 2026-06-15 |
BOTany methods: accessible automation for plant synthetic biology
2026-Mar-02, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiag066
PMID:41715940
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研究论文 | 开发了一套基于Opentrons OT-2机器人的模块化BOTany方法,用于实现植物合成生物学常见实验操作的自动化 | 通过表格化输入无需编程经验即可操作,降低了自动化门槛,并提供了从简单到复杂操作的端到端分子克隆流程 | 依赖于Opentrons OT-2机器人平台,且验证方案可能仍需针对特定实验条件进行微调 | 提高植物合成生物学实验中自动化技术的可及性和易用性 | 植物分子生物学和合成生物学相关的实验流程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 579 | 2026-06-15 |
Advancing codon language modeling with synonymous codon constrained masking
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag166
PMID:41736545
|
研究论文 | 提出了一种受生物学约束的同义密码子掩码语言模型SynCodonLM,用于建模蛋白质编码DNA序列 | 在密码子语言模型中引入同义密码子约束,使模型仅从同义选项中预测掩码密码子,从而分离密码子层面与蛋白质层面的语义,捕捉核苷酸特异性模式 | NA | 开发能更好捕获DNA层面生物学特征的密码子语言模型,推进合成生物学中的序列设计 | 蛋白质编码DNA序列 | 自然语言处理 | NA | 密码子语言建模 | SynCodonLM (基于Transformer的密码子语言模型) | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 580 | 2026-06-15 |
Design prokaryotic cis-regulatory elements using language model
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag122
PMID:41693567
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研究论文 | 提出了一个名为PromoGen2的语言模型,用于设计原核生物顺式调控元件(CREs),无需先验实验数据 | 该模型在无明显实验数据下设计CREs,从17000个原核生物基因组预训练,零样本预测启动子强度相关性显著提升(平均Spearman相关从0.27提高到0.50),参数减少10^3倍,并在多种细菌中实现100%设计成功率 | 原文未明确提及局限性 | 开发一个广泛适用的平台,用于生成数千种原核生物的功能性启动子 | 原核生物顺式调控元件(CREs) | 机器学习 | NA | 语言模型 | PromoGen2, PromoGen2-proka | DNA序列 | 17000个原核生物基因组 | NA | Escherichia coli, Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Agrobacterium tumefaciens, Jejubacter sp. L23 | 启动子 | 合成生物学, 微生物学 |