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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-02-15 |
Cell-free systems for expression of proteins and enzymes
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.002
PMID:41688138
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综述 | 本章回顾了无细胞表达系统在蛋白质和酶生物合成中的发展历程、类型、应用及未来挑战 | 无细胞表达系统提供了一个开放且可控的环境,突破了细胞调控的限制,实现了对表达动态的精确操控,特别适用于有毒蛋白质和复杂酶的合成 | NA | 探讨无细胞表达系统在蛋白质和酶生物合成中的应用及其在生物技术领域的潜力 | 无细胞表达系统及其在蛋白质和酶生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统,包括基于提取物的系统和PURE系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 诊断学、治疗学、生物制造、合成生物学 |
| 582 | 2026-02-14 |
Decoding life: A detailed examination of program collection
2026-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2026.105693
PMID:41500378
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综述 | 本文提出并详细阐述了“生命是程序的集合”这一理论,认为生命是由遗传、代谢、发育和神经认知等程序构成的复杂有序系统 | 将生命系统抽象为多层次程序集合的理论框架,整合了哲学思想与多学科科学证据,为理解生命本质提供了新的跨学科范式 | 面临“意识难题”等哲学挑战以及合成生物学应用中的伦理争议 | 构建一个统一的理论框架来解释生命的本质、结构与运作机制 | 生命系统(包括其遗传、代谢、发育和神经认知等组成部分) | NA | NA | 单细胞组学、人工智能建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 583 | 2026-02-14 |
Engineered probiotics that sequester arsenite in a mouse gastrointestinal system
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.699961
PMID:41648437
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研究论文 | 本研究开发了一种基于合成生物学的工程化益生菌,用于在小鼠胃肠道中检测和隔离砷离子,以减少其系统性吸收 | 创新点包括设计了一个砷离子响应的遗传切换开关,能激活螯合剂表达并在生物静态条件下维持生产,同时自动在细胞分裂时关闭以降低代谢负担和提高生物安全性,并改造了砷离子结合蛋白以消除DNA结合活性,保留高亲和力金属结合,适合细胞内隔离 | NA | 研究目的是开发一种策略,防止饮食中的砷离子在消化过程中进入人体,以减少长期健康风险 | 研究对象是工程化的益生菌菌株,用于在小鼠胃肠道系统中隔离砷离子 | 合成生物学 | 癌症、器官功能障碍、神经系统疾病 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 砷离子响应的遗传切换开关,用于激活螯合剂表达,并设计了一个非毒性螯合剂用于细胞内隔离 | 医学 |
| 584 | 2026-02-13 |
Synthetic germ granules reveal a direct role of Vasa/DDX4 in RNA localization and translational activation
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.01.703065
PMID:41676510
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研究论文 | 本研究通过合成方法从头生成生殖颗粒,揭示了Vasa/DDX4在RNA定位和翻译激活中的直接作用 | 开发了一种合成方法从头生成生殖颗粒,首次证明Vasa/DDX4是连接RNA招募与局部翻译激活的核心因子,且其他DEAD-box解旋酶无法替代 | NA | 探究生殖颗粒中RNA定位和翻译激活的分子机制 | 生殖颗粒、Vasa/DDX4蛋白、内源性生殖颗粒mRNA(如Nanos) | 合成生物学 | NA | 合成方法、正交RNA锚定方法、急性耗竭实验 | NA | NA | NA | PopTag-based scaffold、Gibson Assembly | Caulobacter(衍生)、活体生物 | 合成生殖颗粒、基于Oskar的RNA结合域与Vasa解旋酶的两组分模块 | 医学、基础生物学研究 |
| 585 | 2026-02-13 |
Synthetic biology for phytohormone production
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102649
PMID:41456574
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综述 | 本文批判性地评估了合成生物学方法在植物激素生产中的应用,重点关注生长素、赤霉素和水杨酸这三种对农业至关重要的化合物 | 利用合成生物学方法为植物激素生产提供可持续的替代方案,克服传统生产中的优化和提取难题 | NA | 探索合成生物学在植物激素可持续生产中的应用,以替代农用化学品 | 植物激素,特别是生长素、赤霉素和水杨酸 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 586 | 2026-02-13 |
Small RNAs, big potential: Engineering microRNA-based synthetic gene circuits
2026-Feb, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102652
PMID:41621146
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综述 | 本文综述了基于microRNA的合成基因电路工程,探讨了其在疾病诊断和治疗中的应用潜力 | 介绍了CRISPR关联的miRNA响应系统和iFFL架构等最新创新,将应用从被动传感转向治疗干预 | 存在泄漏、细胞资源限制和递送挑战等局限性 | 工程化基于miRNA的合成基因电路,用于传感和解释内源性miRNA水平 | microRNA及其在合成生物学中的工程应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR | NA | miR-OFF系统、miR-ON架构、基于逻辑的分类器、分层调控策略、iFFL架构 | 医学 |
| 587 | 2026-02-13 |
Development of a Tool for High-Efficiency, Markerless and Iterative Genome Editing in Shouchella clausii
2026-Feb, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70287
PMID:41662148
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研究论文 | 本研究开发了一种用于Shouchella clausii的高效、无标记、可迭代基因组编辑工具,并验证了其在枯草芽孢杆菌中的适用性 | 开发了首个针对Shouchella clausii的温度敏感型穿梭载体系统,结合Golden Gate组装和两步整合策略,实现了超过60%成功率的无标记基因编辑 | 研究主要针对模式菌株DSM 8716,在其他Shouchella clausii菌株中的适用性尚未验证 | 克服Shouchella clausii的遗传操作障碍,建立高效的基因组编辑平台 | Shouchella clausii DSM 8716和枯草芽孢杆菌168 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、电穿孔转化、Golden Gate组装 | NA | NA | 使用Shouchella clausii DSM 8716和枯草芽孢杆菌168两种细菌菌株 | Golden Gate Assembly | Shouchella clausii, Bacillus subtilis | 温度敏感型E. coli-S. clausii穿梭载体系统,包含抗性标记和荧光报告基因 | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 588 | 2026-02-13 |
Digital Twins are a Key Enabling Technology for Personalized Medicine
2026-Jan-14, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-025-01589-w
PMID:41530522
|
观点文章 | 本文探讨了数字孪生作为个性化医疗的关键使能技术,强调其在健康管理中的潜力 | 从学术和商业视角分析数字孪生技术,并扩展到生态、生物技术等跨领域应用 | NA | 强调数字孪生技术对数学建模社区的机遇及其在个性化医疗中的作用 | 数字孪生技术及其在人类生物学和健康管理中的应用 | NA | NA | NA | 计算模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗, 生态, 生物技术, 农业, 合成生物学 |
| 589 | 2026-02-12 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2026-Mar, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
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研究论文 | 本研究利用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,过表达藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白,并比较TEV和HRV蛋白酶在切割融合蛋白中的效率 | 首次在蓝藻中稳定过表达功能性人干扰素α-2作为藻蓝蛋白融合体,并系统比较TEV和HRV蛋白酶在蓝藻系统中的切割效率,发现HRV蛋白酶优于TEV及其他近期测试的蛋白酶 | 研究仅针对特定蓝藻宿主和融合蛋白设计,未评估其他光合生物或不同融合策略的适用性,且切割效率可能受表达条件影响 | 开发蓝藻作为低成本重组蛋白生产平台,优化融合蛋白切割技术以提高蛋白分离效率 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803、藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白、TEV和HRV蛋白酶切割位点 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、融合蛋白构建、蛋白酶切割分析 | NA | 实验数据 | 使用蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主,涉及不同蛋白酶切割位点的构建体 | 融合蛋白构建、蛋白酶切割系统 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803 | 藻蓝蛋白CpcB β-亚基与人干扰素α-2的融合蛋白,包含TEV或HRV蛋白酶切割位点 | 工业生物技术、医药 |
| 590 | 2026-02-12 |
Advances in site-specific knock-in techniques for gene editing
2026-Feb-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.25-076
PMID:41669806
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综述 | 本文系统总结了位点特异性敲入基因编辑技术的最新进展,包括重组酶和核酸酶系统,并讨论了其在疾病建模和基因治疗中的应用 | 综述了Cas9-Bxb1整合酶系统在实现大片段DNA靶向整合方面的突破,并比较了twinPE+Bxb1和PASTE系统的优缺点 | 当前技术仍存在脱靶活性和编辑效率低的问题,且跨物种基因组安全港数据库尚未完善 | 提高基因靶向敲入技术的精确性和效率,以推动精准医学和合成生物学应用 | 位点特异性重组酶系统(如Bxb1整合酶)和可编程核酸酶系统(如CRISPR/Cas9) | NA | NA | 位点特异性重组酶系统,可编程核酸酶系统,CRISPR/Cas9,多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Bxb1整合酶 | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 591 | 2026-02-12 |
Enhancing Stress Tolerance of Probiotics: Mechanisms, Strategies, and Translational Challenges
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12872
PMID:41614565
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综述 | 本文系统总结了益生菌应激耐受性的分子机制,并评估了包括菌株筛选、适应性进化、基因工程和封装技术在内的现有增强策略 | 强调了基于CRISPR的基因组编辑、合成生物学和纳米材料辅助递送等新兴方法作为克服转化瓶颈的有前景的解决方案 | 与监管批准和大规模制造相关的挑战仍有待解决 | 增强益生菌的应激耐受性,以提高其在生产、储存和应用过程中的存活率和功效 | 益生菌 | NA | NA | CRISPR-based genome editing, synthetic biology, nanomaterial-assisted delivery | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 益生菌(未指定具体物种) | NA | 食品, 制药, 农业 |
| 592 | 2026-02-12 |
Classification, Pharmacological Properties, and Applications of Bioactive Constituents in Mentha Species
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13261
PMID:41614637
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综述 | 本文综述了薄荷属植物的分类、药理特性及其生物活性成分的应用 | 探讨了利用合成生物学生产薄荷醇以应对资源环境限制和市场需求的创新方向 | NA | 综述薄荷属植物的生物活性成分及其在食品、医药和现代农业等领域的应用 | 薄荷属植物及其生物活性成分,如薄荷醇和类黄酮 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药, 现代农业 |
| 593 | 2026-02-12 |
Characterization of the Key Enzymes and a Gene Pair in Triterpenoid Biosynthesis of Ficus microcarpa
2026-Feb-11, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12253
PMID:41615816
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研究论文 | 本研究功能表征了榕树中的八个氧化角鲨烯环化酶,揭示了它们在生成八种不同三萜醇骨架中的作用,并鉴定了一个罕见的ψ-蒲公英甾醇合酶及关键残基差异 | 首次在桑科植物中鉴定出罕见的ψ-蒲公英甾醇合酶,揭示了染色体连锁基因对在羽扇豆烷型衍生物合成中的顺序作用,并发现CYP716A亚家族酶具有保守的催化多功能性 | NA | 阐明榕树中三萜类化合物生物合成的关键酶和基因对 | 榕树中的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 594 | 2026-02-12 |
Developmentally inspired synthetic kidney engineering
2026-Feb-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03011-9
PMID:41667710
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研究论文 | 本文提出了一种受发育启发的合成肾脏工程策略,利用合成生物学和空间模式工具指导体外多尺度组织结构形成 | 提出'发育工程'新范式,将胚胎肾脏发育的时空线索应用于体外组织构建,通过引导和组织基序的链式组装实现可扩展的工程化组织 | 策略仍处于概念阶段,临床转化面临功能成熟度、细胞类型缺失和可扩展性等挑战 | 开发可用于临床移植的肾脏替代组织 | 干细胞衍生的肾脏组织 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 合成生物学、空间模式控制、组织微环境调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 干细胞 | 组织基序引导与链式组装系统 | 医学 |
| 595 | 2026-02-12 |
Light force-powered cellular medical micromachines
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1746261
PMID:41658983
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综述 | 本文系统综述了光力驱动的细胞微机器(包括趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构)的设计策略及其在靶向药物递送、微创手术和免疫治疗中的应用 | 提出将天然生物细胞与可编程光镊技术相结合,克服传统人工合成材料微机器在生物安全性和深部组织疗效方面的限制 | 存在组织穿透深度有限、光毒性管理以及操作智能化不足等关键挑战 | 探讨光力驱动的细胞微机器在精准医疗中的应用潜力与发展方向 | 趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构 | 生物医学工程 | NA | 光镊技术、光子技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、人类红细胞、免疫细胞 | NA | 医学 |
| 596 | 2026-02-11 |
Self-assembling protein cages: from coiled-coil module to machine learning-driven de novo design of next-generation biomaterials
2026-Feb-09, Materials advances
IF:5.2Q2
DOI:10.1039/d5ma00792e
PMID:41446439
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综述 | 本文综述了基于卷曲螺旋或其他模块化蛋白结构域的工程化蛋白笼设计策略、功能化及其定制化应用前景 | 结合模块化蛋白设计、相互作用表面计算设计及基于机器学习的生成式蛋白设计,推动蛋白笼设计的革命性进展 | NA | 探讨自组装蛋白纳米笼的理性设计及其在合成生物学、生物技术和生物医学中的应用 | 自组装蛋白纳米笼 | 机器学习 | NA | 机器学习驱动的生成式蛋白设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物技术, 生物医学 |
| 597 | 2026-02-11 |
Recent advances of engineered bacteria for therapeutic applications
2026-Feb-04, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.11.013
PMID:41234015
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综述 | 本文系统回顾了工程化细菌在治疗应用中的最新进展,重点关注其在疾病干预中的多功能生物治疗平台作用 | 通过合成生物学方法,结合计算建模和模块化基因电路设计,克服了细菌固有的功能限制,提高了治疗的时空精度、生物安全性和可扩展性 | NA | 探讨工程化细菌作为治疗策略的发展、测试及其在肿瘤治疗和代谢紊乱管理中的应用 | 工程化细菌系统 | 合成生物学 | 肿瘤、代谢紊乱 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 模块化基因电路设计,如生物传感器、逻辑门 | 医学 |
| 598 | 2026-02-10 |
[Design and synthesis of molecularly imprinted polymers and their applications in medical diagnosis and biocatalysis]
2026-Feb-08, Se pu = Chinese journal of chromatography
DOI:10.3724/SP.J.1123.2025.06013
PMID:41641521
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综述 | 本文综述了分子印迹聚合物(MIPs)的理性设计、功能化制备及其在生物传感、生物催化和生物医学诊疗等领域的跨学科应用 | 提出了三维策略(高通量单体筛选、分子识别机制阐明和功能单元定向组装),开发了具有刺激响应特性的智能MIPs,并建立了从体外传感到体内精准干预的集成智能诊疗平台前沿方向 | 指出了MIPs在印迹层不均匀、模板残留、大分子印迹水相容性有限、工业可扩展性、识别机制不明确以及与微流控和人工智能等新兴领域融合不足等方面的挑战 | 推进分子印迹技术(MIT),开发高性能MIPs,并拓展其在生物医学诊断、生物催化等领域的应用 | 分子印迹聚合物(MIPs) | NA | 心力衰竭、癌症 | 分子印迹技术(MIT)、高通量单体筛选、分子动力学模拟、固相表面印迹法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、环境、制药 |
| 599 | 2026-02-10 |
A programmable ribozyme for RNA signal transduction
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68175-5
PMID:41519779
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研究论文 | 本文报道了一种可编程的RNA触发激活双位点自切割核酶平台UNBAR,用于RNA信号转导 | 首次开发了一种通用方法,允许RNA触发器直接激活多种非编码RNA效应子,实现了RNA检测与功能转导的一体化 | NA | 开发一种可编程的RNA信号转导平台,用于合成生物学、诊断和基因调控 | RNA触发器、非编码RNA效应子(如sgRNA、shRNA、适配体) | 合成生物学 | NA | RNA工程、细胞自由传感、蛋白质自由扩增 | NA | RNA序列数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 斑马鱼胚胎、人类细胞 | 可编程双位点自切割核酶,具有模块化传感域和切割产物 | 医学、合成生物学、诊断 |
| 600 | 2026-02-09 |
AP2/ERF transcription factors regulate the biosynthesis of terpenoids, phenolics, and alkaloids in plants
2026-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf280
PMID:41647723
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综述 | 本文综述了AP2/ERF转录因子在调控植物萜类、酚类和生物碱等次生代谢物生物合成中的分子机制与作用 | 系统性地分类和剖析了AP2/ERF转录因子调控次生代谢的多种模式,并探讨了其在代谢工程和合成生物学中的新兴应用 | NA | 阐明AP2/ERF转录因子调控植物次生代谢物生物合成的分子机制 | AP2/ERF转录因子及其调控的萜类、酚类和生物碱等植物次生代谢物 | NA | NA | 多组学技术、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |