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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-08-29 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本文利用微流控捕获平台结合共聚焦显微镜,定量研究了钙离子在无蛋白质条件下介导巨型单层囊泡融合的机制,揭示了其融合效率对膜组成和机械张力的敏感性 | 首次在细胞尺寸的巨型单层囊泡上直接定量钙离子介导的膜融合,并同时测量脂质混合、内容物混合和融合结果,克服了以往实验中囊泡尺寸的不一致性 | 研究仅限于无蛋白质的合成膜系统,可能无法完全反映生理条件下的融合过程;另外,融合效率对膜组成高度敏感,参数空间狭窄 | 阐明钙离子在无蛋白质条件下驱动细胞尺寸膜融合的机制,并提供设计规则以应用于合成生物学和膜重构研究 | 巨型单层囊泡和大型单层囊泡 | 生物物理学 | 不适用 | 共聚焦显微镜、微流控捕获平台 | 不适用 | 图像 | 数百个单个囊泡 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学 |
| 602 | 2026-08-29 |
Synthetic budding morphogenesis by optogenetic receptor tyrosine kinase signaling
2026-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.31.715459
PMID:41959406
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研究论文 | 本研究通过光遗传学控制受体酪氨酸激酶RET,实现对肾脏类器官出芽形态发生的定向调控,并展示了其在构建合成替换肾脏方面的潜力。 | 首次实现通过光遗传学方法,以蓝光介导的聚类方式非配体依赖性地激活RET信号,从而控制肾脏类器官的出芽方向,为上皮类器官设计提供了新的合成生物学策略。 | 摘要中未提及具体局限性,如体内应用挑战、长期稳定性或信号通路干扰等。 | 开发一种通过光遗传学控制受体酪氨酸激酶RET信号的方法,以实现肾脏类器官的可控出芽形态发生,并促进合成肾脏的构建。 | 小鼠胚胎肾脏、人类干细胞来源的肾脏类器官以及表达optoRET的上皮细胞。 | 合成生物学 | 肾脏疾病 | 光遗传学 | NA | 图像 | 小鼠胚胎肾脏、人类干细胞来源的肾脏类器官(具体数量未提及) | 光遗传学 | 人类干细胞来源的肾脏类器官、小鼠胚胎肾脏 | 光遗传学RET受体(optoRET)介导的信号通路 | 医学 |
| 603 | 2026-08-29 |
Coupled Perturbations of Gene Circuit Dynamics by Resource Competition and Growth Dilution
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5304-3_19
PMID:42420739
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研究论文 | 本文介绍了一种在E. coli中构建和表征抑制性基因级联的实验流程,以研究资源竞争和生长稀释对基因电路动力学的耦合影响 | 首次系统解析资源竞争和生长介导稀释对基因电路行为的耦合效应,而非单独考虑每个因素 | 未提供具体的实验结果或数据,仅描述实验方案,且可能局限于E. coli系统 | 研究共享细胞资源和生长过程如何塑造基因电路行为,指导合成生物学中多个上下文依赖效应的研究 | 大肠杆菌中的抑制性基因级联 | 合成生物学 | NA | 荧光测定法 | NA | 荧光数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 抑制性基因级联 | 工业生物技术 |
| 604 | 2026-08-29 |
SEGUID v2: Extending SEGUID checksums for circular, linear, single- and double-stranded biological sequences
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0346164
PMID:42566484
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研究论文 | 本文提出了SEGUID v2,扩展了原始SEGUID校验和以支持环形、线性、单链和双链生物序列 | SEGUID v2通过引入方向不变性和旋转不变性,解决了原始SEGUID无法处理环形DNA和双链DNA的问题,并采用Base64url编码以提高在文件名和URL中的兼容性 | 摘要中未提及明确的局限性 | 开发一种适用于各种类型DNA和RNA序列的校验和算法,以增强序列数据的完整性和注释检索效率 | DNA和RNA序列,包括线性、环形、单链和双链形式 | 生物信息学 | NA | 校验和算法(SHA-1哈希) | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 605 | 2026-08-29 |
Recombinant humanized type VII collagen for skin repair and regeneration: prospects for reconstructing the dermal-epidermal junction
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1912442
PMID:42656479
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综述 | 本文综述了重组人源化VII型胶原蛋白在皮肤修复与再生中的应用前景,重点探讨其在重建真皮-表皮连接中的作用 | 首次系统总结rhCol VII相较于传统I型和III型胶原材料的潜在优势,包括安全性、可规模化生产和针对DEJ的结构功能靶向性 | 尚需解决材料开发和临床转化中的挑战,如生产工艺优化和长期安全性评估 | 为基于rhCol VII的皮肤修复材料进一步研究提供参考,推动其在慢性伤口、美容术后屏障损伤和组织工程皮肤中的应用 | VII型胶原蛋白及其重组人源化形式(rhCol VII) | 合成生物学 | 皮肤损伤 | 重组蛋白表达技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 606 | 2026-08-29 |
A review of glycosylation diversity and biosynthetic advances of steroidal saponins in Paris polyphylla var. yunnanensis
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1905483
PMID:42657317
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综述 | 系统总结了云南重楼中甾体皂苷的糖基化多样性和生物合成途径的研究进展,并探讨了利用异源生物合成提高其产量的策略。 | 整合多组学技术和合成生物学的最新进展,重点分析了甾体皂苷的糖基化模式及其对结构多样性的贡献。 | 未提及具体实验验证,仅基于已有文献进行总结。 | 阐明云南重楼中甾体皂苷的结构多样性和糖基化模式,并系统总结其生物合成途径,为可持续利用提供理论基础。 | 云南重楼中的甾体皂苷及其生物合成途径。 | 合成生物学 | NA | 多组学技术 | NA | 文献数据 | 不适用 | NA | NA | 甾体皂苷生物合成途径 | 医药 |
| 607 | 2026-08-28 |
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Sep, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11007-9
PMID:42029996
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综述 | 系统分类并总结芽孢杆菌属(Bacillus spp.)产生的次生代谢产物,涵盖其化学多样性、作用机制、结构-功能关系及实际应用中的挑战与机遇 | 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次生代谢产物,并整合了作用机制、结构-功能关系及基因组挖掘和合成生物学等新兴策略 | 未提供具体实验数据,且对代谢产物异质性、毒性等问题仅作定性讨论 | 为芽孢杆菌代谢产物的理性选择和应用提供框架,重点在农业、食品和医学领域 | 芽孢杆菌属的次生代谢产物,如脂肽、多肽、大环内酯、有机酸、聚酮和角鲨烯 | 微生物学 | NA | 基因组挖掘、代谢组学辅助去重复化、合成生物学 | NA | 文本和综述性资料 | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品, 医学 |
| 608 | 2026-08-28 |
The division of vesicles requires the fission of closed membrane necks but does not require active processes
2026-Aug-26, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d6sm00283h
PMID:42300069
|
研究论文 | 本文分析了巨囊泡和纳米囊泡分裂过程的研究,结合理论、实验和模拟,证明囊泡分裂需要闭合膜颈的裂开,但不需要核苷酸水解等主动过程的化学机械耦合。 | 首次系统证明囊泡分裂仅依赖于闭合膜颈的形成和裂开,而不需要主动过程的参与,并揭示了自发曲率和应力不对称性对收缩力的控制作用。 | 分析主要基于本组的研究结果,可能未涵盖所有相关研究;且对膜裂开的分子机制细节未深入探讨。 | 阐明囊泡分裂的物理机制,探索不依赖主动过程的仿生分裂过程。 | 巨囊泡和纳米囊泡的分裂过程,包括均匀膜、含结构域膜及与凝聚液滴接触的膜。 | 软物质科学、合成生物学 | NA | 理论分析、实验、模拟 | NA | 实验数据、模拟数据 | 未明确提及具体样本数量,涉及多种膜系统。 | NA | NA | NA | 合成生物学、软物质科学 |
| 609 | 2026-08-28 |
An insoluble de novo protein enables survival of Escherichia coli by sequestering a gene repressor
2026-Aug-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2601204123
PMID:42623447
|
研究论文 | 该研究通过筛选组合文库,鉴定出一种名为Ubq的新蛋白,该蛋白通过隔离基因阻遏物MetJ,上调胱硫醚β-合酶表达,从而挽救大肠杆菌中致死性基因缺失,维持细胞生长。 | 首次发现一种不溶性从头设计蛋白能够通过隔离阻遏物来调控基因表达,实现生命维持功能,为从头基因在合成生物学和自然进化中的作用提供了新见解。 | 该研究仅在特定大肠杆菌菌株和特定条件下进行验证,对于其他生物体或更复杂系统中的普适性尚未探索。 | 探索从头设计蛋白能否在细胞中提供新功能以维持细胞存活,并揭示其作用机制。 | 大肠杆菌(Escherichia coli)以及一种从头设计蛋白Ubq。 | 合成生物学 | NA | 组合文库筛选、蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质序列、蛋白质组数据 | 涉及多种大肠杆菌菌株和一种从头蛋白,具体样本数未在摘要中说明。 | NA | E. coli | 基因调控回路(通过隔离MetJ阻遏物上调胱硫醚β-合酶表达) | 合成生物学、生物技术 |
| 610 | 2026-08-28 |
Research progress on biosynthesis and regulation of monoterpenoid compounds
2026-Aug-24, Natural products and bioprospecting
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s13659-026-00640-0
PMID:42635857
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综述 | 本文综述了单萜类化合物的生物合成途径、多层调控机制以及异源生产的最新进展,重点关注可持续和高效生物制造的主要瓶颈及优化策略 | 系统总结了单萜类化合物在生物合成、多层级调控(包括环境信号、植物激素信号、转录调控、表观遗传及转录后调控)和微生物异源生产方面的最新进展,并强调了可持续生物制造的瓶颈与优化策略 | 未提及具体局限性 | 总结单萜类化合物生物合成与调控的研究进展,探讨其异源生产中的瓶颈及优化策略 | 单萜类化合物及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 单萜类化合物生物合成途径 | 食品, 香料, 医药, 农业 |
| 611 | 2026-08-28 |
Quantitative Measurement of Synthetic Repression Curves Reveals Design Challenges for Genetic Circuit Engineering under Growth Arrest
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00123
PMID:42125829
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研究论文 | 本研究在单细胞分辨率下测量大肠杆菌中遗传NOT门在生长停滞和活跃生长条件下的抑制曲线,系统探究生长停滞对电路行为的影响 | 首次系统量化生长停滞对合成遗传电路性能的影响,发现未抑制表达水平降低超过100倍是主要因素,并指出现有设计范式不足 | 研究仅针对大肠杆菌和NOT门,未涵盖其他宿主或电路类型,且未提供解决生长停滞问题的具体电路设计 | 研究生长停滞对合成遗传电路性能的影响,并评估当前设计范式的适用性 | 大肠杆菌中的遗传NOT门库 | 合成生物学 | NA | 单细胞荧光测量 | NA | 图像数据(单细胞荧光) | 多个遗传NOT门变体在大肠杆菌中,具体数量未在摘要中提供 | NA | 大肠杆菌 | 遗传NOT门(抑制曲线) | 工业生物技术、环境 |
| 612 | 2026-08-28 |
Engineering Auronidin Production in Marchantia polymorpha Enables a New Class of Plant-Derived Textile Pigments
2026-Aug-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00118
PMID:42470384
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研究论文 | 该研究通过工程化地钱植物(Marchantia polymorpha)增强一类罕见类黄酮色素——金盏花素的生产,并将其应用于纺织染色,展示了植物底盘在可持续纺织生物技术中的潜力。 | 首次将金盏花素作为纺织染料进行生物技术应用,通过在Marchantia polymorpha中调控R2R3-MYB转录因子MpMYB14实现增强生产,并系统比较了多种诱导表达系统。 | 摘要中未提及明显局限性。 | 旨在通过合成生物学方法提高金盏花素产量,并验证其作为纺织染料的可行性,以提供可持续的植物源色素替代方案。 | 研究对象为地钱植物(Marchantia polymorpha)和金盏花素色素。 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控(热激、糖皮质激素受体、β-雌二醇诱导系统) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 地钱(Marchantia polymorpha) | 热激、糖皮质激素受体、β-雌二醇(XVE)诱导表达系统 | 纺织、生物技术 |
| 613 | 2026-08-28 |
Oncolytic Virotherapy for Solid Tumors: Clinical Advances and Future Directions
2026-04, Surgical oncology clinics of North America
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.soc.2025.10.011
PMID:41903995
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综述 | 本文综述了溶瘤病毒疗法的生物学基础、临床应用、联合治疗策略及未来发展方向 | 总结了溶瘤病毒疗法的最新临床进展,并探讨了合成生物学和免疫肿瘤学进展如何推动下一代病毒平台的发展 | 未具体说明临床试验中的量化结果或详细的安全性数据 | 概述溶瘤病毒疗法在实体瘤中的临床应用现状,并分析其未来研究方向 | 溶瘤病毒及其在实体瘤治疗中的应用 | 免疫肿瘤学 | 实体瘤 | NA | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 614 | 2026-08-28 |
Lipid composition effects on the number and size of liposomes formed by the inverted emulsion method
2026-02-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.12.013
PMID:41383017
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研究论文 | 本研究系统探究了磷脂组成对反相乳液法生成脂质体的产量和大小分布的影响,发现带电磷脂能显著提高产量,为优化最小细胞模型制备提供指导。 | 首次系统研究脂质组成对反相乳液法中脂质体产量和大小分布的影响,揭示了带电磷脂和小头基脂质在提升产量方面的作用 | 研究仅限于特定磷脂类型(基于蛋PC),未涵盖其他脂质种类,且离心方法可能掩盖某些脂质效应 | 评估不同磷脂组成对反相乳液法生成脂质体的数量和大小分布的影响,以优化最小细胞模型的制备方案 | 由蛋PC及部分替代的磷脂形成的脂质体 | 合成生物学 | NA | 反相乳液法 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 615 | 2026-08-28 |
Harnessing yeast biodiversity for advanced industrial applications
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag031
PMID:42631727
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综述 | 本文综述了酵母菌生物多样性在工业应用中的最新进展,包括自然多样性和人工多样性,并强调了多组学分析、人工智能辅助工程和过程优化策略的重要性。 | 整合了自然多样性(生态适应和遗传变异)与人工多样性(适应性实验室进化、代谢或表观遗传工程、合成生物学)的视角,并突出了极端嗜极酵母作为胁迫适应模型及菌株水平培养库的建立。 | 未具体说明。 | 总结酵母菌多样性在工业应用中的研究进展,并讨论充分开发和利用该多样性以实现高效生物生产的关键策略。 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和各种非传统酵母菌种。 | 机器学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、非传统酵母菌种 | NA | 医药、生物燃料、生物化学品、生物材料、工业生物技术 |
| 616 | 2026-08-27 |
Gut microbiota, microbial metabolites, and microbiome-directed nutritional interventions in hyperuricemia and gout: mechanisms and translational opportunities
2026-Aug-26, Journal of the science of food and agriculture
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/jsfa.71016
PMID:42643149
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综述 | 本文综述了肠道微生物群、微生物代谢产物及微生物组导向的营养干预在治疗高尿酸血症和痛风中的作用机制与转化前景 | 提出通过双歧杆菌和乳酸杆菌特定菌株的三种互连机制调节尿酸稳态,并强调合成生物学和人工智能辅助建模在下一代精准微生物组干预中的应用 | 当前证据大多为临床前研究,且面临菌株功能异质性、定植持久性和宿主变异性等挑战 | 总结微生物群介导的高尿酸血症和痛风调控机制,评估微生物组导向干预措施的转化潜力,并为未来研究确定优先方向 | 肠道微生物群、特定微生物菌株(双歧杆菌属、乳杆菌科)及其代谢产物 | 微生物组学 | 高尿酸血症、痛风 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 617 | 2026-08-27 |
Engineered Microbial Cellulases for Biomass Conversion: Integrating Omics, Expression Platforms, Fermentation Engineering and Enzyme Reusability
2026-Aug-25, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70337
PMID:42640835
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综述 | 本文综述了微生物纤维素酶在生物质转化中的应用,涵盖组学、表达平台、发酵工程和酶可重复使用性,强调从传统微生物生产转向工程化平台。 | 创新点在于将纤维素酶生产视为生物技术平台而非独立发酵过程,整合CRISPR/Cas系统、转录调控、碱基和先导编辑、合成生物学、AI辅助酶设计等先进工具。 | 大规模应用仍受限于原料异质性、代谢物抑制、酶抑制、下游回收成本和放大限制。 | 旨在通过整合微生物多样性、多组学、宿主工程、过程强化和低成本回收策略,创建稳健且经济可行的纤维素酶平台,用于可持续生物精炼和循环生物经济。 | 微生物纤维素酶,包括内切葡聚糖酶、纤维二糖水解酶、β-葡萄糖苷酶和辅助酶,以及生产它们的微生物。 | 工业生物技术 | NA | 组学、CRISPR/Cas系统、转录调控、碱基和先导编辑、合成生物学、AI辅助设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 碱基编辑, 先导编辑 | NA | 酶混合物优化 | 工业生物技术, 食品, 纺织, 洗涤剂, 纸浆和造纸, 废物回收 |
| 618 | 2026-08-27 |
Toward Complex Polyketide Biosynthesis in Yarrowia lipolytica via Metabolic Reprogramming
2026-Aug-21, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2606.06035
PMID:42625493
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综述 | 本文综述了通过代谢重编程在解脂耶氏酵母中实现复杂聚酮类化合物生物合成的最新策略、案例、局限性与未来方向 | 系统总结了从经典代谢重排到细胞器工程和亚细胞区室化等新兴策略,并评估了该酵母作为可编程工业平台的前景 | 当前聚酮类化合物在解脂耶氏酵母中的产量仍有待提高,且存在代谢负担和产物多样性限制等问题 | 建立解脂耶氏酵母作为可编程、工业可行的聚酮类化合物生物合成平台 | 解脂耶氏酵母及其聚酮类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢途径重构、细胞器工程、亚细胞区室化 | 医药、工业生物技术 |
| 619 | 2026-08-27 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Aug-19, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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评论文章 | 本文探讨了生物合成基因簇(BGCs)在细菌种间水平转移的机制及其对化学多样性的进化影响,并讨论了其对合成生物学的启示 | 将BGCs视为可移动的基因组单元,挑战了传统的以基因组为中心的次级代谢观点,并提出模仿自然模块化转移系统来工程化可移植的生物合成平台 | 未提供具体实验数据或案例研究,主要基于理论分析和现有文献的综述性讨论 | 分析BGCs在细菌种间水平转移的机制和进化意义,并探讨其在合成生物学中的应用潜力 | 细菌中的生物合成基因簇(BGCs) | 微生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | 可移植的生物合成平台 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 620 | 2026-08-27 |
A guide to Direct Pathway Cloning (DiPaC) for natural product discovery
2026-Aug-19, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250016
PMID:42210810
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综述 | 本文是一篇关于直接途径克隆(DiPaC)技术的综述,重点介绍其在天然产物发现中的应用,包括技术原理、优势、应用案例和操作指南。 | 系统总结了DiPaC技术在不同天然产物类别中的应用,并提供了选择生物合成基因簇、扩增困难序列和组装策略的实用指导。 | 未提及具体局限性,但作为综述,可能缺乏对DiPaC技术本身潜在缺点的深入分析。 | 介绍DiPaC技术作为现代天然产物研究的关键工具,促进生物合成基因簇的克隆和重构。 | 生物合成基因簇(BGCs)及其编码的天然产物生物合成途径。 | 合成生物学 | NA | 长片段PCR、体外DNA组装 | NA | 基因组序列、生物信息学数据 | NA | DiPaC(直接途径克隆) | NA | 生物合成途径的克隆和重构,包括启动子交换、调控元件移除和模块化重建 | 药物发现、生物技术 |