合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1106 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-04-29 |
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Jul, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110869
PMID:41946009
|
综述 | 该综述文章全面回顾了微生物脂肪酶在工业创新中的应用，涵盖其来源、筛选、生产、纯化及表征等方面 | 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程及AI辅助建模在识别和定制具有所需特性的脂肪酶中的革命性作用 | 未明确说明，但作为综述可能缺乏对特定系统验证的深度讨论 | 探讨微生物脂肪酶在可持续工业创新和绿色化学中的关键作用 | 微生物脂肪酶，包括来自细菌、真菌和酵母的脂肪酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 宏基因组学, 酶工程 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程 | 芽孢杆菌属, 无色杆菌属, 产碱菌属, 节杆菌属, 假单胞菌属, 青霉属 | NA | 工业生物技术, 医药, 食品与饮料, 纺织, 皮革, 洗涤剂, 生物燃料 |
| 622 | 2026-04-29 |
WRKY Transcription Factors: Integral Regulators of Defence Responses to Biotic Stress in Crops
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70542
PMID:41524271
|
综述 | 综述WRKY转录因子在作物生物胁迫防御反应中的核心调控作用 | 系统总结了WRKY在多种生物胁迫（真菌、细菌、卵菌、病毒、害虫）中的调控机制，并探讨了利用多组学与精准基因编辑、合成生物学、基因驱动和人工智能整合提升作物抗性的新方向 | 未具体讨论WRKY在不同作物或不同胁迫条件下的功能特异性差异及潜在副作用 | 阐明WRKY转录因子在作物生物胁迫防御中的调控网络及其在抗性育种中的应用潜力 | WRKY转录因子家族及其在作物生物胁迫响应中的调控模块 | 机器学习 | NA | 多组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 作物 | NA | 农业 |
| 623 | 2026-04-29 |
Reconstitution of Archaeal Membrane Lipid Biosynthesis in Bacterial and Eukaryotic Hosts
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500981
PMID:42046273
|
综述 | 介绍在细菌和真核宿主中重构古菌膜脂生物合成的研究进展 | 系统综述了通过合成生物学和代谢工程实现古菌脂质合成途径的跨域重构，并发现细菌和真核酶对古菌脂质前体具有显著的底物混杂性，从而无需古菌酶即可合成多种古菌脂质 | 未明确提及现有研究的局限性 | 研究古菌膜脂生物合成途径的重构、宿主系统及工程策略，探讨脂质分界的演化含义及生物技术应用 | 古菌膜脂生物合成途径及其在细菌和真核宿主中的重构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli), 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 古菌脂质生物合成途径，包括核心古菌酶的表达和异戊二烯前体供应的增强 | 工业生物技术、医药 |
| 624 | 2026-04-29 |
GAN-GA: A Deep-Evolutionary Approach for Synthesizing Functionally Similar Heat Shock Proteins
2026-Apr-27, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3688058
PMID:42043999
|
研究论文 | 提出GAN-GA混合框架，结合生成对抗网络与遗传算法以设计功能相似的热激蛋白 | 将Wasserstein GAN与多目标遗传算法NSGA-II结合，在蛋白质序列生成后加入理化性质优化阶段，克服传统生成方法缺乏功能验证的局限 | 未详细说明对生成蛋白质的湿实验验证结果，论文仅描述序列优化阶段未提及实际蛋白质表达与功能测试 | 开发一种无需天然模板的从头蛋白质设计方法，生成具有生物学相关性的功能蛋白序列 | 合成热激蛋白HSP70和HSP90的序列设计 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列生成 | Wasserstein GAN, NSGA-II, ProtBert, ESM, 变分自编码器, 强化学习 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 625 | 2026-04-29 |
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Apr-27, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
DOI:10.1002/brv.70175
PMID:42046427
|
综述 | 综述光周期通过生长素流调控树木次生生长的机制及其潜在应用 | 提出生长素流作为光周期调控次生生长的关键机制，并探讨合成生物学方法调控光周期-生长素流关系以优化树木性能 | 现有证据尚不充分，部分分子机制（如FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子）的作用未完全明确 | 阐述光周期通过生长素流调控次生生长的机制，并探索利用该机制增强树木生长和干旱抗性的策略 | 温带森林树木（尤其杨树）的次生生长过程 | 植物生物学、森林科学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 杨树（Populus） | 设计光周期不敏感的生长素生物合成回路 | 环境（碳封存）、农业（林木优化）、工业生物技术 |
| 626 | 2026-04-29 |
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-026-02201-5
PMID:41991721
|
研究论文 | 利用系统发育组学、代谢组学和异源表达方法，调查了82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成基因簇及其天然产物 | 首次系统性地对肉座菌目生防真菌的生物合成能力进行大规模调查，揭示了约80%的基因簇编码未知产物，并表征了四种参与未知产物合成的非核糖体肽合成酶样合成酶 | 仅涉及82种真菌，样品量有限，且主要关注生物合成基因簇与分子的关联，未能覆盖所有潜在生物活性化合物 | 探索肉座菌目真菌作为生物防治剂的生物合成潜力，为可持续农业害虫防治奠定基础 | 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌及其生物合成基因簇 | 数字病理学 | NA | 系统发育组学, 代谢组学, 异源表达 | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | 82种真菌物种 | 异源表达 | NA | 生物合成基因簇 | 农业 |
| 627 | 2026-04-29 |
Single Molecule Force Measurements Reveal Energy Stabilization of Theophylline Aptamer RNA Switch Required for Gene Control
2026-Mar-25, ACS physical chemistry Au
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsphyschemau.5c00109
PMID:41909145
|
研究论文 | 利用单分子力谱测量茶碱适体RNA开关的能量稳定化机制及其在基因调控中的作用 | 首次通过光镊单分子力谱技术量化了茶碱结合对RNA适体折叠动力学的影响，发现茶碱通过稳定结构而非诱导构象重排来调控基因表达 | 未提及实验局限性或应用中的潜在挑战 | 揭示茶碱适体RNA开关的折叠动力学和能量稳定化机制，为合成生物学中适体工具的设计提供依据 | 茶碱适体RNA | 合成生物学 | NA | 光镊单分子力谱（optical tweezers single-molecule force spectroscopy） | NA | 单分子力曲线 | 单分子级别的RNA分子样本 | NA | NA | 茶碱适体RNA开关（theophylline aptamer RNA switch） | 合成生物学, 医学（治疗） |
| 628 | 2026-04-28 |
Mechanistic Insight into Conformational Control of Enzyme Activity by Genetically Encoded Metal-Responsive Switches
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70349
PMID:42033023
|
研究论文 | 探究基于遗传编码金属响应开关的酶活性构象控制机制 | 揭示双吡啶丙氨酸金属螯合残基通过局部构象变化调控酶活性的分子机制 | 仅针对两种酶中的一种进行机理验证，通用性需进一步验证 | 阐明金属响应系统中连接基团控制构象变化驱动酶活性调节的机理 | 激烈火球菌脯氨酸寡肽酶（Pfu POP） | 合成生物学 | NA | 荧光金属竞争实验、分子动力学模拟、F核磁共振波谱 | NA | 分子结构数据、荧光信号 | NA | NA | NA | 金属响应开关 | 合成生物学、生物传感、可编程催化 |
| 629 | 2026-04-28 |
From Design to Practice: A Comprehensive Tutorial for the Rapid Multiplex Engineering of Escherichia coli Using Antibiotic Resistance Markers
2026-Apr-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5665
PMID:42037765
|
研究论文 | 提供使用抗生素标记快速多重改造大肠杆菌的全面教程 | 整合15种抗生素抗性盒实现10-15个基因组修饰在3周内完成，并提供详细设计指南 | 不适用于需要无疤痕修饰的场景，且主要针对易操作微生物 | 建立一种快速、高效的多重基因组工程方法 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 重组工程 | NA | 实验方法 | NA | 重组工程，抗生素标记 | 大肠杆菌 | 多重基因组修饰 | 工业生物技术 |
| 630 | 2026-04-28 |
Modular Deep Learning for Direct RNA Sequence Design via Self-Contained RNA Units
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.719021
PMID:42039474
|
研究论文 | 提出了一种基于自包含RNA单元（SCRU）的模块化深度学习框架，用于直接设计RNA序列 | 通过构建包含超过61,000个自包含RNA单元（SCRU）的SCRU-DB数据库，将RNA分解为结构自主的模块，突破了传统方法依赖高分辨率3D结构数据的瓶颈，并实现了直接O(1)预测和高效扩散采样 | 未提及具体局限性，但可能依赖于SCRU数据库的完整性和结构聚类准确性 | 开发可扩展且物理合理的RNA序列设计方法 | RNA序列及其自包含结构单元 | 合成生物学, 深度学习 | 不适用 | 深度学习, 3D结构聚类, GNN | 图神经网络（GNN）, 扩散模型 | 序列, 3D结构数据 | 超过61,000个自包含RNA单元（SCRU），涵盖8,200多个独特结构簇 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学 |
| 631 | 2026-04-28 |
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Apr, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202514620
PMID:41848017
|
综述 | 介绍基于纳米颗粒膜包覆凝聚液滴的形成机制、理化性质及仿生应用 | 系统分类纳米颗粒膜形成的主要驱动力（界面能驱动自组装、静电相互作用主导组装、协同多机制组装），并强调膜包覆显著提升凝聚液滴的结构完整性和选择性分子渗透性 | 当前在纳米颗粒包覆凝聚液滴的设计和调控方面存在局限性 | 通过概述纳米颗粒基膜包覆凝聚液滴的研究进展，推动其在合成生物学和仿生材料领域的进一步研究和应用 | 凝聚液滴和基于纳米颗粒的膜包覆系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 仿生材料 |
| 632 | 2026-04-28 |
Exploring the chemical diversity of Dictyostelium secondary metabolites and their biological implications
2026-Mar-10, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04742-8
PMID:41805866
|
综述 | 详细介绍盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其生物学意义 | 首次全面总结了盘基网柄菌中独特的次级代谢产物化学多样性，包括其他微生物来源中未发现的稀有骨架化合物，并揭示了多酮合酶和萜烯合酶基因家族在代谢多样性中的作用 | 未提及具体的研究局限性，可能受限于现有基因组数据的不完整性和代谢产物产出量的优化问题 | 探索盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其在药物发现中的潜在应用 | 盘基网柄菌的次级代谢产物，包括多酮类、萜类、生物碱、酚类和肽类等 | 天然产物化学 | NA | 色谱法, 光谱法, 化学合成, 基因组挖掘 | NA | 文本, 化学结构数据 | NA | NA | 盘基网柄菌 | NA | 医学, 药学 |
| 633 | 2026-04-28 |
From machine learning to multimodal models: The AI revolution in enzyme engineering
2026-Mar, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100044
PMID:42038007
|
综述 | 本文系统回顾了人工智能在酶工程中的发展，从传统机器学习到多模态模型，并提供了当前酶工程任务的指导图景 | 提出了AI在酶工程中演进的四个阶段（经典机器学习、深度神经网络、蛋白质语言模型和多模态架构），并总结了重塑该领域的四大趋势，包括从手工特征到统一嵌入、从单模态到多模态系统的转变等 | 作为综述，未提出新的实验方法或数据，可能未涵盖所有最新研究进展 | 提供AI在酶工程中应用的整合视角，包括模型类型、关键任务和数据资源 | 酶工程任务，包括功能注释、结构建模和性质预测 | 机器学习 | NA | NA | 经典机器学习算法、深度神经网络、蛋白质语言模型、多模态架构 | 蛋白质序列与结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物催化、药物发现 |
| 634 | 2026-04-28 |
Bacterial secondary metabolites as resistance-modifying adjuvants: microbial origins, molecular mechanisms, and translational relevance
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1779022
PMID:42039799
|
综述 | 综述2020至2025年间细菌次级代谢产物作为抗性修饰佐剂的研究进展 | 将细菌次级代谢产物重新定位为下一代抗菌药物耐药性干预策略的核心组成部分，并整合其化学多样性、生态功能及多项分子机制 | 未明确提及具体局限性，但综述性质决定了缺乏原始实验数据验证 | 阐述细菌次级代谢产物作为抗性修饰佐剂在对抗抗菌药物耐药性中的作用 | 细菌次级代谢产物及其抗性修饰机制 | 微生物学 | 抗菌药物耐药性相关疾病 | 基因组挖掘、多组学方法、合成生物学、人工智能辅助结构活性建模 | NA | 综述性数据 | NA | 合成生物学 | 细菌 | 抗性修饰回路（如外排泵抑制、β-内酰胺酶抑制、核糖体保护干扰、生物膜与群体感应网络破坏） | 医学、生物技术 |
| 635 | 2026-04-28 |
Synthetic microbiomes in bioengineered rhizospheres: new frontiers for climate-resilient agriculture
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1780132
PMID:42039802
|
综述 | 探讨通过设计合成微生物组和工程化根际来增强植物在环境胁迫下的恢复力，以应对气候变化对农业的威胁 | 整合多界微生物（细菌、真菌、原生生物和古菌）互作，并结合合成生物学工具（如CRISPR）和系统生物学方法，提出针对特定胁迫的定制化根际工程策略 | 对多界微生物动态的理解不足、合成群落在特定环境下的优化困难、实验室成果向田间应用转化时面临规模化和生态安全性挑战 | 开发气候韧性可持续农业系统 | 多界微生物群落（细菌、真菌、原生生物、古菌）及植物根际系统 | 微生物生态学 | NA | CRISPR基因编辑、代谢通路工程、高通量筛选、机器学习、宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 代谢通路工程 | 植物（根际宿主） | 合成微生物组（SynComs）、根际工程（调控根系分泌物和土壤理化性质） | 农业 |
| 636 | 2026-04-27 |
Multilayer microbial framework of aerobic granule microecosystems: Integrating community ecology, genetic networks, and enhancement strategies
2026-Jul, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134569
PMID:41950970
|
综述 | 提出好氧颗粒污泥微生态系统的多层微生物框架，整合群落生态学、遗传网络和强化策略 | 提出功能性状驱动的自组织过程而非简单细胞聚集的概念框架，揭示群体感应系统与代谢协同和功能分区强化的关联机制 | 缺乏定量跨尺度耦合模型，当前强化策略存在局限性，工程普遍性和可设计性尚需验证 | 统一解释好氧颗粒污泥形成与稳定性的微生物学机制 | 好氧颗粒污泥微生态系统 | 环境微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 好氧颗粒污泥中的微生物群落 | 群体感应调控回路（luxI/luxR通路） | 废水处理, 环境工程 |
| 637 | 2026-04-27 |
Ion- and Temperature-Programmable Reconfiguration of Subcompartments in Synthetic Cells
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500928
PMID:42029428
|
研究论文 | 提出一种纯镁离子介导的可逆子区室组装机制，实现合成细胞内的动态重构 | 首次利用镁离子作为可逆调控因子，通过离子浓度和温度变化实现合成细胞子区室的空间重构，克服了合成细胞设计中动态重组的挑战 | 未研究镁离子在生理浓度下的长期稳定性及多离子协同效应，也未验证该系统在复杂生物环境中的适用性 | 开发一种基于物理刺激的合成细胞动态组织机制，模拟活细胞子区室的空间重组 | 带负电的巨型单层囊泡和中性大单层囊泡，分别作为合成细胞底盘和子区室模型 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 638 | 2026-04-27 |
Membrane-Based Assembly and Interactions in Immune Receptors
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00993
PMID:41865294
|
综述 | 本文综述了免疫受体的膜基组装和相互作用，探讨了其在脂质双层中的分子原理和结构基序 | 系统总结了跨膜结构域（TMD）在免疫受体组装和信号传导中的关键作用，并揭示了膜内与膜间的分子相互作用对受体结构和功能的重复性解决方案 | NA | 理解免疫受体在脂质双层中的组装和调控机制，以及它们在合成生物学应用中的潜力 | 免疫受体，特别是单跨膜蛋白组成的受体复合物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 639 | 2026-04-27 |
Engineering oncolytic bacteria as precision cancer therapeutics: design principles, therapeutic strategies, and translational perspectives
2026-Apr-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf085
PMID:41128615
|
综述 | 综述了工程化溶瘤细菌作为精准癌症治疗平台的设计原则、治疗策略和转化前景 | 系统整合了合成生物学调控回路设计（感知外源信号、细菌自身信号、肿瘤微环境特征）与多种治疗模态的联合策略 | 未提及临床试验中宿主免疫反应对细菌活性的具体影响及长期安全性数据 | 为开发安全有效的个性化细菌癌症疗法提供设计框架和转化路线 | 工程化溶瘤细菌及其基因调控回路 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 群体感应系统, 合成基因回路 | 细菌（如溶瘤细菌） | 诱导型/自主调控回路（包括群体感应开关、细菌入侵开关、一氧化氮响应启动子、缺氧/低pH/乳酸响应启动子），产物释放模块（前药转化酶、细胞因子、抗体/纳米抗体片段） | 医学 |
| 640 | 2026-04-25 |
Systematic Categorization and Functional Diversity of Secondary Metabolites from Bacillus spp.: A Review
2026-Apr-24, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-11007-9
PMID:42029996
|
综述 | 系统分类基于芽孢杆菌属的次级代谢产物，并总结其功能多样性 | 基于生物合成逻辑和化学骨架系统分类芽孢杆菌次级代谢产物，并整合其作用机制与结构-功能关系 | 代谢产物在复杂混合物中的异质性、产量和可制造性、细胞毒性和稳定性，以及体内特定化合物因果归因的挑战 | 系统分类和总结芽孢杆菌属次级代谢产物的功能多样性及潜在应用 | 芽孢杆菌属产生的次级代谢产物 | 微生物学 | NA | 基因组挖掘、代谢组学去重复、合成生物学 | NA | 化学结构数据、代谢物数据 | NA | 合成生物学 | 芽孢杆菌 | NA | 农业, 食品, 医药 |