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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-04-15 |
The next frontier: Exploring plant hypoxia sensing and response mechanisms through synthetic biology
2026-Apr-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2606254123
PMID:41973930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 642 | 2026-04-25 |
From Gene Knockouts to Genome Remodeling: Large DNA Fragment Deletion Technologies in Plants
2026-Mar-15, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15060909
PMID:41901428
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综述 | 系统比较植物中用于大DNA片段删除(LDFD)的主要技术,包括ZFNs、TALENs、CRISPR/Cas系统、位点特异性重组酶、转座子系统及引物编辑衍生策略,并讨论当前瓶颈与未来方向 | 首次全面比较植物中多种LDFD技术的机制与效率,强调植物特异性染色质组织和DNA修复对删除效果的约束,并展望AI辅助设计核酸酶与重组酶等新方向 | NA | 综述植物中大DNA片段删除技术的现状、瓶颈及未来发展方向,以推动功能基因组学与理性基因组设计 | 植物中已应用的大DNA片段删除技术 | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR/Cas系统(Cas9、Cas12a、Cas3),位点特异性重组酶,转座子系统,引物编辑衍生策略 | NA | NA | NA | ZFNs, TALENs, CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a, CRISPR-Cas3, 位点特异性重组酶, 转座子系统, 引物编辑衍生策略 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 643 | 2026-04-25 |
Engineered Bacteriophages: A Next-Generation Platform for Precision Antimicrobials and Therapeutics
2026-Mar-13, Viruses
DOI:10.3390/v18030355
PMID:41902263
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综述 | 系统总结了工程化噬菌体在制备技术、抗菌应用和癌症治疗中的进展,并分析了临床转化的挑战 | 提出工程化噬菌体作为可定制的精准生物工具,融合合成生物学、医学和环境科学,为抗菌药物耐药性危机提供变革性解决方案 | 监管审批、大规模生产和长期安全性验证等关键挑战尚未解决 | 总结工程化噬菌体的制备技术及其在精准抗菌和医疗中的应用前景 | 工程化噬菌体 | 合成生物学 | 抗菌药物耐药性感染、胃肠道疾病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 基因修饰、化学偶联、物理封装 | 噬菌体 | 工程化噬菌体作为精准抗菌剂、靶向递送载体、免疫佐剂 | 医学、环境科学 |
| 644 | 2026-04-24 |
Protein-free membrane fusion: A refined view of the delicate fusogenic properties of calcium
2026-Apr-21, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.03.040
PMID:41863074
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研究论文 | 本文使用微流控捕获平台结合共聚焦显微镜,定量研究了钙离子介导的巨型单层囊泡融合,揭示了其作为无蛋白质融合剂的精细特性 | 首次在细胞大小的膜上系统量化钙离子介导的融合效率,并发现融合依赖于狭窄的参数空间,澄清了不同尺寸囊泡实验间的长期矛盾 | 研究仅限于特定脂质成分和钙浓度,未涵盖生理条件下其他离子或蛋白质的影响 | 阐明钙离子在无蛋白质条件下促使细胞大小膜融合的机制及其应用潜力 | 巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 数百个单个囊泡 | NA | NA | NA | 合成生物学, 膜重构研究 |
| 645 | 2026-04-24 |
On-Demand Droplet Routing and Splitting Using Independently Addressable Interdigitated Electrodes
2026-Mar-20, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17030375
PMID:41900261
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研究论文 | 提出一种利用独立寻址叉指电极实现按需液滴路由和分裂的低电压微流控平台 | 将倾斜叉指电极与非对称Y型结点集成,在单一器件中实现电可调液滴分裂与分选,并通过低电压介电泳实现液滴动态路由和实时确定性分裂 | NA(摘要未明确提及局限性) | 开发低电压微流控平台,实现液滴的按需路由和分裂,用于生物化学分析 | 微流控芯片中的液滴 | 微流控 | NA | 微流控、介电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、单细胞分析、分子诊断、合成生物学 |
| 646 | 2026-04-24 |
Unintended Creation or Insertion of Antisense Promoter Motifs During Codon Optimization: A Cyber-Biosecurity Risk
2026-Mar-12, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14030638
PMID:41900397
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研究论文 | 本研究探究密码子优化过程中无意引入或有意插入反义启动子基序(如“TATAAT”)的网络安全风险,并开发了计算管道进行检测和防御 | 首次揭示密码子优化工具中双向DNA链筛查的缺失可能导致潜在生物网络安全漏洞,并提出计算防御策略 | 研究主要基于计算机模拟分析和公共数据集,缺乏湿实验验证插入反义基序后的实际生物效应 | 评估密码子优化过程中反义启动子基序的无意引入或有意插入风险,并提出防御方法 | 484741个蛋白质编码序列及其密码子优化后的反义链基序 | 合成生物学 | NA | 密码子优化 | NA | 基因组序列 | 484,741个蛋白质编码序列 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 647 | 2026-04-24 |
A Scaffoldomics Platform for Modular In Vivo Enzyme Colocalisation and Its Application to Naringenin Biosynthesis
2026-Mar, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70328
PMID:41814496
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研究论文 | 开发了一种‘支架组学’平台,用于模块化体内酶共定位,并应用于柚皮素生物合成 | 提出了一种通用的‘支架组学’合成框架,能够实现多达四种途径酶在蛋白支架上的组合组装,并通过大肠杆菌中染色体编码的生物传感器实现实时检测和途径评估 | 当前方法仍可能劳动密集且效率不足,但该平台展示了显著改善 | 提高微生物细胞工厂的代谢效率,增强精细化学品的产量 | 微生物细胞工厂中的酶共定位系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白支架组装、生物传感器 | NA | 实验数据 | 多种酶组合的支架组装和柚皮素生物合成实验 | 蛋白质工程、生物传感器 | 大肠杆菌 | 蛋白支架用于多酶复合物组装和代谢途径优化 | 工业生物技术、医药 |
| 648 | 2026-04-23 |
iFLinkC-EZ: A scalable and automatable method for the assembly of complex fusion proteins and multi-gene expression constructs based on the iFLinkC framework
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.03.008
PMID:42006855
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研究论文 | 本文介绍了一种基于iFLinkC框架的可扩展且可自动化的方法iFLinkC-EZ,用于组装复杂融合蛋白和多基因表达构建体 | iFLinkC-EZ通过遗传手段纯化DNA组装产物,简化了组装过程并使其兼容机器人自动化,克服了传统方法需要物理纯化DNA片段的限制 | NA | 开发一种标准化框架,用于组装任意大小和复杂度的蛋白质编码序列和多基因表达构建体 | 融合蛋白和多基因表达构建体,包括单色和多色多荧光融合蛋白以及多顺反子表达构建体 | 合成生物学 | NA | 迭代功能性连接子克隆(iFLinkC) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 酵母 | 合成蛋白开关、传感器、多酶复合物以及由此组成的遗传电路和代谢途径 | 生物技术 |
| 649 | 2026-04-23 |
Natural Food Pigments: From Biosynthesis to Application
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05093
PMID:41954457
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综述 | 本文综述了天然食品色素的生物合成、合成生物学策略、药理活性机制以及在医药、保健和化妆品中的应用进展 | 系统整合了天然色素的生物合成路径、合成生物学策略、药理活性机制及多领域应用,结合代谢工程、人工智能辅助筛选和生物传感等新兴技术,提出了从基础合成到高价值应用的跨学科发展路径 | NA | 探讨天然色素的生物合成、应用潜力及作为功能性色素在天然药物开发中的多重价值 | 天然食品色素,包括吡咯、类异戊二烯、醌类、酚类和甜菜碱五大结构类别 | NA | NA | 代谢工程、人工智能辅助筛选、生物传感 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、保健、化妆品 |
| 650 | 2026-04-23 |
Decoding Outer Membrane β-Barrels: From Structural Curiosity to Engineered Nanotherapeutics
2026-Apr-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00902
PMID:41973831
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综述 | 本文综述了外膜β-桶状蛋白(OMPs)的结构、功能多样性及其在生物传感、药物递送和纳米医学等领域的工程应用前景 | 将OMPs从结构研究对象提升为可工程化的精准生物分子设计平台,并系统整合了其从基础发现到纳米治疗应用的全链条发展 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或具体技术方案,主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨外膜β-桶状蛋白的结构功能特性及其在生物工程与纳米治疗领域的应用潜力 | 革兰氏阴性细菌、线粒体和叶绿体中的跨膜β-桶状外膜蛋白(OMPs) | 结构生物学与合成生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、核磁共振(NMR)、分子动力学模拟(MD simulations)、AlphaFold | NA | 结构数据、生物化学数据、相互作用组数据 | NA | 理性设计工程 | 革兰氏阴性细菌、线粒体、叶绿体 | 生物传感器、药物递送系统、诊断平台 | 医学、合成生物学、纳米医学、生物传感、诊断 |
| 651 | 2026-04-23 |
From Xylose to Biobased High-Value Chemicals: Advances in Microbial Xylose Utilization for Industrial Biotechnology
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06628
PMID:41979057
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综述 | 本文综述了微生物利用木糖生产高价值化学品的最新研究进展,重点关注木糖代谢途径、代谢工程策略以及相关挑战与未来机遇 | 系统总结了利用代谢工程和合成生物学技术提升微生物木糖利用效率的最新策略,并提出了从木质纤维素中高效提取木糖、葡萄糖与木糖共利用等关键挑战的解决方案 | NA | 提高木质纤维素生物质中木糖的利用效率,以生产高价值化学品并促进工业生物技术发展 | 微生物的木糖代谢途径及利用木糖生产高价值化学品的生物过程 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 能源,工业生物技术 |
| 652 | 2026-04-23 |
Living Microbial Drugs
2026-Apr-22, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202503523
PMID:42015835
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综述 | 本文综述了活微生物治疗剂作为新型药物类别的发展,从传统益生菌到先进的合成生物学工程微生物,探讨了其设计原则、应用领域及面临的挑战 | 将合成生物学应用于微生物工程,使其具备检测宿主信号、原位递送治疗药物的能力,实现动态、自调节的个性化治疗 | 存在生物安全性、生物控制、监管审批和患者接受度等障碍 | 探讨活微生物治疗剂作为新型药物的发展、设计原则及其在疾病治疗中的应用 | 工程化微生物(包括细菌、酵母、噬菌体和古菌)作为治疗平台 | 合成生物学 | 传染病、代谢疾病、炎症性疾病、癌症 | 合成生物学、遗传逻辑电路、群体感应调控、合成记忆设备 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌、酵母、噬菌体、古菌 | 遗传逻辑电路、群体感应调控系统、合成记忆设备,用于实现上下文依赖和自我调节的治疗能力 | 医学 |
| 653 | 2026-04-23 |
Epigenetic Control of Toehold-Mediated Strand Displacement for Programmable Molecular Circuit Regulation and Enhanced microRNA Detection
2026-Apr-21, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01658
PMID:41952075
|
研究论文 | 本文提出了一种利用N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰调控toehold介导的链置换反应的方法,实现了对DNA分子电路的可编程动力学控制,并应用于microRNA检测 | 首次将单碱基表观遗传修饰(mA)引入toehold结构域,实现了对链置换反应动力学的可逆、精确调控,突破了传统方法依赖固定toehold稳定性的限制 | 未明确说明该技术在其他类型核酸电路或更复杂生物环境中的普适性及长期稳定性 | 开发一种可编程调控分子电路动力学的新方法,并提高microRNA检测的灵敏度与特异性 | toehold介导的DNA链置换反应、催化发夹组装电路、癌症相关microRNA-21 | 合成生物学 | 癌症 | 单碱基N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰、脱甲基酶FTO调控、细胞内成像 | NA | 实验数据与理论分析 | NA | NA | NA | 表观遗传调控的toehold介导链置换系统、催化发夹组装电路 | 生物传感、分子计算、合成生物学 |
| 654 | 2026-04-23 |
mRNA medicine for cardiovascular disease
2026-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00804-8
PMID:41981145
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综述 | 本文综述了mRNA技术在心血管疾病治疗中的进展,包括mRNA修饰、递送平台、基因组编辑及免疫细胞工程等应用 | 整合了mRNA修饰、纳米技术、基因组编辑和RNA合成生物学的最新进展,为心血管疾病提供了新的治疗策略 | NA | 探讨mRNA技术在心血管疾病治疗中的应用潜力和发展方向 | 心血管疾病,包括高胆固醇血症、动脉粥样硬化、缺血性心脏损伤、心脏纤维化和心脏淀粉样变性 | NA | 心血管疾病 | mRNA技术、纳米技术、基因组编辑、RNA合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 655 | 2026-04-22 |
Synthetic Control of Implanted Engineered Liver Tissue Growth
2026-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693527
PMID:41427324
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学工具控制植入后工程肝组织生长的策略,以解决组织工程植入物规模扩大的临床转化难题 | 结合合成生物学和组织工程技术,首次实现植入后通过合成触发因子按需诱导工程肝组织生长 | NA | 开发一种通过植入后诱导生长来扩大工程组织规模的方法,以治疗器官衰竭 | 工程肝组织和人肝细胞 | 组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具、YAP和生长因子信号通路调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人肝细胞 | 通过合成生物学工具控制YAP和生长因子信号轴,以驱动组织扩张 | 医学 |
| 656 | 2026-04-21 |
Functional identification of key enzymes in calycosin biosynthesis in Astragalus membranaceus and establishment of heterologous expression system
2026-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2026.100118
PMID:42005051
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研究论文 | 本研究鉴定了黄芪中毛蕊异黄酮生物合成的三个关键酶,并成功在酵母和烟草中建立了异源表达系统 | 揭示了毛蕊异黄酮的新型合成途径,发现AmOMT2的多功能性拓宽了AmIFS的底物范围 | NA | 阐明黄芪中毛蕊异黄酮的生物合成途径并建立异源生产系统 | 黄芪(Astragalus membranaceus)及其关键生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组织特异性表达分析 | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 酵母, 烟草 | 毛蕊异黄酮生物合成途径(涉及AmIFS、AmOMT2、AmI3'H三个关键酶) | 医药 |
| 657 | 2026-04-21 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Jun, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过连接结构预测、功能注释和理性设计,形成一个协同循环,从而彻底改变蛋白质研究 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,展示了深度学习在蛋白质结构预测、功能注释和从头设计中的突破性进展,并阐述了这些领域如何相互促进,形成一个自我强化的循环 | 在数据稀缺性、模型可解释性以及分布外泛化方面仍存在挑战 | 阐述深度学习如何变革蛋白质研究,并展示结构预测、功能注释和理性设计之间的协同循环 | 蛋白质(特别是单域、球状蛋白质) | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆向折叠模型,混合实验-计算工作流(如与AI集成的冷冻电镜) | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI | 序列数据,3D坐标,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 658 | 2026-04-21 |
Post-translational modifications of silk proteins
2026-Apr-16, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d6cb00012f
PMID:41822872
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综述 | 本文综述了丝蛋白的翻译后修饰(PTMs)如何赋予其化学多样性,从而调控其高级组装、水合作用和共价连接性,并探讨了这些修饰对蛋白质结构稳定性和机械性能的贡献 | 整合了蛋白质组学揭示的低丰度PTMs新发现,并强调了合成生物学和生物正交化学在程序化安装修饰以调控理化性质方面的最新进展 | NA | 为在化学生物学与材料科学交叉领域预测性设计下一代蛋白质基材料奠定基础 | 丝蛋白及其翻译后修饰 | 化学生物学与材料科学交叉领域 | NA | 蛋白质组学、合成生物学、生物正交化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料 |
| 659 | 2026-01-26 |
A new frontier in synthetic biology: leveraging phase separation for robust gene circuits
2026-Apr-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.020
PMID:41580366
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 660 | 2026-04-21 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
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综述 | 本文全面总结了植物异戊烯基转移酶(PTs)的多样性、催化活性、机制及其在异源生产异戊烯化天然产物(PNPs)中的应用 | 系统综述了超过160种已报道的植物UbiA型PTs和代表性IDSs,填补了植物PTs功能多样性理解的不足 | NA | 推进植物异戊烯基转移酶的表征与应用,为基于异戊烯化天然产物的药物开发奠定基础 | 植物异戊烯基转移酶(PTs)和异戊烯化天然产物(PNPs) | 合成生物学 | NA | 植物基因组学、合成生物学 | NA | NA | 超过160种已报道的植物UbiA型PTs和代表性IDSs | NA | NA | NA | 医药 |