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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-08-21 |
Plant-derived antioxidants: Biosynthesis, refining and applications
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108989
PMID:42503343
|
综述 | 本文综述了植物源抗氧化剂的分类、来源、抗氧化机制、生物合成与调控、提取精炼及其在食品和医药领域的应用进展 | 整合合成生物学、绿色纯化与纳米递送策略,提出克服植物源抗氧化剂工业挑战的新见解,并强调通过多靶点调控氧化应激通路来预防慢性疾病 | 未详细说明具体实验验证或量化数据,主要基于文献综述而非原始研究 | 总结植物源抗氧化剂的最新研究进展,并探讨其在食品和医药领域的应用前景及面临的挑战 | 植物源抗氧化剂,包括多酚类、萜类、维生素、生物碱和皂苷等 | 合成生物学 | 神经退行性疾病, 病毒性疾病, 心血管疾病, 糖尿病, 癌症 | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 食品工业, 医药 |
| 662 | 2026-08-21 |
Synthetic biomanufacturing of triterpenoids: From laboratory to industry
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108992
PMID:42503341
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综述 | 该综述总结了三萜类化合物的分类、生物活性、微生物合成策略及从实验室到工业规模的放大挑战 | 系统性地整合了代谢工程和合成生物学策略,包括酶优化、途径优化、区室化工程和系统生物学方法,并讨论了从实验室到工业规模放大过程中的技术经济可行性和产业前景 | 现有三萜类化合物微生物合成方法受限于生产效率、环境负担和产品多样性,且工业规模的发酵和下游处理仍需优化 | 探讨利用代谢工程和合成生物学实现三萜类化合物高效、可持续的异源生物合成,并推动其从实验室研究走向工业应用 | 三萜类化合物及其微生物合成宿主和生物合成途径 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献综述 | NA | NA | 微生物宿主(具体未指定) | 三萜类化合物的异源生物合成途径 | 医药、化妆品、食品、工业生物技术 |
| 663 | 2026-08-21 |
Converging quality by design, artificial intelligence, and biofoundry automation: A new paradigm for scalable circular biomanufacturing
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109001
PMID:42532294
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综述 | 本文综述了质量设计、人工智能和生物铸造自动化三者融合如何推动合成生物学从实验室创新走向工业化规模的循环生物制造。 | 提出将QbD、AI辅助设计和生物铸造自动化三者融合是当前阶段特征,而非单一技术,并系统分析了DBTL循环从研究工具转变为工业开发框架的过程。 | 依赖现有技术经济数据和生命周期数据,对于新兴产品可能缺乏充分对比;对监管差异的讨论主要聚焦于欧盟和美国,未能覆盖全球其他地区。 | 探讨合成生物学从实验室到工业规模循环生物制造的路径,识别未来十年需满足的条件以支持循环生物经济。 | 合成生物学产品、DBTL循环、微生物、植物和动物系统,以及欧盟和美国监管框架。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物、植物、动物细胞 | NA | 工业生物技术、环境、医药、农业 |
| 664 | 2026-08-21 |
Site-specific recombinases and their essential role in synthetic biology
2026-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109005
PMID:42570711
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综述 | 本文系统总结了位点特异性重组酶在合成生物学中的类别、结构机制、关键特性、重组模型、工程策略及多种功能应用 | 全面整合位点特异性重组酶的基础概念与最新进展,涵盖酶分类、结构机制和工程策略的多个层面,为合成生物学工具箱提供系统性参考 | 未详细讨论位点特异性重组酶在特定应用中的潜在局限或挑战,如脱靶效应和递送效率等 | 提供位点特异性重组酶在合成生物学中的系统性综述,以推动其发现、表征和工程化应用 | 位点特异性重组酶 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的DNA重组 | NA | 文献数据 | NA | 位点特异性重组酶(如Cre、Flp等),用于基因组工程和基因线路设计 | 未明确指定,涉及多种宿主 | 遗传开关、DNA组装和计算设计相关的基因线路 | 工业生物技术、医学 |
| 665 | 2026-08-21 |
Discovering what is possible: How synthetic biology illuminates development
2026-Aug-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101619
PMID:42242210
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观点文章 | 本文探讨了合成生物学如何通过自下而上的方法揭示多细胞组织的发育原理和因果机制,并展望了这些工程化系统在理解自然发育过程中的潜力。 | 强调合成系统作为简化平台,用于测试发育潜力的极限,理清因果关系,并预测模型,提供了一种新的研究路径。 | 文中未明确提及局限性,但可能隐含合成系统与自然系统的差异可能导致结论外推受限。 | 探讨合成生物学在阐明多细胞组织发育的一般原理和因果机制中的作用。 | 胚胎发育过程,多细胞组织的自组织性。 | 合成生物学、发育生物学 | NA | 基因组工程、成像、计算建模 | 预测模型 | 文本 | NA | 基因组工程 | NA | NA | 医学 |
| 666 | 2026-08-21 |
Rare functional groups and unique scaffolds in Streptomyces natural products
2026-Aug-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00012f
PMID:42300430
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综述 | 该综述总结了链霉菌天然产物中稀有官能团、独特骨架和非典型修饰的结构特征,并探讨其酶促机制与合成生物学应用 | 系统性地将链霉菌天然产物的独特结构与其生物合成酶机制联系起来,为细胞工厂设计和药物分子优化提供新思路 | 未提供具体实验数据,缺乏对各类天然产物覆盖深度的详细说明 | 通过分析链霉菌天然产物的结构多样性和生物合成酶,促进合成生物学在高效细胞工厂设计和新药研发中的应用 | 链霉菌天然产物及其稀有结构特征 | 天然产物化学、合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 链霉菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 667 | 2026-08-21 |
Fuel-Driven Coacervates: Design Principles, Dissipative Dynamics, and Life-like Functions
2026-Aug-19, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.6c02653
PMID:42504573
|
综述 | 本文综述了燃料驱动的凝聚体系统,重点关注不同燃料类别如何调控其形成、演化和解组装,以及耗散瞬态性质如何产生类生命功能 | 系统性地总结了燃料驱动凝聚体的设计原则和耗散动力学,强调了其在模拟生命系统中的前沿进展 | 综述文章,未提供新的实验数据,可能限制于现有研究的范围 | 探讨燃料调节的凝聚体系统及其在模拟无膜细胞器动态组织中的应用 | 燃料驱动的凝聚体(无膜细胞器模型) | 合成生物学 | NA | 自组装 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | 燃料驱动的凝聚体系统,涉及形成、演化、解组装的动态过程 | 医学、工业生物技术 |
| 668 | 2026-08-21 |
Enzyme Engineering: From Classical Strategies to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Aug-19, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04272
PMID:42616438
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综述 | 本文综述了酶工程从经典策略到AI驱动生物催化剂设计的演变过程,涵盖传统方法、人工智能辅助设计及未来趋势 | 整合了蛋白质语言模型、生成式AI和DBTL自动化闭环工作流在酶工程中的应用,强调自主实验室和可持续生物催化的新兴方向 | 未提供具体实验数据或案例验证,主要基于文献分析 | 总结酶工程从经典方法到AI辅助生物催化剂设计的进展、挑战和未来趋势 | 酶工程中的生物催化剂、蛋白质序列、结构和功能关系 | 机器学习 | NA | 高通量测序、蛋白质语言模型、深度学习、生成式AI | 蛋白质语言模型、深度学习模型、生成式AI模型 | 序列数据、结构数据、功能注释数据 | NA | 合成生物学工具 | NA | 设计-构建-测试-学习(DBTL)闭环工作流 | 工业生物技术, 可持续生物催化 |
| 669 | 2026-08-21 |
High-throughput synthesis of DNA fragments by molecular self-assembly of overlapping oligonucleotides
2026-Aug-19, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03266-2
PMID:42618804
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研究论文 | 本文介绍了一种名为分子自组装诱导克隆的高通量基因合成方法,通过寡核苷酸的重叠互补自组装和宿主细胞内的DNA修复机制,实现大规模基因片段的并行合成 | 该方法利用正交自组装克服了分子串扰和寡核苷酸错位问题,结合微芯片寡核苷酸合成,实现了超过1000个不同基因片段的一锅法并行合成,且错位率接近零 | 寡核苷酸合成错误仍维持在恒定但可控水平,未完全消除合成错误 | 开发一种高通量的基因合成方法,以解决合成生物学中DNA合成技术的瓶颈 | 基因片段、PETase酶的变体文库 | 合成生物学 | NA | 微芯片寡核苷酸合成、分子自组装、宿主细胞DNA修复 | NA | 基因序列数据 | 超过1000个基因片段 | NA | 宿主细胞(未具体指明) | NA | 工业生物技术 |
| 670 | 2026-08-21 |
Spatially Encoded Protocell Network for Non-Cascaded Parallel Biocomputation
2026-Aug-18, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.77019
PMID:42610528
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研究论文 | 本文提出了一种基于空间编码和梯度响应的原始细胞群落非级联并行生物计算架构,用于实现半加器和全加器逻辑运算 | 利用三维水凝胶基质中空间编码的梯度响应原始细胞群落,通过反应-扩散动力学实现非级联的并行多阈值计算,避免了传统分子级联中的信号衰减和串扰问题 | 未在摘要中明确说明局限性 | 开发一种低复杂度、稳健、非级联的分子计算系统,用于并行生物计算 | 空间编码的原始细胞群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基于空间编码的梯度响应原始细胞群落,实现半加器和全加器逻辑运算 | 合成生物学, 计算科学 |
| 671 | 2026-08-21 |
Systematic discovery of novel ribozymes with gene silencing properties from global deep-sea RNA viromes
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1866359
PMID:42614413
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研究论文 | 系统分析全球深海RNA病毒组,发现具有基因沉默功能的新型核酶 | 首次从深海RNA病毒组中系统发现大量锤头状核酶,并验证其对HIV-1和HSV-1的抑制能力,展示其作为治疗性催化RNA支架的潜力 | 文中未提及具体局限性 | 探索深海RNA病毒作为核酶资源库的潜力,并评估其基因沉默和抗病毒功能 | 全球深海沉积物中的RNA病毒组,包括291个样本中的1305种锤头状核酶 | 合成生物学 | HIV-1感染、HSV-1感染 | RNA病毒组测序 | NA | 序列数据 | 291个深海沉积物样本 | NA | NA | 锤头状核酶 | 医学, 合成生物学 |
| 672 | 2026-08-21 |
Microbial valorization of E-waste: Bacterial recycling and synthesis of technology-critical metal nanoparticles
2026, Advances in microbial physiology
DOI:10.1016/bs.ampbs.2026.06.001
PMID:42618146
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综述 | 本文探讨了电子废弃物作为城市矿山在循环经济中的作用,并重点介绍了利用细菌系统进行可持续金属回收的生物策略,以及将回收金属升级转化为具有应用价值的纳米颗粒。 | 将电子废弃物管理与微生物生物技术和纳米技术相结合,提出了一种可持续获取技术关键金属的新途径,强调利用组学方法指导合成生物学策略以增强金属回收和纳米颗粒合成。 | 未提及具体局限性。 | 探讨利用细菌回收电子废弃物中技术关键金属并合成金属纳米颗粒的可持续策略,促进绿色循环经济转型。 | 电子废弃物中的技术关键金属以及用于金属回收和纳米颗粒合成的细菌系统。 | 微生物生物技术、纳米技术、合成生物学 | NA | 转录组学、代谢组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 环境、材料、医学、能源 |
| 673 | 2026-08-20 |
Photodictated Programmed Orthogonal DNA Microdroplets Enable Molecular Communication between Transient Self-Sorting Membraneless Artificial Cells
2026-Aug-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c05486
PMID:42611219
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研究论文 | 本文报道了一种光引导策略,用于编程两种正交DNA液滴群体的液-液相分离,并实现瞬态融合、分子通信和自分类,基于此构建了多读自重写分子消息加密平台 | 首次通过光引导策略选择性编程两种正交DNA液滴群体的相分离,并实现瞬态融合与耗散性分子通信,展示了内在自分类能力,以及多读和自重写的分子消息加密应用 | 未明确提及局限性,可能限于体外人工细胞模型,尚未在活细胞中验证 | 构建能够展现动态分子通信、空间自分类和耗散信号传导的人工细胞模拟系统 | 两种正交DNA液滴群体,由DNA Y-motif组装而成 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 正交DNA液滴群体通过光引导液-液相分离,瞬态融合后实现分子交换和自分类 | 分子通信、信息加密 |
| 674 | 2026-08-20 |
Harnessing natural variation for photosynthetic improvement in next-generation crop breeding
2026-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70317
PMID:42290551
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综述 | 本文综述了光合作用自然变异的研究进展,探讨了如何利用自然遗传多样性和现代生物技术来优化光合作用,提高作物产量潜力,并增强作物对未来气候的适应性 | 系统整合了从生理、发育到冠层尺度的光合作用自然变异,并探讨了合成生物学与光合遗传工程在作物育种中的互补途径 | 未明确提及具体局限性 | 为利用自然遗传多样性和生物技术改造光合作用,提升作物生产力和气候适应性提供战略框架 | 作物光合性状及其自然遗传变异 | 植物科学、作物育种 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 增强光合能力的代谢通路或调控网络设计 | 农业 |
| 675 | 2026-08-20 |
Deep Learning Predicts Dissimilar DNA-DNA Binding and Engineers Hyperconnected Networks
2026-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75395-w
PMID:42426013
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研究论文 | 本文介绍了BINND,一种结合超高通量平台和深度学习模型的工具,用于预测DNA-DNA结合相互作用,并展示了其在构建超连接网络中的应用 | 利用深度学习模型快速准确预测非正交DNA相互作用,速度比现有模型快50倍,并能在多样序列上泛化 | 未提及具体的局限性 | 开发一种能够准确快速预测非正交DNA相互作用的模型,以利用完整的序列空间 | DNA-DNA相互作用 | 机器学习 | NA | 超高通量测量平台 | 深度学习模型(BINND) | 分子相互作用数据 | 未提供具体样本量,但平台测量数百万个相互作用 | NA | NA | 超连接网络(基于DNA相互作用的合成网络) | 生物工程,合成生物学 |
| 676 | 2026-08-20 |
A portable Cas6f-based system for multiplex translational repression in bacteria
2026-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-75135-0
PMID:42420316
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Cas6f的紧凑型系统MORTISE,用于革兰氏阴性细菌中的多重翻译抑制,不依赖宿主Hfq或RNase,并在大肠杆菌和恶臭假单胞菌中实现稳健的多重基因敲低 | 该系统利用Cas6f蛋白构建紧凑型平台,无需宿主Hfq或RNase,可在多种革兰氏阴性菌中工作,支持单启动子多重抑制和一步克隆装配多达9个引导序列,实现翻译起始区域的精确靶向 | 未明确提及局限性,但可能受限于革兰氏阴性菌宿主范围,且引导与靶转录匹配需要优化 | 开发一种不依赖宿主因子、可移植且可调的多重翻译抑制平台,以促进代谢工程和合成生物学应用 | 革兰氏阴性细菌(大肠杆菌和恶臭假单胞菌)及相关的基因表达系统 | 合成生物学 | NA | sRNA设计、染色体报告基因分析、克隆装配 | NA | 基因表达和代谢产物数据 | 未明确样本数量,涉及大肠杆菌和恶臭假单胞菌中的实验 | CRISPR-Cas6f系统 | 大肠杆菌, 恶臭假单胞菌 | 基于Cas6f的翻译抑制系统(MORTISE),支持多重基因敲低 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 677 | 2026-08-20 |
Probiotic-Based Materials as Living Therapeutics
2026-01, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508500
PMID:40999775
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综述 | 本文综述了基于益生菌的工程活体材料(PLMs)作为活体治疗药物的研究进展,涵盖其设计、应用及面临的挑战。 | 提出了益生菌活体材料(PLMs)作为工程活体材料(ELMs)的一个亚类,与活体生物治疗产品(LBPs)区分,并系统探讨其在多种医学应用中的潜力及临床转化障碍。 | PLMs在临床应用中面临缺乏稳健的益生菌工程遗传工具、生物安全担忧(如水平基因转移或非预期生物活性)、临床前结果转化困难及缺乏明确监管指南等挑战。 | 探讨基于益生菌的活体材料在生物医学应用中的设计、进展、生物安全问题及监管框架的现状。 | 基因工程益生菌与基质结合的活体材料(PLMs),涵盖生物传感、感染治疗、骨修复、伤口愈合、阴道失衡、肠道相关疾病和癌症治疗等应用。 | 生物医学工程 | 感染、骨损伤、伤口、阴道失衡、肠道疾病、癌症 | 合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 益生菌 | 基因工程电路用于生物传感和疾病治疗 | 医学 |
| 678 | 2026-08-19 |
SBOL converter: enabling backward compatibility for biological designs
2026-Aug-18, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2026-0005
PMID:42608859
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研究论文 | 本文介绍了SBOL转换器,一种支持生物设计向后兼容的工具,可将旧版设计更新至最新SBOL版本,并支持转换为旧版本以兼容传统工具,同时整合现有SBOL工具提供统一的验证和合规检查接口。 | 首次提供SBOL不同版本间的双向转换功能,支持向后兼容及向前兼容,并集成了现有SBOL工具和多种生物格式处理能力,作为轻量级工具加速工程生物学设计工作流。 | 未提及具体限制,但可能受限于SBOL版本间特性差异和工具集成复杂度。 | 旨在促进SBOL标准的采用,通过提供转换工具,实现生物设计在不同版本间的互操作性,提高设计的可重用性和可重复性。 | 生物设计数据,包括SBOL格式(各版本)及其他格式如GenBank和FASTA。 | 合成生物学 | NA | 软件工具开发 | NA | 文本(生物设计数据) | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 679 | 2026-08-18 |
Advances, challenges, and opportunities in engineering C5 and C6 sugar transporters in yeast for bio-based industrial biotechnology
2026-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2680416
PMID:42386498
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综述 | 本文综述了酵母中C5和C6糖转运蛋白工程化的进展、挑战和机遇,以推动生物基工业生物技术发展。 | 总结了C5糖转运的关键瓶颈,并重点介绍了理性蛋白工程、定向进化和机器学习等策略在扩展C5转运蛋白库和优化转运效率方面的最新突破。 | 未详细讨论C6糖转运的具体机制及全部工程化案例(根据摘要推断)。 | 促进酵母高效转化戊糖(D-木糖和L-阿拉伯糖),实现可持续的生物基生产。 | 酵母中的D-木糖和L-阿拉伯糖转运蛋白 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 680 | 2026-08-18 |
Fluorescent-Activating Proteins Manipulate Self-Assembly Peptides Trafficking and Intracellular Distribution
2026-Aug-17, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.6c00950
PMID:42606054
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研究论文 | 本文报道了一种结合孔雀石绿的自组装肽系统,该系统与荧光激活蛋白相互作用,能够精确调控肽在细胞内的运输和分布,从而逃避溶酶体降解 | 通过利用荧光激活蛋白的特异性结合特性,实现了对肽亚细胞定位的动态调控,具有时空控制肽聚集和分解的能力,为药物递送和合成生物学提供了新工具 | 摘要未明确提及局限性 | 开发一种能够精确调控细胞内肽运输和分布的自组装肽系统,以避免溶酶体降解并实现靶向递送 | 自组装肽与孔雀石绿的结合物及其与荧光激活蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像(共聚焦成像) | NA | NA | NA | 自组装肽-孔雀石绿系统与荧光激活蛋白的相互作用电路 | 药物递送、合成生物学 |