本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-04-16 |
Heterologous expression of Vibrio natriegens transporters enhances the growth of Escherichia coli and Bacillus subtilis on glutamate
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100264
PMID:41982386
|
研究论文 | 本研究通过异源表达Vibrio natriegens的谷氨酸转运蛋白,有效提升了Escherichia coli和Bacillus subtilis在谷氨酸碳源上的生长速率 | 首次发现跨物种底物转运蛋白可改变细菌细胞资源分配,为调控微生物生物量生长提供了新的遗传策略 | NA | 探索通过异源表达转运蛋白改善细菌在特定碳源上生长性能的方法 | Escherichia coli和Bacillus subtilis两种细菌 | 合成生物学 | NA | 异源表达技术 | NA | 生长实验数据 | NA | 异源表达系统 | Escherichia coli, Bacillus subtilis | 谷氨酸转运蛋白表达系统 | 工业生物技术 |
| 682 | 2026-04-16 |
Advances in polyethylene biodegradation and bioconversion: Microbial, enzymatic, and biotechnological insights
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100255
PMID:41982382
|
综述 | 本文系统总结了聚乙烯(PE)生物降解与生物转化的最新进展,包括降解效率评估方法、微生物与酶的降解机制、已鉴定的微生物与酶资源,以及增强降解效率的物理化学策略与生物方法的整合 | 将合成生物学和机器学习等前沿生物技术工具与传统生物降解方法相结合,以加速PE降解速率并实现更可持续的塑料废物管理 | NA | 开发可持续的解决方案以缓解顽固性聚烯烃(如聚乙烯)对环境造成的负担 | 聚乙烯(PE)塑料 | NA | NA | 生物降解、生物转化、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 683 | 2026-04-16 |
Genetically encoded biosensors enabled high-throughput screening of microbial cell factories
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100258
PMID:41982388
|
综述 | 本文综述了基因编码生物传感器在高通量筛选微生物细胞工厂中的应用、关键特征、工程策略及优化挑战 | 系统总结了生物传感器在高通量筛选中的关键性能特征,并详细阐述了通过合成生物学策略对生物传感器进行工程改造的最新进展 | NA | 为开发用于高通量筛选的基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂优化中的应用提供全面指导 | 基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂高通量筛选中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选(HTS)、合成生物学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学策略 | 微生物细胞工厂 | 生物传感器(用于检测天然与非天然产物) | 工业生物技术 |
| 684 | 2026-04-16 |
Biomaterials Based on Bacteria for Cancer Clinical Therapy
2026, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0350
PMID:41982812
|
综述 | 本文系统探讨了基于细菌的生物材料在癌症临床治疗中的应用,包括工程化细菌的抗肿瘤机制及其与标准疗法的协同潜力 | 利用合成生物学将细菌工程化为精确的活体治疗剂,实现局部药物递送、靶向免疫调节和肿瘤微环境重塑,并探讨其与化疗、放疗和免疫疗法的协同作用 | NA | 开发基于细菌的创新癌症治疗策略,克服传统治疗的耐药性 | 工程化细菌及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 685 | 2026-04-15 |
Benchmarking genetic elements for high-level protein expression using a novel Marchantia polymorpha transient expression system
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151715
PMID:41911994
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于农杆菌的瞬时表达系统,用于快速评估地钱中的遗传元件,并系统性地比较了多种启动子、终止子和信号肽的性能 | 开发了首个用于地钱的高通量瞬时表达系统,可在8天内完成实验,显著提高了遗传元件表征的效率,并发现了一个截短的CaMV35S启动子变体,其活性比标准版本提高了409倍 | NA | 开发并验证一种快速高效的瞬时表达系统,以扩展地钱的遗传工具包并提高蛋白质表达水平 | 地钱(Marchantia polymorpha)中的遗传元件,包括启动子、终止子和信号肽 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达系统 | NA | 蛋白质表达数据 | 21个启动子、15个终止子和7个信号肽 | 农杆菌介导的转化 | 地钱(Marchantia polymorpha) | NA | 农业 |
| 686 | 2026-04-15 |
Valorization of ligustrum species: biosynthesis, metabolic engineering, and pharmacology of bioactive compounds
2026-Mar-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01042-3
PMID:41888324
|
综述 | 本文综述了女贞属植物的生物活性化合物、药理特性、组学分析及生物合成研究进展,并提出整合多组学、合成生物学和绿色制造以实现其全植物价值化和种质资源保护的策略 | 提出整合多组学、合成生物学和绿色制造的综合性方法,以促进女贞属植物的全植物价值化和可持续利用,为药用资源开发提供新的理论框架和技术范式 | NA | 建立女贞属植物作为药用资源的全面开发和可持续利用的理论框架与技术范式 | 女贞属植物及其生物活性化合物(如三萜类、苯乙醇苷类、黄酮类等) | NA | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、环境、食品 |
| 687 | 2026-04-15 |
Label-Free Microfluidic Modulation Spectroscopy Monitors RNA Origami Structure and Stability
2026-Mar-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16030166
PMID:41892058
|
研究论文 | 本研究采用微流控调制光谱技术,作为无标记的结构生物传感器,用于监测RNA折纸的结构与稳定性 | 首次将微流控调制光谱技术应用于RNA折纸的结构分析,实现了对RNA碱基和碱基对在1760-1600 cm⁻¹振动指纹区的无标记、高通量检测 | NA | 开发一种可扩展的、溶液相的RNA折纸结构监测方法,以评估其设计架构、成熟过程及稳定性分布 | RNA折纸结构,特别是六螺旋束带扣的RNA折纸模型 | 合成生物学 | NA | 微流控调制光谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | RNA折纸作为支架用于生物传感、合成生物学和纳米医学 | 生物传感, 合成生物学, 纳米医学 |
| 688 | 2026-04-15 |
Systems biology can provide guidance to synthetic biology in the pursuit of new drug targets
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1770107
PMID:41971098
|
观点文章 | 本文通过案例研究展示了系统生物学分析在指导药物靶点发现中的力量,强调动态建模作为合成生物学中药物干预设计的探索工具 | 利用系统生物学分析简化生理电路,揭示直觉可能误导药物靶点选择,并展示动态建模如何克服这一挑战,为合成生物学提供指导 | 案例研究基于简化的线性代谢通路模型,可能未完全反映真实生物系统的复杂性 | 探索系统生物学如何指导合成生物学在寻找新药物靶点方面的应用 | 涉及NQO1酶和β-拉帕醌的癌症相关氧化还原电路,作为生理反馈机制的案例 | 系统生物学与合成生物学 | 癌症 | 动态建模 | NA | NA | NA | NA | NA | 涉及NQO1酶的正反馈回路,模拟生理和病理中观察到的电路类型 | 医学 |
| 689 | 2026-04-15 |
Programmable saponin biosynthesis from gene networks to predictive biomanufacturing
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1800149
PMID:41971552
|
综述 | 本文综述了皂苷生物合成从基因网络到预测性生物制造的最新进展,包括合成生物学工具和AI辅助设计在优化生产平台中的应用 | 将皂苷研究从描述性途径阐明转向预测性和可编程的生物制造,通过合成生物学和AI技术实现精确控制与优化 | NA | 探讨皂苷生物合成的可编程和预测性生物制造策略 | 皂苷生物合成途径、基因网络和工业生物制造平台 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based transcriptional modulation, synthetic promoters, transcription factor rewiring, structure-guided enzyme engineering, AI-assisted protein design | NA | 基因组、多组学数据、代谢基因簇分析 | NA | CRISPR-Cas9 | engineered microbes, plant suspension cells, hairy roots, adventitious root systems | biosynthetic networks, metabolic pathways | medicine, industrial biotechnology |
| 690 | 2026-04-14 |
Incoherent feedforward loop dominates the robustness and tunability of necroptosis biphasic, emergent, and coexistent dynamics
2026-Mar, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.02.009
PMID:41971832
|
研究论文 | 本研究通过建模分析,揭示了坏死性凋亡信号通路中RIP1-RIP3-Caspase-8非相干前馈环作为核心拓扑结构,主导双相、涌现和共存动力学的鲁棒性与可调性 | 首次引入潜在景观和香农熵量化坏死性凋亡共存动力学的不确定性,并系统筛选出实现BEC动力学的最小电路拓扑,确认非相干前馈环的核心作用 | 研究基于电路建模和理论分析,实验验证可能有限,且主要关注三节点电路,可能未涵盖更复杂网络 | 探究坏死性凋亡信号通路中双相、涌现和共存动力学的电路结构基础与调控机制 | 坏死性凋亡信号通路中的RIP1、RIP3和Caspase-8蛋白及其相互作用网络 | 合成生物学 | 细胞死亡相关疾病 | 电路建模、网络拓扑分析、随机电路分析、潜在景观和香农熵计算 | NA | 理论模型数据 | NA | NA | NA | 非相干前馈环嵌入RIP3对RIP1的正反馈,以及RIP3自磷酸化的钟形调节 | 医学 |
| 691 | 2026-04-13 |
INVITED REVIEW: Turning Dairy Food Waste into Valuable Products via Yeast Bioproduction
2026-Apr-09, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27900
PMID:41966398
|
综述 | 本综述探讨了如何通过酵母生物生产将乳制品食物废物转化为高价值产品 | 强调了利用酵母发酵,特别是乳糖发酵酵母和酿酒酵母,将乳制品废物转化为增值产品的策略,并讨论了新兴的菌株工程和合成生物学方法 | 面临工业优选酵母无法天然代谢乳糖、废物成分多变、微生物污染以及经济、物流和监管障碍等挑战 | 旨在减少乳制品食物废物,回收营养物质,降低温室气体排放,并支持乳制品行业的循环经济 | 乳制品食物废物,特别是奶酪乳清及其衍生物 | NA | NA | 酵母发酵,菌株工程,适应性进化,合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酵母,包括乳糖发酵酵母物种和酿酒酵母 | NA | 农业,环境,工业生物技术 |
| 692 | 2026-04-13 |
Beyond the Sequence: Chemical and Topological Design and Innovations in mRNA Therapeutics
2026-Apr-08, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00347
PMID:41875901
|
综述 | 本文综述了mRNA治疗中化学和拓扑工程的最新进展,包括修饰方法、合成策略、结构-活性关系及对下一代治疗的影响 | 引入了拓扑工程作为mRNA设计的新维度,如环状RNA、分支结构和合成套索架构,以调控稳定性、免疫原性和翻译效率 | NA | 探索mRNA的化学和拓扑工程,以优化其治疗应用 | mRNA分子,包括其化学修饰和拓扑结构 | 合成生物学 | 传染病、肿瘤、遗传病 | 化学合成、合成生物学、RNA结构设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 693 | 2026-04-13 |
Data storage and retrieval with unnatural proteins expressed via E. coli
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70061-7
PMID:41764153
|
研究论文 | 本研究通过将数字数据编码为氨基酸序列并整合到胶原样蛋白模板中,利用大肠杆菌表达非天然蛋白质进行数据存储,并通过胰蛋白酶消化和LC-MS/MS分析实现数据检索 | 开发了一种基于非天然蛋白质的数据存储和检索框架,利用胶原样蛋白模板和选择性氨基酸与精氨酸间隔实现高稳定性数据存储,并支持随机访问和加密数据保护 | 未提及具体的数据存储容量限制或表达效率的量化分析 | 建立基于蛋白质的数据存储和检索系统 | 非天然蛋白质和数据存储技术 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS分析、胰蛋白酶消化 | NA | 数字数据编码的氨基酸序列 | NA | 大肠杆菌表达系统 | 大肠杆菌 | 胶原样蛋白模板用于数据编码 | 数据存储、合成生物学、蛋白质工程 |
| 694 | 2026-04-12 |
In Vivo Tracking Modalities for Oncolytic Reovirus: Principles, Clinical Applications, and Translational Integration
2026-Apr-10, Molecular imaging and biology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s11307-026-02092-x
PMID:41963749
|
综述 | 本文综述了溶瘤呼肠孤病毒(特别是Pelareorep)在体内追踪的策略,包括光学成像、核成像、MRI、超声/光声技术、分子报告基因和纳米平台,并探讨了其在临床转化中的应用 | 批判性评估了当前和新兴的体内追踪策略,强调了合成生物学报告基因、AI驱动的图像分析、生物传感器和液体活检等新兴技术,为患者特异性追踪提供了可扩展的解决方案 | 存在基因组容量有限、免疫介导的清除和信号穿透性不足等持续挑战 | 评估溶瘤呼肠孤病毒的体内追踪策略,以优化其临床转化和个性化治疗 | 溶瘤呼肠孤病毒(特别是Pelareorep)及其在癌症治疗中的应用 | 医学影像学 | 癌症 | 光学成像、核成像、MRI、超声/光声技术、分子报告基因、纳米技术平台、CRISPR驱动电路、病毒条形码 | NA | 图像、分子数据 | NA | CRISPR | NA | CRISPR驱动电路 | 医学 |
| 695 | 2026-04-11 |
Engineering chaperone/usher pathway pili for surface display: Structural constraints, design principles, and biotechnological potential
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108865
PMID:41819295
|
综述 | 本文系统分析了基于伴侣蛋白/菌毛组装蛋白(CU)途径菌毛的细菌表面展示平台的结构约束、设计原则及生物技术潜力 | 通过统一的结构框架重新解读先前的展示策略,提炼出定义工程可塑性的保守设计原则,并提出了将CU菌毛扩展为多功能可调表面展示平台的实用工程方法 | NA | 为评估可行性及指导CU菌毛展示系统的理性工程提供结构引导的框架 | 大肠杆菌、沙门氏菌和鼠疫耶尔森菌中结构特征明确的CU菌毛 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测 | NA | 结构数据 | NA | NA | 革兰氏阴性细菌 | 细菌表面展示平台 | 生物技术 |
| 696 | 2026-04-11 |
Synthetic biology-engineered immunotherapies: Precision control of immune responses
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108871
PMID:41864375
|
综述 | 本文综述了合成生物学在精准免疫疗法中的应用,重点讨论了如何通过工程化细胞系统来克服现有免疫治疗的局限性 | 利用合成生物学设计可编程的细胞系统,实现逻辑门控激活和反馈控制的细胞因子分泌等上下文依赖的免疫功能,从而增强治疗的特异性和可调性 | NA | 探讨合成生物学如何推动精准免疫疗法的发展,以治疗癌症和免疫疾病 | 合成生物学工程化的免疫疗法,特别是可编程的细胞系统 | 合成生物学 | 癌症、自身免疫性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成免疫回路,包括设计的受体、模块化信号通路和逻辑门控激活、反馈控制的细胞因子分泌等 | 医学 |
| 697 | 2026-04-11 |
Engineering cis- and trans-acting RNA regulators for next-generation prokaryotic synthetic biology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108882
PMID:41921585
|
综述 | 本文综述了用于下一代原核合成生物学的顺式和反式RNA调控器,强调了它们在基因表达控制中的工程应用 | 提出了一个面向工程师的框架,围绕转录终止、翻译起始和mRNA稳定性三个可操作控制点,整合计算和AI辅助建模以提升可预测性和可移植性 | 主要基于大肠杆菌为中心的实施,可能在其他原核生物中的适用性有限 | 推动RNA调控成为下一代原核合成生物学中常规、可工程化的控制层 | 原核生物(如细菌)中的RNA调控器 | 合成生物学 | NA | RNA调控技术,包括5' UTR和RBS工程、核糖开关、核酶、合成小RNA和基于CRISPR的RNA靶向工具 | NA | NA | NA | CRISPR, 核糖开关, 核酶 | 大肠杆菌 | 顺式和反式RNA调控器,用于构建复杂和响应性细菌系统,如逻辑门和生物传感器 | 工业生物技术 |
| 698 | 2026-04-11 |
Engineering synthetic biology sensors with artificial intelligence: From programmable circuits to next-generation biosensing
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108874
PMID:41881285
|
综述 | 本文系统综述了人工智能如何推动合成生物学传感器从理性设计向AI驱动预测的转变,并提出了一个连接AI算法与DBTL周期的框架 | 首次建立了AI算法与DBTL周期的系统性框架,并提出了AI驱动工作流的三个核心前沿:AI引导的传感器元件设计、AI辅助的信号处理以及AI驱动的闭环优化 | 存在“现实差距”和“小数据困境”等未解决的障碍 | 探讨人工智能在合成生物学传感器设计与优化中的应用,推动其向稳健、可部署的智能传感系统发展 | 合成生物学传感器 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 生物传感器、逻辑门、振荡器 | 环境、医学、食品安全、工业生物技术 |
| 699 | 2026-04-11 |
Analysis and engineering of quorum sensing-based communications between bacteria and fungi
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03838-25
PMID:41801051
|
综述 | 本文综述了基于群体感应的细菌与真菌间通讯机制,分析了其在微生物网络组装和生态系统功能中的作用,并探讨了通过合成生物学策略重新编程这些相互作用的工程化前景 | 首次系统性地总结和分析了细菌与真菌间基于群体感应的跨物种通讯机制,并对比了自然范式与合成生物学设计策略,为模块化控制微生物群落提供了蓝图 | 该领域现有认识仍较为零散,缺乏系统性总结,且对某些特定环境或物种组合的相互作用机制理解尚不深入 | 全面分析和工程化改造基于群体感应的细菌与真菌间通讯,以促进对复杂微生物相互作用的解析并增强工程化微生物群落的能力 | 细菌与真菌间的群体感应通讯系统及其介导的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 启动子工程, 定向进化 | 细菌, 真菌 | 群体感应系统, 生物传感器 | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 700 | 2026-04-11 |
Antimicrobial peptides: emerging next-generation strategy for sustainable plant disease management
2026, Frontiers in antibiotics
DOI:10.3389/frabi.2026.1766594
PMID:41958967
|
综述 | 本文综述了抗菌肽作为可持续植物病害管理的新一代策略,包括其作用机制、结构功能多样性以及在农业中的应用潜力 | 将抗菌肽定位为应对气候变化、单一栽培和化学农药过度使用等挑战的可持续解决方案,并整合了分子生物学、计算建模和合成生物学的最新进展来优化抗菌肽的应用 | NA | 评估抗菌肽作为化学农药和抗菌剂的替代品,为植物病害管理提供环境友好、持久且高效的策略 | 抗菌肽及其在植物病害防治中的应用 | NA | 植物病害 | 分子生物学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |