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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-08-18 |
Tangled Tail of Mechanically Interlocked Peptides
2026-07-08, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c05395
PMID:42334221
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综述 | 本文综述了机械互锁肽(MIPs)在自然界中的发现及化学合成进展,并提出了统一命名法,以促进分子生物学与超分子化学领域的融合。 | 首次系统比较自然界存在的机械互锁生物分子与化学合成的肽基机械互锁分子,并提出统一的命名法,为跨学科研究奠定基础。 | 未提及具体实验数据或量化分析,可能缺乏对实际应用挑战的深入讨论。 | 综述机械互锁肽的研究现状,建立统一命名法,并促进生物学与化学领域的跨学科合作。 | 自然界存在的机械互锁生物分子(如连环DNA、HK97噬菌体衣壳蛋白)及化学合成的机械互锁肽。 | 化学生物学,合成生物学 | NA | NA | NA | 文本,综述数据 | NA | NA | NA | 机械互锁肽结构(如连环肽、链甲结构) | 基础研究,化学生物学 |
| 682 | 2026-08-18 |
Omics Technologies-Driven Research and Applications of Synthetic Biology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5264-0_16
PMID:42108303
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综述 | 本文系统阐述了整合多组学、空间组学和培养组学如何为合成生物学提供全链条解决方案,涵盖功能预测、动态调控、功能验证和群落构建,并推动其在生物制造、环境修复和医疗健康等领域的应用 | 提出整合多组学、空间组学和培养组学的全链条策略,以解决合成生物学中功能稳定性差、代谢通路适应性不足和自然微生态模拟困难等关键挑战 | 未明确讨论具体实验验证或技术局限性,内容偏向概念性综述 | 探讨组学技术如何驱动合成生物学的研究与应用,实现组学与合成生物学的深度融合 | 合成生物系统,包括合成菌群、底盘菌株和自然微生态系统 | 合成生物学 | NA | 组学技术(多组学、空间组学、培养组学) | NA | 文本、组学数据 | NA | NA | NA | 代谢通路优化 | 生物制造、环境修复、医疗健康 |
| 683 | 2026-08-17 |
A high-throughput heterologous expression platform for plant synthetic biology based on Arabidopsis suspension cells
2026-Jul-10, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf545
PMID:41432110
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研究论文 | 本文建立了一种基于拟南芥悬浮细胞的高通量异源表达平台,用于植物合成生物学中复杂多基因途径的工程化。 | 该平台无需特殊设备或耗材,兼容多种细胞系,可在两周内快速生成100克转基因细胞,并支持单构建体中至少六个基因的堆叠表达。 | 摘要中未提及明确的局限性。 | 开发一种高效、可扩展的异源表达平台,以加速植物合成生物学的设计-构建-测试循环,并应对生物固氮等重大生物技术挑战。 | 拟南芥悬浮细胞,以及固氮酶铁钼辅因子成熟酶NifB的同源物。 | 合成生物学 | NA | 植物细胞包浸润转化,瞬态和稳定转化 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量,涉及多个细胞系和NifB同源物文库。 | NA | 拟南芥(悬浮细胞) | 多基因堆叠表达系统,包含氮酶模块成分NifU, NifS, FdxN和NifB。 | 农业,工业生物技术 |
| 684 | 2026-08-16 |
Harnessing yeast for polyhydroxyalkanoates (PHAs) production: Challenges, engineering strategies, and future prospects
2026-Aug-07, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.153992
PMID:42567388
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综述 | 本文综述了酵母菌生产聚羟基脂肪酸酯(PHAs)的现状、挑战、工程策略及未来前景,重点涵盖野生酵母和工程化酵母的产量提升方法 | 总结了利用酵母作为替代宿主生产PHAs的独特优势,包括抗逆性、GRAS状态、底物利用多样性和亚细胞区室环境,并系统分析了多种合成生物学和代谢工程策略的优缺点 | 指出了酵母基PHAs生产的知识空白,并解释了其相对于其他微生物来源的局限性 | 评估酵母菌作为PHAs生产宿主的可行性,并探讨提高产量的工程策略 | 野生酵母菌株和工程化酵母菌株 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 酵母菌 | PHAs生物合成途径、竞争途径敲除、代谢工程前体供应、可再生原料利用 | 环境, 工业生物技术 |
| 685 | 2026-08-16 |
bHLH Family Transcription Factors: Molecular Switches in Plant Specialized Metabolism
2026-Aug-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15151400
PMID:42587808
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综述 | 本文综述了碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子作为植物特殊代谢调控开关的作用,重点探讨了茉莉酸-JAZ-MYC模块及其在多种植物代谢途径中的调控机制 | 采用直接-级联-杂交框架整合启动子语法、空间能力、储存解剖结构和证据层次,区别于以途径或MYC2为中心的现有综述 | 未提供具体的实验数据或量化分析,为定性综述 | 系统阐述bHLH转录因子在植物特殊代谢中的调控机制,并提出工程应用策略 | bHLH转录因子、植物特殊代谢物(如萜类、生物碱、苯丙烷类、黄酮类等)及其相关调控模块 | 植物分子生物学 | NA | 多组学引导的因子发现 | NA | 文献数据 | NA | NA | 拟南芥、红豆杉、青蒿、长春花、丹参、银杏、水稻、棉花 | 茉莉酸-JAZ-MYC调控模块 | 农业、医药、合成生物学 |
| 686 | 2026-08-16 |
Fructans and Fructooligosaccharides in Plants and Fruits: Metabolism, Functional Roles, and Emerging Biotechnological Opportunities
2026-Jul-30, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31152656
PMID:42588504
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综述 | 本文综述了植物和水果中果聚糖和低聚果糖的代谢、功能作用及新兴生物技术机遇 | 重点关注水果中果聚糖的未充分探索领域,并整合了最新的生物技术策略如代谢工程和合成生物学 | 未提及 | 提供果聚糖和低聚果糖代谢的更新概述,并探讨其在植物生理和人类营养中的双重作用及生物技术应用机会 | 植物和水果中的果聚糖和低聚果糖 | 植物生物学、代谢工程 | 不适用 | 育种、代谢工程、合成生物学 | 不适用 | 文献数据 | 不适用 | 育种、代谢工程、合成生物学 | 植物 | 果聚糖生物合成途径 | 食品、营养保健品、农业 |
| 687 | 2026-08-16 |
Mechanism of Terpene Formation in Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang Revealed by Metabolome and Transcriptome Analysis
2026-Jul-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156836
PMID:42589492
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研究论文 | 通过代谢组和转录组分析揭示了荆广藿香不同组织中萜类化合物的形成机制,特别是根中多环倍半萜的积累和生物合成调控 | 首次系统研究了广藿香地下部分(根)中倍半萜的生物合成,整合代谢组和转录组数据,并揭示了根特异积累的多环倍半萜及其调控网络 | 未提及 | 阐明荆广藿香不同组织中萜类化合物的生物合成机制,特别是根中多环倍半萜的积累和调控网络 | 荆广藿香(Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang)的根、茎、叶、花和腺毛 | 植物代谢组学与转录组学 | NA | GC-MS, 转录组测序, 生物信息学分析, 共表达网络分析 | NA | 代谢组数据, 转录组数据 | 未明确样本数量,涉及根、茎、叶、花和腺毛五种组织 | NA | 荆广藿香(Pogostemon cablin cv. Jing Huoxiang) | NA | 医药, 香料, 生物燃料 |
| 688 | 2026-08-16 |
Cyanobacterial Circadian Clock: Molecular Mechanisms and Physiological Outputs
2026-Jul-27, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15152293
PMID:42588797
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综述 | 本文综述了蓝藻生物钟的分子机制、生理输出及其在进化上的意义 | 挑战了原核生物仅被动响应环境信号的假设,展示了不依赖转录-翻译反馈的蛋白质振荡器,并提供了对生物钟进化逻辑的独特见解 | 未明确提及具体局限性,但指出了包括振荡器与细胞周期耦合、生态型功能分化和群落水平作用等未解问题 | 总结蓝藻生物钟研究进展,阐明其分子基础、输入输出网络及生理协调机制,为合成生物学和生物计时原理提供基础 | 蓝藻的生物钟系统,特别是KaiA、KaiB和KaiC蛋白振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | KaiABC蛋白振荡器 | 合成生物学, 生物技术 |
| 689 | 2026-08-16 |
Genome-Wide Identification and Functional Verification of Core Berberine Bridge-like Enzyme Genes for Benzylisoquinoline Alkaloid Biosynthesis in Corydalis saxicola Bunting
2026-Jul-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27156708
PMID:42589364
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研究论文 | 对岩黄连中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的核心小檗碱桥酶样基因进行了全基因组鉴定与功能验证 | 首次对岩黄连的BBE基因家族进行全面的功能基因组学分析,并通过体外酶学实验证实了候选基因催化特定底物生成脱氢卡维丁和药根碱的氧化酶活性 | 未明确说明研究的局限性 | 鉴定和功能验证岩黄连中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的核心BBE样基因,为种质保护和合成生物学改良奠定基础 | 岩黄连中的小檗碱桥酶样基因家族 | 基因组学 | NA | 全基因组分析、系统发育分析、表达分析、蛋白质结构预测、分子对接、体外酶学实验 | NA | 基因组序列、基因表达数据、蛋白质结构数据 | 从岩黄连基因组中鉴定出22个BBE家族成员 | NA | NA | NA | 医药 |
| 690 | 2026-08-16 |
Natural flavonoids in multiple sclerosis: molecular insights and emerging therapeutic strategies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1888423
PMID:42597552
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综述 | 本文综述了天然黄酮类化合物在多发性硬化中的分子机制和新兴治疗策略,涵盖实验模型和人类研究证据 | 系统整合了黄酮类化合物在调节NF-κB、Nrf2、炎症小体信号及小胶质细胞/巨噬细胞极化中的作用,并探讨了结构-活性关系、代谢和糖基化对暴露的影响,以及合成生物学在规模化生产和衍生物优化中的应用 | 临床证据尚早期且结果不一,存在低且可变生物利用度、血脑屏障穿透有限、标准化不足及与获批疗法潜在相互作用等转化障碍 | 总结黄酮类化合物对多发性硬化的治疗潜力及其分子机制,并评估新兴递送和优化策略 | 天然黄酮类化合物及其在多发性硬化中的分子靶点和细胞过程 | 神经免疫学 | 多发性硬化 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 691 | 2026-08-15 |
Growth, signals, and survival: the evolutionary divergence of terpenoid metabolism in terrestrial plants
2026-Aug-14, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d6np00035e
PMID:42598787
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综述 | 本文综述了陆地植物萜类代谢的进化分化,涵盖其结构多样性、生物合成途径、功能角色及基因组学、代谢组学和合成生物学方面的进展 | 强调了基因家族谱系特异性扩张与功能分化如何驱动萜类代谢网络的组合模块化,从而产生复杂的生物活性结构,并探讨了其在植物生态和生物技术应用中的多重作用 | 未提供具体实验数据或定量分析,主要基于已有文献总结 | 阐述陆地植物萜类代谢的进化机制及其在植物生长和环境互作中的功能,并展望生物技术创新潜力 | 陆地植物的萜类代谢系统,包括相关酶类(如萜烯合酶和细胞色素P450单加氧酶)及基因家族 | 植物生物学, 进化生物学, 合成生物学 | NA | 基因组学, 代谢组学, 合成生物学 | NA | 文本 | NA | 合成生物学工具(未具体指定) | NA | 萜类代谢途径的组合模块化设计 | 医药, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术, 农业 |
| 692 | 2026-08-14 |
An orthogonal mammalian gene circuit for selective sensing of taurine-conjugated bile acids
2026-Sep-17, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.154326
PMID:42492193
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研究论文 | 本研究利用来自霍乱弧菌的胆汁酸诱导型二鸟苷酸环化酶VC1372,在哺乳动物细胞中构建了一种正交的牛磺酸结合胆汁酸响应基因回路,实现对Tau-BAs的选择性检测。 | 首次将细菌来源的VC1372酶改造为哺乳动物细胞中的正交代谢物传感器,实现对牛磺酸结合胆汁酸的选择性检测,避免了内源受体干扰。 | 该基因回路主要在体外细胞水平验证,尚未在体内模型中进行测试,且对低浓度Tau-BAs的敏感性和特异性有待进一步优化。 | 开发一种能够在哺乳动物细胞中正交且选择性响应牛磺酸结合胆汁酸的合成基因回路,为相关疾病的诊断和治疗提供模块化平台。 | 哺乳动物细胞中的合成基因回路,以及主要循环Tau-BAs(TCA、TDCA、TCDCA)。 | 合成生物学 | 慢性肝病、代谢性疾病、神经退行性疾病 | 定点突变、基因回路构建、细胞培养、荧光报告基因检测 | NA | 实验数据(基因表达响应数据) | NA | 定点突变 | 哺乳动物细胞 | 正交牛磺酸结合胆汁酸响应基因回路,包括VC1372酶促模块和BldD依赖性转录模块 | 医学 |
| 693 | 2026-08-14 |
Metabolic Pathways and Molecular Regulatory Mechanisms of Nervonic Acid Biosynthesis in Malania oleifera
2026-Jun-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27125507
PMID:42353223
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综述 | 本文系统总结了马拉尼奥油藤中神经酸生物合成的代谢途径与分子调控机制,包括脂肪酸合成、极长链脂肪酸延伸和Δ15去饱和过程,并讨论了多组学数据、转录调控和表观遗传调控。 | 整合多组学数据,分析了KCS基因家族的系统发育和共线性分布,并讨论了转录调控网络及表观遗传调控在神经酸积累中的作用,提出了代谢工程和合成生物学应用的展望。 | 未提供具体的实验验证数据,主要基于已有研究进行综述和推测。 | 系统总结神经酸在马拉尼奥油藤中的生物合成途径和调控机制,为可持续神经酸生产的代谢工程和合成生物学提供理论基础。 | 马拉尼奥油藤(Malania oleifera)中的神经酸生物合成相关酶和调控因子。 | 植物分子生物学、代谢工程 | NA | 多组学数据分析 | NA | 基因组、转录组等组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、农业 |
| 694 | 2026-08-14 |
Next-Generation Bionic Sensors for Small Molecule Detection: Integrating Synthetic Biology, Nanomaterials, and Artificial Intelligence
2026-Jun-15, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi17060725
PMID:42354756
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综述 | 本文综述了结合合成生物学、纳米材料和人工智能的下一代仿生传感器在小分子检测中的最新进展,重点讨论了如何克服传统方法的局限性并实现复杂环境中的实时检测。 | 首次系统性地整合合成生物学、纳米材料和人工智能三个领域,提出了一种问题导向的视角来设计下一代仿生传感器,涵盖了从生物识别元件到信号处理的全流程创新。 | 讨论中提及了AI驱动系统在可扩展性、成本、数据可靠性和伦理方面面临的挑战,但未提供具体的解决方案或实验验证。 | 旨在提供一个全面的概述,展示下一代仿生传感器如何通过跨学科整合解决小分子检测中的关键难题,推动实际应用。 | 小分子检测中的生物识别元件(如酶、抗体、适配体、分子印迹聚合物)以及纳米材料(如石墨烯、碳纳米管、量子点、MXenes)和AI技术。 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 食品 |
| 695 | 2026-08-14 |
Global Probiotic Markets Meet Synthetic Biology: Translational Challenges and Escherichia coli Nissle 1917 as a Model Chassis
2026-Jun-11, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061306
PMID:42354930
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综述 | 本文综述了全球益生菌市场扩张与合成生物学在活体生物治疗产品开发中的应用,重点讨论了以大肠杆菌Nissle 1917为模型底盘的工程化策略、治疗机遇及转化障碍 | 将益生菌市场扩张与活体生物治疗产品开发联系起来,并以大肠杆菌Nissle 1917作为模型底盘,探讨其外膜囊泡在治疗递送中的潜力 | 未提及具体实验数据或临床验证结果,可能缺乏实证支持 | 探讨合成生物学如何将益生菌转化为可编程微生物平台,以弥合市场扩张与临床转化之间的差距 | 全球益生菌市场、活体生物治疗产品、大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 肠道相关疾病 | NA | NA | 综述文献 | NA | NA | 大肠杆菌Nissle 1917 | 可编程微生物平台,用于感知疾病相关信号并产生治疗输出 | 医学 |
| 696 | 2026-08-14 |
Design and Implementation of a Blue-Light-Controlled Gene-Switch System
2026-Jun-10, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31122032
PMID:42357431
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研究论文 | 开发并优化了一种蓝光诱导的T7RNAP双输入调控基因开关系统,实现了精确的时空基因控制,并集成了苯甲酸响应模块以实现化学关闭功能 | 结合蓝光精确诱导与苯甲酸化学关闭的双输入调控,实现了非侵入性、按需激活及生态应用中的可控关闭 | 未提及 | 构建可预测、可编程的基因开关系统,用于生物制造、治疗和微生物工程中的精确基因控制 | 蓝光诱导的T7RNAP系统及其变体,包括RBS序列、串联T7启动子和split-T7RNAP变体 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控 | NA | 荧光输出和实时生长曲线数据 | 未明确样本数量,涉及多种RBS变体、启动子构建和模块测试 | NA | 未明确 | 蓝光诱导的双输入基因开关,包含苯甲酸响应模块 | 医学、环境、工业生物技术 |
| 697 | 2026-08-14 |
RpaA Overexpression Enhances Bioluminescence Intensity and Elevates Rhythmic Extracellular Vesicle Yield in Synechococcus elongatus PCC 7942
2026-May-25, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16060885
PMID:42355412
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研究论文 | 本研究探讨了蓝细菌昼夜节律输出调控因子RpaA对PCC 7942细胞外囊泡产量的调控作用,发现RpaA过表达可增强生物发光强度并提高细胞外囊泡的产量 | 首次揭示昼夜节律输出信号与细胞外囊泡生物发生之间的关联,并提出RpaA过表达作为提高细胞外囊泡产量的有效策略 | 摘要未提及研究的局限性 | 研究RpaA在调节蓝细菌PCC 7942细胞外囊泡生产中的作用,并探索提高细胞外囊泡产量的策略 | 蓝细菌PCC 7942及其RpaA基因 | 合成生物学 | NA | 转录分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除和过表达 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | 昼夜节律输出调控回路 | 工业生物技术、医学(纳米载体技术) |
| 698 | 2026-08-14 |
From Discovery to Manufacturing: A Quantitative Review of Phosphonates and Strategies for High-Titer Production
2026-May-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14061170
PMID:42354795
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综述 | 本文对膦酸酯天然产物进行了定量综述,涵盖其发现趋势、生物活性、产生菌分类及高产策略,并提出加速发现和改善生产可及性的建议 | 首次对1959年至今的71篇膦酸酯天然产物报告进行系统性定量分析,整合发现趋势与生物功能及规模化生产之间的联系,并总结结构-活性关系和工程策略 | 综述依赖已发表的报告,可能遗漏未发表或非细菌来源的数据,且定量分析受限于原始报告的质量和完整性 | 系统梳理膦酸酯天然产物的发现、生物活性和生产策略,为加速新膦酸酯发现和提高产量提供方向 | 膦酸酯天然产物及其产生菌(主要为细菌) | 天然产物研究 | NA | 代谢工程、合成生物学、生物催化级联 | NA | 文献数据 | 71篇报告(1959年至今) | NA | 细菌 | 代谢途径工程 | 医学、农业 |
| 699 | 2026-08-14 |
Therapeutic Applications of Natural Products in Biomedicine and Pharmacotherapy
2026-May-22, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16060873
PMID:42355401
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综述 | 本文对天然产物在药物化学、生物医学和药物治疗中的治疗应用进行了批判性和整合性分析,重点探讨其结构、功能和转化之间的联系 | 提出一个连接结构、功能和转化的系统,结合化学、药理学和转化方法,以应对天然产物开发中的挑战 | 未提供具体实验数据,仅基于文献综述,可能缺乏实证验证 | 分析天然产物在药物发现和精准医学中的潜力,并批判性评估当前策略和挑战 | 代表性天然产物如紫杉醇、青蒿素和姜黄素 | 药物化学 | NA | 基因组挖掘、合成生物学、网络药理学 | NA | 文献数据 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | 医学 |
| 700 | 2026-08-14 |
Recent strategies in synthetic food production for sustainable food security: applications and challenges
2026, Frontiers in nutrition
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fnut.2026.1829214
PMID:42358301
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综述 | 本文综述了合成食品生产的最新策略,包括细胞、组织和干细胞培养技术、转基因生物、微生物发酵、植物蛋白工程及人工智能等,并探讨其在可持续食品安全中的应用与挑战 | 系统性地整合了多种前沿技术(如合成生物学、人工智能)在合成食品生产中的应用,并全面分析了其经济、监管和公众接受度方面的挑战 | 合成食品生产面临高生产成本、缺乏技术优化、监管复杂性及安全性等问题,且商业化需要先进技术降低成本和立法支持 | 探讨合成食品生产的创新技术及其在满足全球食品安全需求方面的潜力和挑战 | 合成食品,包括培养肉、人工甜味剂、微生物蛋白、新型脂肪、强化及合成乳制品和功能食品成分 | 生物技术 | NA | 细胞培养、组织培养、干细胞培养、转基因技术、微生物发酵、合成生物学、人工智能 | NA | 文本 | NA | 转基因、合成生物学 | 微生物、植物细胞 | 代谢途径工程 | 食品工业、医药、农业、营养保健品 |