本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-08-10 |
Antimicrobial Peptides (AMPs) as Potential Antibiotics: Classification, Development and Future Prospects in Combating Multi-drug Resistant Pathogens
2026-Aug, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-025-01510-y
PMID:42568698
|
综述 | 本文综述了抗菌肽作为潜在抗生素的分类、开发进展及其对抗多重耐药病原体的前景 | 强调抗菌肽独特的抗菌机制,使细菌难以产生耐药性,并探讨了合成与工程化肽在药物开发中的创新应用 | 抗菌肽的开发面临稳定性、毒性和生产成本等挑战,以及监管和经济障碍 | 促进抗菌肽作为下一代抗生素的临床转化,以应对抗菌素耐药性威胁 | 抗菌肽 | 药物开发 | 多重耐药菌感染 | 肽工程、合成生物学 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 多种生物 | NA | 医学 |
| 722 | 2026-08-09 |
Engineered diazotrophs with host-inducible nitrogen supply systems: Transforming rice farming through innovative nitrogen biofertilizers
2026-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70320
PMID:42367143
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学改造固氮菌,使其具备宿主诱导的氮供应系统,以作为水稻创新氮生物肥料的潜力,并探讨了减少工业氮肥依赖、推动可持续农业的路径 | 强调结合野生稻中丰富的固氮菌群与现代合成生物学手段,开发可输出氮的工程化固氮菌及合成微生物群落,并针对水稻品种的响应性进行定制化研究 | 未提及具体实验数据或技术限制,主要基于文献综述和展望 | 旨在通过工程化固氮菌提供可持续的氮肥替代方案,补充水稻氮营养,促进可持续农业 | 固氮菌、水稻品种、合成微生物群落 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、宏基因组学 | NA | 文献数据、微生物组数据 | 未明确,涉及野生稻和栽培稻的微生物组研究 | CRISPR-Cas9、TALEN、ZFN | 固氮菌(如共生固氮菌) | 氮输出生物传感器或代谢通路 | 农业、环境 |
| 723 | 2026-08-09 |
Extrachromosomally co-encoded toxin-immunity pairs in yeast and their application potential
2026-May-26, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13876-0
PMID:42189293
|
综述 | 本文综述了酵母中由染色体外元件共编码的毒素-免疫因子对,并探讨了其在合成生物学和生物技术中的应用潜力 | 系统整合了毒素-免疫因子对的分子知识及其克隆、研究和工程化方法,并类比细菌毒素-抗毒素系统,提出其在合成生物学中的应用前景 | 对免疫因子的保护机制研究相对较少,应用潜力仍需进一步探索 | 推动对酵母毒素-免疫因子对的基础理解,并促进其在合成生物学和生物技术中的应用 | 酵母中的毒素-免疫因子对,包括dsRNA真菌病毒卫星和dsDNA病毒样元件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本信息 | NA | NA | 酵母 | 毒素-免疫因子对系统 | 食品,医药,生物技术 |
| 724 | 2026-08-09 |
Structures of pentatricopeptide repeat proteins
2026-Apr-01, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications
DOI:10.1107/S2053230X26002311
PMID:41919993
|
综述 | 本文全面调查了所有已解析的五肽重复序列(PPR)蛋白晶体结构,分析其晶体学性质、结构特征及其对理解PPR功能的贡献。 | 系统性地编目所有PPR晶体结构,包括核糖体PPR结构,并总结RNA识别编码机制及构象变化等关键见解。 | 未提及具体局限性。 | 为晶体学家和植物生物学家提供PPR蛋白结构综合资源,以理解其结构和功能。 | 五肽重复序列(PPR)蛋白及核糖体PPR蛋白的结构。 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学、冷冻电镜 | NA | 结构数据 | 30个PPR和83个核糖体PPR晶体或冷冻电镜结构 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 725 | 2026-08-08 |
S-layer (Glyco)protein lattices: Biophysical principles of antifouling at prokaryotic interfaces
2026-Aug-07, Quarterly reviews of biophysics
IF:7.2Q1
DOI:10.1017/S0033583526100213
PMID:42563455
|
综述 | 该综述整合历史超微结构观察与现代原子分辨率结构数据和生物物理原理,论证抗污性是所有细菌和古菌S层的基本和普遍功能,并探讨其在生物技术和材料科学中的仿生应用。 | 首次将S层抗污性置于低雷诺数物理框架下,强调晶格动力学、晶体纳米形貌、静电马赛克、碎片化疏水性、结构化水合壳和聚糖介导的空间排斥的协同作用。 | 主要基于理论综合,缺乏直接实验验证抗污性机制在不同环境下的定量比较。 | 阐明S层(糖)蛋白晶格在低雷诺数环境中的抗污生物物理机制,并突出其作为可调界面的潜力。 | 细菌和古菌的表面层(S层)蛋白和糖蛋白晶格。 | 生物物理学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 细菌和古菌 | NA | 生物技术、合成生物学、材料科学 |
| 726 | 2026-08-08 |
Integrative framework for selecting gene delivery technologies in microalgae for synthetic biology
2026-Aug-07, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12553-9
PMID:42565914
|
研究论文 | 本研究对微藻合成生物学中使用的基因递送技术进行了比较分析,并提出了一个实用的方法选择框架 | 提出了一个基于工程目标和物种特异性细胞特征来组织基因递送方法的选择框架,该框架强调了递送平台需兼容多样化货物、受体物种和工程应用 | 新兴技术如细胞穿透肽和金属有机框架的实用性需要更广泛的物种级验证 | 为微藻合成生物学中的基因递送技术选择提供指导框架 | 微藻基因递送技术,包括常规技术和新兴技术 | 合成生物学 | NA | 基因递送技术(包括 agitation、微粒轰击、电穿孔、农杆菌介导转化、细胞穿透肽、金属有机框架) | NA | 文献数据 | NA | NA | 微藻 | NA | 工业生物技术 |
| 727 | 2026-08-08 |
Functional diversity, evolution, and translational potential of isoprenoids in eukaryotic membranes
2026-Aug, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.04.014
PMID:42161681
|
综述 | 本文综述了类异戊二烯在真核生物膜中的功能多样性、进化及其翻译潜力,重点关注它们作为膜成分如何调节膜性质,并讨论了合成生物学在生产相关类异戊二烯方面的进展与局限 | 系统性地整合了类异戊二烯的结构多样性与膜功能关系,并深入探讨了其在合成生物学生产中的调控和储存机制 | 未提供具体实验数据,可能缺乏对某些细节机制的深入验证 | 阐明类异戊二烯在真核膜中的作用及其合成生物学生产的潜力与挑战 | 类异戊二烯及其衍生化合物在植物、真菌和动物细胞膜中的结构与功能 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医药 |
| 728 | 2026-08-08 |
TolC Is Required for a Mixed-Linkage β-Glucan (MLG) Biosynthesis: Engineering Bacteria for MLG Overproduction
2026-Aug, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70424
PMID:42552791
|
研究论文 | 该研究揭示了TolC蛋白在苜蓿中华根瘤菌混合连接β-葡聚糖生物合成中的关键作用,并通过共过表达策略实现了MLG的高效生产 | 首次发现外膜蛋白TolC作为MLG生物合成机器的一部分,与BgsA和BgsB形成三聚复合体,并通过共过表达tolC、bgsBA和组成型活性二鸟苷酸环化酶(pleD*)实现8倍的MLG产量提升 | TolC与BgsA和BgsB复合体的具体分子机制尚未完全阐明,且生产优化仅在特定条件下验证 | 探究MLG生物合成所需的关键组分并开发增强MLG生产的方法 | 苜蓿中华根瘤菌及中生根瘤菌等根瘤菌宿主 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、互补表达、共过表达、生物反应器发酵 | NA | 基因序列、生物量、MLG产量数据 | 涉及多种根瘤菌菌株,具体样本数量未明确 | 基因敲除、遗传互补、共过表达(非指定工程工具) | 苜蓿中华根瘤菌、中生根瘤菌 | 通过共过表达tolC和bgsBA以及pleD*来增强MLG生物合成的基因回路 | 工业生物技术、材料科学 |
| 729 | 2026-08-08 |
Modular Scalable Synthetic Gene Circuits for Complex Functions Within Minimal Computational Layers in Human Cells
2026-Jun-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74408-y
PMID:42303993
|
研究论文 | 提出一种模块化可扩展的合成基因电路设计框架,通过较少的计算层在人类细胞中实现复杂功能。 | 采用正交反剪接AND门、天然-合成杂交启动子和合成microRNA的组合,在减少计算层数的同时实现复杂逻辑功能,提高了电路的可扩展性并降低了资源消耗。 | 未明确说明局限性。 | 开发能在人类细胞中执行复杂遗传程序且计算层数最少化的可扩展基因电路。 | 人类细胞中的合成基因电路。 | 合成生物学 | 不适用 | 基因电路工程 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 人类细胞 | 三输入组合逻辑门、半加器、全加器、动态3-1多路复用器 | 生物医学、生物技术、基础生物学 |
| 730 | 2026-08-08 |
Bioengineering Living Biohybrid Therapeutics for Synergistic H2S Gaseous-Photothermal Cancer Eradication
2026-01, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501621
PMID:40820708
|
研究论文 | 开发了一种整合工程菌与自矿化硫化铜纳米颗粒的活体生物混合治疗平台,用于协同硫化氢气体-光热癌症治疗 | 将工程微生物原位产生硫化氢与自矿化硫化铜纳米颗粒结合,形成活体生物杂化物,首次实现气体与光热疗法的协同癌症治疗 | 未提及 | 开发高效、安全的癌症治疗新方法,通过生物杂交平台实现协同气体-光热治疗 | 工程化兼性厌氧菌Vibrio natriegens,乳腺癌荷瘤小鼠模型 | 合成生物学,纳米技术 | 乳腺癌 | NA | NA | 体内成像数据、肿瘤抑制率数据 | 乳腺癌荷瘤小鼠模型 | NA | Vibrio natriegens | 代谢通路:细菌产生硫化氢并合成硫化铜纳米颗粒 | 医学 |
| 731 | 2026-08-08 |
The promise and peril of mirror bacteria
2026, Acta biochimica Polonica
IF:1.4Q4
DOI:10.3389/abp.2026.16673
PMID:42434594
|
观点文章 | 本文探讨镜像细菌从理论概念走向实际可行性的前景与风险,分析其在应用、伦理、监管和文化层面的影响 | 超越狭隘的生物安全讨论,从更广泛的伦理、监管和文化角度审视镜像细菌,将其视为科学与社会应对创造新型生命责任的罕见测试案例 | 未提供具体实验数据或详细技术方案,属于观点性论述 | 评估镜像细菌的机遇与风险,探讨其伦理、监管和文化影响,并为合成生物学治理框架提供建议 | 镜像细菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、生物工程、信息存储 |
| 732 | 2026-08-08 |
The Enzyme-Bag Platform for Cytochrome P450 Biotransformation and High-Throughput Drug Metabolism Screening
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5190-2_9
PMID:42562981
|
研究论文 | 介绍了一种基于裂殖酵母的酶袋平台,用于细胞色素P450生物转化和高通量药物代谢筛选 | 利用半完整细胞方法(酶袋系统)结合重组人CYP酶,避免了传统微粒体制备和纯化蛋白的繁琐过程,支持所有57种人CYP酶的功能分析,并兼容多种检测方式 | 文中未明确提及研究的局限性 | 开发一种简化且多用途的药物代谢研究平台,以支持药理学、毒理学和精准医学中的酶活性、底物特异性和抑制剂分析 | 人细胞色素P450酶(包括孤儿CYP)、II相酶(UGTs、SULTs)、昆虫P450s,以及裂殖酵母和酿酒酵母等宿主 | 药物代谢研究,合成生物学 | 不适用 | 重组表达、选择性透化处理、生物转化实验、发光检测、色谱和质谱分析 | 不适用 | 实验数据(酶活性、代谢产物谱) | 所有57种人CYP酶及扩展至II相酶和昆虫P450s,未提及具体样本数量 | 不适用 | 裂殖酵母,酿酒酵母 | 生物转化平台,包括CYPome基因文库和酶袋cocktail高通量筛选系统 | 药物代谢,毒理学,合成生物学,药物开发 |
| 733 | 2026-08-08 |
A Physics-Inspired Approach to Improve Oligonucleotide Design and Gene Synthesis
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0189
PMID:42564310
|
研究论文 | 提出一种基于统计物理模型的算法,用于优化聚合酶循环组装(PCA)中的寡核苷酸设计,以改善基因合成的产量和可靠性。 | 采用统计物理模型和转移矩阵形式精确求解低温度解,结合模拟退火修复和密码子重设计,相比启发式方法能更有效地处理短、GC偏向或易形成二聚体的序列。 | 未明确讨论算法在处理复杂异源二聚体相互作用时的计算成本,以及实验验证仅覆盖14个代表性设计,可能不足以全面评估其普遍适用性。 | 改进PCA基因合成中寡核苷酸的设计,确保均匀杂交温度和最小化非特异性二聚体形成,特别是针对困难序列。 | 超过10,000条被认为不适合合成的序列,以及14个代表性设计用于实验验证。 | 合成生物学 | NA | 聚合酶循环组装(PCA)、琼脂糖凝胶电泳 | 统计物理模型、转移矩阵、模拟退火 | 序列数据 | 10,000多条序列(计算评估),14个代表性设计(实验验证) | NA | NA | 寡核苷酸设计 | 合成生物学、自动化基因组装 |
| 734 | 2026-08-08 |
Saccharomyces cerevisiae in cancer research: modeling tumor biology and enabling drug discovery
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.08.885
PMID:42564453
|
综述 | 本文综述了酿酒酵母在癌症研究中的应用,包括模拟肿瘤生物学和促进药物发现。 | 将酿酒酵母作为一种简化和可扩展的真核模型,用于研究癌症相关的保守细胞过程,并作为转化和生物技术应用的平台。 | 未明确提及,但可能包括酵母与哺乳动物系统在癌症复杂性方面的差异。 | 探讨酵母平台在癌症研究中的应用,包括肿瘤生物学建模和药物发现。 | 酿酒酵母及其在癌症研究中的应用。 | 生物技术 | 癌症 | 遗传操作、异源表达、合成生物学、功能基因组学、高通量筛选。 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学技术。 | 酿酒酵母 | 用于研究致癌信号、代谢重编程、应激适应、DNA修复和自噬的工程酵母平台。 | 医学、工业生物技术 |
| 735 | 2026-08-07 |
Fungal biodiversity and oxidative enzymes: nature-based solutions for lignin degradation and circular economy applications
2026-Aug-06, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2026.2690415
PMID:42557892
|
综述 | 本文系统综述了真菌氧化酶在木质素降解中的应用,涵盖酶结构、催化机制、协同作用及工业转化前景。 | 整合了真菌木质素降解系统的多样性、酶工程和合成生物学进展,并建立与循环生物经济的直接联系。 | 未提及具体实验数据或量化比较,依赖已有文献,缺乏实际工业案例的深度分析。 | 探讨真菌氧化酶用于木质素降解和生物质转化的可持续工业生物技术解决方案。 | 真菌氧化酶,包括木质素过氧化物酶、锰过氧化物酶、多功能过氧化物酶、漆酶及辅助氧化酶。 | 工业生物技术 | NA | 蛋白质工程、定向进化、异源表达、固定化酶系统、合成生物学、人工智能辅助酶优化 | NA | 文献综述 | NA | CRISPR-Cas9, 定向进化, 异源表达 | 真菌 | 木质素降解途径 | 工业生物技术, 环境, 能源, 材料 |
| 736 | 2026-08-07 |
Programmable short peptide condensates with intrinsic enzyme-like activity
2026-Aug-05, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00685j
PMID:42478940
|
研究论文 | 本研究通过短肽共组装构建具有内在酶样催化活性的可编程肽基凝聚物,实现选择性富集底物并促进水解反应 | 首次通过短肽共组装策略将催化功能直接编码到凝聚物形成单元中,赋予凝聚物内在酶样活性,无需外部酶或模拟物封装 | 尚未明确催化活性对局部环境(如pH、温度)的敏感性和长期稳定性,且应用范围有待进一步验证 | 开发一种生物启发的策略来构建具有内在催化功能的可编程肽基凝聚物,模拟天然催化性生物分子凝聚物 | 短肽共组装形成的液态凝聚物(组氨酸标记短肽与三苯丙氨酸基肽) | 合成生物学 | NA | 液相-液相相分离 | NA | 实验数据(包括相分离观察、催化活性测定) | NA | NA | NA | 用于催化水解反应的肽基凝聚物作为生物传感器或仿生反应器 | 合成生物学 |
| 737 | 2026-08-07 |
Harnessing human tumor organoids for cancer modeling and precision therapy
2026-Aug-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwag007
PMID:41698840
|
综述 | 本文综述了人类肿瘤类器官在癌症建模和精准治疗中的应用,涵盖类器官的生成、技术进展、临床应用及未来发展方向。 | 强调了类器官作为动态“活体生物传感器”的潜力,并整合了合成生物学、功能基因组学和机器学习等前沿技术。 | 完全模拟肿瘤微环境仍然困难,尤其是在复制血管复杂性和全身免疫反应方面。 | 探讨人类肿瘤类器官作为功能性精准医学工具,架起基础研究与临床转化之间的桥梁。 | 人类肿瘤类器官,包括患者来源的类器官、基因工程平台以及共培养系统。 | 生物医学 | 癌症 | 类器官培养、共培养系统、类器官芯片、三维生物打印、人工智能分析、合成生物学、功能基因组学 | 类器官模型 | 基因、图像、药物反应数据 | 不适用(综述文章) | CRISPR-Cas9(基因工程) | 人类 | 不适用(主要通过基因工程平台构建类器官,未详细描述特定电路) | 医学 |
| 738 | 2026-08-07 |
Peptide-Ligand Cooperative Interplay Drives Gold Nanoparticle Encapsulation by Protein Cages
2026-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.73690
PMID:42093323
|
研究论文 | 本研究结合实验与分子动力学模拟,揭示了金纳米颗粒被 encapsulin 蛋白笼封装过程中肽-配体协同作用对封装效率和盐浓度依赖性的分子机制 | 首次从分子层面阐明了配体与肽段在金纳米颗粒封装中的协同效应,通过自由能景观分析解释了不同盐浓度下的封装行为差异 | 研究主要聚焦于初始结合阶段,未涵盖封装后续步骤及体内应用验证 | 理解并指导生物启发的纳米笼用于选择性递送和模板合成 | encapsulin 蛋白笼与金纳米颗粒的相互作用 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据及模拟数据 | 未明确样本数量,涉及不同盐浓度和配体功能化条件 | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 739 | 2026-08-07 |
From design-build-test-learn cycles to AI-driven digital twins for bioprocess scale-up in the Genesis Mission era
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103516
PMID:42190350
|
评论 | 本文讨论了Genesis Mission倡议下,将合成生物学与人工智能结合以加速生物生产,并指出了AI驱动生物技术发展中的挑战与机遇 | 提出将AI驱动的数字孪生技术与设计-构建-测试-学习循环相结合,以解决生物过程放大中的不确定性 | 未提供具体的实验数据或案例研究,仅从概念层面进行探讨 | 探讨如何利用AI和数字孪生技术优化生物制造过程,促进工业规模的应用 | 微生物菌株、生物反应器操作和生物制造过程 | 机器学习 | NA | NA | 迁移学习、强化学习、贝叶斯优化 | 实时数据、文献数据 | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 740 | 2026-08-07 |
Emergent bioengineering
2026-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103520
PMID:42235106
|
研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学改造现有生态系统,以增强其恢复力并防止突变,提出从经典工程向涌现工程设计的范式转变 | 提出了一种从经典工程到涌现工程的设计哲学转变,强调适应、反馈和多尺度复杂性作为生态系统设计的基础 | 未提供具体的实验结果或案例研究,主要基于理论探讨 | 探讨合成生物学在生态系统工程中的应用,以及如何实现可控且可持续的生态干预 | 现有生态系统及其中的生物群落 | 合成生物学 | 不适用 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 生态系统工程中的合成生物电路设计 | 环境 |