合成生物学相关文章
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当前共找到 1386 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-06-04 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了合成生物学在植物和微生物工程中的应用，以推动农业、环境及未来技术的发展 | 利用新基因组构建工具、计算机辅助设计和人工智能实现“智能植物”与微生物群落协同工程，突破传统单基因改造限制 | 未具体说明现有技术在实际应用中的生物安全风险或规模化部署的挑战 | 推动合成生物学驱动下一次农业革命，并拓展植物工程在制造、基础设施、传感和修复领域的应用 | 植物（核、叶绿体、线粒体基因组）及其相关微生物（真菌、细菌、古菌） | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物, 真菌, 细菌, 古菌 | 环境响应电路、形态改变电路、威胁响应电路 | 农业, 环境, 制造, 基础设施, 传感, 修复 |
| 722 | 2026-06-04 |
Yeast Biosensors for the Safety of Fermented Beverages
2026-Jan-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16010064
PMID:41590316
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综述 | 综述酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的应用与发展 | 系统总结了酵母生物传感器在发酵饮料安全检测中的优势，包括实时检测、低成本、可集成于发酵系统，以及利用酵母的GRAS特性确保安全 | 酵母生物传感器仍主要停留在实验室规模，与工业广泛应用之间存在明显差距，需进一步研究其鲁棒性、可扩展性和监管整合 | 探讨酵母生物传感器在发酵饮料生产中保障安全性和品质的潜力，推动更安全、更高质量产品的制造 | 酵母生物传感器及其在啤酒、葡萄酒、康普茶等发酵饮料中的应用 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 报告系统（如荧光、颜色变化或电信号） | 食品 |
| 723 | 2026-06-04 |
The synergy of foundation technologies and computer sciences advances microbial expression systems in biomedical genetic engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.007
PMID:42191273
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综述 | 基础技术与计算机科学的协同作用推动了生物医学基因工程中微生物表达系统的发展 | 系统阐述了合成生物学、CRISPR-Cas9等基因组编辑工具、下一代测序与组学技术、人工智能以及系统生物学与代谢建模等多学科技术的协同潜力，并提出克服当前障碍的策略 | 仍存在脱靶效应、代谢负担和放大生产限制等挑战 | 探讨基础生物技术与计算科学如何协同推进生物医学基因工程中微生物表达系统的进步 | 微生物表达系统 | 机器学习 | NA | 下一代测序, 组学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 医学 |
| 724 | 2026-06-04 |
Protein Design Enters the Artificial Intelligence Era: Foundations, Tools, and Emerging Paradigms
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0105
PMID:42231905
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综述 | 本文综述了人工智能在蛋白质设计领域的应用，涵盖深度学习、蛋白质语言模型和知识图谱等技术，以及它们在序列-结构-功能关系解析中的进展 | 系统总结了AI在蛋白质设计中的新范式，包括AlphaFold2的结构预测精度和Transformer模型从头序列设计，突出了计算与实验整合的趋势 | 模型可解释性不足、训练数据存在偏差以及实验验证率较低仍是主要挑战 | 分析人工智能驱动蛋白质设计的计算方法、基准指标及机器学习与实验管线的整合 | 蛋白质序列、结构和功能关系，以及相关计算工具和模型 | 机器学习 | NA | 深度学习, 蛋白质语言模型, 知识图谱, AlphaFold2, Transformer | 深度学习模型, 蛋白质语言模型, Transformer | 蛋白质序列数据, 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 工业生物技术, 合成生物学 |
| 725 | 2026-06-03 |
Essential Proteins Prediction Using Features Synergy Model and GO Pure Centrality
2026-Jun-01, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3698655
PMID:42224331
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研究论文 | 提出一种基于特征协同模型和GO纯中心性的必需蛋白预测方法FSM，以提升识别率 | 创新性地融合特征协同模型与GO纯中心性，构建纯PPI网络并设计新中心性度量GPC，有效降低PPI数据噪声并增强特征关系整合 | 方法依赖GO注释和基因表达数据质量，可能在不同物种或数据稀疏场景下性能受限 | 提高必需蛋白预测的准确率，推动合成生物学和疾病治疗发展 | 酵母数据集中的必需蛋白 | 机器学习 | NA | 基因表达分析、GO注释分析 | 特征协同模型 | 蛋白质相互作用数据、基因表达数据、GO注释数据、亚细胞定位和直系同源蛋白数据 | 三个不同的酵母数据集 | NA | 酿酒酵母 | NA | 合成生物学、医学 |
| 726 | 2026-06-03 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 通过多层次的宿主工程改造酿酒酵母，增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译活性 | 首次结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主改造，实现了CrPV IRES介导翻译活性数量级的提升 | 仅建立了概念验证框架，未具体量化各改造步骤对翻译效率的独立贡献，且可能存在工程菌株生长适应性代价 | 通过宿主工程策略提高CrPV IRES在酿酒酵母中的翻译效率，以扩展其在合成生物学中的RNA调控应用 | 酿酒酵母宿主菌株及CrPV IRES报告系统 | 合成生物学 | NA | 报告基因筛选、基因工程改造 | NA | 报告基因表达数据 | 多个改造菌株（具体数量未明示） | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | CrPV IRES介导的非经典翻译调控元件 | 合成生物学 |
| 727 | 2026-06-03 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
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综述 | 综述利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落的最新进展 | 系统总结了利用噬菌体递送各种CRISPR-Cas效应器进行精准基因组编辑和原位扰动的方法 | 部署的系统发育广度仍存在挑战 | 讨论利用噬菌体递送CRISPR有效载荷以工程改造微生物群落 | 微生物群落和噬菌体 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体递送 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 噬菌体工程 | 细菌, 宿主环境 | CRISPR有效载荷, 精准基因组编辑 | 医学, 食品, 农业 |
| 728 | 2026-06-03 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 探究普城沙雷氏菌胞外聚合物在浮游和生物膜系统中对铜离子吸附的关键作用 | 首次揭示普城沙雷氏菌As3-5a(5)菌株中紧密结合型胞外聚合物的蛋白组分对铜离子高效吸附的贡献，并定量比较浮游细胞与生物膜系统的吸附效率 | 未通过合成生物学方法优化铜离子固定能力，且系统在真实工业废水条件下的技术成熟度尚需提升 | 阐明细菌胞外聚合物在铜离子生物吸附中的核心机制并开发工业废水处理应用 | 普城沙雷氏菌As3-5a(5)菌株的浮游细胞和生物膜系统 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附 | NA | 浓度数据 | 铜离子初始浓度3.14 mM（实验室体系）和40 mM（电镀废水） | NA | 普城沙雷氏菌 | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 729 | 2026-06-03 |
Engineering Trichoderma-mediated plant defense against bacterial phytopathogens: Micro-and nanobiotechnological strategies
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026002
PMID:41938783
|
综述 | 该文章综述了利用木霉介导的植物防御对抗细菌性植物病原体的微生物与纳米生物技术策略 | 将纳米技术与CRISPR基因编辑和合成生物学相结合，构建木霉作为下一代精准作物保护平台 | 田间转化、生物安全性和监管方面仍存在挑战 | 综述木霉在防控细菌性植物病害中的微生物与纳米生物技术策略 | 木霉属真菌及细菌性植物病原体（如XXX、XXX等） | NA | 细菌性植物病害 | CRISPR基因编辑、合成生物学、纳米技术、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 木霉 | 工程化生物防治菌株 | 农业 |
| 730 | 2026-06-03 |
Engineering the holobiont: Synthetic biology strategies for reversing bioenergetic collapse in radiation enteritis
2026, AIMS microbiology
IF:2.7Q3
DOI:10.3934/microbiol.2026003
PMID:41938784
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综述 | 本文综述了利用合成生物学策略工程化肠道微生物组，以逆转放射场肠炎中生物能量崩溃的方法 | 提出从经验性益生菌补充转向理性微生物组工程，包括热力学工程、遗传驯化和布尔逻辑门生物计算机设计，以解决当前治疗的局限性 | 目前仍处于概念性路线图阶段，缺乏大规模人体临床验证和安全性评估的具体数据 | 通过合成生物学方法重建肠道稳态，实现放射场肠炎的治疗并改善癌症长期生存率 | 肠道微生物组，特别是工程化共生菌和宿主-微生物互作网络 | 合成生物学 | 放射场肠炎 | 合成生物学，基因编辑，微生物工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程化共生菌（如大肠杆菌），肠道微生物组 | 布尔逻辑门，热力学工程，遗传驯化（如磺酸酶删除），生物计算机，STALEMATE生物防护系统 | 医学，肿瘤放疗 |
| 731 | 2026-06-02 |
Eukaryotic cell-free protein synthesis: Chassis diversification, system engineering, and emerging applications
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.022
PMID:42221684
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综述 | 从系统工程角度全面综述和分析真核无细胞蛋白质合成系统的最新进展，涵盖底盘多样化、系统设计和新兴应用 | 从系统工程视角综合分析底盘多样化、核心反应组件理性设计，并探讨人工智能和合成生物学工具在突破标准化和成本瓶颈中的应用潜力 | 当前标准化和成本瓶颈仍阻碍工业化进程，需通过人工智能和合成生物学工具进一步优化 | 为构建经济、高通量的真核无细胞生物制造平台提供理论参考和实践指导 | 真核无细胞蛋白质合成系统 | NA | NA | 无细胞蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | 真核生物底盘 | NA | 人工细胞构建、生物电子接口开发、微阵列芯片设计 |
| 732 | 2026-06-02 |
Employing synthetic biology to modulate metabolic flux: Current strategies and applications
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.012
PMID:42020273
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综述 | 本综述总结了代谢工程中用于调控代谢流的最新基因调控工具和策略及应用 | 根据中心法则的分子调控水平对工具进行分类，并讨论了尚未充分开发的潜在工具 | 未提供具体实验数据或比较分析，仅基于文献综述 | 总结代谢工程中的基因调控工具和策略，以促进可持续生物制造 | 细菌、古菌和真核生物中的多酶途径基因调控工具 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌, 古菌, 真核生物 | 代谢调控回路，包括基因开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术, 医药, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品 |
| 733 | 2026-06-02 |
Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.014
PMID:42025521
|
研究论文 | 开发了改进版tRNA阵列方法，实现21种tRNA的同步体外合成 | 通过序列修饰和引入前导序列，解决了原tRNA阵列方法中特定tRNA组限制翻译活性的问题 | NA | 提高tRNA阵列方法的翻译活性，使之与单独制备tRNA的性能相当 | tRNA阵列方法及翻译活性受限的tRNA组 | 合成生物学 | NA | 体外转录与翻译，序列修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | tRNA阵列，包含前导序列的基因表达系统 | 合成生物学，生物技术 |
| 734 | 2026-06-02 |
Tailored base editing toolkits for functional genomics and metabolic engineering in the halophile Salinivibrio
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
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研究论文 | 开发了适用于嗜盐菌Salinivibrio的碱基编辑工具包，用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌中开发高效的碱基编辑平台，实现单、双、三位点替换，以及新型融合蛋白实现协同双碱基编辑 | 未提及在更广泛嗜盐菌中的适用性或长期稳定性 | 开发高效遗传工具以促进嗜盐菌的工业应用 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | NA | NA | ABE, CBE, PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑工具，包括腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器及协同双碱基编辑器 | 工业生物技术 |
| 735 | 2026-06-02 |
Engineering AraC L9K for inducer-independent pBAD activation in Salmonella Gallinarum
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
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研究论文 | 通过在肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌中结合宿主基因组修饰和定点诱变，生成不依赖诱导剂的AraC变体L9K，实现pBAD启动子的组成型高表达 | 首次在沙门氏菌中通过L9K单点突变获得不依赖阿拉伯糖的AraC组成型激活变体，且与常用pBAD载体兼容，避免了代谢负担 | NA | 开发不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统，用于微生物制造和合成生物学应用 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 定点诱变，基因敲除，结构建模 | NA | NA | NA | 靶向诱变 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 不依赖诱导剂的组成型基因表达系统 | 工业生物技术，医学，合成生物学 |
| 736 | 2026-06-02 |
Synthetic biology-driven innovations in triple-negative breast cancer: Integrating engineering design with targeted therapeutics
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.017
PMID:42082082
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综述 | 综述合成生物学驱动的三阴性乳腺癌精准诊疗工程化策略 | 系统整合合成生物学与工程化设计原理，涵盖细胞工程、微生物工程和核酸工程三大类策略，并提出联合免疫肿瘤学与精准医学克服肿瘤异质性和耐药性的协同潜力 | 未提及具体临床转化障碍或体内验证数据，理论框架多于实验证据 | 总结合成生物学方法在三阴性乳腺癌中的最新进展，探索下一代自适应个性化治疗方案 | 三阴性乳腺癌（TNBC） | 合成生物学 | 三阴性乳腺癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因回路 | 医学 |
| 737 | 2026-06-02 |
Powering next-generation precision therapeutics through integrated synthetic transcriptional systems
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117308
PMID:42035420
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综述 | 综述整合合成转录系统在精准治疗中的应用进展，涵盖启动子工程、模块化转录因子设计和人工智能辅助的理性设计 | 从经验试错转向理性预测设计，通过人工智能辅助实现了合成启动子和转录因子的协同整合，支持多输入感知、可调表达和高正交性 | 未明确讨论系统在体内应用的长期稳定性和免疫原性等潜在问题 | 推动合成转录系统在哺乳动物精准治疗中的应用，增强治疗精确性并减少脱靶效应 | 合成启动子与合成转录因子的整合系统 | 合成生物学 | 复杂疾病 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 逻辑门、反馈回路、可调系统 | 医学 |
| 738 | 2026-06-02 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-01-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
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综述 | 综述了液-液相分离驱动生物分子凝聚体形成的分子机制、设计策略及其在合成生物学中的转化前景 | 将液-液相分离原理从细胞组织引申至合成平台，系统归纳了利用内在无序蛋白、模块化互作基序和RNA支架设计功能性凝聚体的策略 | 未涉及合成凝聚体在体内复杂环境中的长期稳定性及潜在脱靶效应 | 总结液-液相分离介导的凝聚体分子机制与工程设计方法，促进细胞生物物理学与生物工程的交叉研究 | 液-液相分离形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 合成凝聚体（用于增强催化、代谢控制、靶向药物递送和生物传感） | 医学, 工业生物技术 |
| 739 | 2026-06-02 |
Chemically synthesized high-fidelity oligos ≤ 600 nt as building blocks to accelerate complex gene construction in synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag005
PMID:42222009
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研究论文 | 报道一种名为UCOS的新型平台，用于高效合成长度≤600个核苷酸、具有复杂重复序列和碱基分布不均特征的高保真寡核苷酸 | 采用非多孔硅微球替代传统可控孔玻璃作为固相载体，结合5'侧翼序列杂交的全长富集和错误去除酶，显著提升复杂超长寡核苷酸的合成保真度 | NA | 开发能够高效合成复杂、超长DNA片段的方法，以支持合成生物学和基因工程应用 | 超长复杂寡核苷酸（≤600 nt），包括串联重复序列和碱基分布不均的序列 | 合成生物学 | NA | UCOS（超长复杂寡核苷酸合成） | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、合成基因组学 |
| 740 | 2026-06-01 |
Dual-promoter control of gene expression: from transcriptional fine-tuning to antibiotic resistance
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102747
PMID:41903510
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综述 | 综述微生物中双启动子调控基因表达的策略及其在抗生素耐药性预测和合成生物学中的应用 | 系统总结了双启动子结构在微生物中的组合调控机制，并探讨其在抗生素应激传感及耐药性机制预测中的新应用 | 未提供具体的实验数据或定量分析，主要基于文献综述，缺乏对直接因果关系验证的深入讨论 | 阐明双启动子调控基因表达的机制及其在微生物中作为生物传感器和合成生物学工具的应用价值 | 微生物（包括细菌和真菌）中的双启动子调控系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 双启动子逻辑门、生物传感器、合成基因回路 | 医学, 工业生物技术 |