合成生物学相关文章

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当前共找到 1806 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
61 2026-11-01
Dynamics of genetic circuits in Pseudomonas protegens
2026-Mar-18, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 该文开发了实验-理论流程,在土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 中评估 NOT 逻辑电路(反相器),并建立数学模型分析电路动态特性 首次在 Pseudomonas protegens Pf-5 中系统表征和建模 NOT 逻辑电路,发现其开关转换比 Pseudomonas putida 更陡峭,并验证了两个兼容反相器串联产生 YES 逻辑响应 研究仅针对 NOT 逻辑电路,未探索更复杂的电路拓扑;且仅在单一非模式宿主中验证,普适性有待进一步验证 扩展合成生物学底盘选项,评估 Pseudomonas protegens Pf-5 作为环境合成生物学底盘的潜力 Pseudomonas protegens Pf-5 中的 NOT 逻辑电路(反相器) 合成生物学 NA NA 数学模型 NA NA NA Pseudomonas protegens Pf-5 NOT 逻辑电路(反相器)及其串联组成的 YES 逻辑电路 环境
62 2026-11-01
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology IF:5.9Q1
综述 本文探讨微生物的自然计算能力以及合成生物学中实现的合成基因回路,旨在弥合两者之间的复杂度差距 提出理解和形式化微生物计算方式对于改进合成基因回路至关重要,并系统比较了自然微生物计算与合成基因回路的能力差异 作为综述文章,未提供原始实验数据;对自然微生物计算的符号表示和算法原理的理解仍不充分 探索微生物的计算能力,弥合自然微生物计算与合成基因回路之间的复杂度差距 微生物(以细菌为重点)及其自然计算机制和合成基因回路 合成生物学 NA 合成基因回路构建 NA 文本 NA NA 细菌 布尔门电路、组合逻辑电路、时序逻辑电路、记忆系统、模拟电路、细胞群落分布式计算 环境, 工业生物技术
63 2026-11-01
Automated workflow for genotyping individual transposon library variants
2026-Jan-12, BMC methods
研究论文 本文提出并验证了一套基于开源OT-2液体处理平台的自动化工作流程,用于对转座子文库中的单个变异进行基因分型,并配套开发了自定义Python包用于测序结果注释 将开源OT-2液体处理平台与六步模块化实验流程及自定义Python注释包相结合,实现了转座子插入文库单克隆基因分型的低成本、可复用、标准化自动化流程,并遵循SEVA载体标准和LAP脚本规范以保证可移植性与可重复性 工作流程的通量受限于液体处理平台的工作台容量,需通过多次运行或在多台液体处理平台上并行处理来扩展;此外尚未整合适配OT-2的菌落挑取器,流程仍可进一步简化 开发一套可访问、可重复、可扩展的自动化工作流程,用于转座子插入文库中单个变异的基因分型,降低人力投入和人为误差 恶臭假单胞菌KT2440(Pseudomonas putida KT2440)中的转座子插入文库变异 合成生物学, 基因组工程 NA 任意PCR(arbitrary PCR)、菌落PCR、Sanger测序、液体处理自动化 NA 测序数据, 实验图像/菌落数据 46个转座子插入变异(其中40个成功鉴定插入位点) NA 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)KT2440 NA 医学, 工业生物技术
64 2026-10-31
Synthetic Biology and Soft Robotics in Biohybrid Kidney Replacement: A Conceptual Framework and Translational Roadmap
2026-Nov, Artificial organs IF:2.2Q3
综述 本文提出一个概念性框架,探讨将合成生物学与软体机器人技术整合到生物混合肾脏替代治疗中,并规划其转化路线图 提出“赛博肾单位”概念,即耦合活体肾/血管细胞与柔性机械和流体接口的工程化功能单元,并组织为具有可分离过滤、小管转运、内分泌支持和控制模块的模块化肾脏辅助装置(MRAD),同时应用技术就绪水平(TRL)区分已建立、临床前和概念性组件 该框架属于假设生成性研究框架而非近期临床解决方案,许多关键组件(如自主肾脏基因回路、主动免疫隔离、持久血管整合、全植入闭环控制)仍处于临床前或概念阶段(TRL 1-2),且面临血栓形成、氧输送、细胞成熟、遗传稳定性、机械疲劳、功率需求、网络安全以及活体-设备组合产品监管等重大障碍 探讨合成生物学和软体机器人在生物混合肾脏替代治疗框架中的潜在整合,并制定分阶段验证的转化路线图 慢性肾脏病患者的肾脏替代治疗 合成生物学, 软体机器人, 生物医学工程 慢性肾脏病 NA NA 文献 NA NA 哺乳动物细胞 自主肾脏基因回路(概念性) 医学
65 2026-10-31
Recent biotechnological advances and technology readiness level of natural products derived from marine fungi
2026-Nov, 3 Biotech IF:2.6Q3
综述 该综述分析了百余种海洋真菌来源的生物活性化合物,聚焦其化学多样性、生物活性、商业化现状、经济相关性及技术成熟度(TRL),并讨论了商业化障碍与提升策略 系统评估海洋真菌天然产物的技术成熟度等级(TRL),并针对不同应用领域(药物、营养品、化妆品、工业酶)分别给出TRL区间,同时整合菌株改良、发酵优化、OSMAC、基因组挖掘、代谢工程和CRISPR/Cas通路工程等多种提升TRL的策略 多数化合物仍处于早期开发阶段(TRL 1-3),仅约10-20种已上市;代谢物产量低且不稳定、结构复杂、法规与生物勘探限制、转化投资与工业基础设施不足,以及后期开发的高财务与技术风险 分析海洋真菌来源天然产物的化学多样性、生物活性与商业化潜力,评估其技术成熟度并识别商业化障碍,提出提升TRL与促进可持续循环生物经济的策略 海洋真菌来源的天然产物(次级代谢产物),包括聚酮、生物碱、萜类、肽类、氮杂菲酮等百余种生物活性化合物 天然产物生物技术,海洋生物技术,合成生物学,工业生物技术 癌症,感染性疾病(抗菌、抗病毒) 生物勘探,发酵优化,化学酶合成,OSMAC,原位产物移除,基因组挖掘,代谢工程,化学基因组学,CRISPR/Cas通路工程 NA 文献数据,化合物信息 一百多种海洋真菌来源的生物活性化合物 CRISPR-Cas9 海洋真菌 代谢通路工程与途径工程(用于次级代谢产物生产) 医药,食品(营养品),化妆品,工业生物技术,环境
66 2026-10-31
Yeast-Based Platforms for Next-Generation Human Health Applications
2026-Oct-30, FEMS yeast research IF:2.4Q3
综述 系统综述了酵母平台在人类健康应用中的转化演进,涵盖合成生物学工具包、糖基工程、人工智能辅助设计以及疫苗、治疗酶和活体生物治疗产品等临床应用 将传统及非常规酵母重新定义为可扩展的生物制造工厂和先进的活体治疗产品,并强调人工智能驱动的基因表达预测和菌株设计等数据驱动范式 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对具体技术细节和临床转化中的挑战讨论有限 探讨酵母平台在下一代人类健康应用中的转化演进和未来方向 酿酒酵母、Komagataella phaffii、布拉氏酵母、解脂耶氏酵母等传统及非常规酵母 合成生物学 NA CRISPR介导的多重编辑、模块化克隆框架、高通量分泌筛选、糖基工程、人工智能预测 NA 文本 NA CRISPR-Cas9 酿酒酵母, Komagataella phaffii, 布拉氏酵母, 解脂耶氏酵母 NA 医学, 工业生物技术
67 2026-10-31
Natural and engineered bacteriophages against multidrug-resistant ESKAPE pathogens: current landscape and clinical translation
2026-Oct-29, Future microbiology IF:2.5Q3
综述 本文综述了天然和工程化噬菌体对抗多重耐药ESKAPE病原体的研究进展、工程改造策略及临床转化面临的挑战 系统总结了尾纤维修饰、解聚酶和内溶素增强、CRISPR基因组编辑及计算设计噬菌体鸡尾酒等合成生物学改造策略,并批判性分析了临床转化的科学和监管障碍 缺乏临床试验数据,监管框架不明确,缺少GMP级生产,药代动力学变异大 探讨工程化噬菌体对抗ESKAPE病原体的改造方法,识别限制临床应用的障碍,并概述广泛采用所需的关键步骤 多重耐药ESKAPE病原体及针对其的天然和工程化噬菌体 合成生物学、医学微生物学 医院获得性感染 CRISPR基因组编辑、尾纤维修饰、解聚酶工程、内溶素增强、计算设计 NA 文本 NA CRISPR-Cas 噬菌体、细菌 噬菌体鸡尾酒、工程化噬菌体 医学
68 2026-10-31
Bacterial R-bodies with common morphologies and unrolling dynamics are phylogenetically scattered, indicating extensive lateral gene transfer and wide application potential
2026-10-21, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 该文研究了来自六种假单胞菌门的R体,比较其形态、遗传数据和展开动力学,发现R体在系统发育上分散且存在广泛横向基因转移,并首次将其分为快速爆发和慢速两类 首次基于高帧率光镜视频记录将R体分为快速爆发和慢速酸性诱导伸展两类动力学,并提出该标准可能最适合选择生物技术应用的R体工具 文章未明确说明每种R体的具体样品数量,且仅研究了六种假单胞菌门的R体,横向基因转移使得基于遗传数据的统一框架受到干扰 整合R体的遗传学、形态学和展开动力学,为建立R体生物技术工具箱提供依据 来自六种假单胞菌门的R体,包括系统发育多样的内共生菌和非内共生菌 合成生物学 NA 电子显微镜、高帧率光镜视频记录 NA 图像、视频、遗传数据 六种假单胞菌门的R体 NA 假单胞菌门细菌 NA 医学、工业生物技术
69 2026-10-31
Elucidating the effect of spatial localization on metabolic systems
2026-Oct-07, Journal of the Royal Society, Interface
研究论文 该研究结合自下而上的基本构建块研究和自上而下的具体案例研究,探讨空间定位/区室化对代谢系统的影响 揭示了空间定位对代谢基序的结构不变量和多种非直观效应,引入并分析了空间控制系数,发现了定位在代谢网络工程中的多种权衡 未明确提及具体局限性 理解空间组织对细胞内生物分子网络的影响,特别是代谢系统中空间定位/区室化的效应 代谢系统及代谢网络 系统生物学 NA 系统生物学建模、空间成像、数据处理 NA NA NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
70 2026-10-31
Multi-omics dissection of transcriptional and post-transcriptional responses in cyanobacterial high-light adaptation
2026-Oct-06, Plant physiology IF:6.5Q1
研究论文 该研究通过整合转录组和蛋白质组分析,揭示了蓝细菌耐高光菌株中少量点突变介导高光耐受性的协调网络机制 结合多组学手段系统解析了NdhF1F124L和EF-G2R461C两个关键点突变如何通过协调转录和转录后调控网络赋予蓝细菌高光耐受性,并发现磷酸盐代谢调控在高光适应中的重要作用 未在摘要中明确说明研究局限性 阐明少量点突变介导蓝细菌高光耐受性的分子机制,为合成生物学底盘开发提供理论基础 蓝细菌Synechocystis sp. PCC 6803的实验室型菌株和高光耐受型菌株 合成生物学、微生物学 NA 转录组学、蛋白质组学、多组学整合分析 NA 转录组数据、蛋白质组数据 NA NA Synechocystis sp. PCC 6803 NA 合成生物学、工业生物技术
71 2026-10-31
Biomedical applications of antimicrobial peptides: Multifunctional mechanisms, engineering strategies, and therapeutic development
2026-Oct-03, International journal of antimicrobial agents IF:4.9Q1
综述 本文综述了抗菌肽的来源、结构特征、主要抗菌机制、细菌耐药机制、设计优化策略及其在生物医学领域的应用前景与挑战 系统整合了抗菌肽的多功能机制、工程化设计策略(自组装纳米结构、联合疗法、靶向修饰)以及人工智能驱动设计、纳米技术和合成生物学等前沿发展方向 抗菌肽的临床应用仍面临稳定性有限、潜在毒性和制造成本高等障碍 全面概述抗菌肽的多功能机制、工程策略和治疗开发,为未来抗感染治疗提供参考 抗菌肽(AMPs) 生物医学 感染性疾病 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 材料
72 2026-10-31
Endophytes for climate-resilient agriculture: Mechanisms and systems-level insights
2026-Oct, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1
综述 系统综述内生菌通过多种机制增强作物气候适应性的研究进展,并强调多组学和系统级方法的应用 从系统级视角整合多组学、微生物组工程、合成生物学和精准农业,提出开发稳健内生菌技术和微生物联合体的路径 田间表现不稳定、环境适应性有限、制剂和递送困难、宿主微生物兼容性问题、生态互作复杂、生物安全及监管要求等制约农业转化 综述内生菌在气候韧性农业中的作用机制,并探讨其农业应用的限制与系统级解决方案 植物内生细菌和真菌及其与作物的互作关系 农业微生物组学 NA 多组学、微生物组工程、合成生物学、精准农业 NA 文献 NA NA 植物 NA 农业、环境
73 2026-10-31
Regulatory cascade of NdpR and NdpR2 in controlling nicotine degradation operons in Sphingomonas melonis TY
2026-09-23, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 该文阐明了Sphingomonas melonis TY中NdpR和NdpR2协同调控尼古丁降解操纵子的级联调控机制,并基于此构建了可编程的多因子基因回路 揭示了NdpR和NdpR2在重叠靶启动子上的多层級联调控网络,提出了转录和蛋白质水平协同作用的双锁调控机制,并开发了响应尼古丁、2,5-DHP和IPTG的双向可逆多因子基因回路 研究主要基于结构模拟和突变分析,缺乏体内动态实时监测数据;异源宿主应用仅在假单胞菌JY-Q中验证,普适性有待进一步评估 解析NdpR和NdpR2调控尼古丁降解操纵子的层级关系和分子机制,并开发可编程调控工具 Sphingomonas melonis TY中的TetR家族调控蛋白NdpR和AraC家族调控蛋白NdpR2及其靶启动子 合成生物学 NA 结构分析、定点突变、分子模拟 NA 文本、结构数据 NA NA Sphingomonas melonis TY, Pseudomonas sp. JY-Q 多因子基因回路(双向可逆响应尼古丁、2,5-DHP和IPTG) 环境, 工业生物技术
74 2026-10-31
Metabolic engineering of Komagataella phaffii for enhanced production of heterologous proteins and small molecules: key strategies and future directions
2026-08-19, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
综述 综述了通过代谢工程改造Komagataella phaffii(毕赤酵母)以提高异源蛋白和小分子产量的关键策略及未来方向 系统总结了代谢通量控制、动态调控、系统建模、底盘细胞优化等策略在毕赤酵母代谢工程中的应用进展 作为综述文章,未提供新的实验数据,主要基于已有文献归纳,缺乏对具体策略的定量比较和实验验证 总结毕赤酵母代谢工程的研究进展,分析核心优化策略,并指出当前挑战和未来发展方向 Komagataella phaffii(毕赤酵母)表达系统及其代谢工程改造策略 合成生物学 NA 代谢工程、合成生物学、计算生物学 NA 文本 NA NA Komagataella phaffii 代谢通量控制、代谢动态控制、底盘细胞优化 医药,工业生物技术
75 2026-10-31
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-04-22, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 该文章开发了一种在大肠杆菌中可紧密调控、低速率基因组重组的Cre-lox系统,并应用于缺氧环境下的亚砷酸盐生物传感 开发了可滴定、低基础活性的Cre重组酶系统,实现低速率遗传记忆;构建了基于重组记忆的亚砷酸盐全细胞生物传感器,可在缺氧条件下记录暴露并在好氧条件下延迟荧光读数 未明确说明系统的动态范围、长期稳定性及在复杂环境样本中的性能 开发可调控的低速率基因组重组工具,用于环境生物传感和合成生物学应用 大肠杆菌(Escherichia coli)及亚砷酸盐 合成生物学 NA Cre-lox重组系统 NA 荧光信号 NA Cre-lox 大肠杆菌 基于Cre重组酶的遗传记忆开关 环境监测,合成生物学
76 2026-10-31
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-03-18, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2
研究论文 通过调控胞内c-di-GMP信号水平来工程化改造嗜酸氧化亚铁硫杆菌的生物膜,从而提升生物浸出效率和砷耐受性 首次通过靶向调控全局调控分子c-di-GMP来实现生物膜基质组成的可调重塑,同时提升生物浸出效率和重金属耐受性,克服了传统单性状改造策略的局限性 研究仅针对模式生物浸出微生物嗜酸氧化亚铁硫杆菌,未在其他浸矿微生物中验证;砷胁迫下的长期适应性及工业规模应用效果尚待进一步评估 通过调节胞内c-di-GMP信号增强生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性,为环境友好型生物浸出和尾矿回收提供合成生物学策略 嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans) 合成生物学、环境生物技术 NA 基因过表达、转录组分析、c-di-GMP定量检测 NA 转录组数据、生化指标数据 3株工程菌株(S-222、S-306、S-651)及空载体对照菌株 基因过表达(二鸟苷酸环化酶基因过表达) 嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans) c-di-GMP信号通路调控(过表达二鸟苷酸环化酶基因) 环境、工业生物技术、采矿冶金
77 2026-10-31
Forged in O2: Transition metal ions and the rise of aerobic life
2026-Feb, Journal of inorganic biochemistry IF:3.8Q1
综述 该文综述了氧气代谢演化中过渡金属离子和金属蛋白在双氧活化、利用与解毒中的关键作用,并整合生物无机化学、酶学、合成生物学和微生物组学的视角 从跨学科角度系统连接仿生分子配合物、天然与人工金属蛋白的研究,揭示管理双氧反应性的结构与功能策略,并强调金属离子在宿主-微生物互作和病理结果中的系统作用 作为综述文章,未提供原始实验数据或新的实证结果,主要基于已有文献的综合分析 建立理解金属离子在双氧化学中关键作用的基础,阐明其支撑健康代谢和氧化应激相关疾病的机制 过渡金属离子、金属蛋白、金属酶、仿生分子配合物、天然和人工金属蛋白、微生物组 生物无机化学, 酶学, 合成生物学, 微生物组学 氧化应激相关疾病 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
78 2026-10-31
Mitigating chromium-induced oxidative stress in plants: a cross-talk between phytohormones and rhizospheric microbes
2026, International journal of phytoremediation IF:3.4Q2
综述 本文综述了六价铬诱导植物氧化应激的机制,以及植物激素与根际微生物之间的交互作用 提出ACC脱氨酶AP2/ERF通路是PGPR介导的Cr(VI)耐受最佳表征途径,强调激素组合策略优于单一激素,并归纳出调控Cr(VI)分子响应的四模块基因网络 植物提取与食品安全之间存在冲突,且缺乏田间规模验证,现有有效性指标均为实验室估计 综合梳理Cr(VI)诱导氧化应激、分子改变、PGPR机制、植物激素交互及多组学与合成生物学方法 受Cr(VI)胁迫的植物及其根际微生物和植物激素 植物科学, 环境科学, 微生物学 NA 多组学, 合成生物学 NA 文献 NA NA 植物, 根际细菌 NA 农业, 环境
79 2026-10-31
Synthetic genome shuffling of poxviruses in yeast generates novel poxvirus candidates with potential oncolytic properties
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
研究论文 该研究在酵母中建立了痘病毒基因组规模的合成重组平台,通过合成基因组 shuffling 生成来源于多种非人致病痘病毒的嵌合痘病毒库,并展示了其在人类癌细胞中的功能多样性和潜在溶瘤特性 首次利用酵母介导的基因组 shuffling 进行多物种痘病毒基因组重组,快速生成功能多样的嵌合痘病毒;实现了痘苗病毒基因组在酵母中的近完全组装并产生功能性病毒 所描述的嵌合病毒尚未包含实现肿瘤选择性复制所需的减毒突变 开发合成生物学框架,通过酵母中的基因组规模重组生成具有潜在溶瘤特性的新型嵌合痘病毒候选物 多种非人致病痘病毒谱系(包括痘苗病毒)及其嵌合重组体 合成病毒学, 溶瘤病毒治疗, 合成生物学 癌症 合成基因组 shuffling, 酵母介导的基因组重组, 全基因组测序 NA 基因组序列, 表型数据(噬斑形态、传播行为、癌细胞系活性) 多种痘病毒物种的基因组输入;多个嵌合构建体;多种人类癌细胞系(具体数量未提供) NA 酿酒酵母, 人类癌细胞 NA 医学
80 2026-10-30
Artificial Cells and Biomimetic Cells: Intelligent Systems Driving a Paradigm Shift in Drug Discovery and Delivery
2026-Oct-28, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
综述 本文综述了人工细胞和仿生细胞作为连接基础生物学发现与临床转化的框架,涵盖五条关键技术路径,用于药物发现和递送 提出将人工细胞与仿生细胞作为统一框架连接基础发现与临床转化,系统梳理五条技术路径,并强调闭环学习、可解释模型与先进生物制造在其中的作用 在可规模化制造、长期稳定性以及监管适应性方面仍存在挑战 评估人工细胞和仿生细胞在药物发现与递送范式转变中的作用 人工细胞、仿生细胞、无膜细胞器系统、多区室人工细胞、原细胞通信网络、虚拟细胞 合成生物学, 材料科学, 人工智能 NA 合成生物学, 材料科学, 人工智能 虚拟细胞, 可解释模型, 闭环学习 NA NA NA NA 逻辑门控细胞间通讯, 微环境触发释放, 原细胞通讯网络 医学, 制药
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