合成生物学相关文章
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当前共找到 821 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
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综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展，旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合，提出可编程干预手段（如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞） | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |
| 62 | 2026-05-03 |
Engineering Rapamycin-Induced Dimerization for Control of Gene Expression in Plants
2026-Apr-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00125
PMID:41990133
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研究论文 | 开发了一种基于雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统，用于植物基因表达的精确调控 | 首次在植物中开发出雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统，通过系统优化实现87倍诱导倍数且超过组成型表达，表面喷洒或土壤施用即可诱导 | 未明确说明局限性，但可能存在雷帕霉素对植物细胞的其他影响或系统在田间环境的稳定性问题 | 开发一种低背景、高诱导、操作简便的植物化学诱导基因表达系统 | 植物（如模式植物），具体物种未指定 | NA | NA | 分裂转录因子系统 | NA | NA | NA | NA | 植物（如模式植物） | 雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统，含DNA结合域与转录激活域的融合蛋白 | 农业、工业生物技术 |
| 63 | 2026-05-03 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
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research paper | 提出一个标准化工作流程，用于动力学代谢模型的构建、注释、可视化和共享 | 整合社区标准和开源工具，确保模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | NA | 提高动力学代谢模型的可重复性和实用性 | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 64 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
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研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 65 | 2026-05-02 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-Apr-24, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
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研究论文 | 工程化肠道共生菌多形拟杆菌实现结直肠肿瘤靶向药物递送 | 基于天然肠道共生菌多形拟杆菌构建新型细菌递送系统，通过筛选表面锚定蛋白实现肿瘤靶向蛋白展示，并整合治疗模块实现双重抗肿瘤效果 | 尚需进一步评估临床安全性和长期免疫反应 | 开发基于肠道共生菌的靶向肿瘤治疗新策略 | 多形拟杆菌 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微生物工程 | NA | NA | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | NA | 多形拟杆菌 | 肿瘤靶向蛋白展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |
| 66 | 2026-05-02 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
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综述 | 本文综述了鸟氨酸脂及其他酰氧基酰基氨基脂的研究进展，包括其合成途径、功能及其在合成生物学中的潜在应用 | 首次系统分析了编码鸟氨酸脂合酶的基因在细菌分类中的分布，并讨论了鸟氨酸脂修饰对膜性质的生物物理影响及其与Toll样受体4的相互作用 | 未提供实验数据验证预测，且综述范围限于已发表研究，可能遗漏未报道的数据 | 总结鸟氨酸脂的生物合成、修饰、功能及应用进展，促进其在合成生物学中的利用 | 细菌中的鸟氨酸脂及类似脂类 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌（E. coli） | 代谢通路：鸟氨酸脂生物合成与修饰 | 合成生物学 |
| 67 | 2026-05-02 |
Mass spectrometry integrates protein design into structural biology method development
2026, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2025.10018
PMID:42063620
|
综述 | 概述了质谱如何通过验证多种设计目标来补充蛋白质设计，并探讨了工程蛋白作为方法开发测试平台的价值 | 提出将机器学习与原生质谱整合形成反馈循环的新观点，即新设计挑战分析技术，改进的方法提供更丰富数据以指导未来预测 | 未提及具体实验数据或量化分析，缺乏对整合方法实际效能的评估 | 阐述质谱在蛋白质设计验证中的作用及其与机器学习的协同关系 | 人工设计蛋白质及其结构特征（寡聚化、折叠、配体结合、动态构象变化） | 机器学习 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工原细胞开发 |
| 68 | 2026-05-02 |
PSMA-directed CAR-T cell therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer: a next-generation engineering perspective on stem cell-derived immune effectors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819701
PMID:42064077
|
综述 | 这篇综述回顾了针对转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）的PSMA导向CAR-T细胞疗法的临床翻译现状，并提出了一种三重协同框架来克服TME免疫抑制、抗原异质性和T细胞适应性等核心挑战 | 提出了三重协同框架系统解构实体瘤障碍，并聚焦于干细胞衍生免疫效应器（如iPSC衍生CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞）作为新一代细胞产品范式，同时纳入基于证据的等级评估提升学术严谨性 | NA | 为PSMA-CAR-T疗法提供战略蓝图，以将其推进至mCRPC的治愈性治疗，并广泛适用于新一代干细胞衍生免疫疗法 | PSMA导向CAR-T细胞疗法及其在mCRPC中的临床应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | 人 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 69 | 2026-05-01 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
|
研究论文 | 该研究探索了机器学习和机理模型的整合方法，并应用于合成生物学资源竞争问题 | 提出了部分不确定模型结构（PUMS）概念和嵌入式物理信息神经网络（ePINNs），通过两个共享损失函数神经网络无缝融合ML和MM组件，并防止ML忽视机理约束 | 机理模型构建耗时且依赖简化假设，可能无法完全捕捉现实复杂性 | 结合机器学习和机理模型以实现更鲁棒的预测和增强的系统洞察 | 机器学习模型与机理模型的整合方法 | 机器学习 | NA | NA | 嵌入式物理信息神经网络（ePINNs） | NA | NA | NA | 活细胞 | 基因网络模型 | 合成生物学 |
| 70 | 2026-05-01 |
Engineered live bacteria for liver diseases and gut-liver axis disorders: from genetic modification to advanced delivery systems
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04483-2
PMID:42057131
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综述 | 本文综述了工程化活菌在肝脏疾病及肠肝轴疾病中的应用，从基因修饰到先进递送系统的进展 | 系统总结了工程化活菌在肝脏疾病治疗中的内部基因修饰与外部共价连接策略，并讨论了多种递送系统（胶囊、微囊、纳米制剂）和给药方式 | 面临挑战包括工程化活菌的临床转化难度、安全性及稳定性问题 | 探讨工程化活菌在肝脏疾病治疗中的潜力，推动其临床应用并减轻肝脏疾病的全球负担 | 双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉酵母菌、罗伊氏乳杆菌等工程化活菌 | 数字病理学 | 肝细胞癌、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病 | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | 生物传感器, 代谢通路 | 医学 |
| 71 | 2026-05-01 |
Bacillus methanolicus as an emerging platform for energy-efficient biomanufacturing from one-carbon and marine resources
2026-Apr-28, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103500
PMID:42056785
|
综述 | 本文强调枯草芽孢杆菌甲醇利用菌作为新兴生物制造平台，能够高效利用甲醇和甘露醇 | 首次系统阐述该菌在利用一碳和海洋资源方面的能量高效特性及合成生物学工具进展 | 讨论甲醇和甘露醇生物制造面临的挑战，需进一步优化菌株 | 建立枯草芽孢杆菌甲醇利用菌作为联接一碳和海洋衍生底物与可持续化学合成的多功能平台 | 枯草芽孢杆菌甲醇利用菌的甲醇和甘露醇代谢途径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌甲醇利用菌 | NA | 工业生物技术 |
| 72 | 2026-04-28 |
Ultra-rapid and high-titer biomanufacturing of trehalose 6-phosphate by an in vitro synthetic biology platform
2026-Apr-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01057-w
PMID:42043645
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2026-05-01 |
Opportunities for artificial intelligence and synthetic biology in designing living drug delivery systems
2026-Apr-27, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115883
PMID:42055250
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综述 | 综述了人工智能和合成生物学在设计活体药物递送系统方面的机遇 | 首次系统阐述了AI和合成生物学协同设计活体药物递送系统的潜力，重点解析了从受体设计到基因电路组成的序列-功能和组成-功能原理 | 传统设计-构建-测试-学习方法在解析受体、信号处理和基因调控元件方面存在困难且通量低 | 探讨如何利用AI和合成生物学克服活体药物递送系统设计中的挑战 | AI和合成生物学在工程化人类细胞和细菌作为活体药物递送载体中的应用 | 机器学习,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人类细胞,细菌 | 合成受体、信号蛋白、基因调控元件、基因电路 | 医学 |
| 74 | 2026-05-01 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Apr-27, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
|
研究论文 | 基于GP35重组酶的遗传操作工具，用于反刍动物支原体的靶向基因编辑 | 首次利用来自噬菌体SPP1的GP35重组酶在牛支原体中实现精准基因插入和缺失，避免随机脱氨风险，编辑效率高达77.78%-100% | 该工具当前仅针对牛支原体验证，对其他反刍动物病原体的适用性需进一步验证，且未探讨长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发一种有效的遗传工具以推进反刍动物支原体致病机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体病原体，特别是牛支原体 | 合成生物学， | 反刍动物传染病， | GP35重组酶介导的长单链DNA重组工程 | NA | DNA序列， | 涉及牛支原体突变体，具体样本数未提及 | GP35重组酶， | 牛支原体 | 基于GP35重组酶的精准基因编辑系统 | 畜牧业，兽药 |
| 75 | 2026-05-01 |
From modular engineering to practical applications: Advances in GPCR-based yeast biosensors
2026-Apr-24, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108909
PMID:42035967
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综述 | 系统剖析基于GPCR的酵母生物传感器的工程化进展及其模块化框架 | 通过模块化框架梳理传感、转导和输出三个核心模块的工程策略，并强调人工智能与合成生物学整合实现下一代生物传感器的预测性和可编程设计 | 未提及具体实验数据或定量性能比较，依赖已发表文献的综述性总结 | 综述GPCR酵母生物传感器的工程化进展及其在多种配体检测中的应用扩展 | GPCR、酵母信号网络、报告蛋白 | 合成生物学 | NA | GPCR工程、酵母信号通路改造 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 生物传感器（GPCR信号转导与报告基因输出） | 医学、农业、环境、工业生物技术 |
| 76 | 2026-05-01 |
Closing the loop: AI-driven integration of multi-omics and phenomics for systematic resilient crop engineering
2026-Apr-24, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108908
PMID:42035969
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综述 | 本文综合阐述了边缘到云的闭环框架，该框架统一了多组学、实时表型组学和合成生物学，并由人工智能驱动，以实现系统性抗逆作物工程 | 提出从被动预测转向主动设计的范式转变，利用生成式人工智能和基础模型加速设计-构建-测试-学习循环，并提出了弥合计算机模拟与田间实际差距的路线图 | 未具体说明局限性，可能涉及当前框架在田间部署的挑战、数据可获取性或计算资源限制 | 将作物改良转化为能够为未来气候培育抗逆品种的预测性工程学科 | 作物及其与基因型-环境-管理相互作用的复杂系统 | 机器学习 | NA | 多组学、实时表型组学、合成生物学、深度学习、生成式人工智能 | Transformer架构、图神经网络、多模态融合算法、生成式人工智能、基础模型 | 多组学数据、表型数据 | NA | 合成生物学工具 | NA | 抗逆蛋白和基因回路 | 农业 |
| 77 | 2026-05-01 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
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研究论文 | LinkCraft是一个用于设计多结构域蛋白质中柔性连接子的交互式计算工具 | 将连接子视为可调节的分子功能决定因素，支持基于理化性质的序列生成和系综建模评估 | 未明确讨论实验验证结果或与其他设计工具的性能比较 | 为多结构域蛋白质的柔性连接子提供理性设计工具 | 多结构域蛋白质中的固有结构无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 系综模型 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | 多结构域蛋白质连接子设计 | 合成生物学, 生物技术 |
| 78 | 2026-05-01 |
Plant Synthetic Biology Takes Off: Bryophytes Onboard with New Tools, Systems, and Opportunities
2026-Apr-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00092
PMID:41984537
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综述 | 本文综述了苔藓植物作为植物合成生物学新兴平台的最新进展，强调其简化系统和快速工具开发的优势 | 首次系统总结苔藓植物（苔类、藓类和角苔类）在合成生物学中的应用潜力，突破传统被子植物研究局限 | 苔藓植物作为模型系统的基因编辑效率和代谢通路复杂性仍需进一步优化 | 推广苔藓植物作为跨植物谱系通用生物工程平台，建立可迁移的合成生物学工具 | 苔藓植物（苔类、藓类、角苔类），重点以小立碗藓为例 | 合成生物学 | NA | 模块化克隆、基因回路设计、基因组编辑、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化克隆 | 苔藓植物（小立碗藓等） | 基因回路、生物传感器 | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 79 | 2026-05-01 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
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综述 | 整合PANoptosis的分子架构与临床转化，提出以细胞死亡架构为基础的药物发现框架 | 首次提出PANoptosis作为药物发现框架，集成细胞死亡架构与临床试验转化，并引入临床极性与时序模型指导PANoptosis的诱导或抑制 | PANoptosis的分子机制尚未完全阐明，临床转换中组织特异性调控和长期安全性数据仍有限 | 综述PANoptosis的分子架构、调节机制及药物干预策略，推动其在感染、炎症、癌症和神经退行性疾病中的临床转化 | PANoptosis通路及其相关蛋白（ZBP1、AIM2、NLRP3、Pyrin、ASC、RIPK1、FADD、caspase-1/8、RIPK3-MLKL、gasdermins）和临床疾病模型 | 机器学 | 癌症，感染性疾病，炎症性疾病，神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 80 | 2026-05-01 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-01-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
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研究论文 | 利用合成生物学重构DELTA-NOTCH信号通路，研究分节时钟中细胞间振荡通讯的动态机制 | 首次通过合成生物学方法重建DELTA-NOTCH通路，并结合光遗传学验证配体呈现动态对细胞通讯的关键作用 | 结果主要基于小鼠PSM类器官模型，需进一步在体内验证 | 验证DELTA-NOTCH信号在分节时钟中耦合细胞间振荡的作用 | 小鼠前体节中胚层类器官中的DELTA缺陷细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学构建、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成DELTA-NOTCH通路 | 小鼠 | DELTA-NOTCH信号振荡回路 | 发育生物学 |