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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-08-01 |
Discovery and engineering of polymerases and ligases for the synthesis of modified nucleic acids
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102697
PMID:42143538
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综述 | 本文综述了利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的最新进展,并提供了一个简化生物催化剂家族脚手架发现的网络应用。 | 重点关注计算工具加速核酸修饰酶的发现与工程化,并提供了一个公开的网络应用以辅助生物催化剂家族探索。 | 未提及明确局限性。 | 综述酶促寡核苷酸合成中工程化聚合酶和连接酶的最新方法,并推动该领域的工具化应用。 | 寡核苷酸、聚合酶、连接酶、非天然构建块 | 合成生物学 | NA | 酶促合成 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医疗、诊断、合成生物学 |
| 62 | 2026-08-01 |
Synthetic DNA circuits for programming cell functions
2026-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102701
PMID:42214130
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综述 | 本文综述了合成DNA电路在细胞功能编程中的最新进展,重点介绍了DNA逻辑网络与细胞环境的整合,以实现对细胞功能的逻辑门控控制。 | 强调从体外演示向体内功能实施的范式转变,并探讨了将DNA电路与内源通路接口的策略。 | 未明确提及具体局限性。 | 探讨利用合成DNA电路编程细胞功能的方法,以推动精准治疗和自主生物制造的发展。 | 合成DNA电路及其在细胞环境中的集成。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 链置换、逻辑门、放大器、神经形态架构 | 医学、工业生物技术 |
| 63 | 2026-08-01 |
Exploring halophilic microorganisms for novel antimicrobial discovery: molecular mechanisms and computational approaches
2026-Jul-31, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-026-01568-1
PMID:42533221
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综述 | 本文综述了嗜盐微生物作为新型抗菌物质来源的潜力,涵盖其生态适应性、抗菌机制及组学和计算学发现方法 | 将生态适应性、非经典抗菌机制和现代组学及计算学发现流程整合为统一的抗菌物质发现框架 | 大多数已报道的化合物仍停留在体外阶段,体内验证进展有限 | 探索嗜盐微生物作为新型抗菌物质来源,以应对抗生素耐药性危机 | 嗜盐微生物及其产生的生物活性代谢物 | 微生物学 | 多重耐药菌感染 | 多组学、计算学发现流程 | NA | 文本 | NA | 合成生物学、代谢工程 | 嗜盐微生物 | 沉默生物合成通路激活 | 医学、工业生物技术 |
| 64 | 2026-08-01 |
De Novo Autogenic Engineered Living Functional Materials
2026-Jul-31, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.74312
PMID:42536049
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研究论文 | 本文介绍了一个基于蛋白质挖掘、计算建模和合成生物学的通用平台,用于从头设计自主工程活体功能材料(ELMs),实现了从非模式细菌中生物合成CsgA样ELMs,并展示了增强的机械性能、UV-C防护和可编程功能 | 通过分析33,564个CsgA样同源物,结合AlphaFold2和分子动力学模拟,实现从头设计自主功能ELMs,并从非模式细菌中生物合成分子量增加至9倍、β-折叠重复单元扩展的CsgA样蛋白,同时实现了3D打印性和选择性结合纳米颗粒及抗体的可编程功能 | 未明确说明局限性,但可能包括对非模式细菌中ELM合成的效率和生产规模限制 | 开发一个通用平台,用于发现、设计和利用天然生物分子系统,以推进下一代自主工程活体材料 | 大肠杆菌curli机器和CsgA样同源蛋白 | 合成生物学 | NA | AlphaFold2, 分子动力学模拟, 合成生物学 | AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | 33,564个CsgA样同源物 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | curli分泌途径重编程 | 材料科学, 生物技术 |
| 65 | 2026-08-01 |
Converging quality by design, artificial intelligence, and biofoundry automation: A new paradigm for scalable circular biomanufacturing
2026-Jul-30, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.109001
PMID:42532294
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综述 | 本文评述了合成生物学中质量设计、人工智能和自动化生物铸造的融合,探讨了如何将设计-构建-测试-学习循环从研究工具转变为工业发展框架,并分析了扩大规模、监管和社会瓶颈,以推动循环生物制造。 | 强调质量设计、人工智能和生物铸造自动化的三者融合是当前领域发展的关键,而不仅仅是单一技术;并对比了欧盟和美国的监管框架对技术采用的影响。 | 未提及具体技术细节或数据,缺乏实证分析,可能受益于更具体的数据支持。 | 探讨合成生物学从实验室创新到工业规模循环生物制造的路径,并确定未来十年需满足的要求以支持循环生物经济。 | 合成生物学产品(包括微生物、植物和动物系统)和设计-构建-测试-学习循环。 | 合成生物学 | 不适用 | 人工智能辅助生物设计,生物铸造自动化 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 微生物、植物、动物系统 | 设计-构建-测试-学习循环 | 工业生物技术 |
| 66 | 2026-08-01 |
Small Regulatory RNAs in Prokaryotes: Key Features, Identification, Environmental Roles, and Applications
2026-Jul-16, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071561
PMID:42514066
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综述 | 该综述整合了海洋和环境原核生物中小调控RNA的计算预测、宏组学发现和合成生物学应用,提供了从识别到功能和工程应用的多层次视角 | 区别于以往侧重模式生物的综述,本文聚焦海洋和环境原核生物,整合了计算预测、宏组学发现和合成生物学应用,并批判性评估了sRNA识别工具,强调了减少假阳性预测的策略 | 未明确说明 | 全面综述原核生物sRNA生物学,强调其在环境适应和生物技术应用中的关键作用,并为菌株工程提供资源 | 海洋和环境原核生物中的小调控RNA(sRNA) | 生物信息学 | NA | 计算预测、宏基因组学、宏转录组学 | NA | 基因组序列、转录组数据 | 未明确说明 | 合成RNA工程 | 未明确说明 | 合成sRNA调控元件 | 工业生物技术、环境科学 |
| 67 | 2026-08-01 |
Global Research Trends on Polyhydroxyalkanoate-Producing Microorganisms: A Bibliometric and Scientometric Analysis of Sustainable Bioplastic Biotechnology
2026-Jul-15, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14071550
PMID:42514055
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研究论文 | 通过文献计量和科学计量方法,分析2014至2025年间全球关于聚羟基脂肪酸酯产生微生物及其在生物基包装中应用的研究趋势。 | 采用Scopus数据库结合Bibliometrix和VOSviewer工具,揭示研究主题从基础生理和分类学向代谢工程、合成生物学及量子建模等新兴方向的转变,并识别关键的技术空白。 | 研究存在下游加工挑战、混合微生物群落管理困难以及资金不足等限制,影响PHAs的商业可扩展性和可持续性。 | 评估全球PHA产生微生物研究的产出、合作网络及主题演变,并指出未来研究重点以克服经济和技术的瓶颈。 | 关于聚羟基脂肪酸酯产生微生物的研究文献及其在生物基包装中的应用。 | 机器学习 | 不适用 | 文献计量分析 | 不适用 | 文献数据 | 2014-2025年间发表的学术论文 | CRISPR-Cas9 | 不适用 | 不适用 | 环境, 材料 |
| 68 | 2026-08-01 |
The Genetic Transformation Mechanism and Application of Plant Hairy Roots
2026-Jul-13, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15142160
PMID:42514528
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研究论文 | 本文综述了植物毛状根遗传转化的分子机制、递送系统开发、诱导与再生平台构建及其在遗传育种和次生代谢物提取中的应用 | 强调毛状根系统相比传统农杆菌介导方法在单步产生转基因纯合子和广泛适应性方面的优势,并系统梳理其分子机制与平台构建 | 未明确提及具体限制 | 总结毛状根遗传转化机制及其在植物育种和合成生物学中的应用,以加速基因编辑和快速驯化等前沿技术的发展 | 植物毛状根 | 植物生物技术 | NA | 农杆菌介导转化 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 毛状根诱导与再生系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 69 | 2026-08-01 |
The Emergence of Life in the Light of Evolution
2026-Jul-12, ArXiv
PMID:42389247
|
研究论文 | 本文从进化视角探讨生命起源,认为生命起源不仅是化学问题,还需考虑进化机制,并整合地质化学、分子生物学等多学科证据,提出生命起源研究应扩展至前生物系统的进化过程 | 将种群遗传学视角引入生命起源研究,强调LUCA之前的深层进化历史,并提出通过理论、实验室实验和合成生物学验证的进化驱动假说 | 信息不足,无法明确说明本文的局限性 | 提出一个涵盖前代谢自催化网络、原始细胞、翻译和DNA基因组转变的进化研究议程,以约束生命起源场景 | 生命起源过程、最后一个普遍共同祖先(LUCA)、前生物系统(如原始细胞、自催化网络) | 进化生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | 文献综述与理论分析 | NA | 合成生物学(涉及合成细胞实验) | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 70 | 2026-08-01 |
The disorazole family of potent anticancer agents: structures, bioactivity, total synthesis, and heterologous biosynthesis
2026-Jul-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.07.028
PMID:42431458
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综述 | 本文对disorazole家族进行了全面系统的分析,涵盖其结构、生物活性、全合成方法以及异源生物合成途径 | 该综述提出了disorazole研究的范式转变,即从传统的全化学合成转向利用可编程的生物合成工程,并整合了异源表达、Red/ET重组工程和模块化聚酮合酶工程等关键技术 | 未明确提及局限性 | 旨在弥合复杂化学合成与现代生物合成工程之间的差距,提供对disorazole家族的全面系统分析,并展望未来整合生物合成可扩展性与化学合成精确性的临床转化策略 | disorazole家族天然产物及其相关生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 异源表达、Red/ET重组工程、聚酮合酶工程、全合成 | NA | 文本 | NA | Red/ET重组工程 | 粘细菌(Sorangium cellulosum) | NA | 医学 |
| 71 | 2026-07-31 |
Fast, Streamlined In Situ Genotyping of Bacterial Strains for Single-Cell and Subcellular Dynamics Profiling
2026-Jul-27, Chemical & biomedical imaging
DOI:10.1021/cbmi.5c00220
PMID:42529381
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研究论文 | 开发了一种快速、精简的原位基因分型方法,用于细菌菌株的单细胞和亚细胞动力学分析 | 通过表面修饰策略抑制微流控芯片中荧光探针的非特异性聚集,并结合条形码化拷贝数可调质粒,解耦活细胞成像与事后基因分型的冲突,实现了高通量、低扰动的细菌动态表型筛选 | 未明确提及,但从上下文推断可能涉及方法对特定细菌菌株的普适性或长期成像的稳定性挑战 | 克服现有技术在时间分辨率、单细胞信息与实验通量之间的权衡,实现大规模单细胞和亚细胞动力学表型筛选 | 细菌菌株(文库)中的单细胞动态表型及其对应基因型 | 机器学习和合成生物学 | NA | 活细胞延时成像、序贯荧光原位杂交、微流控芯片、基因分型 | NA | 显微图像 | NA | NA | 细菌 | 条形码化拷贝数可调质粒(用于基因分型标签) | 基础生物学, 合成生物学 |
| 72 | 2026-07-31 |
[Evaluation of the skin barrier repair function and anti-inflammatory activity of recombinant mussel mucin Mfp151]
2026-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250750
PMID:42522623
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研究论文 | 利用合成生物学技术高效生产重组贻贝粘蛋白Mfp151,并评估其抗炎和皮肤屏障修复功能 | 首次通过合成生物学方法高效获取重组贻贝粘蛋白Mfp151,并系统验证其在体外和体内的抗炎、抗氧化及皮肤修复活性 | 未提及重组蛋白的长期安全性评估及大规模生产工艺优化 | 评估重组贻贝粘蛋白Mfp151的皮肤屏障修复功能和抗炎活性 | 重组贻贝粘蛋白Mfp151 | 合成生物学 | 皮肤老化、炎症 | 合成生物学、CCK-8检测、qPCR、跨膜电阻测量、划痕实验、ELISA、自由基清除实验 | NA | 实验数据 | 体外模型:人永生化角质形成细胞(HaCaT)、人包皮成纤维细胞(HFF-1)、人单核细胞白血病细胞(THP-1);体内模型:斑马鱼晒伤模型 | NA | NA | NA | 医学、化妆品 |
| 73 | 2026-07-31 |
A risk-based framework to guide oversight of nucleic acid constructs
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1870125
PMID:42528926
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评论文章 | 提出一个基于风险的框架,以指导对核酸构建体的监督,旨在根据生物安全相关性对合成核酸产品进行分类 | 构建了一个三级分类框架,将定制与非定制产品区分,并根据长度和来源划分为高、中、低风险类别,为比例性筛查提供指导 | 未明确覆盖所有材料,如非定制仓库中的长病毒序列,需要进一步调查和政策发展 | 基于风险评估制定合成核酸产品的分类框架,优化生物安全监督 | 合成核酸产品,包括DNA和RNA序列、寡核苷酸及非DNA/RNA核酸 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 74 | 2026-07-31 |
Microbial remediation of recalcitrant pollutants in soil and geo-environmental engineering systems
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1904267
PMID:42529377
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综述 | 综述微生物修复土壤中难降解污染物的过程及其在地环境工程系统中的应用 | 综合讨论了难降解污染物类型、土壤微生物群落及关键微生物过程,并批判性地评估了地环境工程应用,如生物刺激、生物强化、根际修复、真菌修复、微生物诱导碳酸盐沉淀和渗透反应性生物屏障,同时指出了合成生物学、工程微生物菌群、纳米生物修复和人工智能等新兴创新 | 未明确提及综述的具体局限性 | 总结微生物修复难降解污染物的原理、过程及地环境工程应用,并展望未来研究方向 | 土壤中难降解污染物(如多环芳烃、石油烃、氯化化合物、农药、药物、全氟和多氟烷基物质及重金属)及微生物群落 | 机器学习和数字病理 | NA | 微生物降解、生物吸附、生物累积、生物转化、生物矿化、共代谢、生物膜介导过程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌、放线菌、微生物菌群 | 生物修复途径(如降解、转化、固定化、解毒) | 环境 |
| 75 | 2026-07-30 |
Learning from nature's plant engineers: Hijacking metabolism and development beyond genetics
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102905
PMID:42250525
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综述 | 本文探讨了除基因工程外,利用自然界中细菌、真菌和昆虫等生物劫持植物代谢和发育的机制,为合成生物学提供新思路 | 提出超越传统基因工程视角,从物种间相互作用中学习植物代谢重编程的新策略 | NA | 研究自然界生物劫持植物代谢的机制,扩展合成生物学的概念边界 | 植物代谢网络及其与细菌、真菌、昆虫的相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术, 材料 |
| 76 | 2026-07-30 |
Living sensors: Engineering plants to sense and report on their environments
2026-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102923
PMID:42391913
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综述 | 综述了利用合成生物学改造植物作为活体传感器,以感知和报告环境胁迫的研究进展 | 总结了三类主要策略:利用天然启动子系统、工程化蛋白基生物传感器以及构建植物-微生物跨界信号网络,并结合光学报告系统实现远程检测 | 未明确讨论现有传感器植物在田间部署中的稳定性、可扩展性及环境安全评估等具体限制 | 设计可部署于田间的工程植物传感器,用于实时环境监测和土地管理 | 工程改造的传感器植物(包括植感器或哨兵植物) | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 基因工程 | NA | 光学信号(荧光、生物发光、色素信号等) | NA | NA | 植物 | 感知-响应模块(包括天然启动子系统、蛋白基生物传感器、植物-微生物跨界信号网络) | 环境监测, 农业 |
| 77 | 2026-07-30 |
Next-Generation Food Enzymology: From Metagenomic Discovery to AI-Driven Biocatalyst Design
2026-Jul-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c04349
PMID:42461222
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评论 | 讨论宏基因组学和人工智能如何融合以推动下一代食品酶学的创新,实现从经验性酶发现到预测性生物催化剂设计的转变 | 将宏基因组学与AI驱动的蛋白质设计相结合,实现从传统经验性酶发现到预测性精准生物催化剂设计的范式转变 | NA | 探讨宏基因组学、人工智能和合成生物学在食品酶学中的应用,推动下一代食品加工中的定制化生物催化剂开发 | 食品加工中的酶和生物催化剂 | 机器学习 | NA | 宏基因组学, 蛋白质结构预测, 蛋白质设计 | NA | 基因组数据 | NA | 宏基因组学, 合成生物学 | NA | NA | 食品 |
| 78 | 2026-07-30 |
Silkworm synthetic biology: Toolkit development, chassis engineering, and biomanufacturing applications
2026-Jul-29, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70331
PMID:42522963
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综述 | 本文综述了家蚕合成生物学在底盘特征、工程工具包、代表性应用和未来前景方面的最新进展 | 系统总结了家蚕作为昆虫合成生物学底盘的潜力,涵盖了从工具开发到生物制造应用的完整流程,并提出了利用泛基因组学、多组学和人工智能辅助设计的未来方向 | 跨品系适应性有限、调控元件标准化不完整、整合与表达行为不确定性以及生物安全问题 | 介绍家蚕合成生物学的进展并讨论其在基础研究和生物技术中的应用前景 | 家蚕(Bombyx mori)及其丝腺 | 合成生物学 | NA | 稳定转基因、定点整合、可编程基因组编辑、时空基因调控、重组酶系统、基因沉默、启动子和增强子捕获 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, 重组酶系统 | 家蚕(Bombyx mori) | 组织特异性表达系统、诱导表达系统、重组酶系统、基因沉默系统 | 医学、农业、工业生物技术 |
| 79 | 2026-07-30 |
Adaptive Responses of Tropical Crops: A Multi-Scale Omics Integrated Perspective
2026-Jul-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.76735
PMID:42505031
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综述 | 本文从多组学整合视角综述了热带作物应对极端和多变环境的适应策略 | 提出通过多组学解析协同胁迫响应机制、利用野生种质和分子设计育种加速抗逆品种开发、基于生态位框架优化热带农林复合系统,以及将热带适应机制通过合成生物学和基因编辑应用于其他作物 | 未具体讨论各作物适应机制的细节数据支持及现有研究的技术局限性 | 探索热带作物适应性策略并为气候适应性可持续农业提供理论和实践方案 | 甘蔗、香蕉、木薯、橡胶、油棕等热带作物 | 数字病理学 | 不适用 | 多组学、分子设计育种、合成生物学、基因编辑 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | CRISPR-Cas9 | 热带作物(如甘蔗、香蕉、木薯等) | 不适用 | 农业 |
| 80 | 2026-07-30 |
Engineering therapeutic super-competitor cells for educative cancer treatment and ecological replacement
2026-Jul-27, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218765
PMID:42508749
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综述 | 提出治疗性超级竞争细胞(TSCs)作为一种可编程的、进化感知的肿瘤教育治疗框架,通过生态竞争而非直接杀伤来控制肿瘤 | 将主动杀伤转变为可控生态竞争,整合癌症生态学、发育细胞竞争和合成生物学,提供进化感知的肿瘤治疗新范式 | 该框架仍处于假设阶段,尚未建立临床平台,现有研究多为理论性,缺乏实验验证 | 探索基于生态竞争的治疗性超级竞争细胞用于肿瘤教育治疗和生态替代 | 治疗性超级竞争细胞(TSCs)及其在肿瘤微环境中的生态互动 | 合成生物学, 癌症生态学 | 肿瘤 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 生态竞争回路、代谢限制回路、免疫重塑回路 | 医学 |