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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-03-17 |
Recognition of Non-standard Base Pairs by Triplex-Forming Oligonucleotides Containing an Expanded Genetic Alphabet
2026-Feb-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8652009/v1
PMID:41756467
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研究论文 | 本文通过使用人工扩展遗传信息系统(AEGIS)的核碱基,扩展了三链体形成寡核苷酸(TFOs)对双链DNA的识别能力,实现了在中性pH下对标准、损伤或合成碱基对的高亲和力靶向 | 利用AEGIS核碱基系统性地评估了120种碱基三联体组合,识别出至少12种新的模块化三联体,可在中性pH下以纳摩尔亲和力靶向包含标准、损伤或合成碱基对的双链DNA | NA | 扩展三链体形成寡核苷酸的识别空间,以增强对双链DNA的序列特异性识别能力 | 三链体形成寡核苷酸(TFOs)及其与双链DNA的相互作用 | 合成生物学 | NA | 人工扩展遗传信息系统(AEGIS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 核酸纳米技术 |
| 62 | 2026-03-16 |
Engineered Bacteria as living detectors of tumor DNA: A new diagnostic frontier
2026-Apr-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2026.120914
PMID:41724454
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综述 | 本文综述了利用合成生物学技术设计基因工程细菌作为生物传感器,用于原位检测肿瘤DNA(特别是KRAS突变)的最新进展 | 将基因工程细菌作为活体检测器,结合CRISPR-Cas工具和水平基因转移,实现对肿瘤DNA的特异性识别和可视化报告输出 | 存在生物安全性、定植效率和检测灵敏度方面的限制 | 开发基于工程细菌的肿瘤DNA检测方法,以革新癌症诊断和管理 | 肿瘤生成的DNA,特别是驱动多种癌症的KRAS突变 | 合成生物学 | 结直肠癌和胃肠道癌症,以及其他实体肿瘤 | CRISPR-Cas工具、水平基因转移、同源重组 | NA | DNA序列 | NA | CRISPR-Cas | 多种细菌物种 | 独特的遗传电路、多重CRISPR系统、安全电路,用于提高特异性、灵敏度和生物安全性 | 医学 |
| 63 | 2026-03-16 |
Microbial consortia interactions and bioremediation of pesticides: A review on designing, mechanism and efficacy
2026-Apr, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2026.106993
PMID:41831863
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综述 | 本文对微生物联合体在农药污染土壤修复中的设计、作用机制和效能进行了系统性综述 | 首次系统性地综述了微生物联合体在农药生物修复中的应用,并探讨了合成生物学、机器学习和人工智能等新兴技术在该领域的潜力 | NA | 深入分析基于微生物联合体的农药污染土壤修复的现有知识,并探讨未来研究方向 | 农药污染的农业土壤 | 环境科学 | NA | 微生物联合体技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业 |
| 64 | 2026-03-16 |
Decoding Cdk1 control: from mitotic thresholds to meiotic specificity
2026-Mar-12, Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10577-026-09796-4
PMID:41817770
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综述 | 本文回顾了Cdk1在细胞周期控制中的定量与定性模型,并探讨了通过合成生物学和磷酸化蛋白质组学技术解码其调控逻辑的进展 | 整合了Shokat系统的Cdk1等位基因开发,结合化学遗传学和质谱技术,实现了对Cdk1活性的高时空分辨率控制与底物鉴定 | 研究主要基于芽殖酵母和裂殖酵母等单Cdk模型,可能无法完全反映多Cdk高等真核生物的复杂性 | 解析Cdk1在细胞周期调控中的定量与定性作用机制,并探讨其在有丝分裂和减数分裂中的特异性 | 真核细胞周期调控蛋白激酶Cdk1及其底物 | NA | NA | 化学遗传学、质谱分析、磷酸化蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 芽殖酵母、裂殖酵母 | NA | NA |
| 65 | 2026-03-16 |
Engineering chaperone/usher pathway pili for surface display: Structural constraints, design principles, and biotechnological potential
2026-Mar-10, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108865
PMID:41819295
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综述 | 本文综述了利用伴侣蛋白/分泌蛋白(CU)途径菌毛作为细菌表面展示平台的结构约束、设计原理及生物技术潜力 | 基于近年积累的原子级或近原子级分辨率结构信息,系统分析了CU菌毛展示的结构约束,重新诠释了先前的展示策略,提炼了通用的设计原则,并提出了实用的工程化方法 | NA | 评估并指导CU菌毛展示系统在合成生物学工具箱中的理性设计与应用 | 大肠杆菌、沙门氏菌和鼠疫耶尔森菌中结构特征明确的CU菌毛 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测、高分辨率结构解析 | NA | 结构数据 | NA | NA | 革兰氏阴性细菌(如大肠杆菌、沙门氏菌、鼠疫耶尔森菌) | 细菌表面展示平台 | 生物技术、合成生物学 |
| 66 | 2026-03-16 |
Sustainable bioenergy manufacturing in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101711
PMID:41517869
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综述 | 本文综述了如何通过合成生物学、基因组学、人工智能和化学等多学科融合,克服传统生物质转化的效率、成本和多功能性限制,以推动可持续生物能源制造,并以自发光植物为例进行了深入探讨 | 提出利用多学科融合(合成生物学、基因组学、AI、化学)革新生物能源生产,并重点介绍了基于真菌生物发光途径(FBP)的自发光植物这一前沿应用,其利用内源性代谢物咖啡酸实现可持续自主生物照明 | 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体技术细节,主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨如何通过多学科方法克服传统生物能源制造的局限性,推动可持续植物基能源生产的发展 | 生物能源制造过程、能源作物、生物精炼厂、自发光植物 | NA | NA | 基因组编辑、组学技术、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能用于基因组编辑,文中提及但未明确指定) | 植物(能源作物) | 真菌生物发光途径(FBP),利用内源性咖啡酸代谢物将光合作用能量转化为可见光发射的生物传感器/照明系统 | 能源, 环境 |
| 67 | 2026-03-16 |
Plant non-canonical peptides: From identification to mechanisms
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
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综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控多种生物过程中的功能机制,并系统总结了植物肽鉴定的历史发展与最新策略 | 系统总结了植物非经典肽的鉴定策略进展,并提出了整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学以挖掘植物肽在作物改良中潜力的新方向 | 肽的发现和功能注释仍然面临挑战,现有技术尚未完全解析植物肽组的复杂性 | 阐明植物肽(特别是非经典肽)的鉴定方法、生物合成机制及其在植物生长、发育和抗逆中的调控功能 | 植物肽,包括经典肽、非经典肽和非核糖体肽 | 植物分子生物学 | NA | 肽组学、质谱分析、高通量技术、功能基因组学 | NA | 基因组数据、质谱数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 68 | 2026-03-16 |
Editing and synthetic engineering of chloroplast genomes
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101783
PMID:41761616
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综述 | 本文综述了叶绿体基因组编辑与合成工程的最新进展,包括基因组最小化、高效编辑和代谢途径重设计 | 整合了叶绿体基因组最小化、精确编辑工具和代谢途径动态调控,为下一代叶绿体工程提供综合方法 | NA | 优化叶绿体功能,促进高价值化合物的从头生物合成和作物性状改良 | 植物和藻类的叶绿体 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、敲入、碱基替换、多重修饰 | NA | NA | NA | NA | 植物、藻类 | 代谢途径重设计 | 生物技术、农业 |
| 69 | 2026-03-16 |
Biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids and its evolution in plants
2026-Mar-09, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101786
PMID:41776991
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综述 | 本文系统综述了植物中苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径、关键酶及其进化机制,并展望了未来研究方向 | 整合了BIAs生物合成途径的系统知识,并提出了通过多组学数据与合成生物学结合来可持续生产高价值BIAs的新策略 | 仍存在途径空白、酶的多功能性以及调控网络尚未完全阐明等挑战 | 阐明苄基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径及其在植物中的进化机制 | 苄基异喹啉生物碱(BIAs)及其生物合成途径与关键酶 | NA | NA | 多组学数据整合、蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业 |
| 70 | 2026-03-16 |
Pelecyphora chihuahuensis (Britton & Rose) D. Aquino & Dan. Sánchez: A Review on Its Taxonomy, Ecology and Conservation of an Endemic Mexican Cactus Species with Biotechnological Perspectives
2026-Mar-03, Biology
DOI:10.3390/biology15050413
PMID:41823840
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综述 | 本文综述了墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis的分类学、生态学、保护现状及其生物技术应用前景 | 首次系统整合传统分类学与现代生物技术工具(如分子标记、NGS、CRISPR-Cas和合成生物学)来解决该特有仙人掌物种的保护问题 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且对CRISPR-Cas和合成生物学在仙人掌保护中的具体应用仍处于讨论阶段 | 通过整合生物技术、生态学和分类学知识,促进该特有仙人掌物种及其相关濒危仙人掌的可持续管理和保护 | 墨西哥特有仙人掌物种Pelecyphora chihuahuensis | NA | NA | 分子标记、下一代测序(NGS)、基于GIS的物种分布模型、组织培养、低温保存 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 环境, 农业 |
| 71 | 2026-03-16 |
Double-edged sword: Aspergillus flavus as a threat to food safety and a resource for biotechnology
2026-Feb-21, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108848
PMID:41730464
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综述 | 本文综述了黄曲霉作为食品安全威胁与生物技术资源双重角色的最新研究进展 | 将黄曲霉重新定义为具有双重用途的生物体,既关注其生物安全风险,又挖掘其作为可利用化学多样性资源的潜力 | NA | 系统梳理黄曲霉次级代谢产物的多样性、调控机制及其在生态、致病和生物技术中的应用 | 黄曲霉及其次级代谢产物 | NA | NA | 真菌基因组学、代谢组学、基因组挖掘、CRISPR技术、异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR, 合成生物学平台 | NA | NA | 医药, 农业 |
| 72 | 2026-03-16 |
Exploring the computing power of microbes that shapes the environment
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102700
PMID:41494508
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综述 | 本文探讨了微生物通过遗传和代谢机制处理信息并影响环境的计算能力,并回顾了合成生物学在构建遗传电路以模拟这种计算方面的进展 | 通过比较自然微生物计算与合成遗传电路的复杂性,提出理解微生物计算形式化方法以缩小两者间的差距 | 主要聚焦于细菌,可能未全面涵盖其他微生物群体的计算特性 | 探索微生物的计算能力及其对环境的影响,并研究如何通过合成生物学工具提升人工遗传电路的计算效能 | 自然微生物和合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 布尔门电路、组合输入处理电路、顺序逻辑、基于记忆的系统、模拟电路和细胞联合体中的分布式计算 | 环境, 工业生物技术 |
| 73 | 2026-03-15 |
Recoding multiple rare codons enables the simultaneous incorporation of up to five distinct noncanonical amino acids
2026-Mar-13, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-026-02084-y
PMID:41826677
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研究论文 | 本文提出了一种多类型稀有密码子重编码策略,实现了在哺乳动物细胞中高效、多位点同时引入多种非经典氨基酸 | 通过系统评估和重新利用稀有密码子,并结合工程化的正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对,首次实现了在哺乳动物细胞中单个蛋白内同时引入多达五种不同非经典氨基酸 | NA | 扩展遗传密码,实现哺乳动物细胞中多位点、多类型非经典氨基酸的高效同时引入 | 非经典氨基酸、哺乳动物细胞、蛋白质 | 合成生物学 | NA | 稀有密码子重编码、正交氨酰-tRNA合成酶/tRNA对工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 多类型非经典氨基酸同时引入的翻译系统 | 生物医学, 合成生物学 |
| 74 | 2026-03-15 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)的致癌机制,并探讨了下一代诊断工具和疗法的前景 | 整合新兴诊断生物标志物(如病毒microRNAs)与下一代治疗策略(包括基因编辑和合成生物学方法),强调精准医学在改善疾病检测、治疗特异性和患者预后方面的机遇 | 当前KS诊断主要依赖组织病理学和LANA免疫染色,这些方法在早期或不典型病变以及区分潜伏与裂解感染方面存在重要限制,且KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗,临床结果仍不理想 | 理解KSHV驱动的致癌机制,并为未来诊断和治疗创新提供关键方向 | 卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)及其相关的癌症,如卡波西肉瘤(KS)、原发性渗出性淋巴瘤(PEL)和多中心性Castleman病(MCD) | NA | 卡波西肉瘤 | 组织病理学、LANA染色、先进成像、分子生物标志物检测、CRISPR-Cas9、治疗性适配体 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 75 | 2026-03-14 |
Plant-derived bioactive compounds modulate the gut microbiota in Alzheimer's disease: Metabolite signaling, neuroimmune circuits, and systems-level regulation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157919
PMID:41678917
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综述 | 本文综述了植物来源的生物活性化合物如何通过调节肠道菌群及其代谢物,影响阿尔茨海默病的病理生理过程 | 提出了一个系统层面的框架,将植物干预与肠道菌群重塑和代谢物信号联系起来,并强调了肠道菌群作为植物源治疗活性的核心介质作用 | NA | 阐明植物来源的生物活性化合物如何通过微生物群依赖的代谢和神经免疫机制调节阿尔茨海默病的病理生理学 | 植物来源的生物活性化合物(如植物化学物质、多糖、复方草药)、肠道菌群及其代谢物 | NA | 阿尔茨海默病 | 文献综述、多组学整合分析 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 76 | 2026-03-14 |
Systems-level understanding of plant immune networks through single-cell and spatial omics
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102870
PMID:41719893
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综述 | 本文综述了通过单细胞和空间组学技术系统理解植物免疫网络的进展,包括受体激活、基因调控回路、蛋白质互作中心和染色质动态如何共同影响免疫结果 | 整合单细胞和空间组学揭示植物免疫异质性,识别了专门的“PRIMER”细胞和“旁观者”细胞,并探讨了系统与合成生物学方法在作物抗病工程中的应用 | NA | 系统理解植物免疫网络,以指导作物更持久和广谱的抗病性工程 | 植物免疫系统,包括PTI、ETI、SAR层,以及NLR受体、PRIMER细胞和旁观者细胞 | NA | NA | 单细胞组学、空间组学、结构分析、蛋白质组学、互作组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 77 | 2026-03-14 |
Super-enhancer-mediated transcriptional regulation of gene clusters in plants
2026-Apr, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2026.102871
PMID:41719895
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研究论文 | 本文探讨了植物基因组中超级增强子如何调控基因簇(特别是生物合成基因簇)的转录,以协调基因的共表达,从而影响特化代谢物的产生 | 揭示了超级增强子在植物生物合成基因簇共表达中的核心作用,并展示了通过CRISPR/Cas技术破坏超级增强子可以改变整个基因簇的表达 | NA | 研究超级增强子介导的基因簇转录调控机制,以促进合成生物学、代谢工程和作物改良 | 植物基因组中的基因簇,包括同源基因簇和生物合成基因簇,特别以拟南芥为例 | 合成生物学 | NA | T-DNA插入、CRISPR/Cas诱导删除、组织特异性染色质可及性数据集分析 | NA | 基因组数据、染色质可及性数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 78 | 2026-03-14 |
Chromosome-Level Genome Assembly of the Allotetraploid Gynostemma pentaphyllum Provides Novel Insights Into the Biosynthesis of Ginsenoside and Gypenoside LVI
2026-Mar-13, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70598
PMID:41821502
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研究论文 | 本研究通过组装绞股蓝染色体级别基因组,揭示了其皂苷类成分生物合成差异的机制,并鉴定了一个关键的双功能P450酶 | 首次组装了绞股蓝的染色体级别基因组,揭示了其异源四倍体起源,并鉴定了一个在绞股蓝和五加科植物中独立进化、具有双功能(C-12和C-2羟基化)的关键P450酶GpCYP88AB3 | NA | 阐明绞股蓝不同地理种群间达玛烷型人参皂苷和绞股蓝皂苷LVI积累差异的分子机制 | 绞股蓝(Gynostemma pentaphyllum),特别是来自遂宁(SN)和南宁(NN)的种群 | 基因组学与合成生物学 | NA | 染色体级别基因组组装、多组学分析(基因组、转录组、代谢组)、系统发育分析、染色体进化分析、体内外酶功能验证 | NA | 基因组序列数据、多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 79 | 2026-03-14 |
The disputed identity of Pseudomonas putida KT2440: when taxonomists rename your favorite microbe
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03390-25
PMID:41589905
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评论 | 本文讨论了假单胞菌KT2440菌株的分类学重命名问题,强调社区实践和历史连贯性应优先于不断变化的分类学正统 | 提出在微生物命名中,对于标志性菌株如KT2440,应基于社区共识和实际效用而非单纯系统发育分析来决定名称 | NA | 探讨微生物分类学重命名对科学社区和实践的负面影响,并倡导社区参与命名决策 | 假单胞菌KT2440菌株及其分类学身份 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 假单胞菌KT2440 | NA | 环境微生物学, 生物技术, 合成生物学 |
| 80 | 2026-03-14 |
Synthetic overlapping genes stabilize genetic systems
2026-Mar-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02725-25
PMID:41649272
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研究论文 | 本文提出了一种名为OAFI的新方法,用于创建合成重叠基因,以稳定基因系统并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 开发了OAFI(重叠、交替框架插入)方法,通过将编码在交替框架中的“内部”基因插入“外部”基因的灵活区域,创建合成重叠基因对 | 未明确说明该方法在不同宿主或复杂基因系统中的普适性,也未讨论长期进化稳定性 | 开发一种创建合成重叠基因的方法,以稳定工程基因并限制抗生素抗性基因的水平转移 | 基因报告因子、细菌毒素和抗生素抗性基因 | 合成生物学 | NA | OAFI(重叠、交替框架插入)方法 | NA | NA | NA | OAFI | 细菌(未指定具体种类) | 合成重叠基因对,其中内部基因(如毒素)编码在抗生素抗性基因的交替阅读框架中 | 工业生物技术, 环境 |