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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-06-19 |
Development, optimization, and application of an episomal plasmid system for Rhodotorula toruloides
2026-Jun-13, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.102489
PMID:42288134
|
研究论文 | 首次在圆红冬孢酵母中开发并优化了游离型质粒系统,并应用于基因表达、代谢工程和CRISPR基因组编辑 | 首次建立圆红冬孢酵母的游离型质粒系统,并开发Cre-loxP介导的体内再环化策略提高转化效率,以及实现无缝基因组编辑 | 未明确讨论系统中可能存在的长期稳定性和大规模应用的限制 | 开发一种功能性的游离型质粒系统以加速圆红冬孢酵母的代谢工程和合成生物学研究 | 圆红冬孢酵母(Rhodotorula toruloides) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR、Cre-loxP | Rhodotorula toruloides | 游离型质粒系统、CRISPR系统 | 工业生物技术 |
| 62 | 2026-06-19 |
Recent advances in microbial production of S-adenosyl-L-methionine and its high-value derivatives
2026-Jun-13, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108948
PMID:42288128
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综述 | 综述了微生物生产S-腺苷甲硫氨酸及其高价值衍生物的最新进展,重点介绍了系统代谢工程和合成生物学策略 | 系统总结了提高SAM生物合成、利用和循环的工程策略,并特别强调了SAM在阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸等衍生物合成中的作用 | 未明确说明具体局限性,但指出了当前依赖化学合成的问题以及未来可持续生产的挑战 | 推动SAM及SAM依赖性高价值化合物的高效可持续微生物生产 | 微生物生产S-腺苷甲硫氨酸及其高价值衍生物,包括阿魏酸、麦角硫因、肌酸、亚精胺和β-甲基苯丙氨酸 | 系统代谢工程与合成生物学 | NA | 系统代谢工程 | NA | NA | NA | 系统代谢工程、合成生物学 | 微生物 | NA | 生命科学、工业生物技术 |
| 63 | 2026-06-19 |
Bacteria as anticancer agents: bioactive metabolites, engineered platforms, and translational mechanisms
2026-Jun-12, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovag050
PMID:42240519
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综述 | 本文综述了细菌作为抗癌剂的潜力,包括其产生的生物活性代谢物、工程化平台及转化机制 | 系统总结了细菌来源的多种生物活性代谢物及其抗癌机制,并结合宏基因组学、基因组挖掘和合成生物学技术,突出了工程化细菌平台在肿瘤靶向治疗中的创新应用 | 尽管具有前景,但细菌衍生物在毒性、产量、选择性和临床转化方面仍存在挑战 | 探讨细菌衍生物在抗癌治疗中的现状与未来发展方向 | 细菌及其产生的生物活性代谢物和相关工程化平台 | NA | 癌症 | 宏基因组学, 基因组挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌(放线菌、芽孢杆菌、假单胞菌、海洋来源菌等) | 工程化细菌平台(选择性定植肿瘤、递送治疗分子、激活前药疗法) | 医学 |
| 64 | 2026-06-19 |
Nanofluidics for Pioneering Synthetic Biology of Bottom-Up Cell-Free Molecular Systems
2026-Jun-12, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00178
PMID:42284545
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观点评述 | 提出纳米流体学作为推动自下而上无细胞分子系统合成生物学发展的变革性平台 | 首次系统阐述纳米流体学如何利用纳米限域效应和精准质量传输,实现分子构建块的功能整合与时空结构主动组装 | 未涵盖纳米流体系统实际应用的实验验证及规模化生产的潜在挑战 | 探索纳米流体学在自下而上无细胞分子系统合成生物学中的核心作用与未来方向 | 自下而上构建的无细胞分子系统及纳米流体器件 | 合成生物学 | NA | 纳米流体学 | NA | NA | NA | NA | NA | 分子主动组装与时空结构 | 合成生物学 |
| 65 | 2026-06-10 |
Microbial Degradation of Plastics: Mechanisms, Pathways, and Multiomics Insights
2026-Jun-08, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.6c02515
PMID:42258349
|
综述 | 综述微生物降解塑料的机制、途径及多组学见解,提出解决塑料污染问题的框架 | 整合微生物分类学、酶学解聚与多组学功能分析,提出连接微生物特性与塑料降解四阶段的系统框架,并讨论生物强化策略与转化瓶颈 | 降解度量指标的变异性和可比性不足,实验室结果向实际应用的转化受限 | 弥合实验室发现与实用生物降解策略之间的差距,推动微生物塑料修复研究 | 塑料降解微生物及其降解机制 | 微生物学、环境科学 | NA | 多组学分析、酶工程、基因修饰 | NA | 综述数据 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程, 合成微生物群落设计 | NA | NA | 环境, 工业生物技术 |
| 66 | 2026-06-19 |
Engineered suppressor tRNAs enable precise translational control of genetic circuits in E. coli
2026-Jun-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag623
PMID:42312487
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研究论文 | 通过工程化携带标准氨基酸的抑制性tRNA,在大肠杆菌中实现遗传电路的精确翻译调控 | 首次系统筛选了20种抑制性tRNA变体,明确了tRNA反密码子与琥珀终止密码子相似性决定翻译通读效率的设计规律,并展示了其在生物传感器和代谢工程中的应用 | 未探讨在多种宿主或复杂环境中的普适性;长期稳定性及脱靶效应未被评估 | 开发用于遗传电路精确正交翻译调控的工程化抑制性tRNA工具 | 大肠杆菌中的抑制性tRNA及其对遗传电路的调控效果 | 合成生物学 | NA | 抑制性tRNA工程化、糖酵解通量动态平衡 | NA | NA | 20种tRNA变体;涉及LacI生物传感器和代谢工程菌株 | 抑制性tRNA | 大肠杆菌 | LacI生物传感器、代谢通路(pykA/pykF调控)用于N-乙酰神经氨酸增产 | 工业生物技术、医学 |
| 67 | 2026-06-19 |
Metabolic engineering strategies for neuroactive postbiotic production: Current progress and perspectives
2026-Jun-06, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2026.107571
PMID:42251865
|
综述 | 系统综述了代谢工程与合成生物学策略在神经活性后生元生产中的最新进展,并评估其产业化潜力 | 首次将技术就绪水平评估整合到神经活性后生元生产系统分析中,连接实验室创新与商业实施 | 未提供具体实验数据或定量比较,主要基于文献综述 | 促进神经活性后生元的工业化生产,应用于功能食品、营养保健品和神经治疗领域 | 神经活性后生元(GABA、短链脂肪酸、血清素、多巴胺、吲哚衍生物等)的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢通路优化、调控元件调谐、辅因子平衡 | 医学、食品、工业生物技术 |
| 68 | 2026-06-19 |
Untapped microbial factories for next-generation therapeutics: Endophytic fungi of medicinal plants
2026-Jun-04, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03036-4
PMID:42243878
|
综述 | 本文综述了药用植物内生真菌作为下一代治疗药物可持续来源的潜力 | 强调了多组学技术、合成生物学与生物技术工具在解锁内生真菌生物合成潜力中的整合应用 | 低产量、沉默基因簇及大规模生产困难仍是主要障碍 | 探索药用植物内生真菌作为下一代治疗药物生物工厂的潜力 | 药用植物内生真菌及其产生的次生代谢产物 | NA | NA | OSMAC, 共培养, 表观遗传修饰, 基因组学, 转录组学, 代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 药用植物 | NA | 医药 |
| 69 | 2026-06-19 |
Beyond Tanacetum cinerariifolium: Advances in Pyrethrins Biosynthesis and Prospects for Engineered Cell Factories
2026-Jun, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01549-8
PMID:41485148
|
综述 | 本文综述了除虫菊酯生物合成的最新进展,并探讨了利用合成生物学和代谢工程构建工程细胞工厂以实现其可持续生产的可能性 | 将除虫菊酯生产从传统花卉种植转向工程细胞工厂的新思路,总结了关键酶的发现与异源合成进展 | 异源合成仍面临代谢路径瓶颈和工程技术挑战,具体解决方略尚需进一步验证 | 探索除虫菊酯的异源生物合成途径,并利用工程细胞工厂实现规模化、可持续生产 | 除虫菊酯及其生物合成途径中的关键酶和代谢路径 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工程微生物、酵母 | 除虫菊酯生物合成途径 | 农业、环境 |
| 70 | 2026-06-19 |
A review on Mitragyna alkaloids pharmacology, biosynthesis and biotechnological insights
2026-Jun, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2026.100710
PMID:42309612
|
综述 | 综述九种帽柱木属植物的民族植物学、药理特性、植物化学组成及生物技术方法 | 更新了2022至2024年间九种帽柱木属植物的研究,并全面回顾了其植物生物技术方法及吲哚生物碱的代谢工程和合成生物学进展 | NA | 总结帽柱木属植物的药理特性、生物合成途径及生物技术应用,以促进可持续的药用化合物生产 | 九种帽柱木属植物(美丽帽柱木、多裂帽柱木、托叶帽柱木等)及其次生代谢产物如帽柱木碱、钩藤碱和异钩藤碱 | NA | 心血管疾病、神经系统疾病、消化系统疾病 | 植物生物技术(培养基操控、前体喂饲、植物生长调节、诱导),代谢工程,合成生物学 | NA | 文献综述数据 | NA | 代谢工程, 合成生物学 | 帽柱木属植物 | 吲哚生物碱生物合成途径 | 医药 |
| 71 | 2026-06-19 |
Machine learning-assisted single-cell Raman imaging for rapid, sensitive detection and intracellular mapping of carotenoids in plant cell cultures
2026-May-23, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-026-03858-x
PMID:42176120
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研究论文 | 将拉曼成像与多层感知器神经网络结合,用于烟草BY-2细胞中类胡萝卜素的无损、无标记分类和细胞内定位 | 首次结合拉曼成像与神经网络对植物细胞进行基于类胡萝卜素组成的无标记分类,实现活细胞水平的无损检测和代谢物分布成像 | 文中未明确提及局限性,但可能包括神经网络模型对特定拉曼峰特征的依赖以及通用性需要进一步验证 | 开发一种基于拉曼成像与机器学习结合的植物细胞分析平台,以无标记方式分类和定位类胡萝卜素 | 烟草BY-2细胞(野生型与转基因细胞系) | 机器学习 | NA | 拉曼成像, 表面增强拉曼散射(SERS), 高效液相色谱(HPLC) | 多层感知器神经网络 | 图像 | 涉及野生型和转基因烟草BY-2细胞系,具体样本数量未明确 | NA | 烟草(Nicotiana tabacum)BY-2细胞 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 72 | 2026-06-19 |
Hypergraph learning with multi-dimensional metabolite feature extractions and static-dynamic attention mechanisms to fill missing reactions in metabolic networks
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag314
PMID:42308419
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研究论文 | 提出一种基于超图学习的多维代谢物特征提取与静动态注意力机制方法,用于预测和填补代谢网络中的缺失反应 | 首次结合超图神经网络、多种预训练语言模型和静动态多头注意力机制,实现代谢网络中缺失反应的高精度预测 | 仅在计算层面验证,未在湿实验中对预测的缺失反应进行生物学验证 | 提高基因组规模代谢模型重建质量,自动填补知识空白中的缺失反应 | 108个BiGG数据库中的基因组规模代谢模型及24种细菌的表型数据 | 机器学习 | NA | 超图学习、预训练语言模型、多头注意力机制 | 超图神经网络、有向图神经网络 | 代谢物特征和反应数据 | 108个GEMs和24种细菌生物体 | NA | 细菌 | NA | 合成生物学、生物制造、生物医学 |
| 73 | 2026-06-19 |
Genetically engineered pig-to-human liver xenotransplantation
2026-Mar, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.044
PMID:41076089
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研究论文 | 本文报道了全球首例基因编辑猪肝向活体人类进行辅助异种移植并存活171天的病例 | 首次在活体人类中进行10基因编辑猪肝辅助异种移植,实现171天存活,并详细记录了异种移植相关血栓性微血管病的免疫学和组织病理学分析 | 患者最终因反复上消化道出血死亡,且移植后38天因xTMA移除辅助肝,长期成功率尚待改进 | 探索基因编辑猪肝作为人类肝移植桥接策略的可行性 | 接受10基因编辑猪肝辅助异种移植的右叶大肝细胞癌患者 | 合成生物学与临床移植 | 肝细胞癌,肝衰竭 | 基因编辑(10个靶向基因编辑) | NA | 临床监测数据 | 1例患者 | CRISPR-Cas9(基于10基因编辑平台) | 猪 | 基因敲除(异种抗原基因)和基因敲入(7个人类免疫和凝血相容性基因) | 医学 |
| 74 | 2026-06-19 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 基于2325个宏基因组样本,构建了反刍动物胃肠道微生物组参考基因组目录(CRMC),揭示了维生素合成微生物的路径选择和基因共选择模式 | 首次构建大规模反刍动物胃肠道维生素合成微生物参考基因组目录,发现不同反刍动物宿主间维生素合成微生物存在高度趋同的路径选择和基因共选择模式,且与人类肠道微生物组具有一致性 | 未提及因果关系验证和功能实验验证 | 系统解析反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征和生态分布模式 | 8种反刍动物宿主的2325个宏基因组样本 | 微生物组学 | NA | 宏基因组测序 | NA | 宏基因组测序数据 | 2325个宏基因组样本,来自8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物(8种宿主) | NA | 农业, 医学 |
| 75 | 2026-06-18 |
A programmable Aeromonas chassis, AMAX2, for advanced biomanufacturing
2026-Jun-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00231-26
PMID:42148730
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研究论文 | 开发下一代工程化气单胞菌底盘AMAX2,用于先进生物制造 | 通过删除毒力相关和非必需基因增强生物安全性,同时保持快速生长和蛋白质表达,并整合多种功能模块(如无DNA微细胞生成、表面展示、蛋白转运) | 可能存在的长期稳定性或大规模生产中的未知挑战 | 开发可编程的细菌底盘用于工业生物制造和生物治疗 | AMAX2底盘及其工程化功能模块 | 合成生物学 | NA | CRISPRi-seq, 基因工程 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 气单胞菌 | 可诱导系统、表面展示系统、VI型分泌系统、微细胞生成系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 76 | 2026-06-18 |
Hydrazinoacetic acid is a biosynthetic precursor of the bacterially produced nitramine, N-nitroglycine
2026-Jun-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00631-26
PMID:42159495
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研究论文 | 本研究揭示了细菌产生的硝胺类天然产物N-硝基甘氨酸的生物合成路径,鉴定肼基乙酸为关键前体 | 首次阐明N-硝基甘氨酸的生物合成途径,发现肼基乙酸作为前体,并确定其从赖氨酸衍生的硝基氮来源 | 仅通过同位素标记和体外重建验证,尚未在体内完整证实通路;硝胺生物合成中间体为推测性 | 解析细菌产生硝胺类化合物的生物合成机制,探索可持续生产含能硝胺的合成生物学途径 | N-硝基甘氨酸及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS, 稳定同位素标记, 生物信息学基因簇分析, 体外酶促重建 | NA | 质谱数据, 晶体结构数据 | NA | NA | NA | 硝胺生物合成途径(涉及肼基乙酸生成) | 能源, 工业生物技术 |
| 77 | 2026-06-18 |
Superfolder Green Fluorescent Protein (sfGFP): A Versatile Tool for Biotechnology Research
2026-Jun-17, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-026-05783-x
PMID:42307699
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综述 | 综述超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)作为生物技术研究通用工具的特性、优势及局限性 | 指出sfGFP的核心价值不在于亮度和光稳定性普遍优越,而在于能在传统GFP变体折叠或性能受损的条件下维持荧光 | 荧光对pH敏感、单体行为依赖背景、光稳定性未优化,需根据应用需求选择并与其他新型GFP比较 | 评估sfGFP在生物技术研究中的多功能应用潜力及其适用场景 | 超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP)及其在不同生物技术系统中的应用 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程, 荧光蛋白工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 蛋白质设计 |
| 78 | 2026-06-18 |
Modular Scalable Synthetic Gene Circuits for Complex Functions Within Minimal Computational Layers in Human Cells
2026-Jun-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74408-y
PMID:42303993
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研究论文 | 提出一种模块化设计框架,在人类细胞中以较少的计算层实现复杂功能的基因电路 | 通过集成正交转剪接AND门、天然-合成杂合启动子和合成microRNA,在最小化计算层的同时实现复杂逻辑功能,克服了传统级联架构的可扩展性障碍 | 可能仍存在负载效应和长期稳定性问题,且适用范围可能受限于特定细胞类型 | 开发可扩展的合成基因电路设计框架,用于人类细胞中的复杂遗传编程 | 人类细胞中的合成基因电路 | 合成生物学 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 正交转剪接、天然-合成杂合启动子、合成microRNA | 人类细胞 | 三输入组合逻辑门、半加器、全加器、动态3对1多路复用器(含专用选择器过载状态输出) | 生物医学, 生物技术, 基础生物学 |
| 79 | 2026-06-18 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
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研究论文 | 报告从超过16 000个组合DNA环成功组装真正的奥运凝胶,并表征其遗传、机械和结构特性 | 首次从大规模组合DNA环库成功组装具有独特力学和溶胀特性的奥运凝胶,结合聚合物物理、合成生物学和DNA纳米技术创建新型材料平台 | 未明确提及,但可能涉及奥运凝胶的实际应用规模化挑战 | 实现从DNA环组装真正的奥运凝胶并研究其网络拓扑对宏观材料性质的影响 | 超过16 000个不同序列的DNA环 | 合成生物学 | NA | 下一代测序, 振荡流变学, 原子力显微镜, 冷冻电子显微镜, 大规模计算模拟 | NA | 序列数据, 图像, 机械特性数据 | 超过16 000个独特DNA环分子 | 酶促活化, 分子内环化 | NA | DNA环库, 网络拓扑设计 | 生物材料, 仿生系统, 软物质物理 |
| 80 | 2026-06-18 |
Butyrate-Producing Bacteria in Intestinal Disease Therapy: Potential and Challenges
2026-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70260
PMID:42307077
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综述 | 综述丁酸盐产生菌在肠道疾病治疗中的潜力与挑战 | 整合机制理解与转化实践,评估新兴策略如精准益生元、噬菌体介导的生态位工程和AI个性化治疗 | 转化治疗面临瓶颈:丁酸盐产生菌对氧气高度敏感,交叉喂养网络需要生态学方法而非单菌株策略,宿主环境决定丁酸盐的保护或促进作用 | 总结丁酸盐产生菌在肠道健康中的作用机制,评估其在肠道疾病治疗中的转化现状和未来方向 | 丁酸盐产生菌(包括Faecalibacterium prausnitzii、Roseburia spp.、Eubacterium rectale等厌氧厚壁菌门细菌)及其在炎症性肠病、结直肠癌、放射损伤、感染和移植物抗宿主病中的作用 | NA | 炎症性肠病, 结直肠癌, 放射损伤, 感染, 移植物抗宿主病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 人类肠道微生物群 | 丁酸盐产生菌的代谢通路与交叉喂养网络 | 医学 |