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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-01-27 |
Marine-derived antimicrobial peptides (AMPs): Blue biotechnological assets for sustainable healthcare and circular bioeconomy
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2025.08.002
PMID:41581932
|
综述 | 本文综述了海洋来源抗菌肽作为可持续替代品在应对全球抗菌素耐药性危机中的潜力,涵盖其发现、优化、生产及应用 | 强调海洋来源抗菌肽在结构功能上的独特优势,并整合基因组学、机器学习与合成生物学技术进行创新发现与优化,推动蓝色生物经济发展 | 面临生产可扩展性和监管框架等关键挑战 | 探讨海洋来源抗菌肽作为可持续医疗和循环生物经济资产的应用前景 | 海洋来源抗菌肽,来源于无脊椎动物、极端微生物和蓝细菌等海洋生物 | NA | NA | 基因组学、宏基因组学工具、机器学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健、水产养殖、食品安全、环境修复 |
| 62 | 2026-01-27 |
New frontiers and applications of cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.10.002
PMID:41581983
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综述 | 本章节概述了无细胞系统(CFS)作为合成生物学关键平台的基本原理及其在蛋白质合成、生物传感、药物发现和代谢工程等领域的广泛应用 | 强调了无细胞系统在消除细胞膜分子运输障碍方面的独特设计,以及其在生物技术、生物医学和环境可持续性领域提供快速、适应性强且经济高效解决方案的最新进展 | NA | 探讨无细胞系统在合成生物学中的应用及其对生物技术和工业领域的转型作用 | 无细胞系统,包括来自原核和真核生物的细胞提取物 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统技术 | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | NA | 生物技术, 生物医学, 环境可持续性 |
| 63 | 2026-01-27 |
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.003
PMID:41581985
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综述 | 本章深入探讨了无细胞系统在生物传感器开发中的设计、功能与应用 | 强调了无细胞生物传感器在即时检测和资源匮乏环境中的独特价值,并展望了其与物联网、分布式制造等智能技术的融合前景 | 讨论了当前无细胞生物传感器在储存寿命、灵敏度和可扩展性方面的限制 | 综述无细胞系统在生物传感器开发中的应用潜力与技术进展 | 无细胞系统及其构建的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 体外转录与翻译 | NA | NA | NA | NA | NA | 遗传电路(包括信号输出策略) | 医疗保健, 环境科学, 农业, 食品质量保障 |
| 64 | 2026-01-27 |
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.008
PMID:41581984
|
综述 | 本章探讨了无细胞系统与自动化和机器人技术的融合,及其在生物技术和生物工程领域的应用 | 将无细胞系统的可编程性与自动化和机器人技术的精确性和可扩展性相结合,以加速发现和创新生物材料的开发 | 标准化、创建更稳健且经济的无细胞提取物,以及整合人工智能和机器学习以优化实验设计和过程 | 研究无细胞系统在自动化和机器人技术中的应用,以推动生物技术和生物工程的发展 | 无细胞蛋白质合成(CFPS)和其他可编程的无细胞生物机制 | 生物工程 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、微流体设备、液体处理机器人、集成分析平台 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学电路的快速原型设计 | 生物技术、生物工程、高通量筛选、按需生物制造、即时诊断 |
| 65 | 2026-01-27 |
High-throughput screening of biomolecules using cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.11.001
PMID:41581987
|
综述 | 本文探讨了基于无细胞系统的高通量筛选在生物分子鉴定与评估中的原理、平台及应用 | 系统阐述了无细胞系统作为传统活细胞筛选的替代方案,克服了细胞毒性、代谢干扰等限制,并整合了微流控、自动化与机器学习等前沿技术 | 存在试剂成本较高、翻译后修饰功能有限等挑战 | 推动合成生物学、药物发现、诊断和蛋白质工程领域的下一代生物分子筛选与治疗开发 | 生物分子(化合物、核酸、蛋白质) | 合成生物学 | NA | 高通量筛选、无细胞转录翻译系统、微流控、数字PCR、质谱分析 | NA | 荧光、发光、质谱等生化输出数据 | NA | NA | 大肠杆菌、小麦胚芽、兔网织红细胞 | NA | 医药、诊断、工业生物技术 |
| 66 | 2026-01-27 |
Cell-free systems for low-cost diagnostics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.005
PMID:41581986
|
综述 | 本章节全面概述了无细胞系统作为低成本诊断平台的基本原理、设计方法、技术突破及其在即时诊断中的应用 | 系统性地整合了无细胞诊断平台的生化基础、合成生物学工具(如基因电路、CRISPR-Cas、RNA适配体)以及新兴技术(纸基检测、微流控/可穿戴生物传感器),并探讨了AI辅助系统设计等前沿趋势 | 作为综述章节,未提供原始实验数据,且重点讨论技术原理与应用前景,对具体实施细节和商业化路径的覆盖可能有限 | 总结无细胞系统在低成本诊断领域的发展现状、技术原理与应用潜力,旨在推动该技术在医疗资源匮乏地区的普及 | 无细胞诊断系统(包括大肠杆菌裂解液、小麦胚芽提取物、PURE系统等平台)及其在即时诊断中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统、CRISPR-Cas工具、RNA适配体技术、纸基检测、微流控生物传感、可穿戴生物传感 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 基因电路 | 大肠杆菌, 小麦胚芽 | 用于提高诊断灵敏度与特异性的基因电路 | 医学 |
| 67 | 2026-01-27 |
Protocol for preparation of cell-free system
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.002
PMID:41581988
|
研究论文 | 本文提供了无细胞蛋白质合成(CFPS)系统的完整制备协议,包括高活性细胞提取物的制备、蛋白质表达反应系统的优化以及蛋白质表达与功能的评估方法 | 详细介绍了宿主菌株选择、机械裂解、提取物澄清以及能量与离子平衡优化的逐步协议,并探讨了将机器学习与冻干格式CFPS结合的未来集成流程 | 协议可能面临mRNA降解、蛋白质错误折叠和污染等常见瓶颈,导致产量损失 | 开发高效的无细胞蛋白质合成系统,用于快速、模块化的蛋白质生产 | 无细胞蛋白质合成系统的制备与优化 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、SDS-PAGE、Western印迹分析、荧光检测 | NA | 实验协议 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、诊断领域、按需生物制造、食品、医疗保健、工业 |
| 68 | 2026-01-27 |
Development of cell-free transcription translation
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.003
PMID:41581991
|
综述 | 本文综述了无细胞转录翻译系统的发展历程、优势、应用及面临的挑战与未来方向 | 系统总结了无细胞转录翻译系统从E. coli提取物到多物种提取物的演变,并强调了其在合成蛋白质方面的快速、高效和化学耐受性优势 | 高成本、蛋白质产量有限、缺乏复杂翻译后修饰以及提取物不稳定性 | 探讨无细胞转录翻译系统在分子生物学、合成生物学和生物技术中的应用潜力与改进方向 | 无细胞转录翻译系统及其在蛋白质合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | NA | E. coli, 细菌, 酵母, 真核生物 | NA | 生物技术, 生物制药 |
| 69 | 2026-01-27 |
Artificial intelligence for cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.009
PMID:41581993
|
综述 | 本章探讨了人工智能与无细胞系统的整合,重点关注其在合成生物学中的最新进展、工业应用及未来方向 | 利用人工智能(包括机器学习、深度学习和生成模型)优化无细胞系统,实现了抗菌肽的发现和蛋白质产量的显著提升 | 面临数据需求、模型可转移性和可扩展性等挑战 | 优化无细胞系统以加速生物过程测试和反应条件控制 | 无细胞系统中的蛋白质合成、代谢和反应条件 | 合成生物学 | NA | 细胞游离蛋白质合成 | 机器学习、深度学习、生成模型、贝叶斯优化、神经网络 | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 生物制造、制药、诊断 |
| 70 | 2026-01-27 |
Cell free systems for biodesign
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.010
PMID:41581989
|
综述 | 本文综述了无细胞系统在合成生物学中的发展、优势、应用及挑战 | 阐述了无细胞系统如何通过消除细胞膜限制,实现对生化条件的空前控制,并加速设计-构建-测试周期,代表了向去中心化、可编程生物技术的范式转变 | 面临试剂成本高、批次间差异和规模化等挑战 | 探讨无细胞系统作为合成生物学变革性工具的原理、进展与应用前景 | 无细胞系统及其相关技术与平台 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统,PURE系统,冻干技术,可编程生物合成平台 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | NA | 遗传电路,代谢途径,生物传感器 | 医学,环境,工业生物技术 |
| 71 | 2026-01-26 |
Multi-gene Co-expression systems in E. coli: From single-vector designs to programmable expression platforms
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.008
PMID:41574264
|
综述 | 本文综述了在大肠杆菌中实现多基因共表达的系统设计策略,从单载体构建到可编程表达平台的发展历程 | 系统性地比较了多种多基因共表达策略的机制原理、设计权衡与调控瓶颈,并探讨了整合模块化架构、表达建模与AI辅助设计的新兴可编程工具包 | NA | 为在大肠杆菌及其他微生物底盘中进行多基因系统工程的科研人员提供全面的策略路线图 | 大肠杆菌中的多基因共表达系统 | 合成生物学 | NA | 内部核糖体进入位点(IRES)、2A自切割肽、双启动子盒、多顺反子操纵子、多质粒配置 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 多基因共表达系统,包括逻辑门、生物传感器、代谢途径等 | 工业生物技术 |
| 72 | 2026-01-26 |
Phage therapy in cancer treatment: Mechanisms, emerging innovations, and translational progress
2026-Feb, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105085
PMID:41397585
|
综述 | 本文综述了噬菌体疗法在癌症治疗中的机制、新兴创新及转化进展 | 将噬菌体从传统的抗菌剂重新定位为可编程的生物系统,整合了微生物组调控、免疫激活和纳米载体介导的基因递送,并融合了AI、CRISPR和合成生物学技术 | 仍面临免疫清除、细菌耐药性和监管复杂性等挑战 | 探讨噬菌体疗法在癌症治疗中的应用潜力与转化前景 | 噬菌体及其工程化构建体在肿瘤治疗中的作用 | NA | 口腔鳞状细胞癌、结直肠癌、黑色素瘤、肝细胞癌 | CRISPR-Cas、AI驱动选择流程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 73 | 2026-01-26 |
Integrated omics analysis of the cellulose co-degradation network of Chaetomium thermophilum
2026-Jan-24, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02741-x
PMID:41580774
|
研究论文 | 本研究通过整合组学分析揭示了嗜热毛壳菌纤维素共降解网络的协同机制 | 首次在嗜热真菌中系统揭示了从转录调控到酶分泌适应的多级协同降解机制,并发现CtClr-2作为核心转录因子驱动关键基因共表达 | 研究聚焦于单一嗜热真菌物种,其机制在其他工业相关真菌中的普适性仍需验证 | 解析嗜热真菌高效降解纤维素的系统机制,为生物燃料工业化提供理论依据 | 嗜热毛壳菌(Chaetomium thermophilum)的纤维素降解网络 | 合成生物学 | NA | 整合组学分析(omics analysis) | NA | 转录组与蛋白质组数据 | NA | 合成生物学(synthetic biology) | 嗜热毛壳菌 | 纤维素降解网络(包含LPMOs、CDH、CBH等酶的协同作用) | 能源 |
| 74 | 2026-01-26 |
Plant non-canonical peptides: from identification to mechanisms
2026-Jan-23, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101739
PMID:41580897
|
综述 | 本文全面概述了植物肽的分类、生物合成及其在调控植物生长、发育、免疫和环境适应中的功能机制 | 系统总结了植物肽鉴定的历史发展和最新策略,并提出了整合高通量技术、功能基因组学和合成生物学以揭示植物肽在作物改良和跨学科创新中的潜力 | 肽的发现和功能注释仍然具有挑战性 | 探讨植物肽在作物改良和跨学科创新中的应用潜力 | 植物肽,包括典型肽、非典型肽和非核糖体肽 | NA | NA | 肽组基因组学、质谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 75 | 2026-01-26 |
Membrane and Proteome Allocation Constraints in Escherichia coli Models during Overflow Metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
|
研究论文 | 本研究开发了一个考虑膜蛋白分配约束的基因组尺度代谢模型MAFBA,以揭示大肠杆菌在快速生长时发生溢出代谢的机制 | 提出了首个可扩展的、引入膜蛋白总质量可调约束的基因组尺度代谢模型MAFBA,揭示了膜资源分配与整体蛋白质组限制共同作用驱动溢出代谢的机制 | 模型基于大肠杆菌构建,其普适性在其他微生物中仍需验证;约束参数可能依赖于特定生长条件 | 探究膜蛋白分配约束如何影响大肠杆菌的代谢策略,特别是溢出代谢的发生机制 | 大肠杆菌的代谢网络与膜蛋白分配 | 合成生物学 | NA | 通量平衡分析 | 基因组尺度代谢模型 | 代谢网络数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 76 | 2026-01-26 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-Jan-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
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研究论文 | 本文报道了一种中性双组分系统,首次在生理pH下实现了cAMP和AMP跨脂质体膜的促进运输 | 首次展示了使用中性双组分系统促进cAMP和AMP跨膜运输,通过合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物配对提高运输效率 | NA | 研究核苷酸跨膜运输机制,探索小分子系统在药物递送和合成生物学中的应用潜力 | cAMP和AMP核苷酸 | 合成生物学 | NA | 脂质体荧光实验、P NMR实验 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 合成生物学 |
| 77 | 2026-01-26 |
Engineering bacteriophages for gut health: precision antimicrobials and beyond
2026-Jan-22, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04038-5
PMID:41566387
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道健康中的应用,涵盖合成生物学和纳米技术进展,并探讨其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的治疗潜力 | 利用合成生物学和纳米技术重新设计噬菌体,增强其特异性、功能性和稳定性,作为微生物群中心疗法的多功能工具 | 面临长期稳定性、耐药性发展和规模化生产等挑战 | 探讨工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道疾病治疗中的应用,以应对微生物失调、抗生素耐药性和宿主-微生物相互作用破坏 | 工程化噬菌体及其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病、结直肠癌、感染性肠炎 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 78 | 2026-01-26 |
HMRPred: A Machine Learning-Based Web Resource for Identification of Heavy Metal Resistance Proteins
2026-Jan-22, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169659
PMID:41580067
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研究论文 | 开发了一个基于机器学习的网络资源HMRPred,用于识别重金属抗性蛋白 | 首个针对多种重金属(砷、镉、铬等10种)和生物域的系统性重金属抗性蛋白分类资源,填补了现有机器学习方法主要关注抗生素抗性基因的空白 | 未明确说明模型在跨物种泛化能力方面的具体限制 | 开发一个可靠的预测框架,用于识别重金属抗性蛋白,支持环境修复和合成生物学应用 | 重金属抗性蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 多种机器学习算法 | 蛋白质序列 | 经过实验验证的抗性和非抗性蛋白质数据集 | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 79 | 2026-01-26 |
YhfH functions as a tri-function RNA in Bacillus thuringiensis BMB171
2026-Jan-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1528
PMID:41562254
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研究论文 | 本研究揭示了枯草芽孢杆菌BMB171菌株中的YhfH RNA具有三重功能:作为小RNA调控嘧啶生物合成、作为反义RNA调控LipR表达、以及作为mRNA编码抑制自身转录的肽YhfH-P | 首次发现单个RNA分子(YhfH)同时具备小RNA、反义RNA和mRNA三重调控功能,并阐明其通过编码肽YhfH-P实现自我反馈抑制的新机制 | 研究局限于枯草芽孢杆菌BMB171菌株,尚未在其他细菌中验证YhfH功能的保守性;YhfH-P抑制ilv-leu操纵子的具体结构机制有待进一步解析 | 探究枯草芽孢杆菌中YhfH RNA的多重调控功能及其分子机制 | 枯草芽孢杆菌BMB171菌株的YhfH RNA及其编码肽YhfH-P | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 枯草芽孢杆菌 | 三重功能RNA调控网络(包含自我抑制反馈环路、代谢途径交叉调控) | 合成生物学 |
| 80 | 2026-01-26 |
A new frontier in synthetic biology: leveraging phase separation for robust gene circuits
2026-Jan-12, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.01.020
PMID:41580366
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |