本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-05-26 |
Arboviral Diseases in a Changing World: Evolutionary Dynamics, Host-Vector Interactions, and Novel Control Strategies
2026-Feb, Vector borne and zoonotic diseases (Larchmont, N.Y.)
DOI:10.1177/15303667251376450
PMID:40955762
|
综述 | 系统综述虫媒病毒在气候变化背景下的进化动态、宿主-媒介互作及新型防控策略 | 整合基因组分析、元流行病学综合与预测建模的多学科框架,系统阐述CRISPR基因驱动、沃尔巴克氏体干预及mRNA疫苗等新型防控策略 | 伦理、生态和监管问题(如基因编辑和微生物干预)需进一步考量 | 理解虫媒病毒进化机制、宿主-媒介互作及新型控制策略以有效缓解疾病 | 登革病毒、寨卡病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒等虫媒病毒及其媒介(蚊、蜱) | NA | 虫媒病毒病 | 基因组分析、元流行病学综合、预测建模 | NA | 文献数据 | 从16320篇初始文献中筛选出12项高质量同行评审研究 | CRISPR基因驱动 | 蚊、蜱 | 基因驱动回路、基于RNAi的抗病毒回路 | 医学 |
| 802 | 2026-05-26 |
Next-Generation Probiotics: From Traditional Strains to Personalized Therapeutics
2026-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70339
PMID:41327880
|
review | 本文综述了从传统益生菌到下一代益生菌的演变,重点比较了机制差异和功能进步,并探讨了合成生物学、人工智能和微生物组分析在个性化益生菌治疗中的潜力 | 系统对比传统益生菌与下一代益生菌在机制上的区别,引入合成生物学可编程基因电路和人工智能驱动的个性化治疗策略 | 广泛临床应用仍处于早期阶段,面临安全性、监管和转化方面的挑战 | 比较传统与下一代益生菌,探讨个性化治疗的前沿进展 | 传统益生菌(如乳杆菌属、双歧杆菌属)与下一代益生菌(如阿克曼氏菌、普拉梭菌) | NA | 代谢性疾病、炎症性疾病、神经系统疾病 | 合成生物学、微生物组分析 | NA | NA | NA | 可编程基因电路 | 人体肠道微生物 | 可编程基因电路 | 医学、营养学 |
| 803 | 2026-05-26 |
Gut-engineered Bacillus subtilis-mediated BAMBI delivery for the treatment of thioacetamide-induced liver fibrosis through mechanotransduction inhibition
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1817519
PMID:42183058
|
研究论文 | 利用肠道工程化枯草芽孢杆菌递送BAMBI蛋白治疗硫代乙酰胺诱导的肝纤维化 | 首次采用遗传工程枯草芽孢杆菌通过肠-肝轴持续递送BAMBI蛋白,同时抑制生化信号和机械传导,创新性地将合成生物学与机械生物学相结合治疗肝纤维化 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体中验证;需评估长期口服活菌的安全性和潜在副作用 | 开发一种基于工程微生物的肝纤维化治疗方法,通过抑制机械传导来逆转肝纤维化 | 经硫代乙酰胺诱导肝纤维化的小鼠模型 | 合成生物学 | 肝纤维化 | 遗传工程、口服给药、组织分析、血清标志物检测 | NA | 实验数据(组织学评分、血清生化指标、蛋白表达数据) | 小鼠模型,具体数量未在摘要中说明 | NA | 枯草芽孢杆菌 | 构建持续分泌BAMBI蛋白的基因电路 | 医学 |
| 804 | 2026-05-25 |
Tunable low-rate genomic recombination with Cre-lox in Escherichia coli: a versatile tool for anoxic environmental biosensing and synthetic biology
2026-04-22, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01768-25
PMID:41870091
|
研究论文 | 开发了一种在大肠杆菌中利用Cre-lox系统实现可调低速率基因组重组的方法,应用于厌氧环境生物传感和合成生物学 | 开发了严格调控、可滴定的Cre重组酶系统,实现了低重组率和最小基础活性,并展示了其在厌氧砷检测中的实用性 | 论文未明确说明系统的长期稳定性和潜在脱靶效应 | 开发可用于环境生物传感和合成生物学的可调低速率基因组重组工具 | 大肠杆菌及基于重组的砷生物传感器 | 合成生物学 | NA | Cre-lox位点特异性重组 | NA | NA | 未明确样本数量 | Cre-lox系统 | 大肠杆菌 | 基于Cre-lox的砷响应生物传感器电路 | 环境监测, 合成生物学 |
| 805 | 2026-05-25 |
Amalgamation of Biofilms and Synthetic Biology: A Paradigm Shift in Biotechnology
2026-Feb-17, Medical principles and practice : international journal of the Kuwait University, Health Science Centre
IF:2.9Q1
DOI:10.1159/000550994
PMID:41701651
|
综述 | 本文综述了生物膜工程与合成生物学交叉领域的最新进展,重点介绍了调控生物膜行为以用于生物技术应用和解决相关挑战的策略 | 整合了噬菌体疗法、电遗传系统、微生物联合体设计、群体感应调控、遗传电路、胞外聚合物修饰和抗菌肽涂层表面等多种策略,实现了对生物膜结构、组成和代谢输出的精确调控 | 存在生物安全性、异质性、可扩展性和监管合规性等挑战 | 探讨合成生物学工具在生物膜工程中的应用,以优化生物膜在废水处理、生物修复、生物能源和诊断等领域的性能,并控制致病性生物膜 | 生物膜及其工程化系统 | 机器学习 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 遗传电路 | 环境, 能源, 医学 |
| 806 | 2026-05-25 |
Predicting lasso peptide structure with LassoPred
2026, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2026.01.037
PMID:42177065
|
研究论文 | 提出LassoPred,一个基于机器学习的模块化计算流程,用于从序列预测套索肽的三维结构 | LassoPred通过整合ESM2嵌入训练的支持向量机分类器注释关键拓扑特征(异肽环和塞子残基),并采用拓扑感知的结构构建器组装和优化原子模型,实现了近实验精度,同时将预测时间缩短至分钟级,并将已知套索肽结构覆盖率从不足50个扩展至超过4000个基因组挖掘模型 | 输入标题与摘要中未明确提及局限性 | 从序列准确预测套索肽的三维结构,桥接序列发现与结构洞察的差距 | 套索肽(LaPs) | 机器学习 | NA | 机器学习、同源建模、能量最小化 | 支持向量机 | 序列数据 | 超过4000个基因组挖掘模型 | NA | NA | NA | 酶学、结构生物学、合成生物学、治疗学设计 |
| 807 | 2026-05-24 |
Unveiling the adaptive structure-function synergy in thermophilic translation initiation factor 1: A molecular dynamics framework
2026-Aug, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2026.107644
PMID:42085878
|
研究论文 | 通过分子动力学模拟揭示嗜热翻译起始因子1的结构-功能协同适应性机制 | 首次通过全原子分子动力学模拟系统比较嗜热与中温翻译起始因子1的动态特性,揭示嗜热因子通过扩展氢键和盐桥网络增强结构刚性的分子机制 | 仅基于计算机模拟,缺乏体外实验验证;仅研究了单一嗜热菌株的IF1蛋白 | 阐明嗜热细菌翻译起始因子1的热稳定性分子机制,为工程化耐热蛋白建立框架 | 嗜热菌Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum的IF1蛋白(TT_IF1)与中温菌Flavobacterium kingsejongi的IF1蛋白(FK_IF1) | 分子生物学 | 不适用 | 分子动力学模拟,主成分分析 | 不适用 | 模拟轨迹数据 | 每种IF1蛋白3次独立模拟,每次1000纳秒 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 合成生物学,工业生物技术 |
| 808 | 2026-05-23 |
Coarse-grained modeling of hydrodynamic behavior in DNA synthesis monomers
2026-May-28, The Journal of chemical physics
IF:3.1Q1
DOI:10.1063/5.0325256
PMID:42170875
|
研究论文 | 提出了一种用于DNA合成单体粗粒化建模的方法,并研究了其流体动力学行为 | 首次提出DMT保护核苷酸单体的四珠粗粒化模型,并通过玻尔兹曼反演验证,计算效率提升20倍以上 | 未涉及实验验证或实际合成场景中的多因素影响 | 理解DNA合成中单体的微观动力学,优化合成参数 | DMT保护的核苷酸单体(腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶、鸟嘌呤) | 机器学习 | NA | 粗粒化建模、随机欧拉-拉格朗日方法 | 粗粒化模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,DNA数据存储 |
| 809 | 2026-05-23 |
Gene expression and metabolic regulation of carotenoid and withanolide biosynthetic pathways in Withania somnifera with emphasis on FPPS-mediated regulation
2026-May-22, Protoplasma
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s00709-026-02212-y
PMID:42171742
|
研究论文 | 研究了睡茄中类胡萝卜素和睡茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控,重点分析了法尼基焦磷酸合酶介导的调控作用 | 首次系统揭示了FPPS作为睡茄内酯生物合成关键通量调控酶的作用,并通过瞬时过表达验证了WsFPPS2对睡茄内酯含量的提升效果 | NA | 解析睡茄中类胡萝卜素和睡茄内酯生物合成途径的基因表达与代谢调控机制,探究FPPS作为代谢工程靶点的可行性 | 睡茄的营养组织和生殖组织,以及其22个相关基因的表达谱 | 植物生物学 | NA | 转录谱分析、瞬时过表达、系统发育分析 | NA | 基因表达数据、系统发育树 | NA | 瞬时过表达 | 睡茄 | NA | 医学、农业 |
| 810 | 2026-05-23 |
Programmable living therapeutics for cancer immunotherapy
2026-May-21, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2026.04.007
PMID:42119557
|
综述 | 本文综述了合成生物学在癌症免疫治疗中可编程活体疗法的进展 | 系统总结了基于合成生物学电路的三类活体治疗手段(工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌和溶瘤病毒)的设计策略与调控机制 | 临床转化面临电路复杂性、靶向精度、底盘优化及跨平台协同等关键挑战 | 探讨合成生物学驱动的精准、安全癌症免疫治疗活体疗法的当前进展与未来方向 | 工程化CAR-T细胞、溶瘤细菌、溶瘤病毒 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | T细胞, 细菌, 病毒 | 小分子响应开关、物理信号响应开关、肿瘤标志物响应开关、群体感应电路、肿瘤微环境响应逻辑、肿瘤选择性启动子、miRNA靶向模块、重定向衣壳/配体 | 医学 |
| 811 | 2026-05-23 |
Selective on-chip DNA synthesis using electric field-assisted PCR
2026-May-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc01200g
PMID:42015792
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于微电极阵列的电辅助聚合酶链反应(E-PCR)系统,用于选择性片上DNA合成 | 利用电场操控实现DNA选择性固定和酶介导的单链DNA合成,达到微尺度空间控制,并优化电场模式解决电化学稳定性和DNA完整性挑战 | NA | 开发一种稳健的选择性片上DNA合成平台,用于高通量酶促合成 | DNA合成过程中的电场操控和酶反应 | 合成生物学 | NA | E-PCR(电辅助聚合酶链反应) | NA | 核酸序列 | NA | NA | NA | NA | DNA数据存储,合成生物学,分子诊断 |
| 812 | 2026-05-23 |
Systematic investigation of double emulsion dewetting dynamics for the robust production of giant unilamellar vesicles
2026-May-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00098c
PMID:42018534
|
研究论文 | 系统研究了双乳液去湿润动力学,以稳健制备巨单层囊泡 | 揭示了脂质组成、水相条件、液滴约束和流体动力学对去湿过程的影响,并提出了在生理盐存在下通过增加膜堆积饱和度克服盐诱导抑制的新见解 | NA | 提高基于液滴微流体的巨单层囊泡平台的可靠性和可及性,以推动生物物理学、合成生物学和药物发现领域的发展 | 双乳液去湿润动力学及巨单层囊泡的形成 | 合成生物学 | NA | 双乳液液滴微流控 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物物理学, 合成生物学, 药物发现 |
| 813 | 2026-05-23 |
A combinatorial screening platform for in situ gene delivery to adherent cells via digital microfluidics and flexible electrodes
2026-May-20, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d6lc00124f
PMID:42029944
|
研究论文 | 开发了一种集成数字微流控与柔性电极的组合筛选平台,用于原位基因递送至贴壁细胞 | 通过数字微流控与柔性叉指电极阵列的集成,实现贴壁细胞低电压电穿孔及全自动试剂梯度生成,避免酶消化带来的生理应激 | NA | 解决传统电穿孔技术通量低、试剂消耗高及需细胞悬浮等问题,实现贴壁细胞原位高效基因递送 | 贴壁细胞(人真皮成纤维细胞) | 数字病理学 | NA | 数字微流控, 电穿孔 | NA | 图像 | NA | NA | 人真皮成纤维细胞 | NA | 再生医学, 合成生物学 |
| 814 | 2026-05-23 |
Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications
2026-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70260
PMID:40936353
|
研究论文 | 本研究设计并合成了编码肠球菌素A的完整遗传盒,在大肠杆菌中异源表达并纯化出具有抗菌活性的重组多肽 | 开发了从包含体中高效回收并重折叠生物活性细菌素的稳健低成本方法,为抗菌肽应用提供新途径 | 未提及该方法的长期稳定性或体内应用效果 | 开发基于合成生物学的异源表达和纯化方法,以生产抗菌肽肠球菌素A | 肠球菌素A的合成基因盒及其在大肠杆菌中的表达产物 | 合成生物学 | 抗菌耐药相关疾病 | PCR、测序、Ni-NTA亲和层析 | NA | 序列数据 | 5种多重耐药病原菌用于抗菌活性测试 | NA | 大肠杆菌 | 合成遗传盒包含entA基因、His标签及调控元件,用于表达肠球菌素A | 医学、食品 |
| 815 | 2026-05-22 |
Breaking boundaries for PFAS surveillance in water reservoirs: CRISPR-electrochemical synergies from MXene to microfluidics- A review
2026-Sep-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118756
PMID:42070443
|
综述 | 本文提出了一个基于MXene、CRISPR-Cas12a和微流控协同融合的下一代全氟和多氟烷基物质(PFAS)监测框架 | 首次提出将磺酸基功能化MXene、CRISPR-Cas12a和微流控自动化三者协同结合,实现PFAS的超高灵敏度、特异性和便携式检测 | 作为综述,缺乏实验验证数据和实际环境样本测试结果,且框架的实际可行性尚待进一步实验证明 | 开发超越现有方法局限的下一代PFAS监测技术,实现超灵敏、特异性强、便携且低成本的检测方法 | PFAS(全氟和多氟烷基物质) | 环境监测 | NA | CRISPR-Cas12a, 核酸适配体技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a | NA | PFAS特异性适配体引导的CRISPR-Cas12a检测系统 | 环境, 水处理 |
| 816 | 2026-05-22 |
Extended Dissipative Analysis for Uncertain Delayed Genetic Regulatory Networks via Interval Type-2 T-S Fuzzy Framework
2026-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2026.3652172
PMID:41553905
|
研究论文 | 本文在区间二型T-S模糊框架下研究不确定时滞基因调控网络的扩展耗散性分析 | 首次利用区间二型模糊集捕获基因调控网络的复杂动态和参数不确定性,通过构建新Lyapunov-Krasovskii泛函导出最大允许时滞界限,并开发隶属函数依赖的稳定性准则以降低保守性 | 数值示例显示了优于现有方法的性能,但未提及其他实际约束或实验验证 | 发展不确定时滞基因调控网络的鲁棒控制策略理论分析和设计 | 不确定时滞基因调控网络 | 机器学习 | NA | NA | 区间二型T-S模糊模型 | 数值仿真数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 817 | 2026-05-22 |
The role of fungal G protein-coupled receptors in interspecies cell-cell communication
2026-May-21, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuag024
PMID:42166155
|
综述 | 总结真菌G蛋白偶联受体在非自身信号感知中的角色,并提出改进的分类系统 | 提出区分已表征、假定和未表征GPCRs的细化分类系统,并强调合成生物学工具在解析真菌GPCRs生理作用中的潜力 | 多数真菌GPCRs仍是孤儿受体,配体和功能未知,限制了对其在跨物种细胞间通讯中作用的全面理解 | 阐明真菌G蛋白偶联受体在跨物种细胞间通讯中的作用 | 真菌G蛋白偶联受体及与其相互作用的非自身信号 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 真菌 | NA | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 818 | 2026-05-22 |
Evolving conservation: The role of unconventional approaches to restore contemporary vertebrate populations and genomic biodiversity
2026-May-21, The Journal of heredity
IF:3.0Q2
DOI:10.1093/jhered/esag040
PMID:42166210
|
综述 | 探讨生物技术在保护和恢复当代脊椎动物种群及基因组生物多样性中的非常规方法 | 提出将进化与基因组视角整合进传统生态保护与恢复,强调生物技术作为创新工具应对气候加速变化下常规方法不足的问题 | 生物技术应用引发生态不可预测性、公众对野生种群基因干预的阻力等伦理、生态和监管争议 | 分析生物技术在保护和恢复领域的现状、案例、争议及未来潜力,推动其与传统生态知识的透明整合 | 受威胁脊椎动物种群及基因组生物多样性 | 生物保护与恢复生态学 | NA | 基因拯救、合成生物学、基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 脊椎动物 | NA | 环境 |
| 819 | 2026-05-22 |
Recurrent neural chemical reaction networks that approximate arbitrary dynamics
2026-May-20, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101572
PMID:42025162
|
研究论文 | 提出一种名为“递归神经化学反应网络”(RNCRN)的模块化分子架构,用于逼近任意动力学行为 | 首次将递归人工神经网络的概念引入化学反应网络,并证明其可以系统训练以模拟任意动力学,且具有DNA链置换技术的实验可行性 | 需要足够多的化学神经元和快速反应才能实现精确逼近,且实际训练中只能使用少量神经元和中等反应速率范围 | 解决合成生物学和分子纳米技术中构建具有丰富动力学特性的新型化学系统的难题 | 递归神经化学反应网络的分子实现和动力学近似能力 | 机器学习 | NA | DNA链置换技术 | 递归神经网络 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | 递归神经化学反应网络(类似合成神经电路) | 合成生物学, 分子纳米技术 |
| 820 | 2026-05-22 |
PHYCUT: Scalable Multiplex CRISPR/Cas9 Editing for Genome Engineering in the Diatom Phaeodactylum tricornutum
2026-05-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00843
PMID:41979903
|
研究论文 | 开发了一种名为PHYCUT的多重CRISPR/Cas9编辑工具,用于硅藻基因工程,特别是减少免疫原性岩藻糖基化 | 首次在硅藻中实现基于质粒的多重CRISPR/Cas9编辑系统,利用Csy4核糖核酸酶处理多导向RNA阵列,可同时编辑多个基因 | 文章未明确讨论长期遗传稳定性或脱靶效应,且系统在非模式硅藻中的适用性尚未验证 | 解决硅藻多重基因组编辑效率低的问题,并实现人源化糖基化修饰以支持生物制药应用 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)及其α(1,3)-岩藻糖基转移酶基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, Csy4核糖核酸酶处理, 多重基因编辑 | NA | NA | 三个α(1,3)-岩藻糖基转移酶基因的编辑, 多个菌株获得低岩藻糖基化 | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum) | 多导向RNA阵列处理系统,基于Csy4核糖核酸酶 | 生物制药, 藻类生物技术 |