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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
981 2026-04-18
Negative design enables cell-free expression and folding of designed transmembrane β-barrels
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用无细胞表达系统研究跨膜β桶蛋白的设计与折叠,提出通过负设计策略抑制聚集倾向以改善膜组装 发现抑制聚集倾向中间体(通过β链局部去稳定化的“负设计”)能显著改善膜组装,即使通常认为高度去稳定的取代(如脯氨酸或暴露于双层核心的极性苏氨酸)在策略性定位时也能改善折叠 研究主要针对理想化的小型跨膜β桶蛋白,其发现向更复杂膜蛋白设计的普适性仍需验证 探究序列特征如何影响设计的跨膜β桶蛋白在合成膜中的热力学驱动组装,以推动膜蛋白的从头设计 设计的跨膜β桶蛋白变体 合成生物学 NA 无细胞表达系统 NA NA NA NA NA 跨膜β桶蛋白的合成设计 工业生物技术
982 2026-04-18
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2026-Apr, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过代谢组学和基因组关联分析,揭示了茶树中水平转移基因CsMTAN如何调控嘌呤代谢和咖啡因生物合成 首次鉴定出CsMTAN基因通过水平转移事件进入植物基因组,并发现其F179Y突变显著影响酶活性和嘌呤代谢流量 研究主要基于体外酶活实验和瞬时过表达,缺乏稳定的转基因茶树验证;样本量183个虽具多样性但可能未覆盖所有自然变异 探究茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱(如咖啡因)生物合成的遗传与分子机制 茶树(Camellia sinensis)的183个遗传多样性种质及其叶片组织 植物代谢组学与合成生物学 NA 代谢组学分析、全基因组关联研究(GWAS)、体外酶活测定、系统发育分析、蛋白质结构建模 NA 代谢物数据、基因组数据 183个茶树种质的幼叶和成熟叶组织 瞬时过表达(在烟草中) 茶树(Camellia sinensis)、本氏烟草(Nicotiana benthamiana) NA 农业(分子育种)、工业生物技术(合成生物学)
983 2026-04-17
Biodesulfurization: Back on-stage through synthetic biology and metabolic engineering approaches
2026-Apr, Current opinion in biotechnology IF:7.1Q1
综述 本文综述了通过合成生物学和代谢工程方法复兴生物脱硫技术,重点关注4S途径及其在红球菌和革兰氏阴性菌平台中的应用 整合了红球菌和假单胞菌平台的最新进展,包括操作子重构、底盘设计以及过程级约束的融合,并讨论了与加氢脱硫的整合策略 NA 探索生物脱硫技术,以解决中馏分燃料中持久性有机硫化合物的脱除问题 红球菌(野生型性能、调控、系统生物学和基因工程)和革兰氏阴性菌平台(尤其是假单胞菌) NA NA 合成生物学、代谢工程、系统生物学、基因工程 NA NA NA 操作子重构、底盘设计 Rhodococcus, Pseudomonas 4S途径(生物脱硫途径),涉及C-S键断裂而保留烃骨架 能源, 工业生物技术
984 2026-04-17
Engineering prime editors in Salvia miltiorrhiza for precise genome modification
2026-Apr, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
研究论文 在丹参中开发了优化的Prime Editing系统,实现了碱基颠换、复杂插入和碱基替换,用于精确基因组修饰 在丹参中首次优化Prime Editing系统,能够进行碱基颠换、复杂插入和碱基替换,并成功应用于提高丹参酮含量 NA 开发在丹参中实现精确基因组修饰的Prime Editing系统,以提升生物活性成分含量 丹参(Salvia miltiorrhiza)的关键基因 合成生物学 NA Prime Editing NA NA NA Prime Editing 丹参(Salvia miltiorrhiza) NA 医药
985 2026-04-17
Chemical Signaling and Metabolomic Crosstalk in Endophytic Fungi-Medicinal Plant Symbioses for Natural Product Discovery and Sustainable Bioproduction
2026-Feb-28, Metabolites IF:3.4Q2
综述 本文综述了药用植物内生真菌之间通过化学信号传导和代谢组学串扰驱动天然产物生物合成的多层机制,并探讨了利用这种共生智能进行可持续生物生产的策略 系统总结了宿主来源的化学信号(如根系分泌物和氧脂素)作为唤醒真菌沉默生物合成基因簇(BGCs)的主要触发因素,并批判性地评估了空间代谢组学(如MALDI-MSI)在揭示植物-真菌界面局部化代谢交换方面的应用 本文是一篇综述,未报告原始实验数据,其结论基于对过去十年文献的系统调查,可能受限于现有研究的覆盖范围和深度 旨在总结药用植物与内生真菌之间代谢串扰的机制,并评估利用这种共生关系进行天然产物发现和可持续生物生产的策略 药用植物及其相关的内生真菌 NA NA 空间代谢组学(MALDI-MSI)、共培养模型、植物体内模型、结构解析 NA NA NA NA 药用植物,内生真菌 NA 医药,工业生物技术
986 2026-04-16
Comprehensive genomic analysis reveals the class II diterpene cyclases in Dodonaea viscosa
2026-Jul, Phytochemistry IF:3.2Q2
研究论文 本文通过基因组测序和注释,揭示了药用植物Dodonaea viscosa中二类二萜环化酶的发现与生化特性,为合成生物学规模化生产生物活性二萜类化合物提供了基础 首次报道了Dodonaea viscosa的核基因组草图及完整叶绿体和线粒体基因组序列,并鉴定出两个新的二类二萜环化酶DvCPS和DvKPS,催化形成labdane和clerodane二萜类生物活性化合物的前体 NA 阐明Dodonaea viscosa中生物活性二萜类化合物的生物合成途径,以支持通过合成生物学实现规模化生产 药用植物Dodonaea viscosa及其基因组序列和二萜环化酶 合成生物学 NA 基因组测序、生化表征 NA 基因组序列数据 NA NA NA NA 医药
987 2026-04-16
Programmable Synthesis of DNA Networks in Giant Vesicles via Rolling Circle Amplification
2026-Apr-15, Nano letters IF:9.6Q1
研究论文 本文介绍了一种基于滚环扩增技术的仿生囊泡平台,可在巨型囊泡内构建DNA网络以增强结构稳定性 首次在合成囊泡中通过滚环扩增构建类细胞骨架的DNA网络,实现分子尺度生化活动与介观尺度机械行为的耦合 NA 开发具有功能调控和机械反馈能力的合成细胞 巨型囊泡和DNA网络结构 合成生物学 NA 滚环扩增技术 NA NA NA DNA折纸术 NA DNA网络结构(类细胞骨架) 合成生物学、生物制造、仿生材料
988 2026-04-16
Stomata as a Defence Nexus: Integrating Drought and Pathogen Stress Signalling
2026-Apr-14, Plant, cell & environment
综述 本文综述了植物气孔在协调病原体入侵和干旱胁迫响应中的双重防御角色,强调了在复合压力下气孔动态的协同与拮抗机制 将气孔视为防御中枢,整合干旱和病原体胁迫信号,揭示了复杂的信号网络交叉对话,并探讨了工程化优化气孔响应以增强作物抗逆性的前沿方向 未解决防御与生长之间的权衡、信号通路干扰以及组织特异性功能冗余等关键问题 研究气孔在整合干旱和病原体胁迫信号中的防御作用,以增强作物对气候变化的复合胁迫抗性 植物气孔及其在胁迫响应中的功能 植物生物学 NA 单细胞测序、合成生物学 NA NA NA 合成生物学 NA NA 农业
989 2026-04-16
Bacterial Extracellular Vesicles in Biomedical Research and Clinical Translation
2026-Apr, Microbial biotechnology IF:4.8Q1
综述 本文综述了细菌胞外囊泡在生物医学研究和临床转化中的应用、工程化策略及面临的挑战 系统总结了利用分子与合成生物学技术(如基因操作、表面功能化、糖工程和模块化展示技术)对bEVs进行定向生物工程改造的最新进展,以生产具有增强安全性、稳定性、靶向精度和功能多样性的定制化bEVs 指出bEVs技术转化仍面临可扩展性、安全性、标准化和监管框架等关键挑战 探讨细菌胞外囊泡在生物医学领域的应用潜力及临床转化前景 细菌胞外囊泡 NA NA 基因操作、表面功能化、糖工程、模块化展示技术 NA NA NA NA 细菌 NA 医学
990 2026-04-16
Overriding Bioprocess Perturbations With a Cell-Machine Interface for Reliable Microbial Stress-Response Control
2026-Apr, Microbial biotechnology IF:4.8Q1
研究论文 本研究开发了一种细胞-机器接口系统(Segregostat),用于在工业生物反应器扰动条件下可靠控制微生物的应激响应 首次在工业生物反应器典型扰动条件下评估并验证了Segregostat系统对微生物应激响应的鲁棒控制能力 研究仅针对大肠杆菌和酿酒酵母两种模式生物,未在更广泛的工业菌株或复杂共培养体系中验证 开发在工业生物过程扰动条件下可靠控制微生物应激响应的细胞-机器接口系统 大肠杆菌(Escherichia coli)和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的通用应激响应 合成生物学 NA 规模缩小生物反应器实验、自动化流式细胞术 NA 流式细胞术数据、生物过程参数 NA 细胞-机器接口 大肠杆菌, 酿酒酵母 应激响应控制系统(Segregostat) 工业生物技术
991 2026-04-16
Heterologous expression of Vibrio natriegens transporters enhances the growth of Escherichia coli and Bacillus subtilis on glutamate
2026-Mar, Engineering microbiology
研究论文 本研究通过异源表达Vibrio natriegens的谷氨酸转运蛋白,有效提升了Escherichia coli和Bacillus subtilis在谷氨酸碳源上的生长速率 首次发现跨物种底物转运蛋白可改变细菌细胞资源分配,为调控微生物生物量生长提供了新的遗传策略 NA 探索通过异源表达转运蛋白改善细菌在特定碳源上生长性能的方法 Escherichia coli和Bacillus subtilis两种细菌 合成生物学 NA 异源表达技术 NA 生长实验数据 NA 异源表达系统 Escherichia coli, Bacillus subtilis 谷氨酸转运蛋白表达系统 工业生物技术
992 2026-04-16
Advances in polyethylene biodegradation and bioconversion: Microbial, enzymatic, and biotechnological insights
2026-Mar, Engineering microbiology
综述 本文系统总结了聚乙烯(PE)生物降解与生物转化的最新进展,包括降解效率评估方法、微生物与酶的降解机制、已鉴定的微生物与酶资源,以及增强降解效率的物理化学策略与生物方法的整合 将合成生物学和机器学习等前沿生物技术工具与传统生物降解方法相结合,以加速PE降解速率并实现更可持续的塑料废物管理 NA 开发可持续的解决方案以缓解顽固性聚烯烃(如聚乙烯)对环境造成的负担 聚乙烯(PE)塑料 NA NA 生物降解、生物转化、合成生物学、机器学习 NA NA NA NA NA NA 环境
993 2026-04-16
Genetically encoded biosensors enabled high-throughput screening of microbial cell factories
2026-Mar, Engineering microbiology
综述 本文综述了基因编码生物传感器在高通量筛选微生物细胞工厂中的应用、关键特征、工程策略及优化挑战 系统总结了生物传感器在高通量筛选中的关键性能特征,并详细阐述了通过合成生物学策略对生物传感器进行工程改造的最新进展 NA 为开发用于高通量筛选的基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂优化中的应用提供全面指导 基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂高通量筛选中的应用 合成生物学 NA 高通量筛选(HTS)、合成生物学策略 NA NA NA 合成生物学策略 微生物细胞工厂 生物传感器(用于检测天然与非天然产物) 工业生物技术
994 2026-04-15
Benchmarking genetic elements for high-level protein expression using a novel Marchantia polymorpha transient expression system
2026-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于农杆菌的瞬时表达系统,用于快速评估地钱中的遗传元件,并系统性地比较了多种启动子、终止子和信号肽的性能 开发了首个用于地钱的高通量瞬时表达系统,可在8天内完成实验,显著提高了遗传元件表征的效率,并发现了一个截短的CaMV35S启动子变体,其活性比标准版本提高了409倍 NA 开发并验证一种快速高效的瞬时表达系统,以扩展地钱的遗传工具包并提高蛋白质表达水平 地钱(Marchantia polymorpha)中的遗传元件,包括启动子、终止子和信号肽 合成生物学 NA 农杆菌介导的瞬时表达系统 NA 蛋白质表达数据 21个启动子、15个终止子和7个信号肽 农杆菌介导的转化 地钱(Marchantia polymorpha) NA 农业
995 2026-04-15
Valorization of ligustrum species: biosynthesis, metabolic engineering, and pharmacology of bioactive compounds
2026-Mar-27, Bioresources and bioprocessing IF:4.3Q1
综述 本文综述了女贞属植物的生物活性化合物、药理特性、组学分析及生物合成研究进展,并提出整合多组学、合成生物学和绿色制造以实现其全植物价值化和种质资源保护的策略 提出整合多组学、合成生物学和绿色制造的综合性方法,以促进女贞属植物的全植物价值化和可持续利用,为药用资源开发提供新的理论框架和技术范式 NA 建立女贞属植物作为药用资源的全面开发和可持续利用的理论框架与技术范式 女贞属植物及其生物活性化合物(如三萜类、苯乙醇苷类、黄酮类等) NA NA 多组学分析、代谢工程、合成生物学 NA NA NA NA NA NA 医药、农业、环境、食品
996 2026-04-15
Label-Free Microfluidic Modulation Spectroscopy Monitors RNA Origami Structure and Stability
2026-Mar-16, Biosensors
研究论文 本研究采用微流控调制光谱技术,作为无标记的结构生物传感器,用于监测RNA折纸的结构与稳定性 首次将微流控调制光谱技术应用于RNA折纸的结构分析,实现了对RNA碱基和碱基对在1760-1600 cm⁻¹振动指纹区的无标记、高通量检测 NA 开发一种可扩展的、溶液相的RNA折纸结构监测方法,以评估其设计架构、成熟过程及稳定性分布 RNA折纸结构,特别是六螺旋束带扣的RNA折纸模型 合成生物学 NA 微流控调制光谱 NA 光谱数据 NA NA NA RNA折纸作为支架用于生物传感、合成生物学和纳米医学 生物传感, 合成生物学, 纳米医学
997 2026-04-14
Incoherent feedforward loop dominates the robustness and tunability of necroptosis biphasic, emergent, and coexistent dynamics
2026-Mar, Fundamental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过建模分析,揭示了坏死性凋亡信号通路中RIP1-RIP3-Caspase-8非相干前馈环作为核心拓扑结构,主导双相、涌现和共存动力学的鲁棒性与可调性 首次引入潜在景观和香农熵量化坏死性凋亡共存动力学的不确定性,并系统筛选出实现BEC动力学的最小电路拓扑,确认非相干前馈环的核心作用 研究基于电路建模和理论分析,实验验证可能有限,且主要关注三节点电路,可能未涵盖更复杂网络 探究坏死性凋亡信号通路中双相、涌现和共存动力学的电路结构基础与调控机制 坏死性凋亡信号通路中的RIP1、RIP3和Caspase-8蛋白及其相互作用网络 合成生物学 细胞死亡相关疾病 电路建模、网络拓扑分析、随机电路分析、潜在景观和香农熵计算 NA 理论模型数据 NA NA NA 非相干前馈环嵌入RIP3对RIP1的正反馈,以及RIP3自磷酸化的钟形调节 医学
998 2026-04-13
INVITED REVIEW: Turning Dairy Food Waste into Valuable Products via Yeast Bioproduction
2026-Apr-09, Journal of dairy science IF:3.7Q2
综述 本综述探讨了如何通过酵母生物生产将乳制品食物废物转化为高价值产品 强调了利用酵母发酵,特别是乳糖发酵酵母和酿酒酵母,将乳制品废物转化为增值产品的策略,并讨论了新兴的菌株工程和合成生物学方法 面临工业优选酵母无法天然代谢乳糖、废物成分多变、微生物污染以及经济、物流和监管障碍等挑战 旨在减少乳制品食物废物,回收营养物质,降低温室气体排放,并支持乳制品行业的循环经济 乳制品食物废物,特别是奶酪乳清及其衍生物 NA NA 酵母发酵,菌株工程,适应性进化,合成生物学 NA NA NA 合成生物学 酵母,包括乳糖发酵酵母物种和酿酒酵母 NA 农业,环境,工业生物技术
999 2026-04-11
Engineering chaperone/usher pathway pili for surface display: Structural constraints, design principles, and biotechnological potential
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文系统分析了基于伴侣蛋白/菌毛组装蛋白(CU)途径菌毛的细菌表面展示平台的结构约束、设计原则及生物技术潜力 通过统一的结构框架重新解读先前的展示策略,提炼出定义工程可塑性的保守设计原则,并提出了将CU菌毛扩展为多功能可调表面展示平台的实用工程方法 NA 为评估可行性及指导CU菌毛展示系统的理性工程提供结构引导的框架 大肠杆菌、沙门氏菌和鼠疫耶尔森菌中结构特征明确的CU菌毛 合成生物学 NA 蛋白结构预测 NA 结构数据 NA NA 革兰氏阴性细菌 细菌表面展示平台 生物技术
1000 2026-04-11
Engineering cis- and trans-acting RNA regulators for next-generation prokaryotic synthetic biology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文综述了用于下一代原核合成生物学的顺式和反式RNA调控器,强调了它们在基因表达控制中的工程应用 提出了一个面向工程师的框架,围绕转录终止、翻译起始和mRNA稳定性三个可操作控制点,整合计算和AI辅助建模以提升可预测性和可移植性 主要基于大肠杆菌为中心的实施,可能在其他原核生物中的适用性有限 推动RNA调控成为下一代原核合成生物学中常规、可工程化的控制层 原核生物(如细菌)中的RNA调控器 合成生物学 NA RNA调控技术,包括5' UTR和RBS工程、核糖开关、核酶、合成小RNA和基于CRISPR的RNA靶向工具 NA NA NA CRISPR, 核糖开关, 核酶 大肠杆菌 顺式和反式RNA调控器,用于构建复杂和响应性细菌系统,如逻辑门和生物传感器 工业生物技术
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