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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 981 | 2026-01-26 |
Phage therapy in cancer treatment: Mechanisms, emerging innovations, and translational progress
2026-Feb, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105085
PMID:41397585
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综述 | 本文综述了噬菌体疗法在癌症治疗中的机制、新兴创新及转化进展 | 将噬菌体从传统的抗菌剂重新定位为可编程的生物系统,整合了微生物组调控、免疫激活和纳米载体介导的基因递送,并融合了AI、CRISPR和合成生物学技术 | 仍面临免疫清除、细菌耐药性和监管复杂性等挑战 | 探讨噬菌体疗法在癌症治疗中的应用潜力与转化前景 | 噬菌体及其工程化构建体在肿瘤治疗中的作用 | NA | 口腔鳞状细胞癌、结直肠癌、黑色素瘤、肝细胞癌 | CRISPR-Cas、AI驱动选择流程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 982 | 2026-01-26 |
Engineering bacteriophages for gut health: precision antimicrobials and beyond
2026-Jan-22, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04038-5
PMID:41566387
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道健康中的应用,涵盖合成生物学和纳米技术进展,并探讨其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的治疗潜力 | 利用合成生物学和纳米技术重新设计噬菌体,增强其特异性、功能性和稳定性,作为微生物群中心疗法的多功能工具 | 面临长期稳定性、耐药性发展和规模化生产等挑战 | 探讨工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道疾病治疗中的应用,以应对微生物失调、抗生素耐药性和宿主-微生物相互作用破坏 | 工程化噬菌体及其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病、结直肠癌、感染性肠炎 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 983 | 2026-01-26 |
Contrasting genome composition and codon usage in Listeria monocytogenes temperate versus virulent phages
2026, Virus evolution
IF:5.5Q1
DOI:10.1093/ve/veaf100
PMID:41573078
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研究论文 | 本研究比较了单核细胞增生李斯特菌温和噬菌体与烈性噬菌体的基因组组成和密码子使用模式 | 首次系统比较了单核细胞增生李斯特菌中温和与烈性噬菌体的基因组大小、基因长度及密码子使用偏好的差异,揭示了噬菌体生活方式对密码子使用的塑造作用 | 研究仅针对单核细胞增生李斯特菌噬菌体,结论在其他细菌噬菌体中的普适性有待验证 | 探究噬菌体生活方式(温和型 vs 烈性)对基因组结构和密码子使用模式的影响 | 单核细胞增生李斯特菌的温和噬菌体(686个)和烈性噬菌体(1516个)的编码序列 | 微生物基因组学 | NA | 基因组比较分析、密码子适应指数计算 | NA | 基因组序列数据 | 2202个噬菌体编码序列(686个温和型 + 1516个烈性型) | NA | 单核细胞增生李斯特菌 | NA | 生物技术、合成生物学、治疗应用、生物防治 |
| 984 | 2026-01-25 |
Prototissues: Assembly strategies, collective behaviors, and emerging applications
2026-May, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.12.033
PMID:41567986
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综述 | 本文综述了原组织的组装策略、集体行为及其新兴应用,提出了一个理解原组织设计的双维度框架 | 提出了一个双维度框架来理解原组织设计,包括原细胞间粘附策略和空间编程方法,并总结了由此启发的关键集体行为 | 主要挑战包括实现动态和选择性粘附、在保持分辨率的同时扩展空间架构、改善信号传输以及增强生物整合 | 推进自下而上的合成生物学,以构建更复杂的人工生命系统,并探索原组织在生物医学、生物传感和智能材料等领域的应用 | 原组织,即由相互连接的原细胞组装体形成的结构 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 生物传感, 智能材料 |
| 985 | 2026-01-25 |
Systematic optimization of TF-based carboxylic acid biosensors in cell-free system
2026-Apr-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118371
PMID:41512477
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研究论文 | 本文提出了一种在无细胞系统中系统优化基于转录因子的羧酸生物传感器的框架 | 通过整合控制转录因子可用性和启动子序列,建立了在无细胞系统中理性构建高性能生物传感器的模块化方法 | NA | 优化无细胞系统中的生物传感器性能,以支持合成生物学和代谢工程应用 | 基于转录因子的羧酸生物传感器,特别是衣康酸响应型生物传感器 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统,启动子工程 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 生物传感器(衣康酸响应型,3-羟基丙酸响应型) | 工业生物技术 |
| 986 | 2026-01-25 |
ACCU-RATES: A web tool for accurate enzyme kinetics and initial reaction rate measurements
2026-Jan-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169654
PMID:41577122
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研究论文 | 开发了一个名为ACCU-RATES的网络工具,用于精确分析酶动力学数据和测定初始反应速率 | 采用微分形式的米氏方程对反应进程曲线进行数值拟合,无需依赖线性反应阶段,在数据噪声和低采样率条件下仍能提供可靠参数估计 | 需要至少两个时间点的产物积累或底物消耗曲线数据 | 开发精确测定酶初始反应速率和动力学参数的工具 | 酶反应进程曲线 | 生物信息学 | NA | 数值拟合方法 | 微分形式的米氏方程 | 酶反应动力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,医学(抑制剂发现和生物标志物检测) |
| 987 | 2026-01-25 |
The Importance of Being Imperfect: Structure and Function of Bacterial Amyloid
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517090
PMID:41347620
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综述 | 本文综述了细菌功能性淀粉样蛋白(FuBAs)的结构、组装和功能,强调其作为进化中间体和生物材料工程平台的潜力 | 通过冷冻电镜和计算研究揭示了FuBAs(如CsgA和FapC)的β-螺旋折叠结构,由不完美重复序列稳定,具有高稳定性和低多态性,并展示了其内在催化活性和分层机械性能 | NA | 探讨细菌功能性淀粉样蛋白的结构与功能关系及其在生物材料和合成生物学中的应用 | 细菌功能性淀粉样蛋白,特别是大肠杆菌的curli(CsgA)和假单胞菌的FapC | NA | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、整合计算研究 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli)、假单胞菌(Pseudomonas) | NA | 生物材料工程、合成生物学、催化、生物膜控制 |
| 988 | 2026-01-25 |
Engineered food-borne probiotics delivering checkpoint-inhibitor modulators
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004399
PMID:41497008
|
研究论文 | 本文探讨了工程化食源性益生菌作为递送检查点抑制剂调节剂的新型策略,结合合成生物学、营养学和癌症免疫疗法 | 开发了工程化食源性益生菌,通过分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2等分子,在临床前模型中显示出显著的抗肿瘤效果,并首次在非小细胞肺癌的I期试验中验证了其安全性和有效性 | 存在定植和生物安全性方面的挑战 | 研究工程化食源性益生菌作为低毒性免疫治疗平台的潜力 | 工程化食源性益生菌、检查点抑制剂调节剂、癌症免疫疗法 | 合成生物学 | 肺癌 | 工程化益生菌、可控基因电路 | NA | 临床前模型数据、临床荟萃分析、I期试验数据 | 临床前小鼠模型、非小细胞肺癌I期试验患者 | 可控基因电路 | 食源性益生菌 | 分泌可溶性CD80、PD-L1纳米抗体和IL-2的生物传感器或递送系统 | 医学 |
| 989 | 2026-01-25 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
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研究论文 | 本文提出了一种利用工程化乳酸杆菌表达肿瘤杀伤细胞因子(如IL-12、IL-15和TRAIL)的新型生物治疗方法,旨在克服系统性细胞因子疗法的毒性问题 | 将免疫疗法与微生物组工程相结合,开发出局部作用、低毒性的工程化益生菌作为抗肿瘤生物治疗剂 | 研究目前主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发一种新型的低毒性抗肿瘤生物治疗方法 | 工程化乳酸杆菌及其表达的肿瘤杀伤细胞因子 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工具(诱导型启动子、生物安全杀死开关) | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | 细胞因子表达系统(IL-12、IL-15、TRAIL表达通路) | 医学 |
| 990 | 2026-01-25 |
Structure of Chlamydomonas reinhardtii LciA guided the engineering of FNT family proteins to gain bicarbonate transport activity
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02200-9
PMID:41507353
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研究论文 | 本研究解析了莱茵衣藻LciA蛋白的结构,并基于结构指导成功改造了FNT家族蛋白,使其获得碳酸氢盐转运活性 | 首次报道了莱茵衣藻LciA的冷冻电镜结构,揭示了碳酸氢盐选择性的分子机制,并成功通过定点突变将细菌FNT家族亚硝酸盐通道改造为碳酸氢盐通道 | NA | 增强光合作用效率,为将CO2浓缩机制引入C3作物提供分子工具 | 莱茵衣藻LciA蛋白、细菌FNT家族蛋白NirC、莱茵衣藻亚硝酸盐通道NAR1.1/NAR1.5 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、定点突变、生长测定 | NA | 结构数据、功能数据 | NA | 定点突变 | 莱茵衣藻、细菌 | 碳酸氢盐转运通道 | 农业 |
| 991 | 2026-01-24 |
Bioelectrochemical energy conversion and wastewater treatment in microbial fuel cells: a review of progress, limitations, and future developments
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133903
PMID:41475609
|
综述 | 本文综述了微生物燃料电池(MFC)在生物电化学能量转换和废水处理方面的最新进展、局限性与未来发展 | 系统总结了合成生物学与微生物工程在增强生物膜稳定性及促进胞外电子传递方面的最新进展,并分析了纳米结构电极相较于传统碳电极在提升电流输出方面的优势 | 面临材料成本高、电极污染、长期稳定性有限及规模化困难等挑战,阻碍了其工业化应用 | 探讨MFC在环境可持续性与可再生能源生产框架下的技术进展、挑战与应用前景 | 微生物燃料电池(MFC) | NA | NA | 生物电化学能量转换、废水处理 | NA | NA | NA | 合成生物学、微生物工程 | 微生物(具体种类未指定) | NA | 环境, 能源 |
| 992 | 2026-01-24 |
Pheromone-mediated quorum sensing enables dynamic regulation of cordycepin biosynthesis in Cordyceps militaris
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133915
PMID:41478417
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研究论文 | 本研究在蛹虫草中重构了信息素介导的群体感应系统,实现了对虫草素生物合成的动态调控 | 首次在蛹虫草中构建了基于信息素群体感应的动态调控系统,实现了细胞密度依赖的虫草素合成调控 | NA | 开发高效的虫草素生物合成动态调控策略 | 蛹虫草(Cordyceps militaris)及其虫草素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 系统发育分析、保守结构域分析、2A肽介导的多基因共表达 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | 蛹虫草(Cordyceps militaris) | 信息素响应型合成回路:α-信息素(mfα1)受色氨酸响应启动子P控制,激活关键生物合成基因cns1和cns2 | 医药 |
| 993 | 2026-01-24 |
Lyophilized chloroplasts as molecular capsules: A scalable platform for stable and functional human α-lactalbumin production
2026-Feb, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.12.016
PMID:41448438
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研究论文 | 本研究展示了在冻干转基因烟草叶绿体中稳定生产功能性人α-乳白蛋白(hLA)的可扩展平台 | 利用冻干叶绿体作为分子胶囊,实现hLA的长期稳定储存和高效生产,浓度提升34倍,并验证其生物功能 | 研究使用烟草作为宿主,未来需转向可食用植物宿主,并需进行体内和临床研究验证安全性和有效性 | 开发一种大规模、经济高效的替代蛋白质生产方法,以应对粮食安全挑战 | 人α-乳白蛋白(hLA)在转基因烟草叶绿体中的表达与稳定性 | 合成生物学 | NA | 转基因技术、蛋白质表达分析、Western印迹、体外乳糖合成测定 | NA | 蛋白质表达数据、稳定性测试数据、功能测定数据 | 冻干烟草叶绿体储存长达六个月 | 转基因技术 | 烟草 | 转基因叶绿体表达系统,用于生产人α-乳白蛋白 | 食品、农业 |
| 994 | 2026-01-24 |
Microbial and molecular approaches for PFAS transformation in soils: prospects and limitations
2026-Jan-16, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d5ra07508d
PMID:41561006
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综述 | 本文综述了微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的潜力与限制 | 评估了微生物介导的PFAS转化、多组学研究提出的酶候选机制,以及分子工程和合成生物学的前景 | 尚无实验验证的酶能高效催化全氟C-F键断裂,转化多涉及前体化合物而非终端PFAS,环境因素、慢动力学和机制不确定性限制实际应用 | 探讨微生物和分子方法在土壤中转化PFAS的科学发展和应用前景 | 全氟和多氟烷基物质(PFAS)及其在土壤中的转化 | 环境生物技术 | NA | 多组学、计算建模、分子工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 995 | 2026-01-23 |
Development of a suite of activatable plant synthetic promoter systems using a bacterial LysR-type transcriptional regulator FdeR
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.005
PMID:41551741
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研究论文 | 本文开发了一套基于细菌LysR型转录调控因子FdeR的可激活植物合成启动子系统,以丰富植物合成生物学工具包 | 利用细菌LysR型转录调控因子FdeR开发了52个合成启动子系统,这些系统在配体非依赖性方式下被激活,表达活性范围广泛,最高可达CaMV 35S启动子活性的约65% | NA | 开发正交且可调的遗传部件,以在植物中同时表达多个基因,推动植物合成生物学发展 | 土壤细菌中的LysR型转录调控因子FdeR及其对应操作子,以及基于此的合成启动子系统 | 合成生物学 | NA | MoClo-based plug-and-play组装系统、酵母预筛选平台 | NA | NA | NA | MoClo, Gibson Assembly | 烟草 | 基于FdeR的合成启动子系统,包括配体非依赖性激活的合成激活剂 | 农业 |
| 996 | 2026-01-23 |
Advancing cellulose degradation through synthetic biology: engineered pathways and microbial systems for sustainable biomass conversion
2026-Jan-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01328-0
PMID:41555463
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综述 | 本文综述了合成生物学在改善纤维素降解方面的最新进展,并强调了这些工具如何优化可持续农业和工业应用中的纤维利用 | 结合人工智能,合成生物学实现了微生物菌株的预测筛选和精准工程,以高效降解纤维素 | NA | 克服纤维素降解中的关键技术障碍,以支持循环生物经济原则 | 纤维素,作为植物纤维的主要成分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法,包括工程基因、合成调节因子和优化酶的引入 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 微生物系统 | 多酶复合物的理性重新设计,以改善纤维素酶的分泌和催化效率 | 农业, 工业生物技术 |
| 997 | 2026-01-23 |
Recoded Bacteriophage Genome for Bio-Orthogonal-Enabled Concentration and Detection of E. coli in Drinking Water
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00665
PMID:41436063
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研究论文 | 本研究通过高复杂度Golden Gate组装技术重新编码噬菌体基因组,开发了一种基于噬菌体的生物传感器,用于饮用水中大肠杆菌的浓缩和检测 | 利用HC-GGA技术直接合成噬菌体基因组,实现快速、准确、灵活的基因组修饰,并通过生物正交反应结合磁性纳米颗粒,显著提高检测效率和灵敏度 | NA | 开发一种基于合成生物学的噬菌体工程方法,以应对饮用水中有害病原体和指示性非致病菌的检测挑战 | 大肠杆菌作为饮用水中的指示生物 | 合成生物学 | NA | 高复杂度Golden Gate组装技术 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌 | 生物传感器设计,通过基因组重编码实现炔烃修饰非经典氨基酸的掺入,并与叠氮化物共轭磁性纳米颗粒进行生物正交环加成反应 | 环境监测, 公共卫生 |
| 998 | 2026-01-23 |
Artificial Multidomain Ribosomally Synthesized and Post-translationally Modified Peptide Enzymes for Farnesylated Peptide Library Generation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00613
PMID:41451912
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研究论文 | 本文开发了一种人工多结构域核糖体合成和翻译后修饰肽酶系统,用于生成法尼基化肽库 | 设计了一种简单而稳健的方法,通过融合多个生物合成基因到一个高表达、可溶的构建体中,实现了大环肽的生产和酪氨酸侧链上C、C或C类异戊二烯的选择性修饰 | NA | 开发合成生物学方法以创建具有药物特性的肽基化学库 | 蓝细菌素生物合成途径及其酶 | 合成生物学 | NA | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)途径 | NA | NA | 估计最大规模为260万肽衍生物的库 | Gibson Assembly, BioBrick | 活体生物(未具体指定) | 多结构域酶融合构建体,用于大环化和异戊二烯化 | 药物发现 |
| 999 | 2026-01-22 |
A growth-coupled progesterone-responsive biosensor for high-throughput microfluidic screening in Saccharomyces cerevisiae
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.004
PMID:41551738
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研究论文 | 本研究开发了一种在酿酒酵母中基于生长耦合的孕酮响应生物传感器,结合微流控高通量筛选平台,用于筛选能高效转化孕烯诺龙为孕酮的酵母菌株 | 开发了首个将孕酮形成与细胞生长和荧光直接耦合的生物传感器,并整合了羟丙基-β-环糊精系统以提高细胞内类固醇的可利用性,同时利用IPTG诱导型lac操纵子和3-氨基三唑精确调控筛选严格性 | 研究主要针对孕烯诺龙到孕酮的转化,尚未验证其对其他类固醇前体或更复杂生物合成途径的普适性 | 解决类固醇前体水溶性差导致的微生物生物转化效率低和高通量菌株筛选困难的问题,以促进菌株改良和工业应用 | 酿酒酵母菌株及其对孕烯诺龙到孕酮的生物转化能力 | 合成生物学 | NA | 大气室温等离子体诱变、微流控液滴封装、荧光检测 | NA | 荧光信号、生长曲线、产物浓度数据 | 通过ARTP诱变和筛选获得5个酵母变异株 | CRISPR-Cas9, iGEM | 酿酒酵母 | 生长耦合型生物传感器,包含孕酮响应元件、荧光报告基因和与细胞生长关联的筛选标记 | 工业生物技术, 医药 |
| 1000 | 2026-01-22 |
Engineering a broad-spectrum glucose oxidase via substrate channel and linker design for enhanced lignocellulose bioconversion
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.016
PMID:41551740
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和蛋白质工程策略,设计了一种广谱葡萄糖氧化酶,用于增强木质纤维素生物转化 | 通过底物通道和连接子设计,工程化广谱葡萄糖氧化酶,显著扩展了酶的底物谱,并增强了与纤维素酶的协同作用 | NA | 工程化广谱葡萄糖氧化酶以提升复杂生物转化过程(如农业废弃物增值)中的应用潜力 | 来自 sp. 的葡萄糖氧化酶(AreGOD) | 合成生物学 | NA | 定点诱变、连接子工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、蛋白质工程 | NA | NA | 农业、环境、工业生物技术 |