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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2026-03-23 |
Modular metabolic engineering of Yarrowia lipolytica and semi-rational design of CYP716A520 for enhanced betulinic acid biosynthesis
2026-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134364
PMID:41802472
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研究论文 | 本研究通过模块化代谢工程改造Yarrowia lipolytica,并结合半理性设计优化CYP716A520酶,以增强桦木酸(betulinic acid)的生物合成 | 首次在Yarrowia lipolytica中通过模块化代谢工程将角鲨烯产量提升813倍,并采用结合计算工具与进化信息的半理性设计策略,成功优化植物来源的P450酶CYP716A520,其L359V变体活性和特异性分别提高4倍和3倍 | 未在摘要中明确提及具体局限性,但可能涉及微生物宿主中植物P450酶的适应性挑战或规模化生产的潜在问题 | 开发可持续且成本效益高的桦木酸微生物生产方法,以替代传统的植物提取 | Yarrowia lipolytica酵母和植物来源的P450酶CYP716A520 | 合成生物学 | NA | 模块化代谢工程、半理性设计、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(可能涉及,但未在摘要中明确指定,因此输出NA) | Yarrowia lipolytica | 代谢途径工程,包括角鲨烯前体供应路径和P450酶催化系统 | 医药 |
| 1062 | 2026-03-23 |
CRISPR-enhanced microalgae biosynthesis: a promising approach for future functional feed ingredients
2026-Mar-20, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01367-1
PMID:41857689
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综述 | 本文综述了利用CRISPR系统增强微藻生物合成以生产功能性饲料成分的当前应用、构建策略及未来展望 | 重点探讨了基于CRISPR的基因组编辑技术在优化微藻营养特性方面的突破性进展 | NA | 通过合成生物学策略提升微藻细胞工厂的生产力,以满足日益增长的功能性饲料原料市场需求 | 微藻及其合成的高价值生物活性化合物(如优质蛋白质、多不饱和脂肪酸、色素和维生素) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 微藻细胞工厂中的关键通路节点优化 | 农业, 食品 |
| 1063 | 2026-03-23 |
A review on microbial lipids conversion from organic wastes: Adaptive laboratory evolution-driven strategies for enhanced biofuel precursor synthesis
2026-Mar-18, Environmental research
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.envres.2026.124312
PMID:41856232
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综述 | 本文综述了利用适应性实验室进化(ALE)技术驱动策略,将有机废物转化为微生物油脂以增强生物燃料前体合成的研究。 | 提出了将ALE技术与合成生物学、精准代谢工程、基因组编辑和机器学习相结合的新型整合策略,以拓展ALE技术在有机废物资源化利用中的应用边界。 | NA | 探讨如何利用ALE技术增强产油微生物对复杂发酵液中抑制成分的耐受性,从而提高从有机废物到微生物油脂的生物转化效率。 | 产油微生物及其在有机废物(发酵液)资源化转化过程中的适应性进化。 | NA | NA | 适应性实验室进化(ALE),合成生物学,精准代谢工程,基因组编辑,机器学习 | NA | NA | NA | NA | 产油微生物 | NA | 能源,环境 |
| 1064 | 2026-03-23 |
Microplastic biodegradation and environmental safety: From microbial mechanisms to engineered systems and circular bio-based implementation
2026-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120016
PMID:41833249
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综述 | 本文综述了微塑料生物降解的微生物机制、工程系统及环境安全,并探讨了其在循环生物基实施中的可行性 | 对微塑料生物降解过程进行了机制整合分析,明确区分了表面改性、解聚、生物转化和完全矿化,并重点关注了环境安全考虑和循环生物基回收框架的整合 | 可控条件下解聚效率虽已提升,但规模化、法规遵从性及生态系统层面的风险评估仍是核心挑战 | 评估微塑料生物降解策略的环境安全性与循环生物基实施的可行性 | 微塑料(合成聚合物颗粒,尺寸小于5毫米) | 环境生物技术 | NA | 微生物降解、酶工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 1065 | 2026-03-22 |
Precision modulation of the gut microbiota-immune axis by natural products: a structure-activity relationship perspective in cancer immunotherapy
2026-Mar-20, Journal of Asian natural products research
IF:1.3Q3
DOI:10.1080/10286020.2026.2644307
PMID:41860786
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综述 | 本文从构效关系视角综述了天然产物如何通过精确调控肠道菌群-免疫轴来增强癌症免疫治疗效果 | 首次从多糖、萜类、多酚和生物碱等天然产物的特定结构决定簇出发,系统解构其如何驱动特定的微生物重塑和免疫调节结果,并提出未来结合人工智能多组学和合成生物学进行理性设计 | NA | 探讨天然产物通过调控肠道菌群-免疫轴来克服癌症免疫治疗耐药性的机制与策略 | 天然产物(多糖、萜类、多酚、生物碱)及其对肠道微生物群和宿主免疫系统的影响 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1066 | 2026-03-22 |
Repurposing nuclear receptors for ligand-responsive liquid condensate formation and gene regulation
2026-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69099-4
PMID:41620421
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研究论文 | 本文通过重新利用核受体配体结合域和共激活因子,开发了响应激素或临床批准药物的化学诱导二聚化系统,并设计了配体响应的液-液相分离凝聚物,用于基因调控和转录放大 | 创新点包括利用内源性信号分子(如激素和药物)构建化学诱导二聚化系统,以及设计配体控制的液-液相分离凝聚物以实现可调谐的转录控制,实现高达数百倍的激活效果 | NA | 研究目的是开发与内源性生理信号整合的合成生物学工具,用于基因调控和转录控制 | 研究对象包括核受体(如TRβ、VDR、RARγ、ERβ、GR2)的配体结合域、TIF2共激活因子肽,以及相关的激素和药物配体 | 合成生物学 | NA | 化学诱导二聚化、液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 双输入转录开关、配体响应的液-液相分离凝聚物 | 医学、基因电路、生物传感、治疗学 |
| 1067 | 2026-03-22 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了口腔链球菌中的一种三重酶复合物,该复合物通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变,从原始的HMG-CoA合成功能进化获得Friedel-Crafts C-酰化新功能的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特殊功能,阐明酶功能多样化的进化机制 | 口腔链球菌来源的三重酶复合物(SmaATase),包含HMGS、ACAT和DUF35蛋白 | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌(Streptococcus macacae) | NA | 合成生物学(为C-C键形成催化剂工程提供模板) |
| 1068 | 2026-03-21 |
Biosynthesis of L-Pipecolic Acid and Its Hydroxylated Derivatives: Enzyme, Engineering, and Synthesis Method
2026-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70156
PMID:41532523
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综述 | 本文综述了L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成进展,重点介绍了酶工程和合成生物学在可持续高效生产这些化合物中的应用 | 强调了通过酶工程和合成生物学方法实现L-哌啶酸及其羟基化衍生物的可持续生产,包括代谢工程策略、酶级联反应和脯氨酸羟化酶的蛋白质工程 | NA | 促进L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成生产,以替代传统化学合成方法 | L-哌啶酸及其羟基化衍生物(羟基哌啶酸) | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、蛋白质工程、酶级联反应、固定化酶策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、抗生素、天然产物 |
| 1069 | 2026-03-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Apr, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中MAN2和MAN5酶在维持半纤维素生物合成中的作用,通过酵母合成生物学揭示了它们与CSLA的功能互作 | 发现MAN2和MAN5酶在细胞内通过切割不溶性β-甘露聚糖为亲水性对应物,从而维持高尔基体中的半纤维素生产,这揭示了之前未知的生物合成调控机制 | 研究主要基于拟南芥模型,可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性 | 研究β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在生物合成参与者,以增强植物中β-甘露聚糖含量 | 拟南芥(Arabidopsis)的MAN2和MAN5酶,以及CSLA基因 | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 农业 |
| 1070 | 2026-03-21 |
Dynamics of genetic circuits in Pseudomonas protegens
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101513
PMID:41763221
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研究论文 | 本研究开发了一种实验-理论结合的流程,用于评估土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 中的 NOT 逻辑电路,并探索其作为合成生物学新宿主的潜力 | 首次在 Pseudomonas protegens Pf-5 中评估 NOT 逻辑电路,利用数学模型推断动态原理,并设计验证了串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 研究主要聚焦于 NOT 逻辑电路,可能未全面评估其他电路类型或更复杂系统在 Pf-5 中的表现 | 扩展合成生物学宿主选择,评估 Pseudomonas protegens Pf-5 作为环境合成生物学新宿主的适用性 | 土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 及其中的 NOT 逻辑电路(逆变器) | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程、数学建模 | 数学模型 | 实验数据、模型参数 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Pseudomonas protegens Pf-5 | NOT 逻辑电路(逆变器)、串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 环境 |
| 1071 | 2026-03-21 |
Engineering Plant-Based Platforms for Saccharide Biosynthesis: Progress and Prospects
2026-Mar-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14582
PMID:41805344
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综述 | 本文综述了利用植物底盘系统进行糖类生物合成的关键技术进展、研究现状、技术挑战及优化策略 | 系统总结了植物底盘在糖类合成生物学中的独特优势,即结合光合固碳与天然糖类生物合成代谢,为可持续大规模生产提供新平台 | NA | 为合成生物学发展提供见解,并挖掘植物底盘在糖类生物合成中的商业潜力 | 植物底盘系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物系统 | 糖类生物合成与代谢途径 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 1072 | 2026-03-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,实现了独立拷贝控制和环境信号响应 | 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点,实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然复制机制的限制 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 合成复制起点(SynORI),包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 | 工业生物技术 |
| 1073 | 2026-03-20 |
Structure-coevolution dual-guided engineering of C-glycosyltransferase enables high-level biosynthesis of vitexin in Yarrowia lipolytica
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.011
PMID:41852688
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研究论文 | 本研究通过结构-共进化双引导工程策略改造C-糖基转移酶,显著提升了其催化活性和热稳定性,并在Yarrowia lipolytica中实现了杜荆素的高效生物合成 | 提出了结构-共进化双引导的协同框架来指导C-糖基转移酶工程,通过改造底物结合腔和优化相互作用,大幅提升了酶活性和热稳定性,并构建了高效的微生物细胞工厂 | 未明确说明该工程策略在其他C-糖基转移酶或宿主系统中的普适性,也未详细讨论大规模工业化生产可能面临的其他技术挑战 | 开发高效的C-糖基转移酶工程策略,实现黄酮类C-糖苷的高效生物合成 | 来自T. cuspidata的C-糖基转移酶TcCGT1及其工程变体,以及Yarrowia lipolytica宿主系统 | 合成生物学 | NA | 结构-共进化双引导工程策略、分子动力学模拟、结构分析、代谢工程、补料分批发酵 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Yarrowia lipolytica | 杜荆素合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 1074 | 2026-03-20 |
Exogenous biostimulants: mechanisms and innovations for enhancing seed germination and resilience under abiotic stress
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.023
PMID:41831683
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综述 | 本文综述了外源生物刺激剂在缓解非生物胁迫(如干旱、盐分和极端温度)对种子萌发抑制的生理生化机制,并探讨了利用纳米材料、植物激素、代谢物等外源物质增强种子耐受性的潜力与挑战 | 提出了一个整合合成生物学、可生物降解纳米材料和刺激响应型纳米递送系统的多学科策略路线图,旨在实现活性成分的靶向、按需释放,以跨越实验室研究与田间应用的鸿沟 | 从实验室成果到田间应用仍面临成本效益、环境安全性和作用周期短等重大障碍 | 增强种子在非生物胁迫下的萌发能力和恢复力,以应对气候变化对作物建植和粮食安全的威胁 | 种子萌发过程及其对干旱、盐分、极端温度等非生物胁迫的响应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 1075 | 2026-03-20 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2026-Jan, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
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综述 | 本文全面综述了细菌来源的胞外保护剂Ectoine作为后生元疗法的机制、应用及未来发展方向 | 系统阐述了Ectoine在神经退行性疾病、自身免疫病和代谢综合征等新治疗领域的潜力,并探讨了纳米载体、水凝胶等先进递送系统与植物化学物的协同增效策略 | Ectoine在真核细胞中生物利用度低、工业化生产可扩展性受限、合成生物学方法成本高昂 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂的潜力,探索其在多种疾病治疗中的应用前景 | Ectoine(一种细菌来源的胞外保护化合物) | NA | 鼻窦炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫病、代谢综合征 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 1076 | 2026-03-19 |
Advances in detecting category A biothreat agents: Toward symptom-driven sensing strategies
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.002
PMID:41847150
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综述 | 本文综述了针对A类生物威胁剂的最新生物传感平台,并探讨了其诊断目标、优化方法及与临床症状的关联 | 提出建立传感技术与临床应用之间的系统性联系,支持针对生物恐怖、流行病和公共卫生的医疗资源分配研究 | NA | 开发针对A类生物威胁剂的传感技术,以应对生物恐怖和公共卫生威胁 | A类生物威胁剂 | NA | 生物恐怖相关疾病 | 生物传感平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 公共安全 |
| 1077 | 2026-03-19 |
Inter-species horizontal transfer of biosynthetic gene clusters: an evolutionary driver for chemical diversity in bacterial communities
2026-Mar-18, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20250014
PMID:41847751
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综述 | 本文探讨了细菌间生物合成基因簇的水平转移机制及其对细菌群落化学多样性的进化驱动作用 | 挑战了传统以基因组为中心的次生代谢观点,提出模仿自然界模块化转移系统可为合成生物学提供可移植生物合成平台的设计灵感 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于理论探讨和现有文献分析 | 研究生物合成基因簇在细菌种间水平转移的机制及其进化意义 | 细菌生物合成基因簇及其水平转移过程 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献分析 | NA | NA | 细菌 | 可移植生物合成平台 | 工业生物技术 |
| 1078 | 2026-03-19 |
Friedelane-type oxidosqualene cyclases in friedelin production: Advances in biosynthesis, functional characterization, structure-function relationships, and engineering strategies
2026-Mar-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151349
PMID:41812943
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综述 | 本文综述了friedelane型氧化鲨烯环化酶在friedelin生物合成中的研究进展,包括功能表征、结构-功能关系及工程策略 | 首次报道植物OSC的冷冻电镜结构,揭示了独特的“阳离子穿梭运行”机制,并整合多组学技术识别了18种friedelane型OSC酶 | 未明确提及具体实验数据或样本规模的限制,主要基于现有文献综述 | 探讨friedelin的生物合成、酶功能及工程化生产策略,以实现其可持续生物制造 | friedelane型氧化鲨烯环化酶(OSCs)及friedelin生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 多组学整合技术、冷冻电镜(cryo-EM)、代谢途径工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA | 代谢途径工程、蛋白质工程、亚细胞区室化 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | friedelin生物合成途径的重建 | 医药、工业生物技术 |
| 1079 | 2026-03-19 |
Decoding signaling architectures: CAR versus TCR dynamics in solid tumor immunotherapy
2026-01-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025190
PMID:41132090
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综述 | 本文比较了T细胞受体(TCR)和嵌合抗原受体(CAR)在信号传导架构上的差异,并总结了针对实体瘤免疫治疗中CAR-T细胞功能提升的最新策略 | 系统性地解码了CAR与TCR在信号动力学上的差异,并强调了通过工程化优化CAR设计、增强免疫突触形成、调整ITAM数量/强度以及整合新型共刺激域等突破性策略,以缩小实体瘤与血液肿瘤疗效差距 | NA | 旨在改善CAR-T细胞在实体瘤免疫治疗中的疗效,通过理解信号传导机制并开发创新策略来克服现有障碍 | T细胞受体(TCR)、嵌合抗原受体(CAR)及其在实体瘤免疫治疗中的应用 | 免疫学 | 实体瘤 | 合成生物学工具、表观遗传重编程 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 可调/逻辑门控的CAR激活 | 医学 |
| 1080 | 2026-03-19 |
The Role of Bacterial Outer Membrane Vesicles in Tumor Development: Facts, Potential Applications and Future Perspectives
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S582600
PMID:41847176
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综述 | 本文综述了细菌外膜囊泡在肿瘤发展中的作用,包括其促进或抑制肿瘤的机制,以及作为工程化纳米疫苗和免疫治疗剂的转化潜力 | 系统性地将OMVs的作用与癌症的14个标志对齐,并探讨了其作为可编程纳米平台的工程化应用前景 | NA | 探讨细菌外膜囊泡在肿瘤生物学中的角色及其在癌症预防、诊断和治疗中的潜在应用 | 细菌外膜囊泡及其在肿瘤发展中的机制 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌 | 可编程囊泡设计 | 医学 |