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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2026-06-13 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
|
研究论文 | 探索机器学习与机理模型在合成生物学资源竞争问题中的融合,提出部分不确定模型结构和嵌入式物理信息神经网络方法 | 提出部分不确定模型结构概念以防机器学习忽略机理约束,引入嵌入式物理信息神经网络方法,无缝融合机器学习和机理模型组件 | 机理模型构建劳动密集且依赖简化假设,机器学习可能忽视机理信息导致过拟合或可解释性降低 | 通过融合机器学习和机理模型实现更鲁棒的预测、增强系统洞察并改进对稀疏或噪声数据的处理 | 合成生物学中因资源共享导致基因电路意外行为的基因网络模型 | 机器学习 | NA | NA | 物理信息神经网络 | NA | NA | NA | NA | 基因电路 | 合成生物学 |
| 1142 | 2026-06-13 |
Cytochrome P450-mediated structural diversification of diketopiperazine alkaloids
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103476
PMID:41793977
|
综述 | 综述细胞色素P450酶催化二酮哌嗪生物碱结构多样化的研究进展 | 强调P450酶除羟基化外的催化多样性,包括二聚化、核苷碱基偶联和分子内环化,并探讨工程化P450变体在可持续生物合成中的应用 | 未提及具体实验验证或定量比较不同P450变体的催化效率 | 总结P450酶在二酮哌嗪结构多样化中的作用,并探索合成生物学驱动的创新策略 | 细胞色素P450酶及其催化的二酮哌嗪生物碱 | 合成生物学 | NA | P450酶催化、工程化P450变体 | NA | NA | NA | 工程化P450变体 | NA | 二酮哌嗪生物合成途径 | 药物发现 |
| 1143 | 2026-06-13 |
Sugarcane Biorefinery from Component Separation to High-Value Outputs: Technical Progress and Future Perspectives
2026-May-26, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods15111877
PMID:42279664
|
综述 | 系统总结了甘蔗汁、蔗渣和滤泥的高值化利用途径,并提出甘蔗加工全组分高值化利用框架 | 构建'甘蔗加工树'全组分高值化框架,定量揭示功能糖高利润、蔗渣预处理成本占比40-50%以及滤泥粗蜡回收率仅5-8%等关键瓶颈,并提出耦合生物炼制、合成生物学和标准化框架的未来方向 | 当前瓶颈包括预处理效率低、菌株性能不佳和分离成本高 | 解决甘蔗加工单一产品依赖和副产品利用率低的问题,推动低碳循环转型 | 甘蔗汁、蔗渣、滤泥 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、农业 |
| 1144 | 2026-06-13 |
Molecular recruitment and release using DNA host condensates
2026-May-12, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d5nh00586h
PMID:41774821
|
研究论文 | 使用DNA宿主凝聚体实现分子招募与释放 | 在DNA纳米星中整合适配体以构建具有招募和释放目标生物分子能力的凝聚体,并研究适配体位置对凝聚和招募效率的影响 | 仅研究了链霉亲和素(SA)一种模型蛋白,且适配体定位对凝聚和招募无显著影响可能限制了设计灵活性 | 探索DNA纳米星凝聚体作为可调控分子招募与释放平台的潜力 | DNA纳米星凝聚体及其招募的链霉亲和素(SA)分子 | 合成生物学 | NA | DNA纳米自组装、适配体技术 | NA | 实验数据 | 未明确说明 | DNA纳米星 | 无细胞系统 | 适配体修饰的DNA纳米星凝聚体 | 合成生物学 |
| 1145 | 2026-06-13 |
Beyond text generation: large language models as autonomous agents for orchestrating synthetic biology cycles
2026-May, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134309
PMID:41763131
|
综述 | 探讨大语言模型作为自主智能体在合成生物学设计-构建-测试-学习周期中的协同作用 | 将LLM定位为自主智能体而非单纯预测工具,提出语义驱动范式替代传统人工特征工程,并系统分析不同LLM架构与生物任务的适配性 | 计算成本、模型可解释性及伦理治理挑战 | 推动合成生物学在可持续制造、医学等领域突破 | 大语言模型在合成生物学中的应用范式 | 自然语言处理, 合成生物学 | NA | 大语言模型 | 各类LLM架构 | 生物序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 可持续制造 |
| 1146 | 2026-06-13 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
|
综述 | 综述通过合成生物学工程非核糖体肽合成酶以优化抗菌肽产量和活性的研究进展 | 系统总结了通过前体代谢工程、代谢流调控、强启动子和调控因子引入以及异源表达等策略提升非核糖体肽产量和生物活性的方法,并指出糖肽类抗生素作为合成生物学工程新方向的潜力 | 未提及具体实验数据验证或比较不同工程策略的效率,且综述范围可能未涵盖所有非核糖体肽类型 | 综述通过合成生物学方法工程改造非核糖体肽合成酶,以提高产量和生物活性 | 非核糖体肽合成酶及其生产的抗菌肽,特别是糖肽类抗生素 | 合成生物学 | NA | 非核糖体肽合成酶工程、代谢工程、启动子工程、异源表达 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1147 | 2026-06-13 |
A synthetic angiotensin II/ACE2-based hormone shunt controlling experimental hypertension
2026-Apr-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71796-z
PMID:41965354
|
研究论文 | 设计一种名为ARCH的全人源抗高血压基因电路,通过合成生物学方法控制实验性高血压 | 提出一种基于合成生物学的闭合环路基因电路,利用天然血管紧张素受体监测血压生物标志物,并驱动可溶性ACE2表达以自我调节血压 | NA | 开发一种可逆、自给自足的闭环系统来精确监测和控制肾素-血管紧张素系统驱动的高血压 | 雄性高血压小鼠 | NA | 高血压 | 基因工程 | NA | NA | 雄性高血压小鼠,具体数量未提及 | 合成生物学基因电路 | 人源细胞 | 包含血管紧张素受体监测模块和可溶性ACE2治疗表达模块的自调节基因电路 | 医学 |
| 1148 | 2026-06-13 |
Gallium in liquid state shows nuclease-mimicking activity
2026-Apr-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71346-7
PMID:41963312
|
研究论文 | 液态镓展现出类似核酸酶的活性,具有优先切割位点 | 首次发现液态镓具有类似核酸酶的活性,其氧化层用于底物吸附,金属核心作为裂解活性中心,构建无配体、无辅因子的人工核酸酶平台 | 未提及 | 探索非生物材料模仿酶活性的新方法 | 液态镓的核酸酶活性及其机制 | NA | NA | NA | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 治疗应用, 合成生物学, 生物材料 |
| 1149 | 2026-06-13 |
Engineering sensor-based antithetic integral controllers for enhanced dynamic performance and noise attenuation
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101512
PMID:41763220
|
研究论文 | 开发并分析了一种基于传感器的拮抗积分反馈控制器,用于增强动态性能和噪声抑制 | 通过对经典拮抗控制基序进行单一修改,内在引入比例反馈,无需额外电路,从而加速动态响应并降低噪声放大 | 当前实现基于大肠杆菌,可能需在其他宿主中验证通用性;实际应用中的长期稳定性未充分探讨 | 设计高性能生物控制器以改善动态性能和噪声特性 | 基于传感器的拮抗积分反馈控制器在大肠杆菌中的实现与表征 | 合成生物学 | NA | intein介导的剪接 | 控制理论模型和随机分析 | 实验测量数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 基于传感器的拮抗积分反馈控制器 | 合成生物学、代谢工程、细胞疗法 |
| 1150 | 2026-06-13 |
Enhanced Heterologous Production of Tylosin Through Pathway Reconstruction and Integrated Optimization in Streptomyces
2026-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70203
PMID:41761947
|
研究论文 | 通过通路重构和整合优化在链霉菌中增强泰乐菌素的异源生产 | 利用ExoCET技术成功捕获87 kb的泰乐菌素生物合成基因簇,并通过两步组装策略在三种链霉菌宿主中实现异源表达,结合培养基优化、启动子替换和调控基因敲除等多层次策略显著提升产量 | 未说明 | 提高泰乐菌素的异源生物合成效率并开发具有增强治疗活性的类似物 | 泰乐菌素生物合成基因簇和链霉菌宿主 | 合成生物学 | NA | ExoCET技术, 异源表达, 启动子替换, 基因敲除 | NA | NA | 三种链霉菌宿主(包括S. albus J1074) | ExoCET, 两步组装策略 | Streptomyces fradiae QL100, Streptomyces albus J1074 | 泰乐菌素生物合成通路 | 医药 |
| 1151 | 2026-06-13 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343925
PMID:41941447
|
研究论文 | 利用合成生物学方法工程化BCG菌株以增强HMBPP的产生,进而促进Vγ9Vδ2 T细胞扩增 | 通过宿主自身-非自身识别机制利用HMBPP感知来增强免疫应答,而非传统的配体或抗原策略 | 尚未进行体内验证,且未评估工程菌株的安全性和长期免疫保护效果 | 开发更有效的抗结核疫苗,增强BCG诱导的免疫应答 | BCG菌株、Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、体外刺激实验、同线性分析 | NA | 基因组序列、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种和356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG(牛分枝杆菌卡介苗) | MEP途径合成基因座,包括HMBPP合酶GcpE过表达 | 医学 |
| 1152 | 2026-06-11 |
Recombinant human serum albumin-A paradigm shift: From laboratory development to industrial-scale production, and clinical translation
2026-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108914
PMID:42086096
|
综述 | 本文综述了重组人血清白蛋白从实验室开发到工业规模生产和临床转化的路径 | 强调重组人血清白蛋白的生产平台选择不仅基于产量,还综合考虑了可扩展性、成本效益、监管可行性和与下一代纯化策略的兼容性,并展望了其作为多功能生物治疗平台的潜力 | 实现其全部潜力取决于克服生产规模化的经济挑战、确保产品一致性以及利用合成生物学和智能制造 | 总结重组人血清白蛋白的工业化路径并探讨其未来应用价值 | 重组人血清白蛋白的生产平台(酵母和转基因水稻)及临床证据 | NA | NA | 重组蛋白表达、综合多模式纯化技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 智能制造 | 酵母(Komagataella phaffii), 转基因水稻 | NA | 医学, 药物递送, 先进疗法 |
| 1153 | 2026-06-11 |
Metabolic engineering strategies for microbial amino acid production: From molecular mechanisms to systems optimization
2026-Aug, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110901
PMID:42166812
|
综述 | 从分子机制到系统优化,系统综述微生物氨基酸生产的代谢工程策略 | 提出一个涵盖分子、网络和系统三个层面的层级约束策略框架,并评估各策略的权衡与边界条件 | 未提供具体的实验验证或定量比较不同策略的性能 | 指导理性选择代谢工程策略,推动氨基酸生物制造的高效可持续发展 | 微生物细胞工厂 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学 | NA | 综述文献 | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、食品、保健品、化工 |
| 1154 | 2026-06-11 |
Metabolic engineering of microbial pathways for 5-aminolevulinic acid biosynthesis: Recent advances and biotechnological applications
2026-Jul, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2026.03.012
PMID:41881187
|
综述 | 回顾微生物合成5-氨基乙酰丙酸的最新进展及生物技术应用 | 综述了代谢工程和合成生物学在构建高效细菌细胞工厂方面的创新策略,包括前体供应、辅因子再生、途径工程、生物传感器调控及系统代谢控制 | 讨论了当前挑战,如复杂反应途径、低生产率和环境问题,但未提供具体数据对比 | 总结细菌5-ALA生物生产的最新进展,指导下一代微生物平台开发 | 微生物细胞工厂,特别是细菌宿主 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | C4和C5生物合成途径、前体供应、辅因子再生、转运系统、生物传感器调控 | 农业, 医药, 化妆品, 动物饲料工业 |
| 1155 | 2026-06-11 |
Engineering aminoacyl-tRNA synthetase activity to enhance branched-chain amino acid biosynthesis
2026-Jul, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.03.014
PMID:41933685
|
研究论文 | 通过工程化氨酰tRNA合成酶活性来增强支链氨基酸生物合成 | 首次提出将氨酰tRNA合成酶作为提升支链氨基酸产量的工程靶点,综合tRNA修饰、靶向诱变和合成生物学工具创制高效微生物细胞工厂 | 直接工程化BCAA氨酰tRNA合成酶的方法仍较为罕见,需进一步优化 | 探索通过工程化氨酰tRNA合成酶活性提升支链氨基酸微生物产量的策略 | 支链氨基酸(缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸)的微生物合成途径 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 代谢工程、靶向诱变、tRNA修饰 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | 生长耦合选择系统、氨酰tRNA合成酶-tRNA工程化 | 工业生物技术 |
| 1156 | 2026-06-11 |
Membrane-Spanning Nanopores Formed from Nucleic Acids
2026-Jun-10, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.5c00905
PMID:42173496
|
综述 | 探讨基于核酸(特别是DNA纳米孔)构建的合成跨膜纳米孔的最新进展 | 系统总结了DNA纳米孔从亚纳米离子通道到可定制大分子通道的多样化架构,并突出RNA折纸技术用于基因编码纳米孔的独特潜力 | 未具体说明,但综述性质决定其可能缺乏实验验证和定量比较 | 评述核酸基纳米孔的设计原理、膜锚定方法、脂质重排影响及功能动态调控 | 核酸纳米孔(DNA纳米孔及RNA折纸纳米孔) | 分子生物学 | 未涉及 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 单分子传感, 细胞操纵 |
| 1157 | 2026-06-11 |
Advancing Genetic Code Expansion in Live Cells Through Metabolic Engineering
2026-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
综述 | 综述通过代谢工程在活细胞中推进遗传密码扩展的研究进展 | 系统总结了通过代谢工程在细胞内合成非标准氨基酸以克服传统依赖外源添加限制的创新策略 | 未具体提及局限性,但可推断当前方法可能面临代谢途径效率、宿主兼容性等挑战 | 探讨代谢工程与遗传密码扩展结合在合成生物学中的应用前景 | 遗传密码扩展技术及非标准氨基酸的生物合成系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、基础研究、应用研究 |
| 1158 | 2026-06-11 |
Repurposing bacterial secretion systems for the design of living therapeutics
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102726
PMID:41780105
|
综述 | 综述利用细菌分泌系统改造共生或益生大肠杆菌,设计活体治疗药物以定向递送治疗蛋白 | 系统比较了不同细菌分泌系统(包括源自病原体的系统)用于工程菌递送治疗性蛋白的优缺点,并以炎症性肠病为例展示了合成生物学在解决治疗递送挑战中的应用 | 未提及具体实验验证或临床转化中的数据,可能停留在概念综述层面 | 探讨通过工程化细菌分泌系统实现治疗蛋白定向递送,克服传统给药方式的系统性副作用 | 共生和益生大肠杆菌及其改造的分泌系统 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 细菌分泌系统工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 分泌系统(如源自病原体的分泌装置)与转录调控通路 | 医学 |
| 1159 | 2026-06-11 |
Degradation dynamics: an insight into microbial interactions with explosive compounds
2026-05-10, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10299-6
PMID:42107032
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综述 | 综述了爆炸物与微生物相互作用中的降解动力学,涵盖降解途径、关键酶及最新研究进展 | 将传统降解动力学与合成生物学工具(如CRISPR/Cas系统)结合,提出通过工程化微生物菌株提升降解活性 | 未详细讨论工程菌株的实际应用效果及环境影响评估 | 提供爆炸物降解动力学的研究现状概述 | 微生物(细菌和真菌)与爆炸物(如硝胺、硝基取代芳香族化合物、苦味酸、TETRYL、HEXYL、RDX等)的相互作用 | 环境科学 | NA | 降解动力学分析、生物组学(Bio-omics)、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 微生物(细菌、真菌) | NA | 环境科学 |
| 1160 | 2026-06-11 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 综述了核碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的应用,涵盖其催化原理、三种主要工作模式及未来发展方向 | 系统总结了核碱基编辑酶在生物传感和成像中的三种应用模式(碱基转换、修饰/去修饰、碱基擦除),并强调其高特异性、高效扩增和生理兼容性 | 讨论该领域面临的挑战,包括酶工程、递送策略和多回路集成的改进需求 | 概述核碱基编辑酶作为可编程分子工具在生物传感和生物成像中的应用现状与前景 | 核碱基编辑酶,包括脱氨酶、甲基转移酶/去甲基酶和DNA糖基化酶 | 数字病理学, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器, 分子回路 | 医学, 工业生物技术 |