合成生物学相关文章

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当前共找到 1583 篇文献,本页显示第 1181 - 1200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1181 2026-04-30
AI-Driven De Novo Binder Design: From Structure Prediction to Closed-Loop Optimization
2026, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
综述 总结了人工智能驱动从头设计蛋白结合物的标准化技术栈,涵盖从结构预测到闭环优化的实用工作流程 系统整合了结构预测、蛋白质语言模型和扩散生成建模等前沿技术,提出了从计算设计到实验反馈的完整闭环优化框架 面临诱导契合、负设计和数据集偏差等关键挑战,端到端复合物生成尚未实现 综述人工智能驱动的从头蛋白结合物设计方法,建立标准化技术栈 蛋白结合物(包括抗体和非抗体支架,如单抗体和设计的锚蛋白重复蛋白) 机器学习 NA 结构预测、蛋白质语言模型、扩散生成建模 扩散模型、蛋白质语言模型 蛋白质序列、蛋白质结构数据 NA NA NA NA 医学、合成生物学
1182 2026-04-30
Artificial intelligence and synthetic biology in traditional Chinese medicine: revolutionizing public health applications
2026, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
综述 探讨人工智能与合成生物学在中医药现代化中的应用,以推动公共卫生领域的革新 首次系统综述人工智能与合成生物学的协同作用,提出将中医药从经验实践转化为标准化、循证公共卫生干预的路径 综述性质缺乏实验验证,未来需增强AI可解释性、扩展生物数据库及优化跨学科协作 分析人工智能与合成生物学如何解决中医药面临的资源不可持续、多靶点机制模糊及标准化不足等挑战 中医药的活性化合物、临床诊疗体系及公共卫生应用 机器学习 COVID-19 NA NA 文本 NA NA NA NA 医学, 制药
1183 2026-04-29
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Jul, Enzyme and microbial technology IF:3.4Q2
综述 该综述文章全面回顾了微生物脂肪酶在工业创新中的应用,涵盖其来源、筛选、生产、纯化及表征等方面 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程及AI辅助建模在识别和定制具有所需特性的脂肪酶中的革命性作用 未明确说明,但作为综述可能缺乏对特定系统验证的深度讨论 探讨微生物脂肪酶在可持续工业创新和绿色化学中的关键作用 微生物脂肪酶,包括来自细菌、真菌和酵母的脂肪酶 机器学习 NA CRISPR-Cas, 宏基因组学, 酶工程 NA 文本 NA CRISPR-Cas9, 酶工程 芽孢杆菌属, 无色杆菌属, 产碱菌属, 节杆菌属, 假单胞菌属, 青霉属 NA 工业生物技术, 医药, 食品与饮料, 纺织, 皮革, 洗涤剂, 生物燃料
1184 2026-04-29
Reconstitution of Archaeal Membrane Lipid Biosynthesis in Bacterial and Eukaryotic Hosts
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3
综述 介绍在细菌和真核宿主中重构古菌膜脂生物合成的研究进展 系统综述了通过合成生物学和代谢工程实现古菌脂质合成途径的跨域重构,并发现细菌和真核酶对古菌脂质前体具有显著的底物混杂性,从而无需古菌酶即可合成多种古菌脂质 未明确提及现有研究的局限性 研究古菌膜脂生物合成途径的重构、宿主系统及工程策略,探讨脂质分界的演化含义及生物技术应用 古菌膜脂生物合成途径及其在细菌和真核宿主中的重构 合成生物学 NA 合成生物学、代谢工程 NA NA NA NA 大肠杆菌(Escherichia coli), 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) 古菌脂质生物合成途径,包括核心古菌酶的表达和异戊二烯前体供应的增强 工业生物技术、医药
1185 2026-04-29
GAN-GA: A Deep-Evolutionary Approach for Synthesizing Functionally Similar Heat Shock Proteins
2026-Apr-27, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出GAN-GA混合框架,结合生成对抗网络与遗传算法以设计功能相似的热激蛋白 将Wasserstein GAN与多目标遗传算法NSGA-II结合,在蛋白质序列生成后加入理化性质优化阶段,克服传统生成方法缺乏功能验证的局限 未详细说明对生成蛋白质的湿实验验证结果,论文仅描述序列优化阶段未提及实际蛋白质表达与功能测试 开发一种无需天然模板的从头蛋白质设计方法,生成具有生物学相关性的功能蛋白序列 合成热激蛋白HSP70和HSP90的序列设计 机器学习 NA 蛋白质序列生成 Wasserstein GAN, NSGA-II, ProtBert, ESM, 变分自编码器, 强化学习 蛋白质序列 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
1186 2026-04-29
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology IF:12.9Q1
研究论文 利用系统发育组学、代谢组学和异源表达方法,调查了82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成基因簇及其天然产物 首次系统性地对肉座菌目生防真菌的生物合成能力进行大规模调查,揭示了约80%的基因簇编码未知产物,并表征了四种参与未知产物合成的非核糖体肽合成酶样合成酶 仅涉及82种真菌,样品量有限,且主要关注生物合成基因簇与分子的关联,未能覆盖所有潜在生物活性化合物 探索肉座菌目真菌作为生物防治剂的生物合成潜力,为可持续农业害虫防治奠定基础 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌及其生物合成基因簇 数字病理学 NA 系统发育组学, 代谢组学, 异源表达 NA 基因组数据, 代谢组数据 82种真菌物种 异源表达 NA 生物合成基因簇 农业
1187 2026-04-29
Single Molecule Force Measurements Reveal Energy Stabilization of Theophylline Aptamer RNA Switch Required for Gene Control
2026-Mar-25, ACS physical chemistry Au IF:3.7Q2
研究论文 利用单分子力谱测量茶碱适体RNA开关的能量稳定化机制及其在基因调控中的作用 首次通过光镊单分子力谱技术量化了茶碱结合对RNA适体折叠动力学的影响,发现茶碱通过稳定结构而非诱导构象重排来调控基因表达 未提及实验局限性或应用中的潜在挑战 揭示茶碱适体RNA开关的折叠动力学和能量稳定化机制,为合成生物学中适体工具的设计提供依据 茶碱适体RNA 合成生物学 NA 光镊单分子力谱(optical tweezers single-molecule force spectroscopy) NA 单分子力曲线 单分子级别的RNA分子样本 NA NA 茶碱适体RNA开关(theophylline aptamer RNA switch) 合成生物学, 医学(治疗)
1188 2026-04-28
Nanoparticle-Based Membranes on Coacervates: From Interfacial Assembly to Biomimetic Applications
2026-Apr, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
综述 介绍基于纳米颗粒膜包覆凝聚液滴的形成机制、理化性质及仿生应用 系统分类纳米颗粒膜形成的主要驱动力(界面能驱动自组装、静电相互作用主导组装、协同多机制组装),并强调膜包覆显著提升凝聚液滴的结构完整性和选择性分子渗透性 当前在纳米颗粒包覆凝聚液滴的设计和调控方面存在局限性 通过概述纳米颗粒基膜包覆凝聚液滴的研究进展,推动其在合成生物学和仿生材料领域的进一步研究和应用 凝聚液滴和基于纳米颗粒的膜包覆系统 合成生物学 NA NA NA NA NA NA NA NA 合成生物学, 仿生材料
1189 2026-04-28
Exploring the chemical diversity of Dictyostelium secondary metabolites and their biological implications
2026-Mar-10, Archives of microbiology IF:2.3Q3
综述 详细介绍盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其生物学意义 首次全面总结了盘基网柄菌中独特的次级代谢产物化学多样性,包括其他微生物来源中未发现的稀有骨架化合物,并揭示了多酮合酶和萜烯合酶基因家族在代谢多样性中的作用 未提及具体的研究局限性,可能受限于现有基因组数据的不完整性和代谢产物产出量的优化问题 探索盘基网柄菌次级代谢产物的化学多样性及其在药物发现中的潜在应用 盘基网柄菌的次级代谢产物,包括多酮类、萜类、生物碱、酚类和肽类等 天然产物化学 NA 色谱法, 光谱法, 化学合成, 基因组挖掘 NA 文本, 化学结构数据 NA NA 盘基网柄菌 NA 医学, 药学
1190 2026-04-28
From machine learning to multimodal models: The AI revolution in enzyme engineering
2026-Mar, Biodesign research
综述 本文系统回顾了人工智能在酶工程中的发展,从传统机器学习到多模态模型,并提供了当前酶工程任务的指导图景 提出了AI在酶工程中演进的四个阶段(经典机器学习、深度神经网络、蛋白质语言模型和多模态架构),并总结了重塑该领域的四大趋势,包括从手工特征到统一嵌入、从单模态到多模态系统的转变等 作为综述,未提出新的实验方法或数据,可能未涵盖所有最新研究进展 提供AI在酶工程中应用的整合视角,包括模型类型、关键任务和数据资源 酶工程任务,包括功能注释、结构建模和性质预测 机器学习 NA NA 经典机器学习算法、深度神经网络、蛋白质语言模型、多模态架构 蛋白质序列与结构数据 NA NA NA NA 合成生物学、生物催化、药物发现
1191 2026-04-27
Multilayer microbial framework of aerobic granule microecosystems: Integrating community ecology, genetic networks, and enhancement strategies
2026-Jul, Bioresource technology IF:9.7Q1
综述 提出好氧颗粒污泥微生态系统的多层微生物框架,整合群落生态学、遗传网络和强化策略 提出功能性状驱动的自组织过程而非简单细胞聚集的概念框架,揭示群体感应系统与代谢协同和功能分区强化的关联机制 缺乏定量跨尺度耦合模型,当前强化策略存在局限性,工程普遍性和可设计性尚需验证 统一解释好氧颗粒污泥形成与稳定性的微生物学机制 好氧颗粒污泥微生态系统 环境微生物学 NA NA NA NA NA 合成生物学 好氧颗粒污泥中的微生物群落 群体感应调控回路(luxI/luxR通路) 废水处理, 环境工程
1192 2026-04-27
Ion- and Temperature-Programmable Reconfiguration of Subcompartments in Synthetic Cells
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology IF:2.6Q3
研究论文 提出一种纯镁离子介导的可逆子区室组装机制,实现合成细胞内的动态重构 首次利用镁离子作为可逆调控因子,通过离子浓度和温度变化实现合成细胞子区室的空间重构,克服了合成细胞设计中动态重组的挑战 未研究镁离子在生理浓度下的长期稳定性及多离子协同效应,也未验证该系统在复杂生物环境中的适用性 开发一种基于物理刺激的合成细胞动态组织机制,模拟活细胞子区室的空间重组 带负电的巨型单层囊泡和中性大单层囊泡,分别作为合成细胞底盘和子区室模型 数字病理学 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学、工业生物技术
1193 2026-04-27
Engineering oncolytic bacteria as precision cancer therapeutics: design principles, therapeutic strategies, and translational perspectives
2026-Apr-01, Protein & cell IF:13.6Q1
综述 综述了工程化溶瘤细菌作为精准癌症治疗平台的设计原则、治疗策略和转化前景 系统整合了合成生物学调控回路设计(感知外源信号、细菌自身信号、肿瘤微环境特征)与多种治疗模态的联合策略 未提及临床试验中宿主免疫反应对细菌活性的具体影响及长期安全性数据 为开发安全有效的个性化细菌癌症疗法提供设计框架和转化路线 工程化溶瘤细菌及其基因调控回路 合成生物学 癌症 NA NA NA NA CRISPR-Cas9, 群体感应系统, 合成基因回路 细菌(如溶瘤细菌) 诱导型/自主调控回路(包括群体感应开关、细菌入侵开关、一氧化氮响应启动子、缺氧/低pH/乳酸响应启动子),产物释放模块(前药转化酶、细胞因子、抗体/纳米抗体片段) 医学
1194 2026-04-25
From Gene Knockouts to Genome Remodeling: Large DNA Fragment Deletion Technologies in Plants
2026-Mar-15, Plants (Basel, Switzerland)
综述 系统比较植物中用于大DNA片段删除(LDFD)的主要技术,包括ZFNs、TALENs、CRISPR/Cas系统、位点特异性重组酶、转座子系统及引物编辑衍生策略,并讨论当前瓶颈与未来方向 首次全面比较植物中多种LDFD技术的机制与效率,强调植物特异性染色质组织和DNA修复对删除效果的约束,并展望AI辅助设计核酸酶与重组酶等新方向 NA 综述植物中大DNA片段删除技术的现状、瓶颈及未来发展方向,以推动功能基因组学与理性基因组设计 植物中已应用的大DNA片段删除技术 NA NA ZFNs, TALENs, CRISPR/Cas系统(Cas9、Cas12a、Cas3),位点特异性重组酶,转座子系统,引物编辑衍生策略 NA NA NA ZFNs, TALENs, CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas12a, CRISPR-Cas3, 位点特异性重组酶, 转座子系统, 引物编辑衍生策略 植物 NA 农业, 工业生物技术
1195 2026-04-25
Engineered Bacteriophages: A Next-Generation Platform for Precision Antimicrobials and Therapeutics
2026-Mar-13, Viruses
综述 系统总结了工程化噬菌体在制备技术、抗菌应用和癌症治疗中的进展,并分析了临床转化的挑战 提出工程化噬菌体作为可定制的精准生物工具,融合合成生物学、医学和环境科学,为抗菌药物耐药性危机提供变革性解决方案 监管审批、大规模生产和长期安全性验证等关键挑战尚未解决 总结工程化噬菌体的制备技术及其在精准抗菌和医疗中的应用前景 工程化噬菌体 合成生物学 抗菌药物耐药性感染、胃肠道疾病、癌症 NA NA NA NA 基因修饰、化学偶联、物理封装 噬菌体 工程化噬菌体作为精准抗菌剂、靶向递送载体、免疫佐剂 医学、环境科学
1196 2026-04-24
On-Demand Droplet Routing and Splitting Using Independently Addressable Interdigitated Electrodes
2026-Mar-20, Micromachines IF:3.0Q2
研究论文 提出一种利用独立寻址叉指电极实现按需液滴路由和分裂的低电压微流控平台 将倾斜叉指电极与非对称Y型结点集成,在单一器件中实现电可调液滴分裂与分选,并通过低电压介电泳实现液滴动态路由和实时确定性分裂 NA(摘要未明确提及局限性) 开发低电压微流控平台,实现液滴的按需路由和分裂,用于生物化学分析 微流控芯片中的液滴 微流控 NA 微流控、介电泳 NA NA NA NA NA NA 药物发现、单细胞分析、分子诊断、合成生物学
1197 2026-04-24
Unintended Creation or Insertion of Antisense Promoter Motifs During Codon Optimization: A Cyber-Biosecurity Risk
2026-Mar-12, Microorganisms IF:4.1Q2
研究论文 本研究探究密码子优化过程中无意引入或有意插入反义启动子基序(如“TATAAT”)的网络安全风险,并开发了计算管道进行检测和防御 首次揭示密码子优化工具中双向DNA链筛查的缺失可能导致潜在生物网络安全漏洞,并提出计算防御策略 研究主要基于计算机模拟分析和公共数据集,缺乏湿实验验证插入反义基序后的实际生物效应 评估密码子优化过程中反义启动子基序的无意引入或有意插入风险,并提出防御方法 484741个蛋白质编码序列及其密码子优化后的反义链基序 合成生物学 NA 密码子优化 NA 基因组序列 484,741个蛋白质编码序列 NA NA NA 工业生物技术
1198 2026-04-24
A Scaffoldomics Platform for Modular In Vivo Enzyme Colocalisation and Its Application to Naringenin Biosynthesis
2026-Mar, Microbial biotechnology IF:4.8Q1
研究论文 开发了一种‘支架组学’平台,用于模块化体内酶共定位,并应用于柚皮素生物合成 提出了一种通用的‘支架组学’合成框架,能够实现多达四种途径酶在蛋白支架上的组合组装,并通过大肠杆菌中染色体编码的生物传感器实现实时检测和途径评估 当前方法仍可能劳动密集且效率不足,但该平台展示了显著改善 提高微生物细胞工厂的代谢效率,增强精细化学品的产量 微生物细胞工厂中的酶共定位系统 合成生物学 NA 蛋白支架组装、生物传感器 NA 实验数据 多种酶组合的支架组装和柚皮素生物合成实验 蛋白质工程、生物传感器 大肠杆菌 蛋白支架用于多酶复合物组装和代谢途径优化 工业生物技术、医药
1199 2026-04-23
Natural Food Pigments: From Biosynthesis to Application
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了天然食品色素的生物合成、合成生物学策略、药理活性机制以及在医药、保健和化妆品中的应用进展 系统整合了天然色素的生物合成路径、合成生物学策略、药理活性机制及多领域应用,结合代谢工程、人工智能辅助筛选和生物传感等新兴技术,提出了从基础合成到高价值应用的跨学科发展路径 NA 探讨天然色素的生物合成、应用潜力及作为功能性色素在天然药物开发中的多重价值 天然食品色素,包括吡咯、类异戊二烯、醌类、酚类和甜菜碱五大结构类别 NA NA 代谢工程、人工智能辅助筛选、生物传感 NA NA NA NA NA NA 医药、保健、化妆品
1200 2026-04-23
Decoding Outer Membrane β-Barrels: From Structural Curiosity to Engineered Nanotherapeutics
2026-Apr-22, Chemical reviews IF:51.4Q1
综述 本文综述了外膜β-桶状蛋白(OMPs)的结构、功能多样性及其在生物传感、药物递送和纳米医学等领域的工程应用前景 将OMPs从结构研究对象提升为可工程化的精准生物分子设计平台,并系统整合了其从基础发现到纳米治疗应用的全链条发展 作为综述文章,未提出新的实验数据或具体技术方案,主要基于现有文献进行整合分析 探讨外膜β-桶状蛋白的结构功能特性及其在生物工程与纳米治疗领域的应用潜力 革兰氏阴性细菌、线粒体和叶绿体中的跨膜β-桶状外膜蛋白(OMPs) 结构生物学与合成生物学 NA 冷冻电镜(cryo-EM)、核磁共振(NMR)、分子动力学模拟(MD simulations)、AlphaFold NA 结构数据、生物化学数据、相互作用组数据 NA 理性设计工程 革兰氏阴性细菌、线粒体、叶绿体 生物传感器、药物递送系统、诊断平台 医学、合成生物学、纳米医学、生物传感、诊断
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