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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1221 | 2026-04-16 |
Comprehensive genomic analysis reveals the class II diterpene cyclases in Dodonaea viscosa
2026-Jul, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2026.114886
PMID:41881186
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研究论文 | 本文通过基因组测序和注释,揭示了药用植物Dodonaea viscosa中二类二萜环化酶的发现与生化特性,为合成生物学规模化生产生物活性二萜类化合物提供了基础 | 首次报道了Dodonaea viscosa的核基因组草图及完整叶绿体和线粒体基因组序列,并鉴定出两个新的二类二萜环化酶DvCPS和DvKPS,催化形成labdane和clerodane二萜类生物活性化合物的前体 | NA | 阐明Dodonaea viscosa中生物活性二萜类化合物的生物合成途径,以支持通过合成生物学实现规模化生产 | 药用植物Dodonaea viscosa及其基因组序列和二萜环化酶 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生化表征 | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1222 | 2026-04-16 |
Stomata as a Defence Nexus: Integrating Drought and Pathogen Stress Signalling
2026-Apr-14, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70542
PMID:41982084
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综述 | 本文综述了植物气孔在协调病原体入侵和干旱胁迫响应中的双重防御角色,强调了在复合压力下气孔动态的协同与拮抗机制 | 将气孔视为防御中枢,整合干旱和病原体胁迫信号,揭示了复杂的信号网络交叉对话,并探讨了工程化优化气孔响应以增强作物抗逆性的前沿方向 | 未解决防御与生长之间的权衡、信号通路干扰以及组织特异性功能冗余等关键问题 | 研究气孔在整合干旱和病原体胁迫信号中的防御作用,以增强作物对气候变化的复合胁迫抗性 | 植物气孔及其在胁迫响应中的功能 | 植物生物学 | NA | 单细胞测序、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 1223 | 2026-04-16 |
Bacterial Extracellular Vesicles in Biomedical Research and Clinical Translation
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70350
PMID:41968466
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综述 | 本文综述了细菌胞外囊泡在生物医学研究和临床转化中的应用、工程化策略及面临的挑战 | 系统总结了利用分子与合成生物学技术(如基因操作、表面功能化、糖工程和模块化展示技术)对bEVs进行定向生物工程改造的最新进展,以生产具有增强安全性、稳定性、靶向精度和功能多样性的定制化bEVs | 指出bEVs技术转化仍面临可扩展性、安全性、标准化和监管框架等关键挑战 | 探讨细菌胞外囊泡在生物医学领域的应用潜力及临床转化前景 | 细菌胞外囊泡 | NA | NA | 基因操作、表面功能化、糖工程、模块化展示技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 1224 | 2026-04-16 |
Overriding Bioprocess Perturbations With a Cell-Machine Interface for Reliable Microbial Stress-Response Control
2026-Apr, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70329
PMID:41973552
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研究论文 | 本研究开发了一种细胞-机器接口系统(Segregostat),用于在工业生物反应器扰动条件下可靠控制微生物的应激响应 | 首次在工业生物反应器典型扰动条件下评估并验证了Segregostat系统对微生物应激响应的鲁棒控制能力 | 研究仅针对大肠杆菌和酿酒酵母两种模式生物,未在更广泛的工业菌株或复杂共培养体系中验证 | 开发在工业生物过程扰动条件下可靠控制微生物应激响应的细胞-机器接口系统 | 大肠杆菌(Escherichia coli)和酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的通用应激响应 | 合成生物学 | NA | 规模缩小生物反应器实验、自动化流式细胞术 | NA | 流式细胞术数据、生物过程参数 | NA | 细胞-机器接口 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 应激响应控制系统(Segregostat) | 工业生物技术 |
| 1225 | 2026-04-16 |
Heterologous expression of Vibrio natriegens transporters enhances the growth of Escherichia coli and Bacillus subtilis on glutamate
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2026.100264
PMID:41982386
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研究论文 | 本研究通过异源表达Vibrio natriegens的谷氨酸转运蛋白,有效提升了Escherichia coli和Bacillus subtilis在谷氨酸碳源上的生长速率 | 首次发现跨物种底物转运蛋白可改变细菌细胞资源分配,为调控微生物生物量生长提供了新的遗传策略 | NA | 探索通过异源表达转运蛋白改善细菌在特定碳源上生长性能的方法 | Escherichia coli和Bacillus subtilis两种细菌 | 合成生物学 | NA | 异源表达技术 | NA | 生长实验数据 | NA | 异源表达系统 | Escherichia coli, Bacillus subtilis | 谷氨酸转运蛋白表达系统 | 工业生物技术 |
| 1226 | 2026-04-16 |
Advances in polyethylene biodegradation and bioconversion: Microbial, enzymatic, and biotechnological insights
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100255
PMID:41982382
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综述 | 本文系统总结了聚乙烯(PE)生物降解与生物转化的最新进展,包括降解效率评估方法、微生物与酶的降解机制、已鉴定的微生物与酶资源,以及增强降解效率的物理化学策略与生物方法的整合 | 将合成生物学和机器学习等前沿生物技术工具与传统生物降解方法相结合,以加速PE降解速率并实现更可持续的塑料废物管理 | NA | 开发可持续的解决方案以缓解顽固性聚烯烃(如聚乙烯)对环境造成的负担 | 聚乙烯(PE)塑料 | NA | NA | 生物降解、生物转化、合成生物学、机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 1227 | 2026-04-16 |
Genetically encoded biosensors enabled high-throughput screening of microbial cell factories
2026-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100258
PMID:41982388
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综述 | 本文综述了基因编码生物传感器在高通量筛选微生物细胞工厂中的应用、关键特征、工程策略及优化挑战 | 系统总结了生物传感器在高通量筛选中的关键性能特征,并详细阐述了通过合成生物学策略对生物传感器进行工程改造的最新进展 | NA | 为开发用于高通量筛选的基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂优化中的应用提供全面指导 | 基因编码生物传感器及其在微生物细胞工厂高通量筛选中的应用 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选(HTS)、合成生物学策略 | NA | NA | NA | 合成生物学策略 | 微生物细胞工厂 | 生物传感器(用于检测天然与非天然产物) | 工业生物技术 |
| 1228 | 2026-04-15 |
Benchmarking genetic elements for high-level protein expression using a novel Marchantia polymorpha transient expression system
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151715
PMID:41911994
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研究论文 | 本研究开发了一种基于农杆菌的瞬时表达系统,用于快速评估地钱中的遗传元件,并系统性地比较了多种启动子、终止子和信号肽的性能 | 开发了首个用于地钱的高通量瞬时表达系统,可在8天内完成实验,显著提高了遗传元件表征的效率,并发现了一个截短的CaMV35S启动子变体,其活性比标准版本提高了409倍 | NA | 开发并验证一种快速高效的瞬时表达系统,以扩展地钱的遗传工具包并提高蛋白质表达水平 | 地钱(Marchantia polymorpha)中的遗传元件,包括启动子、终止子和信号肽 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达系统 | NA | 蛋白质表达数据 | 21个启动子、15个终止子和7个信号肽 | 农杆菌介导的转化 | 地钱(Marchantia polymorpha) | NA | 农业 |
| 1229 | 2026-04-15 |
Valorization of ligustrum species: biosynthesis, metabolic engineering, and pharmacology of bioactive compounds
2026-Mar-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01042-3
PMID:41888324
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综述 | 本文综述了女贞属植物的生物活性化合物、药理特性、组学分析及生物合成研究进展,并提出整合多组学、合成生物学和绿色制造以实现其全植物价值化和种质资源保护的策略 | 提出整合多组学、合成生物学和绿色制造的综合性方法,以促进女贞属植物的全植物价值化和可持续利用,为药用资源开发提供新的理论框架和技术范式 | NA | 建立女贞属植物作为药用资源的全面开发和可持续利用的理论框架与技术范式 | 女贞属植物及其生物活性化合物(如三萜类、苯乙醇苷类、黄酮类等) | NA | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药、农业、环境、食品 |
| 1230 | 2026-04-15 |
Label-Free Microfluidic Modulation Spectroscopy Monitors RNA Origami Structure and Stability
2026-Mar-16, Biosensors
DOI:10.3390/bios16030166
PMID:41892058
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研究论文 | 本研究采用微流控调制光谱技术,作为无标记的结构生物传感器,用于监测RNA折纸的结构与稳定性 | 首次将微流控调制光谱技术应用于RNA折纸的结构分析,实现了对RNA碱基和碱基对在1760-1600 cm⁻¹振动指纹区的无标记、高通量检测 | NA | 开发一种可扩展的、溶液相的RNA折纸结构监测方法,以评估其设计架构、成熟过程及稳定性分布 | RNA折纸结构,特别是六螺旋束带扣的RNA折纸模型 | 合成生物学 | NA | 微流控调制光谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | RNA折纸作为支架用于生物传感、合成生物学和纳米医学 | 生物传感, 合成生物学, 纳米医学 |
| 1231 | 2026-04-14 |
Incoherent feedforward loop dominates the robustness and tunability of necroptosis biphasic, emergent, and coexistent dynamics
2026-Mar, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.02.009
PMID:41971832
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研究论文 | 本研究通过建模分析,揭示了坏死性凋亡信号通路中RIP1-RIP3-Caspase-8非相干前馈环作为核心拓扑结构,主导双相、涌现和共存动力学的鲁棒性与可调性 | 首次引入潜在景观和香农熵量化坏死性凋亡共存动力学的不确定性,并系统筛选出实现BEC动力学的最小电路拓扑,确认非相干前馈环的核心作用 | 研究基于电路建模和理论分析,实验验证可能有限,且主要关注三节点电路,可能未涵盖更复杂网络 | 探究坏死性凋亡信号通路中双相、涌现和共存动力学的电路结构基础与调控机制 | 坏死性凋亡信号通路中的RIP1、RIP3和Caspase-8蛋白及其相互作用网络 | 合成生物学 | 细胞死亡相关疾病 | 电路建模、网络拓扑分析、随机电路分析、潜在景观和香农熵计算 | NA | 理论模型数据 | NA | NA | NA | 非相干前馈环嵌入RIP3对RIP1的正反馈,以及RIP3自磷酸化的钟形调节 | 医学 |
| 1232 | 2026-04-13 |
INVITED REVIEW: Turning Dairy Food Waste into Valuable Products via Yeast Bioproduction
2026-Apr-09, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27900
PMID:41966398
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综述 | 本综述探讨了如何通过酵母生物生产将乳制品食物废物转化为高价值产品 | 强调了利用酵母发酵,特别是乳糖发酵酵母和酿酒酵母,将乳制品废物转化为增值产品的策略,并讨论了新兴的菌株工程和合成生物学方法 | 面临工业优选酵母无法天然代谢乳糖、废物成分多变、微生物污染以及经济、物流和监管障碍等挑战 | 旨在减少乳制品食物废物,回收营养物质,降低温室气体排放,并支持乳制品行业的循环经济 | 乳制品食物废物,特别是奶酪乳清及其衍生物 | NA | NA | 酵母发酵,菌株工程,适应性进化,合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酵母,包括乳糖发酵酵母物种和酿酒酵母 | NA | 农业,环境,工业生物技术 |
| 1233 | 2026-04-11 |
Engineering chaperone/usher pathway pili for surface display: Structural constraints, design principles, and biotechnological potential
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108865
PMID:41819295
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综述 | 本文系统分析了基于伴侣蛋白/菌毛组装蛋白(CU)途径菌毛的细菌表面展示平台的结构约束、设计原则及生物技术潜力 | 通过统一的结构框架重新解读先前的展示策略,提炼出定义工程可塑性的保守设计原则,并提出了将CU菌毛扩展为多功能可调表面展示平台的实用工程方法 | NA | 为评估可行性及指导CU菌毛展示系统的理性工程提供结构引导的框架 | 大肠杆菌、沙门氏菌和鼠疫耶尔森菌中结构特征明确的CU菌毛 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测 | NA | 结构数据 | NA | NA | 革兰氏阴性细菌 | 细菌表面展示平台 | 生物技术 |
| 1234 | 2026-04-11 |
Engineering cis- and trans-acting RNA regulators for next-generation prokaryotic synthetic biology
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108882
PMID:41921585
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综述 | 本文综述了用于下一代原核合成生物学的顺式和反式RNA调控器,强调了它们在基因表达控制中的工程应用 | 提出了一个面向工程师的框架,围绕转录终止、翻译起始和mRNA稳定性三个可操作控制点,整合计算和AI辅助建模以提升可预测性和可移植性 | 主要基于大肠杆菌为中心的实施,可能在其他原核生物中的适用性有限 | 推动RNA调控成为下一代原核合成生物学中常规、可工程化的控制层 | 原核生物(如细菌)中的RNA调控器 | 合成生物学 | NA | RNA调控技术,包括5' UTR和RBS工程、核糖开关、核酶、合成小RNA和基于CRISPR的RNA靶向工具 | NA | NA | NA | CRISPR, 核糖开关, 核酶 | 大肠杆菌 | 顺式和反式RNA调控器,用于构建复杂和响应性细菌系统,如逻辑门和生物传感器 | 工业生物技术 |
| 1235 | 2026-04-11 |
Engineering synthetic biology sensors with artificial intelligence: From programmable circuits to next-generation biosensing
2026 Jul-Aug, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108874
PMID:41881285
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综述 | 本文系统综述了人工智能如何推动合成生物学传感器从理性设计向AI驱动预测的转变,并提出了一个连接AI算法与DBTL周期的框架 | 首次建立了AI算法与DBTL周期的系统性框架,并提出了AI驱动工作流的三个核心前沿:AI引导的传感器元件设计、AI辅助的信号处理以及AI驱动的闭环优化 | 存在“现实差距”和“小数据困境”等未解决的障碍 | 探讨人工智能在合成生物学传感器设计与优化中的应用,推动其向稳健、可部署的智能传感系统发展 | 合成生物学传感器 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 生物传感器、逻辑门、振荡器 | 环境、医学、食品安全、工业生物技术 |
| 1236 | 2026-04-11 |
Analysis and engineering of quorum sensing-based communications between bacteria and fungi
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03838-25
PMID:41801051
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综述 | 本文综述了基于群体感应的细菌与真菌间通讯机制,分析了其在微生物网络组装和生态系统功能中的作用,并探讨了通过合成生物学策略重新编程这些相互作用的工程化前景 | 首次系统性地总结和分析了细菌与真菌间基于群体感应的跨物种通讯机制,并对比了自然范式与合成生物学设计策略,为模块化控制微生物群落提供了蓝图 | 该领域现有认识仍较为零散,缺乏系统性总结,且对某些特定环境或物种组合的相互作用机制理解尚不深入 | 全面分析和工程化改造基于群体感应的细菌与真菌间通讯,以促进对复杂微生物相互作用的解析并增强工程化微生物群落的能力 | 细菌与真菌间的群体感应通讯系统及其介导的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 启动子工程, 定向进化 | 细菌, 真菌 | 群体感应系统, 生物传感器 | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 1237 | 2026-04-10 |
Exploring Azotobacter: a nitrogen-fixing microorganism as a powerhouse for sustainable and green ammonia synthesis
2026-Apr-02, Journal of applied microbiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jambio/lxag083
PMID:41880483
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综述 | 本文综述了利用固氮微生物Azotobacter vinelandii进行可持续绿色氨合成的潜力、机制及工程化策略 | 系统阐述了A. vinelandii在有氧条件下固氮的独特生理遗传适应机制,并探讨了通过合成生物学和代谢工程将其改造为工业级氨合成底盘生物的创新路径 | NA | 探索利用生物固氮技术替代高能耗Haber-Bosch工艺,实现可持续氨合成的可行性 | Azotobacter vinelandii及其固氮酶系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、光生物催化、生物电化学 | NA | NA | NA | NA | Azotobacter vinelandii | 固氮酶表达调控系统、氧保护机制工程化 | 农业, 能源, 工业生物技术 |
| 1238 | 2026-04-10 |
Cellular and viral RNA polymerases: evolutionary insights into eukaryotic origins
2026-Apr, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.11.008
PMID:41350153
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综述 | 本文综述了核质大DNA病毒(NCLDVs)编码的多亚基RNA聚合酶(msRNAPs)与真核生物RNA聚合酶的进化关系,探讨病毒在真核生物起源中的作用 | 通过系统发育和结构研究揭示NCLDV RNAP催化核心与真核生物RNAP的深层进化联系,提出病毒驱动RNAP进化的新假说,将病毒视为进化合作者 | NA | 探讨NCLDV RNA聚合酶与真核生物RNA聚合酶的进化关系,评估病毒在真核生物起源中的角色 | 核质大DNA病毒(NCLDVs)和真核生物的RNA聚合酶 | 进化生物学 | NA | 系统发育分析、结构研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1239 | 2026-04-10 |
Advancing the frontier of plant-based therapeutics: critical innovations in molecular farming and bioprocess Integration
2026-Mar-23, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-026-03723-7
PMID:41870756
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综述 | 本文综述了植物分子农业在生物制药和高价值生物分子生产中的最新进展,包括遗传转化、蛋白质表达、糖基工程和下游加工的创新方法 | 介绍了CRISPR/Cas9介导的途径编辑、优化蛋白质产量和质量的合成生物学框架,以及提高纯化效率的集成生物加工解决方案等新方法 | NA | 指导研究人员开发更有效和可扩展的植物分子农业应用 | 植物分子农业中的生物制药和高价值生物分子生产 | NA | NA | CRISPR/Cas9, 合成生物学, 集成生物加工 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | 植物系统 | 合成生物学框架 | 医药 |
| 1240 | 2026-04-10 |
Expression of nano-engineered RNA organelles in bacteria
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69336-w
PMID:41688461
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研究论文 | 本文利用RNA纳米技术在E. coli中设计并表达非天然的无膜细胞器,通过分支RNA基序的共转录组装实现正交、非混合的凝聚体,并嵌入蛋白质结合适体实现选择性蛋白质招募 | 采用RNA纳米技术设计合成生物分子凝聚体,实现算法控制相互作用、客户亲和力及凝聚体微结构,相比基于肽构建块或重复RNA序列的现有方案更具创新性 | NA | 设计合成生物分子凝聚体以模拟天然无膜细胞器功能,并应用于细胞和代谢工程 | E. coli中的合成无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | E. coli | 基于分支RNA基序通过碱基配对相互作用组装的无膜细胞器,具有蛋白质结合适体嵌入功能 | 工业生物技术 |