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当前共找到 1812 篇文献，本页显示第 1261 - 1280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1261 | 2026-06-02 |
Enhanced tRNA array method version 2 for simultaneous in vitro synthesis of 21 tRNAs
2026-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2026.03.014
PMID:42025521
|
研究论文 | 开发了改进版tRNA阵列方法，实现21种tRNA的同步体外合成 | 通过序列修饰和引入前导序列，解决了原tRNA阵列方法中特定tRNA组限制翻译活性的问题 | NA | 提高tRNA阵列方法的翻译活性，使之与单独制备tRNA的性能相当 | tRNA阵列方法及翻译活性受限的tRNA组 | 合成生物学 | NA | 体外转录与翻译，序列修饰 | NA | NA | NA | NA | NA | tRNA阵列，包含前导序列的基因表达系统 | 合成生物学，生物技术 |
| 1262 | 2026-06-02 |
Tailored base editing toolkits for functional genomics and metabolic engineering in the halophile Salinivibrio
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.012
PMID:42031218
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研究论文 | 开发了适用于嗜盐菌Salinivibrio的碱基编辑工具包，用于功能基因组学和代谢工程 | 首次在非模式嗜盐菌中开发高效的碱基编辑平台，实现单、双、三位点替换，以及新型融合蛋白实现协同双碱基编辑 | 未提及在更广泛嗜盐菌中的适用性或长期稳定性 | 开发高效遗传工具以促进嗜盐菌的工业应用 | 嗜盐菌Salinivibrio sp. TGB4 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑 | NA | NA | NA | ABE, CBE, PmCDA-TadA8e-nCas9-UGI | Salinivibrio sp. TGB4 | 碱基编辑工具，包括腺嘌呤和胞嘧啶碱基编辑器及协同双碱基编辑器 | 工业生物技术 |
| 1263 | 2026-06-02 |
Engineering AraC L9K for inducer-independent pBAD activation in Salmonella Gallinarum
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.019
PMID:42061758
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研究论文 | 通过在肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌中结合宿主基因组修饰和定点诱变，生成不依赖诱导剂的AraC变体L9K，实现pBAD启动子的组成型高表达 | 首次在沙门氏菌中通过L9K单点突变获得不依赖阿拉伯糖的AraC组成型激活变体，且与常用pBAD载体兼容，避免了代谢负担 | NA | 开发不依赖外源诱导剂的AraC-pBAD表达系统，用于微生物制造和合成生物学应用 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 合成生物学 | NA | 定点诱变，基因敲除，结构建模 | NA | NA | NA | 靶向诱变 | 肠炎沙门氏菌血清型鸡伤寒沙门氏菌 | 不依赖诱导剂的组成型基因表达系统 | 工业生物技术，医学，合成生物学 |
| 1264 | 2026-06-02 |
Synthetic biology-driven innovations in triple-negative breast cancer: Integrating engineering design with targeted therapeutics
2026-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.04.017
PMID:42082082
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综述 | 综述合成生物学驱动的三阴性乳腺癌精准诊疗工程化策略 | 系统整合合成生物学与工程化设计原理，涵盖细胞工程、微生物工程和核酸工程三大类策略，并提出联合免疫肿瘤学与精准医学克服肿瘤异质性和耐药性的协同潜力 | 未提及具体临床转化障碍或体内验证数据，理论框架多于实验证据 | 总结合成生物学方法在三阴性乳腺癌中的最新进展，探索下一代自适应个性化治疗方案 | 三阴性乳腺癌（TNBC） | 合成生物学 | 三阴性乳腺癌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因回路 | 医学 |
| 1265 | 2026-06-02 |
Powering next-generation precision therapeutics through integrated synthetic transcriptional systems
2026-May-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117308
PMID:42035420
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综述 | 综述整合合成转录系统在精准治疗中的应用进展，涵盖启动子工程、模块化转录因子设计和人工智能辅助的理性设计 | 从经验试错转向理性预测设计，通过人工智能辅助实现了合成启动子和转录因子的协同整合，支持多输入感知、可调表达和高正交性 | 未明确讨论系统在体内应用的长期稳定性和免疫原性等潜在问题 | 推动合成转录系统在哺乳动物精准治疗中的应用，增强治疗精确性并减少脱靶效应 | 合成启动子与合成转录因子的整合系统 | 合成生物学 | 复杂疾病 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 逻辑门、反馈回路、可调系统 | 医学 |
| 1266 | 2026-06-02 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-01-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
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综述 | 综述了液-液相分离驱动生物分子凝聚体形成的分子机制、设计策略及其在合成生物学中的转化前景 | 将液-液相分离原理从细胞组织引申至合成平台，系统归纳了利用内在无序蛋白、模块化互作基序和RNA支架设计功能性凝聚体的策略 | 未涉及合成凝聚体在体内复杂环境中的长期稳定性及潜在脱靶效应 | 总结液-液相分离介导的凝聚体分子机制与工程设计方法，促进细胞生物物理学与生物工程的交叉研究 | 液-液相分离形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | 合成凝聚体（用于增强催化、代谢控制、靶向药物递送和生物传感） | 医学, 工业生物技术 |
| 1267 | 2026-06-02 |
Chemically synthesized high-fidelity oligos ≤ 600 nt as building blocks to accelerate complex gene construction in synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag005
PMID:42222009
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研究论文 | 报道一种名为UCOS的新型平台，用于高效合成长度≤600个核苷酸、具有复杂重复序列和碱基分布不均特征的高保真寡核苷酸 | 采用非多孔硅微球替代传统可控孔玻璃作为固相载体，结合5'侧翼序列杂交的全长富集和错误去除酶，显著提升复杂超长寡核苷酸的合成保真度 | NA | 开发能够高效合成复杂、超长DNA片段的方法，以支持合成生物学和基因工程应用 | 超长复杂寡核苷酸（≤600 nt），包括串联重复序列和碱基分布不均的序列 | 合成生物学 | NA | UCOS（超长复杂寡核苷酸合成） | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、合成基因组学 |
| 1268 | 2026-06-01 |
Dual-promoter control of gene expression: from transcriptional fine-tuning to antibiotic resistance
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102747
PMID:41903510
|
综述 | 综述微生物中双启动子调控基因表达的策略及其在抗生素耐药性预测和合成生物学中的应用 | 系统总结了双启动子结构在微生物中的组合调控机制，并探讨其在抗生素应激传感及耐药性机制预测中的新应用 | 未提供具体的实验数据或定量分析，主要基于文献综述，缺乏对直接因果关系验证的深入讨论 | 阐明双启动子调控基因表达的机制及其在微生物中作为生物传感器和合成生物学工具的应用价值 | 微生物（包括细菌和真菌）中的双启动子调控系统 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 双启动子逻辑门、生物传感器、合成基因回路 | 医学, 工业生物技术 |
| 1269 | 2026-06-01 |
Evolutionary insights and guidelines to achieve effective and high-yield non-ribosomal peptide and polyketide engineering
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102755
PMID:41967291
|
综述 | 综述了基于进化原理和数据集进行非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程改造的指导原则，以实现高效高产的产物生成 | 从依赖结构数据的工程策略转向融合进化见解和数据集，优化重组边界选择并提高工程通量，为抗生素发现和生产提供新指导 | 没有一种工程策略在减少产量损失方面显著最优，且重组装配线普遍存在产量受损问题 | 探索通过进化原理指导酶工程改造以实现高产且有效的非核糖体肽和聚酮化合物生产 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶装配线 | 合成生物学 | NA | NRPS和PKS工程改造，meta-analysis | NA | 已发表的研究结果 | 综述了多项已发表的工程改造研究结果，未具体说明样本数量 | NA | NA | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶装配线重组 | 药物，工业生物技术 |
| 1270 | 2026-06-01 |
From known knowns to unknown unknowns: synthetic biology paths to antimicrobial discovery
2026-Jun, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102759
PMID:42066660
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研究论文 | 提出一个以合成生物学为中心的框架，用于绘制抗菌天然产物沿化学新颖性和工程可及性两个轴线的图谱 | 通过两个轴线（化学新颖性和工程可及性）引入四象限框架，将天然产物从已知已知扩展到未知未知，并强调象限的动态性，为合成生物学策略提供新视角 | NA | 开发一个基于合成生物学的框架，以指导抗菌天然产物的发现和工程化，应对耐药性挑战 | 抗菌天然产物及其化学结构 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1271 | 2026-06-01 |
Beyond natural evolution: multi-scale in vivo mutagenesis toolkits for synthetic evolution
2026-May-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.05.008
PMID:42218072
|
综述 | 本文综述了按突变规模分类的最新体内诱变工具包，包括全基因组、中等规模和位点特异性诱变，并讨论了其在合成进化中的应用 | 按突变规模（全基因组、中等规模、位点特异性）对体内诱变工具包进行分类，并分析各规模下的机制、能力及局限性 | 当前技术的局限性如脱靶效应、筛选效率不足等被提及，同时指出下一代基因编辑技术、高通量筛选和人工智能的潜力尚未完全开发 | 系统阐述合成进化中多尺度体内诱变工具包的最新进展和应用场景 | 生物分子和生物体（如工业微生物、药用菌株等） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas工程, DNA合成 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, DNA合成 | NA | 连续体内诱变系统 | 工业生物技术, 医学, 农业 |
| 1272 | 2026-06-01 |
Virtual cell: Current perspectives and future prospects
2026-May, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/03000605261425080
PMID:42200280
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综述 | 本文综述了虚拟细胞技术在多学科融合、平台发展和应用潜力方面的当前进展与未来展望 | 提出虚拟细胞技术作为整合生物学、计算机科学和人工智能的综合方法，并探讨了其在跨物种模拟、量子计算和多学科协作中的新兴应用前景 | 包括数据整合难度、模型可解释性不足和计算成本高等挑战 | 介绍虚拟细胞技术的现状、应用领域及未来发展方向 | 虚拟细胞技术及其在精准医学、药物发现和合成生物学中的应用 | 机器学习 | NA | 单细胞测序, 亚细胞成像 | NA | 图像 | NA | NA | NA | 虚拟细胞模拟平台（如E-Cell和CellPACK） | 医学, 药物发现, 合成生物学 |
| 1273 | 2026-06-01 |
Designing synthetic regulatory elements using the generative AI framework DNA-Diffusion
2026-Jan, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02441-6
PMID:41437153
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研究论文 | 介绍了DNA-Diffusion，一种基于生成式人工智能的框架，用于设计具有细胞类型特异性的紧凑调控元件 | 利用机器学习基于多种细胞系的DNA可及性数据生成200碱基对的合成调控元件，重构内源转录因子结合语法，并增强细胞类型特异性 | 未提及在体内长期稳定性或脱靶效应的评估 | 开发生成式AI方法以设计用于精确基因表达控制的调控元件 | 合成调控元件及其在不同细胞系中的功能验证 | 合成生物学 | 白血病 | STARR-seq, EXTRA-seq | 生成式人工智能框架 | DNA可及性数据 | 5,850个元件的STARR-seq文库，在三种细胞系中验证 | NA | 人类细胞系 | 合成调控元件 | 医学, 基因治疗 |
| 1274 | 2026-05-31 |
Unconditional de novo generation and functional validation of synthetic promoters with a diffusion model
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.04.023
PMID:42212299
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研究论文 | 提出一种名为DiPro的无条件扩散模型，用于从头生成合成启动子序列，并通过实验验证其功能 | 首次将无条件扩散模型应用于启动子设计，无需条件输入即可生成新序列，结合inpainting引导生成相位特异性启动子，实现了高结构保真度和功能验证 | 研究仅聚焦于50-bp核心启动子区域，未探索更长的调控区域；实验验证仅基于大肠杆菌，通用性需进一步验证 | 开发一种生成式框架，用于创建具有可编程时序动力学的功能性细菌启动子 | 细菌启动子序列（合成启动子） | 机器学习 | 不适用 | 扩散模型 | Transformer | 序列 | 5000个候选启动子序列，其中81个经实验验证 | 不适用 | 大肠杆菌 | 相位特异性启动子驱动的裂解蛋白回路 | 合成生物学, 代谢工程 |
| 1275 | 2026-05-31 |
Defense-associated reverse transcriptases define an emerging class of noncanonical DNA-writing systems
2026-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.05.001
PMID:42212300
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综述 | 防御相关逆转录酶定义了新兴的非经典DNA写入系统类别 | 揭示DRT不仅仅是RNA到DNA的复制蛋白，而是作为DNA构建模块，能够生成多种非经典DNA产物，包括从头基因组装cDNA、随机单链DNA、DNA同聚物、富含poly(A)的cDNA和蛋白模板化二核苷酸重复DNA，并展示了RNA模板化与蛋白模板化合成在单一防御途径中的结合机制 | 具体局限性未在摘要中提及，可能包括对DRT酶新型反应机制的全面理解仍处于早期阶段，以及其生物学功能和生态意义尚未完全阐明 | 阐明防御相关逆转录酶作为DNA写入系统的机制，探索其在合成生物学和核酸工程中的潜在应用 | 细菌的防御相关逆转录酶（DRTs），特别关注DRT3的合成途径 | 机器学 | NA | 逆转录技术、DNA合成 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 非经典DNA写入系统（包括从头基因组装、随机单链DNA生成、DNA同聚物合成等） | 合成生物学，核酸工程 |
| 1276 | 2026-05-31 |
Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction
2026-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015
PMID:40939890
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研究文章 | 通过机器学习模型BT预测转录因子BmoR的关键残基区域，实现严格正交生物传感器设计，最大化可再生生物燃料的过量生产 | 首次利用机器学习模型BT预测三个关键残基区域，结合半理性工程改造BmoR突变体实现严格信号分子正交性，并建立TF-SM氢键计数主导作用的框架 | 该研究中BT模型的预测准确率为88.5%，可能存在预测误差；实验仅限于BmoR和四种信号分子，通用性尚待验证 | 通过机器学习指导的转录因子进化，实现严格正交生物传感器设计，提高可再生生物燃料产量 | 转录激活因子BmoR及其与信号分子的相互作用 | 机器学习 | NA | 机器学习, 随机森林算法, Discovery Studio分子模拟, 微量热泳动(MST)亲和力测定, 半理性工程 | 随机森林模型 | 分子模拟数据, 实验验证数据 | 245个TF-SM复合物用于训练和测试，5700个BmoR突变体与4种信号分子模拟得到22800个复合物 | NA | 微生物（未具体指明） | 基于BmoR的正交生物传感器 | 合成生物学, 代谢工程, 能源 |
| 1277 | 2026-05-31 |
From transport to regulation: systems engineering for high-efficiency dicarboxylic acid biosynthesis
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103499
PMID:42034010
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综述 | 本文综述了通过酶工程、系统代谢工程和合成生物学方法提高中长链二元酸生物合成效率的策略 | 重点强调了疏水底物跨膜转运机制增强和新型转运蛋白挖掘，以及针对关键酶（如细胞色素P450）的蛋白质工程策略，包括理性设计、融合表达和新型二聚化技术 | 主要受限于低质量传递效率、关键氧化酶系统不稳定和细胞代谢失衡等瓶颈 | 为中长链二元酸的高效和可持续生物制造提供理论指导 | 中长链二元酸生物合成系统和相关酶（如细胞色素P450） | 合成生物学 | NA | 酶工程、系统代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 蛋白质工程、融合表达、二聚化技术 | NA | 反向β氧化循环、辅因子再生和能量代谢重编程 | 工业生物技术、材料 |
| 1278 | 2026-05-31 |
Bacillus methanolicus as an emerging platform for energy-efficient biomanufacturing from one-carbon and marine resources
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103500
PMID:42056785
|
综述 | 本文综述了嗜热甲醇芽孢杆菌作为一种新兴的生物制造平台，能够高效利用甲醇和甘露醇进行可持续化学生产 | 强调了该菌株在热生长、海水适应性和能量高效甲醇同化途径方面的固有优势，并总结了合成生物学工具的最新进展以实现理性菌株工程 | 讨论了从甲醇和甘露醇进行生物制造面临的挑战，但未深入量化实际瓶颈 | 探讨嗜热甲醇芽孢杆菌作为连接一碳和海洋衍生底物与可持续化学合成的多功能平台的潜力 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 嗜热甲醇芽孢杆菌 | 甲醇和甘露醇代谢路径 | 工业生物技术 |
| 1279 | 2026-05-31 |
The convergence of AI-driven engineering biology and emerging technologies advancing globally networked autonomous biofoundries
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103503
PMID:42068969
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综述 | 本文概述了人工智能驱动工程生物学与新兴技术的融合，推动全球网络化自主生物工厂的发展 | 提出AI驱动的全自主生物工厂概念，整合计算设计、自动化制造和数据驱动学习，实现自我改进的设计-构建-测试-学习循环 | NA | 综述塑造AI驱动合成生物学的技术，强调其与自动化、数字化和小型化的融合趋势 | AI驱动的合成生物学技术，包括全细胞建模、数字孪生及自动化生物工厂 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1280 | 2026-05-31 |
Systems-level regulation principles for microbial lignin valorization
2026-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103479
PMID:41875688
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综述 | 系统总结微生物木质素增值的调控原理，涵盖代谢调控、转录因子调控和动态生物传感器调控 | 首次从系统层面整合代谢调控、转录因子工程和动态传感器调控，提出提升木质素生物转化效率的集成框架 | 未涉及具体实验验证，且对工业规模化应用的挑战分析有限 | 阐述微生物木质素增值的系统级调控原理 | 微生物细胞工厂及木质素衍生的芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、环境 |