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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2026-03-08 |
DNA Framework-Encoded Digital Recorder for Bacterial Discrimination
2026-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01091
PMID:41738382
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研究论文 | 本文开发了一种基于DNA框架的位置编码系统(DFDR),用于同时区分多个核酸序列,并应用于细菌鉴别 | DFDR系统通过三角形DNA框架实现位点特异性功能化,单单元可同时解析18个核酸靶标,比传统DNA自组装系统提高6倍多重检测能力,支持时序控制和可重写记录 | NA | 开发一种高分辨率追踪多重分子信息的系统,用于细菌鉴别和诊断 | 核酸序列(包括16S rRNA混合物)和临床相关呼吸道病原体 | 合成生物学 | 呼吸道感染 | DNA框架自组装 | NA | 核酸序列数据 | 医院环境和自然河水样本 | NA | NA | 位置编码系统(DFDR),基于三角形DNA框架设计 | 医学诊断、环境监测 |
| 1342 | 2026-03-08 |
From prebiotics to engineered microbes: microbe-inspired treatments for atopic dermatitis
2026-02-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf451
PMID:41231731
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综述 | 本文综述了针对特应性皮炎(AD)的皮肤微生物组靶向治疗方法,包括微生物移植、益生元、益生菌和后生元,并展望了利用合成生物学工程化皮肤细菌作为下一代益生菌的潜力 | 提出了利用合成生物学工程化皮肤微生物作为活体生物治疗产品的创新视角,以按需产生AD治疗药物 | NA | 探讨通过调节皮肤微生物组来减少AD感染和炎症的治疗策略 | 特应性皮炎(AD)及其相关的皮肤微生物组,特别是金黄色葡萄球菌 | NA | 特应性皮炎 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 皮肤微生物组中的细菌 | 能够感知皮肤信号(如免疫信号)和环境因素,并按需产生AD治疗药物的合成生物电路 | 医学 |
| 1343 | 2026-03-08 |
The cell biologist's guide to detecting and modulating membrane phospholipids
2026-Feb-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202508058
PMID:41481227
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综述 | 本文为细胞生物学家提供了检测和调控膜磷脂的实用工具指南,旨在将脂质生物学融入主流细胞生物学实验 | 系统性地将脂质生物学工具整合到分子细胞生物学家熟悉的实验框架中,包括荧光成像、药理学调控、合成生物学平台和光遗传学系统 | 部分方法仍存在技术难度,且作为综述文章未提出原始实验数据 | 为细胞生物学家提供检测和调控膜磷脂的实用工具与方法 | 细胞膜磷脂 | 细胞生物学 | NA | 免疫荧光、活细胞成像、药理学抑制、合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | 可诱导脂质生成或降解的合成生物学平台 | 基础生物学研究 |
| 1344 | 2026-03-08 |
Structure, Mutation, Functional Domain Roles and Medical Implications of Glycerol Kinase
2026-Feb, The protein journal
DOI:10.1007/s10930-025-10316-2
PMID:41537922
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综述 | 本文综述了甘油激酶(GK)的结构、突变、功能域作用及其在甘油代谢、能量生产和疾病中的医学意义,并探讨了GK抑制剂的研究现状与开发策略 | 系统整合了GK从基因到翻译后修饰的调控机制,并强调了其在合成生物学和肿瘤发展中的新兴研究领域,同时分析了GK作为疾病靶点的抑制剂开发挑战与策略 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献总结,可能受限于当前研究进展的覆盖范围 | 探讨GK在代谢途径中的关键作用及其与疾病的关联,并评估GK抑制剂作为治疗靶点的潜力 | 甘油激酶(GK)及其在细胞代谢和疾病中的功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1345 | 2026-03-08 |
PIONEER: A periplasmic display platform for synthetic biology-based screening of genetically encoded protein regulators
2026-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
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研究论文 | 本文介绍了PIONEER平台,一种用于合成生物学中遗传编码蛋白调节剂筛选的酵母周质展示系统 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现稳定配体保留和稳健自分泌信号,首次实现基于信号而非仅结合的功能优先筛选 | 尽管已应用于G蛋白偶联受体,但平台可适应更广泛的膜蛋白和可溶性蛋白靶标,具体扩展性未在文中详细验证 | 开发一个模块化平台,用于筛选和研究遗传编码的蛋白调节剂,以直接探究膜蛋白功能 | 肽、蛋白质和纳米抗体,针对人类G蛋白偶联受体等膜蛋白 | 合成生物学 | NA | 酵母周质展示技术 | NA | 遗传序列和蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 自分泌信号系统,用于配体活性和纳米抗体调节剂分类 | 医学, 工业生物技术 |
| 1346 | 2026-03-07 |
SSB-mediated enhancement of argonaute activity triggers SOS filamentation in bacteria
2026-Feb-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag175
PMID:41736547
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研究论文 | 本研究揭示了嗜热栖热菌Argonaute蛋白(TtAgo)在细菌中过表达会通过破坏细胞分裂检查点,引发暂时的细菌丝状化现象 | 首次发现SSB蛋白与TtAgo相互作用,将其招募到复制叉,增强其DNA结合活性,从而调控细菌细胞周期和DNA修复途径 | 研究主要基于模式细菌(嗜热栖热菌和大肠杆菌),在其他细菌中的普适性尚未验证 | 探究原核Argonaute蛋白在细菌生理学中的作用及其调控机制 | 嗜热栖热菌Argonaute蛋白(TtAgo)及其与SSB蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 扫描电子显微镜、核DNA染色、截短蛋白变体分析 | NA | 显微图像、分子相互作用数据 | 嗜热栖热菌和大肠杆菌两种细菌模型 | NA | 嗜热栖热菌, 大肠杆菌 | NA | 合成生物学, 生物技术 |
| 1347 | 2026-03-07 |
Harnessing Endophytic Fungi as a Sustainable Source of Novel Anticancer Agents: Opportunities, Challenges, and Future Directions
2026-Feb-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31040693
PMID:41752469
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综述 | 本文综述了内生真菌作为可持续抗癌药物新来源的潜力、挑战及未来方向 | 强调内生真菌作为结构多样抗癌代谢物的未充分开发来源,并探讨了OSMAC、共培养、表观遗传激活等增强发现和产量的策略 | NA | 探索内生真菌作为可持续、低毒性抗癌药物的来源,以克服现有疗法的局限性 | 内生真菌及其产生的抗癌代谢物(如生物碱、萜类、聚酮化合物和肽类) | NA | 癌症 | OSMAC、微生物共培养、表观遗传激活、基因组挖掘、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 1348 | 2026-03-07 |
CRISPR-Mediated Silkworm: The Oncoming Agricultural Revolutions and a Rising Model Organism
2026-Feb-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17020230
PMID:41751614
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综述 | 本文综述了CRISPR基因组编辑技术在蚕中的应用,强调了其在蚕的疾病抗性、产量提升和新材料开发方面的突破,并探讨了CRISPR、泛基因组学和人工智能交叉领域的新方向 | 将CRISPR技术从简单基因敲除扩展到大规模全基因组筛选,并结合人工智能预测CRISPR结果,为蚕的分子育种和合成生物学提供新方法 | NA | 总结蚕基因组编辑的进展,探讨CRISPR技术在蚕农业和生物制造中的应用前景 | 蚕(家蚕) | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蚕(家蚕) | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 1349 | 2026-03-06 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
|
研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法,利用体内自组装siRNA靶向TDP-43蛋白,通过小细胞外囊泡递送至中枢神经系统,改善TDP-43相关神经退行性疾病的病理症状 | 利用内源性小RNA处理机制自组装siRNA封装的小细胞外囊泡,并借助宿主自然循环系统运输siRNA,实现高效、微创的基因治疗 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果和长期安全性仍需进一步验证 | 开发针对TDP-43蛋白异常积累的基因治疗策略,以治疗肌萎缩侧索硬化和额颞叶变性等神经退行性疾病 | TDP-43蛋白、siRNA、小细胞外囊泡、小鼠模型中的神经病理学变化 | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术、小细胞外囊泡递送、立体定向注射、腺相关病毒递送系统 | NA | NA | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9(可能用于工程化肝细胞,但未明确提及,故输出NA) | 小鼠 | 工程化肝细胞表达并包装靶向TDP-43的siRNA到狂犬病毒糖蛋白标记的小细胞外囊泡中,形成自组装递送系统 | 医学 |
| 1350 | 2026-03-06 |
Exploration of diverse glycosyltransferases in Dracocephalum moldavica and engineering the production of bioactive flavonoid glycosides
2026-Mar-04, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70212
PMID:41782194
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研究论文 | 本研究系统探索了香青兰中参与黄酮类化合物糖基化的UDP-糖基转移酶,并通过工程化大肠杆菌实现了两种生物活性黄酮苷的高效合成 | 首次在香青兰中鉴定出五种功能多样的UGTs,包括双功能糖基转移酶DmUGT1,并通过定点突变揭示了其糖供体特异性的关键氨基酸位点 | 研究主要聚焦于已鉴定的五种UGTs,可能还有其他未发现的糖基转移酶参与香青兰黄酮苷的生物合成 | 阐明香青兰中黄酮类化合物糖基化的分子机制,并为合成生物学方法生产生物活性糖苷提供候选基因和方法 | 香青兰中的UDP-糖基转移酶及其催化的黄酮苷生物合成途径 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 同源建模、定点诱变、代谢工程 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 五种鉴定出的UGT基因 | 质粒设计、代谢工程 | 大肠杆菌 | 通过工程化大肠杆菌菌株,利用DmUGT1和DmCGT1,并增强细胞内UDP-葡萄糖醛酸和UDP-葡萄糖的供应,以生产目标黄酮苷 | 医药 |
| 1351 | 2026-03-05 |
Correction for Ipoutcha et al., "A synthetic biology approach to assemble and reboot clinically relevant Pseudomonas aeruginosa tailed phages"
2026-Mar-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00322-25
PMID:41609359
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1352 | 2026-03-04 |
Publisher Correction: Engineering modular and orthogonal genetic logic gates for robust digital-like synthetic biology
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69313-3
PMID:41771868
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1353 | 2026-03-06 |
Designing prokaryotic gene expression regulatory elements: From genomic mining to artificial intelligence-driven generation
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108781
PMID:41419171
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综述 | 本文系统回顾了原核生物基因表达调控元件的设计策略,从基因组挖掘到人工智能驱动生成 | 整合了生物物理模型和人工智能指导的理性设计方法,强调了深度生成模型在功能调控元件开发中的应用 | 未具体说明实验验证的局限性或数据可用性问题 | 优化微生物细胞工厂的生物生产,通过精细调控基因表达 | 原核生物基因表达调控元件 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、随机诱变、靶向诱变、深度生成建模 | 深度生成模型 | 序列数据 | NA | NA | 原核生物 | 基因表达调控元件,如启动子、核糖体结合位点等 | 工业生物技术 |
| 1354 | 2026-03-04 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具,用于在酵母中构建玉米生长素信号通路组件,以进行生化表征 | 开发了AuxInYeast系统,作为植物合成生物学底盘,首次在酵母中重建玉米生长素信号通路,实现高通量定量分析 | 系统基于酵母环境,可能不完全模拟植物体内复杂调控网络,且仅针对玉米组件,通用性需进一步验证 | 构建合成生物学菌株,以生化表征玉米生长素激素信号通路组件 | 玉米生长素信号通路组件,包括受体、阻遏物、辅阻遏物、转录因子和响应元件 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术、荧光蛋白标记 | NA | 生化数据、荧光信号数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酵母 | 生长素信号通路,包括受体-阻遏物复合物、转录激活级联和响应元件 | 农业, 工业生物技术 |
| 1355 | 2026-03-04 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2026-Mar-02, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议,用于分析玉米生长素信号通路 | 开发了基于酵母异源表达平台的AuxInYeast系统,结合荧光流式细胞术实现高通量定量测量植物生长素信号通路组件 | NA | 工程化玉米生长和发育,通过合成生物学工具分析生长素激素信号通路 | 玉米生长素感知受体和荧光标记的阻遏蛋白 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株,具体数量未指定 | AuxInYeast系统 | 酵母 | 生长素感知和阻遏蛋白降解的生物传感器通路 | 农业 |
| 1356 | 2026-03-03 |
Molecular characterization following expression analysis of sugar transporters in passion fruit to explore their roles in fruit development and abiotic stress tolerance
2026-Mar, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-026-04707-0
PMID:41768418
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研究论文 | 本研究通过全基因组分析鉴定百香果中的55个糖转运蛋白,探究其在果实发育和非生物胁迫耐受中的功能 | 首次在百香果中进行糖转运蛋白的全基因组鉴定,结合分子对接、动力学模拟和表达分析揭示其功能多样性及胁迫响应机制 | NA | 探索百香果糖转运蛋白在果实发育和非生物胁迫耐受中的潜在作用 | 百香果(Passiflora edulis)中的糖转运蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组分析、RNA-seq、实时定量PCR、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 基因组序列、RNA-seq数据、蛋白质序列 | NA | 合成生物学 | 百香果(植物) | 合成生物学指导的电路设计,用于开发多重非生物胁迫耐受的高糖百香果 | 农业 |
| 1357 | 2026-03-03 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法,将小鼠H3K9甲基转移酶和HP1引入酿酒酵母,探究H3K9甲基化及其阅读器分子HP1对转录和染色质压缩的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基转移酶和HP1,以简化系统研究其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行,可能不适用于其他生物或染色质区域;H3K9甲基化和HP1单独不足以改变高阶染色质结构 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的重要性及其对转录和染色质结构的影响 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 引入小鼠H3K9甲基转移酶和HP1以模拟异染色质表观基因组系统 | 基础生物学研究 |
| 1358 | 2026-03-03 |
Imagining an ethics for synthetic biology
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1746379
PMID:41767306
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1359 | 2026-03-02 |
Synthetic Biology and Metabolic Engineering of Microalgae for Sustainable Lipid and Terpenoid Production: An Updated Perspective
2026-Mar, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70405
PMID:41117552
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综述 | 本文是一篇关于微藻合成生物学与代谢工程用于可持续生产脂质和萜类化合物的最新进展的综述 | 整合并批判性评估了关键微藻模型(如莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻)的最新研究进展,重点介绍了加速设计-构建-测试-学习(DBTL)循环的新型遗传工具包、基因组规模代谢建模的突破,以及用于高价值化合物细胞器靶向生物合成的创新策略 | NA | 评估微藻合成生物学与代谢工程的最新进展,以推动其作为可持续生产脂质和萜类化合物的生物平台 | 微藻,特别是莱茵衣藻、微拟球藻和三角褐指藻等关键模型 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、基因组规模代谢建模 | NA | NA | NA | NA | Chlamydomonas reinhardtii, Nannochloropsis spp., Phaeodactylum tricornutum | 用于高价值化合物(如多不饱和脂肪酸和萜类)生物合成的代谢途径 | 食品, 燃料, 生物制造 |
| 1360 | 2026-03-02 |
Artificial Intelligence and the Discovery of Antibiotics: Reinventing with Opportunities, Challenges, and Clinical Translation
2026-Feb-23, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics15020233
PMID:41750530
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综述 | 本文综述了人工智能在加速和优化抗生素发现过程中的作用,包括虚拟筛选、新分子设计和早期测试等环节 | 系统性地探讨了人工智能与合成生物学、纳米技术和多组学数据的协同作用,作为下一代抗菌方法的核心组成部分 | 存在数据缺乏、算法偏见以及研究与临床应用之间的转化鸿沟等问题 | 探讨人工智能在应对抗菌素耐药性威胁、加速新型抗生素发现中的应用与挑战 | 小分子抗生素和抗菌肽 | 机器学习 | NA | 机器学习、深度学习、自然语言处理、生成模型 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |