合成生物学相关文章
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当前共找到 1806 篇文献，本页显示第 1401 - 1420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1401 | 2026-05-06 |
Gibson Assembly of Highly Repetitive DNA
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00002
PMID:42021475
|
研究论文 | 报道了一种基于Gibson组装的模块化质粒框架，用于可扩展和序列定义地组装高度重复DNA，并以弹性蛋白样多肽为模型验证其有效性 | 提出了一种通过Gibson消化与组装工作流实现迭代重复扩增的模块化质粒框架，能够高效构建大片段重复DNA序列，并通过全质粒测序验证序列完整性 | 仅以特定重复序列（GVGVP）为模型，未测试其他类型重复序列的适用性；表征限于NEB 5-alpha细胞，未评估在更复杂宿主中的表达效果 | 开发一种通用策略用于合成高度重复DNA序列，并编码可编程蛋白质聚合物 | 编码五肽Gly-Val-Gly-Val-Pro重复序列的弹性蛋白样多肽（ELP）质粒 | 合成生物学 | NA | Gibson组装、DNA消化与组装、全质粒测序 | NA | DNA序列数据 | 构建了最大513个GVGVP重复的质粒，并表征了257个重复的功能 | Gibson Assembly | 大肠杆菌NEB 5-alpha细胞 | 迭代重复扩增的质粒架构（通过dIII和HI消化及Gibson组装实现） | 生物技术、材料科学 |
| 1402 | 2026-05-06 |
Microbial-Derived Anti-Cancer Compounds: Advances in Drug Discovery, Bioengineering, and Therapeutic Applications
2026, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
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综述 | 综述微生物来源抗癌化合物的发现、生物工程和治疗应用进展 | 整合人工智能、机器学习、分子对接与纳米技术来加速微生物代谢产物的发现和递送 | 缺乏体内验证和全面的药代动力学数据，临床转化面临挑战 | 探讨利用人工智能与合成生物学工程化微生物菌株以产生增强生物活性化合物，并利用纳米技术优化靶向递送机制 | 微生物代谢产物及其抗癌活性 | 机器学习 | 癌症 | 分子对接 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 医学 |
| 1403 | 2026-05-05 |
Applications of Metabolomics in the Development of Biomedicine and Biotechnology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-18966-0_21
PMID:42071157
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综述 | 探讨代谢组学从早期谱分析到与先进分析平台、计算生物学和精准医学整合的发展过程，并强调其在癌症、心血管疾病、糖尿病等疾病中的生物标志物发现、机制阐明和个性化治疗中的应用 | 系统阐述了代谢组学在生物医学和生物技术领域的整合应用，包括单细胞代谢组学和机器学习等新兴工具，及其在代谢流追踪和人工途径设计中的实践驱动作用 | 未明确提及具体局限性 | 概述代谢组学在生物医学和生物技术开发中的应用进展 | 代谢物和代谢途径，用于疾病机制和生物过程研究 | 生物信息学 | 癌症， 心血管疾病， 糖尿病 | 代谢组学， 单细胞代谢组学， 机器学习 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | NA | 人工代谢途径 | 医学， 生物技术， 合成生物学 |
| 1404 | 2026-05-04 |
Efficient cell factory design by combining meta-heuristic algorithm with enzyme-constrained metabolic models
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134706
PMID:42034297
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研究论文 | 提出MetaStrain框架，将酶约束代谢模型与元启发式算法结合，用于高效设计微生物细胞工厂 | 首次将元启发式算法与酶约束模型整合，通过降维预筛选和数值编码策略高效探索组合基因编辑空间，实现非直觉组合靶点的快速识别 | 未提供实验验证中脱靶效应的分析，且对大型代谢网络的计算复杂度评估不充分 | 开发一种计算框架以优化微生物细胞工厂中多基因靶点设计，提高目标产物产量 | 酿酒酵母和大肠杆菌的代谢网络模型 | NA | NA | 酶约束代谢模型 | 元启发式算法 | NA | 通过计算模拟涉及酿酒酵母的2-苯乙醇和亚精胺生物合成，实验验证使用大肠杆菌的五靶点组合菌株 | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 组合基因编辑策略，包括敲除、过表达和酶修饰 | 工业生物技术 |
| 1405 | 2026-05-04 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
|
综述 | 探讨合成生物学方法在食品与农业系统中酶学应用的研究进展 | 系统综述了合成生物学在酶工程领域的最新进展，重点讨论了如何将其他行业的技术改造应用于食品与农业系统 | 当前存在的局限性及监管问题，需要进一步探索合成生物学在全球食品系统中的整合方向 | 探索合成生物学在食品与农业系统中通过酶介导解决方案应对全球粮食不安全问题的应用 | 食品与农业系统中的酶及其工程化改造方法 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物催化、计算设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶介导的代谢途径和生物催化通路 | 食品, 农业 |
| 1406 | 2026-05-04 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
|
研究论文 | 研究核酸在生物分子凝聚体中调控相分离和有序化的作用 | 系统揭示了核酸长度和杂交程度对相变行为的影响，并提出生物凝聚体稳定性的评价指标，同时表征液晶有序形成的条件 | 仅关注模型系统（寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合），未涉及天然复杂环境中的多组分相互作用 | 填补核酸在液-液相分离中作用的研究空白，指导合成含核酸凝聚体的设计 | 具有不同长度和杂交程度的寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合体系 | 计算生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据与模拟轨迹 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物医学 |
| 1407 | 2026-05-04 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
|
研究论文 | 开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台，通过目标诱导荧光和degron介导的降解机制实现活细胞RNA的高特异性可视化 | 首次将Pepper RNA基序嵌入crRNA支架，利用degron介导的降解有效抑制背景信号，实现目标RNA识别驱动的荧光激活，显著提高信噪比 | 未提及具体的局限性 | 开发一种低背景、高特异性的活细胞RNA成像平台 | 活细胞中的RNA分子，包括paraspeckle装配动态和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13, 荧光成像 | NA | 图像 | NA | CRISPR-Cas13, degron | 哺乳动物细胞 | 目标诱导荧光CRISPR-tDeg电路 | 合成生物学, RNA生物学 |
| 1408 | 2026-05-03 |
Advances and opportunities for computational interrogation of plant proteins
2026-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70899
PMID:42055456
|
综述 | 综述了计算分析方法在植物蛋白质研究中的进展与机遇 | 强调了计算工具在加速植物蛋白质功能发现方面的潜力，并整合了新兴方法与传统实验手段的优势 | 植物内研究仍受限于遗传转化方法的可用性和效率 | 推动计算与实验结合，以克服植物蛋白质研究瓶颈，促进农业、生态和气候韧性进展 | 植物蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质结构预测、动力学模拟、相互作用分析 | NA | 蛋白质序列、结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 生态, 气候韧性 |
| 1409 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
|
综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展，旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合，提出可编程干预手段（如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞） | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |
| 1410 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
|
研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 1411 | 2026-05-02 |
Mass spectrometry integrates protein design into structural biology method development
2026, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2025.10018
PMID:42063620
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综述 | 概述了质谱如何通过验证多种设计目标来补充蛋白质设计，并探讨了工程蛋白作为方法开发测试平台的价值 | 提出将机器学习与原生质谱整合形成反馈循环的新观点，即新设计挑战分析技术，改进的方法提供更丰富数据以指导未来预测 | 未提及具体实验数据或量化分析，缺乏对整合方法实际效能的评估 | 阐述质谱在蛋白质设计验证中的作用及其与机器学习的协同关系 | 人工设计蛋白质及其结构特征（寡聚化、折叠、配体结合、动态构象变化） | 机器学习 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工原细胞开发 |
| 1412 | 2026-05-02 |
PSMA-directed CAR-T cell therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer: a next-generation engineering perspective on stem cell-derived immune effectors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819701
PMID:42064077
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综述 | 这篇综述回顾了针对转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）的PSMA导向CAR-T细胞疗法的临床翻译现状，并提出了一种三重协同框架来克服TME免疫抑制、抗原异质性和T细胞适应性等核心挑战 | 提出了三重协同框架系统解构实体瘤障碍，并聚焦于干细胞衍生免疫效应器（如iPSC衍生CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞）作为新一代细胞产品范式，同时纳入基于证据的等级评估提升学术严谨性 | NA | 为PSMA-CAR-T疗法提供战略蓝图，以将其推进至mCRPC的治愈性治疗，并广泛适用于新一代干细胞衍生免疫疗法 | PSMA导向CAR-T细胞疗法及其在mCRPC中的临床应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | 人 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 1413 | 2026-05-01 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
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研究论文 | LinkCraft是一个用于设计多结构域蛋白质中柔性连接子的交互式计算工具 | 将连接子视为可调节的分子功能决定因素，支持基于理化性质的序列生成和系综建模评估 | 未明确讨论实验验证结果或与其他设计工具的性能比较 | 为多结构域蛋白质的柔性连接子提供理性设计工具 | 多结构域蛋白质中的固有结构无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 系综模型 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | 多结构域蛋白质连接子设计 | 合成生物学, 生物技术 |
| 1414 | 2026-05-01 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-01-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
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研究论文 | 利用合成生物学重构DELTA-NOTCH信号通路，研究分节时钟中细胞间振荡通讯的动态机制 | 首次通过合成生物学方法重建DELTA-NOTCH通路，并结合光遗传学验证配体呈现动态对细胞通讯的关键作用 | 结果主要基于小鼠PSM类器官模型，需进一步在体内验证 | 验证DELTA-NOTCH信号在分节时钟中耦合细胞间振荡的作用 | 小鼠前体节中胚层类器官中的DELTA缺陷细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学构建、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成DELTA-NOTCH通路 | 小鼠 | DELTA-NOTCH信号振荡回路 | 发育生物学 |
| 1415 | 2026-04-30 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
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研究论文 | 通过半理性筛选和理性设计组合策略工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶，实现高效无副产物的2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | 结合理性计算设计（结构、进化和稳定性预测）与半理性筛选（基于L-岩藻糖响应生物传感器），首次获得五重突变体M5，实现了124.25 g/L的2'-FL产量且无副产物DFL | 未明确讨论该策略对其他岩藻糖基转移酶或不同底物的普适性，也未评估长期工业生产的稳定性 | 开发无副产物的高效2'-FL微生物合成平台 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定点饱和突变、理性计算设计、生物传感器筛选 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | L-岩藻糖响应生物传感器（FcsR-P） | 工业生物技术、食品 |
| 1416 | 2026-04-30 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
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综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制，包括酶学原理、系统工程策略以及绿色高值化利用的前景 | 将棉酚活性酶分为四个功能模块（官能团修饰、芳环裂解、增溶缀合和自由基介导环化），并提出产物解析验证方法以明确定义解毒终点 | 现有解毒方法主要依据总棉酚减少而非产物解析证据，缺乏解毒转化的明确验证 | 系统阐述棉酚的生物解毒机制，并提出绿色高值化利用的策略 | 棉酚及其解毒酶与微生物系统 | NA | NA | 酶工程, 多酶级联, 人工智能辅助酶/通路挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 解毒代谢通路（包括棉酚活性酶的功能模块） | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 1417 | 2026-04-30 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
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review | 综述了小沟四联体（MGTs）作为i-motif结构封盖相互作用的强效多功能机制 | 揭示了MGT能稳定i-motif结构，使其在中性pH下折叠，并仅用两个C:C⁺对形成紧凑构型，同时可逆pH响应且不扭曲B-DNA几何结构 | 尚未提供体内应用的长期稳定性数据或在复杂生物环境中的直接验证 | 探索小沟四联体在i-motif工程中的稳定机制及其在纳米技术和合成生物学中的应用潜力 | 小沟四联体与i-motif DNA结构的相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光光谱、化学修饰（2'-氟取代、荧光胞苷类似物） | NA | NA | NA | NA | NA | i-motif纳米结构（含MGT封盖） | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |
| 1418 | 2026-04-30 |
AI-Driven De Novo Binder Design: From Structure Prediction to Closed-Loop Optimization
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0070
PMID:42052042
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综述 | 总结了人工智能驱动从头设计蛋白结合物的标准化技术栈，涵盖从结构预测到闭环优化的实用工作流程 | 系统整合了结构预测、蛋白质语言模型和扩散生成建模等前沿技术，提出了从计算设计到实验反馈的完整闭环优化框架 | 面临诱导契合、负设计和数据集偏差等关键挑战，端到端复合物生成尚未实现 | 综述人工智能驱动的从头蛋白结合物设计方法，建立标准化技术栈 | 蛋白结合物（包括抗体和非抗体支架，如单抗体和设计的锚蛋白重复蛋白） | 机器学习 | NA | 结构预测、蛋白质语言模型、扩散生成建模 | 扩散模型、蛋白质语言模型 | 蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 1419 | 2026-04-29 |
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Jul, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110869
PMID:41946009
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综述 | 该综述文章全面回顾了微生物脂肪酶在工业创新中的应用，涵盖其来源、筛选、生产、纯化及表征等方面 | 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程及AI辅助建模在识别和定制具有所需特性的脂肪酶中的革命性作用 | 未明确说明，但作为综述可能缺乏对特定系统验证的深度讨论 | 探讨微生物脂肪酶在可持续工业创新和绿色化学中的关键作用 | 微生物脂肪酶，包括来自细菌、真菌和酵母的脂肪酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 宏基因组学, 酶工程 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程 | 芽孢杆菌属, 无色杆菌属, 产碱菌属, 节杆菌属, 假单胞菌属, 青霉属 | NA | 工业生物技术, 医药, 食品与饮料, 纺织, 皮革, 洗涤剂, 生物燃料 |
| 1420 | 2026-04-29 |
Reconstitution of Archaeal Membrane Lipid Biosynthesis in Bacterial and Eukaryotic Hosts
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500981
PMID:42046273
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综述 | 介绍在细菌和真核宿主中重构古菌膜脂生物合成的研究进展 | 系统综述了通过合成生物学和代谢工程实现古菌脂质合成途径的跨域重构，并发现细菌和真核酶对古菌脂质前体具有显著的底物混杂性，从而无需古菌酶即可合成多种古菌脂质 | 未明确提及现有研究的局限性 | 研究古菌膜脂生物合成途径的重构、宿主系统及工程策略，探讨脂质分界的演化含义及生物技术应用 | 古菌膜脂生物合成途径及其在细菌和真核宿主中的重构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli), 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 古菌脂质生物合成途径，包括核心古菌酶的表达和异戊二烯前体供应的增强 | 工业生物技术、医药 |