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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1461 | 2026-01-29 |
Genome-wide identification and characterization of methyltransferase involved in benzylisoquinoline alkaloids biosynthesis from Menispermum dauricum
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.007
PMID:41584705
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研究论文 | 本研究通过全基因组鉴定和生化分析,揭示了北豆根中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的甲基转移酶的功能与特异性 | 首次系统鉴定了北豆根基因组中的甲基转移酶,并发现了四种关键酶(三种OMTs和一种NMT)在BIA结构多样化中的特异性作用 | 研究主要基于体外酶学实验,体内功能验证和调控机制尚未深入探讨 | 系统鉴定和表征北豆根中参与苄基异喹啉生物碱生物合成的甲基转移酶,明确其在BIA生物合成中的功能 | 北豆根(Menispermum dauricum)中的甲基转移酶基因及其编码的酶蛋白 | 植物代谢工程 | NA | 全基因组鉴定、体外酶学测定、蛋白质建模、分子对接 | NA | 基因组数据、酶学活性数据 | 75个甲基转移酶基因 | NA | NA | NA | 合成生物学、医药生物技术 |
| 1462 | 2026-01-29 |
Herbgenomics: Unraveling natural product biosynthesis in traditional Chinese medicine
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.008
PMID:41584702
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综述 | 本文介绍了Herbgenomics这一新兴学科,旨在通过基因组学策略解析传统中药中天然产物的生物合成途径 | 整合基因组学驱动策略(如生物合成基因簇挖掘、共表达分析和转录组-代谢组联合分析),系统识别关键生物合成酶并揭示代谢创新的进化机制 | NA | 探索和工程化传统中药中天然产物的生物合成,以可持续方式发现和生产生物活性化合物 | 传统中药中的生物活性成分及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 1463 | 2026-01-28 |
A comparative review of vector insertion techniques in Saccharomyces cerevisiae
2026-Feb, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107378
PMID:41435996
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综述 | 本文比较了酿酒酵母中三种主要的载体插入技术:体内同源重组、Cre-lox重组和CRISPR/Cas9 | 对酿酒酵母中三种主流载体插入技术进行了系统性的比较分析,突出了各自在基因组工程和合成生物学中的应用与特点 | 未涉及其他新兴或较少使用的载体插入技术,且主要基于现有文献综述,缺乏新的实验数据验证 | 比较和评估酿酒酵母中不同载体插入技术的应用、优势与局限性 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 体内同源重组、Cre-lox重组、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cre-lox | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 工业生物技术 |
| 1464 | 2026-01-28 |
Classification, catalytic mechanisms, and functional characterization of non-heme diiron oxygenases: A review
2026-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150277
PMID:41544786
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综述 | 本文综述了非血红素双铁加氧酶(NDOs)的分类、催化机制及其功能表征,并探讨了其在合成生物学和可持续生物制造中的应用前景 | 整合了结构生物学、光谱学、计算模型和动力学分析的最新进展,为NDOs的家族分类、催化循环和底物结合策略提供了系统的概念框架 | NA | 为非血红素双铁加氧酶的未来机理研究和蛋白质工程提供指导 | 非血红素双铁加氧酶(NDOs) | NA | NA | 结构生物学、光谱学、计算建模、动力学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、可持续生物制造 |
| 1465 | 2026-01-28 |
Probiotic and Microbial Enzymatic Mechanisms for PFAS Detoxification
2026-Jan-27, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10921-2
PMID:41591586
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综述 | 本文综述了微生物和益生菌对PFAS进行生物修复的当前进展,重点探讨了酶促机制、微生物途径以及与常规处理系统的整合 | 系统性地整合了微生物(包括益生菌)对PFAS的吸附、转化和脱氟机制,并探讨了合成生物学在工程化增强PFAS降解能力方面的最新进展 | 当前微生物途径主要通过部分转化而非完全矿化作用,常积累稳定的氟化中间体;真正的矿化受限于酶效率低、底物特异性窄以及实验室成果难以转化到复杂环境基质中 | 评估微生物和工程化益生菌方法对PFAS进行生物修复的可行性,并指出知识空白和未来发展方向 | 全氟和多氟烷基物质(PFAS) | NA | NA | 微生物生物修复、酶学研究、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌、真菌、蓝细菌、肠道微生物群、益生菌菌株 | 具有增强PFAS摄取和降解能力的工程化微生物系统 | 环境 |
| 1466 | 2026-01-28 |
A Microbial Odyssey: Reshaping Probiotic Destinies through Advanced Delivery Technologies
2026-Jan-27, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-026-10926-x
PMID:41591587
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综述 | 本文系统总结了益生菌递送技术的最新进展,包括多种工程策略和材料平台,并批判性地探讨了临床转化中的关键挑战 | 全面整合了靶向递送系统、基因工程益生菌、微胶囊技术和纳米载体平台等先进递送策略,并引入了智能响应系统、仿生技术和合成生物学等跨学科方法以实现精确释放和持续定植 | 临床转化面临配方稳定性、个体间差异、监管不一致性和长期安全性等关键挑战 | 优化和高质量开发益生菌递送系统,为下一代益生菌生物疗法的合理设计提供前瞻性框架 | 益生菌及其递送技术 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病和神经精神疾病 | 基因工程、表面修饰、微胶囊技术、纳米载体平台 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | NA | 医学 |
| 1467 | 2026-01-28 |
Molecular gatekeepers: eukaryotic translation factors decoding plant-virus dynamics for resistance engineering
2026-Jan-27, Stress biology
DOI:10.1007/s44154-025-00273-2
PMID:41591594
|
综述 | 本文综述了植物病毒如何利用宿主真核翻译因子(eTFs)完成其生命周期,并探讨了通过靶向操纵这些因子来工程化植物抗病性的策略 | 提出了一个以eTF为中心的抗性育种框架,整合了分子生物学与应用策略,为开发广谱、持久且环境可持续的植物抗病毒方案提供了新视角 | NA | 阐明真核翻译因子在植物-病毒互作中的机制作用,并探索通过调控这些因子来增强植物抗病毒能力的策略 | 植物病毒、宿主真核翻译因子(如eIF4E, eIF(iso)4E, eIF4G, eEF1A, eEF1B) | 合成生物学 | 植物病毒病 | 自然等位基因挖掘、诱导诱变、TILLING/EcoTILLING、RNA干扰、CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物 | NA | 农业 |
| 1468 | 2026-01-28 |
An Optimization Scheme Based on the Simulated Annealing Algorithm for In situ DNA Microarray Synthesis
2026-Jan-21, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究将DNA微阵列原位合成建模为旅行商问题,并开发基于模拟退火算法的优化策略以提高合成效率 | 首次将DNA微阵列合成顺序优化问题转化为旅行商问题,并应用模拟退火算法显著减少合成周期 | 研究主要基于计算模拟,未涉及实际实验验证优化策略的物理合成效果 | 优化DNA微阵列原位合成的核苷酸添加顺序以提高效率和降低成本 | DNA微阵列合成过程 | 合成生物学 | NA | DNA微阵列合成 | 模拟退火算法、贪婪算法 | 序列数据 | 从10×10 nt到10000×120 nt的不同规模阵列 | NA | NA | NA | 基因编辑、药物开发、DNA数据存储 |
| 1469 | 2026-01-28 |
Photoacid-Fueled Nanopropeller for the Controllable Motion of One-Hole Colloidal Motors with On-Board ATP Supply
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506850
PMID:41014546
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研究论文 | 报道了一种能够定向运动并现场合成ATP的旋转FF-ATP酶驱动胶体马达 | 利用光酸燃料驱动的纳米推进器,通过跨膜质子动力驱动ATP酶旋转,实现可控运动与现场ATP合成,并展示出向ADP/OH梯度的趋化性 | NA | 开发集自主运动与局部能量生产于一体的仿生推进平台 | 单孔胶体马达 | 合成生物学 | NA | 分层组装、光异构化 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生推进平台,整合运动与能量生产功能 | 生物医学, 合成生物学 |
| 1470 | 2026-01-28 |
Synthetic biology empowers development of traditional Chinese medicine
2026-Jan, Chinese herbal medicines
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.chmed.2025.11.010
PMID:41584699
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1471 | 2026-01-27 |
Biomanufacturing polyhydroxyalkanoates from CO2: A critical review of advances, challenges, and solutions for autotrophic and hybrid systems
2026-Jan-23, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108810
PMID:41581798
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综述 | 本文系统评述了利用二氧化碳生物转化生产聚羟基脂肪酸酯的技术进展、挑战与解决方案,重点关注自养和混合系统 | 首次系统比较了直接自养与两步混合系统在CO2至PHA转化中的性能差距,并提出了基于合成生物学、反应器工程和系统集成的战略路线图 | 当前所有平台仍存在气液传质效率低、催化剂稳定性差(寿命<100小时)及下游分离能耗高等关键瓶颈,导致生产成本(3-8美元/公斤)远高于经济阈值 | 评估CO2生物转化为可生物降解聚合物PHA的技术现状,以推动气候缓解与可持续制造的融合 | 二氧化碳生物转化技术,特别是自养系统(如Cupriavidus necator)和混合系统 | 工业生物技术 | NA | 生物转化、合成生物学、反应器工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | Cupriavidus necator | NA | 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 1472 | 2026-01-26 |
Multi-gene Co-expression systems in E. coli: From single-vector designs to programmable expression platforms
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.12.008
PMID:41574264
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综述 | 本文综述了在大肠杆菌中实现多基因共表达的系统设计策略,从单载体构建到可编程表达平台的发展历程 | 系统性地比较了多种多基因共表达策略的机制原理、设计权衡与调控瓶颈,并探讨了整合模块化架构、表达建模与AI辅助设计的新兴可编程工具包 | NA | 为在大肠杆菌及其他微生物底盘中进行多基因系统工程的科研人员提供全面的策略路线图 | 大肠杆菌中的多基因共表达系统 | 合成生物学 | NA | 内部核糖体进入位点(IRES)、2A自切割肽、双启动子盒、多顺反子操纵子、多质粒配置 | NA | NA | NA | BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 多基因共表达系统,包括逻辑门、生物传感器、代谢途径等 | 工业生物技术 |
| 1473 | 2026-01-26 |
Phage therapy in cancer treatment: Mechanisms, emerging innovations, and translational progress
2026-Feb, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105085
PMID:41397585
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综述 | 本文综述了噬菌体疗法在癌症治疗中的机制、新兴创新及转化进展 | 将噬菌体从传统的抗菌剂重新定位为可编程的生物系统,整合了微生物组调控、免疫激活和纳米载体介导的基因递送,并融合了AI、CRISPR和合成生物学技术 | 仍面临免疫清除、细菌耐药性和监管复杂性等挑战 | 探讨噬菌体疗法在癌症治疗中的应用潜力与转化前景 | 噬菌体及其工程化构建体在肿瘤治疗中的作用 | NA | 口腔鳞状细胞癌、结直肠癌、黑色素瘤、肝细胞癌 | CRISPR-Cas、AI驱动选择流程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | NA | 医学 |
| 1474 | 2026-01-26 |
Engineering bacteriophages for gut health: precision antimicrobials and beyond
2026-Jan-22, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04038-5
PMID:41566387
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综述 | 本文综述了工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道健康中的应用,涵盖合成生物学和纳米技术进展,并探讨其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的治疗潜力 | 利用合成生物学和纳米技术重新设计噬菌体,增强其特异性、功能性和稳定性,作为微生物群中心疗法的多功能工具 | 面临长期稳定性、耐药性发展和规模化生产等挑战 | 探讨工程化噬菌体作为精准抗菌剂在肠道疾病治疗中的应用,以应对微生物失调、抗生素耐药性和宿主-微生物相互作用破坏 | 工程化噬菌体及其在炎症性肠病、结直肠癌和感染性肠炎中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病、结直肠癌、感染性肠炎 | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 1475 | 2026-01-26 |
Contrasting genome composition and codon usage in Listeria monocytogenes temperate versus virulent phages
2026, Virus evolution
IF:5.5Q1
DOI:10.1093/ve/veaf100
PMID:41573078
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研究论文 | 本研究比较了单核细胞增生李斯特菌温和噬菌体与烈性噬菌体的基因组组成和密码子使用模式 | 首次系统比较了单核细胞增生李斯特菌中温和与烈性噬菌体的基因组大小、基因长度及密码子使用偏好的差异,揭示了噬菌体生活方式对密码子使用的塑造作用 | 研究仅针对单核细胞增生李斯特菌噬菌体,结论在其他细菌噬菌体中的普适性有待验证 | 探究噬菌体生活方式(温和型 vs 烈性)对基因组结构和密码子使用模式的影响 | 单核细胞增生李斯特菌的温和噬菌体(686个)和烈性噬菌体(1516个)的编码序列 | 微生物基因组学 | NA | 基因组比较分析、密码子适应指数计算 | NA | 基因组序列数据 | 2202个噬菌体编码序列(686个温和型 + 1516个烈性型) | NA | 单核细胞增生李斯特菌 | NA | 生物技术、合成生物学、治疗应用、生物防治 |
| 1476 | 2026-01-25 |
Prototissues: Assembly strategies, collective behaviors, and emerging applications
2026-May, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.12.033
PMID:41567986
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综述 | 本文综述了原组织的组装策略、集体行为及其新兴应用,提出了一个理解原组织设计的双维度框架 | 提出了一个双维度框架来理解原组织设计,包括原细胞间粘附策略和空间编程方法,并总结了由此启发的关键集体行为 | 主要挑战包括实现动态和选择性粘附、在保持分辨率的同时扩展空间架构、改善信号传输以及增强生物整合 | 推进自下而上的合成生物学,以构建更复杂的人工生命系统,并探索原组织在生物医学、生物传感和智能材料等领域的应用 | 原组织,即由相互连接的原细胞组装体形成的结构 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 生物传感, 智能材料 |
| 1477 | 2026-01-25 |
Systematic optimization of TF-based carboxylic acid biosensors in cell-free system
2026-Apr-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2026.118371
PMID:41512477
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研究论文 | 本文提出了一种在无细胞系统中系统优化基于转录因子的羧酸生物传感器的框架 | 通过整合控制转录因子可用性和启动子序列,建立了在无细胞系统中理性构建高性能生物传感器的模块化方法 | NA | 优化无细胞系统中的生物传感器性能,以支持合成生物学和代谢工程应用 | 基于转录因子的羧酸生物传感器,特别是衣康酸响应型生物传感器 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统,启动子工程 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 生物传感器(衣康酸响应型,3-羟基丙酸响应型) | 工业生物技术 |
| 1478 | 2026-01-25 |
ACCU-RATES: A web tool for accurate enzyme kinetics and initial reaction rate measurements
2026-Jan-21, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169654
PMID:41577122
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研究论文 | 开发了一个名为ACCU-RATES的网络工具,用于精确分析酶动力学数据和测定初始反应速率 | 采用微分形式的米氏方程对反应进程曲线进行数值拟合,无需依赖线性反应阶段,在数据噪声和低采样率条件下仍能提供可靠参数估计 | 需要至少两个时间点的产物积累或底物消耗曲线数据 | 开发精确测定酶初始反应速率和动力学参数的工具 | 酶反应进程曲线 | 生物信息学 | NA | 数值拟合方法 | 微分形式的米氏方程 | 酶反应动力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,医学(抑制剂发现和生物标志物检测) |
| 1479 | 2026-01-25 |
The Importance of Being Imperfect: Structure and Function of Bacterial Amyloid
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517090
PMID:41347620
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综述 | 本文综述了细菌功能性淀粉样蛋白(FuBAs)的结构、组装和功能,强调其作为进化中间体和生物材料工程平台的潜力 | 通过冷冻电镜和计算研究揭示了FuBAs(如CsgA和FapC)的β-螺旋折叠结构,由不完美重复序列稳定,具有高稳定性和低多态性,并展示了其内在催化活性和分层机械性能 | NA | 探讨细菌功能性淀粉样蛋白的结构与功能关系及其在生物材料和合成生物学中的应用 | 细菌功能性淀粉样蛋白,特别是大肠杆菌的curli(CsgA)和假单胞菌的FapC | NA | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、整合计算研究 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli)、假单胞菌(Pseudomonas) | NA | 生物材料工程、合成生物学、催化、生物膜控制 |
| 1480 | 2026-01-25 |
Structure of Chlamydomonas reinhardtii LciA guided the engineering of FNT family proteins to gain bicarbonate transport activity
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02200-9
PMID:41507353
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研究论文 | 本研究解析了莱茵衣藻LciA蛋白的结构,并基于结构指导成功改造了FNT家族蛋白,使其获得碳酸氢盐转运活性 | 首次报道了莱茵衣藻LciA的冷冻电镜结构,揭示了碳酸氢盐选择性的分子机制,并成功通过定点突变将细菌FNT家族亚硝酸盐通道改造为碳酸氢盐通道 | NA | 增强光合作用效率,为将CO2浓缩机制引入C3作物提供分子工具 | 莱茵衣藻LciA蛋白、细菌FNT家族蛋白NirC、莱茵衣藻亚硝酸盐通道NAR1.1/NAR1.5 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜、定点突变、生长测定 | NA | 结构数据、功能数据 | NA | 定点突变 | 莱茵衣藻、细菌 | 碳酸氢盐转运通道 | 农业 |