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当前共找到 262 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-01-19 |
Phage-mediated delivery of CRISPR payloads
2026-Jan-16, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102704
PMID:41547318
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综述 | 本文综述了利用噬菌体递送CRISPR-Cas效应器的最新进展，旨在通过原位基因编辑工程化微生物群落 | 结合噬菌体工程策略、合成生物学技术和计算工具，实现CRISPR-Cas系统在宿主环境中的精准递送和基因组编辑 | 在系统发育广度部署方面仍面临挑战 | 开发技术以操纵和工程化微生物群落，实现其功能的理性调控 | 微生物群落及其功能角色 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、噬菌体工程、合成生物学技术、计算工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物群落（未指定具体宿主） | NA | 医学, 食品, 农业 |
| 142 | 2026-01-19 |
SynVectorDB: embedding-based retrieval system for synthetic biology parts
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf088
PMID:41537189
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研究论文 | 本文介绍了SynVectorDB，一个基于嵌入的合成生物学元件检索系统，旨在解决现有数据库数据组织不一致和语义搜索能力有限的问题 | 开发了基于BGE-M3多语言嵌入的可扩展向量数据库架构，实现了语义相似性匹配；提出了新颖的三级层次分类系统；建立了标准化的数据整理工作流程 | NA | 改进合成生物学元件的发现和组织方式，提高检索效率和准确性 | 合成生物学元件（生物部件） | 生物信息学 | NA | 嵌入技术，语义相似性匹配 | BGE-M3嵌入模型 | 文本数据，元数据 | 19,850个生物部件（来自Addgene、iGEM注册库和实验室收集），其中7,656个通过文献验证获得验证状态 | iGEM | NA | NA | 工业生物技术 |
| 143 | 2026-01-19 |
Automated strain-to-peptide conversion: a high-throughput proteome analysis platform empowering rational design of microbial cell factories
2026-Jan-13, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134010
PMID:41539624
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研究论文 | 本文开发了一种名为“菌株到肽转换”的高通量蛋白质组分析平台，用于加速微生物细胞工厂的理性设计 | 提出自动化SPC策略，相比传统SP3方法处理时间减少94%，膜蛋白定量提升28%，并实现96个样品在1小时内处理 | NA | 开发高通量蛋白质组分析平台以支持微生物细胞工厂的理性设计 | 工程化菌株的蛋白质组，特别是大肠杆菌样品 | 合成生物学 | NA | 质谱蛋白质组学，磁固相烷基化 | NA | 蛋白质组数据 | 96个大肠杆菌样品 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 144 | 2026-01-19 |
MGTbind: a comprehensive database of molecular glue ternary interactome
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1075
PMID:41160881
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研究论文 | 本文介绍了一个名为MGTbind的综合性数据库，该数据库专门收集分子胶参与的三元相互作用组数据 | 开发了首个全面整合分子胶三元相互作用组结构数据和实验数据的数据库，并集成了AlphaFold 3预测的结构信息 | 数据库依赖现有实验数据和预测模型，可能无法覆盖所有未知的分子胶相互作用 | 为分子胶的理性设计提供数据资源支持 | 分子胶及其参与的三元蛋白质相互作用 | 生物信息学 | NA | 数据库构建、AlphaFold 3结构预测 | NA | 化学结构数据、蛋白质相互作用数据、生物活性测量数据 | 3093个经人工整理的分子胶，3924个三元相互作用 | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 145 | 2026-01-19 |
GotEnzymes2: expanding coverage of enzyme kinetics and thermal properties
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1053
PMID:41171142
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研究论文 | 本文介绍了GotEnzymes2数据库，这是一个大幅扩展的酶动力学和热性质资源库 | 相比第一版，GotEnzymes2首次整合了催化参数和热参数，实现了kcat、Km、kcat/Km、最适温度和熔解温度的联合预测，创建了迄今最全面的酶动力学和稳定性参数数据库 | NA | 解决酶动力学实验测量参数稀缺的问题，为数据驱动的酶发现、设计和工程提供资源 | 酶动力学参数和热性质参数 | 系统生物学 | NA | 酶动力学参数预测模型 | NA | 酶催化参数和热参数数据库 | 覆盖10,765个物种、730万种酶、5,960万条独特条目 | NA | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 |
| 146 | 2026-01-19 |
Open Enzyme Database: a community-wide repository for sharing enzyme data
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1082
PMID:41188073
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研究论文 | 本研究开发了一个名为开放酶数据库（OED）的社区共享平台，用于整合和共享酶相关数据 | 构建了一个集成了酶动力学参数、结构数据、反应信息和功能注释的综合性数据库，并整合了AI预测工具和化学信息学算法 | NA | 解决现有酶数据库更新不及时、缺乏标准化和机器学习支持不足的问题 | 酶及其相关数据 | 生物信息学 | NA | 数据库构建、人工智能、化学信息学 | AI预测模型 | 酶动力学参数、结构数据、反应数据、实验条件、功能注释 | NA | NA | NA | NA | 生物催化、系统生物学、合成生物学、酶工程、人工智能 |
| 147 | 2026-01-19 |
TEDD: a comprehensive database for translation efficiency dynamics
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1125
PMID:41217970
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研究论文 | 介绍了一个名为TEDD的综合性数据库，用于探索人类翻译效率（TE）、起始效率（TR）和延伸速度（EVI）的动态变化，重点关注5'/3' UTR的调控特征 | 首次系统性地整合了基因和转录本水平的翻译效率、起始效率和延伸速度数据，并关联了详细的UTR注释，为翻译调控研究提供了多维度的在线比较平台 | 数据库目前仅涵盖人类数据，且样本来源（24种组织/细胞类型、74种细胞系、52种条件）虽广泛但仍有扩展空间 | 构建一个全面的翻译效率动态数据库，以支持翻译调控机制研究和相关生物技术应用 | 人类的翻译效率、起始效率、延伸速度及UTR调控特征 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq, RNC-seq | NA | 高通量测序数据 | 1518个RNA-seq、Ribo-seq和RNC-seq样本，来自143个人类项目（279个数据集） | NA | NA | NA | mRNA疫苗设计、合成生物学、基因治疗、酶工程 |
| 148 | 2026-01-18 |
Reprogramming AraC-type transcriptional factor to respond to new ligands 1,3-propanediol and 1,4-butanediol via directed evolution
2026-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118359
PMID:41485247
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研究论文 | 本研究通过定向进化改造AraC家族转录因子PocR，使其能够响应新配体1,3-丙二醇和1,4-丁二醇，并开发了基于生长偶联筛选和流式细胞分选的高通量生物传感器筛选平台 | 开发了结合生长偶联筛选与流式细胞分选的生物传感器筛选平台，并通过定向进化成功重编程了AraC家族转录因子的配体特异性，实现了对非天然二醇类化合物的响应 | NA | 开发可响应新配体的生物传感器，用于代谢工程和高产菌株筛选 | 肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）中的AraC家族转录调控因子PocR | 合成生物学 | NA | 定向进化、结构分析、动力学引导的半理性设计、非理性方法、流式细胞分选、微流控共培养系统 | NA | NA | 160万个微滴 | 定向进化 | 肺炎克雷伯菌 | 二醇类生物传感器 | 工业生物技术 |
| 149 | 2026-01-18 |
Bidirectional regulation strategies of food microorganisms based on mechanistic insights into temperature, osmotic, and acid stresses
2026-Feb-28, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118045
PMID:41539747
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综述 | 本文系统总结了食品微生物对温度、渗透压和酸胁迫的适应机制，并提出了基于这些机制的双向调控策略，以强化有益微生物并抑制有害微生物 | 提出了一个整合生理分子机制与多组学、系统生物学、人工智能及合成生物学见解的“双向调控”策略框架，用于协同优化食品安全与品质 | NA | 为食品微生物的定向管理提供系统框架和技术路径，以协同优化食品安全与品质 | 食品中的有益微生物和有害微生物 | NA | NA | 多组学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 150 | 2026-01-18 |
Multilayer Host Engineering of Saccharomyces cerevisiae to Enhance Cricket Paralysis Virus (CrPV) Internal Ribosome Entry Site Mediated Translation
2026-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00744
PMID:41546634
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研究论文 | 本研究通过多层宿主工程改造酿酒酵母，增强蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点介导的翻译效率 | 提出了一种结合翻译起始、tRNA修饰和mRNA稳定性三个机制层面的宿主工程策略，首次在酵母中实现CrPV IRES翻译效率的数量级提升 | 研究主要基于报告基因系统，尚未在复杂合成生物学回路中验证；工程菌株可能存在生长适应性代价 | 开发增强非经典翻译元件的宿主工程平台 | 蟋蟀麻痹病毒内部核糖体进入位点（CrPV IRES） | 合成生物学 | NA | 宿主工程改造、报告基因筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 内部核糖体进入位点翻译系统 | 工业生物技术 |
| 151 | 2026-01-18 |
Resource Competition and Growth Dilution Modulate Synthetic Gene Cascade Dynamics
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00606
PMID:41457566
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研究论文 | 本文通过构建和表征抑制性基因级联库，揭示了资源竞争和生长稀释对合成基因电路动力学的关键影响 | 发现下游模块表达增强会通过竞争共享细胞资源意外降低上游调控模块的表达，揭示了资源限制可将单向抑制级联转化为意外反馈回路 | NA | 研究合成基因电路的稳健性和可预测性设计 | 抑制性基因级联库（含不同启动子强度、RBS强度和质粒骨架） | 合成生物学 | NA | 基因电路构建与表征 | NA | 基因表达数据 | NA | 质粒构建 | NA | 抑制性基因级联 | 工业生物技术 |
| 152 | 2026-01-18 |
Synergistic regulatory mechanisms in glycolysis revealed by pathway transplantation
2026-Jan-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00219-25
PMID:41532746
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研究论文 | 本研究通过移植糖酵解途径，揭示了多个变构蛋白之间的协同调控机制及其在动态环境中对细胞存活的影响 | 首次通过完整途径互补和单基因互补实验，识别了糖酵解中的关键调控步骤（葡萄糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶），并展示了变构调控在防止糖酵解失衡中的协同作用 | 实验主要基于模式真核生物酿酒酵母，结果可能不直接适用于其他生物体 | 探究糖酵解途径中多个变构调控步骤如何相互作用以调节代谢 | 糖酵解途径（Embden-Meyerhof-Parnas途径）及其变构蛋白 | 系统生物学 | NA | 途径移植、动力学建模、微流控实验 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母 | 糖酵解代谢途径 | 工业生物技术 |
| 153 | 2026-01-18 |
Alkaloids and flavonoids of Solanaceae: Mechanisms of action in neurodegenerative diseases
2026-Jan-13, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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综述 | 本文系统总结了茄科植物中生物碱和类黄酮的结构特征，及其在治疗阿尔茨海默病、帕金森病和亨廷顿病等神经退行性疾病中的治疗潜力和核心作用机制 | 系统总结了茄科植物来源的特定生物碱和类黄酮对三大神经退行性疾病的多种靶点调控通路，并展望了利用合成生物学和纳米递送系统等技术突破来促进其临床应用的潜力 | 这些天然产物在提取纯化、生物利用度、靶点选择性和临床转化方面面临挑战 | 探讨茄科植物中生物碱和类黄酮在神经退行性疾病治疗中的潜力与作用机制 | 茄科植物来源的生物碱（如尼古丁、阿托品、东莨菪碱）和类黄酮（如槲皮素、木犀草素、山奈酚、花青素） | NA | 神经退行性疾病（阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病） | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 154 | 2026-01-17 |
Structure, Mutation, Functional Domain Roles and Medical Implications of Glycerol Kinase
2026-Jan-15, The protein journal
DOI:10.1007/s10930-025-10316-2
PMID:41537922
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综述 | 本文综述了甘油激酶的结构、突变、功能域作用及其在甘油代谢、能量生产和疾病中的医学意义 | 探讨了GK在合成生物学和肿瘤发展中的潜在作用，并分析了GK抑制剂研发的当前状态和策略 | NA | 分析甘油激酶的结构、功能及其在疾病中的作用，并探讨抑制剂研发策略 | 甘油激酶及其相关代谢途径 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 155 | 2026-01-17 |
Advancing Fast-Track Genome Engineering in Bacillus subtilis Phages
2026-Jan-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00727
PMID:41538882
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研究论文 | 本文介绍了一种名为QuickPhage的快速、精确且成本效益高的方法，用于工程化Bacillus subtilis噬菌体基因组，利用CRISPR-Cas9作为反选择系统进行高效编辑 | 开发了QuickPhage方法，使用短至40个核苷酸的同源修复片段实现高效基因组编辑，能在一天内完成高度准确的编辑，并应用于删除必需和非必需基因及插入报告基因 | NA | 加速噬菌体生物学研究、新功能发现和创新基因工程工具开发 | 模型裂解性siphovirus噬菌体SPP1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Bacillus subtilis噬菌体 | 使用诱导系统合成调控蛋白质生产（如GFP），实现高达400倍的诱导水平 | 工业生物技术 |
| 156 | 2026-01-17 |
Screening and machine learning-based prediction of translation-enhancing peptides that reduce ribosomal stalling in Escherichia coli
2026-Jan-14, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00199d
PMID:41142649
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研究论文 | 本研究通过筛选随机人工四肽库，鉴定出能减少大肠杆菌中SecM停滞肽诱导的翻译停滞的翻译增强肽，并开发了基于随机森林算法的机器学习模型来预测其活性 | 首次系统性筛选翻译增强肽，并利用机器学习模型预测其活性，为合成生物学提供了紧凑的肽工具包和数据驱动方法 | 研究主要针对SecM停滞肽，对其他停滞肽的适用性未充分验证，且实验基于大肠杆菌系统，在其他生物中的效果未知 | 开发翻译增强肽以减轻停滞肽诱导的核糖体停滞，并建立预测模型 | 随机人工四肽库和SecM停滞肽在大肠杆菌中的翻译停滞现象 | 合成生物学 | NA | 随机肽库筛选、翻译分析、机器学习 | 随机森林 | 肽序列数据和翻译活性测量数据 | 随机人工四肽库中的多个肽样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 157 | 2026-01-17 |
Advances in Machine Learning Models for Predicting Enzyme Kinetic Parameters
2026-Jan-12, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02428
PMID:41406463
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综述 | 本文综述了机器学习模型在预测酶动力学参数方面的最新进展，包括全局和局部模型的应用 | 通过机器学习模型替代传统实验和计算方法，提高酶动力学参数预测的效率和准确性，并应用于酶工程和代谢建模 | 数据稀缺是主要限制，但可通过高通量数据生成和半监督学习等新兴机会来克服 | 利用机器学习提升酶动力学参数预测的性能、鲁棒性和范围，以准确注释蛋白质序列的目标功能 | 酶动力学参数（如Km、Vmax、kcat/Km） | 机器学习 | NA | 机器学习 | NA | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 158 | 2026-01-17 |
Oral live microbial therapeutics: A synthetic biology roadmap toward durable oral microbiome-based therapies
2026-Jan-09, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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综述 | 本文是一篇关于口服活微生物疗法（LMTs）的叙述性综述，旨在通过整合临床证据和工程学原理，为开发持久有效的口腔微生物疗法提供合成生物学路线图 | 将合成生物学工程工具（如粘附载体、多层生物防护和逻辑门控/CRISPR杀灭开关）系统性地应用于口腔LMTs的开发，并提出了一个包含定植曲线下面积、表观半衰期等指标的位点解析测量框架，以量化微生物在口腔内的持久性 | 这是一篇叙述性综述，而非原始研究，其结论基于现有文献的综合分析，可能受到已发表研究偏倚和异质性的限制；此外，文中提出的工程策略大多处于概念或早期开发阶段，尚未经过大规模临床验证 | 为开发持久、安全的口服活微生物疗法提供合成生物学指导框架，并推动临床转化 | 口服活微生物疗法（LMTs）及其在口腔疾病（如口臭、龋齿、牙周病）中的应用 | 合成生物学 | 口腔疾病（包括口臭、龋齿、牙周病） | NA | NA | NA | NA | CRISPR, 逻辑门控杀灭开关, 合成营养缺陷型设计 | NA | 逻辑门控杀灭开关, 合成营养缺陷型设计, 多层生物防护系统 | 医学 |
| 159 | 2026-01-16 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-Jan-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
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综述 | 本文综述了液-液相分离（LLPS）作为功能性生物分子凝聚物形成的框架，从细胞组织到合成平台的应用 | 利用LLPS原理设计具有可控组成、性质和活性的合成凝聚物，结合结构洞察、定量相行为和合成生物学工具 | NA | 总结LLPS介导的凝聚物的分子机制、设计策略和转化前景 | 生物分子凝聚物，包括天然和合成系统 | 生物物理学与生物工程 | NA | 液-液相分离（LLPS） | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | 医学（靶向药物递送、生物传感）、工业生物技术（增强催化、代谢控制） |
| 160 | 2026-01-16 |
Establishing synthetic ribbon-type active zones in a heterologous expression system
2026-Jan-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98254
PMID:41528127
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研究论文 | 本研究采用合成生物学方法，在HEK293细胞中重建了类似带状活性区的结构，以探究其最小分子需求并研究突触前钙通道的聚集 | 首次在异源表达系统中成功重建了模拟带状活性区的合成结构，结合超分辨率STED显微镜和冷冻相关电子断层扫描技术验证其与天然带状结构的相似性 | 研究基于异源细胞系统，可能不完全反映神经元原生环境中的复杂相互作用 | 探究带状突触活性区的最小分子组成和钙通道聚集机制 | 带状突触活性区的重建结构及其分子组件 | 合成生物学 | NA | STED超分辨率显微镜、冷冻相关电子断层扫描、钙成像、膜片钳技术 | NA | 图像数据、功能分析数据 | 使用HEK293细胞作为异源表达系统 | 合成生物学方法 | 人类胚胎肾293细胞（HEK293） | 带状活性区模拟结构，涉及Bassoon蛋白膜锚定版本和RIBEYEB蛋白共表达 | 医学 |