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当前共找到 1806 篇文献,本页显示第 141 - 160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
141 2026-10-25
Interaction between the oxidative pentose phosphate pathway and chlororespiration sustains high-rate algal exoelectrogenesis
2026-Oct-20, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1
研究论文 本文研究了绿藻Parachlorella kessleri MACC-38中氧化戊糖磷酸途径(OPPP)与氯呼吸之间相互作用维持高效藻类胞外电子生成(exoelectrogenesis)的生理机制。 揭示了在无胁迫处理条件下,OPPP通过葡萄糖-6-磷酸脱氢酶上调提供NADPH作为胞外电子生成的主要还原力,并发现由质体末端氧化酶(PTOX)介导的氯呼吸通过重新氧化质体醌库来维持氧化还原稳态,从而持续支持胞外电子生成。 研究主要基于生理和生化数据,未明确涉及合成生物学工具的具体应用验证,且机制模型仍需进一步遗传学验证。 探究绿藻Parachlorella kessleri MACC-38中高效胞外电子生成的生理基础,特别是OPPP和氯呼吸的相互作用机制。 绿藻Parachlorella kessleri MACC-38菌株 合成生物学、生物电化学 NA 生理生化分析、电子传递测定 NA 生理生化数据 NA NA Parachlorella kessleri NA 能源、环境
142 2026-10-25
SCULPT-MCP: Systematic Chromosomal Upgrades for Locus-Driven Protein Topologies in Microcompartments
2026-Oct-16, ACS chemical biology IF:3.5Q2
研究论文 通过系统性地改变基因在操纵子中的位置,研究其对细菌微区室形态和功能的影响 首次证明基因顺序是控制蛋白质纳米机器组装和功能的可编程设计原则 研究仅针对pduN基因和特定微区室,普适性有待验证 探索基因顺序对蛋白质纳米结构形态发生和功能的影响 细菌微区室(BMCs)及其关键结构基因pduN 合成生物学 NA 基因工程、分子克隆 NA 实验数据 NA NA 细菌 基因操纵子重排 医学, 工业生物技术
143 2026-10-25
Elucidating the Requirements for microRNA-Mediated Upregulation Enables Reengineering of Upregulatory Sites
2026-Oct-16, ACS chemical biology IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用miRFluR双荧光报告系统,以miR-891b上调B3GLCT为模型,系统探究了miRNA介导上调的分子要求,并证明上调位点可被重新设计以响应其他miRNA 首次系统揭示miRNA上调蛋白表达需要特定序列元件和RNA二级结构,且该效应具有上下文依赖性并受局部UTR结构影响;证明上调位点可通过重新设计被其他miRNA触发,为合成生物学操作提供新可能 研究仅基于miRFluR报告系统和一个模型系统(miR-891b调控B3GLCT),上调机制的普遍性仍需在更多内源基因和生理环境中验证 阐明miRNA介导基因上调的分子要求,并探索通过重新设计上调位点实现合成生物学调控的可行性 miRNA上调调控机制,以miR-891b对B3GLCT的上调为模型系统 合成生物学,分子生物学 NA miRFluR双荧光报告基因检测,定点突变,截短分析 NA 荧光报告数据,序列数据 NA NA 哺乳动物细胞 双荧光报告基因系统(miRFluR) 医学,合成生物学
144 2026-10-25
Mining Phage Genomes for Regulatory Elements to Develop a SynBio Toolbox for Non-Model Pseudomonads
2026-Oct-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 该文通过ONT-cappable测序绘制了五种假单胞菌噬菌体的全长初级转录本图谱,挖掘启动子和终止子等调控元件,并在非模式假单胞菌中验证其功能,构建了合成生物学工具箱 首次从噬菌体基因组中系统挖掘并实验验证了适用于荧光假单胞菌和丁香假单胞菌的启动子和终止子文库,发现了噬菌体编码RNAP的特有启动子基序,所获元件比现有跨物种SynBio工具具有更精细的基因表达调控能力 仅对10个启动子和5个终止子进行了体内定量表征,验证子集有限,且元件功能仅在少数假单胞菌菌株中测试,通用性有待进一步验证 从噬菌体基因组中挖掘调控元件,为非模式假单胞菌开发合成生物学工具箱 五种假单胞菌噬菌体(KIL5、KIL3b、KNP、ϕ2、pphageB21)及荧光假单胞菌GL-S-306和丁香假单胞菌 合成生物学 NA ONT-cappable-sequencing、转录组测序 NA 序列数据、转录组数据 五种噬菌体基因组,鉴定出232个转录起始位点和176个转录终止位点;10个启动子和5个终止子在荧光假单胞菌GL-S-306中进行体内表征 NA 荧光假单胞菌、丁香假单胞菌 启动子和终止子调控元件文库 医学、工业生物技术
145 2026-10-25
Laccase-Based Biosensors for Functional Screening of Transcription Factors in Trichoderma reesei
2026-Oct-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 该文章开发了一种基于漆酶的吸收激活生物传感器平台,用于在里氏木霉中快速功能筛选转录因子 利用漆酶作为报告基因构建吸收激活生物传感器,通过重复cbh1启动子顺式元件密集片段和整合高活性异源漆酶提高灵敏度,实现转录因子变体的快速筛选 摘要未明确说明该生物传感器平台的局限性 开发高效的转录因子筛选平台,用于工业微生物菌株的理性优化 里氏木霉转录因子变体 合成生物学 NA 生物传感器筛选 NA 吸光度读数 摘要未明确说明样品数量 NA 里氏木霉 Pcbh1调控的漆酶表达盒 工业生物技术
146 2026-10-25
Integrating Synthetic Biology, Systems Biology, and Bioprocessing to Advance Terpene Production in Cyanobacteria
2026-Oct-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
综述 该综述综合分析了合成生物学、系统生物学和生物过程工程在蓝细菌萜类生产中的应用进展与瓶颈,并统一了滴度单位以便比较 首次将所有蓝细菌萜类生物生产滴度统一为一致单位,实现同类比较,并识别出高滴度生产的三个一致因素 仅1/63项研究达到g/L级别滴度,系统生物学指导的代谢工程策略应用最少 最大化蓝细菌萜类产量和生产力,识别前进路径 蓝细菌及萜类化合物 合成生物学, 系统生物学, 生物过程工程 NA 代谢工程, 发酵优化, 系统生物学分析 NA 文献数据 63项萜类生物生产研究 NA 蓝细菌 萜类前体过表达代谢途径 工业生物技术, 能源, 材料
147 2026-10-25
Membrane Formulation Impacts Vesicle-Based Artificial Cell Functions
2026-Oct-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 该研究组装了由POPC和DOPC两种磷脂混合物组成的巨型单层囊泡(GUVs),并研究了膜配方对基于囊泡的人工细胞功能的影响 揭示了膜脂组成(POPC与DOPC混合)对人工细胞功能的关键影响,发现混合磷脂膜可增强蛋白质膜对接和蛋白质表达,并鉴定出大分子包封效率是导致不同膜配方间蛋白质表达差异的限制因素 研究仅比较了POPC、DOPC及其混合物,未涉及其他磷脂或膜组分;未在更复杂的细胞模拟环境中验证;未详细探讨膜流动性等物理性质与功能增强之间的具体机制 探究膜配方(磷脂组成)对基于囊泡的人工细胞功能的影响 巨型单层囊泡(GUVs)基人工细胞 合成生物学 NA NA NA 实验数据 NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
148 2026-10-25
Promoter Engineering in Yeast Cell Factories: Strategies, Applications, and Perspectives
2026-Oct-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
综述 综述酵母启动子的结构、功能与工程化策略及其在细胞工厂中的应用 强调机器学习与人工智能在启动子预测建模和从头设计中的作用,并聚焦可调与诱导型合成启动子工具包 未提供原始实验数据,主要基于文献总结,缺少对具体策略的定量比较与统一评价标准 系统梳理酵母启动子工程策略、应用与前景,为代谢途径精准调控和生物制造优化提供参考 酵母启动子及酵母细胞工厂 合成生物学 NA 随机突变、组合组装、基于转录因子结合位点的理性设计、内含子介导增强、跨物种方法、机器学习和人工智能 机器学习与人工智能预测模型 文本 NA NA 酵母 NA 医学, 能源, 工业生物技术
149 2026-10-25
Terminal Deoxynucleotidyl Transferase-Mediated Tunable Biopart Synthesis and Metabolic Engineering
2026-Oct-16, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 建立基于末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)的可编程酶法DNA合成平台,用于合成碱基组成可调的随机寡核苷酸文库,并应用于调控元件工程和代谢工程 利用TdT不依赖模板的DNA聚合酶特性,通过优化二价辅因子和dNTP输入比例克服底物依赖性偏好,实现用户自定义的核苷酸分布,并整合到简化的酶法工作流程中实现数小时内的快速克隆和筛选 TdT合成存在底物依赖性偏差需要优化克服,目前仅在大肠杆菌中验证了启动子、5'-UTR和转录终止子的文库筛选,应用范围仍限于调控元件工程 开发基于TdT的下一代DNA书写技术,实现按需台式合成组成可控的寡核苷酸文库,用于调控元件的快速工程化改造 随机序列寡核苷酸文库、启动子、5'-UTR、转录终止子、番茄红素生物合成操纵子 合成生物学、代谢工程 NA TdT介导的酶法DNA合成、动力学表征、文库构建与筛选 NA DNA序列、荧光/产量表型数据 NA NA 大肠杆菌 番茄红素生物合成操纵子的启动子多样化文库 医学、工业生物技术
150 2026-10-25
Modelling mouse embryogenesis from chemically induced totipotent stem cells
2026-Oct-14, Nature IF:50.5Q1
研究论文 该研究建立了仅由化学诱导的全能样干细胞(ciTotiSCs)起始的小鼠胚胎模型,可在体外连续发育至原肠胚后阶段并形成功能性心脏组织 首次证明单一化学诱导的全能样干细胞类型可自主重演从小鼠桑葚胚到E10.5样胚胎的完整早期胚胎发生过程,无需受精卵或生殖系细胞 研究仅限于小鼠体外胚胎模型,未验证体内发育潜能及人体细胞适用性,长期培养的完整性与伦理边界尚待评估 建立从化学诱导全能样干细胞起始、可连续体外发育的小鼠胚胎模型系统,用于研究哺乳动物早期胚胎发育 化学诱导的全能样干细胞(ciTotiSCs)及其衍生的胚胎模型(ciToti-EMs) 发育生物学, 合成生物学, 干细胞生物学 NA 化学诱导重编程, 体外胚胎培养, 谱系追踪 NA 图像, 形态学与谱系标记数据 NA NA 小鼠 NA 医学, 基础研究
151 2026-10-25
Modeling the Impact of Active Site Mutations on the Quenching Fate and Cyclization Depth of a Rare Oxidosqualene Cyclase
2026-Oct-13, Journal of chemical theory and computation IF:5.7Q1
研究论文 该文通过多尺度QM/MM模拟和定点突变,研究了艾蒿中一种稀有氧化鲨烯环化酶AaOSC-20433活性位点突变对淬灭命运和环化深度的影响 揭示了S411作为通用碱控制末端去质子化,并发现F728A突变诱导催化混杂性产生三环和四环产物,L259Y突变解锁羟基化途径并延伸环化深度生成五环羽扇豆醇,且L259Y+F728S组合表现出显著的协同上位效应 研究主要基于计算模拟和定点突变,未进行大规模的体内实验验证或工业应用评估 阐明OSC活性位点突变如何控制产物特异性,为三萜合成酶的机制驱动功能重编程提供理论基础 AaOSC-20433(来自艾蒿的稀有氧化鲨烯环化酶)及其同源PgDDS(来自人参的达玛烯二醇合成酶) 计算生物学, 酶工程 NA 多尺度QM/MM模拟, 定点突变 QM/MM 模拟数据, 实验数据 NA 定点突变 NA NA 合成生物学, 医药
152 2026-10-25
Decoding Bistability and Drivers of Phenotypic Variation in Bacteria
2026-Oct, Annual review of microbiology IF:8.5Q1
综述 综述细菌表型异质性及双稳态的机制与功能重要性,探讨合成生物学在理解基因调控网络和抗生素耐受中的作用 聚焦合成生物学方法解析细菌基因调控网络及抗生素耐受与持留机制,并讨论整合接合元件的双稳态 作为综述,未提供原始实验数据,对具体机制的系统性验证有限 探讨细菌表型异质性和双稳态的机制及其在细菌集体行为中的功能重要性 细菌群体(等基因群体)及基因调控网络 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA 细菌 基因调控网络(含反馈回路) 医学, 工业生物技术
153 2026-10-25
Mechanisms and Application Prospects of Nicotine from Plant Defense to the Frontiers of Bioengineering
2026-Sep-30, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 系统综述了尼古丁的生物合成、调控网络、生态功能及应用潜力,并提出连接核心代谢途径、生态系统相互作用与合成生物学发展的整合框架 提出将尼古丁研究从以减害为主导的范式转变为主动设计新功能并开发高价值实用应用的整合框架,强调连接代谢途径、生态相互作用与合成生物学 对转运途径的理解尚不完整,尼古丁在代谢、应激反应和生物活性潜力中的复杂作用仍未充分探索 系统多维概述尼古丁研究,推动尼古丁研究范式转变 尼古丁及其生物合成、调控网络、生态功能和应用潜力 合成生物学 NA NA NA 文本 NA NA NA NA 医学,工业生物技术
154 2026-10-25
Recent Advances in the Production and Biosynthesis of Oleanane-Type Pentacyclic Triterpenoids
2026-Sep-30, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了齐墩果烷型五环三萜的分类、生物合成途径以及在植物体外培养和微生物细胞工厂中的生产进展,并讨论了提高三萜产量的工程策略 系统总结了齐墩果烷型五环三萜生物合成的最新进展,并归纳了包括增加前体供应、减少竞争途径、酶工程、辅因子工程、亚细胞区室化、增强转运和优化发酵条件等多种工程策略 作为综述文章,未提供原始实验数据;文中指出的现有生物合成挑战尚未完全解决 总结齐墩果烷型五环三萜的生产与生物合成研究进展,并探讨提高产量的工程策略 齐墩果烷型五环三萜类化合物及其生物合成途径 合成生物学 NA 合成生物学, 代谢工程 NA 文本 NA NA 植物, 微生物 三萜生物合成途径 医药, 工业生物技术
155 2026-10-25
Reprogramming RNA Degraders as Intracellular Molecule Sensors for Tumor Cell Sensing and Manipulation
2026-Sep-25, ACS sensors IF:8.2Q1
研究论文 本文介绍了一个名为TRADER的模块化平台,通过重编程RNA降解器来响应细胞内分子(如miRNA、ATP和蛋白酶)从而激活转基因表达,并展示了其在肿瘤细胞传感和清除中的应用 利用 proximity-dependent RNA降解器系统(dCas6-barnase)在转录后水平实现转基因激活,通过miRNA靶位点或蛋白酶切割连接子解除抑制,并引入正反馈回路实现信号放大 文中未明确说明局限性,可能包括需要进一步优化体内递送效率和特异性 开发一种灵活可扩展的工具,用于细胞状态特异性的转基因表达控制,应用于合成生物学、细胞诊断和精准治疗 肿瘤细胞、细胞内分子(miRNA、ATP、cathepsin B蛋白酶) 合成生物学 肿瘤 RNA降解器系统、dCas6-barnase融合、miRNA靶位点、蛋白酶切割连接子、正反馈回路 NA NA NA dCas6-barnase 哺乳动物细胞 proximity-dependent RNA降解器系统、正反馈回路 医学、合成生物学
156 2026-10-25
Advances in Metabolic Engineering for Biosynthesis of 5-Aminolevulinic Acid
2026-Sep-23, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
综述 本文综述了代谢工程和合成生物学在微生物细胞工厂生产5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)方面的生物合成途径与工程策略进展 系统梳理了5-ALA生物合成途径及酶工程、途径优化和细胞工程等代谢工程策略的最新进展,并提出了可持续生产的挑战与展望 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于已有文献进行归纳总结 总结增强5-ALA生产的生物合成途径和代谢工程策略的最新进展,为微生物平台的合理设计与优化提供指导 5-氨基乙酰丙酸(5-ALA)及其微生物细胞工厂 合成生物学, 代谢工程 NA 代谢工程, 合成生物学 NA 文本 NA NA 微生物细胞 5-ALA生物合成途径 农业, 医学
157 2026-10-25
Engineering DNA-Targeting CRISPR and CRISPR-Like Effectors: Advances from Rational Design and High-Throughput Screening to AI-Driven Development
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
综述 本文系统综述了靶向DNA的CRISPR及类CRISPR效应蛋白的工程化改造进展,涵盖结构导向理性设计、定向进化与高通量筛选、生物信息学与进化指导的挖掘以及人工智能辅助开发 提出将天然效应蛋白发现、结构导向假设生成、高通量功能筛选、机器学习模型构建和迭代重设计整合为合成生物学工程连续体,并强调DBTL启发的工作流程 作为综述文章,未提供原始实验数据验证;讨论的策略整合仍处于概念框架阶段,实际工程化应用仍面临递送、PAM限制和脱靶等挑战 总结DNA靶向CRISPR和类CRISPR效应蛋白在筛选、优化和功能工程方面的进展,推动基因组编辑向更高效率、安全性和可编程性发展 靶向DNA的CRISPR-Cas效应蛋白及类CRISPR效应蛋白 合成生物学, 基因组编辑 NA 宏基因组挖掘, 高通量功能筛选, 定向进化, 机器学习, 结构导向理性设计 NA 序列数据, 结构数据, 功能筛选数据 NA CRISPR-Cas NA NA 医学, 合成生物学
158 2026-10-25
AI-Guided Engineering of Tunable CcdB Variants for Flexible Selection in Escherichia coli
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文利用AI引导的蛋白质工程改造CcdB毒素,获得低基础毒性和可诱导致死性的变体,用于大肠杆菌中的无抗生素筛选 采用结构感知的深度学习策略理性设计CcdB变体,首次获得CcdB_L96P变体,其基础毒性显著降低但保留诱导致死性,可在多种大肠杆菌菌株中实现无抗生素CRISPR gRNA质粒构建和正确克隆的高效富集 未明确说明深度学习模型的泛化能力及在其他毒素蛋白上的适用性,仅在大肠杆菌中验证 改造CcdB毒素蛋白以降低其泄漏表达导致的基础毒性,同时保留诱导致死性,实现灵活的大肠杆菌选择标记 CcdB毒素蛋白及其变体、大肠杆菌菌株、CRISPR gRNA质粒、产琥珀酸底盘细胞 合成生物学 NA 结构感知深度学习、定点突变、CRISPR质粒构建 深度学习 蛋白质结构数据、序列数据 NA CRISPR-Cas9 大肠杆菌 毒素-抗毒素系统(CcdB作为反向选择标记) 医学、工业生物技术
159 2026-10-25
Biofoundry Architect 1.0: A Robot-Assisted Module Configurator and Workflow Designer with Hub Interoperability and Throughput-Workflow Economic Evaluation
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文提出了一个基于网络的开放平台Biofoundry Architect 1.0,用于设计、评估和比较使用机器人辅助模块的自动化工作流,并支持枢纽互操作性和吞吐量-工作流经济评估 开发了一个集成了机器人辅助模块配置、工作流设计、经济评估和社区共享功能的开放网络平台,填补了现有生物铸造厂软件工具在集成性和吞吐量-工作流经济评估方面的空白 文中未明确提及限制 为合成生物学中的生物铸造厂提供一个集成的软件工具,以设计、评估和比较自动化工作流,并优化其效率和成本 自动化工作流、机器人辅助模块、生物铸造厂 合成生物学, 实验室自动化 NA NA NA NA NA NA NA NA 医学, 工业生物技术
160 2026-10-25
Boosted Cell-Free Gene Expression for Robust Signal Readout from a Single-Copy DNA Template in Microdroplets
2026-Sep-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文识别并缓解了低DNA输入下体外转录翻译的产量限制瓶颈,开发了一种优化的无细胞基因表达体系,实现了从单拷贝DNA模板在微液滴中的稳健信号读出 发现了低DNA输入下mRNA稀缺和核糖体浓度过高是限制基因表达的关键瓶颈,提出了一种简单的优化配方(补充高活性T7 RNA聚合酶并降低核糖体浓度),使基因表达协同放大约10倍,并首次在皮升液滴中从单拷贝DNA模板实现约94 nM的蛋白质表达 研究主要基于商业化的重组IVTT试剂盒进行优化,未涉及其他无细胞体系的普适性验证;优化的配方可能对特定蛋白质或反应条件具有依赖性;未详细探讨长期稳定性和重复性 提高低DNA浓度下无细胞基因表达的蛋白质产量,实现从单拷贝DNA模板在微液滴中的稳健信号读出,为体外进化和合成细胞提供技术支撑 无细胞体外转录翻译体系(IVTT)、微液滴、单拷贝DNA模板、荧光蛋白和酶 合成生物学 NA 体外转录翻译(IVTT)、微流控液滴技术 NA 荧光信号、蛋白质表达量数据 多种商业IVTT试剂盒及多种荧光蛋白和酶,具体数量未明确 NA NA NA 生物技术、合成生物学
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