本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2026-03-08 |
Natural products as modulators of ferroptosis: Therapeutic implications and molecular mechanisms in disease treatment
2026-May, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2026.110259
PMID:41490559
|
综述 | 本文综述了天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的分子机制与治疗潜力 | 系统性地基于结构类别和作用机制对天然产物进行分类,并强调纳米递送系统和合成生物学作为克服其应用限制的前沿策略 | 天然产物的应用受到来源受限、成分复杂和药代动力学不稳定的限制 | 探讨天然产物作为铁死亡调节剂在疾病治疗中的治疗意义和分子机制 | 天然产物(如萜类、黄酮类、生物碱、皂苷和多酚)及其对铁死亡的调节作用 | NA | 癌症、神经退行性疾病、糖尿病、心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 142 | 2026-03-08 |
Modulation of Clostridioides difficile virulence by metabolites derived from probiotic consortia and genetically edited strains
2026 May-Jun, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108818
PMID:41638450
|
综述 | 本文综述了通过代谢物调节艰难梭菌毒力的策略,重点探讨了恢复次级胆汁酸代谢、增加短链脂肪酸产量和破坏群体感应系统如何协同抑制毒素表达、生物膜形成和孢子萌发 | 提出了一种协同多靶点(胆汁酸代谢、短链脂肪酸、群体感应)抑制艰难梭菌毒力的策略,并展望了合成生物学和代谢工程在开发下一代工程益生菌和活体生物治疗产品中的应用 | NA | 探讨通过调节肠道代谢网络来抑制艰难梭菌毒力、控制感染复发的策略 | 艰难梭菌及其毒力因子(毒素、生物膜、孢子) | 合成生物学 | 艰难梭菌感染 | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、计算建模 | NA | 多组学数据 | NA | 代谢工程 | 益生菌、工程微生物群落 | 具有可编程群体淬灭能力和优化代谢输出的活体生物治疗产品 | 医学 |
| 143 | 2026-03-08 |
Genetic toolbox development for engineering Bacteroides and other bacterial species
2026-Apr, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2026.102709
PMID:41643388
|
综述 | 本文综述了为非模型细菌菌株开发合成生物学工具箱的策略,以 Bacteroides 属为例,探讨如何建立分子生物学框架 | 强调为非模型共生和益生菌菌株开发定制化遗传工具,以支持原位工程化活体治疗或诊断机器的构建 | NA | 开发合成生物学工具箱,以促进非模型细菌菌株的遗传和代谢操作 | Bacteroides 属及其他非模型细菌物种 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Bacteroides, E. coli | 逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学 |
| 144 | 2026-03-08 |
Seizing the key nodes in glabridin biosynthesis network: identification of enzymes for producing licorice hairy roots with high levels of glabridin
2026-Mar-05, Molecular horticulture
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s43897-025-00202-x
PMID:41782076
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和体外酶活验证,阐明了光甘草定生物合成的两条关键途径,并利用转基因毛状根体系实现了光甘草定的高效生产 | 首次系统解析了光甘草定生物合成网络中的关键酶与两条互作途径,并建立了44倍产量提升的转基因毛状根生产平台 | 未在田间或大规模发酵体系中验证生产平台的稳定性与经济效益 | 解析光甘草定生物合成途径并建立高效生物生产体系 | 甘草(Glycyrrhiza glabra)及其光甘草定生物合成相关酶 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、体外酶活测定、农杆菌介导的遗传转化 | NA | 组学数据、酶活数据、代谢物含量数据 | 转基因毛状根系及4年生野生根对照 | 农杆菌介导转化 | 甘草毛状根 | 光甘草定生物合成途径(OMT/ODMT依赖与非依赖双途径) | 医药、化妆品 |
| 145 | 2026-03-08 |
An Easy-To-Use and Field-Deployable Cell-Free Bioreporter for Environmental Detection of Tetracyclines and Macrolides
2026-Mar-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04800
PMID:41693084
|
研究论文 | 本文开发了一种基于合成生物学的无细胞生物报告系统,用于环境中四环素和大环内酯类抗生素的检测 | 该系统整合了抗生素响应转录因子、RNA聚合酶和工程化DNA转录模板,通过体外转录反应产生可见荧光信号,无需生物安全防护,可冻干保存并适用于现场部署 | NA | 开发一种便携、快速且无需复杂仪器的环境抗生素检测方法 | 四环素和大环内酯类抗生素在环境水样中的检测 | 合成生物学 | NA | 体外转录反应 | NA | 荧光信号 | 真实水样 | 合成生物学 | 无细胞系统 | 抗生素响应生物传感器 | 环境 |
| 146 | 2026-03-08 |
Genomic perplexity and the evolution of context-dependent function
2026-Mar-02, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag041
PMID:41739546
|
研究论文 | 本文提出基因组像大型语言模型一样不编码固定功能,而是编码功能和表型结果的概率分布,并引入“基因组困惑度”概念来量化基因流动的适应度成本 | 将基因组功能与大型语言模型进行概念类比,提出基因组编码概率分布而非固定功能的新框架,并首次引入“基因组困惑度”作为量化基因流动适应度成本的信息论度量 | 提出的框架目前主要是概念性的,需要更多实证研究来验证其预测能力,且对基因组复杂性的简化可能忽略某些生物学细节 | 探讨基因组功能的上下文依赖性及其进化意义,为理解基因流动和合成生物学提供新框架 | 基因组功能、基因流动(水平基因转移和基因渗入)、表型结果 | 计算生物学 | NA | 泛基因组学、合成生物学、全基因组关联研究(GWAS) | Transformer、大型语言模型(LLM) | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、进化建模 |
| 147 | 2026-03-08 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2026-Mar, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
|
研究论文 | 本文报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法,可形成囊泡或中空管状结构 | 首次利用DNA折纸技术构建细胞尺度的动态膜结构,突破了传统蛋白质/脂质膜的限制 | 未明确说明结构的长期稳定性及在复杂生物环境中的功能表现 | 开发新型仿生隔室化技术用于合成生物学和细胞尺度软机器人 | DNA折纸膜自组装结构(囊泡/中空管) | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | 结构成像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 仿脂质结构的径向对称DNA折纸亚基自组装膜 | 生物技术, 软体机器人 |
| 148 | 2026-03-08 |
Glassy Dynamics as a Predictive Framework for Lipid Exchange Across Membranes
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512844
PMID:41562888
|
研究论文 | 本文提出了一种受玻璃态动力学启发的热力学-动力学框架,用于预测跨膜脂质交换的活化能和转移时间尺度 | 利用脂质囊泡的热膨胀系数这一单一实验可测参数,应用集体小位移模型进行无调整参数的预测,将脂质交换过程与无定形材料中的协同分子事件联系起来 | NA | 建立脂质跨膜交换的定量预测框架 | 脂质囊泡和跨膜脂质交换过程 | 软物质物理 | NA | 无标记石英晶体微天平实验 | 集体小位移模型 | 实验数据 | 多个脂质系统 | NA | NA | NA | 药物递送、生物仿生材料设计、纳米生物技术 |
| 149 | 2026-03-08 |
Mistletoe- and Mussel-Inspired Fabrication of Hierarchically Structured Protein-Cellulose Scaffolds From Biomolecular Condensates
2026-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520827
PMID:41603494
|
研究论文 | 本研究受槲寄生和贻贝启发,利用生物分子凝聚相开发了一种可调控层次结构的蛋白质-纤维素复合支架的制备方法 | 首次结合贻贝足蛋白-1(rMfp-1)与表面功能化阴离子纤维素纳米棒,通过多组分相分离形成具有核壳形态的凝聚相,并以此制备可调控多孔结构的组织工程支架 | 未明确说明支架在体内组织工程应用中的具体生物相容性、降解性能及长期稳定性数据 | 开发一种受自然启发的生物可再生、水基的层次结构材料制备方法,用于组织工程支架 | 重组贻贝足蛋白-1(rMfp-1)与表面功能化阴离子纤维素纳米棒形成的生物分子凝聚相 | 生物材料 | NA | 冷冻干燥、光谱学与成像技术(多种模态) | NA | 光谱数据、成像数据 | NA | NA | NA | NA | 医学(组织工程) |
| 150 | 2026-03-08 |
Enhanced Heterologous Production of Tylosin Through Pathway Reconstruction and Integrated Optimization in Streptomyces
2026-Mar, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70203
PMID:41761947
|
研究论文 | 本研究通过克隆泰乐菌素生物合成基因簇,在链霉菌宿主中实现异源表达,并通过培养基优化、启动子替换和调控基因敲除等策略,显著提高了泰乐菌素的产量 | 采用ExoCET技术克隆大型GC-rich基因簇,通过两步组装策略在三种链霉菌宿主中实现异源表达,并综合运用培养基优化、启动子工程和调控基因敲除进行系统优化 | 未提及泰乐菌素类似物的开发或规模化生产的验证 | 提高泰乐菌素的异源生物合成效率 | 泰乐菌素生物合成基因簇及其在链霉菌中的异源表达 | 合成生物学 | NA | ExoCET技术、基因克隆、启动子替换、基因敲除 | NA | NA | 三种链霉菌宿主(包括S. albus J1074) | ExoCET, 基因敲除 | Streptomyces fradiae QL100, Streptomyces albus J1074, 链霉菌宿主 | 泰乐菌素生物合成途径重构,包括启动子替换(tylGI和tylI)和调控基因(tylQ)敲除 | 医药 |
| 151 | 2026-03-08 |
DNA Framework-Encoded Digital Recorder for Bacterial Discrimination
2026-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01091
PMID:41738382
|
研究论文 | 本文开发了一种基于DNA框架的位置编码系统(DFDR),用于同时区分多个核酸序列,并应用于细菌鉴别 | DFDR系统通过三角形DNA框架实现位点特异性功能化,单单元可同时解析18个核酸靶标,比传统DNA自组装系统提高6倍多重检测能力,支持时序控制和可重写记录 | NA | 开发一种高分辨率追踪多重分子信息的系统,用于细菌鉴别和诊断 | 核酸序列(包括16S rRNA混合物)和临床相关呼吸道病原体 | 合成生物学 | 呼吸道感染 | DNA框架自组装 | NA | 核酸序列数据 | 医院环境和自然河水样本 | NA | NA | 位置编码系统(DFDR),基于三角形DNA框架设计 | 医学诊断、环境监测 |
| 152 | 2026-03-08 |
From prebiotics to engineered microbes: microbe-inspired treatments for atopic dermatitis
2026-02-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf451
PMID:41231731
|
综述 | 本文综述了针对特应性皮炎(AD)的皮肤微生物组靶向治疗方法,包括微生物移植、益生元、益生菌和后生元,并展望了利用合成生物学工程化皮肤细菌作为下一代益生菌的潜力 | 提出了利用合成生物学工程化皮肤微生物作为活体生物治疗产品的创新视角,以按需产生AD治疗药物 | NA | 探讨通过调节皮肤微生物组来减少AD感染和炎症的治疗策略 | 特应性皮炎(AD)及其相关的皮肤微生物组,特别是金黄色葡萄球菌 | NA | 特应性皮炎 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 皮肤微生物组中的细菌 | 能够感知皮肤信号(如免疫信号)和环境因素,并按需产生AD治疗药物的合成生物电路 | 医学 |
| 153 | 2026-03-08 |
The cell biologist's guide to detecting and modulating membrane phospholipids
2026-Feb-02, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202508058
PMID:41481227
|
综述 | 本文为细胞生物学家提供了检测和调控膜磷脂的实用工具指南,旨在将脂质生物学融入主流细胞生物学实验 | 系统性地将脂质生物学工具整合到分子细胞生物学家熟悉的实验框架中,包括荧光成像、药理学调控、合成生物学平台和光遗传学系统 | 部分方法仍存在技术难度,且作为综述文章未提出原始实验数据 | 为细胞生物学家提供检测和调控膜磷脂的实用工具与方法 | 细胞膜磷脂 | 细胞生物学 | NA | 免疫荧光、活细胞成像、药理学抑制、合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学平台、光遗传学系统 | NA | 可诱导脂质生成或降解的合成生物学平台 | 基础生物学研究 |
| 154 | 2026-03-08 |
Structure, Mutation, Functional Domain Roles and Medical Implications of Glycerol Kinase
2026-Feb, The protein journal
DOI:10.1007/s10930-025-10316-2
PMID:41537922
|
综述 | 本文综述了甘油激酶(GK)的结构、突变、功能域作用及其在甘油代谢、能量生产和疾病中的医学意义,并探讨了GK抑制剂的研究现状与开发策略 | 系统整合了GK从基因到翻译后修饰的调控机制,并强调了其在合成生物学和肿瘤发展中的新兴研究领域,同时分析了GK作为疾病靶点的抑制剂开发挑战与策略 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献总结,可能受限于当前研究进展的覆盖范围 | 探讨GK在代谢途径中的关键作用及其与疾病的关联,并评估GK抑制剂作为治疗靶点的潜力 | 甘油激酶(GK)及其在细胞代谢和疾病中的功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 155 | 2026-03-08 |
PIONEER: A periplasmic display platform for synthetic biology-based screening of genetically encoded protein regulators
2026-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110967
PMID:41274507
|
研究论文 | 本文介绍了PIONEER平台,一种用于合成生物学中遗传编码蛋白调节剂筛选的酵母周质展示系统 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现稳定配体保留和稳健自分泌信号,首次实现基于信号而非仅结合的功能优先筛选 | 尽管已应用于G蛋白偶联受体,但平台可适应更广泛的膜蛋白和可溶性蛋白靶标,具体扩展性未在文中详细验证 | 开发一个模块化平台,用于筛选和研究遗传编码的蛋白调节剂,以直接探究膜蛋白功能 | 肽、蛋白质和纳米抗体,针对人类G蛋白偶联受体等膜蛋白 | 合成生物学 | NA | 酵母周质展示技术 | NA | 遗传序列和蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母 | 自分泌信号系统,用于配体活性和纳米抗体调节剂分类 | 医学, 工业生物技术 |
| 156 | 2026-03-07 |
Assembling a True "Olympic Gel" From over 16 000 Combinatorial DNA Rings
2026-Mar-06, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202520549
PMID:41789447
|
研究论文 | 本研究成功组装了一种由超过16000种不同DNA环构成的真正“奥林匹克凝胶”,并验证了其独特的溶胀行为和弹性响应 | 首次通过酶激活独特序列域的方法,成功避免了非预期的交联和聚合,实现了由大规模组合DNA环库组装真正的奥林匹克凝胶 | NA | 研究网络拓扑结构对宏观材料性质的影响,并探索其作为生物和仿生系统中遗传信息载体的功能 | 由超过16000种不同DNA环组成的奥林匹克凝胶材料 | DNA纳米技术 | NA | 下一代测序、振荡流变学、大规模计算模拟、原子力显微镜、低温电子显微镜 | NA | DNA序列数据、力学性能数据、结构图像数据 | 超过16000种不同的DNA环分子 | NA | NA | NA | 材料、工业生物技术 |
| 157 | 2026-03-07 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
|
研究论文 | 本文通过多维度确定性筛选设计,优化了无细胞基因表达系统的试剂配方,以降低成本、提高重现性和产量 | 开发了一种基于12种组分的简单、可重现的无细胞试剂配方,实现了高达95%的成本降低,并能从氮碱基和核糖生产核苷三磷酸 | NA | 优化无细胞基因表达系统的试剂配方,以降低成本和复杂性,提高蛋白质生产的重现性和产量 | 无细胞基因表达系统及其试剂配方 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达 | NA | 实验数据 | 1,231种不同的试剂配方 | NA | NA | NA | 生物技术、蛋白质制造 |
| 158 | 2026-03-07 |
Recruiting orthogonal biological systems for engineering microorganisms
2026-Mar-04, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.12.023
PMID:41786536
|
综述 | 本文综述了微生物合成生物学中正交策略的最新进展与应用,包括正交遗传系统、代谢途径、能量系统和调控系统的构建 | 总结了正交策略在微生物合成生物学中的创新应用,以解决工程过程对自然代谢的干扰问题 | NA | 探讨正交策略在微生物合成生物学中的应用,以增强工程微生物的功能和可预测性 | 微生物细胞及其正交工程系统 | 合成生物学 | NA | 正交工程策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞 | 正交遗传系统、代谢途径、能量系统、调控系统 | 工业生物技术 |
| 159 | 2026-03-07 |
Developing artificial cytoskeletons using RNA origami-based nanotubes
2026-Feb-28, Progress in biophysics and molecular biology
DOI:10.1016/j.pbiomolbio.2026.02.006
PMID:41765186
|
综述 | 本文综述了利用RNA折纸纳米管构建人工细胞骨架的新兴领域,探讨了其设计策略、功能优势及在合成生物学与纳米技术中的应用前景 | 系统性地提出了利用RNA折纸技术构建可编程仿生细胞骨架网络的创新概念,突出了RNA在共转录折叠、复杂三级结构形成及与细胞机器接口方面的独特优势 | 存在体内稳定性不足和递送效率低等挑战 | 探索RNA折纸纳米管在构建人工细胞骨架中的应用,推动合成细胞工程与RNA纳米技术的发展 | RNA折纸纳米管及其仿生的微管与肌动蛋白丝结构 | 合成生物学 | NA | RNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生细胞骨架网络(模拟微管与肌动蛋白丝) | 纳米技术, 合成生物学, 医疗 |
| 160 | 2026-03-07 |
From biopolymers to microcompartments: A structured review of protein-based scaffolds for enzyme immobilization
2026-Feb-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2026.108851
PMID:41765154
|
综述 | 本文系统回顾了从天然生物聚合物到工程化蛋白质支架,再到细菌微区室(BMCs)等用于酶固定的蛋白质基支架的进展 | 采用分层视角,从天然生物聚合物支架推进到工程化蛋白质支架,并重点介绍了作为新兴细胞器样平台的细菌微区室(BMCs)在空间精度、选择性渗透性和封装多酶途径方面的优势 | NA | 回顾酶固定化支架的发展,为未来支架设计提供信息并拓宽生物催化的应用范围 | 用于酶固定的蛋白质基支架,包括生物聚合物、工程化蛋白质支架和细菌微区室 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医学 |