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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1601 | 2026-02-25 |
Toehold-VISTA: a machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2026-Feb-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag097
PMID:41693568
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研究论文 | 提出一种名为Toehold-VISTA的机器学习框架,用于快速设计高性能RNA传感器,并成功应用于SARS-CoV-2 RNA检测 | 结合生物物理建模与机器学习(偏最小二乘判别分析),通过高通量实验数据训练预测模型,实现对RNA传感器性能关键决定因素的捕获 | 未明确说明模型在其他RNA传感器类型或更广泛靶标中的泛化能力 | 加速RNA传感器的设计与工程化,解决当前设计、生产和筛选高性能RNA传感器耗时长的挑战 | RNA传感器(以toehold switches为模型)与靶标RNA(如SARS-CoV-2 RNA)的相互作用 | 机器学习 | NA | 高通量实验测量、序列-结构特征提取 | 偏最小二乘判别分析(PLS-DA) | RNA序列与结构数据 | NA | NA | NA | RNA传感器(toehold switches) | 生物技术、诊断 |
| 1602 | 2026-02-25 |
Genetic make-up and regulation of the L-lysine biosynthesis pathway in Vibrio natriegens
2026, Microbial cell (Graz, Austria)
DOI:10.15698/mic2026.02.867
PMID:41732680
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研究论文 | 本研究分析了Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径的组成与调控,为将其开发为氨基酸过量生产菌株提供基础 | 发现了一种新的单功能天冬氨酸激酶同工酶Vn.LysC2,该酶对所有L-天冬氨酸家族氨基酸的变构抑制不敏感,并鉴定了L-天冬氨酸半醛脱氢酶和二氢二吡啶酸合酶的功能重复基因 | NA | 分析Vibrio natriegens中L-赖氨酸及相关氨基酸生物合成途径的遗传组成与调控机制,以支持未来的代谢工程应用 | Vibrio natriegens DSM759菌株及其L-赖氨酸和L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | RNA测序、基因删除突变体生长表型分析、酶活性测定 | NA | 基因组测序数据、转录组数据 | NA | NA | Vibrio natriegens | L-赖氨酸及相关L-天冬氨酸家族氨基酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 1603 | 2026-02-24 |
Construction and analysis of a cell factory for terpenoid biosynthesis in Pichia pastoris via metabolic engineering and metabolomics
2026-Mar, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.015
PMID:41725898
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和代谢组学方法,在毕赤酵母中构建并分析了一个用于萜类化合物生物合成的通用细胞工厂 | 开发了一种“即插即用”的细胞工厂,通过增强MVA途径表达和减少分支途径分流策略,实现了多种萜类化合物的高效合成,并利用系统生物学分析揭示了关键蛋白拷贝数增加对精氨酸等代谢途径的影响 | 菌株的鲁棒性和紧密调控的代谢网络限制了理性代谢工程改造的潜力 | 构建高效的微生物细胞工厂以实现萜类化合物的大规模生产 | 毕赤酵母作为宿主细胞,用于生产β-榄香烯、β-法尼烯、(+)-瓦伦烯、(-)-α-红没药醇等萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、代谢组学、系统生物学分析 | NA | 代谢物数据 | 不同工程菌株 | 代谢工程 | 毕赤酵母 | 增强MVA途径表达和减少分支途径分流的通用萜类化合物生物合成细胞工厂 | 医药、保健品、香料 |
| 1604 | 2026-02-24 |
Harnessing endophytes and Multi-Omics for sustainable Colchicine biosynthesis
2026-Feb-18, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-026-04790-8
PMID:41706338
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综述 | 本文综述了利用内生菌和多组学技术促进濒危药用植物Gloriosa superba可持续生产秋水仙碱的系统性策略 | 提出将内生菌生物学与多组学技术、合成生物学整合的系统级合成框架,将秋水仙碱生物合成重新定义为植物-微生物协同代谢网络 | NA | 开发可持续、可扩展的秋水仙碱生产方法,同时支持Gloriosa superba的保护 | Gloriosa superba(植物)、其相关的内生真菌和细菌 | 合成生物学 | 痛风、关节炎、癌症、炎症性疾病 | 多组学分析(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | 异源微生物宿主 | 秋水仙碱合成途径重建 | 医药 |
| 1605 | 2026-02-24 |
T Cell Receptor Co-Stimulation Through Magnetogenetic Tools: A Platform for Wireless Rewiring of Cellular Signaling
2026-Feb-17, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c10000
PMID:41726657
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研究论文 | 本文介绍了一种用于T细胞受体共刺激的磁遗传学平台,利用磁场实现T细胞的无创激活 | 开发了一种无线、磁控的磁遗传学工具,作为TCR信号的可调共刺激器,结合抗原刺激增强T细胞激活 | NA | 探索合成生物学策略以控制细胞功能,用于治疗应用,特别是免疫细胞行为的精确调控 | HEK293细胞、Jurkat细胞和原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | 钙成像、qPCR、蛋白质组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | HEK293, Jurkat, 原代人T细胞 | 磁遗传学平台,涉及工程化TRPV1、TRPV4和电磁感知基因(EPG)构建体 | 医学 |
| 1606 | 2026-02-23 |
Exosome precision engineering: A comprehensive method for targeted gene and drug delivery
2026-Apr, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156369
PMID:41619536
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综述 | 本文综述了外泌体精准工程作为靶向基因和药物递送载体的最新方法、进展与挑战 | 整合了合成生物学与外泌体工程的最新策略,包括表面靶向修饰、先进装载技术(如远程装载、刺激响应系统)以及用于递送CRISPR/Cas9的基因工程方法 | 面临大规模生产、免疫安全性以及监管审批等挑战 | 探讨工程化外泌体作为多功能平台在精准医疗和疾病治疗中的应用潜力 | 外泌体(作为药物和基因递送载体) | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9,远程装载,刺激响应系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 生物传感器(通过表面配体、抗体或肽实现靶向),刺激响应递送系统 | 医学 |
| 1607 | 2026-02-23 |
Bio-Oil from Phototrophic Microorganisms: Innovative Technologies and Strategies
2026-Jan-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010011
PMID:41718349
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综述 | 本文综述了利用光养微生物生产生物油的技术与策略,重点讨论了热化学转化技术和生物优化方法的进展 | 强调将先进热化学转化技术与定向生物优化策略有效结合,是实现光养微生物规模化生产生物油的最有前景途径 | NA | 探讨利用光养微生物生产液体生物燃料的可行技术与策略,以支持低碳能源系统转型 | 光养微生物(特别是微藻)及其生物油生产 | NA | NA | 水热液化、快速热解、催化提质(加氢脱氧等)、菌株优化、胁迫诱导、共培养、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 光养微生物(微藻) | NA | 能源 |
| 1608 | 2026-02-22 |
Conformation-programmed DNA computing
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec8383
PMID:41706864
|
研究论文 | 本文提出了一种基于构象编程的DNA计算框架,通过整合序列可编程性与构象动力学实现多级信号处理 | 首次将序列可编程性与构象动态信号整合于DNA计算中,通过多聚胸腺嘧啶环实现构象信号编码与放大,并构建了可区分7-15个核苷酸环长的构象感知DNA神经网络 | 未明确说明系统在复杂生物环境中的稳定性与长期运行效果 | 开发能够整合序列与构象维度的自适应DNA计算系统 | DNA分子网络与构象信号处理机制 | 合成生物学 | NA | DNA计算、构象编程、催化发夹组装 | DNA神经网络 | 分子构象信号 | NA | DNA自组装 | NA | 变构DNA计算框架、催化发夹组装系统、microRNA响应型基因调控回路 | 医学、合成生物学 |
| 1609 | 2026-02-21 |
Advancing Fast-Track Genome Engineering in Bacillus subtilis Phages
2026-Feb-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00727
PMID:41538882
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研究论文 | 本文介绍了一种名为QuickPhage的快速、精确且成本效益高的噬菌体基因组工程方法,利用CRISPR-Cas9作为反选择系统,在Bacillus subtilis噬菌体SPP1中实现高效基因编辑 | 开发了QuickPhage方法,使用短至40个核苷酸的同源修复片段进行高效基因组编辑,能在一天内完成精确编辑,并成功应用于必需和非必需基因的删除及报告基因的插入 | NA | 加速噬菌体生物学研究、新功能发现和创新基因工程工具的开发 | Bacillus subtilis的模型裂解性siphovirus噬菌体SPP1 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Bacillus subtilis | 使用诱导系统合成调控蛋白质生产(如GFP),实现高达400倍的诱导水平 | 医学, 工业生物技术 |
| 1610 | 2026-02-21 |
What problem do you hope bioengineering or synthetic biology approaches will enable us to tackle in the next decade?
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101539
PMID:41713402
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1611 | 2026-02-21 |
Electron-Mediator-Free Microfluidic Photocatalytic Coenzyme Regeneration with 100% Conversion Efficiency within 126 S
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513720
PMID:41201076
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研究论文 | 本文设计了一种无电子介体的微流控光催化平台,用于高效再生辅酶NAD(P)H,实现了126秒内100%的转化效率和优异的生物活性选择性 | 开发了无电子介体的微流控光催化平台,通过直接电子-质子耦合机制,在超短时间内实现辅酶的高效、高选择性再生,并展现出卓越的长期运行稳定性 | NA | 开发高效、稳定的光催化辅酶再生系统,以推动生物催化、合成生物学和可再生能源领域的应用 | 辅酶NAD(P)H的再生 | NA | NA | 微流控技术、光催化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 合成生物学, 可再生能源 |
| 1612 | 2026-02-21 |
Traceless Regulation of Genetic Circuitry
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519848
PMID:41454732
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综述 | 本文综述了无痕物理诱导基因开关在合成生物学中的应用、挑战与前景 | 强调无痕物理信号(如光、热、声、磁、电和机械力)作为基因开关调控手段,相比化学诱导具有更高特异性、时空分辨率、灵活性和生物电子接口兼容性 | NA | 探讨物理诱导无痕基因开关在合成遗传电路调控中的影响、挑战及未来发展方向 | 物理诱导基因开关及其在合成生物学系统中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成遗传电路,包括基因开关作为调控元件 | 医学, 农业, 能源, 工业生物技术 |
| 1613 | 2026-02-21 |
Editorial: Advancing plant defense: genome editing, RNAi, and synthetic biology for sustainable pest control
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1785705
PMID:41717108
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1614 | 2026-02-20 |
Plant epidermis-derived secretory structures: from glandular trichomes to secretory cavities
2026-Mar, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70892
PMID:41517861
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综述 | 本文比较了植物表皮衍生的分泌结构(如腺毛和分泌腔)的发育调控机制及次生代谢物合成 | 通过对比腺毛和分泌腔的发育与次生代谢调控,为合成生物学应用提供基础知识 | NA | 探讨植物表皮衍生分泌结构的发育和次生代谢物合成的调控机制 | 植物表皮衍生的分泌结构,包括腺毛和柑橘油腺等分泌腔 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 1615 | 2026-02-20 |
Nanoengineering of Exosomal Surfaces for Precision Targeting and Payload Delivery at the Molecular Level
2026-Feb-19, Assay and drug development technologies
IF:1.6Q3
DOI:10.1177/1540658X251369691
PMID:40903045
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综述 | 本文综述了在分子水平上对胞外囊泡表面进行纳米工程以增强其靶向特异性、载药效率和释放控制的研究进展 | 系统性地总结了分子水平胞外囊泡表面工程化策略,并提供了定量性能评估框架,讨论了人工智能建模和多组学等新兴技术的整合 | NA | 指导设计分子工程化胞外囊泡,以提升其临床转化潜力 | 胞外囊泡(外泌体) | NA | 肿瘤学、神经学、心脏病学 | 基因修饰、共价与非共价表面偶联、脂质插入、点击化学、杂化囊泡融合、微流控、合成生物学、人工智能建模、多组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学(靶向药物递送、基因治疗、分子诊断、免疫治疗) |
| 1616 | 2026-02-20 |
Synthesis of 4-hydroxybenzoic Acid in Escherichia coli by a Modular co-culture System
2026-Feb, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05501-z
PMID:41452415
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研究论文 | 本研究通过构建模块化共培养系统,利用大肠杆菌生产4-羟基苯甲酸 | 首次报道使用葡萄糖作为唯一碳源,通过模块化共培养技术合成4-羟基苯甲酸,扩展了该技术的应用范围 | NA | 开发模块化共培养策略以减轻宿主细胞的代谢负担,并高效生产4-羟基苯甲酸 | 4-羟基苯甲酸的生物合成途径及其在大肠杆菌中的模块化表达 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、模块化共培养 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 将完整的4-羟基苯甲酸合成途径在莽草酸节点分割为上游和下游模块,分别构建于不同大肠杆菌菌株中 | 食品、医药、化妆品 |
| 1617 | 2026-02-20 |
Integrated omics analysis of the cellulose co-degradation network of Chaetomium thermophilum
2026-Jan-24, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02741-x
PMID:41580774
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研究论文 | 本研究通过整合组学分析揭示了嗜热毛壳菌纤维素共降解网络的协同机制,包括核心转录因子调控、酶分泌级联模式及糖酸代谢网络的作用 | 首次在嗜热真菌中发现CtClr-2作为核心转录因子驱动LPMOs、CDH和CBH等关键基因共表达,并揭示氧化酶与水解酶的三阶段级联分泌模式使还原糖产量提升60.6% | 研究聚焦于单一嗜热真菌物种,其机制在其他工业相关真菌中的普适性仍需验证;合成生物学工程改造仅停留在理论建议阶段 | 解析嗜热真菌高效降解纤维素的系统机制,为生物燃料工业化生产提供菌株改造靶点 | 嗜热毛壳菌(Chaetomium thermophilum)的纤维素降解网络 | 合成生物学 | NA | 整合组学分析(包括转录组、蛋白质组) | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学 | 嗜热毛壳菌 | 纤维素降解网络(包含转录调控模块、酶分泌级联模块、糖酸代谢模块) | 能源 |
| 1618 | 2026-02-19 |
Engineering delivery platforms for CRISPR-Cas and their applications in healthcare, agriculture and beyond
2026-Feb-17, Nanoscale advances
IF:4.6Q2
DOI:10.1039/d5na00535c
PMID:41640466
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统的递送平台挑战及其在医疗、农业等领域的应用 | 全面概述了CRISPR技术递送的关键挑战及当前与新兴的递送策略,包括病毒载体、非病毒物理方法和纳米颗粒基模态 | 递送系统面临组织细胞特异性、细胞内环境差异、编辑效率可变及脱靶风险等障碍 | 探讨CRISPR-Cas系统的递送平台及其在医疗、农业等领域的应用 | CRISPR-Cas系统及其递送策略 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统,包括碱基编辑器和先导编辑器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医疗, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 1619 | 2026-02-19 |
T cell immunotherapy for solid tumors: limitations, progress, and future prospects
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755751
PMID:41694348
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综述 | 本文全面综述了针对实体瘤的T细胞免疫疗法的现状、挑战与未来前景 | 系统梳理了CAR-T、TCR-T和TIL疗法在实体瘤中的最新进展,并重点讨论了克服抗原异质性、肿瘤微环境抑制等障碍的新兴策略 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据或临床结果,主要基于现有文献进行分析 | 总结T细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的进展、挑战及未来发展方向 | 针对实体瘤的T细胞免疫疗法,包括CAR-T细胞、TCR-T细胞和肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 实体瘤 | 合成生物学工具、基因编辑技术、多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 嵌合抗原受体、T细胞受体工程 | 医学 |
| 1620 | 2026-02-19 |
Elucidation of the pramanicin biosynthetic pathway reveals a DUF2306 family membrane protein involved in terminal epoxidation
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1765828
PMID:41695960
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研究论文 | 本研究阐明了真菌代谢产物pramanicin的生物合成途径,并首次揭示了DUF2306家族膜蛋白在终端环氧化反应中的功能 | 首次鉴定了pramanicin的生物合成基因簇,并发现DUF2306家族膜蛋白PraC在天然产物生物合成中的环氧化功能 | NA | 解析pramanicin的生物合成途径 | 真菌代谢产物pramanicin及其生物合成基因 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组合表达、饲喂实验 | NA | NA | NA | 异源表达 | 真菌、Aspergillus nidulans | pramanicin生物合成途径(包含PKS-NRPS杂合酶、单加氧酶、短链脱氢酶/还原酶及膜蛋白环氧化酶) | 医药 |