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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1661 | 2026-02-06 |
Sustainable production of glutaric acid in microbial cell factories: Current advances and future prospects
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.003
PMID:41631191
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综述 | 本文综述了微生物细胞工厂可持续生产戊二酸的当前进展与未来前景 | 系统总结了戊二酸生物合成的最新进展,重点关注生物合成途径的设计和代谢工程策略,并探讨了系统生物学技术在该途径开发中的应用 | NA | 为戊二酸及相关精细化学品的可持续生产提供理论见解和技术指导 | 戊二酸的微生物生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 戊二酸生物合成途径 | 化学工业,医药,生物材料 |
| 1662 | 2026-02-06 |
A novel LPS-dependent outer membrane-anchoring mechanism for T9SS substrates enables engineered enzyme display and whole-cell PET degradation in Cytophaga hutchinsonii
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.011
PMID:41631190
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研究论文 | 本研究在Cytophaga hutchinsonii中发现了一种新型的LPS依赖性T9SS底物外膜锚定机制,并基于此开发了用于革兰氏阴性菌的酶表面展示平台,成功实现了PET降解 | 首次揭示了T9SS底物通过LPS依赖性机制锚定于外膜,并利用此机制构建了可编程的酶表面展示平台 | NA | 阐明T9SS底物在Cytophaga hutchinsonii中的外膜锚定机制,并开发基于此机制的酶表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii及其T9SS分泌的纤维素酶,以及异源表达的PET水解酶 | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、基因敲除、LC-MS/MS蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据、基因序列数据 | NA | 基因融合、表面展示平台 | Cytophaga hutchinsonii | 将异源酶与T9SS底物的CTD结构域融合,构建表面展示系统 | 环境、工业生物技术 |
| 1663 | 2026-02-06 |
Adaptive laboratory evolution optimizes an engineered phosphite utilization pathway in Synechococcus elongatus PCC 7942
2026-Mar, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.11.006
PMID:41390308
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研究论文 | 本研究通过长期传代培养优化了在Synechococcus elongatus PCC 7942中构建的磷酸盐利用途径,提高了工程菌株的生长和磷酸盐消耗速率 | 发现长期传代培养可诱导htxBCDE转运蛋白基因发生点突变,从而增强磷酸盐转运活性,优化工程代谢途径而不改变其底物特异性 | 研究仅针对单一菌株和特定代谢系统,未评估在其他宿主或代谢途径中的普适性 | 优化工程微生物的磷酸盐依赖代谢系统,以平衡代谢负担与生物安全控制能力 | Synechococcus elongatus PCC 7942工程菌株RH714及其传代演化群体 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室演化、长期传代培养、基因序列分析、基因敲除 | NA | 生长曲线数据、磷酸盐消耗速率数据、基因序列数据 | 原始工程菌株RH714及其传代演化群体 | CRISPR-Cas9 | Synechococcus elongatus PCC 7942 | 磷酸盐依赖代谢系统,包含htxBCDE转运蛋白基因和ptxD基因簇 | 环境、工业生物技术 |
| 1664 | 2026-02-06 |
Automated strain-to-peptide conversion: a high-throughput proteome analysis platform empowering rational design of microbial cell factories
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134010
PMID:41539624
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研究论文 | 开发了一种名为'菌株到肽段转换'的高通量蛋白质组分析平台,用于微生物细胞工厂的理性设计 | 通过自动化工作流程整合细菌裂解、磁性固相烷基化蛋白富集、污染物去除和快速消化,将96个样本处理时间缩短至1小时,相比SP3方法减少94%处理时间,并提高膜蛋白定量28% | NA | 克服微生物工程菌株蛋白质组分析中的样本制备瓶颈,实现高通量蛋白质组分析 | 工程化微生物菌株(如大肠杆菌)的蛋白质组 | 合成生物学 | NA | 质谱蛋白质组学、磁性固相烷基化 | NA | 蛋白质组数据 | 96个大肠杆菌样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 1665 | 2026-02-06 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
|
研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶,能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸为三磷酸盐,并展示了其在体外转录中的应用潜力 | 开发了一种具有广泛底物谱的通用多磷酸激酶,突破了现有PPKs底物限制,实现了对嘌呤和嘧啶单磷酸及二磷酸的高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于通用多磷酸激酶的一锅法体外转录系统 | 工业生物技术 |
| 1666 | 2026-02-06 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
|
综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属(类金属)生物修复中的应用,探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了一个整合CRISPR编辑、多组学、合成生物学和新兴CRISPR生物传感器的统一路线图,用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前面临的生态风险、技术难题、法规问题以及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性,以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 1667 | 2026-02-06 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
|
综述 | 本文综述了细菌在转录水平精确控制蛋白质亚基化学计量的机制,并探讨了这些机制在合成生物学中的应用 | 超越经典的转录调控,重点阐述了转录后精细调控机制(如内部转录终止子和选择性RNA加工与稳定系统)在控制化学计量中的作用,并展示了如何利用这些机制设计可编程的合成基因电路 | NA | 探索细菌精确控制转录化学计量的机制及其在合成生物学中的应用 | 细菌的RNA水平调控机制及合成基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 启动子库、工程化终止子、基于RNase的加工模块、合成基因电路 | 生物技术、生物医学 |
| 1668 | 2026-02-05 |
Advances in engineering and applications of synthetic phase-separated membraneless organelles in biotechnology
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.01.007
PMID:41624985
|
综述 | 本文系统总结了合成无膜细胞器的设计策略、表征技术及应用进展,并讨论了当前挑战与未来研究方向 | 基于天然无膜细胞器的工作机制,设计并构建了多种合成无膜细胞器,应用于酶活性调控、代谢途径优化、基因表达调控、重组蛋白生产和功能生物材料开发等多个生物技术领域 | NA | 为液-液相分离驱动的合成无膜细胞器的设计与应用提供理论指导和实践参考,促进其在合成生物学和生物技术中的创新发展 | 合成无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 1669 | 2026-02-05 |
Facts and Hopes in Harnessing Macrophage-Mediated Antibody-Dependent Cellular Phagocytosis for Cancer Immunotherapy
2026-Feb-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0434
PMID:41329478
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综述 | 本文综述了巨噬细胞介导的抗体依赖性细胞吞噬作用在癌症免疫治疗中的作用、挑战与前景 | 系统性地探讨了肿瘤相关巨噬细胞在ADCP中的核心作用,并提出了通过FcγR分析、抗体工程和合成生物学等新兴策略来选择性增强ADCP的治疗潜力 | 肿瘤相关巨噬细胞的异质性以及不同肿瘤类型中FcγR表达模式的认知有限,制约了ADCP的治疗应用 | 探讨如何利用巨噬细胞介导的抗体依赖性细胞吞噬作用来改进癌症免疫治疗 | 肿瘤相关巨噬细胞、单克隆抗体、Fcγ受体、肿瘤微环境 | NA | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 1670 | 2026-02-05 |
Biological conversion of methane to organic molecules: towards a low-carbon bioeconomy
2026-Jan, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaf547
PMID:41623557
|
综述 | 本文综述了将甲烷生物转化为有机分子的研究进展,旨在推动低碳生物经济的发展 | 提出了一个整合合成生物学、代谢工程和系统生物学的系统性框架,用于设计基于甲烷的生物制造,以开发高效的甲烷同化细胞工厂 | NA | 开发下一代甲烷氧化细胞工厂,克服天然甲烷氧化菌的生理限制,实现甲烷向高价值生物产品的可持续转化 | 甲烷氧化菌及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 甲烷氧化菌 | 甲烷同化途径、中心碳代谢整合 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 1671 | 2026-02-03 |
Identification of a group of UDP-glycosyltransferases catalyze emodin glycosylation in Rheum officinale with substrates promiscuity
2026-Apr, Phytochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.phytochem.2025.114763
PMID:41461342
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研究论文 | 本研究从药用植物掌叶大黄中鉴定并功能表征了六个催化大黄素糖基化的UDP-糖基转移酶,揭示了其底物混杂性及关键催化残基 | 首次系统鉴定并表征了掌叶大黄中负责大黄素糖基化的UGT酶家族,通过分子对接与定点突变揭示了底物识别的关键氨基酸残基 | 未在完整植物体系或代谢工程宿主中验证这些酶的体内功能,酶学特性研究局限于体外生化实验 | 解析掌叶大黄中蒽醌苷类活性成分的生物合成途径 | 掌叶大黄(Rheum officinale)中的UDP-糖基转移酶(UGTs) | 合成生物学 | NA | 生化分析、分子对接、定点突变 | NA | 酶学数据、分子结构数据 | 六个UGT酶(RoUGT1,2,4,5,6,8) | 定点突变 | NA | NA | 医药 |
| 1672 | 2026-02-02 |
Synthetic biology for heparin biomanufacturing
2026-Jan-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00999-x
PMID:41588187
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综述 | 本文全面讨论了肝素生物制造技术的最新进展、挑战和未来前景 | 通过酶工程、代谢工程和合成生物学方法系统优化肝素生物合成途径,探索体内/体外组合策略和从头生物合成作为替代生产方法 | NA | 探索肝素生物制造技术以替代动物源提取方法 | 肝素生物合成途径 | 合成生物学 | 炎症、癌症 | 酶工程、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 肝素生物合成途径 | 医药 |
| 1673 | 2026-02-02 |
Protein engineering strategies to optimise recombinant product synthesis and accumulation in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70232
PMID:40577356
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综述 | 本文综述了在植物分子农业中,通过蛋白质工程和亚细胞工程策略优化本氏烟草中重组产品合成与积累的方法 | 讨论了蛋白质工程与亚细胞工程策略的创新结合,以定制本氏烟草用于重组蛋白质、肽和小分子的生产,包括信号序列融合、多功能结构域应用和异源酶共表达 | NA | 优化本氏烟草中重组产品的合成与积累,提高植物分子农业的生产效率 | 本氏烟草中的重组蛋白质、肽和小分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、亚细胞工程、异源酶共表达 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草 | 合成细胞器、正交翻译后修饰途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 1674 | 2026-02-02 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
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研究论文 | 本研究通过瞬时表达在Nicotiana benthamiana中工程化Solanum家族甾体生物碱和皂苷的生物合成途径,成功生产了多种高价值代谢物 | 发现并利用SlGAME2-NEW木糖基转移酶,首次在异源植物宿主中完整重构了番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷生物合成途径 | NA | 应用合成生物学在异源植物宿主中生产高价值的甾体代谢物 | 番茄和茄子的甾体生物碱及皂苷,包括α-番茄碱、脱氢番茄碱及其立体异构体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、基因工程 | NA | NA | NA | 基因组合表达 | Nicotiana benthamiana | 甾体生物碱和皂苷的生物合成途径,涉及9至15个基因的组合表达 | 医药 |
| 1675 | 2026-02-02 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
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综述 | 本文综述了在烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略,以提升其作为生物工厂的潜力 | 整合了化学/电磁信号传感器、可编程转录因子合成启动子、病毒复制子扩增系统及重组酶处理器等前沿技术,提出植物细胞包和自持生物发光系统等快速原型平台 | 未提供具体实验数据验证所述技术的实际效率与稳定性 | 开发可控制转基因表达的系统以克服烟草生物工厂的规模化限制 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、重组酶技术、病毒复制子技术 | NA | NA | NA | CRISPR, 重组酶系统 | 本氏烟草 | 条件性基因表达电路、信号传感器、合成启动子、转录信号放大系统、细胞记忆模块 | 农业, 工业生物技术 |
| 1676 | 2026-02-02 |
A Comprehensive Multiomics Approach Illuminates the Biosynthetic Mechanism of Scoparone in Artemisia capillaris
2026-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70398
PMID:41078345
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研究论文 | 本研究通过多组学方法阐明了茵陈蒿中主要活性成分滨蒿内酯的生物合成机制 | 首次生成了茵陈蒿的全长转录组和整合代谢组数据集,鉴定并表征了催化滨蒿内酯生物合成最后一步的新型O-甲基转移酶AcOMT1 | NA | 阐明茵陈蒿中滨蒿内酯的生物合成途径 | 茵陈蒿(Artemisia capillaris)及其活性成分滨蒿内酯 | 代谢组学 | 肝病 | 全长转录组学、整合代谢组学、加权基因共表达网络分析、系统发育分析、亚细胞定位分析、酶活性测定、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学、代谢工程 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 滨蒿内酯生物合成途径 | 医药 |
| 1677 | 2026-01-30 |
Green biomineralization of magnetic metal ions: comparative mechanisms and emerging applications
2026-Jan-28, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb02352a
PMID:41427805
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综述 | 本文系统比较了微生物介导的磁性金属离子生物矿化的三种主要机制,并综述了其在生物医学、环境修复和工业生产等领域的应用与挑战 | 首次系统性地比较和整合了生物控制矿化(BCM)、生物诱导矿化(BIM)和微生物影响矿化(MIM)三种机制,弥补了文献中长期以来对BCM过度关注而对BIM和MIM覆盖不足的失衡问题 | BIM机制的结构精确性较低,MIM机制仍处于早期发展阶段,且整个领域面临规模化、批次一致性和转化障碍等跨领域挑战 | 为微生物介导的磁性生物矿化的工业转化和跨学科发展提供一个全面的指导框架 | 磁性金属离子的微生物介导生物矿化机制 | NA | NA | 生物矿化 | NA | NA | NA | 合成生物学、基因工程 | 微生物 | NA | 生物医学, 环境, 工业生物技术 |
| 1678 | 2026-01-30 |
Revolutionizing bio-hydrogen production: smart integration of nanotechnology, microbial engineering, and circular waste valorisation
2026-Jan-28, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-01001-4
PMID:41604032
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综述 | 本文全面综述了纳米技术、微生物工程和循环经济原则在生物制氢系统中的革命性整合 | 创新性地将纳米技术、先进微生物工程(包括CRISPR-Cas9合成生物学方法)与循环经济原则相结合,用于提升生物制氢效率和系统稳定性 | NA | 探索可持续能源替代方案,通过生物制氢实现碳中和能源生产并解决有机废物管理问题 | 生物制氢生产系统,包括可再生原料、微生物创新、纳米技术应用及纯化存储技术 | NA | NA | CRISPR-Cas9技术、纳米金属催化剂、酶固定化技术、等离子体纳米颗粒 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 能源、环境 |
| 1679 | 2026-01-30 |
Isolation of Antigen-Specific Nanobodies From Synthetic Libraries Using a Protein Selection Strategy That Combines MACS-Based Screening of YSD and FLI-TRAP
2026-Jan-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5570
PMID:41607705
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研究论文 | 本文介绍了一种结合MACS酵母表面展示和FLI-TRAP细菌遗传选择系统的两阶段平台,用于高效筛选和优化抗原特异性纳米抗体 | 创新点在于整合了MACS酵母展示的高通量筛选与FLI-TRAP系统的胞内结合评估,通过Tat途径的共转运机制关联结合亲和力与抗生素抗性,提供了一种成本效益高且严格的胞内兼容性筛选方法 | NA | 研究目标是开发一种高效筛选和工程化高亲和力、特异性且功能表达的胞内蛋白质结合剂的方法 | 研究对象是抗原特异性纳米抗体,通过合成酵母展示库和细菌系统进行筛选 | 合成生物学 | NA | MACS酵母表面展示、FLI-TRAP细菌遗传选择系统、Tat途径共转运 | NA | NA | NA | 酵母表面展示、细菌遗传选择系统 | 酵母、细菌 | 利用Tat信号肽标记的蛋白质与β-内酰胺酶标记的抗原靶点共表达,设计基于共转运的筛选系统,仅高亲和力结合对能共转运至周质并赋予抗生素抗性 | 医学、合成生物学 |
| 1680 | 2026-01-30 |
A Paradigm Shift in Microbial Protein Manufacturing
2026-Jan-14, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16010129
PMID:41598284
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综述 | 本文系统分析了微生物作为结构材料在应对全球蛋白质危机中的三种关键策略:菌丝固态发酵、细菌纤维素支架和合成生物学设计功能蛋白 | 提出从结构模拟转向功能创造、建立去中心化生产网络以及发展动态4D打印食品的未来突破方向 | 规模化生产和风味优化方面仍存在挑战 | 探讨微生物作为多功能结构材料以解决全球蛋白质危机和替代蛋白质质地限制 | 微生物策略,包括菌丝固态发酵、细菌纤维素支架和合成生物学设计的功能蛋白 | NA | NA | 菌丝固态发酵、细菌纤维素支架技术、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物(如菌丝、细菌) | 定制功能蛋白的设计 | 食品、农业 |