合成生物学相关文章
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当前共找到 1806 篇文献，本页显示第 1721 - 1740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1721 | 2026-01-22 |
InSillyClo, a User-Friendly Web Application to Assist Large-Scale Golden Gate Cloning and MoClo Workflows
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00553
PMID:41404662
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研究论文 | 本文介绍了InSillyClo，一个开源网络应用程序，用于辅助大规模Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | InSillyClo是首个专门处理大规模克隆工作流程中耗时且易错任务的软件工具，提供用户友好的界面和自动化数据生成 | NA | 开发一个工具来简化和自动化大规模克隆工作流程中的计算任务 | Golden Gate克隆和MoClo工作流程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，Modular Cloning (MoClo) | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly, MoClo | NA | 支持用户定义的遗传设计和工作流程生成 | 工业生物技术 |
| 1722 | 2026-01-22 |
Force Transmission by Minimal Focal Adhesion Complexes Induces Synthetic Cell Deformation
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00645
PMID:41407554
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研究论文 | 本研究通过重构最小黏着斑样复合物于巨型单层囊泡中，揭示了仅由特定蛋白质-膜相互作用即可实现肌动蛋白募集、力传递及结构稳定性，为探究机械传感和工程化力响应仿生系统提供了可控合成生物学平台 | 首次在合成系统中重构了包含kindlin-2、talin-1等核心蛋白的最小黏着斑复合物，并展示了其能独立介导肌动蛋白网络形成、力传递及囊泡变形，无需完整细胞环境 | 研究基于简化合成系统，可能未完全模拟天然细胞中黏着斑的复杂调控机制和动态相互作用 | 探究黏着斑复合物进行力传递和机械传感的最小物理要求 | 由kindlin-2、talin-1、FAK、paxillin、zyxin和VASP等蛋白质与含PIP和整合素β1尾的膜组成的合成黏着斑样复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重构与膜锚定技术 | NA | 实验观察数据 | NA | NA | 巨型单层囊泡（GUVs） | 黏着斑样复合物作为力传感与传递模块，结合肌动蛋白网络和非肌肉肌球蛋白IIa形成收缩系统 | 医学、工业生物技术 |
| 1723 | 2026-01-22 |
Synthetic Biology Strategies for Activating Cryptic BGCs in Streptomyces: Engineering Native and Synthetic Promoters for Antibiotic Discovery
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c08473
PMID:41552574
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综述 | 本文综述了在链霉菌中利用天然和合成启动子工程激活隐性生物合成基因簇以发现新型抗生素的策略 | 系统整合了CRISPR激活系统和机器学习引导的启动子设计等前沿技术，用于激活隐性基因簇 | NA | 为天然产物发现提供启动子工具的系统级理解和转化应用指南 | 链霉菌中的隐性生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、CRISPR激活系统、机器学习引导设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 启动子重构（组成型和诱导型）用于激活隐性生物合成基因簇 | 医药 |
| 1724 | 2026-01-22 |
CRISPR/Cas9-Mediated Metabolic Engineering of Endophytic Pseudomonas loganensis sp. nov. for the Production of Nutritionally Valuable Carotenoids
2026-Jan-13, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05877
PMID:41552580
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研究论文 | 本研究利用CRISPR/Cas9技术对内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov.进行代谢工程改造，以生产具有营养价值的类胡萝卜素 | 首次将内生细菌作为微生物底盘用于类胡萝卜素生产，并利用CRISPR-Cas9技术敲除关键基因构建了能生产多种类胡萝卜素的工程菌株 | 未提及大规模发酵的可行性及生产成本评估 | 开发可持续且环境友好的类胡萝卜素生物生产方法 | 内生细菌Pseudomonas loganensis sp. nov. | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、HPLC分析、响应面方法学 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas loganensis sp. nov. | 代谢途径工程（敲除类胡萝卜素合成关键基因，引入过表达质粒） | 食品、饲料、制药、化妆品 |
| 1725 | 2026-01-22 |
Yohimban acetylation in Rauvolfia is mediated by a leaf-specific acetyltransferase in reserpine biosynthetic gene cluster
2026-Jan, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110714
PMID:41289712
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研究论文 | 本研究在萝芙木中鉴定并表征了育亨宾O-乙酰转移酶（YAT），揭示了其在育亨宾生物碱代谢中的关键作用及叶特异性表达模式 | 首次在利血平生物合成基因簇中发现并表征了叶特异性乙酰转移酶YAT，阐明了育亨宾乙酰化的酶学基础及其在生物碱多样性演化中的意义 | 研究主要基于Rauvolfia serpentina，未在其他物种中广泛验证；对YAT的调控机制和进化路径的探索仍有限 | 解析萝芙木中单萜吲哚生物碱（MIAs）的生物合成途径，特别是育亨宾乙酰化的酶学机制与进化动态 | 萝芙木（Rauvolfia serpentina）中的育亨宾O-乙酰转移酶（YAT）及其在育亨宾和别育亨宾乙酰化中的作用 | 合成生物学 | NA | 同源建模、底物对接实验、基因表达分析 | NA | 基因序列、酶活性数据、表达模式数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 1726 | 2026-01-22 |
Cell-free immuno-profiling on a genetically programmed biochip
2026-Jan, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-02058-0
PMID:41372446
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研究论文 | 本研究开发了一种基于无细胞合成生物学的微流控生物芯片平台，用于定量分析抗体与抗原的相互作用，实现快速免疫分析 | 扩展了先前开发的微流控生物芯片平台，通过局部基因刷在图案化隔室中创建连续抗原密度梯度，实现单次芯片上同时合成多种抗原并生成多个抗体结合曲线 | 未明确说明样本处理的通量限制或芯片的可扩展性 | 开发一种无需蛋白纯化步骤的快速定量方法，用于分析复杂蛋白质相互作用，特别是针对人类免疫分析和新兴病原体应对 | SARS-CoV-2抗原、单克隆抗体、多克隆抗体、人类血清样本、人类ACE2受体 | 合成生物学 | COVID-19 | 无细胞合成生物学、光刻图案化、微流控技术 | NA | 蛋白质相互作用数据 | 1微升人类血清（未明确总样本数） | 基因刷、光刻图案化 | 无细胞系统 | 抗原梯度生成系统、受体-配体相互作用重建系统 | 医学 |
| 1727 | 2026-01-22 |
Deciphering the molecular roles of antimicrobial peptides in plant innate immunity and their potential applications in crop protection
2026-Jan, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110961
PMID:41422562
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综述 | 本文综述了植物抗菌肽在先天免疫中的作用及其在作物保护中的潜在应用 | 整合多组学技术与合成生物学，加速了抗菌肽的理性设计及其在农业中的生态友好型应用 | 存在病原体快速进化抗性、目标特异性不足、田间条件下肽不稳定性、潜在植物毒性以及复杂监管审批路径等挑战 | 探讨植物抗菌肽的分子角色及其在可持续作物保护中的应用潜力 | 植物抗菌肽及其在先天免疫系统中的作用 | NA | NA | 多组学技术（包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学）与合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | NA | 农业 |
| 1728 | 2026-01-21 |
Electrochemical techniques in protein engineering: Innovations in redox-active protein design and electron transfer mechanisms
2026-Jan, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149750
PMID:41418956
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综述 | 本文综述了电化学技术在蛋白质工程中的应用，特别是在设计氧化还原活性蛋白和探究电子转移机制方面的创新 | 综述了人工智能与计算建模在识别增强电子转移效率的突变中的应用，以及合成生物学构建人工电子传递途径和纳米结构材料改善蛋白质固定化与电荷传导的最新进展 | 蛋白质稳定性、隧穿效应的精确控制以及有效的电子集成等挑战仍需解决 | 探讨电化学技术如何支持工程化氧化还原蛋白的设计与功能优化，并推动其在生物电子系统中的应用 | 氧化还原活性蛋白及其工程化设计 | 蛋白质工程 | NA | 电化学技术（阻抗谱、循环伏安法、计时电流法、扫描电化学显微镜） | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | 人工电子传递途径 | 生物传感、生物电催化、生物电子学、医疗保健监测 |
| 1729 | 2026-01-20 |
A review of phage therapy for drug-resistant Pseudomonas aeruginosa infections
2026-Apr, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128417
PMID:41412007
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综述 | 本文系统总结了噬菌体疗法在治疗耐药铜绿假单胞菌感染方面的最新进展，涵盖体外杀菌活性、生物膜降解、与抗生素的协同作用、动物模型证据及临床应用案例 | 全面整合了从基础研究到临床应用的噬菌体疗法证据，并强调了工程化噬菌体与个体化治疗策略的发展前景 | 存在转化障碍，如需要精确宿主匹配、存在免疫中和风险、缺乏标准化监管框架和GMP级生产体系 | 评估噬菌体疗法作为耐药铜绿假单胞菌感染替代治疗策略的潜力与挑战 | 耐药铜绿假单胞菌及其引起的感染（如慢性呼吸道感染、烧伤伤口感染、尿路感染、器械相关感染） | NA | 铜绿假单胞菌感染 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 1730 | 2026-01-20 |
Regulation of Single and Multiple Genes in Bacillus amyloliquefaciens by an Evolution System In Vivo
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00480
PMID:41396964
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研究论文 | 本研究开发了一种用于枯草芽孢杆菌单基因和多基因调控的高效体内进化系统，通过CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑器和进化模板设计，成功优化了碱性蛋白酶活性和血红素产量 | 开发了基于CRISPR/Cas9n-AID的体内进化系统，首次在枯草芽孢杆菌中实现单基因和多基因的同时进化调控，并通过扩展sgRNA策略优化进化效率 | NA | 开发一种高效的体内进化系统，用于调控枯草芽孢杆菌中的单基因和多基因，以优化细胞工厂的构建 | 枯草芽孢杆菌及其基因（如碱性蛋白酶基因和血红素代谢网络关键基因） | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9n-AID碱基编辑、下一代测序、分批补料发酵 | NA | 测序数据、发酵数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 碱基编辑器（Cas9n与AID融合表达）、进化模板（含可编辑RBS序列） | 工业生物技术 |
| 1731 | 2026-01-20 |
A Dual CRISPR-Cas/Cre-loxP Genome Engineering Strategy for Stable Uricase Expression in Food-Grade Probiotics
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00774
PMID:41432353
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研究论文 | 本文开发了一种结合CRISPR-Cas9基因敲入与Cre/loxP介导的基因组精简的双重基因组工程策略，用于在食品级益生菌中实现尿酸酶的稳定表达 | 首次将CRISPR-Cas9基因编辑与Cre/loxP系统整合，构建了遗传稳定、生物安全的食品级益生菌底盘，并实现了异源尿酸酶的高效稳定表达 | 研究目前仅在小鼠肠道中验证了定植能力，尚未进行人体临床试验；尿酸降解实验仅在体外条件下完成 | 开发具有定制代谢功能的食品级微生物底盘，用于合成生物学在健康与营养领域的应用 | 乳酸乳球菌NZ9000菌株及其工程改造菌株 | 合成生物学 | 高尿酸血症/痛风 | CRISPR-Cas9基因编辑, Cre/loxP重组系统, 基因组工程 | NA | 酶活性数据, 基因组测序数据, 体内定植数据 | 工程菌株（NZ9000-Δ）及其对照 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 乳酸乳球菌（Lactococcus lactis） | 尿酸酶异源表达系统, 基因组精简设计 | 食品, 医药 |
| 1732 | 2026-01-20 |
Synthetic Biology Strategies for Harnessing Bacterial Glucose Oxidation Pathways
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00901
PMID:41494861
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综述 | 本文系统综述了细菌葡萄糖氧化途径的组成、分布、生理功能、关键酶及其代谢产物的工业应用，并重点讨论了通过代谢工程策略优化该途径以生产高价值化合物的潜力 | 系统整合了细菌葡萄糖氧化途径的生物学知识与代谢工程策略，并全面评估了该途径在可持续生产多种高价值化合物（如酒石酸、2,5-呋喃二甲酸、维生素C前体和磷肥）中的应用潜力 | NA | 探讨如何利用合成生物学与代谢工程策略优化细菌的葡萄糖氧化途径，以实现特定高价值化合物的高效、可持续生产 | 细菌的葡萄糖氧化途径及其关键酶（如PQQ依赖型和FAD依赖型葡萄糖酸脱氢酶），以及该途径的代谢产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 葡萄糖氧化途径（涉及葡萄糖酸、5-酮基-D-葡萄糖酸、2-酮基-D-葡萄糖酸和2,5-二酮基-D-葡萄糖酸等中间产物的代谢通路） | 工业生物技术, 农业, 医药 |
| 1733 | 2026-01-20 |
A Framework for a Standard-Enabled FAIR Data Management Workflow for Synthetic Biology
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00813
PMID:41498158
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综述 | 本文提出了一个基于标准的FAIR数据管理框架，用于合成生物学实验室中数据与元数据的整合与标准化工作流 | 通过半结构化访谈分析当前实践，构建了将常见数据类型映射到社区标准的框架，并提供逐步采用指南和软件解决方案目录 | NA | 解决合成生物学数据分散、格式不一致的问题，提升数据的可查找性、可访问性、互操作性和可重用性 | 合成生物学项目生命周期中产生的序列、模型、协议、图像和时间序列测量等数据与元数据 | 合成生物学 | NA | 半结构化访谈 | NA | 序列、模型、协议、图像、时间序列测量 | 美国多个实验室的合成生物学研究人员 | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1734 | 2026-01-20 |
Chimeric antigen receptor-based cellular therapy for T-cell malignancies
2026-Jan, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105044
PMID:41285209
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综述 | 本文综述了基于嵌合抗原受体（CAR）的细胞疗法在T细胞恶性肿瘤中的应用，探讨了包括T细胞亚群、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞和γδ T细胞在内的多种免疫效应细胞，并讨论了多抗原靶向、新兴技术和最新临床试验 | 聚焦于CAR疗法在T细胞恶性肿瘤中的挑战，如抗原共享导致的细胞自相残杀和T细胞再生障碍，并探索了多种免疫效应细胞和新兴技术以改善疗效 | NA | 改善复发或难治性T细胞恶性肿瘤的CAR疗法疗效 | T细胞恶性肿瘤患者 | NA | T细胞恶性肿瘤 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞、NK细胞、NKT细胞、CIK细胞、γδ T细胞 | 嵌合抗原受体（CAR）设计，使用单链可变片段（scFv）识别肿瘤相关抗原 | 医学 |
| 1735 | 2026-01-20 |
Toward full automation in synthetic biology: A progressive conceptual framework integrating robotics and intelligent agents
2026-Jan, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100378
PMID:41360266
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综述 | 本文探讨了合成生物学中物理（机器人）和认知（智能代理）自动化的进展与前景，并提出了一个双重概念框架 | 提出了一个双重概念框架：一个用于设计-构建-测试-学习（DBTL）周期的完全自动化，另一个适用于不同实验室环境的渐进式自动化 | NA | 支持合成生物学实验室中自动化系统的开发和负责任实施 | 合成生物学中的自动化技术和智能代理 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 1736 | 2026-01-19 |
Arabinose-Inducible Univariant Control System (AUCS) for Microbial Production of Proteins, Enzymes, and Metabolites
2026-Jan-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00602
PMID:41423945
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研究论文 | 本文介绍了一种阿拉伯糖诱导的单变量控制系统（AUCS），用于微生物生产蛋白质、酶和代谢物，旨在克服现有诱导系统的局限性 | AUCS通过组成型表达阿拉伯糖转运蛋白AraE消除了碳分解代谢物阻遏，并最小化诱导异质性，仅需3 μM l-阿拉伯糖即可实现最大蛋白质输出，显著降低诱导剂成本和环境足迹 | NA | 开发一种稳健、紧密调控且低成本的表达平台，以优化微生物生产中的基因表达控制 | 微生物生产系统，包括蛋白质（如卵清蛋白）、酶（如萜烯合酶、类胡萝卜素裂解双加氧酶）和次级代谢物（如芳樟醇、橙花叔醇和香紫苏醇） | 合成生物学 | NA | 基因表达调控、启动子库定制 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 单变量控制系统，包括阿拉伯糖诱导的启动子和阿拉伯糖转运蛋白AraE的组成型表达，用于精确调控多酶操纵子和复杂生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 1737 | 2026-01-19 |
MGTbind: a comprehensive database of molecular glue ternary interactome
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1075
PMID:41160881
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为MGTbind的综合性数据库，该数据库专门收集分子胶参与的三元相互作用组数据 | 开发了首个全面整合分子胶三元相互作用组结构数据和实验数据的数据库，并集成了AlphaFold 3预测的结构信息 | 数据库依赖现有实验数据和预测模型，可能无法覆盖所有未知的分子胶相互作用 | 为分子胶的理性设计提供数据资源支持 | 分子胶及其参与的三元蛋白质相互作用 | 生物信息学 | NA | 数据库构建、AlphaFold 3结构预测 | NA | 化学结构数据、蛋白质相互作用数据、生物活性测量数据 | 3093个经人工整理的分子胶，3924个三元相互作用 | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学 |
| 1738 | 2026-01-19 |
GotEnzymes2: expanding coverage of enzyme kinetics and thermal properties
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1053
PMID:41171142
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研究论文 | 本文介绍了GotEnzymes2数据库，这是一个大幅扩展的酶动力学和热性质资源库 | 相比第一版，GotEnzymes2首次整合了催化参数和热参数，实现了kcat、Km、kcat/Km、最适温度和熔解温度的联合预测，创建了迄今最全面的酶动力学和稳定性参数数据库 | NA | 解决酶动力学实验测量参数稀缺的问题，为数据驱动的酶发现、设计和工程提供资源 | 酶动力学参数和热性质参数 | 系统生物学 | NA | 酶动力学参数预测模型 | NA | 酶催化参数和热参数数据库 | 覆盖10,765个物种、730万种酶、5,960万条独特条目 | NA | NA | NA | 代谢工程,合成生物学 |
| 1739 | 2026-01-19 |
Open Enzyme Database: a community-wide repository for sharing enzyme data
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1082
PMID:41188073
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研究论文 | 本研究开发了一个名为开放酶数据库（OED）的社区共享平台，用于整合和共享酶相关数据 | 构建了一个集成了酶动力学参数、结构数据、反应信息和功能注释的综合性数据库，并整合了AI预测工具和化学信息学算法 | NA | 解决现有酶数据库更新不及时、缺乏标准化和机器学习支持不足的问题 | 酶及其相关数据 | 生物信息学 | NA | 数据库构建、人工智能、化学信息学 | AI预测模型 | 酶动力学参数、结构数据、反应数据、实验条件、功能注释 | NA | NA | NA | NA | 生物催化、系统生物学、合成生物学、酶工程、人工智能 |
| 1740 | 2026-01-19 |
TEDD: a comprehensive database for translation efficiency dynamics
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1125
PMID:41217970
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研究论文 | 介绍了一个名为TEDD的综合性数据库，用于探索人类翻译效率（TE）、起始效率（TR）和延伸速度（EVI）的动态变化，重点关注5'/3' UTR的调控特征 | 首次系统性地整合了基因和转录本水平的翻译效率、起始效率和延伸速度数据，并关联了详细的UTR注释，为翻译调控研究提供了多维度的在线比较平台 | 数据库目前仅涵盖人类数据，且样本来源（24种组织/细胞类型、74种细胞系、52种条件）虽广泛但仍有扩展空间 | 构建一个全面的翻译效率动态数据库，以支持翻译调控机制研究和相关生物技术应用 | 人类的翻译效率、起始效率、延伸速度及UTR调控特征 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq, RNC-seq | NA | 高通量测序数据 | 1518个RNA-seq、Ribo-seq和RNC-seq样本，来自143个人类项目（279个数据集） | NA | NA | NA | mRNA疫苗设计、合成生物学、基因治疗、酶工程 |