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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1741 | 2026-01-18 |
Reprogramming AraC-type transcriptional factor to respond to new ligands 1,3-propanediol and 1,4-butanediol via directed evolution
2026-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118359
PMID:41485247
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研究论文 | 本研究通过定向进化改造AraC家族转录因子PocR,使其能够响应新配体1,3-丙二醇和1,4-丁二醇,并开发了基于生长偶联筛选和流式细胞分选的高通量生物传感器筛选平台 | 开发了结合生长偶联筛选与流式细胞分选的生物传感器筛选平台,并通过定向进化成功重编程了AraC家族转录因子的配体特异性,实现了对非天然二醇类化合物的响应 | NA | 开发可响应新配体的生物传感器,用于代谢工程和高产菌株筛选 | 肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)中的AraC家族转录调控因子PocR | 合成生物学 | NA | 定向进化、结构分析、动力学引导的半理性设计、非理性方法、流式细胞分选、微流控共培养系统 | NA | NA | 160万个微滴 | 定向进化 | 肺炎克雷伯菌 | 二醇类生物传感器 | 工业生物技术 |
| 1742 | 2026-01-18 |
Bidirectional regulation strategies of food microorganisms based on mechanistic insights into temperature, osmotic, and acid stresses
2026-Feb-28, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.118045
PMID:41539747
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综述 | 本文系统总结了食品微生物对温度、渗透压和酸胁迫的适应机制,并提出了基于这些机制的双向调控策略,以强化有益微生物并抑制有害微生物 | 提出了一个整合生理分子机制与多组学、系统生物学、人工智能及合成生物学见解的“双向调控”策略框架,用于协同优化食品安全与品质 | NA | 为食品微生物的定向管理提供系统框架和技术路径,以协同优化食品安全与品质 | 食品中的有益微生物和有害微生物 | NA | NA | 多组学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 1743 | 2026-01-18 |
Synergistic regulatory mechanisms in glycolysis revealed by pathway transplantation
2026-Jan-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00219-25
PMID:41532746
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研究论文 | 本研究通过移植糖酵解途径,揭示了多个变构蛋白之间的协同调控机制及其在动态环境中对细胞存活的影响 | 首次通过完整途径互补和单基因互补实验,识别了糖酵解中的关键调控步骤(葡萄糖激酶、磷酸果糖激酶和丙酮酸激酶),并展示了变构调控在防止糖酵解失衡中的协同作用 | 实验主要基于模式真核生物酿酒酵母,结果可能不直接适用于其他生物体 | 探究糖酵解途径中多个变构调控步骤如何相互作用以调节代谢 | 糖酵解途径(Embden-Meyerhof-Parnas途径)及其变构蛋白 | 系统生物学 | NA | 途径移植、动力学建模、微流控实验 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母 | 糖酵解代谢途径 | 工业生物技术 |
| 1744 | 2026-01-17 |
Screening and machine learning-based prediction of translation-enhancing peptides that reduce ribosomal stalling in Escherichia coli
2026-Jan-14, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00199d
PMID:41142649
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研究论文 | 本研究通过筛选随机人工四肽库,鉴定出能减少大肠杆菌中SecM停滞肽诱导的翻译停滞的翻译增强肽,并开发了基于随机森林算法的机器学习模型来预测其活性 | 首次系统性筛选翻译增强肽,并利用机器学习模型预测其活性,为合成生物学提供了紧凑的肽工具包和数据驱动方法 | 研究主要针对SecM停滞肽,对其他停滞肽的适用性未充分验证,且实验基于大肠杆菌系统,在其他生物中的效果未知 | 开发翻译增强肽以减轻停滞肽诱导的核糖体停滞,并建立预测模型 | 随机人工四肽库和SecM停滞肽在大肠杆菌中的翻译停滞现象 | 合成生物学 | NA | 随机肽库筛选、翻译分析、机器学习 | 随机森林 | 肽序列数据和翻译活性测量数据 | 随机人工四肽库中的多个肽样本 | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 1745 | 2026-01-17 |
Oral live microbial therapeutics: A synthetic biology roadmap toward durable oral microbiome-based therapies
2026-Jan-09, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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综述 | 本文是一篇关于口服活微生物疗法(LMTs)的叙述性综述,旨在通过整合临床证据和工程学原理,为开发持久有效的口腔微生物疗法提供合成生物学路线图 | 将合成生物学工程工具(如粘附载体、多层生物防护和逻辑门控/CRISPR杀灭开关)系统性地应用于口腔LMTs的开发,并提出了一个包含定植曲线下面积、表观半衰期等指标的位点解析测量框架,以量化微生物在口腔内的持久性 | 这是一篇叙述性综述,而非原始研究,其结论基于现有文献的综合分析,可能受到已发表研究偏倚和异质性的限制;此外,文中提出的工程策略大多处于概念或早期开发阶段,尚未经过大规模临床验证 | 为开发持久、安全的口服活微生物疗法提供合成生物学指导框架,并推动临床转化 | 口服活微生物疗法(LMTs)及其在口腔疾病(如口臭、龋齿、牙周病)中的应用 | 合成生物学 | 口腔疾病(包括口臭、龋齿、牙周病) | NA | NA | NA | NA | CRISPR, 逻辑门控杀灭开关, 合成营养缺陷型设计 | NA | 逻辑门控杀灭开关, 合成营养缺陷型设计, 多层生物防护系统 | 医学 |
| 1746 | 2026-01-16 |
Establishing synthetic ribbon-type active zones in a heterologous expression system
2026-Jan-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98254
PMID:41528127
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研究论文 | 本研究采用合成生物学方法,在HEK293细胞中重建了类似带状活性区的结构,以探究其最小分子需求并研究突触前钙通道的聚集 | 首次在异源表达系统中成功重建了模拟带状活性区的合成结构,结合超分辨率STED显微镜和冷冻相关电子断层扫描技术验证其与天然带状结构的相似性 | 研究基于异源细胞系统,可能不完全反映神经元原生环境中的复杂相互作用 | 探究带状突触活性区的最小分子组成和钙通道聚集机制 | 带状突触活性区的重建结构及其分子组件 | 合成生物学 | NA | STED超分辨率显微镜、冷冻相关电子断层扫描、钙成像、膜片钳技术 | NA | 图像数据、功能分析数据 | 使用HEK293细胞作为异源表达系统 | 合成生物学方法 | 人类胚胎肾293细胞(HEK293) | 带状活性区模拟结构,涉及Bassoon蛋白膜锚定版本和RIBEYEB蛋白共表达 | 医学 |
| 1747 | 2026-01-15 |
An integrated engineered microbial system for copper biosorption, real-time monitoring, and magnetic recovery in water remediation
2026-Feb, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133732
PMID:41319880
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研究论文 | 本研究开发了一种集铜吸附、实时监测和磁回收于一体的工程微生物系统,用于水体修复 | 首次构建了同时具备重金属吸附、实时生物传感和磁性回收功能的集成化工程菌系统 | 未明确说明系统在长期运行中的稳定性及大规模应用的经济性评估 | 开发高效、可监测、可回收的重金属水体修复技术 | 工程改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程、表面展示技术、磁性纳米颗粒功能化 | NA | 实验数据 | 实验室及真实环境水样(含废水) | OmpA锚定系统、SpyTag/SpyCatcher系统、合成基因回路设计 | 大肠杆菌 | 铜感应合成基因回路(含T RNA聚合酶级联放大和降解标签)、表面展示重金属结合肽的吸附系统、基于Curli纳米纤维的磁性回收系统 | 环境修复 |
| 1748 | 2026-01-15 |
Dynamic Interaction: Synthetic Biology and Cell-Free Biosensors Drive Each Other Forward
2026-Jan-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12137
PMID:41406611
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综述 | 本文探讨了合成生物学与生物传感器技术的融合如何推动生物技术革命,并系统总结了无细胞生物传感器领域的最新研究进展与技术突破 | 强调了合成生物学与无细胞生物传感器之间的动态互动关系,突出了无细胞生物传感器在快速原型设计、高可控性、优异生物安全性及对潜在毒性物质耐受性方面的核心优势 | NA | 探索合成生物学与生物传感器整合所释放的创新潜力,并系统总结无细胞生物传感器领域的最新研究进展与技术突破 | 无细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物回路精确设计、代谢途径智能优化 | 生物技术、高效诊断 |
| 1749 | 2026-01-15 |
Nature-Inspired Biomineralization for Food Innovation: Biomimetic Material Design and Targeted Nutrient Delivery
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70400
PMID:41532716
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综述 | 本文系统回顾了过去25年间生物矿化策略从分子机制到食品应用的进展,重点介绍了其在智能包装、功能成分控释和功能性食品开发方面的贡献 | 首次系统地将自然启发的生物矿化策略深入应用于食品科学领域,为解决食品包装、加工、安全检测和营养强化等关键挑战提供了创新方案 | 规模化生产和安全性评估方面仍存在持续挑战 | 探索生物矿化策略在食品创新中的应用潜力,推动食品产业向更高效、自动化和可持续方向转型 | 生物矿化过程及其在食品包装、功能成分递送和功能性食品开发中的应用 | 材料科学与食品科学交叉领域 | NA | 生物矿化、有机模板调控矿化、物理化学策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品、材料科学 |
| 1750 | 2026-01-14 |
Molecular networks and signaling pathways governing abiotic stress tolerance in cotton: advances and perspectives
2026-Jan-13, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01795-8
PMID:41528403
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综述 | 本文综述了棉花响应非生物胁迫(如干旱、盐分、热、冷和重金属毒性)的分子网络与信号通路研究进展,并展望了未来研究方向 | 整合了最新的表观遗传调控机制(如m6A RNA甲基化和非编码RNA)以及合成生物学方法在棉花胁迫响应网络研究中的应用 | NA | 阐明棉花非生物胁迫耐受性的分子调控网络与信号通路,为培育抗逆棉花品种提供理论基础 | 棉花(Gossypium spp.) | NA | NA | 分子生物学、生物技术、遗传工程、基因组编辑、组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 1751 | 2026-01-14 |
Industrial Byproducts as Sustainable Feedstocks for Biopharmaceutical Manufacturing: Waste-to-Medicine Pathways for a Circular Economy
2026-Jan-12, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.70124
PMID:41527212
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综述 | 本文系统性地探讨了工业副产品作为生物制药可持续原料的来源、分类及应用,评估了将其转化为高价值治疗产品的生物技术策略,并分析了相关的环境、经济、监管及技术挑战 | 首次系统性地将工业副产品定位为生物制药的可持续原料,并整合了从废物到药物的转化路径、生命周期分析及人工智能等未来优化策略,强调了其在推动循环经济和零废物生产中的变革潜力 | 存在技术限制、严格的质量与标准化要求、复杂的政策与伦理挑战等重大障碍,且工业副产品的来源和成分可能不稳定,影响生产的可重复性和规模化 | 探索工业副产品作为可持续原料在生物制药制造中的应用潜力,以降低生产成本并促进循环经济 | 工业副产品(如制药及相关行业的废弃物、农业工业废物、海洋来源残留物、发酵副产品)及其转化为生物制药产品的过程 | 工业生物技术 | NA | 微生物发酵、酶促生物转化、合成生物学驱动的代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 1752 | 2026-01-14 |
Triply Responsive Control of Ion Transport with an Artificial Channel Creates a Switchable AND to OR Logic Gate
2026-Jan-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202517444
PMID:41251147
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研究论文 | 本文介绍了一种基于柱[5]芳烃功能化的光开关邻四氟偶氮苯基团的人工离子通道,其活性可通过光、pH和客体/配体三种正交刺激控制 | 开发了一种三响应合成离子通道,实现了光、pH和客体添加的多模态控制,并设计出可切换的AND到OR逻辑门系统 | 未提及具体选择性或与生物离子通道的直接比较数据 | 创建具有多重可控性的合成离子通道以模拟生物离子通道功能 | 基于柱[5]芳烃的光开关人工离子通道 | 合成生物学 | NA | 单分子平面双层电导研究 | NA | 电导数据 | NA | NA | NA | 可切换的AND到OR逻辑门系统 | 医学 |
| 1753 | 2026-01-14 |
2-Hydroxy-4-Methoxybenzaldehyde (2H4MB): Integrating Cell Culture, Metabolic Engineering, and Intelligent Genome Editing
2026-Jan-03, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010503
PMID:41516375
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综述 | 本文综述了利用细胞培养、代谢工程和智能基因组编辑技术提高2-羟基-4-甲氧基苯甲醛(2H4MB)产量的最新进展 | 整合了代谢工程、合成生物学、体外培养方法和人工智能辅助路径预测,并探讨了基于CRISPR的基因组编辑在调控关键生物合成基因中的应用 | 遗传资源不足、生物合成途径了解不充分、缺乏可靠的转化系统 | 提高2H4MB的产量,以应对其在天然植物中生产受限的问题 | 2-羟基-4-甲氧基苯甲醛(2H4MB) | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、机器学习 | 预测性机器学习模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 生物合成途径调控 | 医药、香料、香精 |
| 1754 | 2026-01-13 |
Wetting-Mediated Remodeling of the Cytoskeletal Cortex by Phase-Separated Condensates in Cell-Free Reactions
2026-Jan-12, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c01410
PMID:41461602
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研究论文 | 本文介绍了一种合成生物学平台,整合无细胞转录翻译反应与相分离蛋白凝聚物,以研究其与细胞骨架元素的相互作用 | 开发了合成生物学平台,首次在无细胞反应中展示了相分离凝聚物通过润湿作用重塑细胞骨架皮层,揭示了毛细驱动收缩机制 | NA | 研究膜无细胞器与细胞骨架网络的相互作用机制 | 细菌肌动蛋白同源物MreB、相分离蛋白凝聚物、水-油液滴界面 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译(TXTL)反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物物理学、生物工程 |
| 1755 | 2026-01-13 |
Microbial Lossen rearrangement: Promise and pitfalls in plastic bioremediation
2026-Jan-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2026.181374
PMID:41520378
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综述 | 本文探讨了利用微生物Lossen重排反应进行塑料生物修复的潜力与挑战 | 将经典的有机化学反应Lossen重排改造为生物相容性反应,并在工程化大肠杆菌中利用PET废物衍生底物生物合成药物对乙酰氨基酚 | 目前仅在受控系统中可行,在自然环境中的应用仍不确定,存在技术、生态和监管限制 | 探索塑料生物修复的环境应用前景 | 工程化大肠杆菌及PET废物衍生底物 | 合成生物学 | NA | Lossen重排反应 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, iGEM | 大肠杆菌 | 生物传感器或代谢途径 | 环境, 医药 |
| 1756 | 2026-01-12 |
Design of a Multienzyme Derived from Mouse Fatty Acid Synthase for the Compartmentalized Production of 2-Pyrone Polyketides
2026-Jan-09, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511726
PMID:41243670
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研究论文 | 本研究设计了一种基于小鼠脂肪酸合酶的多酶体系,用于在区室化环境中生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 通过在小鼠非还原型脂肪酸合酶的酮合酶结构域引入两个氨基酸突变,显著提升了酶活性;并利用SpyTag/SpyCatcher系统整合了4-香豆酸连接酶加载模块,实现了肉桂酸衍生物的直接活化与转移 | NA | 开发区室化生物合成平台以高效生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 小鼠非还原型脂肪酸合酶衍生的多酶体系及其催化的2-吡喃酮合成反应 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、化学酶法平台 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | NA | 基于非还原型脂肪酸合酶的多酶区室化合成途径,用于生产2-吡喃酮类化合物 | 医药 |
| 1757 | 2026-01-12 |
Recognition of unnatural base pairs by a eukaryotic DNA polymerase enables universal sequencing of an expanded genetic alphabet
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1460
PMID:41505089
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研究论文 | 本文探索了人类DNA聚合酶β对非天然碱基对的高效特异性合成与延伸能力,并基于此建立了一种测序方法,用于定位含有非天然碱基的DNA | 首次系统研究了人类DNA聚合酶β对非天然碱基对的复制活性,并开发了一种通用测序方法,能够高通量测序含有多种非天然碱基的DNA | NA | 探索非天然碱基对在真核DNA复制系统中的整合潜力,并为扩展遗传字母表的DNA测序提供技术基础 | 非天然碱基对(如dNaM-dTPT3、dCNMO-dTPT3及其功能化衍生物)和含有这些碱基的DNA | 合成生物学 | NA | Sanger测序、深度测序、DNA聚合酶介导的引物延伸 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 1758 | 2026-01-12 |
Design of bacterial DNT sensors based on computational models
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1482
PMID:41505102
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研究论文 | 本研究通过计算模型设计并优化了基于大肠杆菌的细菌生物传感器,用于高灵敏度和特异性检测爆炸物副产物2,4-二硝基甲苯(DNT) | 整合计算建模与合成生物学技术,通过分析DNT暴露下的启动子数据生成367个新变体,显著提升了生物传感器的信号强度和响应速度 | 未明确说明传感器在复杂环境中的长期稳定性或实际现场应用的验证结果 | 开发用于环境监测的高性能DNT生物传感器 | 基于大肠杆菌的细菌生物传感器及其启动子-报告基因融合系统 | 合成生物学 | NA | 计算建模、数据分析和合成生物学技术 | NA | 启动子序列数据和生物发光信号数据 | 367个新生成的启动子变体 | 质粒构建、基因融合 | 大肠杆菌 | 基于启动子作为传感元件与微生物生物发光报告基因盒融合的生物传感器电路 | 环境监测 |
| 1759 | 2026-01-12 |
A unified computational framework for quantitative design and optimization of transcriptional regulation across bacterial species
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1472
PMID:41505101
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化热力学建模框架T-Pro,用于预测和优化跨细菌物种的转录调控,并通过实验验证其在多种细菌中的性能提升 | 提出了一种具有机制清晰性、可组合性和可扩展性的统一计算框架,显著提高了转录性能指标,并在仅三个设计-构建-测试-学习循环中实现优化 | NA | 开发一个计算框架以定量设计和优化跨细菌物种的转录调控 | 细菌物种(大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒杆菌)的转录调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学建模 | 模块化热力学模型 | NA | 涉及三种细菌物种的实验验证 | NA | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 谷氨酸棒杆菌 | 多物种细菌通信电路 | 工业生物技术 |
| 1760 | 2026-01-12 |
DNA Origami and Its Applications in Synthetic Biology
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513357
PMID:41310154
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综述 | 本文全面概述了DNA折纸技术在合成生物学中的创新应用,包括从细胞外到细胞内的多个领域 | 强调了DNA折纸技术与无细胞合成生物学的协同作用,通过体外组装与细胞调控的结合,为人工生命系统的理性设计开辟了新途径 | NA | 概述DNA折纸技术在合成生物学各领域的创新应用及其与无细胞合成生物学的协同作用 | DNA折纸技术及其构建的纳米结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 环境, 工业生物技术 |